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当前共找到 35760 篇文献，本页显示第 3341 - 3360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3341 | 2025-12-06 |
Role of Dendritic Cells in Mediating the Effect of Growth Differentiation Factor 15 on Nonalcoholic Fatty Liver Disease: Insights From Causal Inference and Single-Cell Profiling
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/1153091
PMID:41333917
|
研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序，揭示了生长分化因子15通过树突状细胞介导非酒精性脂肪肝病风险的因果机制 | 首次结合大规模GWAS数据、孟德尔随机化因果推断和单细胞测序技术，系统阐明了GDF-15通过特定树突状细胞亚群介导NAFLD发病的因果通路 | 研究主要基于欧洲人群的GWAS汇总数据，可能限制结论在其他人群中的普适性；单细胞分析样本量相对有限 | 探究循环GDF-15水平与NAFLD之间的因果关系，并鉴定免疫细胞在其中的介导作用 | 人类循环GDF-15水平、NAFLD疾病状态、731种免疫细胞表型 | 生物信息学与计算生物学 | 非酒精性脂肪肝病 | 全基因组关联研究（GWAS）、孟德尔随机化（MR）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 孟德尔随机化模型、中介分析模型 | 基因组汇总数据、单细胞转录组数据 | 大规模GWAS汇总数据（来源包括FinnGen数据库等），具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3342 | 2025-12-06 |
BMDB: An integrated database and web platform for single-cell transcriptomic profiling of bone marrow microenvironment
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.11.028
PMID:41334179
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研究论文 | 本研究介绍了一个名为BMDB的集成数据库和网络平台，用于整合和分析骨髓微环境的单细胞转录组数据 | 首次构建了一个整合健康和疾病状态下、跨物种（人和小鼠）及发育阶段的骨髓微环境单细胞转录组参考图谱数据库，并提供了交互式网络分析平台 | 未明确说明数据覆盖的疾病类型范围是否全面，以及平台对新上传数据的质量控制标准 | 构建一个统一的资源平台，以系统探索骨髓微环境的细胞和分子复杂性 | 骨髓微环境中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 435,682个单细胞，来自142个健康样本和82个病理样本（涵盖人和小鼠） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3343 | 2025-12-06 |
CPRCSdb: A comprehensive phenotype-associated single-cell transcriptomic database for human cancer
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.11.033
PMID:41334181
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研究论文 | 本文介绍了CPRCSdb，一个将临床表型与单细胞转录组异质性整合的综合性数据库 | 开发了首个系统性地将单细胞数据与临床相关表型（如患者生存、肿瘤大小、淋巴结受累、转移和抗癌治疗反应）关联的综合性数据库 | 数据库依赖于手动整理的数据，可能受限于样本的可用性和质量控制的一致性 | 构建一个整合临床表型与单细胞转录组异质性的数据库，以研究肿瘤发生和癌症进展的机制 | 人类癌症的单细胞转录组数据和临床表型数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、批量RNA-seq数据 | 超过405万个细胞，来自1053个手动整理的单细胞样本和101个整合数据集，以及11,032个批量RNA-seq样本，涵盖29种癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3344 | 2025-12-06 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular dynamics and transcriptional changes in diabetic wound tissues following ESWT treatment
2025, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2025.1693937
PMID:41334557
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，构建了体外冲击波疗法（ESWT）治疗糖尿病伤口组织的细胞图谱，揭示了ESWT促进组织修复的细胞机制 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了ESWT治疗糖尿病伤口后引发的广泛转录重编程和细胞间通讯网络变化 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平的功能验证，且样本量相对有限 | 探究体外冲击波疗法促进糖尿病伤口愈合的细胞和分子机制 | 糖尿病伤口组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约39,475个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3345 | 2025-12-06 |
Linking Cellular Senescence to Vascular Pathology: The Diagnostic Potential of Superoxide Dismutase 2 in Aortic Dissection
2025, Vascular health and risk management
IF:2.6Q2
DOI:10.2147/VHRM.S553609
PMID:41334574
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和单细胞转录组分析，探讨了血管衰老在主动脉夹层（AD）发病机制中的分子和细胞机制，并确定了超氧化物歧化酶2（SOD2）作为潜在的诊断生物标志物和治疗靶点 | 整合生物信息学和单细胞RNA测序技术，首次将SOD2与主动脉夹层的免疫调节和氧化应激联系起来，并提出了基因-药物相互作用网络用于靶向治疗 | 研究主要基于公开数据集和单细胞测序数据，需要进一步实验验证SOD2的功能机制和临床适用性 | 研究血管衰老的分子和细胞机制及其在主动脉夹层发病中的作用 | 主动脉夹层组织、血清样本以及相关的基因表达数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 基于公开数据集GSE52093和GSE153434，涉及主动脉夹层组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3346 | 2025-12-06 |
CellNeighborEX: deciphering neighbor-dependent gene expression from spatial transcriptomics data
2023-11-09, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202311670
PMID:37815040
|
研究论文 | 提出一种名为CellNeighborEX的新方法，用于从空间转录组学数据中解析细胞邻居依赖的基因表达 | 开发了一种能有效捕获不同微环境影响的新方法，通过直接细胞定位或多细胞转录组混合来分类细胞，识别与伙伴细胞类型相关的多样化基因集 | NA | 研究细胞邻居依赖的基因表达，以理解细胞间相互作用 | 小鼠胚胎、大脑和肝癌组织中的细胞 | 空间转录组学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3347 | 2025-12-06 |
Imprinted genes and the manipulation of parenting in mammals
2023-11, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-023-00644-3
PMID:37714957
|
综述 | 本文探讨了基因组印记在哺乳动物亲代抚育行为中的角色及其进化意义 | 利用单细胞RNA测序数据，揭示了印记基因与亲代抚育质量之间的双向、迭代关系 | NA | 研究基因组印记如何影响哺乳动物的亲代抚育行为及其进化背景 | 哺乳动物中的印记基因及其在亲代抚育中的作用 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3348 | 2025-12-06 |
Spatiotemporal, optogenetic control of gene expression in organoids
2023-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01986-w
PMID:37735569
|
研究论文 | 本研究结合光遗传学和基因扰动技术，在类器官中实现了目标基因表达的可编程时空控制 | 首次将光遗传学与基因扰动技术结合，用于控制类器官中基因表达的时空模式，并通过空间和单细胞转录组分析揭示了SHH信号在神经发育中的新调控机制 | 未明确说明技术适用范围、效率或潜在脱靶效应，且可能仅限于特定类器官模型 | 开发控制类器官中基因表达时空模式的方法，以研究人类发育和疾病建模 | 干细胞衍生的类器官，特别是人类神经发育类器官模型 | 生物医学工程 | NA | 光遗传学、基因扰动技术、空间转录组学、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3349 | 2025-12-05 |
The unfolded protein response in progeria arteries originates from non-endothelial cell types
2026-Feb, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503485
PMID:41326174
|
研究论文 | 本研究探讨了早衰症动脉中未折叠蛋白反应的起源，发现其主要源于非内皮细胞类型 | 揭示了在表达早老素的动脉中，UPR激活具有细胞类型特异性，挑战了先前关于血管平滑肌细胞和成纤维细胞中UPR普遍激活的观点 | 研究基于小鼠模型，可能不完全反映人类HGPS的病理生理学，且未详细探讨非内皮细胞中UPR的具体机制 | 研究早衰症中未折叠蛋白反应是否导致内皮细胞功能障碍 | Hutchinson-Gilford早衰综合征小鼠模型，特别是内皮细胞特异性表达早老素的动脉组织 | 数字病理学 | 早衰症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3350 | 2025-12-05 |
Spatial transcriptomics mapping of immune cell and TGFβ signalling pathway heterogeneity in testicular germ cell tumours
2026-Jan, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70100
PMID:40693358
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，绘制了睾丸生殖细胞肿瘤中免疫细胞和TGFβ信号通路的异质性图谱 | 首次应用空间转录组学分析睾丸生殖细胞肿瘤的组织切片，揭示了肿瘤内部及周围区域的免疫细胞和TGFβ信号通路异质性 | 样本量较小（仅4例患者），且未涉及长期临床结果验证 | 探究睾丸生殖细胞肿瘤的异质性，特别是免疫细胞和TGFβ信号通路在肿瘤发生发展中的作用 | 睾丸生殖细胞肿瘤组织切片，包括非精原细胞瘤和精原细胞瘤样本 | 空间转录组学 | 睾丸生殖细胞肿瘤 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | 4例TGCT患者样本，超过90个感兴趣区域 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | NanoString GeoMx空间全转录组工作流程 |
| 3351 | 2025-12-05 |
Altered Inflammatory Signature in a C9ORF72 -ALS iPSC-Derived Motor Neuron and Microglia Coculture Model
2026-Jan, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70084
PMID:40952044
|
研究论文 | 本研究利用携带C9ORF72基因突变的人类诱导多能干细胞（iPSC）来源的运动神经元与小胶质细胞共培养模型，揭示了ALS中炎症反应的改变机制 | 首次在iPSC来源的运动神经元与小胶质细胞共培养模型中，结合单细胞RNA测序技术，系统分析了C9ORF72突变对神经炎症的影响，并发现LPS响应性小胶质细胞亚群的消失 | 研究主要基于体外细胞模型，可能无法完全模拟体内复杂的神经微环境；样本类型和数量有限 | 探究肌萎缩侧索硬化症（ALS）中，C9ORF72基因突变如何通过小胶质细胞介导的神经炎症影响疾病病理 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）来源的运动神经元和小胶质细胞，包括携带C9ORF72六核苷酸重复扩增（HRE）的ALS患者iPSC系和C9ORF72敲除（KO）iPSC系 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），细胞共培养，炎症因子表达与分泌分析 | iPSC来源的细胞共培养模型 | 单细胞转录组数据，细胞表型数据 | 多个iPSC细胞系（包括C9ORF72 HRE和KO系），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3352 | 2025-12-05 |
Plasma proteomics identifies potential drug targets for diabetic polyneuropathy: Evidence from prospective cohorts and genetic analysis
2026-Jan, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.70239
PMID:41144938
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研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学分析，结合前瞻性队列和遗传数据，识别出与糖尿病多发性神经病相关的潜在药物靶点，特别是TNFRSF14，并探讨其临床和细胞机制 | 首次大规模整合临床、遗传和单细胞测序数据，系统性地筛选并验证TNFRSF14作为糖尿病多发性神经病的新型生物标志物和治疗靶点 | 研究依赖于观察性队列和遗传关联分析，因果推断需进一步实验验证；单细胞测序数据可能样本有限，需扩大验证 | 识别糖尿病多发性神经病的潜在药物靶点，以提升治疗效果 | 糖尿病多发性神经病患者及相关蛋白质和遗传因素 | 蛋白质组学 | 糖尿病多发性神经病 | 血浆蛋白质组学、单细胞测序 | NA | 蛋白质组数据、遗传数据、临床数据 | 大规模临床和遗传数据集（具体样本数未在摘要中说明） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3353 | 2025-12-05 |
Spatial Myeloid Landscape of Large Artery Atherosclerotic and Cardioembolic Thrombi Retrieved by Mechanical Thrombectomy
2025-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501658RR
PMID:41329022
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和免疫组化分析，比较了大动脉粥样硬化性和心源性栓塞性血栓的免疫细胞组成和分子特征 | 首次在急性缺血性卒中的两种主要亚型中，结合空间转录组学和单细胞RNA测序，揭示了巨噬细胞和中性粒细胞在血栓形成中的特异性免疫血栓模式 | 样本量相对较小（空间转录组学分析仅8例，免疫组化分析35例），且未包括其他卒中病因亚型 | 探究大动脉粥样硬化性和心源性栓塞性卒中血栓中髓系细胞的分子特征和免疫血栓机制 | 接受血管内血栓切除术的急性缺血性卒中患者的血栓样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 免疫组化图像, 单细胞RNA测序数据 | 42例急性缺血性卒中患者（其中8例LAA，27例CE），空间转录组学分析8例（4例LAA，4例CE），免疫组化分析35例（8例LAA，27例CE） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3354 | 2025-12-05 |
Endothelial ADAR1 Deficit Induces the NOCT-IRF7 Axis in Pulmonary Hypertension
2025-Dec-04, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326277
PMID:41342206
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的ADAR1缺乏通过上调NOCT表达，激活肺内皮细胞干扰素信号通路，导致细胞凋亡并促进肺动脉高压的发病机制 | 首次发现ADAR1通过RNA编辑调控NOCT基因表达，并建立了ADAR1-NOCT轴在肺动脉高压中的关键作用机制 | 研究主要基于体外细胞和动物模型，人类样本验证相对有限，且具体RNA编辑位点的功能机制需进一步阐明 | 阐明ADAR1依赖性RNA编辑在调控肺内皮细胞病理表型和肺动脉高压发病中的功能和靶点 | 肺内皮细胞、人类和小鼠肺动脉高压模型 | 分子生物学 | 肺动脉高压 | RNA测序、单细胞RNA测序、腺相关病毒表达 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 人类肺动脉高压肺组织、缺氧PH小鼠模型、多种啮齿动物疾病模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3355 | 2025-12-05 |
Identification of CD7 as a novel biomarker of embryonal hepatoblastoma
2025-Dec-04, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-025-06255-9
PMID:41343061
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研究论文 | 本研究通过多种生物信息学分析和免疫组化染色，探讨了CD7在肝母细胞瘤中的表达及其作为新型生物标志物的潜力 | 首次将CD7鉴定为胚胎型肝母细胞瘤的新型生物标志物，并揭示其与肿瘤进展和不良临床结局的关联 | 研究主要基于回顾性分析，需要进一步的前瞻性验证和功能实验来确认CD7的生物学作用 | 研究CD7在肝母细胞瘤中的表达及其作为生物标志物的潜力 | 人类肝母细胞瘤样本 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学分析, 免疫组化染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3356 | 2025-12-05 |
ScisTree2 enables large-scale inference of cell lineage trees and genotype calling using efficient local search
2025-Dec-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280542.125
PMID:40903391
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研究论文 | 本文介绍了ScisTree2，一种基于无限位点模型、用于大规模细胞谱系树推断和基因型调用的快速准确方法 | ScisTree2是首个能够处理数万或更多细胞数据集的基于模型的细胞谱系树推断和基因型调用方法，并采用高效局部搜索优化树结构 | NA | 开发一种能够从大规模单细胞数据中准确推断细胞谱系树并进行基因型调用的计算方法 | 单细胞测序数据中的细胞谱系树和基因型 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 无限位点模型 | 单细胞测序数据 | 数万或更多细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3357 | 2025-12-05 |
Label-free selection of marker genes in single-cell and spatial transcriptomics with geneCover
2025-Dec-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280539.125
PMID:41224531
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研究论文 | 本文介绍了一种名为geneCover的无标签组合方法，用于在单细胞RNA测序和空间转录组学数据中选择最优的标记基因面板 | 提出了一种基于基因-基因相关性的无标签组合方法，能有效识别稀有细胞类型或微妙空间模式的标记基因，并具有出色的可扩展性 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 开发一种无标签的标记基因选择方法，以捕获单细胞和空间转录组学数据中的细胞和空间异质性 | 单细胞RNA测序和空间转录组学数据中的标记基因面板 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 组合方法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3358 | 2025-12-05 |
Unified integration of spatial transcriptomics across platforms with LLOKI
2025-Dec-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280803.125
PMID:41233159
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研究论文 | 本文提出了一种名为LLOKI的新型框架，用于整合不同平台的空间转录组学数据，无需共享基因面板 | LLOKI通过最优传输引导的特征传播和基于图的插补技术，解决了跨平台ST数据整合中基因面板差异、数据稀疏性和技术变异性的挑战，并利用scGPT等单细胞基础模型生成统一特征 | 未在摘要中明确说明 | 开发一个能够整合不同平台空间转录组学数据的统一框架，以促进对组织结构和细胞相互作用的深入理解 | 小鼠脑组织样本和卵巢癌数据集 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | scGPT（单细胞基础模型），基于图的插补模型 | 空间转录组学数据，单细胞RNA测序数据 | 来自五种不同技术的小鼠脑样本，以及五个卵巢癌数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3359 | 2025-12-05 |
Joint imputation and deconvolution of gene expression across spatial transcriptomics platforms
2025-Dec-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280555.125
PMID:41249066
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研究论文 | 本文提出了一种名为SIID的算法，用于整合不同空间转录组学平台的数据，以进行基因表达的插补和解卷积 | SIID算法通过联合非负因子分解模型，结合空间对齐，能够同时处理基因表达缺失和细胞类型特异性表达推断，在模拟和真实数据中均表现出优于现有工具的性能 | NA | 整合不同空间转录组学技术的数据，以克服单个技术的局限性，实现基因表达的准确插补和解卷积 | 空间转录组学数据，特别是来自10x Genomics Visium和Xenium平台的人类乳腺癌和结肠癌组织切片 | 空间转录组学 | 乳腺癌，结肠癌 | 空间转录组学 | 联合非负因子分解模型 | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium | 10x Visium平台测量多细胞大小点的全转录组，10x Xenium平台在亚细胞分辨率下测量数百个基因 |
| 3360 | 2025-12-05 |
Optimal marker genes for c-separated cell types with SepSolve
2025-Dec-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280637.125
PMID:41067889
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研究论文 | 本文提出了一种名为SepSolve的新方法，用于在单细胞RNA-seq研究中识别细胞类型，通过优化选择标记基因以实现细胞类型的c-分离 | 引入c-分离概念，并设计线性规划模型，在考虑细胞类型内表达变异的同时避免处理所有细胞对，从而高效计算最优标记基因集 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 开发一种高效且稳定的标记基因选择方法，以准确区分单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型及其标记基因 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA-seq | 线性规划 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |