单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 37491 篇文献,本页显示第 3661 - 3680 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3661 2026-01-24
Bulk and single-cell RNA-seq analyses reveal canonical RNA editing associated with microglia homeostasis and its role in sepsis-associated encephalopathy
2024-11-12, Neuroscience IF:2.9Q2
研究论文 本研究通过分析小鼠大脑的bulk和单细胞RNA-seq数据,揭示了与稳态小胶质细胞相关的典型RNA编辑及其在脓毒症相关脑病中的潜在作用 首次将稳态小胶质细胞与RNA编辑联系起来,并探索了其在脓毒症相关脑病中的作用,揭示了不同小胶质细胞亚群间RNA编辑的异质性及其对脂多糖的不同反应 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性有待验证;样本量相对有限(107个样本) 探索稳态小胶质细胞相关的典型RNA编辑及其在脓毒症相关脑病中的潜在作用 小鼠大脑组织和小胶质细胞 生物信息学 脓毒症相关脑病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA RNA-seq数据 107个小鼠大脑组织和小胶质细胞样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3662 2026-01-24
Restoring social deficits in IRSp53-deleted mice: chemogenetic inhibition of ventral dentate gyrus Emx1-expressing cells
2024-10-07, Translational psychiatry IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过化学遗传学抑制小鼠腹侧齿状回Emx1表达细胞,恢复了IRSp53缺失导致的社会行为缺陷 首次确定腹侧齿状回是IRSp53缺失引起社会行为缺陷的关键脑区,并通过化学遗传学方法实现行为恢复 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床验证;机制研究仍待深入 探究IRSp53缺失导致社会行为缺陷的神经机制并寻找潜在治疗靶点 Emx1-Cre;IRSp53 flox/flox基因工程小鼠 神经科学 精神疾病 化学遗传学、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 基因工程小鼠模型 行为学数据、基因表达数据 未明确说明,但涉及实验组和对照组小鼠 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
3663 2026-01-24
Single-cell multiomics analysis reveals cell/tissue-specific associations in bipolar disorder
2024-08-06, Translational psychiatry IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞多组学数据,探讨了双相情感障碍的细胞起源和组织异质性 识别了一个名为ADCY1的新型脑细胞簇,并从高分辨率遗传学角度揭示了胶质细胞作为双相情感障碍的主要细胞病理学关联 研究样本量有限,特别是单细胞RNA测序数据仅来自胚胎和胎儿脑组织,可能无法完全代表成年患者的情况 探究双相情感障碍的细胞起源、组织异质性及其潜在致病机制 双相情感障碍患者及对照组的脑组织样本 生物信息学 双相情感障碍 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 全基因组关联研究, 转录组范围关联研究 scDRS算法 单细胞RNA测序数据, ATAC-seq数据, 批量RNA测序数据, GWAS汇总数据 单细胞RNA测序数据(n=8个样本,1,266个细胞),ATAC-seq数据(n=210),批量RNA测序数据(n=314),GWAS汇总数据(n=413,466) NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 批量RNA-seq, GWAS NA NA
3664 2026-01-24
Single-cell insights into mouse testicular toxicity under peripubertal exposure to di(2-ethylhexyl) phthalate
2024-08-01, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology IF:3.4Q2
研究论文 本研究首次通过单细胞转录组学揭示了青春期小鼠睾丸在邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯暴露下的毒性机制 首次提供了青春期小鼠睾丸在DEHP暴露下的单细胞转录组图谱,明确了支持细胞和间质细胞是DEHP的关键靶点 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本;实验周期限于青春期暴露,长期效应未评估 探究DEHP在青春期暴露下对睾丸毒性的具体细胞靶点和分化过程影响 青春期雄性小鼠睾丸组织 单细胞转录组学 生殖系统疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 16只3周龄雄性小鼠(对照组和DEHP暴露组各8只) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3665 2026-01-24
Single-cell transcriptomics unveiled that early life BDE-99 exposure reprogrammed the gut-liver axis to promote a proinflammatory metabolic signature in male mice at late adulthood
2024-06-26, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了生命早期暴露于阻燃剂BDE-99会重编程肠道-肝脏轴,导致雄性小鼠在成年后期出现促炎症代谢特征 首次结合单细胞转录组测序(scRNA-seq)和无菌(GF)小鼠模型,阐明了生命早期BDE-99暴露如何通过改变肠道微生物组,持久地重编程肝脏细胞类型特异性基因表达和细胞间通讯,从而促进成年后期的促炎症状态 研究仅针对雄性C57BL/6小鼠,未探讨性别差异;暴露时间窗口(出生后2-4天)和剂量(57 mg/kg)可能无法完全模拟人类真实暴露场景;机制关联性部分基于预测和相关性分析 探究生命早期暴露于环境污染物BDE-99对肠道-肝脏轴的长期影响,特别是其对肝脏免疫代谢稳态和肠道微生物组的重编程作用 雄性C57BL/6小鼠(包括常规饲养和无菌小鼠),重点关注其肝脏细胞(如肝细胞、中性粒细胞)和肠道组织 单细胞组学 代谢与炎症相关疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),微生物移植 NA 单细胞转录组数据,基因表达数据 雄性C57BL/6小鼠(具体数量未明确说明),包括BDE-99暴露组和玉米油对照组,并在15月龄进行分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3666 2026-01-24
Single-cell transcriptome analysis reveals keratinocyte subpopulations contributing to psoriasis in corneum and granular layer
2024-Feb, Skin research and technology : official journal of International Society for Bioengineering and the Skin (ISBS) [and] International Society for Digital Imaging of Skin (ISDIS) [and] International Society for Skin Imaging (ISSI) IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了与银屑病相关的角质形成细胞亚群及其分子机制 首次在单细胞水平上系统鉴定了银屑病皮肤角质层和颗粒层中特定的角质形成细胞功能亚群,并阐明了它们参与的关键信号通路 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本量相对有限;未进行体内功能实验验证 探究银屑病发病机制中角质形成细胞的具体功能亚群及其分子特征 正常和银屑病皮肤组织 数字病理学 银屑病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3667 2026-01-23
Multi-platform analysis of the tumor immune microenvironment associated with breast cancer subtypes
2026-Dec-31, Oncoimmunology IF:6.5Q1
研究论文 本研究通过多平台分析揭示了乳腺癌不同分子亚型之间肿瘤免疫微环境的显著差异 首次结合多重免疫组化、单细胞RNA测序和两种反卷积算法,系统比较了PAM50各亚型的免疫景观,并观察到NK细胞和CD8 T细胞在特定亚型中的富集 未明确说明样本来源的具体队列特征(如治疗史、分期等),且未进行功能性验证实验 探索乳腺癌不同分子亚型与肿瘤免疫微环境特征之间的关联 乳腺癌肿瘤组织及其免疫微环境 数字病理学 乳腺癌 多重免疫组化, 单细胞RNA测序, 反卷积算法 NA 图像, 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3668 2026-01-23
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Reveals Shared and Cancer-Type-Specific Cellular Interactions and Chemokine Signaling Associated With Tertiary Lymphoid Structures in Colorectal and Gastric Cancers
2026-Feb, Molecular carcinogenesis IF:3.0Q2
研究论文 本研究整合单细胞和空间转录组学数据,揭示了结直肠癌和胃癌中三级淋巴结构(TLS)的细胞相互作用和趋化因子信号传导机制 首次在单细胞和空间分辨率下,系统比较了结直肠癌和胃癌中TLS的细胞互作网络和趋化因子信号,发现了癌症类型特异性的免疫招募回路 研究样本量有限,且仅聚焦于结直肠癌和胃癌,未涵盖其他胃肠道恶性肿瘤 阐明胃肠道恶性肿瘤中三级淋巴结构的调控机制及其与免疫治疗响应的关联 结直肠癌和胃癌组织样本中的三级淋巴结构及相关免疫细胞 数字病理学 结直肠癌,胃癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
3669 2026-01-23
Single-cell profiling of bone metastasis ecosystems reveals pivotal role of INSR+AEC in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序与空间转录组学,揭示了肾透明细胞癌骨转移生态系统中INSR+动脉内皮细胞的关键作用及其与肿瘤细胞的相互作用 首次在人类骨转移微环境中定义了INSR+动脉内皮细胞亚群,并发现其通过COL4A1-SDC4信号轴与转移性肿瘤细胞相互作用,提出了新的预后标志物IAERS 研究主要基于体外实验和计算分析,缺乏体内功能验证,且样本来源可能有限 阐明肾透明细胞癌骨转移微环境的细胞和空间结构,寻找可干预的治疗靶点 肾透明细胞癌骨转移患者的肿瘤组织和相关细胞 数字病理学 肾癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 多计算管道整合分析 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 未明确指定具体样本数量,但涉及匹配的单细胞和空间样本以及大规模批量队列 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
3670 2026-01-23
Exploration of precise classification and therapeutic targets of breast cancer based on genes related to neuro-cancer crosstalk
2026-Feb, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究基于神经-癌症交互相关基因,探索乳腺癌的精确分类和治疗靶点 利用神经-癌症交互相关基因构建预后特征模型,并揭示了由MIF和MDK信号通路主导的神经-免疫-肿瘤交互网络 研究主要基于TCGA/GEO数据库的转录组和单细胞数据,需进一步实验验证临床适用性 探索乳腺癌中神经-癌症交互的调控机制,并开发预后模型和潜在治疗靶点 乳腺癌患者样本及相关基因 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA-seq, 转录组测序 Cox回归, LASSO-Cox回归 转录组数据, 单细胞数据 TCGA/GEO数据库中的乳腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3671 2026-01-23
Integrated spatial and single-cell transcriptomics reveals RPL8 as a prognostic biomarker and therapeutic target in hepatocellular carcinoma
2026-Feb, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过整合多组学、单细胞转录组和空间转录组数据,揭示了RPL8作为肝细胞癌的诊断生物标志物和治疗靶点 首次将空间转录组学与单细胞转录组学结合,系统阐明RPL8在肝细胞癌中的临床价值和微环境作用机制 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏大规模临床队列验证 探究RPL8在肝细胞癌中的临床意义、分子机制及治疗潜力 肝细胞癌患者样本、癌细胞系 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 NA 转录组数据, 蛋白质组数据, 空间表达数据 TCGA、CPTAC数据库样本及GSE146115单细胞数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学 NA NA
3672 2026-01-23
Beyond macrophages: FIPV tropism includes T and B lymphocytes
2026-Feb, Veterinary microbiology IF:2.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)不仅感染单核/巨噬细胞,还能感染T和B淋巴细胞,并能在这些细胞中进行病毒基因组复制 挑战了FIPV仅选择性感染单核/巨噬细胞的现有模型,首次证实了FIPV对T和B淋巴细胞的嗜性,并发现了治疗后病毒RNA在淋巴细胞中的持续存在 研究样本来自自然发生的猫传染性腹膜炎病例,样本量可能有限;主要关注淋巴组织,其他组织中的感染情况未完全阐明 阐明猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)的细胞嗜性范围、免疫细胞入侵机制及其在免疫失调、病毒持续存在和疾病复发中的作用 患有自然发生渗出性猫传染性腹膜炎(FIP)的猫的肠系膜淋巴结抽吸物和福尔马林固定石蜡包埋的淋巴结组织 数字病理学 猫传染性腹膜炎 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,原位杂交 NA RNA序列数据,图像数据 未明确指定样本数量,但来自患有自然发生渗出性FIP的猫的淋巴结组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3673 2026-01-23
Single-cell analysis of heterogeneity in reverted hiPSC-derived human hepatic stellate cells
2026-Feb, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1
研究论文 本研究利用人诱导多能干细胞衍生的多细胞肝脏模型,探究了活化的肝星状细胞在损伤消退后是否能够恢复到静息状态,并通过单细胞RNA测序揭示了其异质性 首次在人类诱导多能干细胞衍生的多细胞肝脏模型中,通过单细胞RNA测序揭示了活化肝星状细胞在损伤消退后恢复过程中的异质性,并明确了巨噬细胞来源的IL-10通过调控维生素A代谢促进这一恢复过程的关键机制 研究样本量较小(n=4),且模型为体外培养系统,可能无法完全模拟体内复杂的肝脏微环境 探究人类活化的肝星状细胞在损伤消退后是否能够恢复到静息状态,并表征其恢复过程的特征 人诱导多能干细胞衍生的肝星状细胞、肝细胞和巨噬细胞组成的多细胞肝脏模型 单细胞组学 肝纤维化 单细胞RNA测序,基因表达谱分析,功能实验 NA 单细胞RNA测序数据 4个独立实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3674 2026-01-23
Inhibition of FOS-Like Antigen 1 Reduces Chemoresistance to Temozolomide Through Stemness Reprogramming via IL-6/STAT3Tyr705 Pathway
2026-Feb, MedComm IF:10.7Q1
研究论文 本研究通过抑制FOSL1,揭示了其通过IL-6/STAT3通路调控胶质母细胞瘤干细胞特性,从而降低对替莫唑胺化疗耐药性的新机制 首次将FOSL1鉴定为胶质母细胞瘤化疗耐药的新治疗靶点,并阐明其通过IL-6-pSTAT3信号轴调控干细胞特性的具体机制 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在临床患者中进行验证 探索克服胶质母细胞瘤化疗耐药的新治疗策略 胶质母细胞瘤细胞系、小鼠模型 分子生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq、转录组分析 NA 基因表达数据 未明确指定具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3675 2026-01-23
ClusterGVis: An Advanced Visualization and Clustering Tool for Gene Expression Analysis
2026-Jan-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 本文介绍了ClusterGVis,一款用于简化基因表达数据分析和可视化的高级生物信息学软件 开发了集成了模糊c均值和k均值聚类算法以及热图可视化功能的用户友好界面,有效揭示复杂基因表达谱中的模式和关系 NA 简化基因表达数据的分析和可视化,以识别潜在生物标志物并增强对基因功能和调控机制的理解 单细胞RNA测序和批量RNA测序数据 生物信息学 NA RNA测序 模糊c均值聚类, k均值聚类 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
3676 2026-01-23
Molecular Features of Response and Resistance to Glofitamab, a T-Cell Engager for treatment of Large B-Cell Lymphoma
2026-Jan-22, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了glofitamab治疗大B细胞淋巴瘤中T细胞状态与临床反应的关系 揭示了早期维持“新鲜”样T细胞状态(特别是新鲜细胞毒性T细胞)与临床疗效的关联,并探索了4-1BB共刺激增强治疗效果的潜力 研究样本可能有限,且主要基于R/R B-NHL患者,结果可能不适用于其他淋巴瘤亚型或早期疾病阶段 深入理解glofitamab治疗大B细胞淋巴瘤中驱动疗效和耐药性的分子机制 复发或难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤(R/R B-NHL)患者的外周血免疫细胞(PBMC)及临床前肿瘤模型中的肿瘤内T细胞 数字病理学 淋巴瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 来自glofitamab治疗的R/R B-NHL患者的PBMC样本,包括完全代谢应答者(CMR)和进展性代谢疾病(PMD)患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3677 2026-01-23
IL-21 mediates crosstalk between T cells and NK cells during the remission of type 1 diabetes
2026-Jan-21, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 本研究揭示了在1型糖尿病进展和缓解过程中,CD161+ CD4+ T细胞通过IL-21和mTOR信号通路促进致病性NK细胞生成的机制 首次发现CD226+ CD56+ CD16+ NK细胞亚群在T1D发病时扩增并在缓解时收缩,并揭示了IL-21介导的T细胞与NK细胞间串扰机制 研究主要基于小鼠模型和患者样本的横断面分析,长期临床转化效果尚需进一步验证 探究自然杀伤细胞在1型糖尿病发病和缓解过程中的作用机制 1型糖尿病患者样本和雌性小鼠模型 免疫学 1型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 患者横断面和纵向样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3678 2026-01-23
scSemiPLC: a semi-supervised learning framework for annotating single-cell RNA-Seq data by generating pseudo-labels through clustering
2026-Jan-20, mSystems IF:5.0Q1
研究论文 本文提出了一种名为scSemiPLC的半监督学习框架,用于通过聚类生成伪标签来注释单细胞RNA-Seq数据 scSemiPLC利用现有标签信息指导未标记数据的聚类,通过一致性正则化约束扰动数据的预测与伪标签相似,解决了固定高阈值伪标签范式导致的未标记数据利用率低的问题 NA 开发一个高效便捷的自动化细胞注释方法,以应对传统手动标记基因匹配方法的繁琐和耗时问题 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 半监督学习框架 RNA-Seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3679 2026-01-23
Inhibition of PFKFB3 in macrophages ameliorates intestinal inflammation by modulating gut microbiota in DSS-induced colitis
2026-Jan-20, mSystems IF:5.0Q1
研究论文 本研究探讨了糖酵解关键酶PFKFB3在巨噬细胞中的作用,发现抑制PFKFB3可通过调节肠道菌群减轻DSS诱导的结肠炎 首次揭示了巨噬细胞中PFKFB3缺陷通过调节肠道菌群(特别是增强Akkermansia菌属)改善结肠炎的机制,并证明该菌群可水平传播产生治疗效应 研究主要基于小鼠模型,人体验证尚不充分;抗生素处理实验表明菌群介导效应,但具体菌种功能机制需进一步解析 阐明PFKFB3在溃疡性结肠炎中的作用机制,探索通过靶向巨噬细胞代谢调节肠道菌群的治疗策略 溃疡性结肠炎患者组织样本、DSS诱导的结肠炎小鼠模型、巨噬细胞特异性PFKFB3缺陷小鼠 免疫代谢与微生物组学 溃疡性结肠炎 免疫组化染色、单细胞RNA测序、流式分析、高通量转录组数据分析、Spearman相关性分析 小鼠基因缺陷模型(LysM-Cre介导的巨噬细胞PFKFB3敲除) 转录组数据、单细胞测序数据、临床病理数据 人类UC队列组织样本、结肠炎小鼠模型、基因工程小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3680 2026-01-23
Piezo1 dictates K+ homeostasis through coordinated regulation of the ubiquitin ligase Kelch-like 3 in RBCs and the kidney
2026-Jan-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本文揭示了机械传感器Piezo1通过协调红细胞和肾脏中泛素连接酶Kelch-like 3 (KLHL3)的活性,调控细胞外钾离子稳态的机制 首次发现Piezo1-KLHL3相互作用作为红细胞与肾脏之间的关键组织间信号机制,调控钾离子稳态,并提出了该通路作为治疗钾离子紊乱的潜在靶点 研究主要基于小鼠模型和人类遗传数据,需要进一步实验验证该通路在人类疾病中的具体作用机制 探究组织间信号在钾离子稳态中的作用,特别是Piezo1-KLHL3通路的功能 红细胞、肾脏、人类遗传数据(UK Biobank参与者) 分子生物学 钾离子紊乱 CRISPR基因编辑、单细胞转录组学、遗传关联分析 NA 遗传数据、转录组数据、生理参数 200,367名UK Biobank参与者、KLHL3敲入小鼠模型 NA 单细胞转录组学 NA NA
回到顶部