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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3321 | 2026-03-29 |
Spatial tumor evolution panorama of ovarian cancer
2026-Mar-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102666
PMID:41850247
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,揭示了卵巢癌的空间进化全景,包括肿瘤-宿主共定位模式、达尔文进化轨迹以及关键细胞群在转移中的作用 | 开发了STARLETS框架,结合单细胞和空间转录组学,首次在卵巢癌中系统描绘了空间进化全景,并识别了可预测治疗响应的SPP1巨噬细胞 | 样本量相对有限(约60对全基因组和RNA测序),且主要关注卵巢癌,结论在其他癌症中的普适性需进一步验证 | 探究卵巢癌的空间进化机制和微环境特征,以寻找新的治疗靶点 | 卵巢癌患者样本,包括原发灶和转移灶 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 全基因组测序, RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, uDISCO成像 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间数据, 成像数据 | 约60对全基因组和RNA测序样本, 100个单细胞样本, 250万个空间转录组学点 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3322 | 2026-03-29 |
Cancer-associated fibroblasts in bladder cancer: Immunosuppressive mechanisms and therapeutic targeting
2026-Mar-10, Seminars in oncology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.seminoncol.2026.152483
PMID:41895066
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综述 | 本文综述了膀胱癌中癌症相关成纤维细胞(CAFs)的免疫抑制机制及其作为治疗靶点的潜力 | 整合了单细胞分析和空间转录组学的最新发现,揭示了CAFs的异质性、可塑性及其在肿瘤微环境中调控免疫细胞行为和影响治疗反应的空间组织模式 | 作为一篇综述文章,主要基于现有文献进行总结和分析,未提出新的原始实验数据或模型 | 探讨膀胱癌中CAFs介导的免疫抑制机制,并综述针对CAFs的治疗策略 | 膀胱癌及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤生物学 | 膀胱癌 | 单细胞分析,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 3323 | 2026-03-29 |
Dynamic transcriptomic remodeling in grafted human neural progenitor cells uncovers mechanisms for vision preservation in a rat model of retinitis pigmentosa
2026-03-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69776-4
PMID:41792118
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析移植的人类神经祖细胞在视网膜色素变性大鼠模型中的动态基因表达变化,揭示了其通过营养因子分泌等机制保护光感受器细胞 | 首次通过单细胞转录组学系统揭示移植hNPCs在退行性视网膜环境中的长期命运及其与宿主细胞的动态互作机制 | 研究基于啮齿动物模型,结果向人类临床转化的适用性有待验证;长期观察时间点有限 | 探究移植人类神经祖细胞在视网膜色素变性模型中保护视力的分子机制 | 移植的人类神经祖细胞和宿主视网膜细胞 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 啮齿动物模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3324 | 2026-03-29 |
A brain-gut excitatory peptide/CCHamide homolog regulates satiation and motivational state transitions in the Aplysia feeding circuit
2026-Mar, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.111257
PMID:41654135
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研究论文 | 本研究在软体动物海兔中鉴定了EP/CCHa同源肽及其受体,揭示了该脑-肠肽作为饱食信号调控摄食动机状态转换的机制 | 首次在海兔中鉴定出EP/CCHa同源肽及其两个受体,发现其中一个受体意外地与节肢动物受体聚类,揭示了该肽通过特定中枢模式发生器中间神经元调控摄食动机状态转换的新机制 | 研究主要在海兔模型中进行,其发现是否适用于其他物种仍需进一步验证 | 探究EP/CCHa信号通路在摄食回路中的调控机制 | 海兔(Aplysia)的摄食回路及相关神经元 | 神经科学 | NA | 质谱分析、原位杂交、免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 分子数据、细胞数据、行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3325 | 2026-03-29 |
Lipid-dependent accrual of a subset of monocyte-derived macrophages is essential for tissue regeneration
2026-Mar, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-026-01480-5
PMID:41814078
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研究论文 | 本研究揭示了一种脂质依赖性的单核细胞来源巨噬细胞亚群在肝脏损伤后组织再生中的关键作用 | 首次发现并表征了具有高脂质含量和强炎症反应的“脂质炎症性单核来源巨噬细胞”亚群,阐明其通过CD36-神经酰胺-IRE1α-XBP1-IL-6信号轴调控肝脏再生的新机制 | 研究主要聚焦于肝脏再生模型,在其他组织或疾病模型中的普适性有待验证;机制研究尚未完全解析脂质代谢与炎症信号整合的具体分子细节 | 探究肝脏损伤后免疫反应与代谢重编程如何协同调控肝细胞增殖和组织再生 | 小鼠肝脏损伤模型中的单核细胞来源巨噬细胞亚群、肝细胞 | 免疫代谢学 | 肝脏疾病 | 单细胞转录组学、定量脂质组学、多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、脂质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3326 | 2026-03-29 |
Defining the vascular niche of human adipose tissue across metabolic states
2026-Mar, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-026-01475-2
PMID:41820564
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了人类皮下脂肪组织中血管系统的细胞异质性及其在肥胖和2型糖尿病中的变化 | 首次在人类脂肪组织中系统描绘了血管细胞的单细胞图谱,并发现了一个具有内皮、间充质、脂肪细胞和免疫转录特征的独特内皮细胞亚群 | 研究仅针对皮下脂肪组织,未涉及内脏脂肪等其他脂肪类型;样本量相对有限(65名个体) | 阐明人类脂肪组织血管微环境的细胞组成及其在代谢状态变化中的作用 | 人类皮下脂肪组织中的血管细胞 | 单细胞组学 | 肥胖、2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、全组织成像、计算分析 | NA | 单细胞转录组数据、成像数据 | 65名个体的近70,000个血管细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3327 | 2026-03-29 |
Spatial Transcriptomics Profiling of Small Intestine Adenocarcinoma and Adenoma in Humans and a Murine Model with KRASG12D and Loss of CDKN2a-p16
2026-Feb-26, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.01.013
PMID:41763535
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析了人类和小鼠模型中小肠腺癌和腺瘤的分子特征,揭示了分化亚型、微环境及驱动通路 | 首次结合人类和小鼠模型的空间转录组学分析,识别了小肠腺癌的分化特征、微环境信号交互及MEK抑制剂敏感性,并开发了模拟人类病变的新型基因工程小鼠模型 | 研究样本数量有限,且小鼠模型未完全复制人类所有亚型(如肠型腺癌) | 确定人类和小鼠模型中小肠腺癌/十二指肠腺癌的分化亚型及驱动分子通路 | 人类和小鼠的小肠腺癌、腺瘤及其微环境 | 数字病理学 | 小肠腺癌 | 空间转录组学,免疫组织化学 | 基因工程小鼠模型(p16KOKrasG12D) | 空间转录组数据,组织图像 | 人类和小鼠样本,具体数量未明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3328 | 2026-03-29 |
Colorectal microenvironment determines the prognosis of colorectal cancer
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01599-7
PMID:41495419
|
研究论文 | 本研究通过分析结直肠癌患者的肿瘤和非肿瘤组织,评估了区分支持癌细胞生长的微环境与健康微环境的可行性,并发现微环境特征可作为预后生物标志物 | 首次利用bulk RNA测序数据将结直肠癌患者分为肿瘤支持性微环境和健康微环境组,并结合单细胞RNA测序揭示了微环境中特定细胞类型间的相互作用 | 样本量相对有限(273对样本),且研究主要基于回顾性分析,需要进一步前瞻性验证 | 评估结直肠微环境对癌症预后的影响,并探索其作为预后生物标志物的潜力 | 结直肠癌患者及其配对的非肿瘤组织和肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | bulk RNA测序, 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 273对配对的非肿瘤组织和肿瘤样本 | NA | bulk RNA测序, 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3329 | 2026-03-29 |
Microglial CX3CR1 deficiency regulates the selective vulnerability of cone photoreceptors via STAT3/CCL-ACKR1 signaling in the mouse retina
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01618-7
PMID:41535549
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研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞CX3CR1缺陷通过STAT3/CCL-ACKR1信号通路导致小鼠视网膜中视锥光感受器选择性易损性的分子机制 | 首次发现CX3CR1缺陷通过STAT3介导小胶质细胞神经毒性,并鉴定出CCL-ACKR1信号通路在视锥细胞选择性丢失中的关键作用 | 研究局限于小鼠模型,人类视网膜中的机制仍需验证 | 探究神经退行性疾病中神经元选择性易损性的分子机制 | 小鼠视网膜中的小胶质细胞、星形胶质细胞和视锥光感受器 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3330 | 2026-03-29 |
Single-immunocyte transcriptomics reveal the role of natural killer cell-dependent exogenous antigen presentation in ankylosing spondylitis severity
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01619-6
PMID:41593306
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞,揭示了自然杀伤细胞依赖性外源性抗原呈递在疾病严重程度中的作用 | 首次鉴定出具有抗原呈递功能的NK细胞亚群(APC-NK),并阐明其在AS疾病进展中的关键作用,通过小鼠模型验证了HLA-DRB1 NK细胞加速AS样病变的机制 | 研究样本量有限,且主要基于外周血样本,未深入探究关节局部免疫微环境的变化 | 探究强直性脊柱炎发病、加重和缓解过程中的细胞分类学和免疫学特征,揭示导致AS病变的内在规律 | 健康供体和不同疾病阶段的强直性脊柱炎患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康供体和不同疾病阶段的AS患者的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3331 | 2026-03-29 |
Single-cell omics for nutrition research: an emerging opportunity for human-centric investigations
2026, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2025.2566387
PMID:41176166
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术在营养研究中的新兴应用及其潜力 | 提出了将单细胞组学技术与类器官、器官芯片等先进人体衍生系统相结合,以在生理相关背景下进行机制研究的新框架 | 讨论了该领域面临的技术限制、模型选择困难和机构偏见等关键挑战 | 推进以人为中心的营养研究,揭示饮食化合物对人类健康的影响机制 | 饮食化合物与人体细胞的相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞蛋白质组学,单细胞代谢组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3332 | 2026-03-29 |
Resveratrol Alleviates Intervertebral Disc Degeneration by Targeting NCOA4-Mediated Ferritinophagy Through Dual Antioxidant and Anti-Inflammatory Effects
2026, Drug design, development and therapy
DOI:10.2147/DDDT.S575321
PMID:41873334
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验模型,揭示了NCOA4介导的铁蛋白自噬在椎间盘退变中的关键作用,并发现白藜芦醇通过靶向NCOA4发挥双重抗氧化和抗炎效应来缓解退变 | 首次将铁蛋白自噬确立为椎间盘退变的新型病理机制,并阐明NCOA4作为协调铁死亡与自噬交互作用的关键节点,同时验证了天然化合物白藜芦醇通过多靶点调控炎症和铁稳态通路治疗椎间盘退变的潜力 | 研究主要基于大鼠模型和细胞实验,临床转化仍需进一步验证;铁蛋白自噬的具体调控网络及其与其他细胞死亡方式的相互作用尚未完全阐明 | 探究铁蛋白自噬在椎间盘退变中的作用机制,并评估白藜芦醇的治疗效果 | 椎间盘退变患者样本、大鼠椎间盘退变模型、髓核细胞 | 生物信息学与分子生物学 | 椎间盘退变 | 生物信息学分析、单细胞测序、转录组分析、实验模型验证 | NA | 临床转录组数据、单细胞测序数据、实验数据 | 未明确具体样本数量,涉及临床样本、大鼠模型和细胞研究 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3333 | 2026-03-29 |
Cell Differentiation of DPSCs Infected With Different Periodontal Pathogens
2026-Jan, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70045
PMID:40739838
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探究了两种牙周病原体(牙龈卟啉单胞菌和牙周二氧化碳嗜纤维菌)对人牙髓干细胞亚群分化的不同影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示了不同牙周病原体对牙髓干细胞亚群分化的特异性调控作用,并识别出对特定病原体有独特反应的细胞亚群 | 研究样本来源于健康供体,未考虑临床患者个体差异;体外感染模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究牙周病原体感染对牙髓干细胞分化的影响机制 | 人牙髓干细胞 | 单细胞组学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康供体来源的牙髓干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3334 | 2026-03-29 |
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-04117-1
PMID:41276825
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综述 | 本文综述了结直肠癌共识分子分型(CMS)的分类、预后预测作用、识别方法及其在指导个体化治疗中的应用与挑战 | 系统总结了基于基因表达谱、免疫组化(IHC)和基于深度学习的图像分类器(imCMS)等多种CMS识别方法,并探讨了利用单细胞RNA测序解决肿瘤内异质性(ITH)等新兴策略 | 肿瘤内异质性(ITH)和技术障碍阻碍了CMS分类在临床中的广泛采用 | 回顾CMS分类在结直肠癌中的预后和预测作用,评估其指导个体化治疗的潜力,并探讨临床应用的障碍与解决方案 | 结直肠癌(CRC)及其共识分子亚型(CMS1-4) | 数字病理学 | 结直肠癌 | 基因表达谱分析,免疫组化(IHC),单细胞RNA测序,基于计算模型的图像分类(如深度学习) | 深度学习 | 基因表达数据,组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3335 | 2026-03-29 |
Lessons learned from spatial transcriptomic analyses in clear-cell renal cell carcinoma
2025-11, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-024-00980-x
PMID:39789293
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综述 | 本文总结了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌研究中的应用和发现 | 首次系统回顾了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌中的研究,揭示了肿瘤微环境的空间异性和相互作用 | 目前仅针对透明细胞肾细胞癌这一亚型,且技术应用尚处于早期阶段 | 探讨空间转录组学在肾细胞癌研究中的潜力和应用价值 | 透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3336 | 2026-03-29 |
Gene-regulatory programs that specify age-related differences during thymocyte development
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115903
PMID:40570375
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研究论文 | 本研究构建了新生和成年小鼠T细胞发育的转录和染色质可及性图谱,揭示了年龄相关差异的基因调控程序 | 通过整合转录组和染色质可及性数据,结合CRISPR扰动与单细胞RNA测序,鉴定了调控T细胞发育年龄差异的保守转录因子Zbtb20 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且单细胞测序技术可能受限于细胞捕获效率和测序深度 | 探究T细胞发育过程中年龄相关差异的基因调控机制 | 新生和成年小鼠的胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析, CRISPR扰动 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 新生和成年小鼠的胸腺细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3337 | 2026-03-29 |
SwarmMAP: Swarm Learning for Decentralized Cell Type Annotation in Single Cell Sequencing Data
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.13.632775
PMID:39868099
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研究论文 | 本文开发了一种名为SwarmMAP的基于群体学习(Swarm Learning)的机器学习方法,用于在单细胞测序数据中以去中心化的方式自动进行细胞类型注释 | 首次将群体学习应用于单细胞测序数据的细胞类型注释,实现了在无需交换原始数据的情况下进行去中心化模型训练,解决了数据隐私和可扩展性问题 | 摘要中未明确提及具体的研究局限性 | 开发一种标准化、自动化且保护隐私的跨数据集细胞类型注释方法 | 人类心脏、肺和乳腺组织的单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基于Swarm Learning的机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 摘要中未提供具体样本数量,涉及多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3338 | 2026-03-29 |
KLF4 in smooth muscle cell-derived progenitor cells is essential for angiotensin II-induced cardiac inflammation and fibrosis
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.04.597485
PMID:38895472
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研究论文 | 本研究揭示了平滑肌细胞来源的AdvSca1-SM细胞在血管紧张素II诱导的心脏纤维化中向肌成纤维细胞分化的轨迹,并发现转录因子KLF4在此过程中的关键作用 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学方法,首次阐明了冠状动脉相关AdvSca1-SM细胞在心脏纤维化中的促纤维化分化轨迹,并发现KLF4的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;KLF4调控AdvSca1-SM表型的具体分子机制仍需进一步探索 | 探究AdvSca1-SM细胞在血管紧张素II诱导的心脏纤维化中的作用及KLF4的调控机制 | 小鼠血管平滑肌细胞来源的AdvSca1-SM细胞及人类心脏肥厚组织 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 谱系追踪, RNA测序 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3339 | 2026-03-29 |
Generation and Downstream Analysis of Single-Cell and Single-Nuclei Transcriptomes in Brain Organoids
2024-03-29, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66225
PMID:38619271
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研究论文 | 本文提供了一个关于在脑类器官中生成和分析单细胞及单核转录组的逐步实验指南 | 通过结合单细胞和单核转录组学方法,克服了难以分离细胞类型的限制,使单个细胞的转录组分析在脑类器官研究中普遍适用 | NA | 为脑类器官研究提供单细胞和单核转录组学的实验流程,以促进对大脑发育的细胞过程和分子机制的全面研究 | 脑类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学,单核转录组学,RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq | NA | NA |
| 3340 | 2026-03-29 |
Spatial High-resolution Analysis of Gene Expression Levels in Tendons
2024-03-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65852
PMID:38526117
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方法论文 | 本文综述了肌腱组织中空间高分辨率基因表达水平的分析方法,重点关注新型原位杂交技术 | 针对富含基质的肌腱组织,提出了单细胞水平的空间转录组学分析方法,解决了低细胞数、低RNA含量和高基质背景的挑战 | NA | 开发并优化肌腱组织中空间基因表达水平的分析方法 | 肌腱组织,特别是年轻和老年动物模型及人类肌腱样本 | 数字病理学 | NA | 原位杂交,空间转录组学 | NA | 图像,RNA空间表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |