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当前共找到 35811 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-01-28 |
An Integrated Single-Cell Atlas of the Mouse Ileum Links Nutrient Metabolism with Epithelial and Immune Crosstalk
2025-Dec, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2025.09.034
PMID:41033583
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了小鼠回肠的首个整合单细胞图谱，揭示了上皮细胞和免疫细胞的异质性、营养代谢程序以及上皮-免疫相互作用 | 首次提供了小鼠回肠的整合单细胞图谱，系统描绘了上皮细胞分化、营养代谢程序以及上皮-免疫细胞间的相互作用，特别是在肠上皮细胞亚群中发现了与维生素A、类胡萝卜素和维生素B12吸收相关的特异性功能 | 研究仅基于8周龄雄性C57BL/6J小鼠，样本来源单一，未涵盖不同年龄、性别或疾病状态，且未进行功能验证实验 | 绘制回肠细胞异质性图谱，定义上皮细胞分化、营养代谢程序以及上皮-免疫相互作用，以揭示其在健康和疾病中的作用 | 8周龄雄性C57BL/6J小鼠的回肠细胞 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Seurat | 单细胞基因表达数据 | 32,076个回肠细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 342 | 2026-01-28 |
TREM2 Impedes Recovery After Spinal Cord Injury by Regulating Microglial Lysosomal Membrane Permeabilization-Mediated Autophagy
2025-Oct, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70047
PMID:40320759
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研究论文 | 本研究探讨了TREM2在脊髓损伤后通过调节小胶质细胞溶酶体膜通透性介导的自噬来影响恢复的机制 | 首次揭示了TREM2通过调节小胶质细胞溶酶体膜通透性介导的自噬在脊髓损伤恢复中的具体作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 探究TREM2在脊髓损伤中的潜在机制及其对小胶质细胞功能的影响 | 野生型和Trem2敲除小鼠的小胶质细胞，以及脊髓损伤模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序，免疫荧光，3D步态分析，运动诱发电位实验，H&E染色，Masson染色 | NA | 测序数据，图像数据，行为数据 | 野生型和Trem2敲除小鼠在脊髓损伤前后的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 343 | 2026-01-28 |
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2025-Sep-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96713
PMID:40982369
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研究论文 | 本研究利用深度迁移学习工具DEGAS，通过单细胞RNA-seq数据识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞亚群 | 应用深度迁移学习工具DEGAS将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据，首次识别出与2型糖尿病和肥胖相关的独特β细胞亚群，并验证了CDKN1C和DLK1基因的表达差异 | 研究仅基于现有单细胞RNA-seq数据，未来需要扩展到更多人类胰岛组学数据集以揭示复杂的多细胞相互作用 | 优先识别与疾病相关的β细胞亚群，以更好地理解2型糖尿病发病机制并确定靶向治疗的相关基因 | 人类胰腺胰岛β细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA-seq | 深度迁移学习 | 单细胞RNA-seq数据 | 来自健康和非糖尿病捐赠者的人类胰腺切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 344 | 2026-01-28 |
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.30.651101
PMID:40475445
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研究论文 | 本研究优化了单细胞长读长测序协议，以提升胰腺胰岛中异构体的检测能力 | 通过优化5'文库制备协议和靶向耗竭胰岛素转录本，提高了单细胞长读长测序的读长和转录本检测效率 | 单细胞长读长测序存在技术挑战，如读长不足和错误率较高 | 优化单细胞长读长测序协议，以增强胰腺胰岛中异构体的检测 | 胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞长读长RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 345 | 2026-01-28 |
Investigating Gene Expression Noise Reduction by MicroRNAs and MiRISC Reinforcement by Self-Feedback Regulation of mRNA Degradation
2025-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637731
PMID:39990448
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研究论文 | 本研究通过数学建模和单细胞RNA-seq数据分析，探讨了microRNA通过负自反馈调控mRNA降解来降低基因表达噪声的机制 | 首次同时分析mRNA降解动力学和表达噪声，并证明通过mRNA降解的自反馈调控可以降低噪声 | NA | 研究microRNA介导的基因表达噪声减少机制 | microRNA诱导的沉默复合体（miRISC）及其靶向的mRNAs | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 数学建模 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 346 | 2026-01-28 |
Integrated immune profiling of chordomas reveals spatially organized niches and functional heterogeneity
2025-Sep-11, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf213
PMID:41586579
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、T细胞受体分析和多重免疫荧光技术，揭示了脊索瘤的免疫细胞异质性、空间组织及功能状态 | 首次在脊索瘤中整合空间、转录组和TCR数据，揭示系统性抗肿瘤反应、肿瘤特异性TCR基序及纤维隔膜作为免疫相互作用枢纽 | 样本量相对较小（35个脊索瘤样本），作为超罕见癌症类型，结果可能需要更大队列验证 | 深入理解脊索瘤的免疫景观，为开发个性化免疫疗法提供基础 | 脊索瘤样本及其配对外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序，T细胞受体分析，多重免疫荧光 | 加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据，空间分布数据，TCR序列数据 | 35个脊索瘤样本和6个配对肿瘤-PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 347 | 2026-01-28 |
Integrated single-nuclei and spatial transcriptomic profiling of human sacrococcygeal teratomas reveals heterogeneity in cellular composition and X-chromosome inactivation
2025-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.21.665156
PMID:40777431
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术，揭示了人类骶尾部畸胎瘤的细胞组成异质性及其与X染色体失活状态的联系 | 首次在骶尾部畸胎瘤中结合单核RNA测序与空间转录组学分析，揭示了X染色体双等位基因激活与肿瘤细胞身份及性别偏好的关联 | 样本量较小（仅8个肿瘤），且未检测到假定的多能性细胞群 | 探究骶尾部畸胎瘤的细胞起源、临床分层机制及性别偏好的分子基础 | 人类骶尾部畸胎瘤组织样本（包括产后和产前样本） | 单细胞组学 | 骶尾部畸胎瘤 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 8个骶尾部畸胎瘤样本（6个产后样本：1男5女；2个产前样本：均为女性） | NA | 单核RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 348 | 2026-01-28 |
SpaceBF: Spatial coexpression analysis using Bayesian Fused approaches in spatial omics datasets
2025-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.29.646124
PMID:40236135
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpaceBF的贝叶斯融合建模框架，用于在空间组学数据中分析分子间的空间共表达模式 | 开发了首个基于贝叶斯融合方法的框架，能够同时估计局部（位置特异性）和全局（组织范围）的分子共表达，相比现有主要依赖地理空间指标（如双变量Moran's和Lee's）的方法具有更高的特异性和检测能力 | NA | 解决空间组学数据中分子对空间共表达检测方法不足的问题，以更好地理解细胞间通讯 | 空间组学数据中的分子对（包括基因、肽、脂质、N-聚糖等） | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学，质谱成像 | 贝叶斯融合模型 | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学，质谱成像 | NA | NA |
| 349 | 2026-01-28 |
Co-regulator activity of Mediator of DNA Damage Checkpoint 1 (MDC1) is associated with DNA repair dysfunction and PARP inhibitor sensitivity in lobular carcinoma of the breast
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.29.564555
PMID:39677775
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺浸润性小叶癌（ILC）中MDC1蛋白作为雌激素受体共调节因子的新功能，并发现该功能与同源重组修复功能障碍及PARP抑制剂敏感性相关 | 首次发现MDC1在ILC细胞中作为雌激素受体的共调节因子，并揭示这种新功能导致独特的同源重组修复功能障碍（不同于经典BRCAness状态），且与PARP抑制剂敏感性相关 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，临床样本验证有限；MDC1共调节功能的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究乳腺浸润性小叶癌中MDC1蛋白的双重功能（DNA修复与雌激素受体共调节）及其治疗意义 | 乳腺浸润性小叶癌细胞系、异种移植模型及肿瘤数据 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析、DNA修复活性分析、蛋白质相互作用组分析、异种移植模型 | NA | 转录组数据、蛋白质相互作用数据、功能实验数据 | 多个ILC细胞系及异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 350 | 2026-01-28 |
Uncovering the Signatures of Cellular Senescence in the Human Dorsolateral Prefrontal Cortex
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639091
PMID:40027780
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单核RNA测序技术，构建了人类背外侧前额叶皮层衰老和细胞衰老的转录组图谱 | 结合Visium空间转录组学和单核RNA测序，首次在非病理人类组织中系统揭示了背外侧前额叶皮层细胞衰老的异质性和细胞类型特异性特征 | 研究基于非病理组织，可能未完全反映疾病状态下的衰老特征；细胞衰老的罕见性和异质性仍带来识别挑战 | 探索人类背外侧前额叶皮层在衰老过程中的细胞衰老特征和转录组变化 | 人类背外侧前额叶皮层的非病理组织样本 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单核RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 10x Visium，10x Chromium | Visium空间转录组学用于空间基因表达分析，单核RNA测序用于细胞类型特异性转录组分析 |
| 351 | 2026-01-28 |
Hepatic Arterial Flow-Induced Portal Tract Fibrosis in Portal Hypertension: The Role of VCAM-1 and Osteopontin-Expressing Macrophages
2025-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.31.634947
PMID:39975181
|
研究论文 | 本研究探讨了门脉高压中肝动脉血流增加通过VCAM-1和骨桥蛋白阳性巨噬细胞驱动门管区纤维化的分子机制 | 揭示了肝动脉缓冲反应通过VCAM-1介导的巨噬细胞招募和骨桥蛋白表达驱动门管区纤维化的新机制 | 研究基于大鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究门脉高压中肝动脉血流增加导致门管区纤维化的分子机制 | Sprague-Dawley大鼠门脉高压模型 | 病理生理学 | 门脉高压 | 微CT、免疫细胞分析、血流动力学测量、转录组分析、单细胞RNA测序、RNA-FISH | NA | 影像数据、血流数据、转录组数据、单细胞测序数据 | Sprague-Dawley大鼠门脉高压模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 352 | 2026-01-28 |
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Dec, Advances in neural information processing systems
DOI:10.52202/079017-1129
PMID:41551654
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研究论文 | 本研究介绍了STimage-1K4M数据集，该数据集通过提供子图块图像的基因组特征，弥补了现有医学图像-文本数据集中文本描述不足的缺陷 | STimage-1K4M数据集首次将空间转录组学数据与组织病理学图像结合，为子图块区域提供高维基因表达信息，实现了前所未有的数据粒度 | 数据集仅包含1,149张图像，可能无法覆盖所有病理类型或变异，且基因表达维度较高可能增加计算复杂度 | 旨在推动多模态数据分析在计算病理学等领域的先进研究 | 空间转录组学数据衍生的组织病理学图像及其对应的基因表达信息 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据 | 1,149张图像，分解为4,293,195个子图块-基因表达对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 353 | 2026-01-28 |
UBR7 E3 Ligase Suppresses Interferon-β Mediated Immune Signaling by Targeting Sp110 in Hepatitis B Virus-Induced Hepatocellular Carcinoma
2024-11-08, ACS infectious diseases
IF:4.0Q1
DOI:10.1021/acsinfecdis.4c00213
PMID:38938101
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研究论文 | 本研究揭示了E3泛素连接酶UBR7通过泛素化Sp110蛋白，抑制I型干扰素信号通路，从而促进乙型肝炎病毒（HBV）持续感染和HBV诱导的肝细胞癌（HCC）发生的新机制 | 首次发现UBR7在非组蛋白（Sp110）泛素化中的新功能，并阐明其通过下调I型干扰素反应促进HBV持续感染和HCC发生的分子机制 | 研究主要基于体外细胞模型和患者样本分析，缺乏体内动物模型验证；UBR7-Sp110轴在HCC发生发展中的具体调控网络仍需进一步探索 | 探究UBR7在HBV诱导的肝细胞癌发生中的作用机制 | 乙型肝炎病毒（HBV）、肝细胞癌（HCC）细胞、HCC患者样本 | 分子生物学与肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq、转录组学分析、基因敲低 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | HCC患者样本（具体数量未明确说明） | NA | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq | NA | NA |
| 354 | 2026-01-28 |
Meta-atlas of Juvenile and Adult Enteric Neuron scRNA-seq for Dataset Comparisons and Consensus on Transcriptomic Definitions of Enteric Neuron Subtypes
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.31.621315
PMID:39574584
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研究论文 | 本文通过整合多个小鼠肠道神经系统单细胞RNA测序数据集，构建了一个元图谱，旨在识别新的细胞类型、共享标记基因，并达成对肠道神经元亚型转录组定义的共识 | 首次系统整合多个独立的小鼠肠道神经系统scRNA-seq数据集，生成共识元图谱，以改善罕见神经元类别的分辨率，并连接转录组谱与历史分类系统 | 数据集依赖于不同的细胞分离和文库生成方法，可能导致细胞类型检测差异；未来研究需将深度转录组谱与历史分类系统更紧密连接 | 通过整合scRNA-seq数据集，达成对肠道神经元亚型转录组定义的共识，并提高罕见神经元类别的检测能力 | 小鼠肠道神经系统中的神经元 | 单细胞转录组学 | 肠道动力障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个独立数据集，涉及数百至数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 355 | 2026-01-28 |
Adding Highly Variable Genes to Spatially Variable Genes Can Improve Cell Type Clustering Performance in Spatial Transcriptomics Data
2024-Oct-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5315913/v1
PMID:39502778
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研究论文 | 本研究探讨在空间转录组学数据中，将高变异基因与空间变异基因结合是否能提升细胞类型聚类性能 | 首次系统评估高变异基因与空间变异基因联合使用对细胞类型聚类的影响，覆盖多个平台和超过50个真实数据集 | 未详细探讨基因选择方法对聚类结果的具体影响机制，可能受数据集异质性限制 | 提高空间转录组学数据中细胞类型聚类的准确性和效率 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | 超过50个真实空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 356 | 2026-01-28 |
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Jun-20, ArXiv
PMID:38947920
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研究论文 | 本研究介绍了STimage-1K4M数据集，该数据集通过空间转录组学数据提供子图块图像的基因组特征，以弥补现有医学图像-文本数据集中文本描述不足的缺陷 | STimage-1K4M是首个将病理图像子图块与高维基因表达数据（15,000-30,000维）配对的大规模数据集，提供了前所未有的空间分辨率，支持多模态数据分析的深入研究 | 数据集中仅包含1,149张原始图像，且基因表达数据维度较高，可能对计算资源要求较高，同时未提及数据来源的具体疾病类型或样本多样性 | 旨在通过提供细粒度的图像-基因表达配对数据，推动计算病理学和多模态算法的发展 | 空间转录组学数据中的病理图像及其对应的基因表达信息 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像和基因表达数据 | 1,149张图像，分解为4,293,195个子图块-基因表达对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 357 | 2026-01-28 |
Airway injury induces alveolar epithelial and mesenchymal responses mediated by macrophages
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.02.587596
PMID:38617297
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型探究气道特异性上皮损伤如何引发远端肺泡、免疫和间质细胞的次级组织范围响应 | 首次揭示急性气道损伤可通过肺泡巨噬细胞介导的骨桥蛋白信号通路，触发远端肺泡Ⅱ型细胞的瞬时增殖和新型间质细胞群（MANC2）的动态变化 | 研究基于小鼠模型，人类组织中的验证尚需进一步开展 | 探究气道损伤对远端肺组织微环境的影响机制 | 小鼠气道-肺泡组织 | 单细胞转录组学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 358 | 2026-01-28 |
Integrative multiomics analysis of neointima proliferation in human saphenous vein: implications for bypass graft disease
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.14.567053
PMID:38014255
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探索了人类大隐静脉中新生内膜增殖的分子机制，为冠状动脉旁路移植术中的移植物疾病提供新见解 | 首次在人类大隐静脉组织培养模型中整合RNA测序、蛋白质组学和空间转录组学，揭示了新生内膜增殖过程中的新细胞亚群和分子动态 | 研究基于离体组织培养模型，可能无法完全模拟体内生理环境；样本量相对有限（73例患者） | 探究人类大隐静脉在冠状动脉旁路移植术中新生内膜增殖的分子和细胞机制 | 人类大隐静脉组织样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序, 蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 空间转录组数据 | 73例患者的大隐静脉样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 359 | 2026-01-27 |
KCMF1 regulates HRI ubiquitination to inhibit the integrated stress response in ovarian cancer
2026-Mar, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117634
PMID:41391693
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研究论文 | 本研究探讨了钾通道调节因子1（KCMF1）在卵巢癌中的生物学功能及其通过调节HRI泛素化抑制整合应激反应（ISR）的机制 | 首次揭示了KCMF1通过调控HRI泛素化抑制ISR通路促进卵巢癌进展的新机制，并鉴定出Plantainoside D作为新型KCMF1抑制剂 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，缺乏临床患者样本的深入验证 | 探究KCMF1在卵巢癌中的生物学功能及分子机制 | 卵巢癌细胞系、异种移植小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、qRT-PCR、免疫组化、Western blot、Ni-NTA pull-down | 异种移植小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像 | 未明确样本数量，使用细胞系和动物模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 360 | 2026-01-27 |
Dissecting Heterogeneity Reveals Functional Subpopulation of Stem Cells From Human Exfoliated Deciduous Teeth
2026-Feb, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.104014
PMID:41202532
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术鉴定了人脱落乳牙干细胞的功能亚群，并揭示了其血管生成和软骨生成能力 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定了SHEDs中的BAMBI⁺功能亚群，并证实其具有更强的增殖、软骨生成和血管生成能力 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内验证；样本来源有限，可能影响结果的普适性 | 鉴定人脱落乳牙干细胞的功能亚群表面标记，为干细胞精细化应用提供理论基础 | 人脱落乳牙干细胞（SHEDs） | 单细胞组学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、qPCR、Western blot、组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |