单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 43756 篇文献，本页显示第 29301 - 29320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 29301 | 2024-08-05 |
CD163+ Macrophages Induce Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Atheroma
2024-Jul-05, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.324082
PMID:38860377
|
研究论文 | 本研究探讨了CD163+巨噬细胞在动脉粥样硬化中诱导内皮细胞向间充质细胞转变的作用 | 揭示CD163+巨噬细胞通过促凋亡内皮细胞向间充质细胞转变来促进动脉粥样硬化斑块进展 | 仅使用了小鼠模型和人类动脉样本，可能无法完全代表所有类型的动脉粥样硬化 | 阐明动脉粥样硬化中细胞表型转变的刺激因素和意义 | 人类冠状动脉组织切片及不同小鼠模型（如ApoE-/-和ApoE-/-/CD163-/-小鼠） | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、组织病理学分析、西方印迹 | 小鼠模型 | 组织切片、细胞培养 | 107个急性冠状动脉斑块破裂病变 | NA | NA | NA | NA |
| 29302 | 2024-08-04 |
The impact of next-generation sequencing for diagnosis and disease understanding of myeloid malignancies
2024-Jul, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2024.2383445
PMID:39054632
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review | 本综述简要描述了应用于髓系肿瘤（MNs）临床诊断的技术及其相关挑战. | 介绍了当前尚为研究用途的长测序、全外显子组/全基因组测序和单细胞测序等新兴技术，将很快成为临床检测标准. | 讨论了在资源有限的环境中全面基因组测试的采用挑战，以及其纳入临床试验的限制. | 优化髓系肿瘤的临床护理，通过改善诊断、预后、治疗规划和患者监测. | 髓系肿瘤的分子评估与临床技术. | 数字病理学 | NA | 下一代测序（NGS） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29303 | 2024-08-05 |
Correction: Single-cell transcriptome profiling and the use of AID deficient mice reveal that B cell activation combined with antibody class switch recombination and somatic hypermutation do not benefit the control of experimental trypanosomosis
2024-Jul, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012417
PMID:39058654
|
更正 | 该论文修正了关于单细胞转录组分析和AID缺乏小鼠的研究内容 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29304 | 2024-08-05 |
Dimethyl Fumarate Mediates Sustained Vascular Smooth Muscle Cell Remodeling in a Mouse Model of Cerebral Aneurysm
2024-Jun-27, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox13070773
PMID:39061841
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研究论文 | 本研究探讨了二甲基富马酸在小鼠脑动脉瘤模型中对血管平滑肌细胞(VSMCs)的影响 | 文章创新点在于首次揭示了二甲基富马酸对VSMCs的抑制作用与抗氧化功能紊乱之间的关联 | 尚未调查二甲基富马酸对VSMCs功能的潜在副作用 | 研究二甲基富马酸对脑动脉瘤诱导后VSMCs的影响 | 脑动脉瘤诱导后圈状动脉(VSMCs)中的单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 脑动脉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞数据 | 小鼠模型中未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 29305 | 2024-08-04 |
Inferring Tree-Shaped Single-Cell Trajectories with Totem
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_9
PMID:39068362
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研究论文 | 本文介绍了通过Totem推断树状单细胞轨迹和伪时间的方法 | 提出了两种用户友好的协议，可以灵活地推断树状单细胞轨迹，解决复杂拓扑结构预测的挑战 | 主要集中在单细胞转录组数据的应用，未涉及其他类型的数据 | 研究单细胞转录组数据中细胞发育过程的轨迹推断 | 人类骨髓CD34+细胞，研究三条谱系的分支：红系、淋巴系和单核系 | 数字病理学 | NA | 转录组学 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29306 | 2024-08-04 |
Unsupervised Single-Cell Clustering with Asymmetric Within-Sample Transformation and Per-Cluster Supervised Features Selection
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_8
PMID:39068361
|
研究论文 | 本文展示了如何将不对称样本内变换应用于单细胞RNA测序数据，与之前的缺失值插补相匹配 | 提出了一种不对称变换的方法以处理低表达强度，同时保留高表达基因水平，并结合每个基因的熵估计进行非信息基因的去除 | 样本量和不同基因类型的影响可能未在研究中充分探索 | 旨在改进单细胞RNA测序数据的聚类分析和基因特征选择 | 研究对象为单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | GLM | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29307 | 2024-08-04 |
RNA-Seq Analysis of Mammalian Prion Disease
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_20
PMID:39068373
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研究论文 | 本文介绍了利用单细胞RNA测序数据分析哺乳动物朊病毒病的RNA测序方法 | 提出了一种可重复使用的RNA测序分析协议，以揭示朊病毒病中的转录变化 | NA | 揭示哺乳动物朊病毒病的转录特征 | 哺乳动物朊病毒病的单细胞RNA测序数据 | 数字病理 | NA | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 使用自NCBI GEO数据库获得的单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 29308 | 2024-08-05 |
Inferring Novel Cells in Single-Cell RNA-Sequencing Data
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_7
PMID:39068360
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研究论文 | 本文探讨了在单细胞RNA测序数据中推断新细胞类型的方法 | 提出了三类推断新细胞的方法，包括未监督和异常检测的方法、监督和半监督的方法、以及基于拷贝数变异的方法 | 推断新细胞在常规单细胞RNA测序分析中仍然具有挑战性 | 研究单细胞RNA测序技术中识别和表征新细胞类型 | 利用单细胞RNA测序技术分析细胞类型及其亚群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29309 | 2024-08-05 |
Zebrafish Thrombocyte Transcriptome Analysis and Functional Genomics
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3886-6_10
PMID:39068363
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研究论文 | 本文探讨了斑马鱼血小板的成熟过程与功能基因组学 | 采用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析年轻和成熟血小板的转录组，以识别特定基因并揭示其在成熟过程中的角色 | 在血液循环中成熟的具体机制尚不明确 | 理解斑马鱼血小板成熟的机制 | 年轻和成熟的斑马鱼血小板 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 多个斑马鱼血小板样本，包括年轻和成熟类型 | NA | NA | NA | NA |
| 29310 | 2024-08-05 |
A comprehensive assessment of hurdle and zero-inflated models for single cell RNA-sequencing analysis
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad272
PMID:37507115
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研究论文 | 本文全面评估了单细胞RNA测序分析中的障碍和零膨胀模型 | 提出了一个基于TensorFlow的Python包TensorZINB，解决了零膨胀负二项式模型的数值稳定性问题，并结合了混合模型来提高性能 | 未提及特定的局限性 | 提高单细胞RNA测序数据分析中的统计模型的准确性和计算速度 | 障碍和零膨胀模型的性能评估及其对单细胞RNA测序数据的应用 | 数字病理 | NA | RNA-seq | 零膨胀负二项式（ZINB）模型 | 文本 | 使用真实的单细胞RNA测序数据集进行评估 | NA | NA | NA | NA |
| 29311 | 2024-08-05 |
Novel insights into breast cancer copy number genetic heterogeneity revealed by single-cell genome sequencing
2020-05-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.51480
PMID:32401198
|
研究论文 | 本文使用单细胞基因组测序全面映射了乳腺癌肿瘤中拷贝数改变异质性的各个方面 | 提供了乳腺癌肿瘤内非肿瘤细胞的遗传异质性及其对肿瘤基因组的影响的新见解 | 对拷贝数改变异质性的了解仍然有限 | 探讨乳腺癌中拷贝数改变的遗传异质性及其临床意义 | 一组乳腺癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组数据 | 一组乳腺癌肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 29312 | 2024-08-05 |
Transcriptome Dynamics of Hematopoietic Stem Cell Formation Revealed Using a Combinatorial Runx1 and Ly6a Reporter System
2020-05-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.03.020
PMID:32302558
|
研究论文 | 该文章研究了造血干细胞(HSC)形成的转录组动态，利用组合的Runx1和Ly6a报告系统进行可视化 | 通过生成Tg(Runx1-mKO2; Ly6a-GFP)双重报告小鼠，首次识别并追踪造血干细胞的发育过程 | 由于造血干细胞及其前体细胞的稀缺性，可能导致研究样本的局限性 | 揭示前造血干细胞的出现和成熟过程 | 研究对象包括前造血干细胞及其相关细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用了双重报告小鼠的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 29313 | 2024-08-05 |
A single-cell survey of Drosophila blood
2020-05-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54818
PMID:32396065
|
研究论文 | 该论文利用单细胞RNA测序对果蝇血细胞进行了调查 | 发现了在不同炎症条件下果蝇血细胞的多样性，并首次揭示了FGF信号在血细胞之间的相互作用中的新角色 | 目前只集中于果蝇的血细胞种类，结果是否适用于其他物种尚未确定 | 旨在通过单细胞RNA测序深入理解果蝇血细胞的功能 | 果蝇幼虫中的血细胞（称为hemocytes） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29314 | 2024-08-05 |
Pooled Knockin Targeting for Genome Engineering of Cellular Immunotherapies
2020-Apr-30, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.03.039
PMID:32302591
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研究论文 | 本研究开发了一种技术用于对人类T细胞进行高通量的基因敲入筛选 | 提出了一种新颖的合并基因组工程技术，可以对大规模非病毒DNA模板进行条形码标记和追踪 | 未提及具体的样本量和方法的局限性 | 研究目的在于提高基因改造免疫细胞在癌症免疫治疗中的效果 | 主要研究对象为经过基因敲入的初级人类T细胞 | 数字病理学 | 癌症免疫治疗 | CRISPR | NA | 细胞转录组数据 | 数十个独特的条形码模板 | NA | NA | NA | NA |
| 29315 | 2024-08-05 |
Association Analysis of Single-Cell RNA Sequencing and Proteomics Reveals a Vital Role of Ca2+ Signaling in the Determination of Skeletal Muscle Development Potential
2020-04-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells9041045
PMID:32331484
|
研究论文 | 本研究探讨了特定猪模型中肌肉发育潜力决定机制 | 首次揭示了Ca2+信号在骨骼肌发育潜力中的重要作用 | 只使用了特定的猪模型，可能限制了结果的普遍性 | 探索肌肉生成与脂肪生成之间的稳态机制 | 瘦型猪和肥胖型猪的肌肉衍生Myo-谱系细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序和蛋白质组学分析 | NA | RNA和蛋白质数据 | 瘦型猪与肥胖型猪的肌肉衍生细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 29316 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals gene expression dynamics of human fetal kidney development
2019-02, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3000152
PMID:30789893
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组技术研究人类胎儿肾脏的基因表达动态 | 首次详细描述了人类胎儿肾脏的22种细胞类型及标记基因，并揭示了肾小管细胞在不同发育阶段的基因表达变化 | 目前研究尚缺乏对人类肾脏发育的完整理解，可能存在数据不足的情况 | 阐明人类肾脏发育过程中的基因表达变化 | 人类胎儿肾脏的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | 近18000个来自五个不同发育阶段的肾细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 29317 | 2024-08-05 |
The vast majority of somatic mutations in plants are layer-specific
2024-Jul-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03337-0
PMID:39049052
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研究论文 | 本文分析了植物中体细胞突变的频率和分布，特别是在不同的分生组织层中 | 研究发现大多数体细胞突变特定于个别层，并揭示了不同层之间的变异动态 | 对突变特征的了解仍然有限，特别是在变异与表型变化的关系方面 | 研究植物分生组织中体细胞突变的特征与分布 | 在一个杏树的不同部位分析体细胞突变 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 多个水果样本来自整个树木 | NA | NA | NA | NA |
| 29318 | 2024-08-04 |
Diffusion on PCA-UMAP Manifold: The Impact of Data Structure Preservation to Denoise High-Dimensional Single-Cell RNA Sequencing Data
2024-Jul-09, Biology
DOI:10.3390/biology13070512
PMID:39056705
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研究论文 | 该文章提出了一种基于PCA-UMAP扩散的方法来去噪高维单细胞RNA测序数据 | 通过使用PCA-UMAP扩散方法，增强了数据结构的保持，优化了PCA维度和扩散参数的使用 | 未明确提及 | 解决单细胞转录组学中数据噪声和低效转录捕获的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 高维单细胞数据 | 经过多种scRNA-seq数据集验证 | NA | NA | NA | NA |
| 29319 | 2024-08-05 |
Reduction of Glyoxalase 1 Expression Links Fetal Methylmercury Exposure to Autism Spectrum Disorder Pathogenesis
2024-Jun-22, Toxics
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxics12070449
PMID:39058101
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研究论文 | 这篇文章探讨了甘油醛酶1表达的降低将胎儿甲基汞暴露与自闭症谱系障碍的发病机制联系起来 | 研究揭示了甲基汞暴露对自闭症风险基因在皮层发育中的直接影响 | 具体对照组和长时间观察的数据可能不足 | 本研究旨在确定孕期甲基汞诱导早熟神经分化和异常神经发育的分子机制 | 研究对象为孕期暴露于低剂量非凋亡性甲基汞的小鼠模型 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和实时定量PCR (RT-qPCR) | NA | 基因表达数据 | 培养的胚胎放射状胶质前体细胞 (RGPs) | NA | NA | NA | NA |
| 29320 | 2024-08-05 |
Stationary-to-migratory transition in glioblastoma stem-like cells driven by a fatty acid-binding protein 7-RXRα neurogenic pathway
2023-12-08, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad134
PMID:37499046
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研究论文 | 本研究揭示了脂肪酸结合蛋白7（FABP7）驱动的胶质母细胞瘤（GBM）干样细胞的迁移机制 | 首次将FABP7的作用与胶质母细胞瘤干样细胞的迁移联系起来，阐明了PUFA-FABP7-RXRα神经基因途径的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能在人类GBM中存在不同的表现 | 本研究旨在深入了解胶质母细胞瘤干样细胞的迁移机制及其在肿瘤进展中的作用 | 胶质母细胞瘤（GBM）干样细胞以及相应的小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、基因报告酶实验 | NA | 细胞系、患者衍生的样本 | 使用了多个GBM细胞系和来源于患者的胶质母细胞瘤干样细胞 | NA | NA | NA | NA |