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当前共找到 40291 篇文献，本页显示第 2821 - 2840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2821 | 2026-05-10 |
Identification of circadian rhythm-related biomarkers and development of diagnostic models for Crohn's disease using machine learning algorithms
2026-May, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2453922
PMID:39836385
|
研究论文 | 利用机器学习算法识别克罗恩病中与昼夜节律相关的生物标志物并构建诊断模型 | 首次将昼夜节律相关基因与克罗恩病诊断模型结合，利用单细胞测序验证基因表达谱 | 未明确指出样本量和外部验证的局限性 | 识别克罗恩病中与昼夜节律相关的生物标志物并开发诊断模型 | 克罗恩病患者与对照组的基因表达数据 | 机器学习 | 克罗恩病 | 基因表达芯片、单细胞测序 | 机器学习算法（具体类型未明确） | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 2822 | 2026-05-10 |
The construction of a breast cancer prognostic model by combining genes related to hypoxia and endoplasmic reticulum stress
2026-May, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2453941
PMID:39868728
|
研究论文 | 结合缺氧和内质网应激相关基因构建乳腺癌预后模型 | 首次将缺氧和内质网应激相关基因结合构建乳腺癌预后模型，并分析了免疫浸润和药物敏感性 | NA | 利用缺氧和内质网应激相关基因预测乳腺癌患者预后 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞测序 | Cox回归, Lasso回归 | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2823 | 2026-05-10 |
GZMK+CD8+ T cells target a specific acinar cell type in Sjögren's disease
2026-May, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.08.014
PMID:41162286
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学及空间免疫表型分析，揭示干燥综合征中GZMK+CD8+ T细胞靶向特定腺泡细胞类型及其致病机制 | 首次发现PRR4+CST3+WFDC2-浆黏液性腺泡细胞在干燥综合征中选择性丢失，并揭示了GZMK+CD8+ T细胞通过亚胞溶解效应机制损害线粒体完整性和激活先天免疫信号 | 研究仅限于唾液腺组织，可能不适用于其他外分泌腺体；体外实验可能无法完全反映体内复杂微环境 | 探究干燥综合征中唾液腺内不同细胞类型的相互作用及其在病理过程中的角色 | 人类小唾液腺组织样本，包括干燥综合征患者和非患者 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 干燥综合征患者和对照组的唾液腺样本（具体数量未在摘要中明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium用于单细胞测序，10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 2824 | 2026-05-10 |
The transcriptome of CD14+CD163-HLA-DRlow monocytes predicts mortality in idiopathic pulmonary fibrosis
2026-May, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00804-2025
PMID:41360505
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的转录组，预测特发性肺纤维化患者的死亡率 | 首次发现CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的转录组特征可预测特发性肺纤维化患者的死亡风险，并识别出潜在的药物靶点 | 研究基于样本量有限（n=1054），且未在更大规模独立队列中验证；基因评分与功能的因果关系需进一步实验验证 | 探究免疫细胞特异性转录组特征与特发性肺纤维化死亡率之间的关联 | 特发性肺纤维化患者、健康对照及其他肺部疾病患者 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、细胞反卷积分析 | LASSO回归 | 单细胞转录组数据、临床随访数据 | 1054例样本（特发性肺纤维化555例，其他499例） | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 未明确提及，可能基于10x Genomics平台，但文中仅描述scRNA-seq |
| 2825 | 2026-05-10 |
Agonistic GITR treatment enhances antitumor immune responses and suppresses tumor progression in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-May, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02347-y
PMID:41620983
|
研究论文 | 通过GITR激动剂治疗增强胰腺导管腺癌的抗肿瘤免疫反应并抑制肿瘤进展 | 首次在胰腺导管腺癌中证实GITR激活可减少调节性T细胞并增加细胞毒性效应细胞，结合常规化疗可能改善患者预后 | 主要基于小鼠模型和有限的人类样本，临床转化需进一步验证 | 探索GITR作为胰腺导管腺癌免疫治疗靶点的潜力及其机制 | 胰腺导管腺癌细胞、肿瘤微环境中的淋巴细胞 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 小鼠Pan02模型及人类手术切除样本（包括未治疗和新辅助化疗患者） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium空间转录组学 |
| 2826 | 2026-05-10 |
Multi-Scale Mapping of Gene Expression from Whole-slide Images for Identifying Phenotype-Associated Subpopulations
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521151
PMID:41736695
|
研究论文 | 提出BiSCALE框架，从全切片图像预测组织和近细胞水平的基因表达，并关联临床表型 | 首次实现从全切片图像到组织和近细胞水平的双重尺度基因表达预测，结合Vision-Mamba融合模块和两阶段训练策略，解决了尺度和分布差异 | 仅基于三种癌症类型训练和验证，泛化性需进一步验证；近细胞分辨率仍受限于空间转录组数据质量 | 开发一种经济高效的方法，从常规病理切片多尺度预测基因表达，识别表型相关亚群 | 肿瘤组织和微环境中的细胞亚群 | 数字病理学 | 癌症（三种类型） | NA | Vision-Mamba融合模块 | 图像（全切片图像） | 2109个批量肿瘤样本和141,000个空间转录组斑点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2827 | 2026-05-10 |
Single-cell transcriptomics unveils the immunologic landscape of anti-PD-1-associated indirect drug-induced liver injury
2026-May, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02370-z
PMID:41739156
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示抗PD-1相关间接药物性肝损伤的免疫学机制 | 首次构建了荷瘤小鼠模型中抗PD-1诱导肝损伤的肝脏微环境单细胞图谱，揭示了代谢重编程与促纤维化表型的伴随变化，并发现NETosis激活在肝损伤进展中的关键作用 | 主要在动物模型中验证，临床患者标本用于辅助验证，需要更多人类队列研究来确认发现 | 探索抗PD-1相关肝损伤的病理机制，特别是免疫细胞相互作用和分子通路 | Lewis肺腺癌小鼠模型（C57BL/6J小鼠）及患者肝组织标本 | 机器学习 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（数量未明确说明）及患者标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2828 | 2026-05-10 |
Fibroblast pentose phosphate pathway activation upon decreased circPLCE1 exacerbates intestinal fibrosis in Crohn's disease
2026-Apr-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336415
PMID:41390174
|
研究论文 | 该研究揭示了克罗恩病肠道纤维化中成纤维细胞戊糖磷酸途径的激活机制，并发现circPLCE1下调通过XYLB/Xu5P轴加剧纤维化 | 首次多层整合代谢组、单细胞RNA测序和空间转录组分析，发现circPLCE1/XYLB/Xu5P轴调控成纤维细胞戊糖磷酸途径在肠道纤维化中的作用 | 未提及明显局限性，但可能包括动物模型与人类疾病的差异及机制验证的局限性 | 探索克罗恩病肠道纤维化过程中成纤维细胞的代谢重编程及其上游调控因子 | 克罗恩病患者的狭窄与非狭窄肠段组织、原代人肠道肌成纤维细胞、葡聚糖硫酸钠诱导的肠道纤维化小鼠模型 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 代谢组学, 单细胞RNA测序, 空间转录组, circRNA转录组, 代谢流分析, 海马分析, RNA下拉实验 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 空间转录组数据 | 来自克罗恩病患者狭窄和非狭窄肠段的配对黏膜和黏膜下组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组分析 |
| 2829 | 2026-05-10 |
Decoding the tumor immune landscape: emerging TIL subsets as prognostic biomarkers and therapeutic targets
2026-Apr, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04913-2
PMID:41579172
|
综述 | 综述了肿瘤浸润淋巴细胞中新兴亚群作为预后生物标志物和治疗靶点的作用 | 系统总结了超越传统CD3和CD8标记的TIL亚群在不同癌症中的功能，并聚焦于它们在免疫治疗中的预测价值 | 未提及具体的数据分析或实验验证，可能缺乏对某些新兴亚群的深入机制探讨 | 研究TIL亚群的异质性及其在癌症免疫中的预后和治疗意义 | 肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）的多种亚群，包括CD4+T细胞、Tregs、TRM细胞、γδT细胞等 | 自然语言处理 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | NA | NA |
| 2830 | 2026-05-10 |
The tumor-associated fibroblasts regulate urothelial carcinoma progression
2026-Mar-19, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaf032
PMID:40973873
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序、空间增强分辨率组学测序和UTUC免疫荧光芯片队列构建了CAFs的综合微环境图谱，并研究了CAFs在UTUC进展中的作用 | 首次构建上尿路上皮癌中肿瘤相关成纤维细胞的全面微环境图谱，并通过多组学技术揭示其与肿瘤细胞亚群的相互作用信号及共同预后标志物 | 研究仅基于有限样本和特定平台，未涉及功能性验证或临床干预实验 | 阐明肿瘤相关成纤维细胞在上尿路上皮癌进展中的调控机制及与膀胱尿路上皮癌的共享预后标志物 | 上尿路上皮癌患者肿瘤组织中的肿瘤相关成纤维细胞亚群及肿瘤上皮细胞 | 数字病理学 | 上尿路上皮癌、膀胱尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序、空间增强分辨率组学测序、免疫荧光芯片 | NA | 基因表达数据、空间转录组学数据、免疫荧光图像 | 包含UTUC免疫荧光芯片队列的多组学样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序和单细胞核RNA测序使用10x Chromium平台，空间增强分辨率组学测序使用特定空间平台 |
| 2831 | 2026-05-10 |
Atlas-guided discovery of transcription factors for T cell programming
2026-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09989-7
PMID:41639465
|
研究论文 | 通过构建CD8 T细胞状态图谱，系统定义驱动T细胞程序分化的转录因子 | 首次整合转录组和表观遗传数据构建九种CD8 T细胞状态图谱，结合体内CRISPR筛选与单细胞测序发现新型TEX选择性转录因子ZSCAN20和JDP2 | 未明确说明局限性 | 系统定义驱动CD8 T细胞状态分化的转录因子，为精准工程化T细胞免疫治疗提供平台 | CD8 T细胞的多种分化状态（包括终末耗竭T细胞、组织驻留记忆T细胞等） | 自然语言处理 | 癌症 | CRISPR筛选、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、表观遗传数据 | 九种CD8 T细胞状态的数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2832 | 2026-05-10 |
Engineering tumor spatial heterogeneity in vitro
2026-02, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115757
PMID:41386498
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综述 | 综述了通过工程学方法在体外重建肿瘤空间异质性的技术进展及其在肿瘤生物学和治疗研究中的应用 | 系统整合了肿瘤空间异质性的生物学理解与工程学重建策略，为体外模型模拟体内微环境提供新思路 | 未具体讨论技术的可重复性、标准化及临床转化中的挑战 | 探讨肿瘤空间异质性的体外工程重建方法及其在肿瘤生物学和治疗创新中的指导作用 | 肿瘤空间异质性的体外模型，包括三维生物打印、类器官组装体、器官芯片及细胞外基质仿生支架等 | 数字病理学 | 肿瘤 | 三维生物打印、类器官组装体、器官芯片、细胞外基质仿生支架 | NA | 空间转录组学数据、多路成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2833 | 2026-05-10 |
Spatial transcriptomics uncovers hybrid, proinflammatory, and profibrotic cellular niches in pulmonary granuloma of patients with chronic sarcoidosis
2026-Feb-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1093/ajrccm/aamaf089
PMID:41738160
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示慢性结节病患者肺部肉芽肿中混合促炎和促纤维化的细胞微环境 | 首次在慢性结节病患者的肺肉芽肿中通过空间转录组学描绘出中央巨噬细胞微环境同时具备促炎和促纤维化的混合特征，并发现外周成纤维细胞通过胶原表达和持续IFN-γ刺激维持肉芽肿 | 样本量有限（9例患者），缺乏功能验证实验，未涉及其他组织或疾病阶段的比较 | 揭示慢性结节病肺肉芽肿中不同细胞微环境的空间组成及其分子特征 | 慢性结节病患者的肺组织切片（含肉芽肿） | 空间转录组学 | 结节病（慢性） | 空间转录组学（10x Visium平台）、免疫组织荧光染色、RNA原位杂交 | NA | 基因表达空间数据 | 9例结节病患者的肺外植体（含173个肉芽肿，30,587个基因表达位点） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台（用于FFPE组织切片） |
| 2834 | 2026-05-10 |
miR-22-Galectin-1 as an integral signaling axis in regulating metabolism and immunity in HCC
2026-Jan-15, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00838-3
PMID:41540504
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研究论文 | 本研究探讨miR-22与半乳糖凝集素-1（Gal-1）的相互作用在肝细胞癌（HCC）发展和治疗中的作用 | 揭示了miR-22-Gal-1信号轴在调控HCC代谢和免疫中的双重作用，并证明了miR-22基因治疗依赖于Gal-1沉默 | 未提供明确的局限性说明 | 研究miR-22-Gal-1轴在HCC发展和治疗中的重要性 | 肝细胞癌（HCC）患者和小鼠模型 | NA | 肝细胞癌 | 基因治疗、RNA干扰、空间转录组学、转录组学分析 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | 人类HCC样本来自癌症基因组图谱数据库；小鼠模型为原位HCC小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2835 | 2026-05-10 |
Hypoxia Affects Stem Cell Fate in Patient-Derived Ileum Enteroids in a HIF-1α-Dependent Manner
2025-Dec-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15010031
PMID:41511315
|
研究论文 | 本研究探讨缺氧如何通过HIF-1α依赖性方式影响患者来源回肠类器官中干细胞命运 | 首次证明生理性缺氧通过HIF-1α稳定化直接调控肠道上皮干细胞命运，揭示氧梯度在隐窝-绒毛轴中维持肠道稳态的机制 | 未明确说明，但可能包括类器官模型与体内环境的差异及样本量限制 | 研究氧气可用性如何影响肠道干细胞增殖和分化 | 患者来源的人回肠类器官（肠类器官） | 数字病理学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 患者来源的人回肠类器官（具体数量未提及） | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 批量RNA测序和单细胞RNA测序于Illumina NovaSeq平台 |
| 2836 | 2026-05-10 |
Accurate imputation of pathway-specific gene expression in spatial transcriptomics with PASTA
2025-Dec-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67421-0
PMID:41397970
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研究论文 | 提出一种名为PASTA的空间通路基因表达插补方法，利用细胞类型和空间邻近性提高预测准确性 | 创新性地将通路信息整合到空间转录组基因表达插补过程中，利用邻近细胞及同类型细胞的相似表达模式提高预测鲁棒性和生物学相关性 | 标题和摘要未明确提及方法的局限性 | 准确预测空间转录组中未测量的基因表达，特别是在通路水平上实现稳定且具有生物学意义的插补 | 空间转录组数据中未测量的基因表达 | 机器学习 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | PASTA（通路导向空间基因插补模型） | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2837 | 2026-05-10 |
Differential Localization of β-Catenin Protein in CTNNB1 Mutant Endometrial Cancers Results in Distinct Transcriptional Profiles
2025-Sep, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100791
PMID:40348058
|
研究论文 | CTNNB1突变型子宫内膜癌中β-catenin蛋白差异定位导致不同的转录谱 | 首次揭示突变型β-catenin蛋白在子宫内膜癌中的不同亚细胞定位（细胞核 vs 膜/细胞质）与独特转录谱的关联，并发现TROP2作为潜在治疗靶点 | 未提及 | 研究具有CTNNB1外显子3突变的子宫内膜样子宫内膜癌中，β-catenin蛋白核定位与非核定位对下游基因表达的影响 | CTNNB1突变型子宫内膜样子宫内膜癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学 | NA | 基于蛋白定位选择感兴趣区域（ROIs）进行空间转录组分析 |
| 2838 | 2026-05-10 |
A STAT3/integrin axis accelerates pancreatic cancer initiation and progression
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116010
PMID:40701148
|
研究论文 | 本文发现STAT3/整合素轴通过调控ITGB3表达加速胰腺癌的起始与进展，并揭示其表观遗传调控机制 | 首次发现STAT3通过结合ITGB3增强子区域调控其表达，建立18基因预后特征，为胰腺癌分层治疗提供新靶点 | 未在临床样本中验证18基因特征的实际应用，缺乏体内动物模型对机制的直接验证 | 阐明STAT3通路在胰腺导管腺癌进展中的下游调控机制及临床意义 | 缺氧或制瘤素M处理的胰腺导管腺癌细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | ChIP-seq, 单细胞转录组学 | NA | 测序数据 | 未指定样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台进行单细胞转录组分析 |
| 2839 | 2026-05-10 |
A Spatially Coordinated Keratinocyte-Fibroblast Circuit Recruits MMP9+ Myeloid Cells to Drive IFN-I-Driven Inflammation in Photosensitive Autoimmunity
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.19.670635
PMID:40894544
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学等方法，揭示紫外线B通过角化细胞-成纤维细胞-髓系细胞环路驱动光敏感性自身免疫的机制 | 首次发现MMP9+ CD14+髓系细胞是光敏感性的关键效应细胞，并描述了角化细胞-成纤维细胞-髓系细胞多细胞炎症级联环路 | 研究主要基于人类体外模型和临床样本，可能未完全复制体内微环境的复杂性 | 阐明紫外线B暴露如何触发皮肤特异性自身免疫的分子机制 | 皮肤红斑狼疮和皮肌炎患者皮肤组织及健康对照皮肤 | 数字病理学 | 皮肤红斑狼疮, 皮肌炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 (seqFISH+), 紫外线B激发, 体外模型 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 涉及皮肤红斑狼疮和皮肌炎患者皮损及非皮损皮肤样本，健康对照皮肤样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | seqFISH+ | NA |
| 2840 | 2026-05-10 |
High KYNU Expression Is Associated with Poor Prognosis, KEAP1/STK11 Mutations, and Immunosuppressive Metabolism in Patient-Derived but Not Murine Lung Adenocarcinomas
2025-May-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17101681
PMID:40427178
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研究论文 | 本研究发现了肺腺癌中KYNU基因的双峰表达与患者预后不良相关，并揭示了其与KEAP1/STK11突变及免疫抑制代谢的关系 | 首次揭示KYNU在肺腺癌患者来源肿瘤中与KEAP1/STK11共突变相关且具有免疫抑制代谢表型，而在小鼠模型中表达模式与人类不一致，凸显了物种差异 | 小鼠肺腺癌模型无法忠实再现人类KYNU的表达模式，给临床前模型研究带来挑战 | 发现肺腺癌中与预后相关的双峰表达基因，揭示其潜在致癌基因型及新的治疗见解 | 肺腺癌患者肿瘤样本及其对应的免疫微环境、代谢状态和小鼠模型 | 机器学习 | 肺腺癌, 胰腺癌, 肾癌, 黑色素瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | 聚类模型 | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | 多个肺腺癌数据集，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |