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当前共找到 35760 篇文献，本页显示第 3761 - 3780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 3761 | 2025-11-28 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals cellular and molecular changes in EGFR-positive lung adenocarcinoma before and after Furmonertinib treatment
2025-Nov-27, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01706-y
PMID:41307822
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示EGFR阳性肺腺癌在福莫替尼治疗前后的细胞和分子变化 | 首次在EGFR阳性肺腺癌中整合治疗前后配对样本的单细胞转录组数据，系统分析福莫替尼对肿瘤微环境的重塑作用 | 样本量有限，耐药机制仍需进一步验证 | 探究福莫替尼治疗EGFR阳性肺腺癌的细胞分子机制及肿瘤微环境变化 | EGFR阳性肺腺癌患者的肿瘤组织及癌旁组织 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | EGFR阳性肺腺癌患者治疗前后配对样本（数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3762 | 2025-11-28 |
Stem cell specification and niche formation in developing incisor requires actomyosin forces
2025-Nov-26, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf074
PMID:41296682
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研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞RNA测序揭示了小鼠门牙发育过程中干细胞特化和生态位形成的时序关系 | 发现肌动球蛋白网络产生的收缩张力在限制Sox2+干细胞定位和维持其干性中的关键作用 | 研究仅限于小鼠门牙发育模型，未验证其他牙齿类型或物种 | 探究牙齿发育过程中干细胞特化与生态位形成的时序关系和机制 | 小鼠门牙发育过程中的上皮干细胞 | 发育生物学 | NA | 遗传谱系追踪, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | Sox2CreERT2/+; R26RmT/mG和Sox2CreERT2/+; R26RtdT/+胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3763 | 2025-11-28 |
DBP: Adaptive and Interpretable Factor Analysis for Single-cell RNA-seq Data with Deep Beta Processes
2025-Nov-26, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf117
PMID:41298306
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研究论文 | 提出一种基于深度Beta过程的单细胞RNA-seq数据自适应可解释因子分析方法 | 通过stick-breaking Beta过程实现因子数量的自适应选择，并采用对抗学习策略进行批次校正 | NA | 开发自适应且可解释的因子分析方法用于单细胞转录组数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序 | 深度概率框架，Beta过程 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3764 | 2025-11-28 |
Differential expression of viral entry protein neuropilin 1 (NRP1) and neuropilin 2 (NRP2) in fatal COVID-19
2025-Nov-25, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01384-25
PMID:41159753
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研究论文 | 本研究分析了致命性COVID-19病例中病毒进入蛋白神经纤毛蛋白1和2的表达差异及其与SARS-CoV-2刺突蛋白的结合特性 | 首次系统比较NRP1和NRP2在致命COVID-19组织中的表达分布，并发现它们与SARS-CoV-2刺突蛋白片段具有不同的结合特性 | 样本量有限（n=20），且仅针对致命病例，可能无法代表轻中度COVID-19的情况 | 探究神经纤毛蛋白作为SARS-CoV-2辅助受体在COVID-19发病机制中的作用 | 致命COVID-19患者的尸检组织（心脏、肺和血液淋巴器官） | 病理学 | COVID-19 | 免疫组织化学，单细胞RNA测序，空间多重免疫荧光，免疫荧光显微镜 | NA | 组织图像，基因表达数据 | 20例尸检组织 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | CODEX | 空间多重免疫荧光表型分析 |
| 3765 | 2025-11-28 |
Single-cell RNA sequencing highlights the role of epithelial-immune dual features of proximal tubule cells in BK polyomavirus nephropathy
2025-Nov-25, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01394-25
PMID:41055342
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究BK多瘤病毒肾病微环境，发现具有上皮-免疫双重特征的近端肾小管细胞新亚群 | 首次发现IGKC+ PT细胞亚群具有上皮-免疫双重特征，可能通过T细胞耗竭机制促进BKPyVN进展 | NA | 研究BK多瘤病毒肾病的微环境特征，探索新的治疗和诊断方法 | BK多瘤病毒肾病样本和稳定移植肾样本 | 单细胞测序 | 肾病 | 单细胞RNA测序，共免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，尿液样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3766 | 2025-11-28 |
Rheumatoid arthritis synovial fibroblasts modulate T cell activation
2025-Nov-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193054
PMID:41055954
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研究论文 | 本研究揭示了类风湿关节炎滑膜成纤维细胞通过IDO1介导的色氨酸消耗调控T细胞活化的新机制 | 首次发现滑膜成纤维细胞通过IDO1介导的色氨酸消耗诱导T细胞低反应性，并证实其在滑膜微环境中的主导免疫调节作用 | 未明确说明研究样本的具体数量及实验设计的局限性 | 探究类风湿关节炎滑膜成纤维细胞对T细胞活化的调节机制 | 类风湿关节炎患者的滑膜成纤维细胞和T细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3767 | 2025-11-28 |
Multi-omics analysis reveals different cholesterol metabolism subtypes in colorectal cancer
2025-Nov-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03993-z
PMID:41283923
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研究论文 | 通过多组学分析识别结直肠癌中不同的胆固醇代谢亚型及其临床意义 | 首次基于胆固醇代谢相关基因对结直肠癌进行分子分型，并系统揭示不同亚型的肿瘤微环境特征和免疫治疗响应差异 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 识别结直肠癌的胆固醇代谢亚型并揭示其分子和免疫学特征 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 基因组分析 | 无监督聚类 | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | TCGA数据库结直肠癌样本及单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 3768 | 2025-11-28 |
Dose-dependent effects of wheat germ oil and vitamin E on apoptosis and gene expression in breast and cervical cancer cell lines with single-cell RNA-seq profiling
2025-Nov-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-25408-3
PMID:41285842
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析探讨小麦胚芽油和维生素E对乳腺癌和宫颈癌细胞凋亡及基因表达的剂量依赖性影响 | 首次结合单细胞RNA测序技术系统评估小麦胚芽油和维生素E在乳腺癌和宫颈癌细胞中的剂量依赖性抗肿瘤效应 | 仅使用MCF-7和HeLa两种细胞系，缺乏体内实验验证 | 探究天然代谢物在癌症治疗中的潜在应用价值 | MCF-7乳腺癌细胞系和HeLa宫颈癌细胞系 | 单细胞组学 | 乳腺癌,宫颈癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,实时荧光定量PCR | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 两种癌细胞系（MCF-7和HeLa） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3769 | 2025-11-28 |
Integrated scRNA-seq and transcriptome analyses uncover the effects of UBE2H on the immune microenvironment regulation in pancreatic cancer
2025-Nov-24, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04059-4
PMID:41286881
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和转录组分析，揭示了UBE2H在胰腺癌免疫微环境调控中的作用 | 首次在胰腺导管细胞生态位中发现UBE2H+细胞群体，并系统阐明UBE2H通过抑制T细胞功能、损害抗原呈递和激活中性粒细胞胞外诱捕网等方式调控免疫微环境的机制 | NA | 探索胰腺癌'冷'肿瘤形成的关键调控分子及其功能机制 | 胰腺癌样本中的细胞群体，特别是胰腺导管细胞生态位 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, inferCNV分析, 体内实验 | 15基因模型 | 单细胞测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3770 | 2025-11-28 |
Intratumour Ploidy Heterogeneity and Clonal Evolution in Hepatocellular Carcinoma
2025-Nov-24, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.11.015
PMID:41297676
|
研究论文 | 开发了一种新的高通量原位定量数字病理学方法评估肝细胞癌倍性，揭示了倍性异质性与克隆演化的关系 | 创建了首个基于全玻片成像的高通量定量数字病理学方法，能够原位评估HCC倍性并空间重建超倍体核的分布 | 样本量相对有限(111例)，主要基于回顾性分析 | 研究肝细胞癌中肿瘤内倍性异质性和克隆演化机制 | 111例人类肝细胞癌样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 定量数字病理学，全外显子组测序，bulk RNA测序，3' mRNA测序，空间转录组学 | NA | 病理图像，基因组测序数据，转录组数据，空间转录组数据 | 111例人类肝细胞癌 | NA | 全外显子组测序，bulk RNA测序，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 3771 | 2025-11-28 |
The SWI/SNF chromatin-remodeling subunit DPF2 regulates macrophage inflammation in intestinal injury via the CACNA1D-mediated MAPK pathway
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2518762122
PMID:41223220
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研究论文 | 本研究揭示了DPF2通过调控CACNA1D表达和MAPK通路在巨噬细胞炎症极化及肠道损伤修复中的关键作用 | 首次发现DPF2通过调节CACNA1D介导的钙信号和MAPK通路调控巨噬细胞炎症极化的新机制 | NA | 探究DPF2在肠道损伤中调控巨噬细胞炎症反应的分子机制 | 巨噬细胞、肠道组织、临床炎症性肠病患者样本 | 单细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,小鼠遗传学,类器官培养 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据,临床样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 3772 | 2025-11-28 |
Transcriptomic profiling confirms microRNA-140 is more functional in joint development than in disease
2025-Nov-14, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.11.005
PMID:41242538
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研究论文 | 本研究通过转录组分析确认microRNA-140在关节发育中比在骨关节炎疾病中具有更强的功能作用 | 首次通过空间转录组学揭示miR-140-5p在静止软骨细胞和软骨膜中的特异性功能，并系统比较其在发育与疾病中的不同作用 | 研究仅使用小鼠模型，结果向人类转化需谨慎；骨关节炎模型仅采用创伤后模型 | 探究miR-140在骨骼发育和骨关节炎中的不同作用，并识别新的miR-140-5p靶标 | Mir140基因敲除小鼠模型，包括骨骼发育和骨关节炎诱导模型 | 转录组学 | 骨关节炎 | CRISPR-Cas9基因编辑，RNA测序，空间转录组学，组织学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据，空间基因表达数据，组织学图像 | 7日龄小鼠的肋软骨细胞和下肢生长板组织 | NA | RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 3773 | 2025-11-28 |
Matrix metalloproteinases are hallmark early biomarkers and therapeutic targets in FSHD
2025-Nov-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195104
PMID:40966415
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研究论文 | 本研究揭示了基质金属蛋白酶(MMPs)在面肩肱型肌营养不良症(FSHD)中作为早期生物标志物和治疗靶点的重要作用 | 首次通过单细胞RNA测序确定FAPs和巨噬细胞是肌营养不良肌肉中MMPs的主要来源，并证明泛MMP抑制剂batimastat可改善肌肉病变 | 研究主要基于动物模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究MMPs在FSHD疾病进展中的作用机制及治疗潜力 | 面肩肱型肌营养不良症(FSHD)患者活检样本和iDUX4pA FSHD小鼠模型 | 生物医学研究 | 肌营养不良症 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3774 | 2025-11-28 |
Platelets impair the resolution of inflammation in atherosclerotic plaques in insulin-resistant mice after lipid lowering
2025-Nov-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193593
PMID:41066197
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研究论文 | 本研究探讨胰岛素抵抗状态下血小板如何阻碍降脂治疗期间动脉粥样硬化斑块的炎症消退 | 首次揭示血小板通过抑制Fcgr4+巨噬细胞亚群扩增阻碍斑块炎症消退的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床数据有限 | 探究血小板在胰岛素抵抗个体降脂治疗中影响动脉粥样硬化斑块炎症消退的作用机制 | 肥胖胰岛素抵抗小鼠模型及人类临床数据 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，临床数据 | 小鼠模型及患者队列（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3775 | 2025-11-28 |
Key Considerations on CITE-Seq for Single-Cell Multiomics
2025-Nov, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202400011
PMID:39924789
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综述 | 本文聚焦CITE-Seq单细胞多组学技术的工作流程，以微孔板单细胞分析系统为例，提供抗体衍生标签染色、文库制备、测序和数据分析的关键注意事项 | 系统梳理CITE-Seq技术实施要点，首次以微孔板单细胞分析系统为范例提供全流程实用指南 | NA | 为研究人员提供执行CITE-Seq完整工作流程的实用指导 | 单细胞多组学分析技术 | 单细胞多组学 | NA | CITE-Seq, 单细胞mRNA测序, 抗体衍生标签 | NA | 基因表达数据, 蛋白质丰度数据 | NA | NA | 单细胞多组学, CITE-Seq | NA | 微孔板单细胞分析系统 |
| 3776 | 2025-11-28 |
Splicing-aware scRNA-Seq resolution reveals execution-ready programs in effector Tregs
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013682
PMID:41212920
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研究论文 | 开发了一种名为SANSARA的剪接感知单细胞RNA测序分析方法，用于识别效应Treg细胞中的执行就绪程序 | 首次在单细胞RNA测序降维分析中区分剪接和未剪接mRNA，揭示了传统方法无法检测的细胞功能状态 | 方法验证主要限于外周血调节性T细胞，在其他细胞类型和组织中的普适性需要进一步验证 | 开发剪接感知的单细胞RNA测序分析方法，以更精确地解析细胞功能状态 | 外周血调节性T细胞(Treg)亚群，包括Th1和细胞毒性CD4+ T细胞亚群 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3777 | 2025-11-28 |
Altered Epithelial-Mesenchymal Progenitor States Lead to Matrix Deposition, Tissue Inflammation, and Transitional Epithelial State in Congenital Diaphragmatic Hernia
2025 Nov-Dec, Fetal and pediatric pathology
IF:0.7Q4
DOI:10.1080/15513815.2025.2585371
PMID:41246903
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究先天性膈疝肺组织中上皮-间质祖细胞状态改变及其对细胞外基质沉积和组织炎症的影响 | 首次在先天性膈疝模型中揭示间质祖细胞过早获得间质样特征及远端上皮细胞进入过渡状态 | 研究仅使用大鼠模型，样本量有限，需要进一步验证 | 探究先天性膈疝肺发育异常的分子机制 | 正常和先天性膈疝胎鼠肺组织 | 单细胞生物学 | 先天性膈疝 | 单细胞RNA测序，免疫染色 | Seurat | 单细胞转录组数据，图像数据 | 正常和CDH胎鼠肺组织在E17、E19和E21时间点 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3778 | 2025-11-28 |
Single-cell omics arena: evaluation of large language models for automatic cell-type annotations on single-cell omics data via RNA-seq bridging
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf622
PMID:41283813
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研究论文 | 本文评估大型语言模型在单细胞组学数据中自动细胞类型注释的能力，并提出了跨模态翻译方法 | 首次系统评估8种大型语言模型在1226个细胞类型注释任务中的表现，并提出基于VAE的跨模态翻译模块处理非可解释特征 | 仅评估了11个公开可用的单细胞RNA测序数据集，模型性能可能受限于数据集规模和多样性 | 评估大型语言模型在单细胞组学数据中自动细胞类型注释的能力 | 单细胞组学数据中的细胞类型注释 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 大型语言模型(LLM), VAE | 基因表达数据, 表观遗传标记 | 11个公开单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3779 | 2025-11-28 |
PTGER4 Governs Immune Evasion and Therapy Resistance in Kidney Cancer via Ribosome Biogenesis Dysregulation
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70956
PMID:41284374
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了PTGER4通过调控核糖体生物合成影响肾癌免疫逃逸和治疗抵抗的机制 | 首次发现PTGER4作为肾癌中的关键抑癌基因，通过调控核糖体生物合成影响免疫应答和治疗反应 | NA | 探究核糖体生物合成异常在肾透明细胞癌进展和免疫治疗反应中的作用机制 | 肾透明细胞癌(KIRC)患者肿瘤样本 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA测序,基因网络分析(hdWGCNA),机器学习 | NA | 多组学数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3780 | 2025-11-28 |
Development of a PANoptosis-Related Pathomics Prognostic Model in Ovarian Cancer: A Multi-Omics Study
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70958
PMID:41284376
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研究论文 | 本研究开发了一个基于PANoptosis相关病理组学的卵巢癌预后模型，通过多组学分析揭示了STAT4 T细胞通过特定通路激活上皮细胞PANoptosis的机制 | 首次将PANoptosis这一综合细胞死亡机制引入卵巢癌预后研究，并开发了基于深度学习的病理组学预后模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 阐明PANoptosis在卵巢癌预后中的作用并开发预后模型 | 卵巢癌患者数据 | 数字病理 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,深度学习 | ResNet-50,深度学习模型 | 基因表达数据,空间数据,病理图像 | TCGA、GTEx和GEO数据库的卵巢癌数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |