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当前共找到 35765 篇文献,本页显示第 2901 - 2920 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2901 2025-12-14
MCRS1 is associated with immunosuppressive microenvironments in pan-cancer and promotes hepatocellular carcinoma malignant phenotypes
2025-Nov-30, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过泛癌分析揭示了微球蛋白1(MCRS1)在肿瘤免疫抑制微环境中的关键作用,并重点阐明了其在肝细胞癌(HCC)恶性表型中的表观遗传驱动机制 首次报道了MCRS1在泛癌水平上的免疫学意义和治疗潜力,并发现其启动子低甲基化驱动的过表达与M2巨噬细胞极化的免疫抵抗微环境相关 研究主要基于公共数据库和体外功能验证,缺乏体内动物模型的深入机制验证 阐明MCRS1在泛癌中的免疫学意义和治疗潜力,并揭示其在肝细胞癌进展中的表观遗传驱动机制 多种癌症类型(泛癌分析),重点关注肝细胞癌(HCC) 生物信息学,癌症免疫学 肝细胞癌,泛癌 批量转录组学,单细胞RNA测序(scRNA-seq),表观遗传分析,功能验证 NA 转录组数据,单细胞RNA测序数据,表观遗传数据,蛋白质表达数据 来自TCGA、GTEx、HPA等公共数据库的大量样本(具体数量未明确说明),包括24种恶性肿瘤 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
2902 2025-12-14
NK cells undergo transcriptional and functional reprogramming following Streptococcus pneumoniae infection
2025-Nov-28, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了自然杀伤细胞在肺炎链球菌感染后经历转录和功能重编程,并形成具有增强活性的记忆亚群 首次在细菌感染背景下系统揭示NK细胞的转录重编程和记忆形成机制,为先天免疫记忆在细菌感染中的作用提供了新见解 研究主要基于小鼠模型,人类NK细胞的类似机制仍需验证;单细胞测序数据的功能验证有待进一步深入 探究NK细胞在肺炎链球菌感染中的应答机制和记忆形成过程 自然杀伤细胞 单细胞组学 细菌感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2903 2025-12-14
Alterations in Resident Immune Cells in Prenatal Trisomy 21 Lungs
2025-Nov-26, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间表型分析,揭示了唐氏综合征胎儿肺部免疫细胞的变化,特别是B细胞减少,这可能解释其呼吸道感染易感性增加 首次在产前唐氏综合征肺部中系统表征免疫细胞变化,结合单细胞测序与空间技术揭示B细胞减少的分子机制 样本量较小(T21组5例,非T21组4例),且仅关注产前阶段,未追踪出生后免疫发育变化 探究唐氏综合征胎儿肺部免疫细胞异常,以解释其呼吸道感染易感性增加的潜在原因 产前唐氏综合征(T21)和非唐氏综合征(非T21)胎儿肺部组织 单细胞组学 唐氏综合征 单细胞RNA测序,荧光原位杂交,免疫荧光染色,qRT-PCR NA 单细胞RNA测序数据,空间组织切片图像,基因表达数据 T21组5例,非T21组4例产前肺部样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2904 2025-12-14
Functional Division of Insect Blood Cells by Single-Cell RNA-Sequencing and Cell-Type-Specific FISH Markers
2025-Nov-22, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和细胞类型特异性FISH标记,揭示了昆虫血细胞的功能分化与动态变化 首次在鳞翅目昆虫中应用单细胞RNA测序技术解析血细胞功能分化,发现了24个功能簇和7个功能组,并开发了特异性FISH标记识别新细胞群 研究仅针对一种鳞翅目昆虫幼虫,结果可能不适用于其他昆虫种类或发育阶段 探究昆虫血细胞的功能分化类型及其在免疫应答中的动态变化 鳞翅目昆虫(烟草天蛾)幼虫的血细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),荧光原位杂交(FISH) NA 单细胞转录组数据,图像数据 未明确样本数量,使用烟草天蛾幼虫血细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2905 2025-12-14
Inferring the regulation dynamics of oscillatory networks from scRNA-seq data
2025-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种通过整合细胞周期位置信息来改进单细胞RNA测序数据中基因调控网络推断的方法 将振荡过程(如细胞周期)的周期性约束纳入基因调控网络推断,相比传统基于基因相关性或时间进程的方法,能更准确地解析细胞周期调控动力学 仅在小鼠视网膜祖细胞单细胞基因表达数据集上进行了验证,尚未在其他细胞类型或生物系统中广泛测试 提高从单细胞RNA测序数据中推断振荡网络(如细胞周期)调控动力学的准确性 小鼠视网膜祖细胞的单细胞基因表达数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 基因调控网络推断方法(包括Tricycle等八种代表性方法) 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2906 2025-12-14
Img2ST-Net: efficient high-resolution spatial omics prediction from whole-slide histology images via fully convolutional image-to-image learning
2025-Nov, Journal of medical imaging (Bellingham, Wash.)
研究论文 本研究提出了一种名为Img2ST-Net的高效框架,用于从全切片组织学图像中并行预测高分辨率空间转录组数据 提出了首个用于高分辨率空间转录组预测的全卷积图像到图像学习框架,将任务重构为具有数百或数千个输出通道的超内容图像生成问题,并引入了针对高分辨率ST分析的基于结构相似性的评估指标SSIM-ST 论文未明确说明模型在更广泛的组织类型或疾病中的应用局限性,也未讨论模型对极低表达基因的预测能力 开发一种高效、可扩展的框架,以降低高分辨率空间转录组数据获取的成本和时间,直接从常规组织学图像预测基因表达 乳腺癌和结直肠癌的组织样本 数字病理学 乳腺癌, 结直肠癌 空间转录组学 全卷积神经网络 图像, 基因表达数据 两个公共Visium HD数据集(乳腺癌和结直肠癌) 10x Genomics 空间转录组学 Visium HD Visium HD平台,分辨率为8 μm和16 μm
2907 2025-12-14
STIFT: spatiotemporal transcriptomics integration through spatially informed multi-timepoint bridging
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为STIFT的时空转录组学整合框架,用于整合发育或再生过程中跨时间点的空间转录组学数据 STIFT框架结合了发育时空最优传输、时空图构建以及基于时间三元学习的图注意力自编码器,专门为整合时空转录组学数据而设计 NA 整合时空转录组学数据,以去除批次效应、识别空间域、推断轨迹并探索发育动态 蝾螈脑再生、小鼠胚胎发育和3D涡虫再生数据集 空间转录组学 NA 空间转录组学 图注意力自编码器 空间转录组学数据(2D或3D) 数十万个spots NA 空间转录组学 NA NA
2908 2025-12-14
Principles of protein abundance regulation across single cells in a mammalian tissue
2025-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过单细胞蛋白质合成与清除的系统量化,结合单细胞转录组学,揭示了哺乳动物组织中蛋白质丰度调控的组织原则 首次在复杂组织单细胞水平上定量分析蛋白质合成与清除的调控作用,发现翻译和蛋白质清除与细胞生长速率呈线性依赖关系 研究仅基于单一原代组织样本,样本多样性有限,且技术方法可能未覆盖所有蛋白质调控机制 探究哺乳动物组织中单细胞水平蛋白质丰度调控的分子机制与组织原则 来自原代组织的超过4,200个单细胞 单细胞组学 NA 单细胞转录组学、蛋白质合成与清除量化 NA 单细胞蛋白质与RNA数据 超过4,200个原代组织单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2909 2025-12-14
Inflammation perturbs hematopoiesis by remodeling specific compartments of the bone marrow niche
2025-Oct-08, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术相结合的方法,验证了骨髓中中央骨髓区和骨内膜区两个空间区室的划分,并揭示了炎症如何通过重塑特定骨髓微环境区室来扰动造血功能 首次系统验证了骨髓微环境的空间区室划分方法,并发现炎症会特异性地影响不同细胞区室,特别是I型干扰素反应导致表达瘦素受体的间充质基质细胞功能转变,产生过量趋化因子调控局部单核细胞动态 研究主要关注急性炎症模型,慢性炎症或其他复杂病理条件下的骨髓微环境变化仍需进一步探索 探究骨髓微环境空间区室化在炎症等复杂条件下对造血调控的重要性 造血干细胞和祖细胞(HSPC)及骨髓基质细胞 单细胞组学 炎症相关疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2910 2025-12-14
From genetic causality to druggable targets: A multiomics framework identifies ZSCAN16 in gout pathogenesis
2025 Oct-Dec, Science progress IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过多组学框架,结合孟德尔随机化、共定位分析、表型全基因组关联研究和单细胞RNA测序,系统性地识别并优先排序了痛风的新型可成药靶点,最终确定ZSCAN16为高潜力的治疗靶点 采用多层遗传和功能基因组学方法,首次系统性地从遗传因果性角度识别并验证痛风的潜在可成药靶点,特别是通过单细胞分析揭示了ZSCAN16在细胞毒性T/NK细胞中的特异性上调 研究主要基于遗传关联和计算分析,缺乏直接的体内或体外功能验证实验来证实靶点的生物学机制 系统性识别和优先排序痛风的新型、可成药靶点,以克服当前疗法效果不佳和药物开发中缺乏遗传验证靶点的问题 痛风患者(基于GWAS队列数据)及相关的候选基因 生物信息学与计算生物学 痛风 孟德尔随机化,共定位分析,表型全基因组关联研究,单细胞RNA测序,分子对接 NA 遗传关联数据,基因表达数据,单细胞转录组数据 基于两个独立的痛风GWAS队列(openGWAS和FinnGen) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2911 2025-12-14
Unraveling atherosclerosis through single-cell RNA sequencing: insights into cellular heterogeneity and disease mechanisms
2025, Einstein (Sao Paulo, Brazil)
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在动脉粥样硬化研究中的应用,以揭示其细胞异质性和疾病机制 利用单细胞RNA测序技术详细分析动脉粥样硬化斑块内的细胞组成,提供更全面和细致的斑块生物学理解 NA 阐明动脉粥样硬化的发病、进展机制及潜在治疗靶点 动脉粥样硬化斑块 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2912 2025-12-14
Identification of locally advanced rectal cancer-related genes based on transcriptome and mendelian randomization analysis with biological validation
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过转录组和孟德尔随机化分析,结合生物验证,识别了局部晚期直肠癌相关的关键基因 结合孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序,系统识别并验证了局部晚期直肠癌的致病基因,特别是对SLC19A1的功能进行了体外验证 研究主要基于公共数据库数据,体外验证仅针对单个基因,需要进一步体内实验和临床样本验证 揭示局部晚期直肠癌的分子机制并识别潜在治疗靶点 局部晚期直肠癌患者样本 生物信息学 直肠癌 转录组分析,孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,体外功能实验 NA 基因表达数据,eQTL数据,单细胞RNA测序数据 基于GEO和TCGA数据库的局部晚期直肠癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2913 2025-12-14
Anti-HER2/neu TCR-T Cells in Action: linking transcriptional signatures, secretomics, and In Vivo tumor suppression
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过体外细胞毒性实验、单细胞RNA测序、分泌组分析和体内异种移植模型,功能验证了靶向HER2/neu蛋白KIFGSLAFL肽段的特定TCR克隆型,揭示了其抗肿瘤活性和独特的CD4+CD8+ T细胞群体 首次在抗原刺激下鉴定出独特的双阳性(CD4+CD8+)T细胞群体,并系统关联了转录组特征、分泌组学与体内肿瘤抑制效果,为TCR-T细胞治疗提供了新的机制见解 研究主要基于HER2/neu高表达的肿瘤细胞和HLA-A*02限制性模型,可能无法完全代表其他抗原或HLA背景下的情况,且体内实验使用免疫缺陷小鼠模型,未能模拟完整的人类免疫微环境 功能验证靶向HER2/neu的特定TCR克隆型,并阐明其抗肿瘤的分子机制 抗HER2/neu TCR-T细胞 癌症免疫治疗 HER2/neu阳性癌症 单细胞RNA测序, 分泌组分析, 体外细胞毒性实验, 体内异种移植模型 NA 单细胞转录组数据, 分泌蛋白数据, 体内肿瘤生长数据 NA BD Biosciences 单细胞RNA-seq BD Rhapsody BD Rhapsody单细胞分析系统
2914 2025-12-14
IgA expressed by glomerular mesangial cells is involved in the pathogenesis of IgA nephropathy
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和荧光原位杂交技术,证实了肾小球系膜细胞表达IgA,并探讨了其在IgA肾病发病机制中的作用 挑战了IgA肾病发病的“多打击假说”,首次证实肾小球系膜细胞是IgA的来源之一,并揭示了SEB通过TLR4通路诱导Gd-IgA1过表达的新机制 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,人类临床样本验证有限,且SEB诱导的机制在人体内的直接相关性需进一步探究 探究肾小球系膜细胞表达的IgA是否参与IgA肾病的发病及其初步机制 肾小球系膜细胞、μMT小鼠、条件性敲除IGHA的小鼠、人类肾组织样本 数字病理学 IgA肾病 单细胞RNA测序、荧光原位杂交、基因集富集分析、siRNA干扰 动物模型(小鼠)、细胞培养模型 RNA测序数据、图像数据、实验观测数据 未明确指定具体样本数量,涉及人类肾组织、小鼠模型和培养细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2915 2025-12-14
TFEB-mediated autophagy stimulation as an anabolic strategy for bone: insights from TFEB activation in the osteoblast lineage
2025, Autophagy reports
研究论文 本研究通过在小鼠成骨细胞谱系中特异性激活TFEB,探索了自噬刺激对骨形成和骨骼稳态的促进作用 首次在成骨细胞谱系中特异性激活TFEB,揭示了自噬刺激通过减少细胞凋亡和增强功能来促进骨形成的新机制 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证,且具体分子通路细节有待进一步阐明 探究自噬在骨形成中的作用机制,并评估自噬刺激作为骨质疏松潜在治疗策略的可行性 遗传修饰小鼠模型中的成骨细胞谱系细胞 NA 骨质疏松症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2916 2025-12-14
Cuproptosis and Immune Microenvironment Interplay in Temporal Lobe Epilepsy: Identification of Key Molecular Signatures and Therapeutic Targets
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究首次探讨了铜死亡在颞叶癫痫中的作用,揭示了其与免疫微环境的相互作用,并识别了关键分子特征和治疗靶点 首次将铜死亡确立为连接铜失调与颞叶癫痫病理的机制桥梁,提出了基于铜死亡相关基因的疾病亚型分类,并识别了CD44、PDE5A和TUBA1A作为新的治疗靶点 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,缺乏人类患者样本的直接验证,且铜死亡在癫痫中的具体分子机制仍需进一步探索 探究铜死亡在颞叶癫痫中的分子基础、神经炎症串扰及治疗意义 颞叶癫痫患者和毛果芸香碱诱导的颞叶癫痫小鼠模型 生物信息学 颞叶癫痫 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 加权基因共表达网络分析, 共识聚类, 机器学习算法, Western blot, 免疫组织化学 机器学习算法(10种) RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2917 2025-12-14
TMOD2 and DOCK4 as Novel Gut Microbiota-Associated Biomarkers for Colorectal Adenoma: Integrated Transcriptomic Analysis and Therapeutic Target Identification
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学数据和孟德尔随机化分析,鉴定出与结直肠腺瘤风险相关的肠道微生物物种,并确定了TMOD2和DOCK4作为新型生物标志物和潜在治疗靶点 首次将肠道微生物遗传学与转录组学整合,通过孟德尔随机化建立肠道微生物与结直肠腺瘤的因果关系,并利用单细胞RNA测序验证生物标志物在肿瘤微环境不同细胞群中的表达模式 未在独立的大规模临床队列中进行前瞻性验证,药物筛选结果需要进一步的体外和体内实验验证 识别可用于结直肠腺瘤早期检测和治疗的肠道微生物相关分子标志物 结直肠腺瘤患者样本和相关的转录组数据 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 转录组分析, 孟德尔随机化分析 机器学习算法 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2918 2025-12-14
SLC11A1 protein as a key regulator of iron metabolism, ferroptosis mediator, and putative therapeutic target in nonalcoholic fatty liver disease: an integrated bioinformatics analysis
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析,揭示了SLC11A1蛋白作为铁代谢和铁死亡的关键调节因子,是非酒精性脂肪肝病(NAFLD)的潜在生物标志物和治疗靶点 首次通过整合WGCNA、机器学习算法(LASSO)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)和分子对接/动力学模拟,系统鉴定了NAFLD中铁代谢/铁死亡相关的关键调控蛋白(特别是SLC11A1),并预测了已批准药物Resmetirom的潜在靶向作用机制 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏深入的体内功能实验和临床队列验证来证实SLC11A1的因果作用和治疗潜力 深入探索非酒精性脂肪肝病(NAFLD)的新型生物标志物和治疗策略,重点关注铁代谢失调和铁死亡在疾病进展中的作用 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)患者的数据集(来自GEO数据库)以及相关的铁代谢/铁死亡相关基因和蛋白 生物信息学 非酒精性脂肪肝病 生物信息学分析(包括差异表达基因分析、WGCNA、LASSO回归)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接、分子动力学模拟、定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR) 机器学习算法(LASSO回归) 基因表达数据(来自GEO数据库)、单细胞RNA测序数据、蛋白质结构数据 NA(文中提及使用了GEO数据库中的NAFLD数据集和验证集,但未明确总样本数量) NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(推断,来自GEO数据库) NA NA
2919 2025-12-14
Redox phenotype confers T cell-exclusion microenvironment and resistance to immunotherapy by suppressing STING/MDA5 expression and interferon signaling in lung cancers harboring KEAP1/STK11 mutations
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了KEAP1/STK11突变通过调控氧化还原表型抑制STING/MDA5表达和干扰素信号,从而介导免疫逃逸和免疫治疗抵抗的机制 首次将KEAP1/STK11突变驱动的氧化还原表型与STING/MDA5表达抑制及免疫微环境重塑联系起来,揭示了免疫治疗抵抗的新机制 研究主要基于生物信息学分析和回顾性队列,缺乏实验验证;样本来源和数量可能限制结论的普适性 探究KEAP1/STK11突变导致非小细胞肺癌免疫治疗抵抗的分子机制 非小细胞肺癌患者肿瘤样本及免疫检查点抑制剂治疗队列 生物信息学 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 TCGA和GSE72094队列的肺癌样本,以及单细胞RNA-seq数据集和免疫治疗队列 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
2920 2025-12-14
MRI-based radiomic clustering identifies a glioblastoma subtype enriched for neural stemness and proliferative programs
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合术前MRI影像组学特征与多平台转录组学数据,识别出一种与神经干性和增殖程序相关的胶质母细胞瘤高风险亚型 首次将MRI影像组学亚型与单细胞及空间转录组学数据相结合,揭示了影像表型背后的分子机制和细胞群体特征 研究样本量有限,且为回顾性分析,需要进一步的前瞻性验证 探索胶质母细胞瘤影像组学亚型的生物学基础及其与预后的关联 IDH野生型胶质母细胞瘤患者 数字病理 胶质母细胞瘤 MRI影像组学,bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq,空间转录组学 无监督聚类 医学影像,转录组数据 未明确指定样本数量 NA bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
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