单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 35765 篇文献,本页显示第 2981 - 3000 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2981 2025-12-13
Application of computational algorithms for single-cell RNA-seq and ATAC-seq in neurodegenerative diseases
2025-Jan-15, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3
综述 本文综述了整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据的计算工具与机器学习方法,及其在神经退行性疾病中的应用 整合scRNA-seq和scATAC-seq数据以关联转录组与染色质可及性,揭示神经退行性疾病的致病机制 面临数据稀疏性和计算需求高的挑战 促进单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用,以阐明病理机制并识别治疗靶点 阿尔茨海默病和帕金森病等神经退行性疾病 机器学习 神经退行性疾病 scRNA-seq, scATAC-seq NA 单细胞转录组和染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
2982 2025-12-13
TIMP1 Mediates Astrocyte-Dependent Local Immunosuppression in Brain Metastasis Acting on Infiltrating CD8+ T Cells
2025-Jan-13, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脑转移中星形胶质细胞的异质性,并发现一个分泌TIMP1的星形胶质细胞亚群通过抑制浸润性CD8+ T细胞的抗肿瘤活性介导局部免疫抑制,为症状性脑转移患者的联合免疫治疗提供了新策略 首次利用单细胞RNA测序技术解析脑转移中星形胶质细胞的异质性,并鉴定出通过分泌TIMP1介导局部免疫抑制的pSTAT3+星形胶质细胞亚群及其对CD63+ CD8+ T细胞功能的调控机制 研究主要基于小鼠和人类脑转移模型,临床转化效果需进一步验证;TIMP1作为生物标志物的敏感性和特异性在更大样本中待评估 探究脑转移中星形胶质细胞介导的局部免疫抑制机制,以开发针对症状性脑转移的联合免疫治疗策略 脑转移中的星形胶质细胞和浸润性CD8+ T细胞 单细胞测序与免疫学 脑转移瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2983 2025-12-13
Mechanistic insights into GPAA1-mediated cold tumor phenotype and immune evasion in colorectal cancer: integrative multi-omics analysis and experimental validation
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据揭示了GPAA1在结直肠癌中的过表达及其通过基因组不稳定性和免疫抑制促进肿瘤进展的机制 首次系统分析了GPAA1在泛癌及结直肠癌中的表达模式,并揭示了其通过诱导基因组不稳定和免疫冷表型促进肿瘤进展的新机制 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内动物模型验证;样本来源多样可能引入批次效应 阐明GPAA1在结直肠癌中的表达模式、功能作用及其与免疫微环境的关系 结直肠癌组织和细胞系 多组学分析 结直肠癌 多组学整合分析、单细胞转录组学、空间转录组学、功能实验(增殖、迁移、侵袭) NA mRNA表达数据、蛋白质表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 来自TCGA、GTEx、GEO、HPA等多个公共数据库的结直肠癌样本 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq NA NA
2984 2025-12-13
Case Report: Blood single-cell analysis of a IVB high-grade serous ovarian cancer patient presenting a favorable prognosis
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
病例报告 本文报告了一例IVB期高级别浆液性卵巢癌患者,通过血液单细胞分析揭示其良好预后的潜在分子特征 采用多平台液体活检方法,结合血小板RNA测序、单细胞RNA测序和成像流式细胞术,全面分析血液成分,识别与预后相关的独特分子特征 本研究为单病例报告,样本量有限,结果需要更大规模研究验证 探索IVB期高级别浆液性卵巢癌患者良好预后的潜在驱动因素 一名IVB期高级别浆液性卵巢癌患者 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,成像流式细胞术 NA RNA测序数据,流式细胞术图像数据 1名患者的术前外周血样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2985 2025-12-13
Integrated Multi-Omic Analysis Reveals Causal Relationships and Causal Mechanisms of Peripheral Lymphocyte-Driven Remodeling in the Intrahepatic Immune Microenvironment of Early-Stage MAFLD
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化、批量RNA测序和单细胞RNA测序分析,揭示了外周淋巴细胞通过Cd5介导的炎症通路和Vcam1-Itgb1粘附通路驱动早期MAFLD肝内免疫微环境重塑的因果关系和机制 首次利用孟德尔随机化建立了外周淋巴细胞与MAFLD风险的单向因果关系,并通过单细胞RNA测序在MAFLD模型中鉴定出新的Itgb1⁺Cd5⁺Cd4⁺T细胞亚群及其与肝内Vcam1highMmp12⁺Kupffer细胞的相互作用机制 研究主要基于小鼠模型和公共数据集,需要在更大规模的人类队列中进行验证;因果关系推断依赖于孟德尔随机化假设 探究外周血细胞指标与早期MAFLD肝内免疫微环境重塑之间的因果关系和潜在机制 代谢功能障碍相关脂肪肝病(MAFLD)患者和小鼠模型 单细胞组学 代谢功能障碍相关脂肪肝病 孟德尔随机化分析,批量RNA测序,单细胞RNA测序 NA 基因组数据,转录组数据,单细胞转录组数据 小鼠模型和人类公共单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
2986 2025-12-13
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Microglial Heterogeneity and Functional States After Cerebral Ischemia-Reperfusion Injury
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脑缺血再灌注损伤后小胶质细胞的异质性和功能状态 识别了七个转录特征不同的小胶质细胞亚群,并发现ATF3作为核心调控因子,将CH25H介导的代谢变化与细胞因子驱动的神经炎症联系起来 研究基于大鼠模型,结果向人类转化需进一步验证 分析缺血性卒中中小胶质细胞的异质性、激活轨迹和代谢状态,以发现治疗靶点 缺血性和对照大鼠的脑组织 单细胞组学 缺血性卒中 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫组织化学 NA 单细胞RNA测序数据 未明确具体数量,但涉及缺血性和对照大鼠的脑组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2987 2025-12-13
Targeting SHCBP1 Inhibits Tumor Progression by Restoring Ciliogenesis in Ductal Carcinoma
2024-Dec-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究揭示了SHCBP1通过调控Rab8 GTPase活性影响中体残余物与中心体的接近,从而抑制导管癌中纤毛发生,并证明靶向SHCBP1可恢复纤毛发生并抑制肿瘤进展 首次发现SHCBP1通过调控Rab8 GTPase活性介导中体残余物与中心体接近,从而控制导管癌纤毛发生的新机制 研究主要基于动物模型和患者来源异种移植模型,尚未在人体临床试验中验证 阐明导管癌中纤毛缺失的机制及其临床意义,开发新的治疗策略 导管癌 肿瘤生物学 导管癌 单细胞转录组分析、基因敲除、患者来源异种移植模型 转基因小鼠模型、PDX模型 转录组数据、临床预后数据 大型患者队列及转基因小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2988 2025-12-13
Single-Cell RNA-Seq Reveals the Pseudo-temporal Dynamic Evolution Characteristics of ADSCs to Neuronal Differentiation
2024-Dec-11, Cellular and molecular neurobiology IF:3.6Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序揭示了脂肪来源基质细胞向神经元分化的伪时间动态演化特征 首次在单细胞分辨率下描绘了ADSCs向神经元分化的连续动态基因表达图谱,并识别出两个不同的细胞状态机制 研究仅基于体外诱导模型,未验证体内分化潜力;样本时间点覆盖有限,可能遗漏关键过渡状态 解析ADSCs向神经元分化的遗传特征与动态演化过程 脂肪来源基质细胞及其在不同诱导时间点(0、1、3、5、6、8小时)的衍生细胞 单细胞组学 神经退行性疾病(帕金森病相关) 单细胞RNA测序 伪时间轨迹分析(Monocle2) 单细胞转录组数据 38,453个细胞,涵盖8个时间点组别 BD Biosciences 单细胞RNA-seq BD Rhapsody BD Rhapsody单细胞分析平台
2989 2025-12-13
Mechanosensitive genomic enhancers potentiate the cellular response to matrix stiffness
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合全基因组表观基因组分析、表观基因组编辑及单细胞RNA-seq CRISPR筛选,鉴定了一类响应机械微环境的新型基因组增强子——机械增强子 首次系统鉴定并命名了响应细胞外基质硬度的“机械增强子”,并通过表观基因组编辑实现在刚性材料上模拟软材料环境的基因表达模式 未明确机械增强子在具体疾病模型中的完整调控网络及其临床转化路径 探究机械微环境如何通过表观遗传机制精确调控细胞转录与表型 基因组增强子、细胞机械响应通路 表观遗传学、细胞力学 NA 全基因组表观基因组分析、表观基因组编辑、单细胞RNA-seq CRISPR筛选 CRISPR筛选模型 表观基因组数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2990 2025-12-13
Determinants of Survival with Combined HER2 and PD-1 Blockade in Metastatic Esophagogastric Cancer
2023-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究探讨了在转移性食管胃癌中,联合使用HER2和PD-1阻断疗法(帕博利珠单抗、曲妥珠单抗和化疗)的生存决定因素,并评估了多种生物标志物和测序技术 通过整合89Zr-曲妥珠单抗PET、血浆循环肿瘤DNA动态监测和单细胞RNA测序,揭示了患者内基因组异质性对治疗反应的影响,并识别了与治疗抵抗相关的转录程序 研究基于相对较小的样本量(如MSK队列n=226),且为观察性研究,可能受限于回顾性数据分析和潜在的选择偏倚 识别转移性食管胃癌患者在接受HER2和PD-1联合阻断疗法时的预后生物标志物和抵抗机制 转移性食管胃癌患者,包括接受帕博利珠单抗、曲妥珠单抗和化疗联合治疗的患者以及MSK队列中的曲妥珠单抗治疗患者 数字病理学 食管胃癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、全外显子测序、循环肿瘤DNA(ctDNA)监测、89Zr-曲妥珠单抗PET成像 多变量Cox回归模型 影像数据(PET)、基因组数据(ctDNA、scRNA-seq、全外显子测序) MSK队列中226名曲妥珠单抗治疗患者,以及来自MSK和三星的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2991 2025-12-13
Dipeptidyl peptidase 4 inhibition sensitizes radiotherapy by promoting T cell infiltration
2023, Oncoimmunology IF:6.5Q1
研究论文 本研究揭示了放疗未能有效诱导T细胞浸润的机制,并提出通过抑制DPP4来增强放疗疗效的策略 首次发现树突状细胞在放疗后高表达DPP4是限制T细胞浸润的关键因素,并提出DPP4抑制剂联合放疗可增强抗肿瘤免疫 研究主要基于临床前模型,尚未在大型临床试验中验证;机制研究主要聚焦于DPP4对趋化因子的调控 探究放疗联合免疫治疗的增效机制,寻找增强放疗诱导抗肿瘤免疫应答的新策略 肺癌和黑色素瘤患者样本、肿瘤微环境中的免疫细胞 肿瘤免疫学 肺癌、黑色素瘤 单细胞测序 NA 转录组数据、临床数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2992 2025-12-13
The International Conference on Intelligent Biology and Medicine (ICIBM) 2018: systems biology on diverse data types
2018-12-21, BMC systems biology
会议摘要 本文介绍了2018年国际智能生物学与医学会议(ICIBM)的概况,并重点描述了会议中涉及系统生物学在多种数据类型上的研究进展 会议展示了系统生物学在3D基因组结构分析、下一代测序、计算药物发现、癌症基因组学等领域的创新进展,并涵盖了基因调控、环状RNA表达、单细胞RNA测序等多种数据类型 本文为会议摘要,未提供具体研究方法的详细描述或实验数据 总结ICIBM 2018会议中系统生物学在多样化数据类型上的研究进展和趋势 会议涵盖的论文和报告,涉及基因调控、环状RNA、单细胞RNA测序、染色体间相互作用、代谢组学、蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学等 系统生物学 癌症 下一代测序分析,单细胞RNA测序,代谢组学,蛋白质组学,磷酸化蛋白质组学 NA 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,代谢组数据,蛋白质组数据,磷酸化蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,下一代测序 NA NA
2993 2025-12-12
scRNA-sequencing Reveals Bu-Shen-Yi-Qi formula (BSYQF) ameliorates airway remodeling via regulating imbalanced M1/M2 macrophage subtypes in chronic asthmatic mice
2026-Feb-28, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了补肾益气方通过调节慢性哮喘小鼠体内失衡的M1/M2巨噬细胞亚型来改善气道重塑的机制 首次在单细胞分辨率上揭示了补肾益气方通过靶向调节M1和M2巨噬细胞亚型来恢复其失衡比例,从而改善慢性哮喘气道重塑的具体分子机制 研究基于小鼠模型,其结论在人体中的适用性有待进一步验证;样本量相对有限(8个样本) 探究补肾益气方治疗慢性哮喘的潜在分子机制 慢性哮喘小鼠模型 数字病理学 哮喘 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 免疫组织化学, 免疫荧光分析, qRT-PCR NA 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 图像数据 8个样本,超过60,000个小鼠肺组织细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2994 2025-12-12
Multi-omics analysis of ketogenic diet-mediated neural repair in spinal cord injury: Targeting of lysosomal autophagy through CTSB/LAMP2 regulation
2026-Feb, The Journal of nutritional biochemistry IF:4.8Q1
研究论文 本研究采用多组学方法探究生酮饮食通过调控CTSB/LAMP2轴促进脊髓损伤后神经修复的机制 首次整合4D蛋白质组学、转录组学和单细胞RNA测序,揭示生酮饮食通过靶向溶酶体自噬通路CTSB/LAMP2实现神经保护的双重机制 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人体中进行验证 探究生酮饮食在脊髓损伤后神经修复中的作用机制 C5半挫伤小鼠模型和β-羟基丁酸处理的BV2小胶质细胞 多组学分析 脊髓损伤 4D蛋白质组学, 转录组学, 单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 未明确样本数量的小鼠模型和BV2细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2995 2025-12-12
Leveraging mutual information in Variational Autoencoders for improved dimensionality reduction of single-cell RNA sequencing data: The scInfoMaxVAE approach
2026-Feb, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本文提出了一种名为scInfoMaxVAE的变分自编码器方法,通过最大化互信息和采用零膨胀计数似然,旨在改进单细胞RNA测序数据的降维和细胞类型分类 提出了一种结合互信息最大化与零膨胀计数似然的变分自编码器,专门针对scRNA-seq数据的稀疏性和技术噪声进行优化 模型对超参数敏感,且存在一定的运行间方差,建议未来进行自动调优和更大规模的验证 改进单细胞RNA测序数据的降维表示和细胞类型分类的鲁棒性与准确性 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 变分自编码器 基因表达数据 12个公共scRNA-seq数据集,涵盖多种组织和平台 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2996 2025-12-12
Multiomics data reveal microglia's promotion for choroidal neovascularization in endothelial cells
2026-Jan, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究通过多组学数据分析揭示了小胶质细胞通过上调CSRP2并激活VEGF和TGF-β信号通路,促进脉络膜内皮细胞血管生成,从而驱动脉络膜新生血管(CNV)的病理进程 首次通过整合组织、血液样本的单细胞RNA测序分析,并结合体外实验验证,明确了CSRP2作为关键生物标志物在小胶质细胞-内皮细胞互作中的核心调控作用 研究主要依赖于GEO数据库的公共数据,样本来源可能有限;体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂的微环境 阐明脉络膜新生血管(CNV)进展中视网膜和RPE/脉络膜复合体内的特定细胞类型及其分子机制,并探索下游效应物CSRP2的表达变化 年龄相关性黄斑变性(AMD)引起的CNV患者及健康对照者的视网膜组织、RPE/脉络膜复合体和血液样本 数字病理学 年龄相关性黄斑变性 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析, 免疫浸润分析, 基因集富集分析, 体外共培养实验 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 来自GEO数据库的湿性AMD患者和健康对照者的组织与血液样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2997 2025-12-12
Commentary: Toward a global atlas of ocular surface biology: Rationale, design, and clinical applications
2026-Jan, Experimental eye research IF:3.0Q1
评论 本文提出并阐述了构建全球眼表生物学图谱的倡议,包括其基本原理、设计框架和临床转化应用 首次提出并系统规划了针对眼表这一复杂组织的全球性多组学图谱构建计划,整合了单细胞、空间组学及泪液分析技术,并制定了明确的临床转化路线图和决策节点 本文为倡议和框架性论述,尚未展示实际数据或验证结果,其可行性和最终效果有待后续研究证实 构建一个全面、高分辨率的眼表生物学参考图谱,以推动精准眼科的发展,实现基于机制的疾病分型和个性化干预 眼表组织(包括角膜、结膜、泪膜装置),涵盖健康和疾病状态 数字病理学 眼科疾病(如干眼症、圆锥角膜、角膜移植排斥) sc/snRNA-seq, ATAC-seq, 空间转录组学, 泪液蛋白质组学/代谢组学 NA 多组学数据(转录组、表观基因组、空间信息、蛋白质组、代谢组) NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
2998 2025-12-12
Insights and advancements in molecular biology techniques in ophthalmology
2026-Jan, Experimental eye research IF:3.0Q1
综述 本文综述了眼科领域分子生物学技术的最新进展,包括下一代测序、单细胞分析和空间转录组学等,及其在疾病机制解析、生物标志物发现和个性化医疗中的应用 整合了下一代测序、单细胞分析和空间转录组学等前沿技术,提供了高分辨率的细胞异质性和空间转录景观分析,推动了眼科疾病分子机制的深入理解和个性化医疗的发展 NA 综述眼科分子生物学技术的最新进展,以增强对眼部疾病分子机制的理解,并促进非侵入性诊断、疾病监测和靶向治疗的发展 眼部疾病及其相关的分子机制、生物标志物(如蛋白质、代谢物、非编码RNA) 分子生物学 眼部疾病 下一代测序技术、单细胞分析、空间转录组学、流式细胞术、质谱分析、代谢组学 NA 分子数据(如测序数据、蛋白质数据、代谢物数据) NA NA 下一代测序、单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
2999 2025-12-12
Chronic intermittent cold stress-induced lipophagy promotes foamy macrophage susceptibility to ferroptosis and exacerbates atherosclerosis
2026-Jan, Free radical biology & medicine
研究论文 本研究揭示了慢性间歇性冷应激通过诱导泡沫巨噬细胞铁死亡而加剧动脉粥样硬化的分子机制 首次阐明了冷应激通过促进皮质酮释放,激活糖皮质激素受体诱导过度脂噬,进而协同ALOX15介导的脂质过氧化和P62/KEAP1/NRF2/GPX4通路抑制,导致泡沫巨噬细胞铁死亡,从而加剧动脉粥样硬化的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,其在人体中的直接适用性尚需进一步验证 探究慢性间歇性冷应激是否通过诱导泡沫巨噬细胞铁死亡来促进动脉粥样硬化,并阐明其涉及的分子通路 高脂饮食喂养的ApoE缺陷小鼠、泡沫巨噬细胞 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序、免疫荧光、电子显微镜分析 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3000 2025-12-12
The influence of oxygen concentration on the fate determination of retinal ganglion cells
2026-Jan, Experimental eye research IF:3.0Q1
综述 本文综述了氧气浓度对视网膜神经节细胞命运决定的影响及其机制,并比较了常用动物模型和人类类器官模型在模拟体内视网膜发育中的效果 强调了利用微流控和类器官芯片等先进技术精确调控氧气水平,并结合单细胞转录组学和CRISPR/Cas9基因组编辑等新技术以增强机制研究深度 NA 探讨氧气浓度对视网膜神经节细胞命运决定的影响及其机制 视网膜神经节细胞 NA 视神经疾病 单细胞转录组学, CRISPR/Cas9基因组编辑, 遗传扰动, 细胞成像 NA NA NA NA NA NA NA
回到顶部