单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 35811 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-01-28 |
Exosome RAB10 inhibits JAK1/STAT1 to hinder macrophage M1 polarization and promote tumor immune escape
2026-Jan-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-02681-x
PMID:41588435
|
研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌细胞通过外泌体递送RAB10蛋白，抑制巨噬细胞M1极化并促进其M2极化，从而促进肿瘤免疫逃逸的机制 | 首次发现外泌体递送的RAB10蛋白可通过结合IFNAR1受体抑制JAK1/STAT1通路磷酸化，调控巨噬细胞极化，并提出RAB10与PD-L1联合靶向治疗的协同抗肿瘤策略 | NA | 探究外泌体RAB10在巨噬细胞极化及肿瘤免疫逃逸中的作用机制 | 乳腺癌细胞、巨噬细胞、肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 302 | 2026-01-28 |
Cancer-associated fibroblast subtypes in the tumor microenvironment of prostate cancer and associations to patient outcomes
2026-Jan-26, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70023
PMID:41588654
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光和数字病理学数据，识别了前列腺癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞亚型，并评估了其与患者生化复发风险的关联 | 首次在前列腺癌中系统鉴定并验证了三种癌症相关成纤维细胞亚型的存在及其空间分布特征，并揭示了apCAF和iCAF亚型作为独立预后生物标志物的潜力 | 研究基于回顾性队列数据，需要前瞻性研究进一步验证；样本主要来自根治性前列腺切除术标本，可能不适用于其他疾病阶段 | 探究前列腺癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞亚型的特征及其与患者预后的关系 | 前列腺癌患者的根治性前列腺切除术标本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，多重免疫荧光，数字病理学分析 | Cox回归分析 | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，组织图像数据 | 两个队列共475例患者（队列1：235例，队列2：240例） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 303 | 2026-01-28 |
International workshop report on "Animal resilience and organismal response to environmental change: insights from basal metazoans", Tutzing (Germany), 22-25 September 2025
2026-Jan-25, Frontiers in zoology
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12983-025-00592-0
PMID:41580841
|
会议报告 | 本文是关于2025年在德国图青举行的“动物恢复力与生物对环境变化的反应：来自基础后生动物的见解”国际研讨会的报告 | 汇集了来自全球的最新研究成果，涵盖了从分子进化、功能基因组学到生态学、发育生物学和共生等多个领域，并重点关注利用基础后生动物来研究多细胞性起源、组织再生机制和环境适应等基本问题 | NA | 探讨动物恢复力与生物对环境变化的反应机制，并利用基础后生动物模型来研究多细胞性起源、组织再生和环境适应等基本生物学问题 | 基础后生动物，包括刺胞动物（水螅、海葵、水母、珊瑚）、海绵和栉水母 | NA | NA | 单细胞转录组学、基因组组装、表观遗传调控分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 304 | 2026-01-28 |
Airway injury induces alveolar epithelial responses mediated by macrophages
2026-Jan-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116881
PMID:41579370
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型探究了气道特异性上皮损伤如何通过巨噬细胞介导远端肺泡上皮细胞的反应 | 首次揭示了急性气道损伤可通过肺泡巨噬细胞介导远端肺泡II型细胞的瞬时增殖反应 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探究气道损伤对远端肺泡微环境的影响机制 | 小鼠气道损伤模型中的肺泡II型细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 305 | 2026-01-23 |
Building consensus: construction of a juvenile and adult scRNA-seq meta-atlas for dataset comparisons and harmonizing transcriptomic definitions of enteric neuron subtypes
2026-Jan-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12283-5
PMID:41566221
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 306 | 2026-01-28 |
Immunomodulatory role of megakaryocytes in the hematopoietic niche of myeloproliferative neoplasms
2026-Jan-22, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.288948
PMID:41568522
|
研究论文 | 本研究探讨了巨核细胞在骨髓增殖性肿瘤造血微环境中的免疫调节作用 | 首次揭示了JAK2V617F突变巨核细胞通过激活LINE-1逆转录转座子驱动慢性骨髓炎症的新机制 | 主要基于小鼠模型，人类样本验证数量有限（13例患者） | 阐明突变巨核细胞在骨髓增殖性肿瘤发展中的免疫调节功能 | 骨髓增殖性肿瘤（MPN）中的巨核细胞和造血干细胞 | 血液肿瘤学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，蛋白质检测数据 | 小鼠模型和13例MPN患者骨髓样本，5例骨科对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 307 | 2026-01-28 |
Comprehensive transcriptomics and proteomics analysis of neointima formation in human saphenous vein: implications for bypass graft disease
2026-Jan-22, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00653.2025
PMID:41569144
|
研究论文 | 本研究通过转录组学和蛋白质组学分析，探究了人类大隐静脉在旁路移植术后新生内膜形成的细胞和分子动态变化 | 首次在人类大隐静脉离体组织培养模型中，结合转录组学、蛋白质组学和空间转录组学，系统揭示了新生内膜形成过程中的动态变化，并发现了性别和体重指数对重塑进程的影响，以及MIR647在维持血管平滑肌细胞收缩基因表达中的作用 | 研究基于离体组织培养模型，可能与体内真实病理环境存在差异；样本量（72例患者）虽具一定规模，但可能不足以完全代表所有临床亚群 | 探究人类大隐静脉在冠状动脉旁路移植术后新生内膜形成的分子机制，以理解移植物疾病的发病机理 | 用于冠状动脉旁路移植手术的人类大隐静脉样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序，蛋白质组学分析，空间转录组学，组织学检查 | NA | 转录组数据，蛋白质组数据，空间基因表达数据，组织学图像 | 72例患者的静脉样本 | NA | 空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 308 | 2026-01-28 |
Microbial single-cell omics in situ
2026-Jan-22, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101128
PMID:41576946
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用激光诱导前向转移技术，在复杂样本中获取高质量微生物单细胞基因组或转录组的方法 | 开发了基于激光诱导前向转移技术的单细胞方法，可直接分析复杂样本中邻近的细菌细胞或与宿主细胞相邻的细菌细胞，并支持荧光标记后的单细胞可视化收集 | 未明确说明该方法在通量、成本或特定样本类型中的具体限制 | 开发一种能够在复杂环境中对微生物进行原位单细胞多组学分析的技术 | 小鼠肠道、人类唾液和肿瘤切片等复杂样本中的微生物单细胞 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞基因组学、单细胞转录组学、激光诱导前向转移 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及小鼠肠道、人类唾液和肿瘤切片等多种样本类型 | NA | 单细胞基因组学、单细胞转录组学 | 激光诱导前向转移系统 | 基于激光诱导前向转移技术的单细胞采集与分析平台 |
| 309 | 2026-01-28 |
Spatial transcriptomics reveals altered communities and drivers of aberrant epithelia and pro-fibrotic fibroblasts in interstitial lung diseases
2026-Jan-22, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101066
PMID:41576947
|
研究论文 | 本研究利用单核RNA测序和空间转录组学技术，揭示了间质性肺疾病中远端肺的细胞网络变化及其纤维化机制 | 通过整合空间转录组学与组织病理学，首次发现纤维化组织中异常支气管化和脱细胞化现象，并识别了促纤维化成纤维细胞与异常过渡上皮细胞的共定位 | 研究主要基于体外器官模型和空间分析，可能未完全反映体内复杂微环境，且样本来源和数量未明确说明 | 探究间质性肺疾病中肺纤维化的细胞和分子驱动机制 | 间质性肺疾病患者的远端肺组织 | 数字病理学 | 间质性肺疾病 | 单核RNA测序，空间转录组学，器官模型 | NA | 空间转录组数据，单核RNA测序数据 | NA | NA | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 310 | 2026-01-28 |
Cellular senescence in human liver under normal aging and cancer
2026-Jan-22, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101133
PMID:41576948
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学、空间转录组学和CODEX技术，揭示了人类肝脏在正常衰老和癌症中细胞衰老的细胞类型特异性机制、空间组织及癌症相关变化 | 首次在人类肝脏中结合单细胞多组学、Xenium空间转录组学和CODEX技术，系统描绘了衰老、纤维化和癌症中细胞衰老的细胞类型特异性、空间分布及分子特征，并发现了化疗对衰老的显著影响 | 研究样本量相对有限（43个正常肝脏和24个结直肠癌肝转移），且主要基于观察性数据，机制验证仍需进一步实验 | 探究人类肝脏在正常衰老和癌症中细胞衰老的细胞类型特异性机制、空间组织及癌症相关变化 | 人类正常肝脏（涵盖不同年龄和纤维化阶段）、纤维化小鼠模型、结直肠癌肝转移样本 | 数字病理学 | 肝纤维化, 结直肠癌肝转移 | 单细胞多组学, Xenium空间转录组学, CODEX | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组学数据, 蛋白质组学数据 | 43个正常人类肝脏, 24个结直肠癌肝转移样本, 纤维化小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞多组学, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Xenium | 单细胞多组学（可能为10x Chromium单细胞多组学方案）, Xenium空间转录组学平台 |
| 311 | 2026-01-28 |
Uncovering the signatures of aging and senescence in the human dorsolateral prefrontal cortex
2026-Jan-22, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101127
PMID:41576945
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了人类背外侧前额叶皮层在衰老过程中的基因表达变化和细胞组成变化 | 首次结合Visium空间转录组学和单核RNA测序技术，系统揭示了人类背外侧前额叶皮层衰老和细胞衰老的分子特征与空间分布 | 研究样本仅限于非病理性组织，未涉及神经退行性疾病等病理状态下的衰老过程 | 揭示人类背外侧前额叶皮层在衰老过程中的分子和细胞变化特征 | 人类背外侧前额叶皮层非病理性组织 | 空间转录组学 | 衰老相关脑部变化 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 空间基因表达数据, 单细胞基因表达数据 | 一组人类非病理性组织样本（具体数量未说明） | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台（具体配置未说明），单核RNA测序技术 |
| 312 | 2026-01-28 |
Inhibition of CDC25C attenuates IL-17A-driven keratinocyte hyperproliferation and psoriasis progression
2026-Jan-22, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153342
PMID:41587503
|
研究论文 | 本文发现抑制CDC25C可减轻IL-17A驱动的角质形成细胞过度增殖，从而缓解银屑病进展 | 首次将CDC25C鉴定为IL-17驱动的角质形成细胞过度增殖的关键介质，并验证其作为非经典IL-17信号通路中潜在治疗靶点的价值 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证CDC25C抑制剂的疗效和安全性 | 探索CDC25C在IL-17A驱动的角质形成细胞过度增殖中的作用及其作为银屑病治疗新靶点的潜力 | 银屑病患者皮肤样本、角质形成细胞、IMQ诱导的银屑病样小鼠模型 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 银屑病患者单细胞RNA-seq数据集、体外培养的角质形成细胞、IMQ诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 313 | 2026-01-28 |
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2026-Jan-21, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0424
PMID:41563441
|
研究论文 | 本研究优化了胰腺胰岛单细胞长读长测序方案，以改善读长和转录本检测，从而增强异构体识别能力 | 通过比较5'和3'文库制备方案，发现5'方案在转录本识别上更优，并展示了靶向去除胰岛素转录本策略可提升信息性读段的检测，实现了异构体特异性基因表达分析 | 长读长测序技术仍面临读长不足和错误率较高的技术挑战，且高表达单一转录本的细胞类型可能掩盖低丰度转录本的识别 | 优化单细胞长读长测序协议，以提升胰腺胰岛中异构体检测的准确性和效率 | 胰腺胰岛中的各种细胞类型，特别是胰岛内分泌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞长读长RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 314 | 2026-01-28 |
Single nuclei and spatial profiling of sacrococcygeal teratomas reveals cellular composition and X inactivation heterogeneity
2026-Jan-21, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01262-4
PMID:41565739
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学技术，揭示了骶尾部畸胎瘤的细胞组成和X染色体失活异质性 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学分析骶尾部畸胎瘤，发现X染色体双等位基因激活与细胞身份及性别偏见的关联 | 样本量较小（仅8例肿瘤），且未检测到假定的多能性细胞群 | 探究骶尾部畸胎瘤的细胞起源、临床分层和性别偏见机制 | 骶尾部畸胎瘤（SCTs） | 数字病理学 | 畸胎瘤 | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | RNA序列数据, 空间转录组数据 | 8例骶尾部畸胎瘤（6例产后，2例产前） | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 315 | 2026-01-28 |
SpaceBF: Spatial coexpression analysis using Bayesian Fused approaches in spatial omics datasets
2026-Jan-20, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag006
PMID:41556565
|
研究论文 | 本文介绍了SpaceBF，一种用于空间组学数据中分子对空间共表达分析的贝叶斯融合建模框架 | 提出了一种新的贝叶斯融合方法，通过融合马蹄先验在预定义空间邻接图的边上实现空间平滑性，允许大的边缘特异性差异逃脱收缩，同时保持整体结构 | NA | 开发一种稳健的方法来识别空间组学数据中分子对的空间变化共表达 | 空间转录组学和质谱成像数据中的基因、肽、脂质或N-聚糖 | 空间组学 | 癌症 | 空间转录组学，质谱成像 | 贝叶斯融合模型 | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学，质谱成像 | NA | NA |
| 316 | 2026-01-28 |
Hepatic Arterial Flow-Induced Portal Tract Fibrosis in Portal Hypertension: The Role of VCAM-1 and Osteopontin-Expressing Macrophages
2026-Jan-19, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101728
PMID:41565157
|
研究论文 | 本研究探讨了门脉高压中肝动脉血流增加通过VCAM-1和骨桥蛋白阳性巨噬细胞驱动门管区纤维化的分子机制 | 揭示了肝动脉缓冲反应（HABR）通过VCAM-1介导的骨桥蛋白阳性巨噬细胞募集和活化，驱动门管区纤维化的新机制 | 研究主要基于大鼠模型，人类相关性需进一步验证；VCAM-1和Spp1的具体信号通路细节有待深入阐明 | 阐明门脉高压状态下肝动脉血流增加诱导门管区纤维化的分子机制 | Sprague-Dawley大鼠（部分门静脉结扎模型）、巨噬细胞、门脉成纤维细胞 | 病理生理学 | 门脉高压 | 单细胞RNA测序、RNA-FISH、微CT、免疫细胞分析、转录组分析 | 动物模型（大鼠PPVL模型）、细胞共培养模型 | 影像数据、转录组数据、免疫组化数据 | Sprague-Dawley大鼠模型，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 317 | 2026-01-28 |
The Role of Cancer-Associated Fibroblasts and Tumor-Associated Macrophages in the Tumor Microenvironment and Their Impact on Ovarian Cancer Survival and Therapy
2026-Jan-19, Current oncology (Toronto, Ont.)
DOI:10.3390/curroncol33010059
PMID:41590379
|
综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞和肿瘤相关巨噬细胞在卵巢癌肿瘤微环境中的作用及其对生存和治疗的影响 | 整合了单细胞测序和空间转录组学等先进技术来精确识别CAF和TAM亚型，并探讨了针对这些细胞的新型靶向治疗策略 | NA | 探讨CAFs和TAMs在卵巢癌肿瘤微环境中的作用及其对治疗抵抗和预后的影响 | 卵巢癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序，空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 318 | 2026-01-28 |
A single-nucleus RNA sequencing reveals the differential fate mechanism underlying flavonoid biosynthesis of middle and inner tepals in Chimonanthus praecox
2026-Jan-17, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150307
PMID:41554353
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序揭示了蜡梅中内层和中层花被片中类黄酮生物合成的差异命运机制 | 首次构建了蜡梅花被片的单细胞转录组图谱，揭示了表皮细胞和海绵叶肉细胞的发育轨迹及花青素合成基因的早期高表达 | 研究仅基于单核RNA测序数据，缺乏蛋白质组或代谢组学的验证，且样本量相对有限 | 探究蜡梅花被片颜色形成的分子机制，特别是类黄酮代谢物在特定细胞中积累的调控网络 | 蜡梅（Chimonanthus praecox）的内层和中层花被片细胞 | 植物生物学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 单细胞转录组数据 | 从内层和中层花被片分别分离了13,073和12,625个单细胞核，共分为14个细胞簇和5种细胞类型 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 319 | 2026-01-28 |
Protocol for dual spatial transcriptomic profiling of infected tissues
2026-Jan-13, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104282
PMID:41538322
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于感染组织的双重空间转录组分析协议，旨在同时分析宿主和病原体的转录模式 | 开发了一种双重空间转录组分析协议，能够同时分析宿主和病原体的转录模式，以建立病原适应特征并预测感染结果 | NA | 建立一种用于感染组织的双重空间转录组分析协议，以研究宿主-病原体相互作用 | 感染组织 | 空间转录组学 | 感染性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 320 | 2026-01-28 |
Itaconate Promotes Cold Adaptation and Myocardial Protection by Enhancing Brown Adipose Tissue Metabolism
2026-Jan-12, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16010066
PMID:41590674
|
研究论文 | 本研究揭示了免疫代谢物衣康酸在棕色脂肪组织中的表达模式及其通过增强棕色脂肪代谢功能促进冷适应和心肌保护的作用 | 首次阐明了衣康酸合成关键基因Irg1在棕色脂肪组织不同发育阶段的细胞特异性表达，并证明了外源性衣康酸通过依赖棕色脂肪组织的机制增强产热和改善心脏损伤 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；衣康酸的具体作用机制和信号通路仍需进一步探索 | 揭示衣康酸在棕色脂肪组织中的表达模式及其对冷适应和心肌保护的影响 | 小鼠棕色脂肪组织、心肌组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、气相色谱-三重四极杆质谱 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢物数据 | P7新生小鼠和成年小鼠的棕色脂肪组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |