单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 35765 篇文献，本页显示第 2921 - 2940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2921 | 2025-12-14 |
Establishment and transcriptomic characterization of canine organoids from multiple tissues
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1680376
PMID:41378311
|
研究论文 | 本文报道了从两只遗传相关犬只的多个组织中建立并转录组学表征犬类器官样细胞系的研究 | 首次从两只遗传相关犬只的多个组织中建立并全面表征犬类器官样细胞系，包括子宫内膜、胰腺、膀胱、肾脏、肺和肝脏，并利用scRNA-seq识别器官样特异性转录组特征 | 仅使用两只遗传相关犬只的样本，样本量较小，可能限制结果的普遍性 | 建立犬类器官样细胞系平台，以加速药物测试、疾病建模和个性化医学研究，减少对活体动物实验的依赖 | 犬类器官样细胞系，包括子宫内膜、胰腺、膀胱、肾脏、肺和肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 免疫组织化学，bulk RNA-seq，scRNA-seq | NA | 转录组数据，图像数据 | 两只遗传相关犬只（B816和B818）的六个组织器官样细胞系 | NA | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 2922 | 2025-12-14 |
Optimised dissociation and multimodal profiling of prostate cancer stroma reveal fibromuscular cell heterogeneity with clinical correlates
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1653780
PMID:41378308
|
研究论文 | 本研究通过优化组织解离方案并结合单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫荧光等多模态分析，深入表征了前列腺癌基质中纤维肌细胞的异质性及其临床相关性 | 开发了一种优化的组织解离方案，显著提高了基质细胞的回收率和活性，并首次通过多模态整合分析识别出具有空间分布和预后意义的、临床相关的纤维肌细胞亚群，包括与不良预后相关的周细胞和一种与基质活化相关的新型平滑肌细胞亚群 | 未在摘要中明确说明研究的局限性 | 更好地表征前列腺癌肿瘤微环境中作为主要组织驻留基质细胞亚型的成纤维细胞和平滑肌细胞群体 | 前列腺癌组织中的纤维肌基质细胞（成纤维细胞和平滑肌细胞） | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 组织解离, 体外培养 | 降维与聚类分析 | 单细胞转录组数据, 流式细胞计数数据, 免疫组织化学图像 | 未在摘要中明确说明具体样本数量，但涉及良性和恶性样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2923 | 2025-12-14 |
Supervised Screening of EGFR Inhibitors Validated through Computational Structural Biology Approaches
2024-Dec-12, ACS medicinal chemistry letters
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acsmedchemlett.4c00385
PMID:39691517
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与机器学习方法，筛选并验证了针对乳腺癌中EGFR过表达的有效抑制剂 | 结合多组学数据（CCLE、GDSC、scRNA-seq）与机器学习相似性搜索，并通过计算结构生物学方法验证候选化合物的分子相互作用和构象动力学 | 研究主要基于计算和体外数据，缺乏体内实验验证和临床前模型评估 | 识别和验证针对乳腺癌EGFR过表达的有效治疗化合物 | 乳腺癌细胞系数据、ChEMBL数据库中的化合物 | 计算生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、机器学习建模 | 支持向量机（SVM）、人工神经网络（ANN）、随机森林（RF） | 多组学数据（基因表达、药物敏感性）、化学化合物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2924 | 2025-12-13 |
Multi-Omics discovery and clinical validation of IGFBP2, B2M, and CST3 as a serum biomarker panel for diabetic kidney disease progression
2026-Feb-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149858
PMID:41167578
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序与血清蛋白质组学数据，发现并验证了IGFBP2、B2M和CST3作为糖尿病肾病进展的血清生物标志物组合 | 首次通过整合单细胞转录组与血清蛋白质组学数据，系统性地识别并验证了一个用于糖尿病肾病进展诊断的非侵入性三标志物组合，并探索了其作为治疗靶点的潜力 | 临床样本量相对有限（n=139），且主要基于观察性数据，需要更大规模的前瞻性队列研究进一步验证其临床效用 | 开发一种用于糖尿病肾病进展诊断和监测的新型非侵入性生物标志物组合 | 糖尿病肾病患者、健康对照者、小鼠模型以及相关的肾脏组织和血清样本 | 生物信息学与多组学整合分析 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、血清蛋白质组学、bulk RNA-seq、分子对接 | LASSO回归模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、bulk RNA-seq数据、临床血清样本数据 | 30人（肾脏组织scRNA-seq：18名健康，12名DKD）；139人（临床血清验证）；16只小鼠（STZ诱导模型）；外加独立bulk RNA-seq队列（Nephrectomy和Nephroseq） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 2925 | 2025-12-13 |
Recent insights in the development and functions of insect hemocytes
2026-Feb, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2025.101434
PMID:40962030
|
综述 | 本文综述了昆虫血细胞发育和功能的最新研究进展，重点探讨了血细胞分化、增殖及免疫响应中的转录因子和信号通路 | 整合了单细胞RNA测序技术揭示血细胞群体过渡状态基因表达变化，并扩展了对固着血细胞功能的理解 | NA | 总结昆虫血细胞在细胞免疫中的发育机制和功能调控 | 果蝇、蚊子和鳞翅目昆虫的血细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2926 | 2025-12-13 |
Recent advances and applications of single-cell sequencing in insects
2026-Feb, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2025.101455
PMID:41173389
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在昆虫科学中的最新进展与应用，强调了该技术如何推动昆虫生物学从描述性研究转向功能性和机制性研究 | 整合了单细胞多组学技术和空间转录组学的最新进展，结合深度学习方法，为昆虫生物学提供了前所未有的分子动态和细胞多样性视角 | NA | 回顾单细胞基因组学在昆虫科学中的进展，探讨其在昆虫生理、发育、免疫和进化研究中的应用前景 | 昆虫 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序，单细胞多组学，空间转录组学 | 深度学习算法 | 转录组、表观基因组、蛋白质组、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 2927 | 2025-12-13 |
Pharmacovigilance-Based Identification and Mechanistic Exploration of Periodontitis-Related Drugs
2026-Jan, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70040
PMID:40957584
|
研究论文 | 本研究利用药物警戒数据、孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，识别与牙周炎相关的药物并探索其潜在分子机制 | 首次结合大规模真实世界药物警戒数据、孟德尔随机化因果推断和单细胞RNA测序技术，系统性地探索药物与牙周炎风险的关联及其细胞类型特异性分子机制 | 研究主要基于观察性数据和遗传学关联，需要进一步的实验研究来确认因果关系 | 识别与牙周炎风险相关的药物并探索其潜在的分子机制 | 牙周炎患者、药物不良反应报告数据、遗传学数据和单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 牙周炎 | 药物警戒数据挖掘、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | 逻辑回归、信号检测算法、通路富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 药物不良反应报告、遗传学数据、单细胞转录组数据 | 来自FAERS数据库的药物不良反应报告、UKB-PPP和deCODE队列的遗传学数据、牙周炎患者牙龈组织和外周血的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2928 | 2025-12-13 |
Ubiquitylation-oxaliplatin-related prognosis signature reveals the landscapes of immune responses, cell communication, and therapeutic sensitivity for colorectal cancer
2026-Jan-01, Anti-cancer drugs
IF:1.8Q3
DOI:10.1097/CAD.0000000000001778
PMID:41191789
|
研究论文 | 本研究构建了一个泛素化-奥沙利铂耐药相关风险评分模型，用于预测结直肠癌患者的免疫反应、细胞通讯和治疗敏感性 | 首次整合泛素化修饰与奥沙利铂耐药性，通过单细胞RNA测序识别耐药细胞群体，并发现USP7在结直肠癌增殖、侵袭和耐药中的关键作用 | 研究主要基于转录组数据，缺乏体内实验验证，且样本来源可能限制模型的普适性 | 揭示泛素化在结直肠癌奥沙利铂耐药中的作用，并开发预测模型以指导治疗策略 | 结直肠癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，药物敏感性预测 | 风险评分模型 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的结直肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2929 | 2025-12-13 |
Hypoxia-induced regional heterogeneity in proliferative vitreoretinopathy: implications for targeted therapies
2026-Jan, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6494
PMID:41215615
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和免疫荧光染色揭示了增殖性玻璃体视网膜病变（PVR）在视网膜不同位置具有不同的细胞病理学特征，并发现缺氧诱导的区域异质性是其病理机制，为靶向治疗提供了新策略 | 首次利用单细胞测序技术结合免疫荧光染色，系统揭示了PVR在视网膜不同区域（视网膜前和视网膜下）的细胞组成差异，并明确了缺氧作为统一驱动因素但下游通路选择不同，提出了基于解剖位置的靶向治疗新思路 | 研究主要基于手术切除的PVR膜样本和小鼠模型，可能无法完全反映人类疾病的全貌；样本量相对有限，且未详细探讨长期治疗效果 | 探究增殖性玻璃体视网膜病变（PVR）的病理机制，特别是区域异质性，以开发更有效的靶向治疗方法 | 手术切除的PVR膜样本以及dispase诱导视网膜损伤的小鼠模型 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞测序，免疫荧光染色 | NA | 单细胞测序数据，图像数据 | 未明确指定样本数量，但涉及手术切除的PVR膜样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2930 | 2025-12-13 |
Spatial Transcriptomic Assessments of Gene Expression Profiles in Human Peri-Implant Lesions
2026-Jan, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70008
PMID:41077421
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学、RNA测序和免疫组织化学分析人类牙种植体周围炎病变的基因表达谱 | 首次在人类牙种植体周围炎病变中应用空间转录组学技术，结合RNA测序和免疫组织化学，揭示基因簇与特定组织区域的关联及生物通路失调 | 样本量较小（空间转录组学n=4，RNA测序n=20，免疫组织化学n=38），且仅针对严重牙种植体周围炎病例，可能限制结果的普遍性 | 分析有或无牙种植体周围炎的牙种植体部位人类组织样本的基因表达谱 | 从患有严重牙种植体周围炎的患者及无牙种植体周围炎迹象的相邻参考种植体获取的软组织活检样本 | 数字病理学 | 牙种植体周围炎 | 空间转录组学，RNA测序，免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据，RNA测序数据，免疫组织化学图像 | 空间转录组学样本4个，RNA测序样本20个，免疫组织化学样本38个 | NA | 空间转录组学，RNA测序 | NA | NA |
| 2931 | 2025-12-13 |
Mechanosensitive genomic enhancers potentiate the cellular response to matrix stiffness
2025-Dec-11, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adl1988
PMID:40997217
|
研究论文 | 本研究通过整合全基因组表观基因组分析、表观基因组编辑及单细胞RNA测序CRISPR筛选，发现并验证了一类响应机械微环境的基因组增强子，即“机械增强子”，它们能调节细胞功能并影响疾病相关基因 | 首次系统性地识别并验证了响应基质硬度的基因组增强子，通过表观基因组编辑技术重编程细胞对机械微环境的响应，为机械驱动疾病的精准靶向提供了新策略 | 研究主要基于体外细胞模型和有限的人类肺成纤维细胞样本，体内验证和更广泛疾病模型的适用性尚需进一步探索 | 探究机械微环境如何通过表观遗传机制调控基因表达和细胞表型，以识别新型机械响应增强子 | 人类肺成纤维细胞（来自健康和纤维化供体）及相关的基因组增强子区域 | 表观遗传学 | 肺纤维化 | 全基因组表观基因组分析、表观基因组编辑、单细胞RNA测序CRISPR筛选 | CRISPR筛选 | 基因组和转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2932 | 2025-12-13 |
Comparative analysis of human and mouse ovaries across age
2025-Dec-11, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx0659
PMID:41066539
|
研究论文 | 本文通过三维成像、单细胞转录组学和功能研究，比较了人类和小鼠卵巢在年龄变化中的差异 | 首次系统比较了人类和小鼠卵巢在转录和信号传导方面的物种特异性差异及年龄相关变化，并识别了卵巢交感神经和胶质细胞的作用 | 研究可能受限于样本数量或物种间生物学差异的复杂性，未详细探讨所有潜在机制 | 比较人类和小鼠卵巢的生物学特性，以评估小鼠作为人类卵巢生物学模型的适用性 | 人类和小鼠的卵巢组织 | 数字病理学 | NA | 三维成像, 单细胞转录组学 | NA | 图像, 转录组数据 | 未指定具体样本数量，但涉及人类和小鼠卵巢 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2933 | 2025-12-13 |
Diabetes exacerbates destructive inflammation by activating theCD137L-CD137 axis in dendritic and γδ T-cells
2025-Dec-11, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI193289
PMID:41379565
|
研究论文 | 本研究揭示了糖尿病通过激活树突状细胞和γδ T细胞中的CD137L-CD137轴，加剧牙周病等细菌感染中破坏性炎症反应的关键机制 | 首次在单细胞水平上鉴定出高血糖驱动的CD137L-CD137轴是糖尿病加剧炎症性组织破坏的关键介质，并通过抗体抑制和基因敲除实验验证了其核心作用 | 研究主要聚焦于牙周病模型，其他糖尿病相关并发症中的普适性有待进一步验证；人类样本的验证深度可能有限 | 探究糖尿病如何加剧细菌感染（如牙周病）中的炎症反应，并寻找潜在的治疗靶点 | 小鼠模型和人类研究中的树突状细胞、γδ T细胞及牙周组织 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2934 | 2025-12-13 |
CXCR6 defines a distinct resident state in γδ T cells for protecting from liver cirrhosis
2025-Dec-11, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001643
PMID:41380134
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，揭示了肝脏中CD69⁺CXCR6⁺ γδ T细胞在保护肝脏免受肝硬化过程中的关键作用 | 首次明确了CXCR6⁺ γδ T细胞作为肝脏组织驻留记忆T细胞的一个独特亚群，通过FasL-Fas信号通路诱导肝星状细胞凋亡，从而限制纤维化进展 | 研究主要在动物模型中进行，其结论在人类患者中的直接适用性仍需进一步验证 | 探究组织驻留记忆T细胞，特别是γδ T细胞，在肝纤维化发生和发展中的作用机制 | 小鼠肝脏组织、肝脏中的γδ T细胞亚群、肝星状细胞 | 免疫学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2935 | 2025-12-13 |
Spatial transcriptomics defines the molecular progression, invasion and immune landscape of IPMN and IPMN-derived pancreatic cancer
2025-Dec-11, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336117
PMID:41381181
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，定义了IPMN及其衍生的胰腺癌的分子进展、侵袭和免疫景观 | 首次通过空间全转录组分析，揭示了IPMN不同级别和亚型的分子与免疫特征，并识别出与侵袭潜力相关的关键标志物 | 样本量相对较小（12例患者用于空间分析），可能限制结果的普适性 | 表征IPMN的分子和免疫特征，以改善风险分层和靶向干预 | IPMN患者及IPMN相关浸润性癌（IPMN-IC）的组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间全转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | 12例患者用于空间分析，43例患者用于验证 | NA | 空间转录组学 | Digital Spatial Profiling | NA |
| 2936 | 2025-12-13 |
Declining FXR expression coordinates neonatal beta cell mass development with microbial bile acid metabolism maturation in mice
2025-Dec-11, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06618-w
PMID:41381886
|
研究论文 | 本研究揭示了新生儿胰岛β细胞中FXR表达下降与肠道微生物胆汁酸代谢成熟之间的协调机制，对维持正常β细胞发育和血糖稳态至关重要 | 首次发现β细胞FXR表达在出生后生理性下降是适应微生物代谢成熟的关键程序，并鉴定Casp6为FXR下游关键靶点，在人类糖尿病中验证了其病理相关性 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证样本量有限，抗生素干预可能影响整体微生物组 | 阐明微生物胆汁酸代谢和FXR信号在新生儿β细胞发育中的精确作用 | 小鼠胰岛β细胞、肠道微生物组、人类胰岛组织 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、谱系追踪、孟德尔随机化、蛋白质组学分析 | 基因修饰小鼠模型（βFxrKI） | 单细胞转录组数据、表观基因组数据、蛋白质组数据、生理指标数据 | 小鼠发育不同阶段样本、人类胰岛供体样本（含糖尿病与非糖尿病对照） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2937 | 2025-12-13 |
Single-cell spatiotemporal transcriptomic and chromatin accessibility profiling in developing postnatal human and macaque prefrontal cortex
2025-Dec-11, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02150-7
PMID:41381947
|
研究论文 | 本研究构建了人类和猕猴出生后前额叶皮层发育的单细胞时空转录组和染色质可及性图谱，揭示了物种特异性动态轨迹和关键调控网络 | 首次在单细胞分辨率下比较人类和猕猴出生后前额叶皮层发育的基因表达、染色质可及性和空间转录组，识别了人类特有的调控程序和延长发育期的相关因素 | NA | 理解人类前额叶皮层发育的细胞和分子特征，以揭示认知能力和神经精神疾病易感性的基础 | 人类和猕猴出生后前额叶皮层 | 单细胞组学 | 神经发育障碍和神经精神疾病 | 单细胞转录组测序、染色质可及性分析、空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 2938 | 2025-12-13 |
Maternal causation of early-onset pre-eclampsia: excessive endometrial gland-derived apolipoprotein D induces placental ferroptosis and developmental abnormalities
2025-Dec-10, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-025-01199-7
PMID:41366770
|
研究论文 | 本研究通过建立早发型子痫前期患者的子宫内膜腺体类器官，结合多组学分析，首次直接证明了子宫内膜腺体功能失调通过分泌过量载脂蛋白D诱导胎盘铁死亡和发育异常，导致早发型子痫前期的发生 | 首次直接证据将子宫内膜腺体功能失调与胎盘缺陷和早发型子痫前期联系起来，并鉴定出APOD作为关键致病因子和潜在早期生物标志物 | 研究主要基于体外类器官和小鼠模型，人类样本验证有限，且具体分子机制如ER应激诱导需进一步探索 | 探究早发型子痫前期的母源性致病机制，特别是子宫内膜腺体功能失调在胎盘发育异常中的作用 | 早发型子痫前期患者和健康孕妇的子宫内膜腺体类器官、小鼠模型以及妊娠早期血清样本 | 数字病理学 | 子痫前期 | iTRAQ蛋白质组学、RNA测序、空间转录组学 | 类器官模型、基因敲入小鼠模型 | 蛋白质组数据、转录组数据、空间转录组数据 | 包括早发型子痫前期患者和健康孕妇的子宫内膜腺体类器官、小鼠模型以及妊娠早期血清样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2939 | 2025-12-13 |
Unique Sertoli cell adaptations support enhanced spermatogenesis in chickens
2025-Dec-10, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01304-8
PMID:41366807
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了鸡睾丸发育中支持细胞（Sertoli cells）的独特适应性，包括持续增殖能力和丰富的信号网络，以解释鸡精子密度远高于哺乳动物的现象 | 首次建立鸡从孵化到性成熟睾丸的单细胞转录组图谱，通过多物种比较发现鸡支持细胞在性成熟后仍保持增殖能力，并揭示了CREB5和昼夜节律在睾丸发育中的关键调控作用 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平和功能验证实验，且样本时间点可能未完全覆盖所有发育阶段 | 探究鸡睾丸发育和精子发生的细胞与分子基础，以解释其精子密度远高于哺乳动物的原因 | 鸡睾丸组织，包括生殖细胞、支持细胞和间质细胞等 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 鸡睾丸样本从孵化到性成熟多个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2940 | 2025-12-13 |
Multi-omics integration deciphers immune-metabolic heterogeneity in CRC: A prognostic model and therapeutic strategies targeting ANGPTL4/FABP4/RBP7
2025-Dec-10, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.111271
PMID:41381279
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，解析了结直肠癌中免疫-代谢异质性，构建了一个12基因预后模型，并揭示了ANGPTL4、FABP4和RBP7在肿瘤微环境中的关键作用及潜在治疗策略 | 整合TCGA和GEO多组学数据，结合单细胞测序、分子对接和动力学模拟，系统阐明了CRC中免疫-代谢异质性，并首次提出ANGPTL4/FABP4/RBP7核心基因轴作为克服免疫治疗耐药的潜在新靶点 | 研究中的肿瘤抑制效应（如联合疗法）仅为计算生物学预测，缺乏实验验证；预后模型的预测价值为中等 | 解析结直肠癌肿瘤免疫微环境的异质性，构建预后模型并探索克服免疫治疗耐药的潜在策略 | 结直肠癌患者样本及相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单样本基因集富集分析，t-SNE降维，LASSO-Cox回归，单细胞测序，分子对接，动力学模拟，药物敏感性分析，免疫组化，qPCR | LASSO-Cox回归模型，t-SNE | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 1136个CRC样本（TCGA队列568个，GEO队列568个） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |