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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3881 | 2026-04-12 |
Expanding plant single-cell transcriptomics toward the analysis of cell-type-specific isoforms
2026-Jun, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.03.008
PMID:41963136
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3882 | 2026-06-05 |
Ustekinumab resistance in individuals with ulcerative colitis is associated with an alteration of a subset of proinflammatory mucosal regulatory T cells
2026-Jun-01, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izag059
PMID:41984825
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研究论文 | 探讨乌司奴单抗治疗溃疡性结肠炎患者耐药性与黏膜调节性T细胞亚群改变的关系 | 通过单细胞RNA测序、T细胞受体测序、多参数流式细胞术和空间转录组学等多模态方法,首次揭示了黏膜调节性T细胞表型和转录特征与乌司奴单抗治疗响应性的关联,并鉴定出OX40、GITR、GPR15和PIM2等关键分子作为潜在生物标志物 | 样本量较小,亚组分析中仅部分患者进行了多参数流式细胞术和空间转录组学检测,研究仅在单中心进行,需要更大规模多中心队列验证 | 阐明与乌司奴单抗治疗响应性相关的黏膜免疫变化,为治疗决策提供指导 | 接受乌司奴单抗治疗的溃疡性结肠炎患者 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,多参数流式细胞术,空间转录组学,免疫组化 | NA | 基因表达数据,图像 | 接受乌司奴单抗治疗的患者队列,包括响应者和非响应者,具体数量未明确提及 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'文库制备和测序,10x Visium空间转录组学分析 |
| 3883 | 2026-06-05 |
Single-cell transcriptomics reveals a differential response of human bronchial epithelial cell-types to cadmium chloride
2026-Jun, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-026-04344-9
PMID:41807791
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示人支气管上皮细胞类型对氯化镉的差异化反应 | 首次利用单细胞RNA测序技术在高分辨率下解析人支气管上皮不同细胞类型对有毒化合物氯化镉的急性反应,发现了传统批量分析无法捕捉的细胞类型特异性转录特征 | 未提及具体局限性 | 评估单细胞转录组学在分析复杂组织对有毒化合物急性反应中的附加价值 | 人支气管上皮细胞(纤毛细胞、分泌细胞、基底细胞) | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自3名独立供体的完全分化黏膜纤毛上皮,共18,255个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3884 | 2026-06-05 |
Epigenetically controlled endothelial promyelocytic leukemia drives liver inflammation and fibrosis
2026-Jun-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196730
PMID:41842990
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研究论文 | 发现表观遗传调控的LSEC中PML/BRD4通过相分离驱动促炎信号,促进肝脏炎症和纤维化 | 首次鉴定表观遗传异常的LSEC通过PML/BRD4相分离激活超级增强子,放大促炎血管分泌信号,启动肝脏炎症与纤维化级联反应 | 未提及具体限制 | 阐明肝脏损伤初期触发免疫细胞募集的特定分子事件 | 肝脏窦内皮细胞及单核细胞来源的巨噬细胞 | NA | 肝脏纤维化 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠纤维化肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3885 | 2026-06-05 |
Transcription factor 21 deletion from podocyte precursors as a model for congenital nephrotic syndrome
2026-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00490.2025
PMID:42090190
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研究论文 | 通过从足细胞前体删除转录因子21建立先天性肾病综合征小鼠模型,并利用单细胞RNA测序分析肾脏损伤机制 | 首次通过从早期足细胞前体删除转录因子21建立先天性肾病综合征小鼠模型,并生成了全面的肾脏单细胞转录组数据集 | 未明确说明限制 | 研究先天性肾病综合征中肾小球和肾小管间质变化机制 | 转录因子21基因敲除小鼠 | 机器学习 | 儿童肾病综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 转录因子21基因敲除小鼠及其对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3886 | 2026-06-05 |
Engineered Pericyte-Targeted Extracellular Vesicles Protect Against Hypoperfusion-Induced Cognitive Impairment and Vascular Demyelination
2026-Jun, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70319
PMID:42226579
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研究论文 | 开发了一种生物正交方法,工程化改造携带环状NGR肽的细胞外囊泡,实现选择性靶向周细胞,并在慢性脑低灌注小鼠模型中验证了其保护作用 | 首次利用生物正交方法将环状NGR肽功能化修饰到细胞外囊泡上,实现选择性靶向CD13表达的脑周细胞,为血管性认知障碍提供新的周细胞靶向治疗策略 | 未提及 | 开发靶向周细胞的细胞外囊泡治疗策略,用于保护低灌注诱导的认知障碍和血管脱髓鞘 | 周细胞靶向的工程化细胞外囊泡(cNGR-EVs) | 数字病理学 | 血管性认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 3887 | 2026-06-05 |
Endothelial origin of hematopoietic stem cells: Insights from new technologies and unresolved questions
2026-06, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2026.103676
PMID:42102418
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综述 | 利用新技术综述造血干细胞源自血源性内皮细胞的证据及未解决问题 | 通过整合单细胞转录组学、低输入表观基因组学和单细胞功能分析等高精度技术的最新研究,系统总结了HSC生成性HEC的富集标记、功能特性和发育轨迹,并阐述了从主动脉动脉内皮细胞到前造血干细胞的多个精细细胞阶段的连续特性 | 未提及具体局限性 | 总结和解决关于造血干细胞起源中血源性内皮细胞的性质、起源和命运的争议 | 造血干细胞生成性血源性内皮细胞及其前体细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、低输入表观基因组学、单细胞功能分析 | NA | 基因表达数据、表观基因组数据、单细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 3888 | 2026-06-05 |
Establishment of a dendritic cell differentiation system faithfully recapitulating multiple DC subsets in autoimmune disease
2026-Jun-01, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2026.103658
PMID:42235377
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研究论文 | 建立一种在自身免疫性疾病中忠实再现多种树突状细胞亚群的分化系统 | 首次构建了在富含干扰素的自身免疫样微环境中重建所有主要人类树突状细胞亚群的体外平台,并揭示了干扰素信号如何塑造树突状细胞谱系特化与功能极化 | 未在论文标题和摘要中明确提及局限性 | 建立生理相关的体外平台以重现自身免疫性疾病中多种树突状细胞亚群,并定义干扰素信号如何影响树突状细胞谱系特化和功能分化 | 人类树突状细胞及其亚群 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序、多色流式细胞术 | NA | 转录组数据、流式细胞术数据 | 脐带血来源的CD34⁺造血祖细胞(时间点包括分化过程中的3个时点) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3889 | 2026-06-05 |
Oral epithelial barrier: Gatekeeper of mucosal immunity and driver of disease
2026-May-30, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2026.128568
PMID:42235250
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综述 | 探讨口腔上皮屏障作为黏膜免疫守门人和疾病驱动因子的角色,综述其在健康和疾病中的免疫调控机制 | 提出了上皮炎性记忆的新概念,即上皮干细胞和前体细胞保留过去炎症刺激的持久印记,为理解牙周炎等慢性疾病提供了新视角 | NA | 综述口腔上皮屏障在黏膜免疫和口腔炎症疾病中的核心作用及靶向治疗潜力 | 口腔黏膜上皮及其免疫调控机制 | NA | 口腔炎症性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3890 | 2026-06-05 |
Ndufa4l2 drives the pathological activation of Müller cells in ischemic retinopathy via the PI3K/AKT signaling pathway
2026-May-30, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156567
PMID:42235340
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research paper | 该研究揭示了Ndufa4l2通过PI3K/AKT信号通路驱动缺血性视网膜病变中Müller细胞病理活化的机制 | 首次鉴定Ndufa4l2为缺血性视网膜病变中Müller细胞病理活化的关键内在驱动因子,并阐明其通过PI3K/AKT信号通路发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型,需要在人体组织或临床样本中进一步验证 | 探究Ndufa4l2在Müller细胞病理活化中的作用及分子机制 | 缺血性视网膜病变中的Müller细胞 | machine learning | 缺血性视网膜病变 | scRNA-seq, CRISPR/Cas9 | NA | 单细胞转录组数据 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3891 | 2026-06-05 |
Pan-cancer spatial atlas of tertiary lymphoid structures
2026-05-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adz2742
PMID:42207882
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研究论文 | 通过分析12种癌症类型的空间转录组数据,构建泛癌三级淋巴结构图谱,并表征其空间结构和成熟状态 | 首次构建泛癌三级淋巴结构空间图谱,结合超高通量单细胞空间分析揭示成熟过程中的细胞生态位重塑,并开发AI框架从H&E染色图像预测TLS成熟状态 | 未明确提及具体局限性,但可能依赖于公共数据集的可推广性及AI模型的泛化能力 | 系统解析三级淋巴结构的空间组织、成熟状态及其在不同癌症类型中的临床相关性 | 12种癌症类型的空间转录组样本及独立治疗队列的病理图像 | 数字病理学, 计算机视觉 | 癌症(泛癌),肺癌,前列腺癌等 | 空间转录组学, 单细胞空间分析, 组织病理图像AI分析 | 人工智能框架(具体类型未明确,可能为深度学习模型) | 图像,空间转录组数据 | 12种癌症类型的空间转录组样本,TCGA及多个独立治疗队列 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞多组学 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium用于空间转录组分析,10x Chromium用于超高通量单细胞空间分析 |
| 3892 | 2026-06-05 |
Acute wood smoke exposure is associated with cell-specific hippocampal transcriptomic responses in an accelerated ovarian failure mouse model
2026-May-28, Neurotoxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.neuro.2026.103476
PMID:42214760
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研究论文 | 使用加速卵巢衰竭小鼠模型,研究急性木材烟雾暴露对海马细胞特异性转录组反应的影响 | 首次结合空间转录组学和加速卵巢衰竭模型,揭示围绝经期激素状态如何放大木材烟雾暴露引起的海马细胞特异性转录组变化 | 未提及具体局限性 | 探究围绝经期样激素状态是否加剧急性木材烟雾暴露对海马的反应 | 雌性C57BL/6小鼠,使用4-乙烯基环己烯二环氧化物诱导的加速卵巢衰竭模型 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 每组4个海马切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台,用于分析海马组织切片 |
| 3893 | 2026-06-05 |
Current evidence on the cell of origin of meningiomas disputes the arachnoid cap cell dogma
2026-05-21, Acta neurochirurgica
IF:1.9Q2
DOI:10.1007/s00701-026-06908-1
PMID:42165909
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综述 | 重新审视脑膜瘤起源的传统观点,质疑蛛网膜帽细胞假说,并提出基于单细胞转录组学等多组学证据的更复杂异质性起源 | 综合单细胞转录组学、空间测序、发育生物学和转基因动物模型的新证据,挑战统治百年的蛛网膜帽细胞假说,提出脑膜瘤起源的异质性和区域性 | 仅为一篇小型综述,缺乏原始实验数据验证,也可能受限于历史研究样本和传统技术的偏见 | 批判性评估脑膜瘤细胞起源的传统观点,推动基于多组学和发育生物学的更准确分类和治疗策略 | 脑膜瘤的细胞起源,包括蛛网膜帽细胞、成纤维细胞样或区域特异的脑膜祖细胞 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组学、空间测序、多组学、发育生物学、转基因动物模型 | NA | 分子和蛋白质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 3894 | 2026-06-05 |
Multiomic study of cutaneous T-cell lymphoma reveals single-cell clonal evolution in progression and therapy resistance
2026-May-21, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029012
PMID:41662591
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研究论文 | 通过多组学分析揭示皮肤T细胞淋巴瘤在疾病进展和治疗耐药中的单细胞克隆演化 | 首次以单细胞分辨率结合外显子组、全基因组、表观基因组、T细胞受体和RNA测序等多组学数据,全面解析CTCL的克隆演化机制,发现Rho GTPase通路失调在CTCL进展中的新作用 | 未提及具体局限性 | 明确CTCL在单细胞水平上的进展机制,识别临床有用的生物标志物和治疗靶点 | 来自34名CTCL患者的99份临床标注的系列皮肤、外周血和淋巴结样本 | 机器学习 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 外显子组测序、全基因组测序、表观基因组测序、批量RNA测序、单细胞T细胞受体测序、单细胞RNA测序、CUT&RUN | NA | 基因组数据、转录组数据、表观基因组数据 | 34名患者的99份样本 | Illumina | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 使用Illumina NovaSeq进行高通量测序 |
| 3895 | 2026-06-05 |
Single-fiber morphometry and spatial transcriptomics reveal selective oxidative muscle fiber atrophy in non-metastatic breast cancer
2026-May-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.05.11.26351978
PMID:42238445
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研究论文 | 通过单纤维形态测量和空间转录组学揭示非转移性乳腺癌中选择性氧化肌纤维萎缩 | 首次将空间转录组学应用于癌症患者骨骼肌研究,并建立了结合单纤维形态测量和空间转录组学的综合框架 | 信息未提供 | 探究非转移性乳腺癌相关骨骼肌病理变化及其在癌症相关疲劳中的作用 | 非转移性乳腺癌患者和健康对照者的胸大肌活检样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单纤维形态测量, 空间转录组学 | NA | 图像, 空间转录组数据 | 非转移性乳腺癌患者和健康对照者的胸大肌活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3896 | 2026-06-05 |
A harmonized single-cell RNA-seq atlas of human localized and metastatic prostate cancers and benign tissues
2026-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.18.725966
PMID:42239107
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3897 | 2026-06-05 |
Accelerated amyloid neurodegeneration in HIV-1-infected APP-KI Alzheimer's disease mice
2026-May-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.16.725620
PMID:42239074
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研究论文 | 创建了一种新型APP敲入AD小鼠模型,研究HIV-1复制对阿尔茨海默病理的影响 | 首次构建了NOG/APP KM670,671NL /IL-34 (hNAIL)小鼠模型,允许同时研究HIV-1复制和AD病理 | 未明确提及 | 探究HIV-1感染与阿尔茨海默病病理之间的机制联系 | HIV-1感染的APP敲入阿尔茨海默病小鼠 | 机器学习 | 老年疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 4月龄CD34+人类细胞重建小鼠感染HIV-1 ADA毒株 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3898 | 2026-06-05 |
AKT3-Driven Epithelial-Mesenchymal Plasticity Governs Ovarian Metastasis in Colorectal Cancer via Tumor Microenvironment Remodeling
2026-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1718
PMID:41662163
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量转录组分析,揭示AKT3驱动的上皮-间充质可塑性通过肿瘤微环境重塑调控结直肠癌卵巢转移的机制 | 首次鉴定AKT3+上皮间充质转化样细胞作为结直肠癌卵巢转移起始细胞,并揭示其与癌相关成纤维细胞的互作形成前馈环路驱动转移 | 未提及 | 阐明结直肠癌卵巢转移的生物学机制及潜在治疗靶点 | 结直肠癌卵巢转移患者的肿瘤样本、异种移植模型、患者来源类器官 | 机器学习 | 结直肠癌,卵巢转移 | 单细胞RNA测序,批量转录组分析,多重免疫荧光染色,异种移植模型,患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA测序数据,批量转录组数据,多重免疫荧光图像 | 35名患者的155,163个单细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 3899 | 2026-06-05 |
The modified Zuojin formula (SQQT) associates ILC2-linked JAK-2/STAT5/c-Myc cascade and gastric metaplasia regression
2026-May-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121345
PMID:41663001
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研究论文 | 改良左金方通过ILC2介导的JAK-2/STAT5/c-Myc通路促进胃化生消退的机制研究 | 首次揭示了改良左金方通过调控ILC2激活及JAK-2/STAT5/c-Myc通路这一新机制来治疗胃化生 | 未明确说明研究局限性,可能包括样本量有限或动物模型与临床转化的差异 | 研究改良左金方在免疫微环境中对胃化生治疗的机制 | 胃化生患者及他莫昔芬诱导的胃化生小鼠模型 | 数字病理学 | 胃化生 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胃化生患者样本和小鼠模型,具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3900 | 2026-06-05 |
Accurate classification of ependymomas and medulloblastomas using Raman spectroscopy and pilot transcriptomic profiling
2026-May-05, Spectrochimica acta. Part A, Molecular and biomolecular spectroscopy
DOI:10.1016/j.saa.2026.127532
PMID:41653757
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研究论文 | 利用拉曼光谱和后颅窝室管膜瘤与髓母细胞瘤的转录组谱分析实现准确分类 | 首次将拉曼光谱与空间转录组学结合,用于区分后颅窝室管膜瘤和髓母细胞瘤,并在冷冻和FFPE标本中验证了分类模型的准确性 | 样本量较小(34份标本),患者级别的性能需在更大队列中验证,且为回顾性研究 | 评估拉曼光谱在区分后颅窝室管膜瘤和髓母细胞瘤中的准确性,并探索相关生化差异的生物学背景 | 后颅窝室管膜瘤和髓母细胞瘤的冷冻及FFPE组织标本 | 数字病理学 | 脑肿瘤(室管膜瘤和髓母细胞瘤) | 拉曼光谱,空间转录组学 | 主成分分析-支持向量机分类器 | 光谱数据,转录组数据 | 34份标本(21份冷冻,13份FFPE) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium In Situ v2 FFPE workflow | 10x Genomics Xenium In Situ v2 FFPE工作流程 |