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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3141 | 2026-06-13 |
Influence of body composition on the efficacy of nivolumab plus ipilimumab for metastatic clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014363
PMID:41775432
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研究论文 | 研究身体成分对一线纳武利尤单抗+伊匹木单抗治疗转移性透明细胞肾细胞癌疗效的影响 | 首次通过AI分割工具测量CT图像中L3椎体水平的身体成分,并评估骨骼肌质量指数和皮下脂肪组织指数与免疫检查点抑制剂疗效的关联,同时利用单细胞RNA测序探索潜在的免疫机制 | 回顾性研究设计、单中心数据、未纳入健康相关生活质量及治疗中断原因,且BMI和内脏脂肪等指标的关联不明确 | 探究身体成分(骨骼肌质量、皮下脂肪等)对转移性透明细胞肾细胞癌患者接受一线纳武利尤单抗+伊匹木单抗治疗结果的影响 | 309例转移性透明细胞肾细胞癌患者(80.3%男性,中位年龄61.9岁) | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 多变量Cox回归模型 | 医学图像(CT扫描)、基因表达数据 | 309例患者(全队列)及12例初治患者(单细胞队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3142 | 2026-06-13 |
Transcriptional factor ZMYM3 promotes hepatocellular carcinoma metastasis by upregulating CTTN and inducing invadopodia formation
2026-Mar-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08506-6
PMID:41775697
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子ZMYM3通过上调CTTN并诱导侵袭性伪足形成来促进肝细胞癌转移的分子机制 | 首次发现ZMYM3在肝细胞癌中高表达并通过直接结合CTTN启动子促进侵袭性伪足形成和上皮间质转化,揭示了其在肝癌转移中的新机制 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库及体外实验,缺乏体内动物模型验证和更广泛的临床样本验证 | 探究ZMYM3在肝细胞癌侵袭和转移中的分子机制及其作为预后标志物的潜力 | 肝细胞癌组织和细胞系,包括门静脉癌栓和原发灶样本 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 染色质免疫沉淀测序, 单细胞测序, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 组织样本数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌患者数据,具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3143 | 2026-06-13 |
Clinical and immunological implications of lymphocyte-activation gene 3 expression in metastatic colorectal cancer
2026-Mar-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04344-9
PMID:41774207
|
研究论文 | 探讨LAG3在转移性结直肠癌中的表达及其对预后和免疫微环境的影响 | 首次在转移性结直肠癌中系统揭示LAG3表达与血管生成、上皮间质转化及TGF-β信号通路的关联,并发现LAG3⁺CD8⁺ T细胞特有的Galectin-9-TIM-3信号可能限制LAG3阻断疗法的疗效 | 样本量较小且为回顾性研究,可能无法完全代表异质性人群;缺乏功能性验证实验直接证明LAG3表达与免疫抑制机制之间的因果关系 | 评估LAG3表达对转移性结直肠癌的预后价值及其在肿瘤免疫微环境中的生物学作用 | 144例转移性结直肠癌患者的原发和/或转移肿瘤组织,以及TCGA COADREAD队列和23例韩国结直肠癌样本的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组化、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 图像、转录组数据、单细胞测序数据 | 144例转移性结直肠癌患者,23例韩国结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3144 | 2026-06-13 |
Integrated scRNA-seq and bulk transcriptomics identify an amino acid metabolism-associated prognostic signature and highlight FUS as a potential driver in prostate cancer progression
2026-Mar-02, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01824-0
PMID:41766003
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据,开发了一个与氨基酸代谢相关的预后特征,并突出FUS作为前列腺癌进展的潜在驱动因素 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据,结合机器学习,建立了一个9基因氨基酸代谢风险特征和列线图,用于前列腺癌风险分层,并识别出FUS作为潜在致癌调控因子 | 研究主要依赖公共数据集和体外/体内模型验证,FUS的确切致癌机制仍需进一步阐明 | 探究氨基酸代谢在前列腺癌中的预后意义及其潜在分子机制,建立临床可用的风险分层工具 | 前列腺癌细胞、小鼠模型及人类样本 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 机器学习 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | TCGA和GEO队列(具体样本量未在摘要中明确) | 不适用 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 不适用 | 不适用 |
| 3145 | 2026-06-13 |
IFN signaling at the nexus of the radiotherapy response in malignant peripheral nerve sheath tumors
2026-Mar-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI202266
PMID:41766655
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评论 | 研究揭示干扰素信号在恶性周围神经鞘瘤放疗反应中的核心协调作用,并提出联合靶向免疫调节以改善放疗效果 | 首次整合功能基因组学、单细胞转录组学及人类肿瘤分析,证明I型干扰素信号同时调控肿瘤内在放射敏感性与T细胞局部募集激活 | 尚未明确该结论是否广泛适用于其他软组织肉瘤类型(需进一步验证) | 阐明干扰素信号如何协调恶性周围神经鞘瘤对放疗的响应 | 恶性周围神经鞘瘤(包括NF-1相关患者)及相关免疫细胞 | 数字病理学 | 恶性周围神经鞘瘤 | 单细胞转录组测序、功能基因组学 | NA | 单细胞转录组数据、人类肿瘤样本数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3146 | 2026-06-13 |
Macrophage-rich niches regulate T cell dynamics at the liver invasive margin during gallbladder cancer progression
2026-Mar-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI193672
PMID:41766656
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了胆囊癌肝转移过程中巨噬细胞丰富的免疫细胞龛如何调节T细胞动态 | 首次在胆囊癌肝侵润边界中鉴定出两种CXCL9+巨噬细胞亚型(CT和CC龛),并阐明了它们在T细胞招募和耗竭中的不同作用机制 | 未提及明确局限性,但可能包括样本量有限或需要更多验证实验 | 探究胆囊癌肝侵润过程中肿瘤-肝脏界面微环境的细胞和病理作用 | 胆囊癌患者的肿瘤-肝脏交界组织样本 | 计算生物学, 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 未明确说明样本数量,提及了队列研究 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 3147 | 2026-06-13 |
Single-cell transcriptomics reveal heat shock protein dysregulation in severe SARS-CoV-2-associated pediatric encephalopathy
2026-Mar-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-41827-2
PMID:41772029
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示严重SARS-CoV-2相关儿童脑病中热休克蛋白的失调 | 首次在单细胞水平上发现热休克蛋白HSPA1A和HSPB1在严重SARS-CoV-2相关急性脑病中特异性上调,并验证其作为潜在生物标志物 | 样本量较小,仅包含一名严重患者和两名轻度患者,且未进行功能验证 | 探究SARS-CoV-2相关严重儿童脑病的致病机制 | 外周血单核细胞(PBMCs) | 单细胞转录组学 | SARS-CoV-2相关儿童脑病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 1例严重患者、2例轻度患者、1例非SARS-CoV-2发热惊厥患者及公开数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 3148 | 2026-06-13 |
ANKRD1 sustains a neurogenic BMSC niche and counters cognitive aging
2026-Mar-01, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-026-00428-5
PMID:41764190
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示了ANKRD1在维持神经源性骨髓间充质干细胞龛及对抗认知衰老中的关键作用 | 首次发现ANKRD1作为维持神经源性龛的关键调控因子,并通过结合超级增强子维持染色质开放性,且通过神经元靶向递送可挽救衰老小鼠的空间记忆缺陷 | 未提及 | 阐明颅颌面骨髓间充质干细胞中神经源性潜能维持的机制及其对认知衰老的影响 | 颅颌面骨髓间充质干细胞(BMSCs)及其神经源干细胞龛 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 未提及具体样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 3149 | 2026-06-13 |
Integrating feature selection with unsupervised deep embedding for clustering single-cell RNA-seq data
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag082
PMID:41766647
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研究论文 | 提出一个统一框架FSSC,将特征选择与无监督深度嵌入整合,用于单细胞RNA-seq数据的聚类 | 首次在单细胞RNA-seq聚类中联合优化特征选择与聚类损失,利用零膨胀负二项自编码器和组Lasso惩罚同步学习低维表示并选择判别性基因集 | 未提及计算复杂度或对大规模数据集的扩展性,可能依赖于模拟与真实数据集的验证范围 | 解决单细胞RNA-seq数据聚类中特征选择与聚类分离导致的次优问题,实现联合优化以提高聚类准确性和基因选择生物学意义 | 单细胞RNA-seq数据中的基因表达特征和细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 零膨胀负二项自编码器 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3150 | 2026-06-13 |
Exploring the phthalates-induced neurotoxicity mechanisms of neurodegenerative diseases via network toxicology, single-cell transcriptomics and molecular dynamic simulation
2026-Mar-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119954
PMID:41780475
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研究论文 | 通过网络毒理学、单细胞转录组学和分子动力学模拟,探索邻苯二甲酸酯引起神经退行性疾病的神经毒性机制 | 首次结合网络毒理学、单细胞转录组学和分子动力学模拟,系统揭示邻苯二甲酸酯通过BCL2和星形胶质细胞表型转换诱发神经退行性疾病的机制 | 邻苯二甲酸酯与神经退行性疾病关联的临床样本数据有限,且主要基于帕金森病患者组织样本 | 探索邻苯二甲酸酯暴露与神经退行性疾病之间的潜在机制 | 邻苯二甲酸酯(特别是DEHP和DiBP)及其对血脑屏障、星形胶质细胞和神经退行性疾病的影响 | 机器学习 | 帕金森病、路易体病、阿尔茨海默病 | 网络毒理学、单细胞转录组学、分子动力学模拟、分子对接 | 诊断模型 | 单细胞转录组数据 | 帕金森病患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3151 | 2026-06-13 |
Developing a Metabolic-Associated Prognostic Index for Risk Stratification and Therapeutic Guidance in Stage I Lung Adenocarcinoma via Multiomics Analysis
2026-Mar, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO-25-00897
PMID:41771017
|
研究论文 | 通过多组学分析开发代谢相关预后指数,用于I期肺腺癌的风险分层和治疗指导 | 首次系统性地将代谢重编程与I期肺腺癌的预后关联,利用机器学习组合方法开发了代谢相关预后指数(MAPI),并在单细胞水平验证了其与恶性进展的关联 | 研究主要依赖公开数据库中的回顾性数据,且MAPI的临床应用尚需前瞻性队列验证 | 开发一个生物学可解释且临床适用的代谢相关预后指数,用于I期肺腺癌的风险分层和精准治疗决策 | I期肺腺癌肿瘤样本及临床数据 | 机器学习, 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 差异表达分析 | 机器学习组合模型 | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA、GEO和EGA数据库的I期肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3152 | 2026-06-13 |
GeneExt: a gene model extension tool for enhanced single-cell RNA-seq analysis
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag094
PMID:41769841
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研究论文 | GeneExt是一个利用单细胞RNA测序数据改进基因注释的工具,用于增强非模式物种的基因表达定量分析 | 首次提出利用单细胞RNA-seq数据来精修非模式物种的基因注释,特别是解决3'端注释不准确导致的定量问题 | 仅适用于3'端捕获的scRNA-seq方法,且主要针对非模式物种,在模式物种中的效果可能有限 | 改进非模式物种的基因注释,提升单细胞基因表达定量准确性 | 8个非模式生物的单细胞图谱数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8个单细胞图谱数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3153 | 2026-06-13 |
STING activation induces polarized cytokine secretion of IFN-β and IL-17A promoting photoreceptor death and choroidal disruption in age-related macular degeneration
2026-Feb-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08491-w
PMID:41760600
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研究论文 | 揭示STING通路在年龄相关性黄斑变性中通过极化细胞因子分泌(IFN-β和IL-17A)促进感光细胞死亡和脉络膜破坏的机制 | 首次发现STING通路在AMD中具有双相、阶段依赖的功能(健康组织中起保护作用,早期AMD中驱动致病性炎症),并证明了通过空间组织化的炎症同时调控AMD多种病理过程的机制 | NA | 阐明STING通路在年龄相关性黄斑变性免疫介导的视网膜退化中的作用机制 | 人眼组织、患者来源的iPSC-RPE细胞、人视网膜类器官、Cryba1条件敲除小鼠模型、Il17a敲入小鼠模型、AAV2介导的IFN-β过表达模型、Cryba1/Sting双杂合小鼠 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 免疫组织化学分析、单细胞转录组学、AAV2介导的基因过表达 | NA | 图像 | 人眼组织样本(数量未明确)、患者来源iPSC-RPE细胞系、小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3154 | 2026-06-13 |
Canonical human blood dendritic cells are distinguished by robust E-selectin binding
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf307
PMID:41764722
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研究论文 | 人类血液树突状细胞通过E-选择素结合的特征被区分 | 揭示了所有人类血液树突状细胞亚群均具有强E-选择素结合能力的统一特征,重新定义了该类免疫细胞的组织招募分子基础 | 单细胞RNA测序无法提供树突状细胞sLeX表达的关键化学酶效应物信息 | 探究人类血液树突状细胞与E-选择素结合的能力及其分子机制 | 人类血液树突状细胞 | 免疫学 | NA | 多参数流式细胞术, 生化分析, 转录本测量, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3155 | 2026-06-13 |
TWEAK is increased in ulcerative colitis and contributes to fibroblast-mediated monocyte activation via heterologous non-canonical NF-kB/STAT3 signaling
2026-Feb-05, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjag012
PMID:41765035
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研究论文 | 研究揭示TWEAK在溃疡性结肠炎中升高,并通过非经典NF-κB/STAT3信号通路促进成纤维细胞介导的单核细胞活化 | 首次发现TWEAK处理的炎症成纤维细胞诱导的转录程序模拟UC早期单核/巨噬细胞中间体,并鉴定NIK激酶在成纤维细胞-单核细胞通讯中的关键作用 | 未详细说明体内验证实验和临床转化的具体障碍 | 阐明溃疡性结肠炎中成纤维细胞与单核细胞相互作用的机制及其失调机制 | TWEAK处理的结肠成纤维细胞、UC患者和健康供体的组织样本、单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 共培养模型、单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、组织样本 | UC患者和健康供体的结肠活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 公共单细胞转录组数据 |
| 3156 | 2026-06-13 |
7-Ketocholesterol promotes T cell migration through Ca2+-NFATc1 pathway-mediated F-actin polymerization and proinflammatory cytokine production in oral lichen planus
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1682589
PMID:41766904
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研究论文 | 本研究通过代谢组学和单细胞RNA测序发现,7-酮胆固醇通过Ca2+-NFATc1通路促进口腔扁平苔藓中T细胞的F-肌动蛋白聚合和促炎细胞因子产生,从而增强T细胞迁移 | 首次揭示7-酮胆固醇在口腔扁平苔藓T细胞迁移中的促进作用及其通过Ca2+-NFATc1通路的分子机制 | 研究主要基于体外实验和临床样本分析,缺乏体内动物模型验证 | 阐明氧化固醇(特别是7-酮胆固醇)在口腔扁平苔藓发病机制中的作用 | 口腔扁平苔藓患者血浆中的氧化固醇、组织驻留T细胞以及外周T细胞 | 生物信息学, 分子生物学 | 口腔扁平苔藓 | 代谢组学, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, qRT-PCR, Transwell迁移实验 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | 口腔扁平苔藓患者血浆和组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3157 | 2026-06-13 |
Decoding the role of RPL38 in lung adenocarcinoma: a multi-omics approach
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1778481
PMID:41766901
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研究论文 | 通过多组学方法解码RPL38在肺腺癌中的作用 | 首次结合多组学分析(包括泛癌队列和空间转录组学)系统揭示RPL38在肺腺癌中的肿瘤促进功能及免疫抑制微环境关联 | 未提及具体局限性 | 阐明RPL38在肺腺癌发展中的功能和临床意义 | 肺腺癌细胞系及皮下异种移植模型 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq、空间转录组学 | NA | 转录组数据(TCGA数据库)、空间转录组数据 | TCGA-LUAD队列(样本数量未明确) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3158 | 2026-06-13 |
Increased secreted PLA2 in epithelial cells promotes the progression of chronic non-atrophic gastritis to chronic atrophic gastritis through the TGF-β signaling
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343531
PMID:41779702
|
研究论文 | 研究上皮细胞中分泌型磷脂酶A2通过TGF-β信号促进慢性非萎缩性胃炎向慢性萎缩性胃炎进展的机制 | 首次发现PLA2G10在慢性胃炎进展中的关键作用,并揭示其通过TGF-β信号通路调控炎症反应 | 未提及明确局限性 | 探究PLA2G10是否通过TGF-β信号促进CNAG向CAG的进展 | 人胃黏膜上皮细胞(GES-1)和SD大鼠 | 数字病理学 | 胃炎 | RNA微阵列, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 图像 | SD大鼠(CNAG模型)和GES-1细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 3159 | 2026-06-13 |
Integrating computational engines to identify TSPAN6 as a migrasome-associated target for immunotherapy sensitization
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1782717
PMID:41782878
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研究论文 | 整合计算引擎鉴定TSPAN6为迁移体相关免疫治疗增敏靶点 | 首次发现迁移体相关蛋白TSPAN6在免疫治疗耐药中的关键作用,并通过大规模多组学数据、空间转录组学和药物筛选验证其作为治疗靶点的潜力 | 未明确 | 鉴定调控癌症免疫治疗的迁移体相关靶点 | TSPAN6蛋白及其在免疫治疗中作用的机制 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、临床样本数据 | 来自17种肿瘤类型5957名患者,以及44名癌症患者的配对血清样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3160 | 2026-06-13 |
Single-cell sequencing reveals reversible glial remodeling in the visual cortex during visual deprivation and recovery
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1730619
PMID:41789061
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术揭示视觉剥夺与恢复过程中视觉皮层胶质细胞的可逆重塑动态变化 | 首次在单细胞水平上系统描绘了视觉剥夺与恢复过程中非神经元细胞(尤其是小胶质细胞和少突胶质细胞)的转录组动态变化,并揭示小胶质细胞-少突胶质细胞轴在皮层可塑性中的关键作用 | 基于豚鼠模型,结果向人类转化的普适性尚需验证;仅观察了短期恢复(1周),长期恢复效应未涉及 | 阐明视觉剥夺(形觉剥夺性近视)及恢复过程中视觉皮层非神经元细胞的动态变化及其功能角色 | 豚鼠初级视觉皮层中的非神经元细胞(小胶质细胞和少突胶质细胞) | 数字病理学 | 近视 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3组豚鼠:正常对照组、形觉剥夺组(单眼剥夺5周)、恢复组(剥夺4周+恢复1周) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |