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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2981 | 2026-02-07 |
Heterogeneous responses of IM19 anti-CD19 CAR T-cell therapy in refractory systemic lupus erythematosus: an open-label pilot study and a mini-review
2026-Feb-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.014
PMID:41644365
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研究论文 | 本研究评估了IM19抗CD19 CAR T细胞疗法在难治性系统性红斑狼疮(SLE)患者中的疗效和安全性,特别关注狼疮性肾炎(LN) | 首次在难治性SLE患者中评估IM19 CAR T细胞疗法的临床效果,并结合单细胞RNA测序分析B细胞重建情况 | 研究为单臂开放标签试验,样本量较小(仅6例患者),且缺乏长期随访数据 | 评估CAR T细胞疗法在难治性SLE及LN中的疗效和安全性 | 难治性系统性红斑狼疮伴肾脏受累的患者 | NA | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 6例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2982 | 2026-02-07 |
Gain of function NOTCH4 variants disrupt angiogenesis in systemic sclerosis
2026-Feb-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.015
PMID:41644364
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研究论文 | 本研究通过遗传学、单细胞RNA测序、功能实验和小鼠模型,探讨了NOTCH4基因变异在系统性硬化症血管病变中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次在非裔美国人系统性硬化症患者中,通过基因关联分析发现NOTCH4变异与严重血管表型相关,并验证了NOTCH4信号通路在血管生成和内皮-间质转化中的关键作用 | 研究主要聚焦于非裔美国人群体,可能限制了结果在其他种族中的普适性;临床样本量相对有限 | 探究系统性硬化症中严重血管表型的遗传基础,特别是非裔美国人患者预后较差的原因 | 非裔美国人系统性硬化症患者,以及相关的细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序,功能实验,小鼠模型 | NA | 遗传数据,单细胞RNA测序数据,功能实验数据 | 非裔美国人系统性硬化症患者及对照群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2983 | 2026-02-07 |
LineGRN: A Line Graph Neural Network for Gene Regulatory Network Inference
2026-Feb, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3591840
PMID:40699953
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研究论文 | 提出了一种名为LineGRN的线图神经网络框架,用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 通过建模基因对之间的邻域关系,有效保留拓扑结构中的交互信号,并利用线图变换产生高节点度主导的局部网络拓扑,实现更高效的信息传播 | 未明确提及具体局限性 | 推断基因调控网络以揭示转录因子与靶基因之间的复杂相互作用 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 线图神经网络 | scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2984 | 2026-02-07 |
EnsembleRegNet: Interpretable deep learning for transcriptional network inference from single-cell RNA-seq
2026-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种名为EnsembleRegNet的深度学习框架,用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 | 通过集成编码器-解码器和多层感知机架构,结合Hodges-Lehmann估计器二值化、案例删除分析、RcisTarget基序富集和AUCell调控子活性评分,提升了网络推断的鲁棒性和生物学可解释性 | NA | 从高维单细胞RNA测序数据中准确推断基因调控网络的结构 | 转录因子与靶基因之间的调控关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成编码器-解码器, 多层感知机 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2985 | 2026-02-07 |
Lactylation-Related Gene Signature and Immune Infiltration Crosstalk in Heart Failure: Insights From Bulk and Single-Cell Transcriptomics
2026-Feb-01, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001775
PMID:41252712
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研究论文 | 本研究通过批量与单细胞转录组学分析,探讨了乳酰化相关基因特征与免疫浸润在心力衰竭中的相互作用 | 首次系统性地将蛋白质乳酰化修饰与心力衰竭的免疫微环境联系起来,并构建了基于乳酰化相关基因的诊断模型和基因特征 | 研究结果主要基于转录组数据,需要进一步的实验验证来确认乳酰化修饰在心力衰竭中的具体调控机制 | 探索乳酰化修饰在心力衰竭免疫微环境中的作用,并识别相关的生物标志物和潜在治疗靶点 | 心力衰竭患者样本、小鼠心力衰竭模型以及相关的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 无监督聚类, 诊断模型 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 200个心力衰竭样本和166个非心力衰竭样本,以及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2986 | 2026-02-07 |
Colorectal microenvironment determines the prognosis of colorectal cancer
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01599-7
PMID:41495419
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研究论文 | 本研究通过分析结直肠癌患者的肿瘤和非肿瘤组织,评估了区分支持癌细胞生长的微环境与健康微环境的可行性,并发现微环境特征可作为预后生物标志物 | 首次利用bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据,结合16S rRNA测序分析,揭示了结直肠微环境与癌症预后的关联,并识别了特定的细胞相互作用和微生物组成 | 样本量相对有限(273对样本),且研究主要基于回顾性分析,需要进一步前瞻性验证 | 评估结直肠微环境在预测癌症预后中的作用,并探索其作为生物标志物的潜力 | 结直肠癌患者及其配对的非肿瘤组织和肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | bulk RNA测序, 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据, 微生物组数据 | 273对配对的非肿瘤组织和肿瘤样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 2987 | 2026-02-07 |
Microglial CX3CR1 deficiency regulates the selective vulnerability of cone photoreceptors via STAT3/CCL-ACKR1 signaling in the mouse retina
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01618-7
PMID:41535549
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研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞CX3CR1缺陷通过STAT3/CCL-ACKR1信号通路导致小鼠视网膜视锥光感受器选择性易损的分子机制 | 首次发现CX3CR1缺陷通过调控Tnf主导型小胶质细胞与视锥细胞间的CCL-ACKR1相互作用,以及Cxcl1主导型小胶质细胞通过Bmp2-Bmpr1a/Bmpr1b对与星形胶质细胞通讯,共同导致视锥细胞选择性丢失 | 研究局限于小鼠视网膜模型,人体内的相关机制尚需进一步验证 | 探究神经退行性疾病中神经元选择性易损的分子机制 | 小鼠视网膜中的小胶质细胞、星形胶质细胞和视锥光感受器 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2988 | 2026-02-07 |
Immunometabolic reprogramming of macrophages: Emerging roles in skeletal muscle regeneration and therapeutic perspectives
2026-Feb, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108109
PMID:41577156
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞免疫代谢重编程在骨骼肌再生中的作用及其治疗前景 | 整合单细胞和空间转录组学技术揭示巨噬细胞亚群的异质性,强调免疫代谢编程作为巨噬细胞可塑性的关键驱动因素 | NA | 探讨巨噬细胞免疫代谢如何调节骨骼肌再生,并评估其作为治疗肌肉萎缩性疾病的潜在策略 | 巨噬细胞在骨骼肌再生过程中的作用 | NA | 肌肉萎缩性疾病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞 RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2989 | 2026-02-07 |
Single-immunocyte transcriptomics reveal the role of natural killer cell-dependent exogenous antigen presentation in ankylosing spondylitis severity
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01619-6
PMID:41593306
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了自然杀伤细胞依赖性外源性抗原呈递在强直性脊柱炎严重程度中的作用机制 | 首次鉴定出具有抗原呈递细胞特征的自然杀伤细胞亚群,并阐明其在AS疾病加重和缓解中的动态变化及与CD4 T细胞活化的关联 | 研究样本量相对有限,且主要基于外周血单核细胞,未直接分析病变关节组织 | 探究强直性脊柱炎发病、加重和缓解过程中的细胞分类学和免疫学特征 | 健康供体和不同疾病阶段强直性脊柱炎患者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康供体和不同疾病阶段AS患者的外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2990 | 2026-02-07 |
Single-cell and Mendelian analyses reveal shared mechanisms between head and neck neoplasms and aging
2026-Feb-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04550-y
PMID:41621040
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,探索头颈部肿瘤与衰老之间的共享关键基因和机制 | 结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,首次系统性地揭示了头颈部肿瘤与衰老在CD4_naive T细胞下调方面的共同特征,并识别出FHIT作为潜在的分子连接点 | 验证阶段仅保留FHIT基因,且共定位分析显示GWAS与eQTL信号共享因果变异的证据有限(H4=0.01),样本来源局限于外周血单细胞数据 | 探索头颈部肿瘤与衰老之间的共享关键基因和分子机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者、衰老个体和健康对照的外周血单细胞RNA测序数据 | 单细胞组学 | 头颈部肿瘤 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯建模, 共定位分析, 代谢通路富集分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据, eQTL数据 | 头颈部鳞状细胞癌患者、衰老个体和健康对照的外周血样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2991 | 2026-02-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics uncover neoadjuvant chemotherapy-resistant malignant cells with inhibitory signalling on B cells in gastric cancer
2026-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70600
PMID:41630531
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2992 | 2026-02-07 |
Single-cell analysis reveals neuroprotective histone deacetylase inhibitor pathways
2026-Feb, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71108
PMID:41630642
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和体外验证,识别了阿尔茨海默病的可再利用药物,并揭示了组蛋白去乙酰化抑制剂TSA的神经保护机制 | 结合单细胞RNA测序、空间转录组学和iPSC衍生神经元验证,识别了TSA作为阿尔茨海默病治疗候选药物,并发现DISC1作为跨数据集收敛的治疗靶点 | 研究主要基于体外iPSC模型和计算分析,缺乏体内实验验证,且样本来源和规模可能有限 | 识别阿尔茨海默病的可再利用药物并阐明其神经保护机制 | 阿尔茨海默病皮层区域的细胞类型、人iPSC衍生的皮层神经元以及Aβ寡聚体暴露模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, iPSC技术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 体外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2993 | 2026-02-07 |
Single-Cell RNA Sequencing and Bulk RNA Sequencing Revealed the Interplay Between Intratumoral Heterogeneity and the Tumor Microenvironment in Breast Cancer
2026-Feb, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71600
PMID:41635010
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序,揭示了乳腺癌中肿瘤内异质性与肿瘤微环境之间的相互作用 | 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,系统分析了不同乳腺癌分子亚型中细胞间通讯网络,并识别出与预后相关的关键信号通路 | 研究依赖于公共数据库数据,可能受样本来源和技术平台差异的影响,且未进行实验验证 | 研究乳腺癌分子亚型中肿瘤微环境内差异信号通路及其与临床预后的关联 | 乳腺癌样本中的上皮细胞、成纤维细胞、巨噬细胞和淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | SingleR, Monocle, CellChat | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2994 | 2026-02-07 |
Targeting the SIRT1-NAT10-GABABR1 Axis: A Novel Epitranscriptomic Approach to Mitigate Sevoflurane-Induced Cognitive Impairment in Aging
2026-Feb, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70762
PMID:41636018
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研究论文 | 本研究揭示了SIRT1通过去乙酰化NAT10来减少GABABR1 mRNA的乙酰化,从而减轻七氟醚诱导的老年大鼠术后认知功能障碍的机制 | 首次提出并验证了SIRT1-NAT10-GABABR1轴作为麻醉相关神经毒性的新治疗靶点,阐明了表观转录组调控在术后认知功能障碍中的作用 | 研究主要在老年大鼠模型中进行,其结论在人类中的适用性有待进一步验证 | 探究Sirtuin 1 (Sirt1)如何通过靶向N-乙酰转移酶10 (NAT10)介导的mRNA乙酰化和线粒体稳态来保护老年大鼠免受七氟醚诱导的术后认知功能障碍 | 老年大鼠 | 神经科学 | 术后认知功能障碍 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), RIP-qPCR, 点印迹, 膜片钳记录, 蛋白质印迹 (WB), 免疫荧光, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 电生理数据, 行为学数据 | 老年大鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2995 | 2026-02-07 |
Integrative single-cell analysis uncovers distinct tumour microenvironment ecotypes and immune evasion across skin cancers
2026-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70611
PMID:41636115
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学等多组学数据,揭示了皮肤癌中不同的肿瘤微环境生态型及其在免疫逃逸中的作用 | 首次在泛皮肤癌层面系统描绘了肿瘤微环境的免疫重塑模式,鉴定出与疾病进展和免疫治疗反应相关的恶性黑色素瘤细胞亚群及巨噬细胞极化状态,并揭示了SPP1信号在免疫重塑中的关键作用 | 样本量相对有限(102个样本),且主要基于转录组数据,缺乏蛋白质组学或代谢组学的验证 | 阐明不同皮肤癌类型和疾病阶段中肿瘤-免疫生态系统的重塑模式及其对免疫逃逸和治疗抵抗的影响 | 基底细胞癌、鳞状细胞癌、皮肤黑色素瘤和肢端黑色素瘤患者样本 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组测序、批量RNA-seq、免疫荧光染色、体外功能实验、CRISPR筛选 | NA | 单细胞转录组数据、批量RNA-seq数据、免疫荧光图像数据 | 102个皮肤癌样本(包括邻近正常皮肤、早期和晚期肿瘤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2996 | 2026-02-07 |
Parthenolide Alleviates Peritoneal Fibrosis by Blocking Smad2/3 Phosphorylation via Smad Anchor for Receptor Activation
2026-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503305R
PMID:41546557
|
研究论文 | 本研究揭示了小白菊内酯通过阻断SARA介导的Smad2/3磷酸化来缓解腹膜纤维化的分子机制 | 首次阐明SARA在腹膜透析相关腹膜纤维化中的作用,并发现小白菊内酯通过特异性结合SARA的Pro788和Ser795位点,破坏其与Smad3的相互作用 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究小白菊内酯缓解腹膜纤维化的分子机制及SARA在其中的作用 | 腹膜透析小鼠模型、TGF-β1诱导的间皮-间质转化模型、CRISPR/Cas9敲除SARA基因的MeT-5A细胞、HMrSV5细胞 | 分子生物学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9基因编辑、分子对接、生物素下拉实验、免疫共沉淀 | 动物模型、细胞模型 | 测序数据、蛋白质相互作用数据 | 未明确样本数量,包括小鼠模型、细胞系及临床腹膜透析液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2997 | 2026-02-07 |
Bulk Sequencing Combined With Single-Cell Sequencing Identifies High Expression of VCAN in Fibroblasts Promoting the Progression of High-Stemness Gastric Adenocarcinoma Cells
2026-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502979R
PMID:41555841
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研究论文 | 本研究通过整合bulk测序与单细胞测序,发现成纤维细胞中VCAN高表达促进高干性胃腺癌细胞的进展 | 首次结合bulk测序与单细胞测序揭示VCAN在癌症相关成纤维细胞中的特异性表达及其通过MDK-NCL和MIF-CD74-CD44信号通路促进高干性胃腺癌细胞恶性表型的作用机制 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证;信号通路机制尚未完全阐明 | 探究VCAN在胃腺癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 胃腺癌组织、癌症相关成纤维细胞、高干性胃腺癌细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | bulk测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 多个数据库的样本(具体数量未明确说明) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2998 | 2026-02-07 |
Mining Potential Therapeutic Targets for T Cell Exhaustion in Osteoarthritis by Integrating Mendelian Randomization and Single-Cell Sequencing
2026-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503295R
PMID:41603583
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和单细胞测序技术,挖掘骨关节炎中T细胞耗竭的潜在治疗靶点 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞测序方法,系统鉴定骨关节炎中T细胞耗竭相关基因作为生物标志物 | 研究依赖于公共数据库数据,未进行独立队列验证实验 | 确定骨关节炎中与T细胞耗竭相关的生物标志物,为治疗和预后提供潜在靶点 | 骨关节炎患者样本数据 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2999 | 2026-02-07 |
Identification of potential drug targets for Alzheimer's disease from genetic insights: A Mendelian randomization study
2026-Jan-30, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045715
PMID:41630303
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析,从遗传学角度识别了与阿尔茨海默病相关的潜在血浆蛋白靶点,并预测了候选药物 | 结合孟德尔随机化、蛋白质相互作用网络、分子对接和单细胞测序分析,系统识别AD相关枢纽基因并预测潜在药物 | 依赖于公开的GWAS汇总统计数据,可能受限于样本异质性和潜在混杂因素 | 探索阿尔茨海默病的分子机制并识别潜在药物靶点 | 阿尔茨海默病患者相关的血浆蛋白和基因 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化分析、单细胞测序、分子对接 | NA | 基因组关联研究汇总统计数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3000 | 2026-02-07 |
Adult leptomeningeal vestigial neural crest-derived multipotent cells promote vascular repair after stroke
2026-Jan-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116747
PMID:41456275
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研究论文 | 本研究通过谱系追踪、单细胞与空间转录组学等方法,在成年小鼠软脑膜中发现了一群神经嵴来源的多能细胞,并揭示了其在脑卒中后通过特定信号通路促进血管修复的作用机制 | 首次在成年哺乳动物软脑膜中发现并证实了胚胎神经嵴来源的多能细胞持续存在,并阐明了其在脑损伤后被重新激活、迁移至血管损伤部位并通过分泌多效蛋白等机制促进血管修复的全新生物学过程 | 研究目前仅限于小鼠模型,尚未在人类组织中验证;这些多能细胞在长期修复中的具体命运及其在其它神经系统疾病中的作用仍需进一步探索 | 探究成年大脑中是否存在胚胎神经嵴来源的残留多能细胞及其在脑卒中后血管修复中的潜在功能 | 成年小鼠软脑膜中的神经嵴来源多能细胞及其在缺血性脑卒中模型中的行为与功能 | 单细胞生物学与神经血管修复 | 脑卒中 | 神经嵴谱系追踪、单细胞转录组学、空间转录组学、相互作用组建模、活体成像 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、活体成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |