单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32755 篇文献，本页显示第 32041 - 32060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 32041 | 2024-08-09 |
Cell type atlas and lineage tree of a whole complex animal by single-cell transcriptomics
2018-05-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaq1723
PMID:29674432
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，构建了一个完整的复杂动物细胞类型图谱和谱系树 | 结合扰动实验、基因表达分析和计算方法预测细胞状态变化，成功将所有主要细胞类型置于一个单一的谱系树上，连接所有细胞到一个单一的干细胞区室 | NA | 揭示成熟和前体细胞类型，并探索再生过程中的关键细胞类型 | 扁虫物种中的成年动物细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32042 | 2024-08-09 |
Dissociable Structural and Functional Hippocampal Outputs via Distinct Subiculum Cell Classes
2018-05-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.03.031
PMID:29681453
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research paper | 本文通过群体和单细胞RNA测序，揭示了海马体背侧下托中存在两种空间相邻的亚区域，这些区域在锥体细胞基因表达、长程输入、局部连接、投射目标和电生理特性上存在显著差异，并利用基因表达差异进行神经元沉默，展示了这些区域在空间工作记忆中的不同贡献。 | 首次详细描述了海马体背侧下托中两种不同亚区域的结构和功能特性，并通过基因表达差异进行神经元沉默实验，证明了这些区域在行为层面的不同作用。 | NA | 识别、描绘和操纵海马体背侧下托中假定的并行架构，以理解其功能多样性。 | 海马体背侧下托的结构和功能特性。 | NA | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32043 | 2024-08-09 |
Advances in Transcriptomics: Investigating Cardiovascular Disease at Unprecedented Resolution
2018-04-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.117.310910
PMID:29700068
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研究论文 | 本文综述了RNA测序（RNAseq）技术在转录组学中的最新进展，特别是在单细胞转录组学方面的应用 | 介绍了RNAseq技术在单细胞转录组学中的应用，以及其在质量控制、读取映射、特征计数等方面的最新发展 | NA | 探讨RNAseq技术在心血管疾病研究中的应用及其在现代生物学中的重要性 | RNAseq技术及其在单细胞转录组学中的应用 | 基因组学 | 心血管疾病 | RNA测序（RNAseq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32044 | 2024-08-09 |
Characterization of germ cell differentiation in the male mouse through single-cell RNA sequencing
2018-04-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-018-24725-0
PMID:29695820
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，首次全面、无偏地展示了小鼠精子发生过程中的细胞分化过程 | 利用单细胞RNA测序技术，提高了阶段标记检测和验证的准确性，捕捉到了分化的连续性，并揭示了在批量测序数据中被掩盖的稀有细胞群体 | NA | 研究小鼠精子发生过程中的细胞分化 | 小鼠的精子发生过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过2,500个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 32045 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Transcriptional Heterogeneity in Latent and Reactivated HIV-Infected Cells
2018-04-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.03.102
PMID:29694901
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了HIV潜伏感染细胞在潜伏和重新激活状态下的转录异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了HIV潜伏感染细胞在潜伏和重新激活状态下的转录异质性 | NA | 研究HIV潜伏感染细胞的转录异质性，以期为HIV根除提供策略 | HIV潜伏感染细胞的转录异质性 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32046 | 2024-08-09 |
Hippo Signaling Plays an Essential Role in Cell State Transitions during Cardiac Fibroblast Development
2018-04-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.03.019
PMID:29689192
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研究论文 | 研究探讨了Hippo信号通路中的Lats1和Lats2激酶在心脏成纤维细胞发育中的作用 | 首次揭示了Lats1/2缺失导致心脏成纤维细胞分化受阻，细胞停留在中间状态 | 研究仅限于胚胎阶段，未涉及成体心脏的发育情况 | 探究Hippo信号通路在心脏成纤维细胞发育中的作用 | 心脏成纤维细胞的发育过程 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 胚胎心脏组织中的单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 32047 | 2024-08-09 |
Genetic and phenotypic difference in CD8+ T cell exhaustion between chronic hepatitis B infection and hepatocellular carcinoma
2019-01, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmedgenet-2018-105267
PMID:29666149
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研究论文 | 本研究探讨了慢性乙型肝炎（CHB）和肝细胞癌（HCC）中CD8+ T细胞耗竭的遗传和表型差异 | 首次详细比较了CHB和HCC中CD8+ T细胞耗竭的表型、功能状态和分子机制的差异 | 研究仅基于已发表的单细胞测序数据和有限的样本，可能无法全面反映所有CHB和HCC患者的CD8+ T细胞耗竭情况 | 探索CHB和HCC中CD8+ T细胞耗竭的遗传和表型差异 | CHB和HCC患者的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 基于已发表的数据集GSE98638 | NA | NA | NA | NA |
| 32048 | 2024-08-09 |
B-cell receptor reconstruction from single-cell RNA-seq with VDJPuzzle
2018-08-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty203
PMID:29659703
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VDJPuzzle的新型生物信息学工具，用于从单细胞RNA测序数据中重建B细胞受体的完整序列并提取VDJ区域的体细胞突变 | 开发了VDJPuzzle工具，能够从单细胞RNA测序数据中重建B细胞受体的完整序列，并提取VDJ区域的体细胞突变 | NA | 开发一种新的生物信息学工具，用于从单细胞RNA测序数据中重建B细胞受体的序列 | B细胞受体的序列重建和VDJ区域的体细胞突变提取 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 117个人类B细胞和200个小鼠B细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 32049 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-Seq reveals cell heterogeneity and hierarchy within mouse mammary epithelia
2018-06-01, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA118.002297
PMID:29666189
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术结合FACS分析和主成分分析，揭示了小鼠乳腺上皮细胞的异质性和层次结构 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了乳腺上皮细胞的高度异质性，并识别出罕见的CDH5细胞亚群作为静止的乳腺干细胞 | NA | 旨在揭示小鼠乳腺上皮细胞的异质性和层次结构 | 小鼠乳腺上皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 32050 | 2024-08-09 |
Myoepithelial Cells of Submucosal Glands Can Function as Reserve Stem Cells to Regenerate Airways after Injury
2018-05-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.03.018
PMID:29656943
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术，揭示了黏膜下腺的肌上皮细胞在损伤后能够增殖和迁移，以再生气道表面上皮 | 首次发现黏膜下腺的肌上皮细胞具有多能性，并能在严重损伤后在大型动物肺部的气道表面再生 | NA | 探索细胞在损伤后的可塑性及其细胞机制 | 黏膜下腺的肌上皮细胞及其在气道再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个损伤模型的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 32051 | 2024-08-09 |
Cellular diversity in the Drosophila midbrain revealed by single-cell transcriptomics
2018-04-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.34550
PMID:29671739
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术分析了果蝇中脑的细胞多样性 | 利用单细胞转录组学技术揭示了果蝇中脑的细胞多样性，并将其与神经递质和神经调质联系起来 | NA | 理解大脑的分子细节与神经连接图的关系 | 果蝇中脑的单个细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 数千个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 32052 | 2024-08-09 |
Next-Generation Immune Repertoire Sequencing as a Clue to Elucidate the Landscape of Immune Modulation by Host-Gut Microbiome Interactions
2018, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2018.00668
PMID:29666626
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研究论文 | 本文讨论了下一代免疫组库测序技术在营养与肠道免疫学领域的应用潜力 | 该技术结合单细胞转录组学/蛋白质组学，提供了揭示宿主-微生物免疫稳态新原理的关键工具 | 目前仍存在未解决的问题 | 探讨高吞吐量免疫受体测序在营养与肠道免疫学领域的应用 | 宿主与肠道微生物的免疫交互作用 | NA | NA | 下一代测序 | NA | 序列数据 | 单个个体 | NA | NA | NA | NA |
| 32053 | 2024-08-09 |
Cancer: a CINful evolution
2018-06, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2018.03.007
PMID:29625384
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综述 | 本文综述了近期关于非整倍体和染色体不稳定（CIN）在肿瘤演化中的作用的研究进展 | 探讨了非整倍体和CIN如何通过产生基因组不稳定性和肿瘤内异质性促进肿瘤演化 | NA | 旨在回顾非整倍体和CIN的成因及其在细胞水平上提供表型变异的方式，并讨论它们与癌症进展的关联 | 非整倍体和染色体不稳定（CIN）在肿瘤演化中的作用 | NA | 癌症 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32054 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of the mouse kidney reveals potential cellular targets of kidney disease
2018-05-18, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aar2131
PMID:29622724
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了健康小鼠肾脏的57,979个细胞，揭示了肾脏疾病潜在的细胞靶点 | 发现了通过Notch信号通路介导的过渡细胞在肾脏疾病中的作用 | NA | 旨在通过单细胞转录组学揭示肾脏疾病的细胞机制 | 小鼠肾脏细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 57,979个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 32055 | 2024-08-09 |
FateID infers cell fate bias in multipotent progenitors from single-cell RNA-seq data
2018-05, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4662
PMID:29630061
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研究论文 | 本文开发了FateID算法，用于从单细胞RNA测序数据中推断多能祖细胞的细胞命运倾向 | 开发了FateID，一种迭代监督学习算法，用于概率量化祖细胞群体中的细胞命运倾向 | NA | 理解沿着多条谱系的干细胞分化 | 小鼠造血祖细胞，特别是淋巴系祖细胞 | 单细胞RNA测序 | NA | CEL-Seq2 | RaceID3 | RNA-seq数据 | 约2,000个 | NA | NA | NA | NA |
| 32056 | 2024-08-09 |
Pseudotime Dynamics in Melanoma Single-Cell Transcriptomes Reveals Different Mechanisms of Tumor Progression
2018-Apr-03, Biology
DOI:10.3390/biology7020023
PMID:29614062
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研究论文 | 本研究通过分析三种不同遗传背景的黑色素瘤短期培养细胞的伪时间（PT）动力学，探讨了影响黑色素瘤进展的特定和一致的PT动力学特性。 | 首次在黑色素瘤细胞中观察到伪时间动力学主要由细胞周期基因驱动，并发现微眼相关转录因子（MITF）和AXL受体酪氨酸激酶（AXL）的双极表达。 | 研究仅限于短期培养的黑色素瘤细胞，可能无法完全代表所有黑色素瘤细胞的动态变化。 | 研究黑色素瘤细胞的伪时间动力学，以揭示肿瘤进展的不同机制。 | 三种不同遗传背景的黑色素瘤短期培养细胞。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 三种黑色素瘤短期培养细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 32057 | 2024-08-09 |
Detecting hidden batch factors through data-adaptive adjustment for biological effects
2018-04-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btx635
PMID:29617963
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于数据自适应收缩和半非负矩阵分解的新算法，用于检测未知的批次效应 | 该算法在识别隐藏批次效应方面优于现有算法，并能在先前研究中未发现的批次因素中识别出差异表达基因 | NA | 检测隐藏的批次因素，以准确捕捉基因表达与其他建模变量之间的关系 | 批次效应的检测 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 半非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 三个不同数据集：(i) 测序质量控制，(ii) 拓扑替康RNA-Seq，(iii) 胶质母细胞瘤的单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA |
| 32058 | 2024-08-09 |
A multitask clustering approach for single-cell RNA-seq analysis in Recessive Dystrophic Epidermolysis Bullosa
2018-04, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006053
PMID:29630593
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研究论文 | 本文介绍了一种基于方差的单细胞RNA测序数据多任务聚类方法（scVDMC），用于在遗传性大疱性表皮松解症中分析单细胞RNA测序数据 | scVDMC方法通过控制细胞簇内的方差和跨数据集的方差，能够更准确地检测细胞亚群，并揭示新的细胞类型和标记 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序数据分析方法，以更好地整合和分析多个单细胞群体的数据 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 遗传性大疱性表皮松解症 | 单细胞RNA测序 | 多任务聚类 | RNA测序数据 | 两个真实单细胞RNA测序数据集，包含多个重复样本和一个大规模液滴法数据集，涉及三个患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 32059 | 2024-08-09 |
Quantitative single-cell transcriptomics
2018-07-01, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/ely009
PMID:29579145
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）的基本原理、实验协议及其数据处理方法 | NA | NA | 帮助选择适合研究问题的实验和计算方法 | 单细胞RNA测序技术及其数据处理方法 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32060 | 2024-08-09 |
Integrating single-cell transcriptomic data across different conditions, technologies, and species
2018-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.4096
PMID:29608179
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研究论文 | 本文介绍了一种基于共同变异源的分析策略，用于整合不同条件、技术和物种的单细胞转录组数据集，以识别跨数据集的共享细胞群并进行下游比较分析 | 提出了一种新的分析策略，通过整合单细胞RNA测序数据集，增强了统计能力并能共同学习不同或过渡的细胞状态 | NA | 开发一种方法来整合不同条件、技术和物种的单细胞转录组数据集，以进行比较分析 | 外周血单个核细胞、造血祖细胞和胰腺细胞的单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 外周血单个核细胞、造血祖细胞和胰腺细胞的数据集 | NA | NA | NA | NA |