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当前共找到 35765 篇文献，本页显示第 3141 - 3160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3141 | 2025-12-11 |
MLKL deficiency alleviates neuroinflammation and motor deficits in the α-synuclein transgenic mouse model of Parkinson's disease
2023-12-01, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-023-00686-5
PMID:38041169
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研究论文 | 本研究探讨了MLKL蛋白在帕金森病中的神经保护作用，通过基因敲除小鼠模型和单细胞RNA-seq分析，发现MLKL缺乏能减轻神经炎症和运动缺陷 | 首次在α-synuclein转基因小鼠模型中揭示MLKL缺乏对帕金森病神经炎症和运动症状的改善作用，并结合单细胞RNA-seq技术提供了细胞类型特异的转录组证据 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类患者中进行验证，且长期效应和具体分子机制需进一步探索 | 探究MLKL蛋白在帕金森病中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠模型（Tg-Mlkl）、原代神经元细胞、人iPSC来源的中脑类器官 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞RNA-seq | 转基因小鼠模型、基因敲除模型 | 基因表达数据、行为数据 | 未明确指定样本数量，但涉及转基因小鼠、原代细胞和类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3142 | 2025-12-11 |
TALKIEN: crossTALK IntEraction Network. A web-based tool for deciphering molecular communication through ligand-receptor interactions
2023-10-30, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d3mo00049d
PMID:37403821
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研究论文 | 介绍了一个名为TALKIEN的在线R/Shiny应用，用于通过构建和分析蛋白质-蛋白质相互作用网络可视化分子对话信息 | 开发了一个简单直观的在线工具，整合了配体-受体相互作用网络构建、系统生物学分析和下游通路展示，支持药物靶点信息 | NA | 旨在帮助研究人员解释分子通信，特别是通过配体-受体相互作用来预测细胞间通信 | 基因或蛋白质列表，代表细胞谱系 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序，空间转录组学 | NA | 基因或蛋白质列表 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3143 | 2025-12-11 |
A novel mutation in intron 1 of Wnt1 causes developmental loss of dopaminergic neurons in midbrain and ASD-like behaviors in rats
2023-09, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02223-8
PMID:37658228
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研究论文 | 本研究通过大规模筛选自闭症谱系障碍（ASD）风险/致病基因，发现Wnt1内含子1中的一种新型突变，该突变导致WNT1表达降低，并在人源化大鼠模型中引发ASD样行为和中脑多巴胺能神经元发育性缺失 | 首次报道中脑多巴胺能神经元的发育性缺失是ASD的发病机制，并揭示异常祖细胞模式是这种发育性多巴胺能神经元缺失的细胞基础 | 研究基于大鼠模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 探索ASD的潜在致病机制，特别是遗传突变对神经发育的影响 | 人源化大鼠模型，重点关注中脑多巴胺能神经元 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因序列数据，行为数据 | 未明确指定样本数量，但涉及大规模基因筛查和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3144 | 2025-12-10 |
Integrated multi-omics analyses identified the H3K18la-based spatiotemporal characteristics and risk-stratified treatment strategy in lung adenocarcinoma
2026-Jan-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218158
PMID:41274397
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，探索了肺腺癌的代谢异质性，特别是糖酵解和组蛋白H3K18乳酸化（H3K18la），并开发了一个基于机器学习的预后模型来预测患者生存和免疫治疗反应 | 首次整合空间转录组学、单细胞RNA测序、H3K18la ChIP-seq、CRISPR数据和批量转录组学，揭示了H3K18la相关基因活动作为肺腺癌进展的标志物，并开发了在线应用工具和风险分层治疗策略 | NA | 探索肺腺癌的代谢异质性和免疫逃逸机制，开发预后模型和治疗策略 | 肺腺癌（LUAD） | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, H3K18la ChIP-seq, CRISPR, 批量转录组学 | 机器学习 | 多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3145 | 2025-12-10 |
Seeding density-dependent fate divergence of muscle stem cells revealed by single-cell RNA sequencing for cultured pork production
2026-Jan-15, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.117879
PMID:41360565
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了不同接种密度下肌肉干细胞在培养过程中的命运分化，以优化培养肉生产 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了接种密度对肌肉干细胞命运分化的影响，并识别了驱动非肌源性转化的基因和通路 | 研究仅关注了第5代细胞，未探讨长期培养或其他代次的影响，且机制研究尚需进一步实验验证 | 优化培养肉生产中肌肉干细胞的培养效率，探究细胞命运分化的机制 | 通过FACS分离的CD56/CD29阳性肌肉干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个接种密度组（低密度1.9×10^4细胞/cm²和高密度1.5×10^5细胞/cm²）的第5代肌肉干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3146 | 2025-12-10 |
MyD88 Deficiency Protects Mice From Experimental Autoimmune Encephalomyelitis by Influencing Both Dendritic Cells and T Cells
2025-Dec-09, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70079
PMID:41363121
|
研究论文 | 本研究探讨了MyD88信号通路在实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）发病机制中的作用，特别是其对树突状细胞和T细胞功能及相互作用的影响 | 通过重新分析多发性硬化症（MS）患者的单细胞RNA测序数据，揭示了MyD88在DC和CD4 T细胞中的显著上调，并首次在EAE模型中系统阐明了MyD88缺陷如何通过影响DC成熟和促炎细胞因子产生来损害Th1/Th17细胞分化和T细胞激活 | 研究主要基于小鼠EAE模型，其结果向人类MS疾病的直接转化仍需进一步验证；机制研究尚未完全阐明MyD88下游的具体信号通路 | 阐明MyD88信号在实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）发病机制中，特别是在树突状细胞与T细胞相互作用方面的具体作用 | 多发性硬化症（MS）患者外周血单个核细胞、实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3147 | 2025-12-10 |
Expanded but dysfunctional regulatory T cells in treatment-naïve autoimmune hepatitis
2025-Dec-09, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-025-10986-1
PMID:41364306
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫组化等方法，评估了自身免疫性肝炎（AIH）患者中调节性T细胞（Tregs）的表型、功能和分布，发现尽管Tregs在肝脏组织中扩增，但其抑制功能受损，表明功能不稳定是AIH免疫失调的关键因素 | 首次结合单细胞RNA测序和功能实验，揭示了AIH患者Tregs在扩增的同时存在功能缺陷，特别是IL-7R上调提示的功能不稳定性 | 单细胞RNA测序样本量较小（每组仅一人），且未详细探讨Tregs功能受损的具体分子机制 | 评估AIH患者中Tregs的表型、功能和分布，并探讨其与免疫失调的潜在关联 | 57例经活检确诊的AIH患者的外周血和肝脏样本 | 免疫学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化、共培养实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、免疫组化图像 | 57例AIH患者（外周血单核细胞45例，肝脏组织37例，免疫组化33例，共培养实验25例） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3148 | 2025-12-10 |
IL-1β+ lung-resident macrophages mediate endothelial dysfunction and acute lung injury in sepsis through immune-metabolic crosstalk
2025-Dec-08, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02868-0
PMID:41360768
|
研究论文 | 本研究通过小鼠脓毒症模型，揭示了表达IL-1β的肺驻留巨噬细胞亚群通过免疫代谢交互作用介导内皮功能障碍和急性肺损伤的机制 | 首次鉴定出IL-1β⁺肺驻留巨噬细胞亚群在脓毒症急性肺损伤中的关键作用，并揭示了其通过免疫代谢轴协调内皮功能障碍的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；具体代谢通路和临床转化潜力需进一步探索 | 探究脓毒症诱导的急性肺损伤中免疫细胞与肺内皮相互作用的分子调控机制 | 小鼠脓毒症模型中的肺驻留巨噬细胞和肺内皮细胞 | 数字病理学 | 脓毒症相关急性肺损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫测定、Western印迹、代谢组学、体外共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质数据、代谢组数据、组织病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3149 | 2025-12-10 |
Multi-omics reveals that genes linked to succinylation regulate the onset of epilepsy through metabolic reprogramming
2025-Dec-08, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10180-6
PMID:41361022
|
研究论文 | 本研究结合孟德尔随机化和单细胞转录组技术，揭示了琥珀酰化相关基因CTBP1通过代谢重编程和神经元异质性调控促进癫痫发生的新机制 | 首次整合多组学证据，将琥珀酰化修饰基因CTBP1、血浆代谢物失调与癫痫风险联系起来，并利用单细胞转录组学在细胞类型特异性层面解析了其调控网络 | 研究主要基于观察性数据和遗传工具变量分析，因果关系的确立仍需后续实验验证；单细胞数据仅来源于颞叶，可能无法完全代表其他脑区 | 探究琥珀酰化修饰相关基因、血浆代谢物与癫痫之间的因果关系及潜在代谢介导通路 | 癫痫患者（具体样本数未明确提及）的遗传数据、血浆代谢物数据及颞叶单细胞转录组数据 | 生物信息学，多组学整合分析 | 癫痫 | 孟德尔随机化分析，单细胞RNA测序 | NA | 遗传数据（eQTL），血浆代谢物数据，单细胞转录组数据 | NA（使用了公开数据库eQTLGen和血浆代谢物数据库，以及癫痫患者颞叶单细胞数据，但具体样本数未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3150 | 2025-12-10 |
CXCL12 deficiency promotes colorectal cancer progression and reduces anti-PD-L1 immunotherapy efficacy through MDSC regulation
2025-Dec-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07309-1
PMID:41351014
|
研究论文 | 本研究探讨了CXCL12缺乏如何通过调控髓源性抑制细胞（MDSC）促进结直肠癌进展并降低抗PD-L1免疫疗法的疗效 | 首次将CXCL12缺乏与MDSC调控及抗PD-L1耐药性联系起来，并识别了CPEB3、DDX39B和SIDT2作为结直肠癌的新型生物标志物 | 研究机制仍需进一步深入探索，且临床转化策略有待优化 | 阐明CXCL12缺乏在结直肠癌进展及抗PD-L1免疫疗法耐药性中的作用机制 | 结直肠癌细胞、动物模型以及单细胞转录组数据 | 生物信息学与肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序、体外细胞实验、体内动物实验 | 机器学习方法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3151 | 2025-12-10 |
KRAS Withdrawal in Cholangiocarcinoma Leads to Immune Infiltration and Tumor Regression
2025-Dec-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511312
PMID:41332325
|
研究论文 | 本文通过构建条件性TRE.Kras/Trp53敲除小鼠模型，研究了KRAS抑制在胆管癌中的作用，发现KRAS撤除导致肿瘤显著消退并伴随免疫细胞浸润 | 首次利用条件性动物模型证明KRAS抑制能诱导胆管癌肿瘤消退，并揭示其通过激活CD8 T细胞和促炎因子如IL-15和CCL17介导的免疫机制 | 研究基于小鼠模型，结果在人类胆管癌中的直接适用性尚需进一步验证，且未详细探讨长期治疗效应或耐药性 | 探究KRAS抑制在胆管癌治疗中的潜力及其免疫调节机制 | 胆管癌小鼠模型和细胞系 | 癌症研究 | 胆管癌 | CRISPR-Cas9、单细胞RNA-Seq、bulk RNA-Seq、细胞因子阵列、免疫组织化学、共免疫荧光染色 | 条件性敲除小鼠模型 | 基因表达数据、免疫染色图像 | 未明确指定样本数量，但涉及小鼠模型和细胞系实验 | NA | 单细胞RNA-Seq, bulk RNA-Seq | NA | NA |
| 3152 | 2025-12-10 |
Single cell and spatial transcriptomic profiling of the type 2 diabetic coronary microcirculation and myocardium
2025-Dec, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-025-01144-7
PMID:41203872
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，探究了2型糖尿病小鼠冠状动脉微循环和心肌的转录组差异，揭示了与脂肪生成、脂肪酸代谢和氧化磷酸化相关的基因上调 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，全面解析2型糖尿病中冠状动脉微血管疾病的转录组特征，并识别出关键调控基因如Angplt4、Ephx2、Hmgcs2、Acot2、Pdk4和Ech1 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本，且样本规模有限，可能无法完全反映人类疾病的复杂性 | 探究2型糖尿病中冠状动脉微血管疾病的转录组差异，识别新的治疗靶点通路 | 2型糖尿病小鼠的冠状动脉微循环和周围心肌组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3153 | 2025-12-10 |
distQTL: distribution quantitative trait loci identification by population-scale single-cell data
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf155
PMID:41323105
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研究论文 | 本文提出了一种名为distQTL的新方法，利用Fréchet回归和群体规模单细胞RNA测序数据来识别分布定量性状位点 | 该方法首次将Fréchet回归应用于单细胞eQTL分析，使用完整的经验分布作为响应对象，而非简单的汇总统计量如均值，从而能更精细地解析转录调控异质性 | NA | 研究遗传变异如何影响基因表达，特别是通过识别分布定量性状位点来揭示细胞类型特异性调控 | 来自982名供者的外周血单个核细胞的单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | Fréchet回归 | 单细胞RNA测序数据 | 982名供者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3154 | 2025-12-10 |
Long-read sequencing transcriptome quantification with lr-kallisto
2025-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013692
PMID:41325434
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研究论文 | 本文介绍了lr-kallisto，一种用于长读长测序数据的转录本定量方法，旨在解决转录异构体准确量化的问题 | 开发了lr-kallisto，将kallisto方法适配于长读长技术，并证明外显子捕获能提高定量准确性 | 未明确提及具体样本量或实验验证范围，可能受限于长读长数据特性和遗传变异复杂性 | 实现长读长测序数据中转录异构体的快速准确定量 | RNA转录本，特别是全长转录异构体 | 自然语言处理 | NA | ONT长读长测序，外显子捕获 | kallisto适配模型 | 长读长RNA测序数据 | NA | Oxford Nanopore Technologies | 长读长RNA测序 | ONT平台 | Oxford Nanopore长读长测序技术，结合外显子捕获 |
| 3155 | 2025-11-16 |
Spatial Transcriptomics and Proteomics of Mycosis Fungoides Biopsies from Skin of Color Patients Reveal Biomarkers and Potential Treatment Targets
2025-Nov-17, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.10.608
PMID:41237899
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3156 | 2025-12-10 |
Four Decades of Inquiry Into the Genetic Bases of Specific Reading Disability
2025-Nov-11, Journal of speech, language, and hearing research : JSLHR
DOI:10.1044/2025_JSLHR-25-00050
PMID:41091061
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研究论文 | 本研究通过系统梳理过去四十年与特定阅读障碍相关的候选基因，并分析其进化保守性、发育表达模式和功能网络，以探究阅读障碍的遗传基础 | 挑战了存在阅读特异性基因的观念，提出特定阅读障碍反映了在人类特有大脑结构中运作的古老进化神经机制被破坏，并识别了发育表达转换和功能网络 | 研究基于文献综述和生物信息学分析，缺乏直接的实验验证，且候选基因列表可能不完全 | 探究特定阅读障碍的遗传基础，填补对阅读能力遗传结构理解的知识空白 | 175个与特定阅读障碍及阅读相关过程相关的候选基因 | 自然语言处理 | 特定阅读障碍 | 文献综述、生物信息学分析、发育转录组分析、单细胞转录组分析、功能通路分析 | NA | 基因序列数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | NA | Allen Institute for Brain Science | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | Allen Brain Atlas | Allen Brain Atlas 发育和单细胞转录组数据集 |
| 3157 | 2025-12-10 |
GPC3-based circular RNA vaccine suppresses hepatocellular carcinoma progression by activating adaptive immune responses
2025-Nov-07, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001605
PMID:41201153
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研究论文 | 本研究开发了一种基于环状RNA（circRNA）的靶向GPC3的肝癌疫苗，并通过结合TLR4激动剂佐剂，在小鼠模型中验证了其抑制肿瘤进展、激活适应性免疫应答的疗效和机制 | 首次开发了靶向GPC3的circRNA癌症疫苗，克服了传统mRNA疫苗的不稳定性和递送效率问题，并通过结合TLR4佐剂增强了抗肿瘤免疫应答 | 研究主要基于小鼠模型，其疗效和安全性在人体中尚未验证；机制研究虽深入，但临床转化路径仍需探索 | 开发一种更稳定、高效的circRNA癌症疫苗，用于治疗肝细胞癌（HCC） | 肝细胞癌（HCC）及其肿瘤微环境（TME） | 免疫治疗，癌症疫苗 | 肝细胞癌 | 环状RNA疫苗设计，TLR4激动剂佐剂，多重免疫荧光，单细胞测序，空间转录组学，质谱流式细胞术 | NA | 测序数据，成像数据，流式细胞数据 | 小鼠模型（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 3158 | 2025-12-10 |
Atomistic TCR-ligand interactions instruct memory T-cell differentiation
2025-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.05.686789
PMID:41279151
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组测序、TCR-pMHC相互作用的生物物理测量和结构分析，揭示了T细胞受体（TCR）与配体之间的原子水平相互作用如何指导记忆T细胞的分化命运 | 首次在分子水平上系统地将TCR的机械转导特性（如力依赖性结合）与记忆T细胞亚群（TCM与TEM）的分化联系起来，并提出了“双极性”克隆型的概念 | 研究基于小鼠模型和单一的流感病毒表位（NP），其在人类其他病原体或癌症抗原中的普适性仍需验证 | 阐明初始CD8 T细胞在抗原刺激后分化为不同记忆T细胞亚群（中央记忆TCM与效应记忆TEM）的分子机制 | 242个小鼠CD8 TCRαβ克隆型，这些克隆特异性识别由H-2D呈递的流感A病毒（IAV）免疫显性表位NP | 免疫学 | 传染病（流感病毒感染） | 单细胞转录组测序、TCR测序、生物物理测量（力依赖性相互作用）、结构分析 | NA | 转录组数据、序列数据、生物物理测量数据、结构数据 | 242个小鼠CD8 TCRαβ克隆型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3159 | 2025-12-10 |
scFPC-DE: Robust Differential Expression Analysis Along Single Cell Trajectories via Functional Principal Component Analysis
2025-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.03.686374
PMID:41279951
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研究论文 | 本文提出了一种基于功能数据分析的单细胞轨迹差异表达分析方法scFPC-DE，用于识别沿伪时间轨迹的时间差异表达基因 | 通过功能主成分分析建模基因表达作为伪时间函数，有效捕捉共享的基因表达变异和伪时间结构，同时缓解零膨胀问题 | 未明确说明方法在复杂轨迹或多分支轨迹中的适用性，以及计算效率方面的潜在限制 | 开发一种稳健的单细胞轨迹差异表达分析方法，以更准确地识别时间差异表达基因 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达沿伪时间轨迹的变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 功能主成分分析 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3160 | 2025-12-10 |
Atacformer: A transformer-based foundation model for analysis and interpretation of ATAC-seq data
2025-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.03.685753
PMID:41279458
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研究论文 | 本文介绍了Atacformer，一种基于Transformer的基础模型，用于分析和解释ATAC-seq数据 | Atacformer是首个为scATAC-seq数据设计的基于Transformer的基础模型，能够生成单个顺式调控元件的嵌入表示，并支持跨模态对齐和RNA数据推算 | 模型在scATAC-seq数据上的迁移学习潜力尚未充分探索，且现有工具在处理大规模复杂数据集时存在限制 | 开发一个基础模型以解决scATAC-seq数据统一分析和下游任务（如聚类、细胞类型注释和参考映射）的挑战 | scATAC-seq实验数据，包括公共存储库中的近10,000个实验 | 机器学习 | NA | ATAC-seq, scATAC-seq, RNA-seq | Transformer | 基因组数据（原始片段文件、BED文件） | 近10,000个scATAC-seq实验 | NA | single-cell ATAC-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |