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当前共找到 37547 篇文献，本页显示第 3021 - 3040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3021 | 2026-01-07 |
Single-cell RNA sequencing elucidates potential mechanisms of endothelial cells in lung region-specific repair and remodeling in combined pulmonary fibrosis and emphysema
2026-Jan-06, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03460-x
PMID:41491179
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3022 | 2026-02-07 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data for discovery of senescent TAMs prognostic characteristics in neuroblastoma
2026-Jan-06, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15517-7
PMID:41491450
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，发现神经母细胞瘤中衰老肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的预后特征，并构建了一个7基因风险模型 | 首次在神经母细胞瘤中鉴定出具有混合M1/M2状态的衰老TAM亚群，揭示了EIF5作为TAM衰老的关键调控因子，并开发了基于衰老特征的预后模型 | 研究主要基于公共数据集分析，需要进一步实验验证衰老TAMs在神经母细胞瘤中的具体作用机制 | 探索神经母细胞瘤中衰老肿瘤相关巨噬细胞的预后特征及其在肿瘤进展中的作用 | 神经母细胞瘤样本中的肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | Cox/LASSO回归模型 | RNA测序数据 | 来自GEO（GSE147766）、TARGET-NBL和E-MTAB-8248等多个队列的神经母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3023 | 2026-02-07 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomics with explainable AI reveal lethal prognostic axis in prostate cancer
2026-Jan-06, NPJ digital medicine
IF:12.4Q1
DOI:10.1038/s41746-025-02297-4
PMID:41495164
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学、空间转录组学和可解释人工智能，揭示了前列腺癌中的致死性肿瘤轴并建立了一个可解释的预后模型 | 首次整合单细胞与空间转录组数据，结合可解释机器学习识别出与前列腺癌致死性相关的C4恶性上皮亚群及其驱动的预后轴 | 研究样本主要来自特定队列，需要在更广泛的人群中进行外部验证 | 定义前列腺癌的致死性肿瘤轴并建立可解释的预后分层框架 | 前列腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Lasso, PLS-Cox, SHAP | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 141,986个高质量单细胞，涵盖局限性、激素敏感性和去势抵抗性前列腺癌 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3024 | 2026-02-07 |
Single-cell profiling defines the cellular landscape of the urinary bladder: a scoping review
2026-Jan-05, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03750-6
PMID:41491261
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综述 | 本文通过范围综述，总结了单细胞RNA测序技术在健康膀胱细胞异质性研究中的应用，并识别了文献中的空白以指导未来研究 | 整合了12项研究，首次系统性地绘制了膀胱细胞图谱，包括罕见和新发现的细胞类型，并讨论了单细胞与单核RNA测序的比较 | 仅纳入英文发表的研究，可能遗漏其他语言的重要文献；研究范围限定于健康膀胱，未涉及疾病状态 | 旨在评估单细胞RNA测序在健康膀胱细胞异质性研究中的应用现状，并识别文献空白 | 健康膀胱中的细胞，包括尿路上皮细胞、间质细胞、平滑肌细胞、免疫细胞、内皮细胞、间皮细胞和神经细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 基于12项研究的综合样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 3025 | 2026-02-07 |
Mitochondrial-related biomarkers as the diagnostic markers in sepsis induced acute respiratory distress syndrome
2026-Jan-05, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03772-0
PMID:41491575
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研究论文 | 本研究旨在识别与线粒体相关的生物标志物，用于诊断脓毒症诱发的急性呼吸窘迫综合征 | 首次通过整合差异表达基因、线粒体相关基因和多种机器学习算法，识别出三个新的脓毒症诱发ARDS的生物标志物，并构建了具有良好性能的列线图诊断模型 | 研究结果仍需在更大规模的前瞻性临床队列中进行验证，以确认其诊断效能和临床应用价值 | 寻找脓毒症诱发急性呼吸窘迫综合征的诊断生物标志物 | 脓毒症诱发急性呼吸窘迫综合征患者 | 生物信息学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序，定量逆转录聚合酶链反应，Western blotting | 机器学习算法 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 未明确说明具体样本数量，使用了公共数据集和实验验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3026 | 2026-02-07 |
Integrative multi-omics analysis reveals gut microbiota-derived metabolites and immune regulatory pathways in osteoarthritis pathogenesis
2026-Jan-05, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-025-06604-3
PMID:41491956
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，揭示了肠道菌群衍生代谢物和免疫调控通路在骨关节炎发病机制中的作用 | 构建了连接肠道菌群、代谢物和关键基因ARG1的M-M-T网络，并利用机器学习、SHAP和孟德尔随机化等方法识别了具有药物潜力的微生物代谢物 | 研究主要基于计算和生物信息学分析，缺乏体外和体内实验验证 | 探索肠道菌群通过代谢物和免疫调控通路影响骨关节炎发病的机制 | 骨关节炎患者相关的肠道菌群、代谢物、基因和免疫通路 | 机器学习 | 骨关节炎 | 多组学分析、单细胞转录组学、机器学习、孟德尔随机化 | 机器学习模型（未指定具体类型） | 基因表达数据、代谢物数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 3027 | 2026-02-07 |
Downregulation of USP39 in sepsis reflects immune dysfunction and offers diagnostic and prognostic value
2026-Jan-05, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03709-7
PMID:41491968
|
研究论文 | 本研究分析了USP39在脓毒症中的表达下调及其与免疫功能障碍的关联，探讨了其诊断和预后价值 | 首次系统性地将USP39的表达与脓毒症的免疫细胞浸润、临床特征及预后联系起来，并通过单细胞RNA-seq数据验证其在单核细胞和T细胞中的差异表达 | 研究主要基于公共数据集和体外细胞实验，缺乏大规模的前瞻性临床队列验证，且机制研究尚不深入 | 探讨USP39在脓毒症中的表达模式、临床意义及其作为治疗靶点的潜力 | 脓毒症患者样本（来自公共RNA-seq数据集）和LPS诱导的THP-1细胞系 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 细胞培养与转染, 细胞活力与凋亡检测, 炎症因子测定 | Cox回归, ROC曲线分析, GSEA, GSVA, ssGSEA, PCA, UMAP | 基因表达数据, 单细胞数据, 实验数据 | 公共RNA-seq数据集中的脓毒症患者和对照组样本，以及单细胞RNA-seq数据集GSE175453 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3028 | 2026-01-05 |
Spatial transcriptomics of developing human lungs defines cellular phenotypes associated with age, lineage and location
2026-Jan-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34594-z
PMID:41484334
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3029 | 2026-02-07 |
scDBImpute: Dual-Branch Imputation for Single-Cell RNA-Seq Data Dropouts
2026 Jan-Feb, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3636928
PMID:41289139
|
研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序数据中丢失值填补的双分支方法，以解决因技术限制导致的过量零值问题 | 与先前假设单一结构的方法不同，该方法结合线性和非线性关联来构建数据，通过双分支管道进行丢失值填补 | NA | 开发一种能够更准确地恢复单细胞RNA测序数据中丢失基因表达值的方法 | 单细胞RNA测序数据中的丢失值（dropouts） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 双分支模型（结合线性和非线性管道） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3030 | 2026-02-07 |
GALA: Integrating Weighted Graph Walks and Latent-Space Adversarial Training for Single-Cell Batch Alignment
2026 Jan-Feb, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3646228
PMID:41418016
|
研究论文 | 本文提出了一种名为GALA的新型单细胞批次校正框架，通过整合加权图随机游走和潜在空间对抗训练来对齐单细胞RNA测序数据 | 提出了一种结合加权图互近邻模块和潜在空间对抗训练的新框架，在跨批次细胞配对多样性和覆盖率上相比传统方法有显著提升 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的批次效应问题，实现数据整合分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对抗训练 | 基因表达数据 | 五个基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3031 | 2026-02-07 |
Mechanistic Insights into Threonine Tyrosine Kinase Mediated Cell Cycle Regulation in Triple-negative Breast Cancer
2026 Jan-Feb, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20563
PMID:41482351
|
研究论文 | 本研究探讨了苏氨酸酪氨酸激酶（TTK）在三阴性乳腺癌（TNBC）中通过调控细胞周期和Wnt/β-catenin信号通路驱动肿瘤进展的机制 | 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，揭示了TTK在细胞周期S期和G2/M期特异性高表达，并通过维持β-catenin-Cyclin D1信号轴促进TNBC增殖的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接功能验证 | 阐明TTK在三阴性乳腺癌发生发展中的分子机制，并评估其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌细胞系、正常乳腺上皮细胞、公共乳腺癌RNA-seq数据集（包括bulk和单细胞数据） | 癌症生物学 | 乳腺癌（三阴性亚型） | RNA测序（bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq）、siRNA敲低、细胞增殖/克隆形成/迁移实验、细胞周期分析、免疫荧光、Western blot、功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用分析、拟时序轨迹分析 | NA | 基因表达数据（RNA-seq）、蛋白质表达数据、细胞功能表型数据 | 未明确指定具体样本数量，使用了公共数据集、TNBC细胞系和正常乳腺上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3032 | 2026-02-07 |
Exosomes Transfer ST6GAL1-mediated Therapeutic Resistance in Rectal Cancer Cells
2026 Jan-Feb, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20558
PMID:41482354
|
研究论文 | 本研究揭示了直肠癌细胞通过外泌体转移ST6GAL1蛋白介导放化疗耐药的机制 | 首次证明ST6GAL1蛋白可通过外泌体在直肠癌细胞间转移，导致治疗耐药性扩散 | 研究主要基于细胞系和类器官模型，缺乏临床样本验证 | 探究直肠癌放化疗耐药性的传播机制 | 结直肠癌细胞系和类器官 | 肿瘤生物学 | 直肠癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | RNA测序数据，流式细胞数据 | 4个重复实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3033 | 2026-02-07 |
Adding highly variable genes to spatially variable genes can improve cell type clustering performance in spatial transcriptomics data
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf285
PMID:41550256
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研究论文 | 本研究探讨在空间转录组学数据中，将高变异基因与空间变异基因结合是否能提升细胞类型聚类性能 | 首次系统评估了高变异基因与空间变异基因联合使用对空间转录组学数据聚类性能的影响，覆盖了超过50个真实数据集和多种平台 | 未详细探讨不同基因组合策略（如加权或集成方法）对聚类性能的潜在影响，且可能受限于所选数据集的代表性 | 评估高变异基因与空间变异基因结合在空间转录组学数据中提升细胞类型聚类性能的效果 | 空间转录组学数据集中的基因表达数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | 超过50个真实空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3034 | 2026-02-07 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Immunosuppressive Trajectory in the Tumor Microenvironment of Human Giant Cell Tumor of Bone
2026, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/bmri/9855803
PMID:41635288
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的细胞异质性、免疫抑制轨迹及细胞间相互作用 | 首次在骨巨细胞瘤中应用单细胞RNA测序技术，系统描绘了其肿瘤微环境的细胞图谱，并揭示了肿瘤相关巨噬细胞、T细胞亚群的分化轨迹及细胞间通讯网络 | 样本量有限（仅一个肿瘤样本的7091个细胞），缺乏多中心或大样本验证，且为术后样本，可能无法完全反映体内原始状态 | 解析骨巨细胞瘤肿瘤微环境的复杂细胞组成、基因表达模式及免疫抑制机制 | 骨巨细胞瘤手术切除后的肿瘤组织细胞 | 单细胞组学 | 骨巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析，CellPhoneDB细胞互作分析 | 单细胞转录组数据 | 7091个细胞（来自一个骨巨细胞瘤样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3035 | 2026-02-07 |
A Narrative Review of Synaptic Transmission and Its Role in Neurological and Psychiatric Disorders: A Molecular Perspective
2026-Jan, Cureus
DOI:10.7759/cureus.100649
PMID:41635390
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综述 | 本文从分子角度，综述了突触传递在多种神经和精神疾病中的作用，并整合了分子遗传学、突触蛋白质组学、神经影像学和系统神经科学的最新进展，提出了一个跨诊断的系统级框架 | 整合了不同疾病背景下关于突触功能障碍的分散知识，提出了一个跨神经和精神疾病的、以突触为中心的系统级统一框架，并指出了具有转化潜力的新兴工具 | 作为一篇叙述性综述，其结论主要基于对现有文献的综合分析，而非原始研究数据，且所提出的框架仍需未来实验验证 | 旨在弥合关于突触功能障碍在神经和精神疾病中作用的现有知识鸿沟，提供一个整合的、跨疾病的分子视角 | 突触传递的分子过程及其在精神分裂症、自闭症谱系障碍、阿尔茨海默病、癫痫、重度抑郁症和帕金森病等疾病中的功能障碍 | 神经科学 | 神经和精神疾病（包括精神分裂症、自闭症谱系障碍、阿尔茨海默病、癫痫、重度抑郁症、帕金森病） | 分子遗传学， 突触蛋白质组学， 神经影像学， 系统神经科学， 单细胞RNA测序， 空间蛋白质组学， 突触正电子发射断层扫描成像 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序， 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 3036 | 2026-02-07 |
Diabetic kidney disease: integrating multi-omics insights, artificial intelligence, and novel therapeutics for precision medicine
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1760654
PMID:41635803
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综述 | 本文综述了糖尿病肾病研究的最新进展，重点整合了多组学见解、人工智能应用及新型治疗策略，以推动精准肾病学的发展 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学等多组学数据与人工智能深度学习模型，揭示了疾病异质性、早期代谢紊乱及免疫失调机制，并探讨了针对炎症、纤维化和代谢通路的新型治疗靶点 | 作为一篇综述文章，未涉及原始实验数据或具体模型验证，主要基于现有文献进行综合评述，可能未涵盖所有最新研究 | 旨在通过整合多组学技术、人工智能和新型治疗方法，实现糖尿病肾病的早期检测、精准风险分层和个性化管理 | 糖尿病肾病（DKD）的分子机制、生物标志物、疾病进展路径及治疗策略 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学、代谢组学 | 深度学习模型（如DeepDKD） | 图像（视网膜图像）、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3037 | 2026-02-07 |
Synthetic Assessment of Transfer Learning Method From Cell Lines to Single-Cell on Drug Response Prediction
2026 Jan-Feb, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3641230
PMID:41359728
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研究论文 | 本研究首次对基于迁移学习的单细胞药物反应预测代表性模型进行了全面评估 | 首次系统性地比较和评估了从细胞系到单细胞的药物反应预测迁移学习方法，填补了该领域缺乏系统性评估的空白 | 研究依赖于公开数据集，可能无法覆盖所有临床场景；评估主要基于现有方法，未提出新的算法 | 评估迁移学习方法在单细胞药物反应预测中的效果，为模型选择和设计提供方法学指导 | 单细胞表达数据与药物敏感性预测模型 | 机器学习 | 癌症（泛指肿瘤疾病） | 单细胞测序 | 迁移学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3038 | 2026-02-07 |
Identification of common genes and biomarkers between Dermatomyositis and rheumatoid arthritis through integrated bioinformatics
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0340617
PMID:41637423
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法，鉴定了皮肌炎和类风湿关节炎共有的关键基因、生物标志物及免疫微环境特征 | 首次通过整合多组学数据、加权基因共表达网络分析和机器学习模型，系统性地揭示了皮肌炎与类风湿关节炎共有的分子机制和免疫微环境重塑特征，并识别出具有诊断潜力的核心基因 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，缺乏实验验证；样本量有限，且外部验证队列的规模有待扩大 | 阐明皮肌炎与类风湿关节炎共病的分子机制，并识别潜在的诊断生物标志物 | 皮肌炎和类风湿关节炎患者的基因表达数据及免疫微环境 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 微阵列基因表达分析，单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，机器学习建模 | LASSO回归，随机森林 | 基因表达数据 | 基于多个GEO数据集（GSE55235, GSE55457, GSE12021, GSE159117），具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3039 | 2026-02-07 |
Cellular plasticity and regenerative mechanisms in the lung
2026-Jan, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society
IF:9.0Q1
DOI:10.1183/16000617.0168-2025
PMID:41638880
|
综述 | 本文综述了肺组织在应对环境损伤时，其上皮细胞（尤其是驻留干细胞和祖细胞）的可塑性与再生机制，并探讨了这些机制在慢性肺病中的作用及治疗潜力 | 整合了动物模型和人类肺研究的最新发现，利用单细胞和空间转录组学揭示了新的祖细胞状态和过渡中间态，强调了细胞可塑性在正常修复和疾病发病机制中的核心作用 | NA | 阐明肺上皮细胞在损伤后的再生机制，并探讨其在慢性肺病（如特发性肺纤维化和COPD）中的病理意义及治疗靶点 | 肺组织中的驻留干细胞和祖细胞（如基底细胞、肺泡II型细胞、变异克拉拉细胞、细支气管肺泡干细胞等）及其在损伤修复中的行为 | 数字病理学 | 肺病 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3040 | 2026-02-07 |
Multi-omics analysis identifies a microbiota-bile acid-TLR signaling axis driving bladder injury in interstitial cystitis
2025-Dec-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68060-1
PMID:41457077
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了一种微生物-胆汁酸-TLR信号轴在间质性膀胱炎中驱动膀胱损伤的机制 | 首次整合宏基因组测序、靶向代谢组学和单细胞RNA测序，识别出Enterococcus avium富集的微生物特征和胆汁酸代谢改变，并证实其通过TLR3激活导致膀胱上皮损伤 | 研究主要基于实验模型验证，人类样本的直接临床转化和长期效果需进一步评估 | 探究间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征（HIC）的上游驱动机制，以寻找生物标志物和靶向治疗机会 | Hunner型间质性膀胱炎患者的尿液、血清样本及实验模型 | 多组学分析 | 间质性膀胱炎 | 宏基因组测序、靶向代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因组、代谢组、转录组数据 | NA | NA | 宏基因组测序, 靶向代谢组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |