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当前共找到 37547 篇文献，本页显示第 2781 - 2800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2781 | 2026-02-12 |
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Oct-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7564369/v1
PMID:41282090
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VISTA的新方法，用于预测空间转录组学数据中未观测基因的表达水平 | VISTA结合变分推理和几何深度学习，联合建模单细胞RNA-seq数据和空间转录组学数据，并引入不确定性量化，以解决空间转录组学技术中基因数量有限的问题 | NA | 旨在通过预测未观测基因的表达，增强空间转录组学数据的分析能力，以更好地理解空间诱导的细胞状态和特征 | 空间转录组学数据和单细胞RNA-seq数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 变分推理, 几何深度学习 | 基因表达数据 | 四个空间转录组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2782 | 2026-02-12 |
Variational inference of single cell time series
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.29.610389
PMID:39257806
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SNOW的深度学习算法，用于解卷积单细胞时间序列数据，以分离时间依赖和独立成分 | 提出SNOW算法，能够构建有生物学意义的潜在空间、去除批次效应并生成真实的单细胞时间序列 | NA | 解决单细胞RNA测序时间序列数据分析中的挑战，如时间与细胞类型贡献的解卷积、区分真实动态与批次效应 | 单细胞RNA测序时间序列数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2783 | 2026-02-12 |
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2025-Apr-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6248794/v1
PMID:40321776
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了肾上腺皮质类固醇生成谱系的转录组，并发现转录因子HHEX在维持糖皮质激素水平和保护肾上腺免受雄激素诱导的脂质耗竭中起关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别HHEX为糖皮质激素生成细胞中最富集的转录因子，并揭示其在肾上腺性别二态性和脂质代谢调控中的多功能作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类肾上腺中的具体机制尚未完全阐明 | 探究维持肾上腺皮质细胞差异响应能力的分子机制 | 肾上腺皮质糖皮质激素生成细胞（zona fasciculata） | 单细胞组学 | 肾上腺功能障碍 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 使用报告基因小鼠的肾上腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2784 | 2026-02-12 |
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.26.609718
PMID:40166134
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研究论文 | 本文提出了一种名为VISTA的新方法，用于预测空间转录组学数据中未观测基因的表达水平，以解决现有技术基因覆盖限制的问题 | VISTA结合变分推断和几何深度学习，联合建模单细胞RNA-seq和空间转录组学数据，并引入不确定性量化，实现了对未观测基因表达的高效预测 | 方法依赖于单细胞RNA-seq和空间转录组学数据的联合可用性，且性能可能受数据质量和整合难度的影响 | 开发一种能够预测空间转录组学数据中未观测基因表达水平的方法，以增强空间诱导细胞状态和特征的分析能力 | 单细胞RNA-seq数据和亚细胞空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 变分推断, 几何深度学习 | 基因表达数据, 空间数据 | 四个空间转录组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2785 | 2026-02-12 |
MRGPRX2-expressing mast cells are increased in the GI tract of individuals with active inflammatory bowel disease and hereditary α-tryptasemia
2025, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2025.1726096
PMID:41647192
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研究论文 | 本研究探讨了遗传性α-类胰蛋白酶血症（HαT）患者胃肠道中MRGPRX2表达肥大细胞的增加及其在炎症性肠病（IBD）中的作用 | 首次在HαT背景下，结合空间转录组学和质谱流式细胞术，揭示了胃肠道肥大细胞表型改变及MRGPRX2表达上调与IBD活动的关联 | 样本量较小（空间转录组学n=8，质谱流式n=14），且仅针对特定肠道部位（降结肠和小肠）进行分析，可能限制结果的普适性 | 阐明HαT对胃肠道肥大细胞表型及MRGPRX2表达的影响，探索其在IBD症状发生中的潜在机制 | 遗传性α-类胰蛋白酶血症（HαT）患者及匹配的非HαT对照者的肠道组织样本 | 空间转录组学 | 炎症性肠病 | 空间转录组分析、质谱流式细胞术（CyTOF）、微滴数字PCR（ddPCR）、基因分型 | NA | 组织样本、转录组数据、蛋白质表达数据 | 854份生物样本库IBD样本进行基因分型；空间转录组分析8例（HαT=4，对照=4）；质谱流式分析14例（HαT=5，对照=9） | NA | 空间转录组学、单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 2786 | 2026-02-12 |
Multi-omics integration and machine learning-driven construction of an immunogenic cell death prognostic model for colon cancer and functional validation of FCGR2A
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1746907
PMID:41657770
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研究论文 | 本研究通过多组学整合与机器学习构建了一个基于免疫原性细胞死亡（ICD）相关基因的结肠癌预后模型，并验证了关键基因FCGR2A的功能 | 首次系统性地利用ICD相关基因构建结肠癌预后模型，结合单细胞RNA-seq数据解析T细胞状态，并通过大量机器学习模型组合优化特征选择 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床队列验证；体外功能实验仅针对单个基因（FCGR2A） | 开发基于免疫原性细胞死亡的预后模型，探索其与肿瘤免疫微环境及治疗敏感性的关联 | 结肠腺癌（COAD）患者 | 机器学习 | 结肠癌 | 转录组学分析、单细胞RNA-seq、机器学习模型构建 | 随机生存森林（Random Survival Forest） | 转录组数据、临床数据、单细胞RNA-seq数据 | TCGA和GTEx的结肠腺癌患者数据，以及GSE17538和GSE38832作为外部验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2787 | 2026-02-12 |
Multi-omics characterization of RNF157 expression patterns in hepatocellular carcinoma and development of an RNF157-associated prognostic signature
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1738424
PMID:41657776
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学和单细胞分析，表征了肝细胞癌中E3泛素连接酶RNF157的表达模式，开发了一个RNF157相关的预后特征，并探讨了其与肿瘤微环境的关系 | 在单细胞分辨率下表征RNF157在肝细胞癌中的异质性表达模式，并基于此开发了一个新的预后特征模型 | 预后模型的预测性能中等，需要独立验证才能临床应用 | 表征RNF157在肝细胞癌中的表达模式，开发预后特征，并探索其与肿瘤微环境的关系 | 肝细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 流式细胞术 | 预后特征模型 | RNA表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA、GEO数据库和scRNA-seq数据集(GSE149614)的临床和RNA表达数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2788 | 2026-02-12 |
Integrative multi-omics and experimental analyses implicate PTK2 as a lorazepam-associated biomarker and potential therapeutic target in ovarian cancer
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1744802
PMID:41657774
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和实验验证，发现PTK2是劳拉西泮与卵巢癌之间的潜在生物标志物和治疗靶点 | 首次将神经活性药物劳拉西泮与卵巢癌的分子靶点联系起来，并通过空间转录组学揭示了PTK2在肿瘤微环境中的特异性分布 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接药效学证据 | 识别和验证劳拉西泮与卵巢癌共有的分子靶点，以发现新的生物标志物和治疗机制 | 卵巢癌相关基因与劳拉西泮潜在靶点的交集基因，特别是PTK2基因 | 计算生物学 | 卵巢癌 | qPCR, CCK-8, 克隆形成, 伤口愈合, 流式细胞术, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | Lasso-Cox模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2789 | 2026-02-12 |
Single-cell RNA-seq reveals a key role for Vibrio cholerae Mak toxins in Tetrahymena pyriformis killing and bacterial survival
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1729243
PMID:41657991
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq技术揭示了霍乱弧菌Mak毒素在杀死四膜虫和细菌在EFVs中存活的关键作用 | 首次利用单细胞转录组学分析霍乱弧菌暴露于四膜虫时的异质性基因表达，并识别出Mak毒素作为抵抗原生动物捕食和EFVs内存活的关键介质 | 研究仅关注霍乱弧菌和四膜虫的相互作用，分子机制细节仍需进一步探索 | 探究霍乱弧菌抵抗原生动物捕食的分子机制及其在EFVs中的存活策略 | 霍乱弧菌和四膜虫 | 单细胞转录组学 | 霍乱 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 5,344个细菌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2790 | 2026-02-12 |
BMP and NODAL paracrine signalling regulate the totipotent-like cell state in embryonic stem cells
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1720355
PMID:41660012
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和计算框架，探讨了细胞间通讯如何调控胚胎干细胞中的全能样细胞状态，揭示了BMP和NODAL信号通路的关键作用 | 首次结合单细胞RNA测序和计算建模，系统分析胚胎干细胞中配体-受体相互作用，并功能验证BMP和NODAL信号在调控全能样细胞状态中的核心角色 | 研究主要基于体外培养系统，可能无法完全模拟体内胚胎发育的复杂环境，且信号通路的调控机制仍需进一步在体内验证 | 探究细胞间通讯在调控胚胎干细胞命运转变中的作用，特别是针对全能样细胞状态 | 异质性胚胎干细胞群体，尤其是模拟两细胞期胚胎的全能样细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算框架（用于建模配体-受体相互作用和下游调控效应） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2791 | 2026-02-12 |
Single-cell transcriptomics reveals keratinocyte dynamic processes associated with S100a4 expression in psoriasiform dermatitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1744860
PMID:41660613
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了S100a4表达在银屑病样皮炎中与角质形成细胞动态过程相关的机制 | 首次结合CRISPR/Cas9基因敲除小鼠模型和单细胞RNA测序技术，系统解析了S100A4在银屑病发病中的细胞特异性转录景观和调控机制，特别是发现了Klf9介导的Krt15转录失调作为角化过度关键驱动因素的新机制 | 研究基于小鼠模型，结果向人类银屑病的直接转化需进一步验证；单细胞测序样本量相对有限，可能未完全捕获所有细胞亚群异质性 | 探究S100A4在银屑病发病中的具体功能及相关分子机制 | S100a4基因敲除小鼠的皮肤组织及角质形成细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CRISPR/Cas9基因编辑，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量，但涉及不同处理组的小鼠皮肤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2792 | 2026-02-12 |
Characterization of Endothelial Cell Subclusters in Localized Scleroderma Skin with Single-Cell RNA Sequencing Identifies NOTCH Signaling Pathway
2024-Sep-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms251910473
PMID:39408800
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对局限性硬皮病皮肤中的内皮细胞亚群进行了表征，并识别出NOTCH信号通路在疾病中的作用 | 首次在局限性硬皮病皮肤中应用单细胞RNA测序技术详细研究内皮细胞亚群，揭示了NOTCH信号通路的激活及其在疾病进展中的潜在作用 | 研究样本量相对有限（27名患者和17名健康对照），且主要关注内皮细胞，可能未全面覆盖其他细胞类型在疾病中的作用 | 探究局限性硬皮病皮肤中内皮细胞的分子机制及其在疾病发病机制中的作用 | 局限性硬皮病患者和健康对照者的皮肤分离细胞 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 27名局限性硬皮病患者（包括儿童和成人）和17名健康对照者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2793 | 2026-02-12 |
Mast cell activation disrupts interactions between endothelial cells and pericytes during early life allergic asthma
2024-Mar-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173676
PMID:38487999
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研究论文 | 本研究通过定量成像和空间转录组学揭示了早期生命过敏性哮喘中肥大细胞激活破坏内皮细胞与周细胞相互作用的机制 | 首次发现新生儿期过敏暴露通过肥大细胞蛋白酶（如类胰蛋白酶）驱动周细胞覆盖缺失，并利用空间转录组学在儿科哮喘活检中验证血管应激与肥大细胞激活通路的关联 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来自活检样本的空间转录组学分析，样本量有限 | 探究早期生命过敏性哮喘对肺微循环的影响及肥大细胞在血管重塑中的作用 | 新生小鼠的肺组织切片（PCLSs）和儿科哮喘患者的气管内活检样本 | 数字病理学 | 哮喘 | 定量成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2794 | 2026-02-11 |
Inflammation-induced Neuronal Damage in CNS Tuberculosis: Molecular Mechanism and Therapeutic Targets
2026-Mar-15, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2026.150169
PMID:41558621
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综述 | 本文综述了中枢神经系统结核病中神经炎症诱导神经元损伤的分子机制及潜在治疗靶点 | 提出了以胶质细胞驱动的炎症和线粒体功能障碍为核心的统一框架，为疾病发病机制提供了关键见解 | NA | 探讨中枢神经系统结核病中神经免疫机制及宿主导向治疗策略 | 中枢神经系统结核病（CNS-TB）相关的神经炎症和神经元损伤 | NA | 结核病 | 单细胞转录组学、免疫代谢分析 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2795 | 2026-02-11 |
Bioinformatics approach to identifying molecular targets of Danlou tablet against atherosclerosis: a machine learning pharmacology study
2026-Feb-10, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04972-5
PMID:41663811
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研究论文 | 本研究采用整合计算框架，结合网络药理学、生物信息学、单细胞RNA测序和机器学习等方法，旨在识别丹蒌片治疗动脉粥样硬化的新型分子靶点并阐明其作用机制 | 首次将网络药理学、单细胞RNA测序、机器学习、分子对接和分子动力学模拟等多种计算与实验方法整合，系统性地识别丹蒌片抗动脉粥样硬化的新型分子靶点，并提出了HAS2作为β-谷甾醇作用的新候选靶点 | 研究主要基于计算预测和初步的体外细胞验证，缺乏深入的体内实验和临床验证，所提出的分子假说需要进一步的实验证实 | 识别丹蒌片治疗动脉粥样硬化的新型分子靶点并生成机制假说 | 丹蒌片的生物活性成分及其与动脉粥样硬化相关的分子靶点 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 分子对接, 分子动力学模拟, 细胞热位移分析 (CETSA), 酶联免疫吸附测定 (ELISA) | 机器学习算法 | 转录组数据 (单细胞和批量), 化合物-靶点相互作用数据 | 涉及人类脐静脉内皮细胞 (HUVECs) 的初步验证实验 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2796 | 2026-02-11 |
GPR35 protects against reperfusion injury in ischemic stroke by binding with the CR2 domain of Raf1
2026-Feb-10, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03726-1
PMID:41664072
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研究论文 | 本研究揭示了GPR35通过结合Raf1的CR2结构域，在缺血性中风再灌注损伤中发挥保护作用 | 首次发现GPR35与Raf1的CR2结构域直接相互作用，并阐明了其通过Raf1/ERK1/2/MAPK信号通路抑制神经炎症的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探究GPR35在缺血性中风再灌注损伤中的作用机制 | 小鼠脑组织、小胶质细胞 | 神经科学 | 缺血性中风 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2797 | 2026-02-11 |
Mapping Whole-Organism Genetic Comorbidities Across Model Species Using Unified Ontologies
2026-Feb-10, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyag038
PMID:41664592
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研究论文 | 本文提出了一种计算方法来分析与非梗阻性无精子症（NOA）相关基因的全生物体共病性，利用统一的本体结构跨物种比较表型 | 开发了一个整合新生殖表型本体与标准化全身表型类别的框架，实现直接跨物种比较，并创建了CoMorbidity DataBase Mapper（CoMo DBM）资源 | 方法依赖于模型生物数据库中的基因型-表型关联数据，可能受数据完整性和准确性限制 | 识别遗传变异如何贡献于全生物体表型，以揭示疾病机制 | 与非梗阻性无精子症（NOA）相关的基因及其在人类、小鼠、斑马鱼、果蝇和线虫中的直系同源物 | 生物信息学 | 男性不育症 | 单细胞RNA-seq，全生物体基因表达分析，基因本体注释 | NA | 基因型-表型关联数据，RNA-seq数据，基因表达数据 | 204个经实验验证的小鼠基因及其跨物种直系同源物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2798 | 2026-02-11 |
Single-cell analysis reveals the diversity of human fetal membrane and adjacent placental cells with preterm premature rupture of membranes
2026-Feb-09, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf143
PMID:41319021
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了早产胎膜早破（PPROM）中人类胎膜及邻近胎盘细胞的多样性 | 识别了先前未知的滋养层细胞亚型FABP7+Tb，并发现MMP11在EVT-1中的上调表达可能作为PPROM诊断的生物标志物 | 样本来源仅限于脐带周围约两厘米的组织，可能无法完全代表整个胎膜及胎盘区域的细胞多样性 | 探究PPROM的细胞组成和遗传变化，以揭示其分子机制和早期预测靶点 | 来自足月分娩、早产无胎膜早破及PPROM女性的胎膜及邻近胎盘组织 | 数字病理学 | 产科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据，图像数据 | 来自三组女性（FTIL、PPWROM、PPROM）的胎膜及邻近胎盘组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2799 | 2026-02-11 |
AKT3-Driven Epithelial-Mesenchymal Plasticity Governs Ovarian Metastasis in Colorectal Cancer via Tumor Microenvironment Remodeling
2026-Feb-09, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1718
PMID:41662163
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析，揭示了AKT3驱动的上皮-间质可塑性在结直肠癌卵巢转移中的作用，并提出了针对该亚型的精准治疗平台 | 首次在结直肠癌卵巢转移中识别AKT3⁺ EMT样细胞作为转移起始细胞，并阐明其通过肿瘤微环境重塑促进转移的机制 | 研究样本量相对有限，且主要基于观察性数据和模型验证，需进一步临床验证 | 阐明结直肠癌卵巢转移的生物学机制并探索潜在治疗靶点 | 结直肠癌卵巢转移患者样本、异种移植模型和患者来源类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据、批量转录组数据、免疫荧光图像 | 35名患者的155,163个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2800 | 2026-02-11 |
Spatial transcriptomics identifies IL-32 as a lipid droplet-associated cytokine linked to tubular injury in human diabetic kidney disease
2026-Feb-07, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02192-y
PMID:41653322
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术，在人类糖尿病肾病中鉴定出脂滴相关细胞因子IL-32，并揭示其与肾小管损伤及疾病进展的联系 | 首次利用单细胞空间转录组学在糖尿病肾病肾活检组织中鉴定出IL-32作为一种脂滴相关细胞因子，并发现其在损伤肾小管中特异性高表达，建立了脂质代谢失调与炎症信号之间的分子联系 | 样本量相对较小（14例患者），且主要关注肾小管区域，未全面评估其他肾细胞类型的作用 | 探究糖尿病肾病中脂质积累与炎症信号之间的分子联系及其在肾小管损伤中的作用 | 糖尿病肾病患者的肾活检组织 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学，单细胞空间转录组学，数字空间分析，RNA scope，免疫荧光显微镜，尼罗红光谱分析 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | 14例不同病理分期的糖尿病肾病患者肾活检样本 | NA | 空间转录组学，单细胞空间转录组学 | NA | NA |