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当前共找到 44643 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-10-24 |
FOSL2 regulates endothelial cell state and chromatin accessibility in systemic sclerosis pulmonary vascular remodeling
2026-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189107
PMID:42018656
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研究论文 | 本文通过多组学数据和转基因小鼠模型，研究FOSL2在系统性硬化症肺血管重塑中调控内皮细胞状态和染色质可及性的作用 | 首次发现FOSL2是调控系统性硬化症肺血管内皮细胞表型的关键转录因子，并结合深度学习模型ChromBPNet在碱基对分辨率上推断AP-1结合增加 | 研究主要基于小鼠模型和推断分析，缺乏直接的人体治疗干预验证 | 探究系统性硬化症相关肺血管重塑中内皮细胞状态调控的转录因子机制 | 系统性硬化症间质性肺病相关肺动脉高压患者肺组织内皮细胞及Fosl2转基因小鼠 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 深度学习 | CNN | 图像, 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞多组学分析 |
| 302 | 2026-10-24 |
Ancestry-specific rewiring of BCR-MAPK signaling in sarcoidosis B cells
2026-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.20.718985
PMID:42079256
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示结节病B细胞中依赖祖先背景的BCR-MAPK信号通路重塑 | 首次发现结节病B细胞存在祖先特异性（非裔与欧裔）的即早反应改变和MAPK信号通路重塑，且其转录模式与SLE相反，提示不同的免疫应答机制 | 摘要中未明确说明样本量以外的技术局限，也未提及验证实验或功能研究 | 探究B细胞在结节病发病机制中的作用及不同祖先背景下的免疫应答差异 | 非裔和欧裔健康对照者、结节病患者及系统性红斑狼疮患者的PBMC | 单细胞转录组学 | 结节病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 135例样本，包括48例健康对照、59例结节病患者和28例SLE患者 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 303 | 2026-10-24 |
Generative AI-assisted Bayesian-frequentist Hybrid Inference in Single-cell RNA Sequencing Analysis for Genes Associated with Alzheimer's Disease
2026-Apr-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.04.17.26351142
PMID:42078386
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研究论文 | 提出了一种AI辅助的贝叶斯-频率混合推断框架，利用大语言模型ChatGPT-4o为每个基因生成信息先验，结合Yuan(2009)的混合推断理论，应用于阿尔茨海默病单细胞RNA测序数据分析 | 首次将大语言模型（ChatGPT-4o）用于全基因组水平的先验知识提取，通过标准化提示词评估基因与疾病的证据强度并映射为信息正态先验，与频率派混合推断理论结合，实现了可扩展的贝叶斯分析 | 框架依赖大语言模型评估基因-疾病关联的可靠性，可能存在偏差；仅在阿尔茨海默病ROSMAP队列上验证，需在更多疾病和组学平台中评估通用性 | 解决贝叶斯推断在高维组学研究中因先验获取成本过高而难以应用的问题，提出可扩展的AI辅助贝叶斯-频率混合推断方法 | 阿尔茨海默病相关基因及ROSMAP队列的单细胞RNA测序数据 | 机器学习, 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 大语言模型, 线性模型 | 文本, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 304 | 2026-10-24 |
Plectin promotes an aggressive phenotype and represses cytotoxic T cell activity in pancreatic cancer
2026-Apr-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.16.718901
PMID:42079239
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研究论文 | 该文揭示胰腺癌中细胞连接蛋白网蛋白（plectin）通过抑制细胞毒性T细胞活性促进侵袭性表型，并验证抗CSP单克隆抗体可恢复抗肿瘤免疫 | 首次发现网蛋白（PLEC）是胰腺癌T细胞抑制性肿瘤微环境的新型调控因子，并证明靶向细胞表面网蛋白（CSP）的单克隆抗体可在体内恢复抗肿瘤免疫、抑制肿瘤生长 | 研究主要基于生物信息学分析和小鼠模型的功能验证，尚缺乏人体临床试验数据；抗CSP单抗的长期安全性和疗效仍需进一步评估 | 阐明网蛋白在胰腺癌T细胞抑制性肿瘤微环境中的调控机制，并评估靶向细胞表面网蛋白作为治疗策略的可行性 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者肿瘤样本及两种小鼠PDAC模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、生物信息学分析、免疫浸润分析、GSEA、免疫去卷积分析 | NA | 文本（基因表达数据）、图像（NA） | TCGA-PAAD数据集肿瘤样本，229例PDAC患者的单细胞RNA-seq数据，两种小鼠PDAC模型 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 305 | 2026-10-24 |
Folate receptor beta drives NLRP3 inflammasome activation and pyroptosis in macrophages independent of folate binding
2026-Apr-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag051
PMID:41984502
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研究论文 | 本文揭示了叶酸受体β（FRβ，由FOLR2编码）以不依赖叶酸的方式调控巨噬细胞中NLRP3炎症小体激活和细胞焦亡 | 首次发现FRβ是NLRP3炎症小体的新型调控因子，且其功能独立于叶酸结合，可能通过调控DNA甲基化、基因转录和钾离子外流发挥作用 | 研究主要基于THP-1巨噬细胞系，缺乏原代巨噬细胞或体内实验验证；具体分子机制（FRβ如何影响钾通道表达和DNA甲基化）尚未完全阐明 | 探究FRβ在巨噬细胞先天免疫信号传导中的功能，特别是对NLRP3炎症小体激活和细胞焦亡的调控作用 | 人THP-1巨噬细胞（野生型及FOLR2敲除型） | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、全基因组甲基化测序 | NA | 文本（基因表达数据）、图像（甲基化图谱数据） | NA | NA | 单细胞RNA-seq、全基因组甲基化测序 | NA | NA |
| 306 | 2026-10-24 |
Non-enzymatic Rnaseh2c orchestrates proliferating macrophage-driven immunosuppression and HCC progression via Cdk9 proliferation axis and CCL2/CCR2-mediated CD8+ Tex infiltration: a novel therapeutic paradigm with "Rnaseh2c-In1" inhibitor
2026-Apr-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-014993
PMID:41986071
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研究论文 | 该研究通过多组学技术揭示了增殖性巨噬细胞在肝细胞癌中的作用机制，并开发了靶向Rnaseh2c的抑制剂 | 首次鉴定出以Cdk1和Mki67高表达为特征的增殖性巨噬细胞亚群；发现Rnaseh2c作为非酶调控因子直接结合CDK启动子驱动巨噬细胞增殖并抑制其内吞和抗原呈递能力；揭示Rnaseh2c通过CCL2/CCR2轴促进CD8+耗竭T细胞浸润；开发了特异性抑制剂Rnaseh2c-In1 | 摘要未明确说明 | 解析肝细胞癌中增殖性巨噬细胞的表型、功能景观及靶向策略 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的增殖性巨噬细胞 | 肿瘤免疫学、单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、CUT&Tag、bulk RNA测序、多参数免疫荧光、流式细胞术、分子动力学模拟 | NA | 单细胞转录组数据、bulk转录组数据、表观遗传数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、CUT&Tag | NA | NA |
| 307 | 2026-10-24 |
Targeting TPO/MPL Signaling to Mitigate JAK2V617F-driven Cardiac Microvascular Disease
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715884
PMID:41959476
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研究论文 | 该文通过骨髓移植构建JAK2V617F突变血液细胞嵌合小鼠并给予高脂/高胆固醇饮食，揭示突变造血驱动冠状动脉微血管病变，并发现心内膜内皮细胞中TPO/MPL信号可作为治疗靶点 | 首次揭示JAK2V617F突变造血通过心内膜内皮细胞TPO/MPL信号驱动冠状动脉微血管功能障碍，并证明抗MPL中和抗体可改善心脏病理表型 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类患者中验证；样本量及具体机制细节未在摘要中充分说明 | 探究JAK2V617F突变血液细胞驱动血管和心脏功能障碍的机制，特别是TPO/MPL信号在其中的作用 | 携带JAK2V617F突变血液细胞和野生型内皮细胞的嵌合小鼠 | 心血管疾病机制研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、骨髓移植 | NA | 基因表达数据、组织切片图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 308 | 2026-10-24 |
Single-cell resolution spatial transcriptomic signature of the retrosplenial cortex during memory consolidation
2026-04, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03331-3
PMID:41188622
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研究论文 | 该研究利用空间转录组学技术揭示了压后皮质在空间记忆巩固过程中的单细胞分辨率转录组特征 | 首次以单细胞分辨率空间转录组学解析压后皮质在空间记忆巩固早期的分子特征，结合深度学习工具识别细胞类型特异性分子激活模式，并在阿尔茨海默病相关痴呆小鼠模型中验证了学习诱导的神经元激活减弱 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；仅聚焦于记忆巩固早期时间窗口，未涵盖完整时间进程；化学遗传学抑制实验无法区分特定神经元亚型的功能贡献 | 解析压后皮质在空间记忆巩固过程中的转录组特征及兴奋性神经元亚型的分子激活模式 | 小鼠压后皮质组织及阿尔茨海默病相关痴呆模型小鼠 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病相关痴呆 | 空间转录组学 | 深度学习 | 空间转录组数据、图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | Xenium空间转录组学平台，结合非靶向和靶向空间转录组学方法 |
| 309 | 2026-10-24 |
The Spatially Resolved Kidney Transcriptome Signatures in Rat Models of Trauma-Induced Acute Kidney Injury
2026-Apr-01, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000001045
PMID:41396698
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研究论文 | 该研究利用大鼠模型，通过bulk转录组学和空间转录组学分析了失血性休克、横纹肌溶解及其联合作用对肾脏的早期转录组响应 | 首次将商业小鼠空间转录组探针成功应用于大鼠肾脏组织，实现了成本效益高的区域特异性基因表达谱分析，并揭示了RM-HS联合作用的协同致死性反应及不同区域和分子特征 | 研究基于大鼠模型，结果向人类临床转化仍需验证；空间转录组探针为小鼠商业探针，在大鼠中的适用性可能存在局限 | 定义失血性休克、横纹肌溶解及其联合作用对肾脏的早期响应，揭示创伤导致肾小管损伤和急性肾损伤进展的核心机制 | 大鼠创伤模型（失血性休克、横纹肌溶解及联合RM-HS）的肾脏组织 | 空间转录组学 | 急性肾损伤 | bulk转录组学、空间转录组学 | NA | 文本（基因表达数据）、图像（空间转录组数据） | NA | NA | bulk RNA-seq、空间转录组学 | 商业小鼠空间转录组探针 | 商业小鼠空间转录组探针应用于大鼠肾脏组织 |
| 310 | 2026-10-24 |
Molecular Characterization of the Effect of Glucagon-Like Peptide-1 Receptor Agonist Semaglutide in the Nephrotoxic Serum Nephritis Mouse Model
2026-Apr-01, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000001067
PMID:41945470
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研究论文 | 本研究在小鼠肾毒性血清肾炎模型中，利用空间转录组学和单核RNA测序探究司美格鲁肽对肾脏功能、炎症和纤维化的分子效应 | 首次在非肥胖非糖尿病的CKD小鼠模型中证明司美格鲁肽的肾脏保护作用独立于其减肥和降糖效应，并结合空间转录组学和单核RNA测序揭示其抗炎、抗纤维化及改善肾血流动力学的分子机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证；样本量有限；未完全阐明司美格鲁肽下游信号通路的具体分子机制 | 表征胰高血糖素样肽-1受体激动剂司美格鲁肽在小鼠肾毒性血清肾炎模型中的分子效应 | 肾毒性血清肾炎小鼠模型 | 肾脏病学 | 慢性肾脏病 | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 基因表达数据，组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | NA |
| 311 | 2026-10-24 |
Cell type annotation for scATAC-seq via DNA large language model and graph domain adaptation
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014226
PMID:42060707
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研究论文 | 提出scLLMDA框架，利用DNA大语言模型和图域自适应进行scATAC-seq细胞类型注释 | 使用预训练的DNA特异性语言模型生成peak序列的上下文嵌入，结合可及性信息表示细胞；构建基于相似性的细胞图并应用图神经网络对齐域，同时保留局部结构上下文 | 未在摘要中明确说明 | 解决scATAC-seq细胞类型注释中序列表示不足和域自适应缺乏邻域建模的问题，实现更准确稳健的注释 | 单细胞ATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq | DNA大语言模型，图神经网络 | 序列数据和可及性数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 312 | 2026-10-24 |
Single-cell transcriptomic analysis of the terminal ileum identifies BCMA as a therapeutic target in IgA nephropathy
2026-Apr, hLife
DOI:10.1016/j.hlife.2025.12.010
PMID:42903470
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研究论文 | 该研究通过对IgA肾病患者末端回肠和血液样本进行单细胞转录组分析，发现肠道IgA浆细胞显著扩增且高表达BCMA，并验证了靶向BCMA的T细胞衔接器cizutamig在食蟹猴中可选择性降低血清IgA | 首次通过配对末端回肠活检和血液的单细胞转录组分析，揭示IgA肾病中肠道IgA浆细胞优先表达BCMA，并证明靶向BCMA的双特异性T细胞衔接器cizutamig在非人灵长类中优先降低血清IgA水平 | 单细胞测序样本量较小（每组5例），动物实验为食蟹猴而非人体临床试验，BCMA靶向治疗的长期安全性和疗效仍需进一步临床评估 | 探究IgA肾病中致病性IgA产生的细胞驱动因素，并评估BCMA作为治疗靶点的潜力 | IgA肾病患者和健康对照者的末端回肠活检组织和血液样本，以及食蟹猴 | 单细胞转录组学、免疫学 | IgA肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、血清免疫球蛋白定量数据 | 发现队列：IgA肾病和健康对照各5例的配对末端回肠活检和血液样本；验证队列1：IgA肾病30例、健康对照30例、疾病对照10例的外周血样本；验证队列2：IgA肾病23例、健康对照14例、疾病对照24例；食蟹猴实验：每组10只，共4组（0、1.5、5、15 mg/kg） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 313 | 2026-10-24 |
Single cell RNA-sequencing reveals that testosterone reduces estrogen signaling in the healthy human mammary gland
2026-03-25, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-026-09605-y
PMID:41876894
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序比较接受睾酮替代疗法的跨性别男性与顺性别女性的乳腺组织，发现睾酮抑制雌激素信号通路 | 首次在人口统计学匹配的队列中，利用单细胞RNA测序揭示睾酮替代疗法对跨性别男性乳腺组织中雌激素信号通路的抑制作用，并实验验证孕激素受体表达降低 | 样本量有限，未明确具体样本数，且未直接评估乳腺癌风险，仅基于基因表达推测保护作用 | 探究睾酮替代疗法对乳腺生物学的影响及其长期安全性，特别是对雌激素信号通路的作用 | 接受睾酮替代疗法的跨性别男性和顺性别女性的乳腺组织 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 314 | 2026-10-24 |
TimeVault: A molecular time machine for single cells
2026-03-19, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.02.019
PMID:41861790
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评论 | 介绍TimeVault方法，一种能在细胞分裂分化过程中重建过去转录状态的分子时间机器 | 通过在完整细胞内保存分子历史，克服传统scRNA-seq仅捕获终末快照的局限 | 摘要中未提及 | 提供一种替代传统scRNA-seq的方法，以重建细胞过去的转录状态 | 单细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 315 | 2026-10-24 |
Regulatory network architecture constrains inflammatory responses in tissue-resident alveolar macrophages
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.706134
PMID:41757068
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研究论文 | 本文整合单细胞RNA-seq与ATAC-seq数据及深度学习染色质可及性建模，推断组织驻留与招募型肺泡巨噬细胞在炎症应激下的基因调控网络架构 | 揭示了PU.1和CEBP/β参与的稳定调控网络架构使组织驻留肺泡巨噬细胞的炎症反应受到约束，阐明了高阶调控互作在组织驻留巨噬细胞身份与炎症调控中的作用 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 解析组织驻留巨噬细胞身份维持与炎症反应调控的高阶基因调控网络架构 | 组织驻留肺泡巨噬细胞与招募的单核细胞来源肺泡巨噬细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 深度学习染色质可及性建模 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 316 | 2026-10-24 |
Cell-cell fusion and immunostimulatory cytokines significantly impact oncolytic vaccinia virus immunotherapeutic potential
2026-02-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.10.055
PMID:41174883
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研究论文 | 该研究构建了表达IL-12和CCL21的双细胞因子武装的融合性溶瘤痘苗病毒（FUVAC-IL-12/CCL21），并在双侧小鼠肿瘤模型中评估其诱导远隔肿瘤消退和系统抗肿瘤免疫的能力 | 首次将细胞-细胞融合与双免疫刺激细胞因子（IL-12和CCL21）联合武装于溶瘤痘苗病毒，通过单侧单次注射实现72%的完全缓解率，并揭示细胞融合可增加浸润效应记忆CD8 T细胞的TCR多样性 | 研究仅基于小鼠肿瘤模型，尚未在人体临床试验中验证；对FUVAC-IL-12/CCL21的长期安全性和潜在毒性未做充分评估 | 探究细胞-细胞融合与免疫刺激细胞因子联合对溶瘤痘苗病毒免疫治疗潜力的影响，以改善对转移性肿瘤的系统抗肿瘤免疫应答 | 双侧小鼠肿瘤模型中的远隔（非病毒注射）肿瘤及肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫治疗 | 癌症（转移性肿瘤） | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 317 | 2026-10-24 |
Niche environment remodeling promotes long-term endometrium stromal stem cell engraftment and tissue regeneration in thin endometrium
2026-02-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.10.053
PMID:41176621
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研究论文 | 本研究在大鼠薄型子宫内膜模型中，通过免疫抑制和Cd47 mRNA表达抑制免疫激活，并通过VEGF mRNA工程促进血管重建，重塑干细胞龛，从而提高自体子宫内膜基质干细胞的移植率和组织再生效果 | 提出通过免疫抑制（ immunosuppressants 或 Cd47 mRNA）联合VEGF mRNA工程重塑干细胞龛的策略，显著提高eSSCs的长期植入率并改善妊娠结局，并通过scRNA-seq揭示移植细胞通过自我更新和分化参与组织修复 | 主要基于大鼠模型和异种移植模型验证，尚未在大型动物或临床试验中证实；长期安全性和疗效仍需进一步评估 | 探究薄型子宫内膜中干细胞龛重塑对自体子宫内膜基质干细胞长期植入和组织再生的促进作用及其机制 | 薄型子宫内膜大鼠模型及人eSSCs异种移植模型 | 再生医学 | 薄型子宫内膜 | scRNA-seq, mRNA工程 | NA | 单细胞转录组数据, 组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2026-10-24 |
Extracellular cyclophilin a binding to CD146 is critical for Th17 cell differentiation in rheumatoid arthritis
2026-02-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.10.047
PMID:41137392
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研究论文 | 该文揭示了细胞外亲环素A（eCypA）通过结合CD4 T细胞表面的CD146受体，促进STAT3介导的Th17细胞分化，从而驱动类风湿关节炎进展，并证明阻断eCypA与CD146结合是治疗RA的潜在策略 | 首次发现eCypA通过与CD146结合并促进CD146二聚化来驱动Th17细胞分化；抗CypA单克隆抗体在两种关节炎小鼠模型中疗效优于抗TNF-α单抗；CD4 T细胞条件性敲除CD146可抑制Th17分化并缓解关节炎 | 摘要未明确说明研究的局限性，机制验证主要基于小鼠模型，尚需进一步临床转化验证 | 探究eCypA在类风湿关节炎发病中的关键作用机制，并寻找新的治疗靶点 | 类风湿关节炎患者、胶原诱导性关节炎小鼠模型、胶原抗体诱导性关节炎小鼠模型、CD4 T细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、单克隆抗体治疗、条件性基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据、临床样本数据、小鼠模型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 319 | 2026-10-24 |
scIRT: Imputation and Dimensionality Reduction for Single-Cell RNA-Seq Data by Combining NMF with SMOTE
2026-Jan-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27031173
PMID:41683604
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研究论文 | 提出了一种结合SMOTE和NMF的迭代插补流程scIRT，用于单细胞RNA测序数据的缺失值估计和降维 | 将SMOTE过采样技术与NMF非负矩阵分解结合，在插补缺失数据的同时实现降维，并比较了插补矩阵和低维表示矩阵对聚类的不同影响 | 未明确说明 | 解决scRNA-seq数据高丢失率问题，同时实现缺失值插补和降维，以促进细胞类型聚类和可视化等下游分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NMF, SMOTE | 基因表达矩阵 | 多个scRNA-seq数据集（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 320 | 2026-10-24 |
Bulk and Single-Cell Transcriptomics Reveal the Role of Inflammatory Response-Related Genes in Cerebral Ischemia-Reperfusion Injury
2026-01-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503423R
PMID:41460635
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研究论文 | 该研究整合批量和单细胞转录组学，识别脑缺血再灌注损伤中的炎症反应相关基因，并构建诊断模型、分析分子亚型及小胶质细胞异质性 | 整合批量和单细胞转录组数据识别CIRI的炎症反应相关关键基因，构建稳健诊断模型，揭示小胶质细胞七个功能异质性亚群在炎症调控中的协同作用 | 需要前瞻性临床研究和功能实验进一步验证 | 识别驱动脑缺血再灌注损伤进展的炎症反应相关基因，探索其诊断和治疗价值 | 大鼠/小鼠缺血性脑卒中基因表达数据集及CIRI样本 | 转录组学 | 脑缺血再灌注损伤 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | LASSO回归, DESeq2, Seurat, Monocle2, CellChat, AUCell | 基因表达数据, 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |