单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 37547 篇文献,本页显示第 3321 - 3340 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3321 2026-02-02
Insights Into Systemic Sclerosis from Gene Expression Profiling
2021-Sep, Current treatment options in rheumatology IF:1.7Q3
综述 本文综述了基因表达谱分析在系统性硬化症研究中的应用,特别是通过转录组学揭示疾病异质性、病因及治疗靶点 利用转录组学(包括bulk和单细胞技术)量化系统性硬化症的分子异质性,为个性化治疗提供数据驱动见解 疾病轨迹预测仍具挑战性,需进一步研究靶组织中的细胞和分子动态 通过基因表达谱分析提升对系统性硬化症分子异质性和治疗策略的理解 系统性硬化症患者 自然语言处理 系统性硬化症 转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3322 2026-01-30
Lycium barbarum polysaccharides enhance testicular spermatogenesis in d-galactose-induced aging rats via calcium signaling
2026-Feb, Andrology IF:3.2Q1
研究论文 本研究探讨了枸杞多糖如何通过调节钙信号通路改善d-半乳糖诱导的衰老大鼠睾丸精子发生功能 首次结合单细胞测序和多组学方法,系统揭示了枸杞多糖通过钙信号通路改善睾丸衰老的具体细胞机制 研究主要基于动物和细胞模型,尚未在人体中进行验证 探究枸杞多糖对d-半乳糖诱导的睾丸功能障碍的保护作用及其分子机制 d-半乳糖诱导的衰老雄性大鼠和TM3细胞模型 生殖医学 老年性疾病 单细胞测序、多组学分析、组织学分析、SA-β-gal染色 动物模型、细胞模型 测序数据、组织图像、生化指标 未明确说明具体样本数量,但包括大鼠和细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3323 2026-01-30
Systemic activation and tissue infiltration of CD8 + CX3CR1 + T cells in non-small cell lung cancer treated with neoadjuvant immune checkpoint blockade
2026-Feb, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了CD8+CX3CR1+T细胞在非小细胞肺癌新辅助免疫检查点阻断治疗中的系统性激活和组织浸润特征 首次系统性地鉴定并表征了与NA-ICB治疗反应相关的CD8+CX3CR1+T细胞亚群,揭示了其在血液中的增殖动态、组织迁移路径以及向耗竭和细胞毒性NK样CD8+T细胞分化的轨迹 样本量相对有限(共40例患者),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证其作为生物标志物的预测价值 探究新辅助免疫检查点阻断治疗非小细胞肺癌时,哪些T细胞亚群发生扩增和功能重激活,及其组织起源、迁移模式和表型转换 26例接受NA-ICB治疗和14例未经治疗的NSCLC患者的肿瘤组织、配对正常肺组织及外周血样本 单细胞组学与免疫学 肺癌 单细胞RNA测序, TCR repertoire分析, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 流式细胞数据 40例NSCLC患者(26例治疗组,14例未治疗组)的肿瘤、正常肺组织和外周血样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3324 2026-01-30
Single-cell transcriptional mapping of Mustn1 exhibits consistent mural cell localization across musculoskeletal tissues
2026-Feb, JBMR plus IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学方法,系统性地绘制了Mustn1基因在肌肉骨骼组织中的表达图谱,并揭示了其在平滑肌肌动蛋白表达细胞中的一致定位 首次利用开源单细胞RNA测序数据集,采用自上而下的转录组学方法,在多种肌肉骨骼组织中系统性地绘制了Mustn1基因的表达图谱,并发现其与Acta2在血管周细胞中的共定位 研究依赖于已有的开源数据集,可能受限于数据质量和覆盖范围;未进行实验验证Mustn1蛋白的功能 探究Mustn1基因在肌肉骨骼组织中的表达模式和细胞定位 肌肉骨骼组织(骨、滑膜、肌肉、肌腱)中的细胞,特别是血管周细胞和Sox9谱系细胞 单细胞转录组学 肌肉骨骼疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3325 2026-01-30
Integrative Single-Cell Analysis Reveals Targetable Vacuole Membrane Protein 1-Mediated Mechanism of Tumor Angiogenesis in Glioblastoma
2026-Feb, MedComm IF:10.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞分析揭示了VMP1在胶质母细胞瘤中促进肿瘤血管生成的非自噬功能机制 首次发现VMP1在胶质母细胞瘤中具有独立于自噬功能的促肿瘤生长作用,并揭示了其通过VEGFA-VEGFR2信号通路促进血管生成的新机制 研究主要基于胶质母细胞瘤模型,VMP1在其他癌症类型中的功能仍需进一步验证 探究VMP1在胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的非经典功能及其在血管生成中的作用机制 胶质母细胞瘤细胞、内皮细胞、小鼠模型 单细胞分析 胶质母细胞瘤 单细胞转录组测序、空间转录组学、bulk RNA-seq NA 转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
3326 2026-01-30
omnideconv: a unifying framework for using and benchmarking single-cell-informed deconvolution of bulk RNA-seq data
2026-Jan-26, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文提出了omnideconv框架,用于统一和基准测试基于单细胞RNA测序数据的批量RNA-seq数据去卷积方法 开发了一个统一的框架omnideconv,用于简化去卷积方法的应用、基准测试和优化,并全面评估了第二代工具的准确性、可扩展性和鲁棒性 NA 评估和优化基于单细胞RNA测序数据的批量RNA-seq数据去卷积方法的性能 批量RNA-seq数据的细胞类型去卷积 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
3327 2026-01-30
CIPHER: An end-to-end framework for designing optimized aggregated spatial transcriptomics experiments
2026-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个名为CIPHER的端到端框架,用于设计优化的聚合空间转录组学实验,通过联合优化实验编码矩阵和下游细胞嵌入,提高细胞类型可分离性和解码准确性 CIPHER首次将实验编码矩阵和下游细胞嵌入联合优化,并将成像检测的物理限制直接整合到损失函数中,从而在提高区分能力的同时保持对测量噪声和信号约束的鲁棒性 NA 开发一个计算框架,用于设计基于聚合测量的空间转录组学实验,以实现与单细胞RNA-seq数据的高效准确整合 小鼠大脑单细胞RNA-seq参考数据 空间转录组学 NA 聚合转录特征测量,单细胞RNA-seq 神经网络 转录组数据,模拟数据,实验数据 大规模小鼠大脑scRNA-seq参考数据 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
3328 2026-01-30
A dual-action core-shell microneedle system restores mitochondrial function and accelerates healing in diabetic wounds
2026-Jan-17, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本文开发了一种用于治疗糖尿病伤口的新型核壳微针系统,通过顺序递送策略恢复线粒体功能并加速愈合 利用单细胞RNA测序识别了糖尿病伤口中上调的关键内皮靶点VDAC1,并设计了一种具有ROS响应外壳和光交联核心的双功能核壳微针系统,实现了抗氧化、抗菌与持续抑制VDAC1寡聚化的顺序治疗 研究主要基于动物模型(小鼠和猪),尚未进行人体临床试验;长期安全性和大规模生产可行性有待进一步评估 开发一种新型治疗平台,以解决糖尿病伤口愈合中由线粒体功能障碍和持续炎症导致的临床挑战 糖尿病伤口(小鼠和猪模型) 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 糖尿病小鼠和猪模型(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3329 2026-01-30
Prognostic significance and immune landscape of anoikis-related genes in hepatocellular carcinoma: a multi-omics analysis of subtypes and cellular communication
2026-Jan-16, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过多组学分析探索了失巢凋亡相关基因在肝细胞癌中的预后意义和免疫景观,构建了预后模型并识别了两种可靠的HCC亚型 首次结合失巢凋亡相关基因、多组学分析和单细胞RNA测序数据,系统研究其在HCC中的预后价值和细胞间通讯机制 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于HCC细胞系,缺乏临床样本的直接验证 开发肝细胞癌的预后生物标志物并探索其免疫微环境特征 肝细胞癌患者数据、HCC细胞系(HepG2和LO2) 生物信息学 肝细胞癌 生物信息学分析、qRT-PCR、Western blot、单细胞RNA测序 预后模型 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3330 2026-01-30
FOXM1 regulates platelet-induced anoikis resistance in pancreatic cancer cells
2026-Jan-14, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了血小板通过调控FOXM1基因表达增强胰腺癌细胞失巢凋亡抵抗的机制 首次在胰腺癌细胞中揭示血小板通过激活AKT信号通路上调FOXM1表达来促进失巢凋亡抵抗的新机制 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;样本量有限且仅针对特定胰腺癌细胞系 探究血小板如何调控胰腺癌细胞的失巢凋亡抵抗及其分子机制 胰腺癌细胞系 肿瘤生物学 胰腺癌 RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组织化学 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 未明确样本数量,使用胰腺癌细胞系进行实验 NA 单细胞RNA测序、转录组分析 NA NA
3331 2026-01-30
Single-cell and multi-omic characterization of ex vivo expanded ASTRLs from stable kidney transplant recipients reveals a regulatory T cell phenotype
2026-Jan-14, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和质谱流式细胞术,详细表征了从稳定肾移植受者外周血单个核细胞中扩增的异质性抗原特异性T细胞富集调节细胞系(ASTRL),揭示了其获得调节性T细胞表型 首次结合单细胞和多组学技术对肾移植受者中扩增的ASTRL进行深入表征,发现其在供体抗原刺激下获得调节性T细胞转录组特征,为器官移植中的调节性细胞疗法开发提供了新见解 研究基于体外扩增模型,可能无法完全反映体内环境;样本来源仅限于稳定肾移植受者,缺乏疾病状态或健康对照的比较 探究ex vivo扩增的抗原特异性T细胞富集调节细胞系(ASTRL)在肾移植受者中的表型和功能特征,以评估其作为调节性细胞疗法的潜力 从稳定肾移植受者外周血单个核细胞(PBMC)中扩增的ASTRL细胞系 单细胞组学 肾移植 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术, 质谱流式细胞术(mass cytometry) NA 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 从稳定肾移植受者PBMC中扩增的ASTRL细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3332 2026-01-30
Long-Read Spatial Transcriptomics of Patient-Derived Clear Cell Renal Cell Carcinoma Organoids Identifies Heterogeneity and Transcriptional Remodelling Following NUC-7738 Treatment
2026-Jan-14, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究结合长读长空间转录组学与患者来源的透明细胞肾细胞癌类器官模型,揭示了肿瘤异质性及NUC-7738治疗后的转录重塑 首次将长读长空间转录组学应用于患者来源的ccRCC类器官,实现了空间分辨的转录本和异构体水平分析,并评估了新型治疗药物NUC-7738的效果 未提及样本量具体大小或长期治疗效果的验证,可能局限于类器官模型的体外环境 解析ccRCC的基因和异构体水平异质性,并阐明新型治疗药物的空间转录反应 患者来源的透明细胞肾细胞癌类器官 空间转录组学 肾细胞癌 长读长空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3333 2026-01-30
Tumor microenvironment differences between diagnostic and relapsed classic Hodgkin lymphoma revealed by scRNA-seq
2026-Jan-13, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了经典霍奇金淋巴瘤诊断时与复发时肿瘤微环境的差异,并发现早期复发样本中富含具有免疫抑制潜能的galectin-9阳性幼稚B细胞 首次在早期复发经典霍奇金淋巴瘤中发现并表征了一群具有免疫调节潜能的galectin-9阳性幼稚B细胞,揭示了其在塑造免疫抑制微环境中的作用 样本量相对有限,且研究主要基于观察性分析,功能验证有待进一步深入 探究经典霍奇金淋巴瘤诊断与复发时肿瘤微环境的差异,特别是非恶性B细胞在复发中的作用 配对诊断和复发经典霍奇金淋巴瘤样本中的肿瘤微环境细胞 单细胞组学 经典霍奇金淋巴瘤 单细胞RNA测序,成像质谱流式细胞术,免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据,空间蛋白质组数据 配对诊断和复发CHL样本,并在独立验证队列中确认 NA 单细胞RNA-seq,空间蛋白质组学 NA NA
3334 2026-01-30
PCID2 is essential for spermatogonial differentiation by regulating alternative splicing
2026-Jan-13, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究揭示了PCID2通过调控选择性剪接在精子发生中的关键作用 首次证明PCID2通过调控选择性剪接影响精原细胞分化,并鉴定出四个关键剪接靶基因 研究主要基于小鼠模型,人类中的生理功能尚需进一步验证 探究PCID2在精子发生中的生理功能及其分子机制 小鼠精原细胞及精子发生过程 生殖生物学 男性不育症 单细胞转录组测序、RNA测序、免疫沉淀质谱、共免疫沉淀、PCR 条件性基因敲除小鼠模型 转录组数据、蛋白质相互作用数据 Pcid2条件性敲除小鼠及其对照 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3335 2026-01-30
Single-Cell Transcriptomic Atlas of Chicken Ovarian Aging and Cancer Drives Prognostic Model Development
2026-Jan-13, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了母鸡卵巢衰老和癌症的转录组图谱,并基于共同失调基因构建了人类卵巢癌的预后模型 首次对母鸡卵巢癌进行单细胞RNA测序研究,并利用卵巢衰老和癌变过程中免疫细胞显著变化的216个基因构建了20基因预后模型 研究基于母鸡模型,其与人类卵巢癌的完全等效性需进一步验证,样本量相对有限 探索卵巢衰老与癌变之间的免疫相关联系,并开发人类卵巢癌的预后预测工具 母鸡的卵巢组织,包括正常年轻卵巢、正常老年卵巢和老年卵巢癌组织 单细胞转录组学 卵巢癌 单细胞RNA测序 LASSO回归模型 单细胞转录组数据 三个母鸡组:35周龄正常卵巢、110周龄正常卵巢、110周龄卵巢癌组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3336 2026-01-30
Multi-Omics Evidence Linking Depression to MASLD Risk via Inflammatory Immune Signaling
2026-Jan-13, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合流行病学、遗传学、转录组学和单细胞RNA测序数据,提供了多组学证据,表明抑郁症通过炎症介导的免疫信号通路对代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)风险产生因果影响 首次采用多水平整合分析策略(流行病学、孟德尔随机化、转录组共表达网络、机器学习、单细胞测序)系统验证了抑郁症通过炎症免疫信号增加MASLD风险的因果通路,并识别出CCR1-CCL5轴作为潜在的性别特异性免疫机制 研究结果的稳定性受限于样本量,尤其是在单细胞数据分析部分 探索抑郁症是否增加MASLD风险,以及炎症是否介导这一效应 抑郁症与代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) 生物信息学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 单细胞RNA测序, GWAS, 转录组分析, 孟德尔随机化, 机器学习 机器学习, 加权基因共表达网络分析 流行病学数据, 遗传数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 基于NHANES、GWAS、GEO和单细胞RNA测序数据集的多源数据,具体样本量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 转录组学 NA NA
3337 2026-01-30
Cancer-Associated Fibroblast Heterogeneity Shapes Prognosis and Immune Landscapes in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2026-Jan-09, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了头颈部鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞的异质性,并评估了其与患者预后和免疫微环境的关系 首次在头颈部鳞状细胞癌中系统鉴定出6个CAF亚群,并发现炎症性CAF亚群相关的转录程序是患者生存的稳健标志物 进展无生存期预测显示出较大的队列依赖性,需要更多独立队列验证 表征CAF异质性并评估CAF亚群特异性转录程序的预后意义 头颈部鳞状细胞癌患者肿瘤样本 单细胞组学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 预后风险模型 单细胞RNA测序数据,bulk RNA测序数据 TCGA HNSCC队列及独立验证数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3338 2026-01-30
Machine Learning Identifies Key Cells and Therapeutic Targets in Intervertebral Disc Degeneration: SASP-Driven Matrix Catabolism, Inflammation Amplification, and Metabolic Collapse
2026-Jan-07, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,揭示了衰老相关分泌表型(SASP)在椎间盘退变(IVDD)进展中的作用,并识别出BMP2和MMP3作为核心调控靶点 整合单细胞RNA测序与批量RNA-seq数据,利用WGCNA和机器学习算法(LASSO、随机森林、Boruta)识别出BMP2和MMP3作为SASP信号的核心调控网络,并开发了基于这两个基因的SASP评分模型,同时通过药物筛选发现辛伐他汀作为BMP2/MMP3的双重抑制剂 研究主要基于转录组数据,可能未涵盖所有分子机制;动物模型的结果需在人类中进一步验证 探究椎间盘退变的细胞和分子机制,特别是SASP信号的作用,并寻找潜在治疗靶点 椎间盘退变(IVDD)中的髓核细胞(NPCs)亚型 机器学习 椎间盘退变 单细胞RNA测序,批量RNA-seq LASSO,随机森林,Boruta 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
3339 2026-01-30
Integrated Single-Cell and Bulk Transcriptomics Unveils Immune Profiles in Chick Erythroid Cells upon Avian Pathogenic Escherichia coli Infection
2026-Jan-07, Animals : an open access journal from MDPI IF:2.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组学技术,揭示了鸡红细胞在禽致病性大肠杆菌感染下的免疫特征和亚群异质性 首次在单细胞分辨率下系统描绘了鸡红细胞在感染状态下的免疫异质性,并识别了关键的免疫相关基因和转录因子调控网络 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的功能验证;样本量相对有限;未深入探究不同亚群在免疫应答中的具体功能机制 探究鸡红细胞在禽致病性大肠杆菌感染下的免疫特征和细胞异质性 鸡红细胞 单细胞组学 禽致病性大肠杆菌感染 单细胞RNA测序 无监督聚类、伪时间分析、SCENIC分析 单细胞转录组数据、批量转录组数据 未明确说明具体样本数量,但包含感染组和对照组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3340 2026-01-30
Plant bZIPs in Root Environmental Adaptation: From Single-Cell Expression Atlas to Functional Insights
2026-Jan-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了植物bZIP转录因子在根环境适应中的作用,结合单细胞表达图谱与功能遗传学,揭示了其调控机制及在培育气候适应性作物中的潜力 通过整合单细胞RNA测序技术,构建了根bZIPs的高分辨率表达图谱,并结合功能遗传学阐明了其在环境信号响应中的调控模块 NA 探讨植物bZIP转录因子在根环境适应中的调控功能及其在作物改良中的应用潜力 植物根中的bZIP转录因子及其在单细胞水平上的表达模式 植物生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部