单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2901	2024-10-25	Regulation of Bacteroides acidifaciens by the aryl hydrocarbon receptor in IL-22-producing immune cells has sex-dependent consequential impact on colitis 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1444045 PMID:39229279	研究论文	研究了芳香烃受体（AhR）在IL-22产生免疫细胞中对Bacteroides acidifaciens的调控及其对结肠炎的性别依赖性影响	首次揭示了AhR在IL-22产生免疫细胞中对Bacteroides acidifaciens的调控作用及其对结肠炎的性别依赖性影响	研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类	探讨AhR在IL-22产生免疫细胞中对Bacteroides acidifaciens的调控及其对结肠炎的影响	AhR缺陷小鼠、野生型小鼠及其同窝小鼠，以及Bacteroides acidifaciens	免疫学	炎症性肠病	单细胞RNA测序（scRNAseq）、16S rRNA微生物组分析	NA	基因表达数据、微生物组数据	AhR缺陷小鼠、野生型小鼠及其同窝小鼠，以及Bacteroides acidifaciens
2902	2024-10-25	A comprehensive analysis of the role of cuproptosis in periodontitis through integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing 2024, Archives of medical science : AMS IF:3.0Q1 DOI:10.5114/aoms/192414 PMID:39439704	研究论文	本文通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，全面探讨了铜死亡在牙周炎中的作用	首次综合利用单细胞和批量RNA测序数据分析铜死亡相关基因在牙周炎中的表达	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证	探讨铜死亡与牙周炎之间的关系	牙周炎中的铜死亡相关基因	数字病理学	牙周病	RNA测序	NA	RNA	小鼠模型
2903	2024-10-25	Spatial transcriptomics: a new frontier in accurate localization of breast cancer diagnosis and treatment 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1483595 PMID:39439806	研究论文	本文总结了空间转录组学在乳腺癌诊断和治疗中的最新发现	空间转录组学为研究肿瘤内部结构差异和肿瘤微环境组成提供了新的视角	NA	探讨空间转录组学在乳腺癌精准治疗中的应用	乳腺癌及其肿瘤微环境	数字病理学	乳腺癌	空间转录组学	NA	转录组数据	NA
2904	2024-10-25	Exploring shared biomarkers and shared pathways in insomnia and atherosclerosis using integrated bioinformatics analysis 2024, Frontiers in molecular neuroscience IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fnmol.2024.1477903 PMID:39439987	研究论文	本研究通过整合生物信息学分析，探索失眠与动脉粥样硬化之间的共享生物标志物和通路	首次通过整合生物信息学分析，筛选出失眠与动脉粥样硬化之间的共享基因，并构建了预测模型	研究主要基于现有数据库数据，未进行实验验证	探索失眠与动脉粥样硬化之间的共享通路和诊断生物标志物	失眠和动脉粥样硬化	生物信息学	心血管疾病	加权基因共表达网络分析、基因差异表达分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、机器学习算法	NA	基因表达数据	NA
2905	2024-10-25	Integrating Bulk and Single-cell RNA-seq to Construct a Macrophage-related Prognostic Model for Prognostic Stratification in Triple-negative Breast Cancer 2024, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.101042 PMID:39440065	研究论文	本研究整合了bulk和单细胞RNA测序数据，构建了一个与巨噬细胞相关的预后模型，用于三阴性乳腺癌的预后分层	本研究首次整合bulk和单细胞RNA测序数据，构建了一个与巨噬细胞相关的预后模型，用于三阴性乳腺癌的预后分层	本研究仅限于三阴性乳腺癌，未涵盖其他类型的乳腺癌	探索三阴性乳腺癌中巨噬细胞的异质性，并建立一个与巨噬细胞相关的预后模型，用于三阴性乳腺癌的预后分层	三阴性乳腺癌中的巨噬细胞及其相关基因	数字病理学	乳腺癌	RNA测序	NA	基因表达数据	NA
2906	2024-10-25	Bibliometric and visual analysis of single-cell multiomics in neurodegenerative disease arrest studies 2024, Frontiers in neurology IF:2.7Q3 DOI:10.3389/fneur.2024.1450663 PMID:39440247	研究论文	本研究通过文献计量学方法分析了单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用现状和趋势	首次系统性地利用文献计量学方法分析单细胞多组学在神经退行性疾病研究中的应用	主要依赖于文献计量学方法，缺乏实验数据和具体技术细节的深入分析	分析单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用现状和趋势	单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用	生物信息学	神经退行性疾病	单细胞多组学	NA	文献	596篇出版物
2907	2024-10-25	The C-type lectin COLEC10 is predominantly produced by hepatic stellate cells and involved in the pathogenesis of liver fibrosis 2023-11-30, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-023-06324-8 PMID:38036508	研究论文	研究了C型凝集素COLEC10在肝星状细胞中的表达及其在肝纤维化发病机制中的作用	首次发现COLEC10主要由肝星状细胞产生，并在肝纤维化过程中表达下调，揭示了其在肝纤维化发病机制中的新作用	研究主要基于小鼠和人类肝脏样本，缺乏更广泛的物种验证；体外实验结果需要体内实验进一步验证	探讨COLEC10在肝纤维化发病机制中的作用	肝星状细胞、肝纤维化患者和健康捐赠者的血清	NA	肝病	单细胞RNA测序、RNA测序	NA	RNA	小鼠肝脏样本、人类肝脏样本、慢性肝病患者和健康捐赠者的血清
2908	2024-10-25	Identification of PHACTR4 as A New Biomarker for Diabetic Nephropathy and Its Correlation with Glomerular Endothelial Dysfunction and Immune Infiltration 2023-Nov, Iranian journal of kidney diseases IF:0.8Q4 PMID:38043109	研究论文	本研究通过结合微阵列和单细胞测序数据分析，识别出PHACTR4作为糖尿病肾病的新生物标志物，并探讨其与肾小球内皮细胞功能障碍和免疫浸润的相关性	本研究首次将PHACTR4识别为糖尿病肾病的关键生物标志物，并揭示了其与肾小球内皮细胞功能障碍和免疫浸润的关联	本研究主要依赖于微阵列和单细胞测序数据，未进行大规模临床验证	识别与糖尿病肾病相关的生物标志物，并探讨其与肾小球内皮细胞功能障碍和免疫浸润的关系	糖尿病肾病患者的肾小球内皮细胞和免疫细胞	数字病理学	糖尿病	微阵列分析、单细胞测序、RT-PCR	NA	基因表达数据	微阵列数据集GSE30528和单细胞测序数据集GSE131882
2909	2024-10-25	Molecular and spatial landmarks of early mouse skin development 2023-10-23, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2023.07.015 PMID:37591247	研究论文	通过单细胞转录组学、空间细胞类型分配和细胞谱系追踪，研究小鼠早期皮肤发育过程中的分子和空间特征	揭示了小鼠早期皮肤发育过程中细胞类型多样性和组织结构的关键转变，识别了毛囊诱导、肌肉支持和筋膜形成成纤维细胞的时空出现，以及最早的免疫细胞定居	NA	研究小鼠早期皮肤发育的分子和空间特征	小鼠早期胚胎皮肤	数字病理学	NA	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	NA
2910	2024-10-24	High-throughput single-cell sequencing of activated sludge microbiome 2025-Jan, Environmental science and ecotechnology IF:14.0Q1 DOI:10.1016/j.ese.2024.100493 PMID:39430728	研究论文	研究通过高通量单细胞测序技术分析了活性污泥微生物群落，揭示了微生物群落中的基因组异质性和潜在的新物种	首次应用高通量单细胞测序技术分析活性污泥微生物群落，揭示了微生物暗物质的存在，并发现了大量的抗生素抗性基因、质粒片段和噬菌体基因组	研究主要集中在活性污泥微生物群落，未涉及其他环境中的微生物群落	探索活性污泥微生物群落的基因组异质性，揭示微生物暗物质和水平基因转移过程	活性污泥微生物群落	生物技术	NA	单细胞测序	NA	基因组	15,110个单细胞
2911	2024-10-24	Circulating RAC1 contributed to steroid-sensitive nephrotic syndrome: Mendelian randomization, single-cell RNA-sequencing, proteomic, and experimental evidence 2024-Dec, Renal failure IF:3.0Q1 DOI:10.1080/0886022X.2024.2416087 PMID:39422242	研究论文	研究探讨并验证了循环RAC1与类固醇敏感性肾病综合征（SSNS）之间的潜在因果关系	通过孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、蛋白质组学分析和实验研究，首次系统地验证了循环RAC1与SSNS之间的因果关系	研究主要集中在基因表达和蛋白质水平上，未深入探讨RAC1在细胞内的具体作用机制	探索并验证循环RAC1与类固醇敏感性肾病综合征之间的潜在因果关系	循环RAC1与类固醇敏感性肾病综合征（SSNS）	NA	肾病	单细胞RNA测序、蛋白质组学分析	NA	基因表达数据、蛋白质数据	包括SSNS患者和健康对照的外周血单个核细胞样本，以及最小变化肾病综合征患者的样本
2912	2024-10-24	Timing, initiation and function: An in-depth exploration of the interaction network among neutrophil extracellular traps related genes in acute pancreatitis 2024-Nov-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112923 PMID:39137629	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序，深入探讨了中性粒细胞外陷阱（NETs）相关基因在急性胰腺炎（AP）中的相互作用网络及其关键生物行为	首次探索了NETs在AP中的时间点和发病机制，为后续研究提供了基因靶点	NA	全面探索NETs在急性胰腺炎中的关键生物行为，包括时间点和发病机制	中性粒细胞外陷阱（NETs）相关基因及其在急性胰腺炎中的作用	NA	急性胰腺炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）	NA	RNA	AP小鼠模型
2913	2024-10-24	Single-cell analysis in rheumatic and allergic diseases: insights for clinical practice 2024-Nov, Nature reviews. Immunology DOI:10.1038/s41577-024-01043-3 PMID:38914790	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在风湿性和过敏性疾病临床样本中的应用，探讨了其在疾病发病机制中的作用及在临床实践中的潜在应用	结合scRNA-seq数据和细胞表面分子特征、染色质可及性及空间信息等多种细胞属性，深入理解病理机制	单细胞分析结果转化为临床实践和开发个性化治疗策略仍面临挑战	探讨单细胞分析在风湿性和过敏性疾病中的应用，并讨论其在临床实践中的应用前景	风湿性和过敏性疾病的临床样本，包括类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、系统性硬化症、过敏性呼吸道疾病和特应性皮炎	数字病理学	风湿性疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞数据	涉及多种风湿性和过敏性疾病的临床样本，包括外周血细胞和局部病变组织
2914	2024-10-24	Circulating Immune Cells from Early- and Late-onset Pre-eclampsia Displays Distinct Profiles with Differential Impact on Endothelial Activation 2024-Nov-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.4049/jimmunol.2400196 PMID:39302114	研究论文	研究了早发型和晚发型先兆子痫患者循环免疫细胞的差异及其对内皮细胞激活的影响	首次比较了早发型和晚发型先兆子痫患者循环免疫细胞的差异，并探讨了其对内皮细胞激活的影响	研究仅限于体外实验，未涉及临床干预或长期效果的评估	探讨早发型和晚发型先兆子痫患者系统性免疫变化及其对内皮细胞激活的影响	早发型和晚发型先兆子痫患者及正常妊娠对照组的循环免疫细胞	NA	妊娠相关疾病	流式细胞术、多重检测、细胞内细胞因子染色、单细胞RNA测序	NA	血液样本	早发型先兆子痫、晚发型先兆子痫及正常妊娠对照组
2915	2024-10-24	Albumin reprograms the B cell transcriptional landscape and improves neutrophil antimicrobial function in patients with decompensated cirrhosis 2024-Nov, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1 DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101184 PMID:39434891	研究论文	研究探讨了白蛋白在失代偿性肝硬化患者中对B细胞转录组景观的重新编程作用，以及其对中性粒细胞抗菌功能的影响	发现白蛋白能够促进B细胞转录组的重新编程和扩增，并改善中性粒细胞的抗菌功能，从而降低失代偿性肝硬化患者感染的发生率	研究样本量较小，且未进行随机对照临床试验，需要进一步的大规模临床研究验证	探讨白蛋白在失代偿性肝硬化患者中的免疫调节作用及其对感染发生率的影响	失代偿性肝硬化患者和健康志愿者的外周血单核细胞及中性粒细胞	NA	肝硬化	RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	RNA	共涉及20名失代偿性肝硬化患者和34名健康志愿者的外周血单核细胞，以及6名失代偿性肝硬化患者和9名健康志愿者的中性粒细胞
2916	2024-10-24	Senescent Syncytiotrophoblast Secretion During Early Onset Preeclampsia 2024-Oct-23, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979) DOI:10.1161/HYPERTENSIONAHA.124.23362 PMID:39440423	研究论文	研究早发型子痫前期中衰老的合体滋养层细胞分泌物的变化	首次通过单核RNA测序结合空间转录组学技术，识别出早发型子痫前期中合体滋养层细胞的转录组状态变化，并验证了其在临床多中心队列中的应用	研究主要集中在早发型子痫前期的早期预测标记物，未涉及治疗策略的开发	探索早发型子痫前期的发病机制，寻找有效的早期预测标记物	早发型子痫前期和健康对照组的母胎界面单位（胎儿绒毛和母体蜕膜）	NA	妊娠相关疾病	单核RNA测序，空间转录组学	NA	RNA	早发型子痫前期和健康对照组的母胎界面单位样本
2917	2024-10-24	Bioengineered Extracellular Vesicles Delivering siMDM2 Sensitize Oxaliplatin Therapy Efficacy in Colorectal Cancer 2024-Oct-23, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1 DOI:10.1002/adhm.202403531 PMID:39440640	研究论文	研究通过生物工程改造的外泌体递送siMDM2，增强奥沙利铂在结直肠癌治疗中的疗效	首次结合单细胞转录组测序和动态网络生物标志物，揭示了奥沙利铂耐药早期阶段线粒体电子传递链复合物I功能抑制的现象，并通过工程化外泌体递送siMDM2，验证了其在改善奥沙利铂化疗疗效中的应用	研究主要集中在体外和动物模型中，尚未在临床试验中验证	探讨奥沙利铂耐药的早期机制，并开发新的治疗策略	结直肠癌细胞和动物模型	数字病理学	结直肠癌	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	包括患者来源的异种移植模型和肝肺转移小鼠模型
2918	2024-10-24	Distinct deregulation trends of transcriptional protein complexes in aging naive T cells 2024-Oct-22, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiae231 PMID:39437255	研究论文	研究了衰老对幼稚CD4+和CD8+ T细胞中转录蛋白复合物的影响	整合单细胞RNA测序数据和蛋白质-蛋白质及域-域相互作用网络，预测和比较了衰老相关的转录蛋白复合物，并识别了其解释衰老相关变异的能力	NA	研究衰老对T细胞亚群的影响及其潜在的免疫系统功能障碍	幼稚CD4+和CD8+ T细胞	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	来自三个不同年龄组的幼稚CD4+和CD8+ T细胞
2919	2024-10-24	-RAMP3 promotes hepatocellular carcinoma tumor cell-mediated CCL2 degradation by supporting membrane distribution of ACKR2 2024-Oct-21, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113419 PMID:39437486	研究论文	研究探讨了RAMP3与ACKR2的结合及其在肝细胞癌肿瘤微环境中对CCL2降解的协同调控作用	首次揭示了RAMP3通过支持ACKR2的膜分布促进CCL2在肝细胞癌中的降解	研究主要基于细胞系和生物信息学分析，缺乏临床样本的验证	探索RAMP3与ACKR2在肝细胞癌中的相互作用及其对CCL2降解的影响	RAMP3、ACKR2、CCL2以及肝细胞癌细胞系	数字病理学	肝癌	RNA测序、蛋白质-蛋白质相互作用分析	NA	RNA序列、蛋白质相互作用数据	使用了人肝细胞癌细胞系Huh7和HepG2以及小鼠肝细胞癌细胞系Hepa1-6
2920	2024-10-24	Multiple Machine Learning Models, Molecular Subtyping and Singlecell Analysis Identify PANoptosis-related Core Genes and their Association with Subtypes in Crohn's Disease 2024-Oct-21, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2 DOI:10.2174/0109298673330894241008060309 PMID:39440782	研究论文	本研究利用多种机器学习模型和单细胞分析技术，识别了与克罗恩病相关的PANoptosis核心基因及其与亚型的关联	首次构建了具有良好识别效果的PANoptosis特征，揭示了PANoptosis在克罗恩病中的潜在作用	NA	探讨PANoptosis与克罗恩病的关系及其在疾病中的作用机制	克罗恩病患者的PANoptosis相关基因及其亚型	机器学习	消化系统疾病	单细胞RNA测序	随机森林、支持向量机、决策树、高斯混合模型	基因表达数据	多个队列的克罗恩病患者样本