本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-03-20 |
Red panda intestinal organoids for the functional analysis of Lactobacillus salivarius
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114844
PMID:41852748
|
研究论文 | 本研究建立了红熊猫肠道类器官培养系统,用于分析唾液乳杆菌P103的益生功能 | 首次成功建立红熊猫肠道类器官,并利用单细胞RNA测序验证其组织特异性细胞类型和功能,为濒危物种研究提供了可传代、冻存和复苏的模型系统 | 未在摘要中明确提及具体限制,可能包括类器官与体内环境的差异或样本规模有限 | 研究红熊猫肠道类器官的建立及其在宿主-微生物相互作用机制分析中的应用,减少野生动物研究对动物模型的依赖 | 红熊猫肠道类器官及唾液乳杆菌P103 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 342 | 2026-03-20 |
The ATF5-GPER1 axis drives female protection in hepatocellular carcinoma through dual tumor-suppressive and immune-modulatory mechanisms
2026-Mar-19, Bioscience trends
IF:5.7Q1
DOI:10.5582/bst.2026.01026
PMID:41850858
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与机器学习,揭示了ATF5-GPER1轴通过抑制肿瘤增殖、诱导凋亡以及重塑免疫微环境,驱动肝细胞癌女性保护性现象的分子机制 | 首次整合bulk转录组学、单细胞RNA测序与机器学习,系统性地识别并验证了ATF5作为女性保护性基因,并阐明其通过激活GPER1形成雌激素响应模块,在肿瘤细胞和免疫细胞中发挥双重抑制作用的机制 | 研究主要基于回顾性队列和公共数据集,需要在更大规模的前瞻性队列中进行验证;体外细胞实验(HepG2)的发现需要在更复杂的体内模型中进一步确认 | 探究肝细胞癌性别二态性(女性生存优势)的分子机制,并识别相关的生物标志物 | 肝细胞癌患者(包括男性和女性)的肿瘤组织、肿瘤细胞系(HepG2)以及相关的转录组和单细胞数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 机器学习(LASSO, SVM, 随机森林), 组织芯片验证 | LASSO, SVM, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床生存数据, 组织芯片图像数据 | bulk转录组数据来自3个公共数据集(GSE39791, TCGA-LIHC, GSE14520);单细胞RNA测序数据来自5个数据集,共58名患者的238,982个细胞;组织芯片验证包含167个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 343 | 2026-03-20 |
Targeting the ferritinophagy axis: multi-target regulation of TFRC/FTH1/NCOA4 by artesunate ameliorates salivary gland dysfunction in Sjögren's Disease
2026-Mar-19, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-026-01354-8
PMID:41851758
|
研究论文 | 本研究探讨了青蒿琥酯通过调节TFRC/FTH1/NCOA4轴抑制铁死亡,从而改善干燥综合征小鼠唾液腺功能障碍的机制 | 首次揭示了青蒿琥酯通过双重靶向铁蛋白自噬轴(TFRC/FTH1/NCOA4)并增强抗氧化防御来改善干燥综合征唾液腺功能障碍的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,尚未在人类患者中进行验证,且具体分子结合机制需进一步实验确认 | 探究青蒿琥酯是否通过调节TFRC/FTH1/NCOA4轴抑制铁死亡,从而缓解干燥综合征的唾液腺功能障碍 | 非肥胖糖尿病小鼠(干燥综合征模型)和IFN-γ诱导的人唾液腺细胞系A253 | NA | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 分子对接, Western印迹, 免疫荧光, 流式细胞术, 功能测定 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 344 | 2026-03-20 |
Single-cell atlas of B cell heterogeneity in lacrimal IgG4-related disorders: Unraveling the transition from inflammatory exhaustion to clonal malignancy
2026-Mar-19, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70498
PMID:41853890
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了泪腺IgG4相关疾病中B细胞的异质性,揭示了从炎症性耗竭向克隆性恶性肿瘤转变的关键差异 | 首次在单细胞水平上比较了IgG4-ROD和IgG4阳性MALT淋巴瘤中B细胞的分化轨迹和分子特征,识别了记忆B细胞分化状态作为恶性转化的关键节点 | 样本量较小(仅6例患者),且仅分析了泪腺组织,可能无法完全代表疾病的全貌 | 探究泪腺IgG4相关疾病中B细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 4例IgG4-ROD患者和2例IgG4阳性MALT淋巴瘤患者的泪腺组织 | 数字病理学 | 眼部疾病(IgG4相关疾病) | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 6例患者(4例IgG4-ROD,2例MALT淋巴瘤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 345 | 2026-03-20 |
IFN-I-Mediated Transcriptional Reprogramming Drives Myeloid-Skewed Hematopoiesis in Sickle Cell Anemia
2026-Mar-19, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70277
PMID:41853894
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,揭示了镰状细胞贫血中I型干扰素信号驱动的造血干细胞向髓系分化的转录重编程机制 | 首次在镰状细胞贫血中发现了I型干扰素信号异常激活导致造血干细胞过早髓系分化的内在机制,并揭示了G-CSF反应性增强的新现象 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据,缺乏体内功能验证的深入机制探索 | 阐明镰状细胞贫血中病理性髓系造血和慢性炎症的内在驱动机制 | 镰状细胞贫血患者的造血干细胞和多能祖细胞 | 单细胞组学 | 镰状细胞贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 346 | 2026-03-20 |
Uncovering the therapeutic mechanism of Baicalein in diabetic retinopathy through ferroptosis regulation
2026-Mar-18, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2026.2646309
PMID:41848783
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学和单细胞转录组学方法,探讨了黄芩素通过调控铁死亡治疗糖尿病视网膜病变的潜在机制 | 首次整合网络药理学与单细胞RNA测序数据,系统揭示了黄芩素通过靶向铁死亡通路治疗糖尿病视网膜病变的多靶点作用机制,并利用分子对接与动力学模拟验证了关键靶点的结合稳定性 | 研究主要基于生物信息学分析和体外模拟,缺乏体内实验验证;单细胞数据样本来源有限,临床转化潜力需进一步评估 | 探究黄芩素治疗糖尿病视网膜病变的作用机制,重点关注其对铁死亡通路的调控作用 | 糖尿病视网膜病变相关的差异表达基因、铁死亡相关基因、黄芩素作用靶点及视网膜单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 网络药理学、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、通路富集分析 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、蛋白质结构数据 | 基于公共数据库GSE102485和GSE178121的基因表达数据集,未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 347 | 2026-03-20 |
Rudolf Buchheim Award 2026: Toward a ToxAtlas of carbon-based nanomaterials: single-cell RNA sequencing reveals initiating cell circuits in pulmonary inflammation
2026-Mar-18, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05170-7
PMID:41848856
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,系统解析了碳基纳米材料诱导肺部炎症的起始细胞回路,并构建了毒理学图谱 | 首次在单细胞分辨率下,将碳基纳米材料的物理化学特性与细胞特异性炎症起始、应激反应及免疫细胞招募联系起来,为基于作用模式的危害评估提供了概念框架 | 研究基于小鼠模型,结果向人类外推需谨慎;且仅关注了早期炎症起始事件,长期效应未涉及 | 推进对碳基纳米材料引发呼吸道炎症机制的理解,支持更安全的纳米材料理性设计及特异性体外检测方法的开发 | 暴露于碳基纳米材料(炭黑样碳纳米颗粒、柔性双壁碳纳米管、针状多壁碳纳米管)的小鼠肺部细胞 | 毒理学 | 肺部炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 348 | 2026-03-20 |
The Application of Single-cell RNA Sequencing Technology in the Research of Sino-Nasal Diseases
2026-Mar-18, Clinical reviews in allergy & immunology
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s12016-026-09145-7
PMID:41849011
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 349 | 2026-03-20 |
Single-cell Transcriptomics Reveals Cytotrophoblast Subtypes and Senescence in Recurrent Spontaneous Abortion
2026-Mar-18, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaag030
PMID:41849438
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了复发性自然流产(RSA)绒毛组织中细胞滋养层细胞的亚型特征及细胞衰老现象 | 首次在RSA绒毛组织中鉴定出三种细胞滋养层细胞亚型(CTB1、CTB2、CTB3),并发现CTB2和CTB3亚型存在显著的细胞衰老特征 | 研究样本量未明确说明,且未涉及其他可能影响胎盘发育的细胞类型或分子机制 | 探究复发性自然流产(RSA)的发病机制,特别是滋养层细胞的功能异常 | 对照组和RSA患者的绒毛组织 | 单细胞转录组学 | 复发性自然流产 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 350 | 2026-03-20 |
RENAL-CHIP: Rejection Evaluation via Non-Invasive Analysis of Circulating Podocytes With Herringbone-Chip Isolation Platform
2026-Mar-18, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520426
PMID:41849694
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为RENAL-CHIP的非侵入性方法,通过磁性可逆鲱鱼骨微流控芯片从外周血中分离供体来源的循环足细胞,用于评估肾移植排斥反应 | 首次将供体来源的循环足细胞作为急性排斥反应的血液生物标志物,并开发了一种高效的微流控芯片进行非侵入性检测 | 样本量相对较小(65名参与者),且仅针对肾移植排斥反应,未涉及其他疾病或移植类型 | 开发一种非侵入性、精确的肾移植排斥反应诊断方法 | 肾移植受者,特别是那些经历急性排斥反应的个体 | 数字病理学 | 肾移植排斥反应 | 单细胞RNA测序,荧光原位杂交 | NA | 血液样本,单细胞RNA-seq数据 | 65名参与者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 351 | 2026-03-20 |
Single-cell-based identification of drug synergy with immunotherapy via tumor microenvironment remodeling
2026-Mar-18, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014132
PMID:41850739
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和L1000平台筛选,建立了一个评估肿瘤微环境重塑的框架,并识别出增强免疫治疗效果的药物组合 | 开发了单细胞RNA测序资源库和MP评分算法,首次系统性地分析了肿瘤微环境对免疫调节药物的响应,并发现痛风药物别嘌醇能增强抗PD-1疗法的效果 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中得到验证,且药物筛选范围有限(739种化合物) | 识别肿瘤微环境中能增强免疫治疗效果的药物协同作用 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和药物响应 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,L1000平台筛选 | MP评分算法 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及多种癌症类型的小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 352 | 2026-03-20 |
Spi-1 proto-oncogene regulates mRNA hypertranscription and malignant progression in head and neck cancer
2026-Mar-18, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02669-6
PMID:41851070
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子SPI1通过驱动mRNA超转录促进头颈鳞状细胞癌恶性进展的机制 | 首次在头颈鳞状细胞癌中明确了mRNA特异性超转录的作用,并鉴定出SPI1是其关键调控因子 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型,需要更多临床样本验证 | 探究mRNA超转录在头颈鳞状细胞癌恶性进展中的作用及其分子驱动机制 | 头颈鳞状细胞癌细胞系、异种移植模型及单细胞转录组数据 | 癌症生物学 | 头颈癌 | 单细胞转录组学、ChIP-seq、RNA-seq、功能获得/缺失实验 | NA | 转录组数据、基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 353 | 2026-03-20 |
Spatial heterogeneity of MDSCs mediated by ANXA1-FPRs signaling drives immune suppression in OSCC progression
2026-03-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70861-x
PMID:41851114
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了口腔鳞状细胞癌中MDSCs的空间异质性及其通过ANXA1-FPR2信号介导免疫抑制的机制 | 首次揭示了MDSCs在OSCC进展中的空间动态变化(从肿瘤核心浸润到边缘定位)及其通过ANXA1-FPR2信号通路维持免疫抑制的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚需进一步开展;空间异质性的功能影响需更多实验证实 | 探究口腔鳞状细胞癌免疫抑制微环境中细胞空间异质性的作用机制 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)肿瘤微环境中的髓源性抑制细胞(MDSCs)和CD8 T细胞 | 空间转录组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 354 | 2026-03-20 |
Celcomen: spatial causal disentanglement for single-cell and tissue perturbation modeling
2026-Mar-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69856-5
PMID:41851134
|
研究论文 | Celcomen利用数学因果框架,通过生成图神经网络解耦空间转录组数据中的细胞内和细胞间基因调控程序 | 首次将因果框架应用于空间转录组数据,实现虚拟组织的扰动建模和反事实预测 | NA | 解耦空间转录组数据中的基因调控程序,以建模疾病和治疗诱导的组织变化 | 人类胶质母细胞瘤、人类胎儿脾脏和小鼠肺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 生成图神经网络 | 空间转录组数据 | 人类胶质母细胞瘤、人类胎儿脾脏和小鼠肺癌样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 355 | 2026-03-20 |
The AICL-KLRF1 axis supports CD4-CD8 T cell communication and cytokine competence in pre-exhausted CD8+ T cells
2026-Mar-18, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-026-00732-5
PMID:41851343
|
研究论文 | 本文揭示了AICL-KLRF1轴作为CD4-CD8 T细胞通讯通路,支持晚期分化CD8+ T细胞的细胞因子能力 | 首次将KLRF1识别为CD4-CD8通讯轴的一部分,并利用空间蛋白质组学和单细胞多组学技术验证其在肿瘤微环境中的空间相互作用和转录特征 | 研究主要基于体外共培养和观察性分析,缺乏体内功能验证和机制深入探讨 | 探究慢性感染和癌症中前耗竭CD8+ T细胞维持细胞因子产生的信号机制 | 人类CD8+ T细胞、CD4+ T细胞、肺癌组织及循环免疫细胞 | 免疫学 | 肺癌 | 空间蛋白质组学、单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq | NA | 蛋白质组数据、RNA-seq数据、ATAC-seq数据 | 肺癌组织及邻近组织样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 356 | 2026-03-20 |
Lactylation-related gene signature for prognosis prediction and immune infiltration assessment in lung adenocarcinoma via bulk and single-cell RNA sequencing
2026-Mar-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04845-0
PMID:41851557
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2026-03-20 |
Prussian blue analogue-mineralized ginseng-derived vesicles promote PPARγ nuclear translocation to suppress tumor vasculogenic mimicry and reverse the immunosuppressive microenvironment
2026-Mar-18, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04263-y
PMID:41851872
|
研究论文 | 本研究开发了一种仿生纳米平台GDVs@CuPBA-iRGD,通过抑制肿瘤血管生成拟态和逆转免疫抑制微环境来治疗肝细胞癌 | 创新点在于将铜基普鲁士蓝类似物原位矿化到人参来源的囊泡上,并结合肿瘤穿透肽iRGD,构建了pH响应性降解的纳米复合物,首次揭示了其通过促进PPARγ核转位来抑制VM并激活抗肿瘤免疫的机制 | NA | 开发一种新型治疗策略,以抑制肿瘤血管生成拟态并逆转免疫抑制微环境,从而治疗侵袭性肿瘤 | 肝细胞癌细胞及体内肿瘤模型 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 358 | 2026-03-20 |
Dynamic and cell-type specific transcriptional reprogramming underlies the floral transition in the maize shoot apical meristem
2026-Mar-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04033-x
PMID:41851888
|
研究论文 | 本研究通过整合时序性批量RNA-seq、单细胞转录组学、染色质可及性和转录因子结合谱数据,构建了玉米茎尖分生组织花转变的时空分子框架 | 揭示了花转变过程中的全局转录重编程和细胞类型特异性调控动态,并鉴定了一个ZmMADS69-ZmRap2.7-ZMM4调控模块来精细调控花转变 | NA | 探究玉米茎尖分生组织花转变的分子机制,以理解开花时间、环境适应和产量相关性状的调控 | 玉米茎尖分生组织 | 自然语言处理 | NA | RNA-seq, 单细胞转录组学, 染色质可及性分析, 转录因子结合谱分析 | NA | 转录组数据, 染色质可及性数据, 转录因子结合数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 359 | 2026-03-20 |
Single-cell RNA sequencing uncovers neutrophil clusters associated with autoimmune neuroinflammation
2026-Mar-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03772-9
PMID:41851894
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2026-03-20 |
Enhancing gastric cancer immunotherapy: Insights from multi-omics analysis and innovations in photodynamic-chemotherapy nanoplatforms
2026-Mar-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102635
PMID:41747719
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了胃癌免疫检查点阻断治疗耐药的关键机制,并开发了一种新型纳米平台以增强免疫治疗效果 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学结合用于分析胃癌免疫治疗耐药机制,并创新性地设计了巨噬细胞膜伪装的纳米颗粒平台,实现了YAP1靶向抑制与化疗药物的协同递送 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证;纳米平台的长期安全性和生物分布特性需要进一步评估 | 克服胃癌免疫检查点阻断治疗的耐药性并开发新型联合治疗策略 | 胃癌组织样本、基因工程小鼠模型和同系小鼠模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学分析 | 基因工程模型、同系移植模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 接受新辅助免疫检查点阻断治疗的胃癌患者组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |