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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2821 | 2024-10-26 |
Astrocyte-induced Cdk5 expedites breast cancer brain metastasis by suppressing MHC-I expression to evade immune recognition
2024-Oct, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01509-5
PMID:39304713
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研究论文 | 研究揭示了星形胶质细胞诱导的Cdk5通过抑制MHC-I表达促进乳腺癌脑转移的免疫逃逸机制 | 首次揭示了星形胶质细胞诱导的Cdk5在乳腺癌脑转移中的作用,并阐明了其通过抑制MHC-I表达实现免疫逃逸的分子机制 | 研究主要在小鼠模型中进行,需要进一步在临床样本中验证 | 探讨乳腺癌脑转移的免疫逃逸机制及其潜在治疗策略 | 乳腺癌脑转移、星形胶质细胞、Cdk5、MHC-I | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
2822 | 2024-10-26 |
Proteomic Heterogeneity of the Extracellular Matrix Identifies Histologic Subtype-Specific Fibroblast in Gastric Cancer
2024-Oct, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2024.100843
PMID:39305996
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研究论文 | 研究探讨了胃癌中细胞外基质(ECM)的蛋白质组异质性,并分析了其与组织学亚型和患者预后的关系 | 首次通过定量蛋白质组学分析胃癌去细胞化组织中的肿瘤ECM,识别出与特定组织学亚型相关的关键分子标记 | 研究主要集中在ECM的蛋白质组分析,未涉及其他分子层面的深入探讨 | 研究胃癌中细胞外基质的蛋白质组异质性及其与组织学亚型和患者预后的关系 | 胃癌患者的去细胞化组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 定量蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组数据 | 多个胃癌患者的去细胞化组织样本 |
2823 | 2024-10-26 |
HKDC1 promotes liver cancer stemness under hypoxia through stabilizing β-catenin
2024-Sep-06, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001085
PMID:39250463
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研究论文 | 研究探讨了HKDC1在低氧条件下通过稳定β-catenin促进肝癌细胞干性的机制 | 首次揭示了HKDC1在肝癌转移中的特异性作用及其通过稳定β-catenin增强肝癌细胞干性的分子机制 | NA | 比较HKDC1与其他HKs在肝癌中的细胞特异性,并研究其在肝癌转移中的分子机制 | HKDC1、HK1、HK2在肝癌中的表达及其对肝癌转移的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA原位杂交、单细胞RNA测序、代谢组学分析 | NA | RNA | 两个肝癌小鼠模型及肝癌和胆管癌患者肿瘤样本 |
2824 | 2024-10-26 |
Osr1-mediated mesothelial transition of liver mesenchymal cells exacerbates fibrotic liver damage
2024-Sep-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.02.024
PMID:38414241
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研究论文 | 研究揭示了在非酒精性脂肪性肝炎(NASH)模型小鼠中,肝星状细胞(HSCs)在肝损伤后向间皮细胞(MCs)的转变过程,并探讨了Osr1基因在这一过程中的作用 | 首次发现肝星状细胞在肝损伤后可以转变为间皮细胞,并揭示了Osr1基因在这一转变中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨肝星状细胞在肝损伤后的转变过程及其在肝纤维化中的作用 | 肝星状细胞、间皮细胞、Osr1基因 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序、体内谱系追踪 | NA | RNA | 非酒精性脂肪性肝炎(NASH)模型小鼠 |
2825 | 2024-10-26 |
Organoids for Cancer Research: Advances and Challenges
2024-Sep, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400056
PMID:38977414
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综述 | 本文综述了癌症类器官在癌症研究中的进展、应用、优势、局限性和前景 | 癌症类器官作为复杂肿瘤微环境的模型,有望提高肿瘤药物开发的成功率并重现最有效的治疗方案 | 癌症类器官的应用仍面临挑战,包括技术限制和标准化问题 | 探讨癌症类器官在临床肿瘤治疗中的应用潜力 | 癌症类器官及其在肿瘤药物开发中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | NA |
2826 | 2024-10-26 |
A Single-Cell Transcriptome Profiling of Triptolide-Induced Nephrotoxicity in Mice
2024-Sep, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400120
PMID:38864263
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,分析了雷公藤内酯诱导的小鼠肾毒性效应及其机制 | 首次在单细胞分辨率下全面描述了雷公藤内酯处理后肾脏细胞的转录组变化和细胞组成 | NA | 揭示雷公藤内酯诱导的肾毒性机制 | 雷公藤内酯处理后的小鼠肾脏组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 控制组和雷公藤内酯处理组的小鼠肾脏组织 |
2827 | 2024-10-26 |
Single-cell multi-omics analysis reveals cooperative transcription factors for gene regulation in oligodendrocytes
2024-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.19.599799
PMID:38948852
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据,识别了在少突胶质细胞中协同调控基因表达的转录因子 | 本文首次通过深度学习模型预测转录因子对目标基因表达的影响,并计算了转录因子重要性和转录因子间相互作用得分 | 实验验证仅限于部分转录因子对,且使用的是大鼠外周神经的ChIP-seq数据 | 研究少突胶质细胞中转录因子如何协同调控基因表达 | 少突胶质细胞及其相关基因和转录因子 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、ChIP-seq | 深度学习模型 | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 未明确提及具体样本数量 |
2828 | 2024-10-26 |
Noninvasive assessment of the lung inflammation-fibrosis axis by targeted imaging of CMKLR1
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9817
PMID:38896611
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研究论文 | 本文验证了CMKLR1作为肺部炎症-纤维化轴成像生物标志物的准确性 | 首次证明了CMKLR1在单细胞RNA测序数据中的表达作为巨噬细胞的瞬时标志物,并展示了其在小鼠模型中作为PET成像靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 验证CMKLR1作为肺部炎症-纤维化轴的成像生物标志物的准确性 | CMKLR1在肺部炎症-纤维化轴中的作用及其作为成像生物标志物的潜力 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、正电子发射断层扫描(PET) | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型和IPF患者样本 |
2829 | 2024-10-26 |
SUB1 promotes colorectal cancer metastasis by activating NF-κB signaling via UBR5-mediated ubiquitination of UBXN1
2024-Jun, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2429-5
PMID:38240906
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研究论文 | 研究探讨了SUB1通过激活NF-κB信号通路促进结直肠癌转移的机制 | 首次揭示了SUB1通过UBR5介导的UBXN1泛素化激活NF-κB信号通路,从而促进结直肠癌转移 | NA | 探讨SUB1在结直肠癌转移中的作用及其分子机制 | SUB1、UBR5、UBXN1及其在结直肠癌转移中的作用 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序 | NA | RNA | NA |
2830 | 2024-10-26 |
Integrated Single-cell Multiomic Analysis of HIV Latency Reversal Reveals Novel Regulators of Viral Reactivation
2024-05-09, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae003
PMID:38902848
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性测序技术,研究了HIV潜伏逆转的机制,并揭示了新的病毒再激活调控因子 | 本文首次整合了单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性测序技术,以同时分析潜伏感染的CD4+ T细胞的转录组和表观基因组特征,并利用机器学习模型预测病毒再激活 | 本文仅验证了两个候选HIV调控因子,未来需要进一步验证其他潜在的调控因子 | 研究HIV潜伏机制,揭示新的病毒再激活调控因子 | 潜伏感染的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞染色质可及性测序(scATAC-seq) | 机器学习模型 | 转录组和表观基因组数据 | 约125,000个潜伏感染的CD4+ T细胞 |
2831 | 2024-10-26 |
Senolytic and senomorphic agent procyanidin C1 alleviates structural and functional decline in the aged retina
2024-Apr-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2311028121
PMID:38657052
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研究论文 | 研究了衰老视网膜中细胞衰老负担增加对结构和功能的影响,并验证了原花青素C1(PCC1)的抗衰老和抗衰老细胞特性 | 首次全面描述了PCC1对衰老视网膜的改善作用,并通过单细胞RNA测序揭示了其分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类中验证 | 探讨衰老视网膜中的细胞衰老负担及其治疗潜力 | 衰老视网膜的结构和功能变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 小鼠模型 |
2832 | 2024-10-26 |
LIG1 is a novel marker for bladder cancer prognosis: evidence based on experimental studies, machine learning and single-cell sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1419126
PMID:39234248
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研究论文 | 本文探讨了LIG1在膀胱癌中的作用及其与预后的关系 | 首次系统研究LIG1在膀胱癌中的作用,结合实验研究、机器学习和单细胞测序技术 | 实验验证主要基于体外和细胞系,缺乏临床样本的直接验证 | 阐明LIG1与膀胱癌的相互作用及其与临床病理因素的相关性 | LIG1在膀胱癌中的表达、功能及其与预后的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的膀胱癌和癌旁组织样本 |
2833 | 2024-10-26 |
TP63 transcriptionally regulates SLC7A5 to suppress ferroptosis in head and neck squamous cell carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1445472
PMID:39234254
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研究论文 | 研究探讨了TP63通过转录调控SLC7A5抑制头颈鳞状细胞癌中的铁死亡机制 | 首次揭示了TP63+ SLC7A5+头颈鳞状细胞癌亚群通过TP63上调SLC7A5表达抑制铁死亡,从而促进肿瘤生长和免疫治疗抵抗的新机制 | NA | 研究头颈鳞状细胞癌在免疫治疗前后肿瘤微环境的异质性及其机制 | 头颈鳞状细胞癌患者在免疫治疗前后的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
2834 | 2024-10-26 |
Transcriptomic signatures of WNT-driven pathways and granulosa cell-oocyte interactions during primordial follicle activation
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0311978
PMID:39441825
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了WNT信号通路在原始卵泡激活过程中对颗粒细胞和卵母细胞相互作用的调控机制 | 首次使用Wntless条件性敲除小鼠模型,揭示了WNT信号通路在原始卵泡激活过程中对颗粒细胞和卵母细胞转录组变化的影响 | 研究仅限于Wntless条件性敲除小鼠模型,未探讨其他信号通路的影响 | 探讨WNT信号通路在原始卵泡激活过程中对颗粒细胞和卵母细胞相互作用的调控机制 | 颗粒细胞和卵母细胞在原始卵泡激活过程中的转录组变化 | 生殖生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | Wntless条件性敲除小鼠 |
2835 | 2024-10-26 |
Application of a risk score model based on glycosylation-related genes in the prognosis and treatment of patients with low-grade glioma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1467858
PMID:39445005
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研究论文 | 研究基于糖基化相关基因的风险评分模型在低级别胶质瘤患者预后和治疗中的应用 | 首次构建了基于糖基化相关基因的风险评分模型,用于低级别胶质瘤的预后预测和治疗指导 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据,需要进一步的临床验证 | 探讨糖基化相关基因在低级别胶质瘤中的生物学功能及其在预后和治疗中的应用 | 低级别胶质瘤患者及其糖基化相关基因 | 数字病理 | 脑肿瘤 | RNA-seq, scRNA-seq | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的低级别胶质瘤患者数据 |
2836 | 2024-10-26 |
Single-cell sequencing technology in skin wound healing
2024, Burns & trauma
IF:6.3Q1
DOI:10.1093/burnst/tkae043
PMID:39445224
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在皮肤伤口愈合中的应用价值 | 单细胞测序技术能够准确检测细胞表达和基因序列,为伤口愈合研究提供了新的概念和工具 | NA | 探讨单细胞测序技术在皮肤伤口愈合中的应用及其在临床中的价值 | 皮肤伤口愈合过程中的细胞和分子机制 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞测序(SCS) | NA | 基因序列 | NA |
2837 | 2024-10-26 |
Microfluidic single-cell migration chip reveals insights into the impact of extracellular matrices on cell movement
2023-10-24, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc00651d
PMID:37750357
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研究论文 | 开发了一种高通量微流控细胞迁移芯片,结合机器人液体处理和计算机视觉技术,监测3200个单细胞的运动,研究细胞外基质对细胞迁移的影响 | 开发了高通量微流控细胞迁移芯片,提供前所未有的单细胞分辨率,研究不同细胞外基质对三阴性乳腺癌细胞迁移的影响 | 研究主要集中在三阴性乳腺癌细胞,未涵盖所有类型的细胞和疾病 | 研究细胞外基质对细胞迁移的影响,为开发治疗与细胞迁移相关疾病的新策略提供见解 | 三阴性乳腺癌细胞在不同细胞外基质中的迁移行为 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微流控技术 | NA | 图像 | 3200个单细胞 |
2838 | 2024-10-26 |
A subpopulation of lipogenic brown adipocytes drives thermogenic memory
2023-Oct, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-023-00893-w
PMID:37783943
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研究论文 | 本文研究了短暂寒冷暴露后棕色脂肪组织的长期转录和代谢适应机制 | 发现了一种脂质生成棕色脂肪细胞亚群,该亚群在短暂寒冷暴露后驱动热生成记忆,并能改善二次寒冷暴露时的热生成反应 | NA | 探讨短暂环境刺激后长期适应的机制 | 棕色脂肪组织及其在寒冷暴露后的转录和代谢适应 | NA | 肥胖 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
2839 | 2024-10-26 |
Optimized protocol for mouse footpad immune cell isolation for single-cell RNA sequencing and flow cytometry
2023-Sep-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102409
PMID:37402171
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的小鼠足垫免疫细胞分离协议,用于单细胞RNA测序和流式细胞术 | 提出了一个高效的小鼠足垫免疫细胞分离方法,保持高细胞活力,适用于单细胞RNA测序 | NA | 开发和优化用于单细胞RNA测序的小鼠足垫免疫细胞分离方法 | 小鼠足垫中的免疫细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠足垫中的免疫细胞 |
2840 | 2024-10-26 |
The Dynamic Role of Cardiac Macrophages in Aging and Disease
2022-08, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-022-01714-4
PMID:35595950
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综述 | 本文综述了心脏免疫景观在衰老、血流动力学应激和心肌损伤中的动态变化,重点介绍了心脏免疫细胞类型及其在心肌损伤后重塑细胞景观和促进组织重塑中的作用 | 通过单细胞转录组学和效应机制的阐明,提供了关于多种心脏疾病发病机制的新见解,并可能为治疗提供新的靶点 | NA | 探讨心脏免疫细胞在衰老和疾病中的动态作用及其在心脏病理中的机制 | 心脏巨噬细胞及其在心肌损伤后的功能 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |