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当前共找到 35760 篇文献,本页显示第 3481 - 3500 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3481 2025-12-04
Spatial transcriptomics reveals the distinct organization of mouse prefrontal cortex and neuronal subtypes regulating chronic pain
2023-11, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术揭示了小鼠前额叶皮层在细胞类型组成和基因表达模式上的独特性,并识别了调节慢性疼痛的特定神经元亚型和环路 首次通过空间分辨单细胞转录组分析,系统描绘了成年小鼠前额叶皮层的细胞与环路组织,并发现了其与邻近皮层区域的差异,以及神经元亚型在慢性疼痛中的特异性作用 研究仅基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;空间转录组学技术可能受分辨率限制,影响细胞亚型精细识别 解码前额叶皮层在认知、情感、执行功能和疼痛处理等多样功能中的细胞与环路组织机制 成年小鼠的前额叶皮层组织 空间转录组学 慢性疼痛 空间分辨单细胞转录组分析 NA 空间转录组数据 未明确指定样本数量,基于成年小鼠前额叶皮层组织 NA 空间转录组学 NA NA
3482 2025-12-04
DNA-binding protein PfAP2-P regulates parasite pathogenesis during malaria parasite blood stages
2023-11, Nature microbiology IF:20.5Q1
研究论文 本研究鉴定并表征了恶性疟原虫中一个关键的AP2转录因子PfAP2-P,揭示了其在疟原虫血液阶段发育、致病性和有性阶段转换中的调控作用 首次系统性地揭示了PfAP2-P作为上游转录调控因子,在疟原虫血液阶段发育周期中两个不同时间点的表达高峰及其对多种致病相关基因的调控机制 研究主要基于体外实验和测序数据,体内功能验证和具体调控通路的分子机制仍需进一步探索 探究疟原虫血液阶段发育中转录因子对致病性的调控机制 恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)及其AP2转录因子PfAP2-P 分子生物学与寄生虫学 疟疾 染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、荧光激活细胞分选(FACS) NA 基因组测序数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3483 2025-12-04
A new Bayesian factor analysis method improves detection of genes and biological processes affected by perturbations in single-cell CRISPR screening
2023-11, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文提出了一种名为引导稀疏因子分析(GSFA)的新统计方法,用于分析单细胞CRISPR筛选数据,以提高检测受遗传扰动影响的基因和生物过程的效率 GSFA通过推断代表共调控基因或基因模块的潜在因子,并借用这些因子的信息来推断遗传扰动对单个基因的影响,从而在检测扰动效应方面比现有方法具有更高的统计功效 NA 开发一种统计方法以更有效地分析单细胞CRISPR筛选数据,检测受遗传扰动影响的基因和生物过程 单细胞CRISPR筛选数据,具体来自人类CD8 T细胞和神经祖细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序,CRISPR筛选 贝叶斯因子分析,引导稀疏因子分析(GSFA) 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3484 2025-12-04
The cellular states and fates of shed intestinal cells
2023-11, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 本研究通过批量及单细胞RNA测序分析雄性小鼠肠道粪便洗涤物,揭示了脱落肠上皮细胞在肠道腔内的存活状态及功能 首次证明脱落肠上皮细胞在肠道腔内保持活性,并上调独特的抗菌程序,同时识别了免疫细胞的脱落现象及其在结肠炎中的增加 技术限制先前阻碍了对脱落肠细胞状态和命运的研究,本研究可能受限于小鼠模型和粪便样本的复杂性 探究脱落肠细胞的细胞状态、命运及其在肠道腔内的潜在功能 雄性小鼠的肠道粪便洗涤物中的脱落肠上皮细胞和免疫细胞 单细胞组学 结肠炎 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 雄性小鼠肠道粪便洗涤物样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
3485 2025-12-04
Learning single-cell perturbation responses using neural optimal transport
2023-11, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文提出CellOT框架,利用最优传输理论和输入凸神经网络架构,从非配对分布中学习单个细胞对扰动的响应 结合最优传输理论与输入凸神经网络,首次实现从非配对单细胞数据中学习异质性扰动响应 方法依赖于单细胞测量需破坏细胞的限制,仅能处理非配对分布数据 预测单细胞在化学、遗传或机械扰动下的分子响应 单个细胞 机器学习 NA scRNA-seq, 多重蛋白质成像技术 神经网络 单细胞RNA测序数据, 蛋白质成像数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
3486 2025-12-04
Single-cell dissection of cellular and molecular features underlying mesenchymal stem cell therapy in ischemic acute kidney injury
2023-10-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了间充质干细胞在缺血性急性肾损伤治疗中的细胞和分子机制 首次使用无偏单细胞RNA测序解析MSC治疗AKI的详细修复机制,并发现MSC来源的miR-26a-5p通过抑制Zeb2表达来抑制促纤维化TECs和免疫细胞招募 研究基于IRI模型,可能无法完全反映所有类型AKI的机制;单细胞测序数据为观察性,需进一步功能验证 探究间充质干细胞治疗缺血性急性肾损伤的细胞和分子机制 缺血再灌注损伤(IRI)模型小鼠的肾脏组织细胞 数字病理学 急性肾损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 IRI模型小鼠(有/无MSC治疗)的肾脏单细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3487 2025-12-04
A subpopulation of lipogenic brown adipocytes drives thermogenic memory
2023-10, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 本文探讨了短暂冷暴露如何通过脂源性棕色脂肪细胞亚群驱动“产热记忆”,从而改善二次冷暴露的产热反应 揭示了脂源性棕色脂肪细胞亚群在产热记忆中的关键作用,并发现酰基肉碱的补充足以模拟改善的二次冷反应 未明确说明研究的局限性,如样本量或实验模型的潜在限制 研究短暂环境刺激下棕色脂肪组织的长期适应机制,以探索对抗肥胖的潜在治疗策略 棕色脂肪组织及其脂源性亚群 单细胞组学 肥胖 单核RNA测序,空间转录组学 NA 转录组数据,空间转录组数据 NA NA 单核RNA测序,空间转录组学 NA NA
3488 2025-12-04
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Difference of Aortic Atherosclerosis Response to Phytosterols and Oxidation Products of Sterols
2023-06, Molecular nutrition & food research IF:4.5Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了植物甾醇及其氧化产物对主动脉粥样硬化细胞异质性的不同影响 首次在单细胞水平上比较了植物甾醇、胆固醇氧化产物和植物甾醇氧化产物对主动脉细胞组成的差异影响,并鉴定了四个功能不同的成纤维细胞亚群 研究基于ApoE-/-小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;样本量未明确说明 探究饮食中植物甾醇及其氧化产物在动脉粥样硬化发展中对主动脉细胞的影响机制 ApoE-/-小鼠的主动脉细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3489 2025-12-04
PfAP2-MRP DNA-binding protein is a master regulator of parasite pathogenesis during malaria parasite blood stages
2023-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文鉴定并表征了疟原虫血液阶段的关键转录因子PfAP2-MRP,揭示了其在调控寄生虫生长、抗原变异和染色质结构中的核心作用 首次将PfAP2-MRP鉴定为疟原虫致病性的主调控因子,并阐明其在两个不同发育阶段(滋养体和裂殖体)的转录调控机制,包括通过ChIP-seq、单细胞RNA-seq和Hi-C技术揭示其对基因表达和染色质构象的多层次控制 研究主要基于体外实验和特定时间点的分析,可能未完全反映体内复杂环境下的调控网络;基因敲除模型的长期效应和临床相关性有待进一步验证 探究疟原虫在红细胞内发育周期中致病性的分子调控机制,特别是转录因子在寄生虫生长、宿主细胞重塑和免疫逃避中的作用 恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)的血液阶段寄生虫,重点关注其转录因子PfAP2-MRP及相关基因家族 分子生物学与寄生虫学 疟疾 ChIP-seq、单细胞RNA-seq、荧光激活细胞分选、染色体构象捕获(Hi-C)、诱导性基因敲除 NA 基因组DNA、RNA、染色质互作数据 NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学(未明确指定平台) NA NA
3490 2025-12-03
Transcriptional and temporal heterogeneity of developing α cells revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Dec-15, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了发育中α细胞的转录和时间异质性 利用时间分辨报告小鼠系“Gcg-Timer”进行单细胞转录组分析,首次展示了α细胞生成过程中的转录动态和细胞异质性,并发现线粒体转录本在α细胞中比在发育中的β细胞中表达更显著 研究主要基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;单细胞测序技术本身存在技术噪音和批次效应 探索胰腺α细胞在发育过程中的转录动态和细胞异质性 小鼠胚胎中的Gcg表达α细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3491 2025-12-03
Identification and Validation of Phagocytosis-Regulating Factors as Potential Prognostic and Diagnostic Biomarkers for Intracerebral Hemorrhage Through Single-Cell and Bulk Transcriptomic
2025-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞和批量转录组学分析,识别并验证了吞噬作用调控因子作为脑出血潜在预后和诊断生物标志物 首次结合单细胞RNA测序和机器学习方法,系统识别了与脑出血相关的吞噬调控基因,并构建了ceRNA调控网络 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证 探索吞噬作用调控因子在脑出血中的诊断和预后价值 脑出血患者与正常脑组织的转录组数据 生物信息学 脑出血 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习 机器学习特征选择算法, CIBERSORT算法 转录组数据 来自GEO数据库的多个数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
3492 2025-12-03
CASP1 as a potential target of Dendrobium in Sjögren's syndrome: Multi-omics analysis and preliminary experimental evidence
2025-Dec-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过多组学整合分析,探讨了CASP1在原发性干燥综合征(pSS)发病机制中的潜在作用,以及中药成分石斛的可能治疗机制 首次通过多组学整合分析(包括转录组、网络药理学、单细胞测序和分子对接)系统性地识别了CASP1作为pSS的潜在治疗靶点,并验证了石斛活性成分与CASP1的结合潜力 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证,因果关系和治疗效果需要进一步的功能验证研究 探索CASP1在pSS发病机制中的作用及石斛的治疗机制 原发性干燥综合征(pSS)患者 生物信息学 干燥综合征 转录组测序, 单细胞测序, RT-qPCR, 分子对接 NA 基因表达数据, 单细胞测序数据 65名pSS患者及健康对照 NA 单细胞RNA-seq, 转录组测序 NA NA
3493 2025-12-03
IRF5 siRNA Nanoimmunotherapy: Restoring Macrophage Efferocytosis in Atherosclerosis
2025-Dec-02, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究开发了一种靶向IRF5的siRNA纳米免疫治疗平台,用于恢复动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞的胞葬功能 利用工程化siRNA纳米颗粒平台特异性抑制斑块不稳定巨噬细胞分子IRF5,首次实现通过siIRF5纳米免疫治疗增强斑块巨噬细胞的胞葬能力并改善斑块稳定性 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体中验证疗效和安全性 开发治疗动脉粥样硬化的新型免疫治疗方法 动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞(特别是Cd11c+和Trem2hi亚群) 纳米医学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 2个独立的ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3494 2025-12-03
Profiling Cell-state Fingerprints Based on Deep Learning Model with Meta-programs of Pan-cancer
2025-Dec-02, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 本研究基于深度学习模型StateNet,利用泛癌元程序生成细胞状态指纹,以分析癌症细胞状态的共性与个体差异 开发了深度学习模型StateNet,首次基于泛癌元程序生成细胞状态指纹,用于揭示癌症细胞的共享特征和个体特性,并识别了ACAT2作为缺氧与脂质代谢通路的关键介导因子 研究主要依赖单细胞RNA测序数据,可能未涵盖所有细胞状态或组织类型,且样本量虽大但仍有扩展空间 旨在解析泛癌中细胞状态的共同机制和个体差异,开发工具用于癌症分析和预后预测 159,372个细胞,来自245个细胞系,覆盖14种组织类型,以及3,210个癌症样本 机器学习 泛癌 单细胞RNA测序 深度学习模型StateNet 单细胞RNA测序数据 159,372个细胞(来自245个细胞系)和3,210个癌症样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3495 2025-12-03
Spatiotemporal liver dynamics shape hepatocellular heterogeneity and impact in vivo gene engineering
2025-Dec, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究通过克隆追踪、单细胞和空间转录组学技术,探索了小鼠肝脏生长过程中肝细胞异质性的演变及其对体内基因工程的影响 揭示了新生肝脏中克隆性肝细胞在空间生态位中的定位及其对成年组织生成的贡献,并展示了靶向这些细胞可提高基因编辑效率 研究主要基于小鼠模型,结果在人类肝脏中的适用性尚需进一步验证 探究肝细胞异质性在肝脏生长中的动态变化及其对体内基因治疗策略的影响 不同年龄阶段的小鼠肝脏组织 数字病理学 NA 克隆追踪、单细胞转录组学、空间转录组学 NA 转录组数据、空间数据 不同年龄的小鼠肝脏样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3496 2025-12-03
Spatial Transcriptomics of Developing Wheat Seed Reveals Concentric Gene Expression Zones and Subgenome Biased Expression of Key Genes
2025-Dec, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
研究论文 本研究利用STOmics空间转录组平台,可视化小麦种子在灌浆关键期的基因表达空间模式,揭示了胚乳中的同心表达区域和亚基因组偏向表达的关键基因 首次在小麦种子中应用空间转录组技术,实现了亚细胞分辨率的转录本定位,识别了与八个功能细胞群相关的基因表达簇,并发现了胚乳内四个同心区域的表达模式 研究仅聚焦于14 DPA(花后天数)的小麦种子,未覆盖整个发育过程,且样本量有限 探究小麦种子发育过程中基因表达的空间组织,以理解营养储存、胁迫耐受和萌发等关键过程 小麦(Triticum aestivum)种子,特别是在灌浆关键期的发育阶段 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 超过4,000,000个空间解析的转录本 STOmics 空间转录组学 STOmics空间转录组平台 NA
3497 2025-12-03
Spatial Cross-talk Modeling of the Tumor Microenvironment Identifies CCR5-Mediated Glia-to-Glia Signaling as a Key Regulator of Brain Metastatic Progression
2025-Dec-01, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学和细胞间通讯分析,揭示了脑转移瘤微环境中胶质细胞间信号传导的关键作用,并提出了靶向CCR5介导的胶质细胞信号传导作为治疗新策略 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学,系统解析脑转移进展中胶质细胞间的空间交互作用,并发现CCL4-CCR5信号轴可作为治疗靶点 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证不足;靶向治疗的长效性和潜在脱靶效应未充分评估 探究脑转移瘤微环境中胶质细胞间信号传导机制及其对肿瘤进展的调控作用 脑转移瘤微环境中的星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞 空间转录组学 脑转移瘤 RNA测序, 空间转录组学, 细胞间通讯分析 NA 转录组数据, 空间表达数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
3498 2025-12-03
Combining Mendelian randomization and network toxicology to decipher the causal role and molecular mechanisms of environmental pollutants in breast cancer: A focus on Methyl-4-hydroxybenzoate
2025-Dec, Cancer epidemiology IF:2.4Q2
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化和网络毒理学方法,探讨了环境污染物甲基对羟基苯甲酸酯在乳腺癌中的因果作用及分子机制 首次结合孟德尔随机化和网络毒理学,提出了一种非雌激素受体依赖的致癌机制假说,涉及生长因子信号传导失调和代谢重编程 研究主要基于遗传数据和计算分析,缺乏直接的实验验证,且样本来源有限(如FinnGen联盟) 探究甲基对羟基苯甲酸酯在乳腺癌中的因果角色及其非雌激素机制 乳腺癌患者及尿液甲基对羟基苯甲酸酯硫酸盐的遗传数据 生物信息学 乳腺癌 孟德尔随机化分析、网络毒理学、转录组分析、单细胞/空间RNA测序、分子对接 NA 遗传数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 尿液MEP硫酸盐数据n=8285,FinnGen联盟乳腺癌风险数据n=182,927 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
3499 2025-12-03
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing analysis reveals cuproptosis-related proteins in Crohn's disease
2025-Dec, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,揭示了克罗恩病中与铜死亡相关的蛋白标志物及其与代谢和免疫的关联 首次将铜死亡相关蛋白与克罗恩病联系起来,并整合批量与单细胞数据构建诊断模型,揭示了CD274、PDK1、CP和SLC31A2等新标志物 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;单细胞分析仅为初步探索性结果,需进一步功能研究确认 探索铜死亡相关蛋白在克罗恩病中的作用,并构建诊断模型 克罗恩病患者炎症组织与非炎症组织 生物信息学 克罗恩病 RNA测序,单细胞RNA测序,RT-qPCR 诊断模型 基因表达数据 494例组织样本(批量数据)和25,121个细胞(单细胞数据) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3500 2025-12-03
Systematically Revealing Quantitative Multi-Target Integrative Effects of Plants With Artificial Intelligence Method
2025-Dec, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
研究论文 本研究开发了一种基于人工智能的新方法,以山楂为例,系统揭示了植物在单细胞水平上对疾病的多靶点潜在整合效应 提出了一种基于深度自编码神经网络模型的新方法,将植物与疾病之间多个共同靶点在单细胞转录组中的表达水平编码为一个整合值(MTIS),首次在单细胞水平上实现了植物多靶点潜在整合效应的景观和定量图谱 该方法目前仅以山楂和动脉粥样硬化为例进行了验证,其广泛适用性有待更多植物和疾病模型的进一步测试 系统揭示植物对疾病的定量多靶点整合效应 山楂(植物)对动脉粥样硬化疾病的影响 机器学习 心血管疾病 单细胞转录组测序 深度自编码神经网络 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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