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当前共找到 37547 篇文献,本页显示第 3001 - 3020 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3001 2026-02-07
Epigenetic Programming of Macrophage Phenotypes by STING-IRF3 Drives Inflammation in Ascending Thoracic Aortic Dissection
2026-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞测序技术揭示了STING-IRF3信号轴通过表观遗传编程调控巨噬细胞表型,驱动升主动脉夹层炎症的机制 首次在升主动脉夹层中整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学,揭示了STING-IRF3介导的巨噬细胞表观遗传重编程是主动脉炎症的关键驱动因素 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要更大规模的人类队列验证;机制细节如BRG1依赖的染色质重塑需进一步实验证实 探究巨噬细胞表观遗传重编程是否调控其表型命运并促进升主动脉夹层的发病机制 人类升主动脉组织(对照组、升主动脉瘤患者、急性升主动脉夹层患者)及血管紧张素II灌注的小鼠模型 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 基因敲除小鼠模型(MΦ-Sting -/- 和 MΦ-Irf3 -/-) 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 空间基因表达数据 人类主动脉组织样本(对照组、ATAA患者、ATAD患者)及Ang II诱导的小鼠ATAD模型 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 NA NA
3002 2026-02-07
Astrocytic response to traumatic brain injury to rescue neuronal mitochondrial dysfunction through mitochondrial transfer
2026-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了创伤性脑损伤后,星形胶质细胞通过线粒体转移来拯救神经元线粒体功能障碍的内在神经保护机制 揭示了星形胶质细胞在TBI后通过直接接触和细胞外囊泡两种方式向神经元转移功能性线粒体,并首次证明EV介导的线粒体转移能显著改善兴奋性毒性诱导的神经元线粒体功能障碍 研究未观察到线粒体转移至神经元突触的增加,且主要基于急性TBI模型(24小时),长期效应和临床转化潜力仍需进一步探索 探究创伤性脑损伤后中枢神经系统内细胞间线粒体转移的机制及其神经保护作用 表达线粒体荧光标记(mtD2/mtGFP)的转基因小鼠、原代皮层星形胶质细胞和神经元 神经科学 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序、线粒体生物能量学分析、共培养实验、细胞外囊泡分离 NA 基因表达数据、荧光成像数据、生物能量学数据 使用特定转基因小鼠品系(Aldh1l1-CreER; mtD2/mtGFP 和 CamK2aCre; mtD2/mtGFP)及原代细胞进行实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3003 2026-02-07
Uncovering the molecular logic of cortical wiring between neuronal subtypes across development through ligand-receptor inference
2026-Jan-22, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组学追踪小鼠17个发育阶段主要神经元群体的基因表达动态,揭示了皮层神经元亚型间配体-受体相互作用的分子逻辑 识别了NEOGENIN-1作为CBLN4在围产期的主要受体,并发现钙粘蛋白超家族成员在突触特异性中的上下文依赖性作用 研究基于小鼠模型,可能不完全适用于人类皮层发育,且功能验证有限 解码皮层神经元亚型间精确连接的分子机制 小鼠大脑皮层中的兴奋性和抑制性神经元亚型 神经科学 NA 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 多个发育阶段的小鼠神经元群体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3004 2026-02-07
Fibroblast-specific Deletion of Yap/Taz Impairs Mouse Postnatal Dermal Development by Suppressing Collagen Production and Deposition
2026-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了YAP/TAZ在成纤维细胞中对小鼠出生后皮肤真皮发育的关键作用,特别是通过抑制胶原蛋白的生产和沉积来影响真皮成熟 揭示了YAP/TAZ在成纤维细胞中调控细胞外基质(ECM)稳态的新机制,特别是在出生后皮肤发育过程中胶原蛋白合成和沉积的关键作用 研究主要基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类皮肤;未详细探讨YAP/TAZ在其他细胞类型或疾病状态下的作用 探究YAP/TAZ在成纤维细胞中对出生后皮肤真皮发育和ECM稳态的调控作用 小鼠皮肤成纤维细胞和出生后皮肤组织 分子生物学与细胞生物学 皮肤发育与再生相关疾病 基因敲除、RNA-seq、空间转录组学、蛋白质组学 NA 基因表达数据、蛋白质数据、空间转录组数据 使用基因敲除小鼠模型,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、蛋白质组学 NA NA
3005 2026-02-07
Macrophage efferocytosis mediated by the TP63-RAC2 pathway promotes immunosuppressive remodeling in esophageal cancer
2026-Jan-20, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和体内外实验,探讨了巨噬细胞胞葬作用在食管鳞状细胞癌中的作用及其免疫抑制机制 首次揭示了TP63和RAC2作为关键调节因子,介导巨噬细胞胞葬作用,从而促进食管癌的免疫抑制微环境重塑 样本量较小(仅9名患者的27个样本),且主要基于食管鳞状细胞癌,结果在其他癌症类型中的普适性有待验证 探究胞葬作用在食管癌肿瘤微环境中的作用机制及其对免疫反应的影响 食管鳞状细胞癌患者肿瘤样本中的巨噬细胞和凋亡肿瘤细胞 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 9名患者的27个样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3006 2026-02-07
Restoring immune homeostasis in atherosclerotic plaques via inorganic violet phosphorus nano-immunotherapy
2026-Jan-20, Cell reports. Medicine
研究论文 本文开发了一种无机纳米颗粒平台(聚乙二醇化紫磷纳米片),用于通过免疫调节治疗动脉粥样硬化 首次利用无机紫磷纳米片作为纳米免疫疗法平台,通过单细胞RNA测序揭示其调节斑块内四种关键免疫细胞群并重塑细胞间通讯的机制 未在人类临床试验中验证,且未详细探讨长期副作用或与其他疗法的比较 开发一种靶向免疫调节的纳米疗法以治疗动脉粥样硬化 动脉粥样硬化小鼠模型中的免疫细胞(如巨噬细胞、单核细胞、T/B细胞) 纳米医学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但基于小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3007 2026-02-07
BCG vaccination induces antibacterial effector functions among Vδ1/3 T cells that are associated with protection against tuberculosis
2026-Jan-20, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究通过多模态单细胞测序等技术,揭示了BCG疫苗接种如何激活Vδ1/3 T细胞并使其在肺部积累,从而增强对结核分枝杆菌的免疫保护作用 首次系统揭示了Vδ1/3 T细胞在BCG疫苗诱导的抗结核免疫中的关键作用,并证实其在气道中的富集与保护效果相关 研究样本量有限,且主要在婴儿和猕猴模型中进行,人类成人数据不足 探究BCG疫苗接种后Vδ1/3 T细胞在抗结核免疫中的作用机制 人类婴儿和猕猴的γδ T细胞(特别是Vδ1/3+ T细胞) 免疫学 结核病 多模态单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、流式细胞术 NA 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 人类婴儿和猕猴样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3008 2026-02-07
Targeting thymidylate synthase enhances CD8 + T-cell infiltration and inhibits tumor growth in cervical cancer
2026-Jan-19, Medical oncology (Northwood, London, England)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、功能实验和体内模型,揭示了胸苷酸合成酶(TYMS)在宫颈癌中作为免疫代谢调节剂的作用,并证明靶向TYMS可增强CD8+T细胞浸润并抑制肿瘤生长 首次探索了TYMS在宫颈癌中作为免疫代谢调节剂的功能,开发了基于TYMS等基因的T细胞相关预后特征,并发现脱氧尿苷单磷酸是TYMS的高亲和力抑制剂 研究主要基于体外实验和小鼠模型,需要在临床样本中进行进一步验证 阐明TYMS在宫颈癌肿瘤微环境中的免疫代谢调控作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 宫颈癌(CESC) 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、bulk转录组学、功能测定、体内建模、分子对接 NA 单细胞RNA测序数据、bulk转录组数据 47,589个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3009 2026-02-07
Hyperactivated YAP1 Drives an Invasive EMT Subtype of Cervical Squamous Cell Carcinoma
2026-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了YAP1过度激活驱动一种新型HPV非依赖性、侵袭性宫颈鳞状细胞癌亚型,该亚型因缺乏表面病变而逃逸现有筛查策略 首次发现Hippo-YAP信号通路破坏导致的YAP1过度激活足以诱导HPV非依赖性侵袭性宫颈癌亚型,并利用单细胞和空间转录组学解析其细胞结构和免疫微环境 未明确说明样本量大小,且主要基于分子机制研究,临床转化应用仍需进一步验证 探究逃逸现有筛查策略的宫颈癌亚型的分子机制和免疫微环境特征 宫颈鳞状细胞癌(CVC) 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 转录组数据,空间基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
3010 2026-02-07
Imaging spatial transcriptomics reveals molecular patterns underlying accumulation of p-Ser129 α-synuclein in a transgenic mouse model
2026-Jan-16, NPJ Parkinson's disease
研究论文 本研究利用成像空间转录组学结合免疫荧光技术,在转基因小鼠模型中揭示了p-Ser129 α-突触核蛋白积累的分子模式 首次将成像空间转录组学与下游免疫荧光技术结合,在同一组织切片中识别出易积累pSyn的神经元亚型,并揭示了Plk2和hSNCA表达在pSyn形成中的关键作用 研究基于转基因小鼠模型,可能无法完全模拟人类帕金森病或路易体痴呆的复杂性 探究帕金森病和路易体痴呆中α-突触核蛋白选择性积累的分子机制 转基因过表达人α-突触核蛋白的小鼠皮层和海马神经元 数字病理学 帕金森病 成像空间转录组学,免疫荧光 NA 空间转录组数据,图像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3011 2026-02-07
Dual Lineage Tracing Identifies Cellular Mechanisms Underlying Radiation-Associated Changes in Atherosclerotic Lesion Composition
2026-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种双谱系示踪小鼠模型,用于同时追踪动脉粥样硬化斑块中平滑肌细胞和内皮细胞的命运,揭示了辐射如何通过改变这两种细胞的动态变化来影响斑块组成和稳定性 开发了首个能够同时示踪平滑肌细胞和内皮细胞命运的双谱系示踪小鼠模型,克服了传统单谱系示踪方法无法在同一病变中同时追踪两种细胞类型的局限性 研究基于小鼠模型,其发现向人类临床的转化需要进一步验证;研究主要关注辐射这一特定血管应激源,其他应激条件下的细胞动态可能不同 探究辐射条件下平滑肌细胞和内皮细胞在动脉粥样硬化斑块中的命运变化及其对斑块稳定性的影响机制 Apoe缺陷小鼠的平滑肌细胞和内皮细胞 心血管疾病研究 心血管疾病 谱系示踪、免疫染色、单细胞RNA测序 双谱系示踪小鼠模型 基因表达数据、成像数据 未明确说明具体样本数量,但涉及双谱系示踪Apoe缺陷小鼠群体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3012 2026-02-07
Integrative Single-cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Osteosarcoma Reveals Conserved and Distinct Ecosystems Across Sites and Species
2026-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学分析,揭示了骨肉瘤在跨物种和不同部位间保守且独特的生态系统 构建了首个跨物种骨肉瘤单细胞转录组数据集,涵盖人类、犬类、PDX和同基因小鼠模型,并识别了保守的肿瘤细胞状态和肿瘤相关细胞群的重编程特征 研究依赖于转录组数据,可能未完全捕捉蛋白质水平或表观遗传变化,且样本来源的多样性可能引入批次效应 探究骨肉瘤的肿瘤微环境异质性及其在跨物种和不同解剖部位的保守与差异 人类、犬类骨肉瘤标本、患者来源异种移植(PDX)、同基因小鼠模型的原发(骨)和转移(肺)部位细胞 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 转录组数据 超过一百万个细胞/核,来自多物种和多部位样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3013 2026-02-07
Benchmarking cell type deconvolution in spatial transcriptomics and application to cancer immunotherapy
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个用于评估空间转录组学中细胞类型反卷积方法的基准测试框架,并将其应用于癌症免疫治疗研究 提出了一个结合空间和转录复杂性的现实模拟基准测试框架,发现简单的标记基因签名评分方法在性能上具有竞争力,尤其适用于稀有细胞类型 基准测试主要基于模拟数据,可能无法完全反映真实生物样本的复杂性;方法在缺乏匹配单细胞参考数据时的适用性仍需进一步验证 评估和比较空间转录组学中细胞类型反卷积方法的准确性和一致性,并应用于癌症免疫治疗响应分析 空间转录组学数据,包括模拟数据集和真实小鼠癌症模型中的肿瘤及引流淋巴结样本 空间转录组学 癌症 空间转录组学 标记基因签名评分方法 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3014 2026-02-07
A supervised ontology-aware cell annotation method for single-cell transcriptomic data
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种基于监督学习和本体论的细胞注释方法SOCAM,用于单细胞转录组数据,通过概率传播策略确保细胞类型分类的层次一致性 引入概率传播策略以强制本体一致性,无需重新训练现有模型即可提升性能,并提出了基于跳数的F1评分用于本体感知评估 NA 开发一种快速、可解释且本体一致的细胞注释方法,以改进单细胞RNA-seq数据的细胞类型分类 人类单细胞转录组数据 数字病理学 NA 单细胞RNA-seq 逻辑回归 单细胞转录组数据 4200万个人类细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3015 2026-02-07
From glycolytic signatures to patients: A translational roadmap for reproducible, equitable deployment of multi-omics and AI in colorectal cancer
2026-Jan-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
综述 本文提出一个基于多组学和人工智能的可重复、公平部署的路线图,用于结直肠癌的精准肿瘤学 整合国际公认框架(TRIPOD+AI、PROBAST+AI、DECIDE-AI)以确保透明度、校准和分阶段临床评估,并强调使用代谢成像和光谱学进行正交验证 未具体说明数据样本量或模型类型,主要关注方法论和路线图,缺乏实证研究细节 为结直肠癌中多组学和人工智能的可重复、公平临床工具开发提供结构化路线图 结直肠癌的糖酵解异质性及相关生物标志物 机器学习 结直肠癌 批量转录组学、单细胞转录组学、代谢成像、光谱学 NA 转录组数据、成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
3016 2026-02-07
Acute wood smoke exposure is associated with cell-specific hippocampal transcriptomic responses in an accelerated ovarian failure mouse model
2026-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了急性木烟暴露在加速卵巢衰竭小鼠模型中如何影响海马区细胞特异性转录组反应 首次结合卵巢激素下降与急性木烟暴露,利用空间转录组学技术揭示海马区不同细胞类型的特异性转录变化 研究仅使用小鼠模型,样本量较小(每组4个切片),且暴露时间较短(2天),可能无法完全模拟人类长期暴露或更广泛的生理变化 探究卵巢激素下降是否加剧大脑对空气污染(特别是木烟)的脆弱性,并识别相关的细胞通路 雌性C57BL/6小鼠,采用4-乙烯基环己烯二环氧化物诱导的加速卵巢衰竭模型 空间转录组学 老年疾病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 每组4个海马切片(具体动物数量未明确说明) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium平台用于空间转录组分析
3017 2026-02-07
Interpreting the molecular and cellular landscape of PCOS through bulk transcriptomics, single-cell transcriptomics and machine learning
2026-Jan-07, Journal of ovarian research IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合bulk转录组学、单细胞转录组学和机器学习方法,揭示了多囊卵巢综合征的分子机制和细胞组成,并开发了诊断模型 首次结合bulk和单细胞RNA测序与机器学习,识别了PCOS中关键的颗粒细胞亚群GC9,并构建了基于三基因标志的诊断模型 研究样本量有限,且主要基于转录组数据,未全面探索其他分子层面如蛋白质组或代谢组 阐明PCOS的分子机制和细胞基础,以发现潜在治疗靶点并提高诊断准确性 多囊卵巢综合征患者的颗粒细胞 机器学习 多囊卵巢综合征 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, qPCR, western blotting 机器学习算法 RNA测序数据, 临床样本数据 PCOS患者和对照组的临床样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
3018 2026-02-07
Therapeutic potential of CDK8 inhibitor combined with sorafenib for hepatocellular carcinoma: mechanistic insights and in vitro validation
2026-Jan-07, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 本研究探讨了CDK8抑制剂MSC2530818与索拉非尼联合使用对肝细胞癌的治疗潜力,通过机制分析和体外实验验证其协同抗肿瘤效果 首次结合单细胞RNA-seq分析揭示CDK8在肝细胞癌中的表达模式,并验证CDK8抑制剂与索拉非尼的联合治疗策略在体外模型中的协同增效作用 研究主要基于体外细胞实验(Huh7细胞),缺乏体内动物模型或临床样本的直接验证,且样本量有限 探索肝细胞癌的新型治疗靶点及联合治疗策略 肝细胞癌组织样本、Huh7肝癌细胞系 肿瘤生物学 肝细胞癌 免疫组化、RNA-seq、微阵列数据分析、单细胞RNA-seq、细胞增殖实验、划痕实验、Transwell实验 NA 组织样本数据、基因表达数据、单细胞转录组数据、体外细胞实验数据 75例肝细胞癌及癌旁组织样本,整合分析3969例肝细胞癌和3245例非肿瘤肝样本的RNA-seq和微阵列数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 NA NA
3019 2026-02-07
BayesRare: Bayesian mixture model for population-level rare cell type detection in multi-subject single-cell RNA sequencing data
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为BayesRare的层次贝叶斯框架,用于在多主体单细胞RNA测序数据中进行群体水平的罕见细胞类型检测 通过引入罕见簇指示器,结合跨主体信息,支持联合细胞类型聚类和罕见群体识别,并量化不确定性 未在摘要中明确提及 开发一种方法以在群体水平上检测罕见细胞类型,并推断组间差异 多主体单细胞RNA测序数据中的罕见细胞类型 机器学习 NA 单细胞RNA测序 贝叶斯混合模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3020 2026-02-07
scGACL: a generative adversarial network with multi-scale contrastive learning for accurate single-cell RNA sequencing imputation
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种结合生成对抗网络和多尺度对比学习的单细胞RNA测序数据插补方法scGACL,以解决现有方法存在的过度平滑问题 提出了一种集成生成对抗网络与多尺度对比学习的新框架,通过细胞级和细胞类型级对比学习协同工作,在保持细胞间异质性的同时恢复基因表达 未在摘要中明确说明 开发一种能够准确插补单细胞RNA测序数据并保持细胞异质性的计算方法 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 生成对抗网络, 对比学习 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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