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当前共找到 43756 篇文献，本页显示第 29741 - 29760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 29741 | 2024-08-04 |
An integrated single-cell RNA-seq map of human neuroblastoma tumors and preclinical models uncovers divergent mesenchymal-like gene expression programs
2024-06-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03309-4
PMID:38898465
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研究论文 | 本研究生成了神经母细胞瘤细胞系、患者衍生异种移植模型及基因工程小鼠模型的单细胞RNA-seq图谱 | 提出了一种无监督机器学习方法(acNMF)来比较临床与前临床模型中的基因表达程序 | 未详细研究弱表达的间充质样基因表达与药物耐受机制之间的关系 | 更好地理解患者肿瘤异质性与前临床模型之间的关系 | 聚焦于神经母细胞瘤细胞系及其前临床模型的基因表达程序 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq | 无监督机器学习模型 | 基因表达数据 | 涉及多种细胞系、患者衍生异种移植模型及基因工程小鼠模型的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 29742 | 2024-08-05 |
Soluble PD-L1 reprograms blood monocytes to prevent cerebral edema and facilitate recovery after ischemic stroke
2024-02, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.12.007
PMID:38070624
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研究论文 | 这篇文章探讨了可溶性PD-L1如何通过重新编程血液单核细胞来预防脑水肿并促进缺血性中风后的恢复。 | 相关研究首次展示了PD-1阳性单核细胞作为sPD-L1的治疗靶点的潜力。 | 研究在小鼠模型中进行，实际临床应用的效果和安全性仍需进一步验证。 | 研究PD-L1在急性缺血性中风恢复中的治疗潜力。 | 研究对象为急性缺血性中风患者的循环单核细胞以及小鼠模型。 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | 小鼠中动脉闭塞（MCAO）模型 | 生物样本 | 涉及人类患者和小鼠模型，具体样本量未列明 | NA | NA | NA | NA |
| 29743 | 2024-08-04 |
Deciphering the shared mechanisms of Gegen Qinlian Decoction in treating type 2 diabetes and ulcerative colitis via bioinformatics and machine learning
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1406149
PMID:38962743
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研究论文 | 本研究探讨了葛根芩莲汤在治疗2型糖尿病和溃疡性结肠炎中的共享机制 | 揭示了T2DM和UC之间的共病机制，并识别了新的生物标志物和治疗策略 | 缺乏临床试验数据以验证研究结果 | 探究T2DM与UC之间的共享致病机制，并阐明葛根芩莲汤的作用机制 | 研究对象包括2型糖尿病和溃疡性结肠炎的相关靶点 | 生物信息学 | 2型糖尿病, 溃疡性结肠炎 | 生物信息学和机器学习 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29744 | 2024-08-04 |
SlowMoMan: a web app for discovery of important features along user-drawn trajectories in 2D embeddings
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae095
PMID:38962404
|
研究论文 | 本文提出了SlowMoMan，一个Web应用程序，用于发现用户绘制的二维嵌入中的重要特征 | 该应用程序解决了非线性低维嵌入与原始高维数据之间关系的难题，并提供了一种可视化和排序功能 | 未提及具体的限制 | 研究如何在二维嵌入中识别和排序重要特征 | 研究对象包括轨迹推断、空间转录组学和细胞分类等应用场景 | 计算机视觉 | NA | 非线性低维嵌入 | NA | 高维数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29745 | 2024-08-04 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, Mendelian randomization, and eQTL reveals T cell-related nomogram model and subtype classification in rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1399856
PMID:38962008
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研究论文 | 本文整合多重数据集，探讨类风湿性关节炎（RA）中T细胞的异质性及其相关的诊断模型 | 建立了一种与T细胞相关的诊断模型，提供了RA免疫治疗的新方法 | 研究未提及样本的年龄或性别对不同T细胞模式的影响 | 探讨类风湿性关节炎中的T细胞机制及其分类 | 研究对象为582个与类风湿性关节炎相关的T细胞亚型 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | scRNA-seq、bulk RNA-seq、孟德尔随机化（MR）和eQTL | XGB机器学习 | 细胞数据 | 分析了10,211个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 29746 | 2024-08-05 |
Activation of non-classical Wnt signaling pathway effectively enhances HLA-A presentation in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1336106
PMID:38962268
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研究论文 | 本研究识别了急性淋巴细胞白血病（AML）中造血干细胞前体（HSC-Prog）的克隆异质性，并探讨了与AML免疫逃逸相关的分子通路 | 首次揭示非经典Wnt信号通路在AML中与HLA-A呈现的关系 | 未明确涉及样本的多样性或实验结果的临床应用 | 识别AML中造血干细胞前体的克隆异质性并探讨与免疫逃逸相关的分子机制 | 急性髓性白血病（AML）患者的造血干细胞前体 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、大规模RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA（mRNA） | 样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 29747 | 2024-08-05 |
Elucidating the role of angiogenesis-related genes in colorectal cancer: a multi-omics analysis
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1413273
PMID:38962272
|
研究论文 | 本研究通过综合多组学分析阐明了血管生成相关基因在结直肠癌中的重要性 | 研究中识别了结直肠癌中的两种血管生成相关亚型及其四个关键基因，为个性化治疗提供了新见解 | 在基因突变与亚型的关联方面未发现显著性 | 探索血管生成相关基因在结直肠癌中的作用及其机制 | 结直肠癌患者及其血管生成相关基因的表达 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RT-PCR, scRNA-seq | LASSO, Xgboost, 决策树 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29748 | 2024-08-05 |
Border-associated macrophages mediate the neuroinflammatory response in an alpha-synuclein model of Parkinson disease
2023-06-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39060-w
PMID:37365181
|
研究论文 | 这篇文章探讨了边界相关巨噬细胞在帕金森病α-突触核蛋白模型中的神经炎症反应中的作用 | 揭示了边界相关巨噬细胞在神经炎症反应中的关键作用，尤其是在抗原呈递和CD4 T细胞反应中的独特地位 | 尚不清楚边界相关巨噬细胞在其他神经退行性疾病中的作用 | 研究边界相关巨噬细胞在帕金森病神经炎症中的作用 | 边界相关巨噬细胞以及它们在α-突触核蛋白引发的神经炎症中的角色 | 数字病理 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 从后期死亡的帕金森病大脑中关于巨噬细胞和T细胞的位置特征进行的研究 | NA | NA | NA | NA |
| 29749 | 2024-08-05 |
High-throughput total RNA sequencing in single cells using VASA-seq
2022-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01361-8
PMID:35760914
|
研究论文 | 本文开发了VASA-seq技术，以检测单细胞中的整体转录组 | VASA-seq能够捕获所有RNA分子的总转录组，克服了传统方法无法检测许多长非编码 RNA及非多腺苷酸化转录本的限制 | 本文未提到具体的限制因素 | 研究单细胞转录组，并分析不同发育阶段的RNA动态 | 在小鼠胚胎的胚胎发生和器官发生早期阶段研究超过30,000个单细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA数据 | 超过30,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 29750 | 2024-08-05 |
Estimation of tumor cell total mRNA expression in 15 cancer types predicts disease progression
2022-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01342-x
PMID:35697807
|
研究论文 | 本文提出了一种从肿瘤样本中量化特定肿瘤总mRNA表达的方法 | 该研究开发了一种考虑转录物比例、纯度和倍性的新方法，以量化肿瘤特异性总mRNA表达 | 技术和分析挑战仍然存在，可能会影响大规模的全癌症总mRNA内容检查 | 研究总mRNA表达与肿瘤表型和临床结果之间的关系 | 6,590个患者肿瘤，涵盖15种癌症类型 | 数字病理学 | NA | bulk sequencing | NA | 转录组数据 | 6,590例患者肿瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 29751 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA Sequencing: Technological Progress and Biomedical Application in Cancer Research
2024-Jul, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-023-00777-0
PMID:37322261
|
综述 | 本文总结了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术及其在癌症研究中的应用 | 强调了scRNA-seq在肿瘤异质性分析和个性化医学中的潜在应用 | 未提及具体的技术局限性 | 探讨单细胞RNA测序在癌症研究中的应用和技术进展 | 单细胞RNA测序技术及其对癌症和疾病的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29752 | 2024-08-04 |
Comprehensive investigation of malignant epithelial cell-related genes in clear cell renal cell carcinoma: development of a prognostic signature and exploration of tumor microenvironment interactions
2024-Jul-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05426-x
PMID:38951896
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研究论文 | 本文全面研究了透明细胞肾细胞癌中的恶性上皮细胞相关基因及其临床相关性 | 建立了一个预后模型MECRGS，并在多个队列中显示出优越的预测性能 | 未提及具体的样本来源和大小 | 探讨恶性上皮细胞相关基因在透明细胞肾细胞癌中的功能和临床相关性 | 透明细胞肾细胞癌中的219个恶性上皮细胞相关基因 | 数字病理 | 肾癌 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29753 | 2024-08-05 |
Combining single-cell and bulk RNA sequencing, NK cell marker genes reveal a prognostic and immune status in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-07-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65917-1
PMID:38951569
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研究论文 | 该研究探讨了NK细胞标记基因与胰腺导管腺癌患者的预后和免疫反应之间的关系 | 本研究首次通过构建NK细胞标记基因的签名预测胰腺癌患者的预后，并与免疫状态显示了强相关性 | 本研究的局限性在于样本主要依赖于公开数据库，可能存在选择偏倚 | 研究NK细胞在胰腺导管腺癌中的作用及其对患者预后的影响 | 研究胰腺导管腺癌患者中的NK细胞标记基因及其相关性 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和RNA测序 | Cox分析 | 基因表达数据 | 纳入7个NK细胞标记基因，验证了6个GEO数据集的预测能力 | NA | NA | NA | NA |
| 29754 | 2024-08-04 |
Advances in single-cell long-read sequencing technologies
2024-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae047
PMID:38774511
|
综述 | 本文讨论了单细胞长读长测序技术的最新进展 | 提供了针对细胞复杂性来源的新见解，并强调了单细胞RNA异构体测序(scRiso-seq)的显著进展 | 主要集中在下游分析的实际考虑和操作挑战上 | 探讨单细胞测序技术在转录组和基因组研究中的应用 | 长读长测序技术在单细胞中的应用 | 数字病理学 | NA | 长读长测序 | NA | RNA和DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29755 | 2024-08-04 |
scRNA-seq Reveals Novel Genetic Pathways and Sex Chromosome Regulation in Tribolium Spermatogenesis
2024-03-02, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evae059
PMID:38513111
|
研究论文 | 该研究揭示了赤面粉甲虫中生殖细胞发生的新遗传通路和性染色体调控机制 | 首次展示了棉果科昆虫中生殖细胞发生的特异性标记和分子通路 | 研究主要集中在非模式生物，可能缺乏与已知编码分子的直接比较 | 探索赤面粉甲虫的生殖细胞发生过程及其分子基础 | 研究对象为赤面粉甲虫的成年雄性睾丸中的细胞群体 | 数字病理 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年雄性赤面粉甲虫的睾丸样本 | NA | NA | NA | NA |
| 29756 | 2024-08-05 |
Tyrosine Kinase Inhibition Activates Intratumoral γδ T Cells in Gastrointestinal Stromal Tumor
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0061
PMID:37922405
|
研究论文 | 本研究探讨酪氨酸激酶抑制对胃肠道间质瘤中γδ T细胞的影响 | 发现酪氨酸激酶抑制能够进一步刺激肿瘤内γδ T细胞，并揭示其在免疫疗法中的潜在靶向作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的生物反应 | 探讨酪氨酸激酶抑制对胃肠道间质瘤中γδ T细胞的作用机制 | 使用转基因小鼠模型研究γδ T细胞及其在胃肠道间质瘤中的作用 | 数字病理学 | 胃肠道间质瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 包括转基因小鼠模型和新鲜人类胃肠道间质瘤标本 | NA | NA | NA | NA |
| 29757 | 2024-08-04 |
ENGEP: advancing spatial transcriptomics with accurate unmeasured gene expression prediction
2023-12-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03139-w
PMID:38129866
|
研究论文 | 本研究介绍了ENGEP，这是一个基于集成学习的工具，用于在空间转录组数据中预测未测量的基因表达 | ENGEP能够通过多个单细胞RNA测序数据集作为参考，准确预测未测量的基因表达，超越了当前的先进工具 | 本文未提及具体的限制 | 旨在提高空间转录组技术的基因表达预测能力 | 研究对象为空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习 | 转录组数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 29758 | 2024-08-04 |
An information theoretic approach to detecting spatially varying genes
2023-06-26, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100507
PMID:37426750
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研究论文 | 本文采用信息论方法检测空间变异基因的表达模式 | 提出了一种新的算法Maxspin，以提高空间转录组技术的准确性和可扩展性 | 未提及具体的局限性 | 识别具有空间变异表达模式的基因 | 肾细胞癌样本中的空间转录组数据 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 空间转录组技术 | Maxspin | 空间转录组数据 | 肾细胞癌样本的空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 29759 | 2024-08-05 |
Intracellular pH dynamics regulates intestinal stem cell lineage specification
2023-06-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39312-9
PMID:37353491
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研究论文 | 本文报告了细胞内pH动态对成人干细胞谱系特征的调节作用 | 发现细胞内pH梯度在小鼠小肠隐窝中存在，并与干细胞谱系特征关联 | 实验主要基于小鼠模型，可能对人类的适用性存在局限性 | 探讨细胞内pH动态在成人干细胞谱系特征中的作用 | 小鼠小肠中的隐窝干细胞及其谱系特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29760 | 2024-08-05 |
ITGA3 acts as a purity-independent biomarker of both immunotherapy and chemotherapy resistance in pancreatic cancer: bioinformatics and experimental analysis
2023-Jun-04, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01122-z
PMID:37270717
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研究论文 | 该文章研究了ITGA3在胰腺癌中作为化疗和免疫治疗抗药性的生物标志物的作用 | 提出ITGA3作为与胰腺癌化疗和免疫治疗抗药性相关的独立生物标志物 | 不同癌症类型之间的异质性可能影响结果的普遍适用性 | 探讨整合素超家族基因在胰腺癌治疗抗药性中的作用 | 胰腺癌患者的整合素超家族基因及其与治疗抗药性的关联 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA测序、机器学习 | Cox回归模型 | 多组学数据 | 30个整合素超家族基因的组分析数据 | NA | NA | NA | NA |