单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 33880 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-12-08 |
Platelet CKB as a potential contributor to serum creatine kinase abnormalities and metastasis in cancer patients
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01912-8
PMID:41217562
|
研究论文 | 本研究通过整合回顾性癌症队列、血清CK同工酶电泳及qRT-PCR分析，探讨了癌症患者血清CK-MB活性异常升高的分子机制及其与肿瘤生物学的关系 | 首次揭示了血小板CKB作为血清CK异常和癌症转移的潜在贡献者，并开发了整合CK-BB和线粒体CK亚型的复合指数CK-Sub，用于评估肿瘤进展 | 研究主要基于回顾性队列和公共数据集，需要前瞻性研究验证；样本量虽大但集中于结直肠癌和肺癌，其他癌症类型代表性有限 | 探究癌症患者血清CK-MB活性异常升高的分子起源及其与肿瘤生物学特性的关联 | 癌症患者（特别是结直肠癌和肺癌患者）的血清、血小板样本及公共RNA测序数据集 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | qRT-PCR, RNA测序, 单细胞RNA测序, 血清CK同工酶电泳 | NA | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据, 电泳数据, qRT-PCR数据 | 回顾性癌症队列1,651例患者，配对血清和血小板样本 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 362 | 2025-12-08 |
Single-cell multi-omics of ribosome biogenesis-related genes reveals immune microenvironment in psoriasis and constructs a diagnostic model
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01916-4
PMID:41217566
|
研究论文 | 本研究通过整合批量测序和单细胞测序数据，系统分析了核糖体生物发生相关基因在银屑病中的作用，构建了一个高精度的诊断模型，并揭示了其与免疫微环境的相互作用 | 首次系统整合批量测序和单细胞测序转录组数据来表征银屑病中核糖体生物发生相关基因的分子网络，构建了具有临床转化潜力的诊断模型，并阐明了Tregs失衡和STAT1介导的炎症极化的机制基础 | 未在文中明确说明，但可能包括样本量、数据集的异质性或模型的外部验证需求 | 阐明核糖体生物发生相关基因在银屑病中的分子网络，构建诊断模型，并研究其与免疫微环境的相互作用 | 银屑病患者的多中心转录组数据集 | 生物信息学 | 银屑病 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 多中心数据集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 363 | 2025-12-08 |
Identification and external validation of a prognostic signature based on MAPK-related genes to evaluate survival prognosis and treatment efficacy in lung adenocarcinoma
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01925-3
PMID:41217578
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，构建了一个基于MAPK相关基因的预后特征，用于评估肺腺癌的生存预后和治疗效果 | 首次结合孟德尔随机化分析和随机生存森林算法，从多组学角度构建并验证了MAPK相关基因的预后模型，为肺腺癌提供了新的风险分层和治疗指导工具 | 模型主要基于回顾性数据，需要前瞻性临床研究进一步验证其在实际临床应用中的效果 | 构建一个稳健的MAPK相关基因特征，以增强肺腺癌的风险分层和治疗指导 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 转录组测序、孟德尔随机化分析、随机生存森林算法、RT-qPCR、单细胞RNA测序 | 随机生存森林 | 基因表达数据 | TCGA-LUAD队列及三个独立的GEO队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 364 | 2025-12-08 |
Tertiary lymphoid organ-associated transcriptomic features predict rejection and outcome in kidney transplantation: integrative analysis and experimental validation
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01899-2
PMID:41217598
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，揭示了肾移植中三级淋巴器官（TLO）相关的转录组特征，并建立了与排斥反应和移植结局相关的预测模型 | 首次构建了将TLO特征与临床结局关联的综合性多组学框架，并识别出具有诊断和预后效用的TLO相关基因生物标志物 | 研究主要基于回顾性队列数据，需要在更大规模的前瞻性队列中进行验证 | 表征肾移植中TLO相关的免疫景观，并研究其与移植物排斥反应和临床结局的关联 | 肾移植患者的移植物活检样本和移植排斥大鼠模型 | 生物信息学 | 肾移植排斥 | 多组学分析，包括bulk转录组测序和单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解（NMF），多种机器学习算法集成模型 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 多个肾移植队列的bulk转录组数据集和大鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 365 | 2025-12-08 |
Exploring the prognostic value of T cell exhaustion and mitochondrial dysfunction related genes in breast cancer through bioinformatics analysis and RT-qPCR validation
2025-Nov-06, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01888-5
PMID:41193924
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和RT-qPCR验证，探索了与T细胞耗竭和线粒体功能障碍相关的基因在乳腺癌中的预后价值 | 首次整合T细胞耗竭和线粒体功能障碍相关基因构建乳腺癌预后模型，并结合单细胞转录组学分析免疫微环境 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步的前瞻性临床验证 | 识别乳腺癌中与T细胞耗竭和线粒体功能障碍相关的预后基因，并构建预后模型 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RT-qPCR, 单细胞转录组学, 生物信息学分析 | 回归分析, Cox回归, 风险模型 | 转录组数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 366 | 2025-12-08 |
TRIB3 promotes endometrial cancer progression through interacting with E2F1 and enhancing PKM2-mediated tumor glycolysis
2025-Nov, Gynecologic oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.ygyno.2025.09.008
PMID:40997650
|
研究论文 | 本研究探讨了TRIB3在子宫内膜癌中的表达、功能及其通过稳定E2F1和增强PKM2转录促进肿瘤糖酵解的分子机制 | 揭示了TRIB3通过稳定E2F1和增强PKM2转录促进子宫内膜癌糖酵解的新机制，并首次鉴定出吲达帕胺作为TRIB3的化合物抑制剂 | 研究主要基于体外和体内实验，缺乏大规模临床验证，且TRIB3抑制剂吲达帕胺的临床转化潜力需进一步评估 | 探索TRIB3在子宫内膜癌中的作用及其潜在分子机制 | 子宫内膜癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、qRT-PCR、Western blot、共免疫沉淀、双荧光素酶报告基因、免疫荧光双染色、泛素化实验、染色质免疫沉淀 | NA | 单细胞RNA测序数据、TCGA数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 367 | 2025-12-08 |
FLT3LG as an inflammatory hub bridging tumor immune surveillance to therapy response in breast cancer
2025-Oct-29, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01889-4
PMID:41152656
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和炎症基因网络分析，发现FLT3LG作为乳腺癌中关键的炎症枢纽，连接肿瘤免疫监视与治疗反应，并评估其作为预后和治疗靶点的潜力 | 首次基于单细胞RNA测序和炎症基因网络分析，将FLT3LG识别为乳腺癌中连接免疫监视与治疗反应的关键炎症枢纽，并揭示其与特定基因突变模式（如PIK3CA和TP53）及免疫检查点抑制剂反应的关联 | 研究主要基于相关性分析，缺乏直接的体内或体外功能验证实验来证实FLT3LG的因果作用机制 | 探索乳腺癌中炎症驱动的免疫失调机制，并寻找新的预后标志物和治疗靶点 | 乳腺癌患者队列及其肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，基因网络分析 | NA | RNA测序数据，基因表达数据 | 多个患者队列（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 368 | 2025-12-08 |
Positionally distinct interferon-stimulated dermal immune-acting fibroblasts promote neutrophil recruitment in Sweet syndrome
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.05.029
PMID:40516577
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术，揭示了Sweet综合征皮肤中干扰素激活的成纤维细胞在促进中性粒细胞招募中的关键作用 | 首次在Sweet综合征中识别出位置不同的干扰素激活成纤维细胞亚群，并阐明其通过I型干扰素识别和趋化因子表达驱动中性粒细胞浸润的机制 | 研究基于存档临床样本，样本量有限；功能验证主要在体外细胞培养中进行，缺乏体内模型验证 | 阐明Sweet综合征的细胞和分子景观，特别是中性粒细胞浸润的机制 | Sweet综合征、坏疽性脓皮症患者及健康对照的皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | 转录组数据、空间定位数据 | 存档临床皮肤样本（Sweet综合征、坏疽性脓皮症患者及健康对照） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 369 | 2025-12-08 |
Decoding Cellular Communication Networks and Signaling Pathways in Bone, Skeletal Muscle, and Bone-Muscle Crosstalk Through Spatial Transcriptomics
2025-Jun-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6701121/v1
PMID:40585205
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术，解码了小鼠股骨及邻近骨骼肌中的细胞间通讯网络和信号通路，揭示了骨-肌肉互作的关键分子机制 | 首次提供了骨与骨骼肌之间细胞间通讯的空间解析图谱，识别了关键的配体-受体对和信号通路，为理解骨-肌肉互作提供了新的分子见解 | 研究局限于小鼠模型，且空间转录组学在骨-肌肉相互作用研究中的应用仍有限，需要进一步验证和扩展 | 研究骨与骨骼肌之间的细胞通讯网络和信号通路，以理解其互作机制及相关疾病 | 小鼠的股骨和邻近的骨骼肌组织 | 空间转录组学 | 骨质疏松症、肌肉减少症、代谢综合征 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 370 | 2025-12-08 |
Targeting the Epigenetic Regulator CBX5 Promotes Fibroblast Metabolic Reprogramming and Inhibits Lung Fibrosis
2025-Jun, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0255OC
PMID:39642371
|
研究论文 | 本研究揭示了表观遗传调控因子CBX5在肺纤维化中通过调节成纤维细胞代谢重编程促进其活化，并探讨了靶向CBX5作为治疗策略的潜力 | 首次发现CBX5作为连接表观遗传改变与成纤维细胞代谢异常的关键因子，在特发性肺纤维化（IPF）进展中驱动成纤维细胞持续活化 | 研究主要基于体外细胞模型和动物实验，临床转化潜力需进一步验证；CBX5调控代谢的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究表观遗传调控因子CBX5如何通过调节成纤维细胞代谢促进肺纤维化进展 | 肺成纤维细胞、特发性肺纤维化（IPF）患者肺组织、博来霉素诱导的肺损伤模型 | 分子生物学与病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组化分析、代谢评估 | NA | RNA测序数据、免疫组化图像、代谢数据 | 未明确样本数量，但包括IPF患者肺组织、肺外植体及细胞模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 371 | 2025-12-08 |
Decoding the distinct immune landscape and possible regulatory mechanisms of autoimmune hepatitis through integrated single-cell and bulk RNA sequencing
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335605
PMID:41343465
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序，解码了自身免疫性肝炎的独特免疫景观和可能的调控机制 | 整合单细胞和批量RNA测序数据，识别了AIH中失调的免疫细胞群、信号通路及潜在治疗靶点 | 数据来源于公共数据库，可能受样本来源和测序技术限制，未进行实验验证 | 解码自身免疫性肝炎的免疫景观和调控机制 | 自身免疫性肝炎患者 | 数字病理学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 372 | 2025-12-08 |
Single cell RNA sequencing reveals a dysbalance of proinflammatory vs. immunosuppressive dendritic cells in mouse and human aortic aneurysms
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1713030
PMID:41346489
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠和人类主动脉瘤中促炎性与免疫抑制性树突状细胞的失衡状态 | 首次通过单细胞RNA测序整合分析，系统表征了主动脉瘤中树突状细胞的异质性，并定义了新的DC3亚型及其促炎表型 | 研究主要基于动物模型数据向人类疾病转化，需要进一步的人类样本验证 | 探究树突状细胞在主动脉瘤发病机制中的具体作用 | 小鼠主动脉瘤模型和人类主动脉瘤组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个小鼠AA模型及人类AA样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 373 | 2025-12-08 |
Comprehensive analysis of the role of diverse programmed cell death patterns in sepsis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1685533
PMID:41346577
|
研究论文 | 本研究通过整合公共转录组数据与独立验证队列，系统分析了脓毒症中多种程序性细胞死亡模式的作用，并开发了诊断风险评分 | 首次系统整合公共微阵列、单细胞转录组数据及独立高通量测序验证，全面揭示了脓毒症中铁死亡、双硫死亡、NETosis和胞吞性死亡四种关键失调的PCD通路，并确定了单核细胞作为整合PCD、代谢重编程和免疫通讯的核心枢纽 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质或功能层面的直接验证；样本量相对有限，且部分数据来自公共数据库，可能存在批次效应 | 系统表征脓毒症中多样化的程序性细胞死亡模式及其临床相关性，以寻找新的诊断标志物和治疗靶点 | 脓毒症患者和健康对照的转录组数据（包括公共数据集和独立队列） | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 微阵列 | LASSO回归 | 转录组数据 | 公共数据集：81名对照，165名脓毒症患者；单细胞数据集：4名对照，4名早期脓毒症患者，共52,315个细胞；外加一个独立的RNA-seq验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 374 | 2025-12-08 |
R3HDM4 influences kidney renal clear cell carcinoma progression, immune modulation, and potential links to the IGSF8 immune checkpoint
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1722358
PMID:41346582
|
研究论文 | 本研究探讨了R3HDM4基因在肾透明细胞癌中的致癌作用、免疫调节功能及其与免疫检查点IGSF8的潜在联系 | 首次通过整合多组学数据系统评估R3HDM4在KIRC中的预后价值，并发现其通过调控EMT和免疫微环境影响肿瘤进展，同时揭示了与IGSF8免疫检查点的潜在关联 | IGSF8在免疫检查点调控中的作用仍属推测，需要进一步实验验证；研究主要基于生物信息学分析，临床样本验证相对有限 | 阐明R3HDM4在肾透明细胞癌发病机制中的作用，探索其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 肾透明细胞癌组织样本、癌细胞系、肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、Western印迹、RT-qPCR、siRNA敲低 | NA | 基因表达数据、临床数据、DNA甲基化数据、免疫浸润数据 | 来自TCGA、GEO、ArrayExpress、ICGC等多个数据库的KIRC样本数据，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 375 | 2025-12-08 |
Disc inflammation and intercellular communication in shaping the immune microenvironment of intervertebral disc degeneration
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1719293
PMID:41346614
|
研究论文 | 本研究通过整合多组转录组和单细胞RNA-seq数据，结合生物信息学分析和体外验证，识别了与椎间盘退变相关的关键生物标志物及其免疫调控作用 | 整合了多种生物信息学方法（如SHAP、孟德尔随机化、CellChat分析）和单细胞RNA-seq数据，系统性地揭示了MMP9、HPGD和UCHL1作为IDD关键生物标志物的作用，并首次强调了MIF信号通路在髓核细胞与免疫细胞互作中的关键角色 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证，缺乏体内实验或临床样本的广泛验证，可能限制其直接临床转化性 | 探究椎间盘退变的分子和免疫机制，识别诊断和治疗潜在靶点 | 椎间盘退变相关的基因和免疫细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA-seq, Western blot | ANN, LASSO, 随机森林, SVM-RFE | 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 376 | 2025-12-08 |
Myeloid PDLIM2 repression as a common mechanism of infection susceptibility in lung diseases
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1669117
PMID:41346604
|
研究论文 | 本文探讨了PDLIM2在肺部疾病中的抑制作用及其与感染易感性的关联 | 揭示了PDLIM2在肺部疾病中的广泛抑制作用，特别是在髓系细胞中，作为驱动COPD、ILD/IPF和肺癌的共同机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本数据有限，且未详细探讨PDLIM2抑制的具体分子机制 | 研究PDLIM2在慢性阻塞性肺病（COPD）和间质性肺病（ILD/IPF）中的作用及其与感染易感性的关系 | 人类肺部样本、PDLIM2条件敲除小鼠和野生型小鼠 | 生物医学研究 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、组织学分析、体外吞噬和中性粒细胞胞外陷阱（NET）形成实验 | 条件敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织学图像、单细胞RNA测序数据 | 人类肺部样本（具体数量未明确）、PDLIM2条件敲除小鼠和野生型小鼠（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 377 | 2025-12-08 |
Prognostic differential subpopulation classification and immunotherapy response prediction in pancreatic cancer patients based on the gene features of necrotizing apoptosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1592231
PMID:41346619
|
研究论文 | 本研究基于坏死性凋亡相关基因特征，对胰腺癌患者进行预后亚群分类并预测免疫治疗反应 | 通过多组学数据（包括单细胞数据集、孟德尔随机化和空间转录组学分析）揭示CHST11作为关键预后生物标志物与坏死性凋亡及胰腺癌恶性预后的关联 | NA | 探索坏死性凋亡相关基因在胰腺癌中的预后意义 | 胰腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 聚类分析、差异表达分析、Spearman相关分析、孟德尔随机化、空间转录组学 | 预后模型 | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 378 | 2025-12-08 |
Integrated multi-omics reveals GABARAP-mediated mitophagy and pyruvate metabolism as key drivers of osteosarcoma progression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680554
PMID:41346635
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多组学分析，揭示了GABARAP介导的线粒体自噬与丙酮酸代谢在骨肉瘤进展中的关键驱动作用 | 首次系统性地将GABARAP、线粒体自噬和丙酮酸代谢在骨肉瘤中联系起来，并揭示了其通过代谢适应和免疫逃逸促进肿瘤进展的机制 | 研究主要基于公共数据集和体外实验，缺乏体内模型验证；样本量有限，且未涉及治疗干预的临床前评估 | 探究骨肉瘤中细胞异质性、肿瘤微环境特征以及线粒体自噬与代谢的相互作用机制 | 骨肉瘤细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞（T细胞、NK细胞、Tregs、M2巨噬细胞） | 生物信息学、肿瘤生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合分析、体外功能实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、公共基因表达数据集 | 多个公共数据集（GSE162454, GSE237070, TARGET, GSE21257, GSE32981） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 379 | 2025-12-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Peritoneal Environment and New Insights into Fibrosis in a Continuous Ambulatory Peritoneal Dialysis Patient: A Longitudinal Self-Controlled Study from Dialysis Initiation to 3-Year Follow-Up
2025 Jan-Dec, Kidney diseases (Basel, Switzerland)
DOI:10.1159/000548294
PMID:41347053
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了一名连续非卧床腹膜透析患者从透析开始到3年随访期间腹膜透析流出液中的细胞动态变化，揭示了腹膜纤维化的机制 | 首次在连续非卧床腹膜透析患者中采用纵向自对照设计，利用单细胞RNA测序技术从透析起始至3年随访期间动态解析腹膜微环境及纤维化进程 | 研究仅基于单一样本，样本量较小，可能限制结果的普遍性 | 探究长期腹膜透析中腹膜微环境的动态变化及其与腹膜纤维化的关系 | 连续非卧床腹膜透析患者的腹膜透析流出液中的免疫细胞和腹膜间皮细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1名连续非卧床腹膜透析患者在透析起始和3年随访两个时间点的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 380 | 2025-12-08 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
|
研究论文 | 本文评估了Element Biosciences的亲和碱基化学测序技术在单细胞RNA-seq文库中准确测序通过同聚物引物位点的能力，及其对多聚腺苷酸化位点精确量化的影响 | 首次利用Element Aviti仪器的亲和碱基化学测序技术，成功测序通过单细胞RNA-seq中的胸腺嘧啶同聚物，实现配对末端比对以直接独立分配读取到多聚腺苷酸化位点 | 与单端比对相比，配对末端比对并未一致提高读取映射率，且存在低水平伪影，需调整适配器修剪和比对工作流程 | 改进单细胞RNA-seq文库的表征，特别是多聚腺苷酸化位点的精确量化 | 单细胞RNA-seq文库中的cDNA片段，包括同聚物引物位点和后续cDNA序列 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq, 亲和碱基化学测序 | NA | 序列数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti, Illumina测序平台 | Element Aviti仪器用于亲和碱基化学测序，Illumina平台用于标准测序比较 |