单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40217 篇文献,本页显示第 3941 - 3960 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3941 2026-04-24
Cell migration inducing protein alleviates adverse remodeling after ischemia and reperfusion injury by controlling fibroblast activation
2026-Apr-22, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 探究细胞迁移诱导蛋白在控制成纤维细胞活化后减轻缺血再灌注损伤后不良重塑的作用 首次揭示CEMIP通过调节透明质酸周转和抑制成纤维细胞向肌成纤维细胞转化,在心肌梗死后愈合中发挥保护作用 仅使用全球Cemip敲除小鼠模型,未在特定细胞类型中验证,且机制研究主要基于体外实验 研究CEMIP在心肌梗死后心脏重塑中的功能及其潜在治疗靶点 小鼠心肌缺血再灌注损伤模型及心脏成纤维细胞 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 小鼠心脏样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3942 2026-04-24
Predictive model for clear cell renal cell carcinoma: a novel model integrating sunitinib resistance and prognosis related genes and clinical factors
2026-Apr-22, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 开发一种整合舒尼替尼耐药性、预后相关基因和临床因素的列线图模型,用于预测肾透明细胞癌患者的药物敏感性、治疗反应和生存结果 首次将舒尼替尼耐药相关基因(IFITM1、IMPA2、KCNN3)与临床因素整合,构建临床基因预后列线图模型(CGPNM),实现药物敏感性、治疗反应和生存结果的综合预测 摘要未提及研究的局限性 识别与肾透明细胞癌舒尼替尼耐药和预后相关的关键基因,并开发一个整合基因和临床因素的临床基因预后列线图模型 肾透明细胞癌(ccRCC)患者 机器学习 肾透明细胞癌 RNA-seq 列线图模型 基因表达数据、临床因素数据 NA NA NA NA NA
3943 2026-04-24
Imputing causality and clonal dynamics from single-cell transcriptomics in paroxysmal nocturnal hemoglobinuria
2026-Apr-22, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析阵发性睡眠性血红蛋白尿症患者的骨髓细胞,揭示PIGA突变干细胞的克隆动态和因果关系 首次从单细胞转录组层面解析PNH患者中正常造血干细胞与PNH型造血干细胞在骨髓衰竭背景下的差异表达模式,以及免疫负向选择对正常造血干细胞的影响 样本量较小,仅纳入PNH细胞比例较大(>50%)和较小(10-50%)的两组患者,可能无法完全反映疾病异质性 探究阵发性睡眠性血红蛋白尿症中PIGA突变干细胞的克隆扩增机制及骨髓衰竭的病理生理学 阵发性睡眠性血红蛋白尿症患者的骨髓细胞 数字病理学 阵发性睡眠性血红蛋白尿症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 阵发性睡眠性血红蛋白尿症患者,根据PNH细胞比例分为大(>50%)和小(10-50%)两组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3944 2026-04-24
Dysfunction of the neurovascular unit as a temporal driver in Alzheimer's pathogenesis
2026-Apr-22, Translational neurodegeneration IF:10.8Q1
综述 系统回顾了阿尔茨海默病进展中神经血管单元功能障碍的作用,以及空间转录组学和类器官技术在NVU研究中的应用 强调神经血管单元功能障碍可能是阿尔茨海默病发病的早期驱动因素,并整合三维NVU类器官、单细胞分辨率空间转录组学和人工智能技术构建功能结构模型的新视角 未明确提及本综述的局限性,但可能受限于现有研究数据的完整性和技术进步的速度 系统梳理神经血管单元功能障碍在阿尔茨海默病进展中的时序作用及相关技术应用 神经血管单元功能障碍事件,包括内皮细胞紧密连接损伤、周细胞退化、星形胶质细胞和小胶质细胞激活、神经元凋亡,以及Aβ沉积与NVU功能障碍的协同作用 数字病理学 阿尔茨海默病 空间转录组学, 类器官技术, 人工智能, 机器学习, 深度学习 NA 文本 NA NA 空间转录组学 NA 单细胞分辨率空间转录组学
3945 2026-04-24
Heterogeneity of bacterial host-pathogen interactions across biological scales
2026-Apr-21, mSystems IF:5.0Q1
综述 本文综述了单细胞技术如何揭示宿主-病原体相互作用的动态和异质性,探讨了从单细胞到组织和整个生物体的多尺度感染结果 整合了显微成像、单细胞转录组学、蛋白质组学及新兴的双RNA-seq和空间方法,强调多尺度异质性在决定感染结局中的关键作用 未明确讨论跨尺度模型整合的计算挑战及临床转化中的实际限制 理解宿主-病原体相互作用的异质性及其对感染结局的影响 细菌病原体与宿主细胞之间的相互作用 机器学习 感染性疾病 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 双RNA-seq, 空间转录组学 计算与数学建模 转录组数据, 蛋白质组数据, 空间数据 不适用 不适用 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 不适用 不适用
3946 2026-04-24
Hypoxia inducible factor network reflects kidney disease progression in diabetes and sodium-glucose co-transporters inhibition
2026-Apr-21, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示糖尿病肾病患者中缺氧诱导因子网络反映疾病进展及SGLT2抑制剂治疗反应 首次通过单细胞转录组数据构建启动子锚定的HIF调控网络,并使用多组学数据验证,实现对糖尿病肾病的进展和治疗反应的量化评估 该研究未明确提及具体局限性,但可能包括样本来源有限(主要为年轻2型糖尿病患者)以及网络在更广泛人群中的验证仍需进一步研究 探讨缺氧诱导因子网络如何反映糖尿病肾病的进展以及SGLT2抑制剂的治疗效果 患有2型糖尿病的年轻人(临床DKD证据极少)、晚期DKD患者(来自KPMP项目)以及缺氧人肾类器官模型 计算生物学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序、多组学分析、空间转录组学 调控网络模型 单细胞转录组数据、表观基因组数据(多组学)、空间转录组数据 未在摘要中明确样本量,但提及年轻T2D患者、KPMP项目参与者以及肾类器官模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3947 2026-04-24
CD44 expression in renal tubules during maladaptive repair is a potential marker for the transition from acute kidney injury to chronic kidney disease in rats
2026-Apr-20, Toxicology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了大鼠急性肾损伤向慢性肾病转化过程中肾小管CD44的表达及其作为不良修复标志物的潜力 首次系统揭示了CD44在急性肾损伤向慢性肾病转化过程中的动态表达模式,并发现血清CD44可能成为顺铂肾毒性中肾小管不良修复的循环标志物 该研究仅在大鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证其临床相关性 探索CD44作为急性肾损伤向慢性肾病转化过程中肾小管不良修复标志物的可能性 大鼠肾小管上皮细胞 机器学习 肾病 基因芯片分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 NA 基因表达数据、组织病理图像 大鼠模型,具体样本数量未列出 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 小鼠缺血再灌注模型单细胞RNA测序分析
3948 2026-04-24
Time-series single-cell transcriptomics and spatial metabolomics reveal spatiotemporal tobacco leaf response to herbivory
2026-Apr-17, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 通过时间序列单细胞转录组学和空间代谢组学揭示烟草叶片应对草食动物取食的时空响应机制 首次构建了烟草叶片草食胁迫下的单细胞分辨率动态防御网络,并鉴定了WRKY81作为早期防御启动的关键调控因子 未详细说明局限性,但从方法看可能包括VIGS验证的瞬时性及代谢物空间分布的检测精度限制 解析烟草叶片对草食动物取食防御反应在细胞类型和时间尺度上的调控机制 模拟草食胁迫下的烟草叶片细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序、空间代谢组学、共表达分析、伪时间分析、配体-受体推断、qRT-PCR、VIGS NA 单细胞转录组数据、空间代谢物分布数据 28,318个烟草叶片细胞 NA 单细胞RNA测序、空间代谢组学 NA NA
3949 2026-04-24
Integrated spatial and single‑cell transcriptomics maps disulfidptosis in renal cell carcinoma and reveals PDLIM1 as a prognostic biomarker and potential therapeutic target
2026-Apr-14, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 整合空间和单细胞转录组学绘制肾细胞癌中二硫下垂的图谱,并揭示PDLIM1作为预后生物标志物和潜在治疗靶点 首次在肾细胞癌中综合空间转录组学和单细胞RNA测序,系统绘制二硫下垂的异质性图谱,并鉴定PDLIM1作为新的预后生物标志物和治疗靶点 尚未在独立大样本队列中验证PDLIM1的临床价值,缺乏体内功能验证实验 阐明肾细胞癌中二硫下垂的组织分布及其临床相关性,并鉴定潜在生物标志物和治疗靶点 肾细胞癌组织样本(6例空间转录组学样本、4个单细胞RNA测序队列)和肾癌细胞系 机器学习 肾细胞癌 空间转录组学, 单细胞RNA测序, RCTD反卷积, CytoTRACE分析, sh-RNA敲降 NA 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 6个肾癌切片的空间转录组数据和4个单细胞RNA测序队列 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
3950 2026-04-24
STC2-mediated calcium homeostasis dysregulation in the osteosarcoma microenvironment: Insights from single-cell sequencing and machine learning
2026-Apr-14, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过单细胞测序和机器学习分析,揭示STC2介导的钙稳态失调在骨肉瘤微环境中的作用 首次结合单细胞测序和多种机器学习算法,识别STC2作为骨肉瘤中钙稳态失调的关键预后基因,并探讨其在免疫治疗反应中的潜在预测价值 STC2与免疫检查点抑制剂反应之间的关联仍需要进一步验证 探究钙稳态失调在骨肉瘤进展中的作用,并识别关键预后基因 骨肉瘤细胞系(U2OS和143B)以及骨肉瘤微环境中的内皮细胞、成纤维细胞和恶性细胞 机器学习和数字病理学 骨肉瘤 单细胞测序 机器学习算法 单细胞表达谱数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3951 2026-04-24
[Preliminary study on the role of IL-1β+ neutrophils in bone regulation of periodontitis mice]
2026-Apr-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
研究论文 本研究探讨白细胞介素-1β阳性中性粒细胞在牙周炎小鼠骨调控中的作用及机制 首次揭示IL-1β+中性粒细胞通过TLR4-NF-κB信号通路抑制MC3T3-E1细胞成骨分化,为牙周炎骨再生免疫治疗提供新靶点 未提及明显局限性 探究IL-1β+中性粒细胞在牙周炎小鼠骨调控中的作用及机制 牙周炎小鼠模型及MC3T3-E1细胞 数字病理学 牙周炎 单细胞转录组测序, Micro-CT, 流式细胞术 NA 图像, 文本 20只8周龄雄性C57BL/6J小鼠 Illumina 单细胞RNA测序 NA NA
3952 2026-04-24
Bufalin Inhibits the PI3K/AKT Pathway by Targeting GTF3C4 to Impede Breast Cancer Progression
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究揭示蟾蜍灵通过靶向GTF3C4抑制PI3K/AKT通路阻碍乳腺癌进展 首次鉴定GTF3C4为蟾蜍灵的直接作用靶点,并阐明其通过调控PI3K/AKT通路和肿瘤微环境发挥抗乳腺癌作用 摘要中未提及具体局限性 探索蟾蜍灵抑制乳腺癌进展的分子机制 乳腺癌细胞系MDA-MB-231和MCF-7,以及小鼠乳腺癌模型 机器学习 乳腺癌 RNA测序,单细胞RNA测序,限制性蛋白酶解-质谱分析,细胞热位移分析,药物亲和反应靶标稳定性分析,表面等离子体共振 NA RNA测序数据 MDA-MB-231和MCF-7细胞系,小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq,RNA-seq NA NA
3953 2026-04-24
DSG2+ Cancer Stem Cells Co-Located With FAP+ Myofibroblasts in the Tumor Boundary That Determines the Efficacy of Immunotherapy in Non-Small Cell Lung Cancer
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 整合单细胞RNA测序与空间转录组学,揭示非小细胞肺癌中DSG2+癌症干细胞与FAP+肌成纤维细胞在肿瘤边界的共定位关系及其对免疫治疗疗效的影响 首次通过空间转录组学定位DSG2+癌症干细胞在肿瘤边界的富集,并阐明其与FAP+肌成纤维细胞形成特定微环境,以MMP依赖方式促进肿瘤干细胞表型和治疗耐药 未明确提及研究局限性 解析非小细胞肺癌中癌症干细胞的转录程序与空间组织,及其对治疗耐药的影响 非小细胞肺癌组织和细胞系中的癌症干细胞与肌成纤维细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光, 共培养实验 加权基因共表达网络分析 基因表达数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 独立临床蛋白质组数据集(未具体说明样本数量) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'试剂盒, 10x Visium FFPE空间基因表达试剂盒, Illumina NovaSeq测序平台
3954 2026-04-24
PDZK1-ULK1 Axis Triggers Lipophagy to Inhibit Tumor Progression and Sunitinib Resistance in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 揭示PDZK1-ULK1轴通过诱导脂噬抑制透明细胞肾细胞癌进展和舒尼替尼耐药 发现PDZK1-ULK1轴通过调控脂噬维持脂滴稳态,并首次提出ULK1作为舒尼替尼疗效预测生物标志物 未明确阐明PDZK1与LEF1相互作用的详细结构基础,且临床样本量可能有限 阐明PDZK1-ULK1轴在透明细胞肾细胞癌脂滴积累和舒尼替尼耐药中的作用机制 透明细胞肾细胞癌患者肿瘤组织、细胞系及异种移植模型 数字病理学 肾细胞癌 单细胞RNA测序, CUT&Tag分析 NA 基因表达数据 透明细胞肾细胞癌患者临床样本(具体数量未提供) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium, Illumina测序平台 10x Chromium单细胞RNA测序用于scRNA-seq分析;Illumina平台用于CUT&Tag测序
3955 2026-04-24
RIPK3 Orchestrates Scar-Associated Macrophage Dysfunction to Drive Pulmonary Fibrosis
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了RIPK3通过非坏死性凋亡的免疫代谢功能调控肺纤维化,并靶向疤痕相关巨噬细胞(SAMs)发挥促纤维化作用 首次发现RIPK3通过非坏死性凋亡的免疫代谢功能调控肺纤维化,并明确其在疤痕相关巨噬细胞(SAMs)中的关键作用 NA 探究RIPK3在特发性肺纤维化(IPF)中的非经典功能及其分子机制 特发性肺纤维化患者及小鼠模型中的巨噬细胞,特别是疤痕相关巨噬细胞(SAMs) 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 IPF患者及小鼠样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析巨噬细胞亚群
3956 2026-04-24
Single-Cell RNA Analysis of Murine Osteosarcoma Uncovers Skp2 Function in Metastasis, Genomic Instability, and Immune Activation and Reveals Additional Target Pathways
2026-Apr-01, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序分析小鼠骨肉瘤,揭示Skp2在转移、基因组不稳定性和免疫激活中的作用,并发现其他靶向通路 首次在免疫健全的转基因小鼠骨肉瘤模型中应用单细胞RNA测序,系统揭示Skp2基因敲除对肿瘤异质性、微环境复杂性、T细胞耗竭减少、干扰素信号上调及转移抑制的多维度影响,并发现潜在逃逸机制 研究基于小鼠模型,结论向人类骨肉瘤的转化需要进一步验证;未详细说明单细胞分析的细胞数量或测序深度等具体数据 探索Skp2在骨肉瘤转移、基因组不稳定性及免疫激活中的功能,并识别新的治疗靶点 Osx-Cre条件性Rb1/Trp53敲除小鼠的原发性骨肉瘤肿瘤细胞,以及Skp2敲除或Skp2-p27相互作用破坏的模型 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 NA 基因表达数据, 蛋白质组数据 未明确具体样本数量,涉及多种基因型小鼠模型的肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3957 2026-04-24
Single-cell analysis of the human immune system reveals sex-specific dynamics of immunosenescence
2026-Apr, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析人类免疫系统,揭示免疫衰老的性别特异性特征 首次在单细胞水平上系统揭示免疫衰老的性别二态性,发现女性免疫重塑更强且具有特定细胞亚群变化,男性则与慢性淋巴细胞白血病前驱状态相关的B细胞扩增 未提供具体局限性,但可能包括样本来源为外周血单核细胞,无法反映组织驻留免疫细胞的变化;横断面研究设计限制因果推断 探究生物学性别如何影响免疫系统在细胞水平的衰老过程 982名成年雌性和雄性捐赠者的外周血单核细胞 计算生物学, 单细胞组学 免疫衰老, 慢性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 982名捐赠者(包括女性和男性) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3958 2026-04-24
Re-analysis of single-cell transcriptomics reveals a critical role of TNS1 gene in driving contractile VSMC transdifferentiation into macrophage-like SMC and atherosclerotic plaque instability
2026-Apr, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 通过重新分析单细胞转录组数据,发现TNS1基因在驱动收缩型血管平滑肌细胞转分化为巨噬细胞样平滑肌细胞及动脉粥样硬化斑块不稳定中起关键作用 首次揭示TNS1基因在血管平滑肌细胞表型转换中的调控作用,并验证其通过促进巨噬细胞样平滑肌细胞转分化加剧斑块不稳定的机制 未提及具体局限性 探究血管平滑肌细胞转分化亚型对动脉粥样硬化进展和斑块不稳定的影响 动脉粥样硬化斑块中的血管平滑肌细胞 单细胞转录组学 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析 NA 单细胞转录组数据 GSE155513和GSE253903数据集以及三个不稳定斑块转录组数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3959 2026-04-24
The landscape of responses to neoadjuvant immunotherapy in resectable Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog-mutant lung adenocarcinoma: Clinical heterogeneity and correlative immunologic analysis
2026-Apr, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 通过整合临床结果与单细胞RNA测序,分析KRAS突变肺腺癌对新辅助免疫治疗反应的异质性和免疫特征 首次在KRAS突变肺腺癌中结合临床预后与单细胞转录组,发现免疫抑制性CD4T_Treg_TNFRSF4亚群和新型耗竭样B细胞(Bex)与Th1细胞的协同网络,并阐明Treg与Th1/Bex平衡决定治疗疗效 单细胞RNA测序样本量较小(13例KRAS突变),且未进行功能验证实验 阐明KRAS突变肺腺癌对新辅助免疫治疗反应差异的免疫决定因素 可切除肺腺癌患者(143例临床队列,48例单细胞测序样本) 数字病理学 肺腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 143例患者(106例KRAS野生型,37例KRAS突变型);单细胞测序48例(13例KRAS突变,35例野生型) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3960 2026-04-24
Single-cell RNA sequencing and high-dimensional flow cytometry reveal distinct peripheral immune landscapes of type 1 autoimmune pancreatitis and pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和高维流式细胞术揭示1型自身免疫性胰腺炎与胰腺导管腺癌的外周免疫景观差异 首次利用单细胞RNA/BCR测序结合流式细胞术,鉴定了AIP患者PBMC中三种新型免疫细胞亚群(IgG4高表达转换记忆B细胞、Tfh细胞、TREM2上调中间单核细胞),并建立了基于这些亚群的诊断列线图 未明确说明,但可能涉及样本量较小(10例AIP患者)及外部验证队列的局限性 阐明AIP的外周免疫特征,区分其与PDAC的免疫差异,并寻找新的生物标志物用于疾病鉴别诊断 1型AIP患者、PDAC患者和健康志愿者的外周血单核细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA/BCR测序(scRNA/BCR-seq),高维流式细胞术 Boruta算法 基因表达数据 10例AIP患者(scRNA/BCR-seq)、13例PDAC患者和11例健康志愿者(公共数据) NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部