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当前共找到 35760 篇文献，本页显示第 3441 - 3460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3441 | 2025-12-04 |
Single-cell multiomics reveals macrophage-derived IL-23 and CXCL9/10 drive pathogenic IFNG+IL17+ T cells in immunotherapy-related colitis
2025-Nov-29, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011959
PMID:41320225
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了巨噬细胞来源的IL-23和CXCL9/10驱动IFNG+IL17+ T细胞在免疫治疗相关结肠炎中的致病作用 | 首次在免疫治疗相关结肠炎中鉴定出具有双重Th1/Th17特征的致病性IFNG+IL17+CD4+ T细胞亚群，并阐明其由组织驻留记忆T细胞分化而来，同时揭示了巨噬细胞通过IL-23和CXCL9/10信号通路驱动该过程的机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，需要更大规模的人类队列验证；机制研究虽深入但部分信号通路的具体调控细节仍需进一步探索 | 阐明免疫检查点阻断治疗相关结肠炎的免疫病理机制，并寻找不影响抗肿瘤疗效的治疗靶点 | 免疫治疗相关结肠炎患者和小鼠模型中的免疫细胞，特别是IFNG+IL17+CD4+ T细胞和肠道巨噬细胞 | 数字病理学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 空间转录组学, 流式细胞术, qPCR, 体内中和抗体阻断, 巨噬细胞耗竭 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, T细胞受体序列数据, 流式细胞术数据, qPCR数据 | 人类irColitis病变样本和小鼠模型样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3442 | 2025-12-04 |
Neutrophil extracellular traps-STC1 positive feedback loop promotes immune evasion and metastasis in bladder cancer
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012736
PMID:41314976
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研究论文 | 本研究揭示了膀胱癌中中性粒细胞胞外陷阱（NETs）与抗吞噬检查点STC1之间的正反馈环路在促进免疫逃逸和转移中的关键作用 | 首次发现NETs通过TLR2-MAPK-FosL1轴上调STC1，形成NETs-STC1自增强反馈环路，并阐明STC1通过隔离钙网蛋白抑制抗原呈递及分泌形式增强NET形成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床验证仍需进一步开展；反馈环路在其他癌症类型中的普适性未明确 | 探究膀胱癌免疫治疗耐药机制及NETs在其中的作用 | 膀胱癌患者临床队列、小鼠肺转移模型、肿瘤细胞与中性粒细胞共培养体系 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 免疫荧光染色、扫描电镜、蛋白质组学、单细胞转录组学 | 小鼠肺转移模型 | 临床队列数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据、影像数据 | 多个接受免疫检查点抑制剂治疗的临床队列（具体样本量未明确） | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 3443 | 2025-12-04 |
Cellular dynamics in cerebrospinal fluid unveils the key regulators of intracranial response to immune checkpoint inhibitors in NSCLC brain metastases
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012071
PMID:41314983
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了非小细胞肺癌脑转移患者在接受免疫检查点抑制剂治疗期间，脑脊液和脑转移瘤中的细胞动态变化，并识别出CD4+PDCD1+CXCR6+ T细胞作为颅内治疗反应的关键预测因子 | 首次在脑脊液中利用单细胞RNA测序构建了高分辨率的细胞动态图谱，并鉴定出CD4+PDCD1+CXCR6+ T细胞这一新型免疫细胞亚群作为免疫检查点抑制剂颅内疗效的阳性预测标志物 | 样本量相对较小（脑脊液样本n=20），且依赖于外部数据库数据进行整合分析，可能需要更大规模的前瞻性队列验证 | 探索非小细胞肺癌脑转移患者对免疫检查点抑制剂治疗的颅内反应机制，并寻找预测性生物标志物 | 非小细胞肺癌伴脑转移的患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 蛋白质组学分析, 多重免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 蛋白质组数据, 免疫组织化学图像 | 脑脊液样本20例, 外部数据库样本20例, 流式细胞验证队列8例, 蛋白质组学验证队列31例, 多重免疫组化验证队列25例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3444 | 2025-12-04 |
Blocking PCSK9 suppresses hepatocellular carcinoma immune escape by decreasing FLI1-mediated SPP1 and PD-L1 expression
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012586
PMID:41314977
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研究论文 | 本研究揭示了PCSK9通过NOTCH3/FLI1信号通路上调SPP1和PD-L1表达，从而促进肝细胞癌免疫逃逸的机制，并探索了基于CRISPR碱基编辑和小分子抑制剂的干预策略 | 首次发现PCSK9通过NOTCH3/FLI1通路调控SPP1和PD-L1表达，介导肝细胞癌免疫逃逸，并开发了新型ABE碱基编辑器和小分子抑制剂parecoxib作为治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，尚未在人体临床试验中验证，且PCSK9抑制剂parecoxib的具体作用机制和长期安全性需进一步研究 | 揭示PCSK9促进肝细胞癌免疫逃逸的分子机制，并探索靶向PCSK9的治疗策略 | 肝细胞癌细胞系（Hepa1-6、H22、HepG2）、小鼠肝细胞癌模型、CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、CRISPR腺嘌呤碱基编辑、共培养实验 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 多种肝细胞癌细胞系及小鼠模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3445 | 2025-12-04 |
Selective modification of glycoprotein substrates by GnT-V in mouse kidney
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113894
PMID:41323266
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠肾脏中N-乙酰葡糖胺转移酶-V（GnT-V）对蛋白质底物选择性的机制 | 通过凝集素辅助蛋白质组学鉴定出ANPEP和MEP1A为GnT-V的主要底物，并揭示了修饰位点的结构特征和极化亚细胞运输在选择性修饰中的作用 | 研究仅基于小鼠肾脏模型，未在其他组织或物种中验证，且机制细节仍需进一步探索 | 探究GnT-V在蛋白质选择性糖基化中的机制 | 小鼠肾脏中的糖蛋白底物，特别是ANPEP和MEP1A | 糖生物学 | NA | 凝集素辅助蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3446 | 2025-12-04 |
Niclosamide suppresses gastric cancer progression through YTHDF2 inhibition-affected lactate metabolic reprogramming
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113868
PMID:41323282
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了胃癌的代谢重编程特征，并发现药物氯硝柳胺通过抑制m6A甲基化调控蛋白YTHDF2来影响代谢基因，从而抑制胃癌进展 | 首次将氯硝柳胺的抗癌作用与m6A甲基化调控蛋白YTHDF2联系起来，并系统阐明了其在调节乳酸代谢重编程和肿瘤微环境乳酸穿梭中的作用机制 | NA | 探究胃癌代谢重编程的分子机制，并评估氯硝柳胺通过靶向YTHDF2抑制胃癌进展的治疗潜力 | 胃癌患者样本、胃癌细胞系 | 肿瘤代谢 | 胃癌 | 非靶向代谢组学、转录组学、单细胞RNA-seq | NA | 代谢组数据、转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3447 | 2025-12-04 |
stTransfer enables transfer of single-cell annotations to spatial transcriptomics with single-cell resolution
2025-Nov-17, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101205
PMID:41101315
|
研究论文 | 本文提出了一种名为stTransfer的方法，通过整合单细胞RNA测序数据和空间转录组数据，利用图自编码器和迁移学习实现单细胞级别的细胞类型注释 | stTransfer方法通过图自编码器和迁移学习最小化scRNA-seq与ST数据集间的信息传递损失，在准确性和鲁棒性上优于现有方法 | 未在摘要中明确说明 | 解决空间转录组技术中因检测灵敏度和基因覆盖度限制导致的单细胞级别细胞类型注释难题 | 斑胸草雀视顶盖的高精度Stereo-seq数据集中的神经元群体 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 图自编码器, 迁移学习 | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Stereo-seq | 高精度Stereo-seq |
| 3448 | 2025-12-04 |
GPR15 and CD38 define a subset of peripheral blood pathogenic effector Th2 cells associated with active eosinophilic esophagitis
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.16.688265
PMID:41332632
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，识别了外周血中GPR15+ CD38+致病性效应Th2细胞亚群与活动性嗜酸性食管炎的关联 | 首次将外周血GPR15+致病性效应Th2细胞与食管组织中的对应细胞直接关联，并发现CD38表达上调可作为活动性疾病的标志，为非侵入性诊断提供了新靶点 | 样本量相对有限（外周血74例，活检17例；单细胞测序外周血27例，活检10例），且机制研究如环境暴露的具体因素需进一步探索 | 评估GPR15+致病性效应Th2细胞在嗜酸性食管炎发病机制中的作用及其作为疾病状态生物标志物的潜力 | 嗜酸性食管炎患者及对照者的外周血和食管活检样本 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 流式细胞术：74例外周血样本和17例活检样本；单细胞RNA测序：27例外周血样本和10例活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3449 | 2025-12-04 |
Integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome data reveals age-related immune cell alterations in primary glioblastoma associated with prognosis
2025-Nov-12, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04206-w
PMID:41222641
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据分析，揭示了原发性胶质母细胞瘤中与年龄相关的免疫细胞变化及其与预后的关联 | 首次系统比较了原发性与复发性胶质母细胞瘤中年龄相关的免疫细胞差异，并发现小胶质细胞在老年原发性患者中经历显著的细胞状态变化，其中HSPB1高表达与不良预后相关 | 研究样本量相对有限，单细胞数据仅来自25名患者，且主要依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探究衰老如何影响胶质母细胞瘤进展，特别是年龄相关的免疫细胞变化在原发性与复发性肿瘤中的差异 | 胶质母细胞瘤患者（包括原发性和复发性）以及年轻和老年小鼠的异种移植模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，批量转录组分析，细胞间通讯分析，轨迹分析 | NA | 转录组数据，临床数据，基因组变异数据 | 13名原发性胶质母细胞瘤患者和12名复发性患者，共计88,908个细胞的单细胞数据；TCGA和CGGA数据库的批量数据；年轻和老年小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 3450 | 2025-12-04 |
Tumor microenvironment remodeling across thyroid cancer differentiation states revealed by spatial transcriptomics
2025-Nov-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04210-0
PMID:41182416
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了甲状腺癌去分化过程中肿瘤微环境的动态重塑 | 首次在甲状腺癌不同分化状态中应用空间转录组学技术，系统揭示了去分化与免疫抑制性肿瘤微环境（特别是髓系细胞和CAFs增加）的空间关联，并识别了JAK-STAT和VEGF信号通路的激活 | 样本量较小（仅12例患者），需要更大队列研究验证结果；空间转录组学分辨率有限，可能无法完全解析细胞亚型异质性 | 探究甲状腺癌去分化过程中肿瘤微环境的动态变化及其与临床侵袭性的关系 | 甲状腺癌患者的肿瘤组织样本，包括分化型（PTC、FTC）和去分化型（PDTC、ATC） | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 空间转录组学、免疫组化、生物信息学分析（CellDART、PROGENy、REACTOME） | NA | 空间转录组数据、组织图像数据 | 12例甲状腺癌患者（涵盖PTC、FTC、PDTC、ATC亚型）的FFPE肿瘤组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium CytAssist | Visium CytAssist平台用于FFPE组织的空间转录组分析 |
| 3451 | 2025-12-04 |
Partial Reprogramming in Senescent Schwann Cells Enhances Peripheral Nerve Regeneration via Restoration of Stress Granule Homeostasis
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511019
PMID:40899516
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了衰老过程中雪旺细胞应激颗粒稳态失衡是导致周围神经再生受损的关键机制，并证明部分重编程可通过恢复该稳态来促进神经再生 | 首次发现Runx2雪旺细胞群在神经再生中的病理积累与应激颗粒稳态失衡相关，并证明部分重编程可通过恢复该稳态来逆转衰老相关的神经再生缺陷 | 研究主要基于大鼠模型，尚未在人类样本中得到验证；部分重编程的长期安全性和具体分子调控网络仍需进一步探索 | 探究部分重编程对衰老过程中周围神经再生的影响及其分子机制 | 年轻和衰老大鼠的坐骨神经损伤模型中的雪旺细胞 | 单细胞转录组学 | 周围神经损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和衰老大鼠的坐骨神经样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3452 | 2025-12-04 |
Enhancer Reprogramming Reveals the Tumorigenic Role of PTPRZ1 in Lung Squamous Cell Carcinoma
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509344
PMID:40899632
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析揭示了肺鳞状细胞癌中增强子驱动的转录网络，并识别出PTPRZ1-MDK轴作为关键的可靶向通路 | 首次通过整合ChIP-seq、bulk RNA-seq、单细胞ATAC/RNA-seq和空间转录组学等多组学数据，系统描绘了LUSC中的肿瘤特异性致癌增强子网络，并发现PTPRZ1-MDK轴在肿瘤发生中的关键作用 | 研究样本量相对有限（59对匹配样本），且主要基于体外和体内功能验证，临床转化应用仍需进一步探索 | 识别肺鳞状细胞癌的新型致癌驱动因子并解析其表观遗传调控机制 | 59对匹配的肺鳞状细胞癌肿瘤组织和邻近正常组织 | 数字病理学 | 肺癌 | ChIP-seq, bulk RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因组学数据、表观基因组学数据、转录组学数据、空间转录组数据 | 59对匹配的LUSC肿瘤和邻近正常组织 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 3453 | 2025-12-04 |
Spatial Transcriptomics Reveals Transcriptomic and Immune Microenvironment Reprogramming during Thyroid Carcinoma Dedifferentiation
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202506925
PMID:40908584
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了甲状腺癌去分化过程中的转录组和免疫微环境重编程机制 | 首次在共存的不同分化程度甲状腺癌区域进行空间转录组测序，揭示了从分化型甲状腺癌向未分化型甲状腺癌逐步重编程的轨迹，并鉴定出PDCD4和TYMP等关键调控因子及其在诱导免疫抑制性肿瘤相关巨噬细胞形成中的作用 | 样本量较小（7例），且为回顾性研究，需要更大样本的前瞻性研究验证 | 阐明甲状腺癌去分化过程的分子机制和免疫微环境变化 | 甲状腺癌组织样本（包含未分化型、低分化型和分化型甲状腺癌共存区域） | 空间转录组学 | 甲状腺癌 | 空间转录组测序、全外显子组测序、inferCNV分析、轨迹分析 | NA | 空间转录组数据、基因组数据 | 7个包含共存区域的样本 | NA | 空间转录组测序 | NA | NA |
| 3454 | 2025-12-04 |
Inhibition of Macrophage ARID3A Alleviates Myocardial Ischemia-Reperfusion Injury After Heart Transplantation by Reducing THBS1/CD47 Signaling-Mediated Neutrophil Extracellular Traps Formation
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509952
PMID:40913516
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞ARID3A在心脏移植后心肌缺血再灌注损伤中的作用，发现通过THBS1/CD47信号通路减少中性粒细胞胞外陷阱形成可缓解损伤 | 首次揭示了M1巨噬细胞通过THBS1/CD47轴促进NETs形成，并发现4-OI能特异性抑制巨噬细胞ARID3A，为治疗心肌缺血再灌注损伤提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证，且具体信号通路的详细机制有待深入探索 | 探究心脏移植后心肌缺血再灌注损伤的分子机制，并寻找潜在治疗策略 | 巨噬细胞、中性粒细胞及其相互作用在心肌缺血再灌注损伤中的角色 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子对接分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用髓系特异性ARID3A敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3455 | 2025-12-04 |
CFTR High Expresser BEST4+ cells are pH-sensing neuropod cells: new implications for intestinal physiology and cystic fibrosis disease
2025-Nov-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00082.2025
PMID:41005986
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质免疫定位，首次将大鼠小肠中的CFTR高表达细胞鉴定为能够感知和响应管腔pH的神经足细胞，并确认BEST4+细胞在近端小肠中即为CHEs，为肠道生理和囊性纤维化疾病提供了新见解 | 首次将大鼠小肠中的CFTR高表达细胞鉴定为神经足细胞，并揭示其在管腔pH调节中的关键作用，同时首次在CF大鼠模型中表征了CHEs中CFTR及相关mRNA和蛋白质的变化 | 研究主要基于大鼠模型，人类数据验证有限；样本量未明确说明；未探讨CHEs在其他肠道疾病中的潜在作用 | 探究肠道中BEST4+细胞的身份、功能及其在囊性纤维化疾病中的作用机制 | 人类和大鼠肠道上皮细胞，特别是BEST4+细胞和CFTR高表达细胞（CHEs） | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），蛋白质免疫定位 | NA | RNA序列数据，蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3456 | 2025-12-04 |
Intrinsic changes in cell differentiation and identity drive impaired wound healing in aged female murine skin
2025-Nov-01, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-025-10340-w
PMID:41175301
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了老年雌性小鼠皮肤中细胞内在变化如何导致伤口愈合受损的机制 | 首次在老年雌性小鼠皮肤和伤口中应用单细胞RNA测序，全面解析了细胞内在变化对伤口微环境的影响 | 研究仅针对雌性小鼠，且伤口观察时间点限于损伤后3天，未涵盖其他性别或更长时间窗口 | 探究老年皮肤中细胞内在变化如何影响伤口愈合的早期反应 | 年轻和老年雌性小鼠的完整皮肤及损伤后3天的伤口组织 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 年轻和老年雌性小鼠的皮肤及伤口组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3457 | 2025-12-04 |
SpaBatch: Deep Learning-Based Cross-Slice Integration and 3D Spatial Domain Identification in Spatial Transcriptomics
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509090
PMID:40953305
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研究论文 | 本研究提出了一个名为SpaBatch的深度学习框架，用于整合和分析多切片空间转录组数据，以进行跨切片的3D空间域识别 | SpaBatch是首个能够有效校正批次效应并实现跨切片3D空间域识别的框架，克服了现有方法仅关注单一切片内2D空间域识别且忽略切片间空间相关性的局限 | 论文未明确提及该方法的计算复杂度或对大规模数据集的可扩展性限制 | 开发一个鲁棒可靠的多切片空间转录组数据整合框架，以实现准确的3D空间域识别 | 人类皮层切片、小鼠脑切片、小鼠胚胎切片、人类胚胎心脏切片、HER2+乳腺癌组织和小鼠下丘脑切片 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 深度学习 | 空间转录组数据 | 八个真实空间转录组数据集 | MERFISH | 空间转录组学 | MERFISH平台 | 使用MERFISH平台分析的小鼠下丘脑切片和HER2+乳腺癌组织 |
| 3458 | 2025-12-04 |
Spatial Transcriptional Dynamics of CD74⁺ B Cells in Tertiary Lymphoid Structures Drive Immune Evolution in Penile Squamous Cell Carcinoma
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509742
PMID:41111459
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研究论文 | 本研究整合空间转录组学、单细胞测序和免疫组化技术，揭示了阴茎鳞状细胞癌中三级淋巴结构内CD74⁺ B细胞的空间转录动态及其驱动免疫演化的机制 | 首次在PSCC中系统阐明了三级淋巴结构内CD74⁺ B细胞的空间分布动态、与初始T细胞的相互作用机制及其通过HLA-DRA激活NF-κB等转录因子的免疫调控网络 | 研究样本量有限，未在独立队列中验证CD74⁺ B细胞的预后价值，机制研究主要基于转录组数据缺乏功能实验验证 | 解析阴茎鳞状细胞癌三级淋巴结构的免疫架构与功能机制 | 阴茎鳞状细胞癌组织样本及其中的三级淋巴结构、CD74⁺ B细胞、初始T细胞 | 空间转录组学 | 阴茎鳞状细胞癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据、bulk RNA-seq数据、组织图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3459 | 2025-12-04 |
Role of Mitophagy in Ischemia-Reperfusion Renal Injury: New Insights from Bioinformatics Analysis
2025-Oct-30, Nephron
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000548962
PMID:41166509
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析结合单细胞测序，探讨了线粒体自噬在缺血再灌注肾损伤中的作用，并识别了关键基因SLC3A2作为潜在治疗靶点 | 结合转录组测序、单细胞测序和机器学习算法，筛选出与线粒体自噬相关的差异表达基因SLC3A2和TXN，并通过多层面实验验证了SLC3A2在缺血再灌注肾损伤中的关键作用 | 研究中TXN在细胞实验中的结果与先前分析相反，表明可能存在未考虑的调控机制或实验条件差异 | 阐明线粒体自噬在急性肾损伤（AKI）发病机制中的分子相互作用，以开发新的治疗策略 | 缺血再灌注损伤（IRI）相关的急性肾损伤（AKI） | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 转录组测序，单细胞测序，生物信息学分析，机器学习算法 | 机器学习算法（未指定具体类型） | 转录组数据，单细胞数据 | 未明确指定样本数量，但涉及体外实验、体内大鼠实验和临床AKI病例 | NA | 单细胞测序，转录组测序 | NA | NA |
| 3460 | 2025-12-04 |
Coxiella burnetii Strains Elicit Distinct Inflammatory Responses in Human Macrophages
2025-Oct-29, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens14111101
PMID:41305339
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了不同毒力的贝氏柯克斯体菌株在人巨噬细胞中引发差异化的炎症反应和极化状态 | 首次系统比较了不同毒力贝氏柯克斯体菌株在人肺泡巨噬细胞和THP-1细胞中引发的宿主转录组反应异质性，并揭示了菌株特异性和细胞特异性因素在塑造宿主免疫中的重要性 | 研究主要基于体外细胞模型，未在动物模型或临床样本中验证；单细胞RNA测序仅针对NMII菌株感染的THP-1细胞 | 阐明贝氏柯克斯体不同菌株与宿主巨噬细胞相互作用的分子机制，为Q热的靶向治疗提供依据 | 人肺泡巨噬细胞(hAMs)和THP-1巨噬细胞系 | 感染免疫学 | Q热 | RNA测序(RNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 细胞因子检测 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，使用人肺泡巨噬细胞和THP-1细胞系进行感染实验 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |