单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
2781 2024-10-27
Structure-preserved integration of scRNA-seq data using heterogeneous graph neural network
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出了一种利用异构图神经网络(scHetG)进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据整合的方法 通过构建异构图来表示多批次细胞和基因之间的相互作用,并结合异构图神经网络和对比学习,同时获取包含结构信息的细胞和基因嵌入 NA 消除批次效应并保留细胞和基因的结构信息 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 异构图神经网络(Heterogeneous Graph Neural Network) 基因表达数据 涉及多个物种、组织和尺度的数据
2782 2024-10-27
Single-cell RNA sequencing to map tumor heterogeneity in gastric carcinogenesis paving roads to individualized therapy
2024-Sep-13, Cancer immunology, immunotherapy : CII
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在胃癌(GC)研究中的应用,探讨了其在揭示肿瘤异质性和个性化治疗中的潜力 scRNA-seq技术提供了前所未有的分子、细胞和免疫层面的肿瘤微环境(TME)复杂生物组成和特征的见解 NA 探讨scRNA-seq在胃癌研究中的应用及其在个性化治疗中的潜力 胃癌的肿瘤异质性、肿瘤微环境中的免疫细胞和基质细胞 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
2783 2024-10-27
NR3C2 affects the proliferation and invasiveness of colon cancer cells through the Wnt/β-Catenin signaling pathway
2024-Sep-05, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 研究探讨了核受体亚家族3组C成员2(NR3C2)与结肠癌预后及机制之间的潜在关联 首次揭示了NR3C2通过Wnt/β-Catenin信号通路影响结肠癌细胞的增殖、侵袭、凋亡和自噬 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据,实验验证仅限于体外和动物模型 探索NR3C2与结肠癌预后及机制之间的关联 结肠癌细胞的增殖、侵袭、凋亡和自噬 数字病理学 结肠癌 RNA测序 NA mRNA数据 包括TCGA数据库中的结肠癌样本和GEO数据库中的单细胞数据,以及三个新鲜结肠癌样本及其对应的癌旁样本
2784 2024-10-27
Emerging advances in defining the molecular and therapeutic landscape of small-cell lung cancer
2024-Aug, Nature reviews. Clinical oncology
综述 本文综述了小细胞肺癌(SCLC)的分子和治疗领域的最新进展 本文介绍了通过单细胞RNA测序数据揭示的SCLC的可塑性和肿瘤内及肿瘤间异质性,以及这些特性与治疗抵抗的可能关联 治疗抵抗的快速发展和缺乏有效的SCLC患者选择生物标志物是当前的挑战 综述SCLC的基因组和转录组特征,并探讨将其转化为新的治疗策略以改善患者预后的机会 小细胞肺癌(SCLC)及其分子和治疗策略 NA 肺癌 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 NA
2785 2024-08-07
Unraveling the dynamics of myometrial remodeling: insights from single-cell and spatial transcriptomics in term pregnancy
2024-Aug-01, Physiological genomics IF:2.5Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
2786 2024-10-27
Development of a CD163-Targeted PET Radiotracer That Images Resident Macrophages in Atherosclerosis
2024-May-01, Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine IF:9.1Q1
研究论文 开发了一种靶向CD163的PET放射性示踪剂,用于成像动脉粥样硬化中的常驻巨噬细胞 首次开发了一种靶向CD163的PET放射性示踪剂,用于非侵入性检测动脉粥样硬化中的常驻巨噬细胞 需要在转化研究中进一步验证[Cu]Cu-ICT-01的敏感性和特异性 开发一种靶向PET放射性示踪剂,用于成像动脉粥样硬化中的CD163阳性巨噬细胞,并评估CD163作为人类动脉粥样硬化生物标志物的潜力 CD163阳性巨噬细胞和动脉粥样硬化斑块 NA 心血管疾病 PET成像 NA 图像 多个小鼠动脉粥样硬化模型和人类颈动脉粥样硬化斑块
2787 2024-10-27
Exercise mitigates flow recirculation and activates metabolic transducer SCD1 to catalyze vascular protective metabolites
2024-Feb-16, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 研究探讨了运动如何通过激活代谢传感器SCD1来减轻血流再循环并催化血管保护代谢物 首次揭示了运动通过激活内皮细胞中的SCD1来催化抗炎脂质代谢物,从而减轻NF-κB介导的炎症反应 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在人类中验证 探讨运动对心血管代谢疾病的改善作用及其背后的代谢机制 小鼠的内皮细胞和血管 心血管疾病 心血管疾病 代谢组学分析、计算机模拟分析、单细胞转录组学 NA 代谢物、基因表达数据 野生型小鼠和内皮细胞缺失的小鼠
2788 2024-10-27
The implication of integrative multiple RNA modification-based subtypes in gastric cancer immunotherapy and prognosis
2024-Feb-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究全面探讨了多种RNA修饰对胃癌的影响,并开发了一种预测模型来评估其对免疫治疗和预后的影响 首次综合研究多种RNA修饰对胃癌的影响,并开发了基于Stepwise Regression和Random Survival Forest算法的预测模型 NA 探讨多种RNA修饰对胃癌免疫治疗和预后的影响 胃癌样本中的多种RNA修饰 数字病理学 胃癌 RNA测序 随机生存森林 基因表达数据 1,946个胃癌样本
2789 2024-10-27
Genetically inspired organoids prevent joint degeneration and alleviate chondrocyte senescence via Col11a1-HIF1α-mediated glycolysis-OXPHOS metabolism shift
2024-02, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 研究报告了COL11A1基因与髋关节发育不良(DDH)的关联,并通过基因工程器官模型预防关节退化和减轻软骨细胞衰老 首次报道了COL11A1基因与DDH的关联,并开发了一种基于COL11A1过表达的器官模型用于预防关节退化和减轻软骨细胞衰老 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在人类中进行验证 探索COL11A1基因在髋关节发育不良和关节退化中的作用,并开发新的治疗方法 髋关节发育不良患者、Col11a1基因敲除小鼠、软骨细胞 生物医学 骨关节疾病 全基因组关联研究(GWAS)、外显子测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因数据、单细胞RNA测序数据 不同人群的家族性DDH患者、Col11a1基因敲除小鼠
2790 2024-10-27
Redefining the tumor microenvironment with emerging therapeutic strategies
2024, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本文讨论了通过调整肿瘤微环境(TME)来改善癌症治疗的新策略 提出了通过外泌体传递药物和增强免疫检查点抑制剂(ICIS)的联合治疗策略,以及采用细胞转移(ACT)疗法作为肿瘤治疗选项 NA 探讨如何通过调整肿瘤微环境来提高抗癌免疫力和克服治疗抵抗 肿瘤微环境及其在癌症进展和治疗反应中的作用 NA NA 单细胞RNA测序和空间转录组学 NA NA NA
2791 2024-10-27
NSUN6 and HTR7 disturbed the stability of carotid atherosclerotic plaques by regulating the immune responses of macrophages
2024, Open medicine (Warsaw, Poland)
研究论文 研究通过识别和验证八个关键基因,探讨了它们在颈动脉粥样硬化斑块稳定性中的作用 首次发现NSUN6和HTR7通过调节巨噬细胞的免疫反应影响颈动脉粥样硬化斑块的稳定性 研究主要基于体外实验和数据分析,缺乏体内实验验证 寻找促进颈动脉粥样硬化斑块从稳定状态转变为不稳定状态的关键基因 颈动脉粥样硬化斑块和巨噬细胞 NA 心血管疾病 RT-qPCR, ELISA, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 五组数据集,中风患者的样本
2792 2024-10-27
Neural stem cell metabolism revisited: a critical role for mitochondria
2023-08, Trends in endocrinology and metabolism: TEM
综述 本文综述了线粒体代谢在鼠和人类神经干细胞(NSCs)胚胎和成年大脑中的作用 本文重新审视了线粒体在神经干细胞代谢中的关键作用,并探讨了单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据在成年NSCs代谢特征中的应用 NA 探讨线粒体代谢在神经干细胞维持和命运决定中的作用 鼠和人类神经干细胞(NSCs) 细胞生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
2793 2024-10-27
Cloning a profibrotic stem cell variant in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-04-26, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 研究通过单细胞克隆技术在特发性肺纤维化患者中鉴定出一种促纤维化干细胞变异体 首次通过单细胞克隆技术鉴定出特发性肺纤维化中的一种主要干细胞变异体,并发现其在体外能将正常肺成纤维细胞转化为病理性肌成纤维细胞,在体内能激活和招募肌成纤维细胞 研究样本量较小,且仅限于特发性肺纤维化患者和对照组,未涵盖其他肺部疾病 探讨特发性肺纤维化中干细胞变异体的特征及其在疾病发展中的作用 特发性肺纤维化患者的远端肺部基底干细胞 数字病理学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 16名特发性肺纤维化患者和10名对照组
2794 2024-10-26
SRSF2 is essential for maintaining pancreatic beta-cell identity and regulating glucose homeostasis in mice
2024-Dec, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
研究论文 研究探讨了剪接因子SRSF2在维持胰腺β细胞身份和调节小鼠血糖稳态中的关键作用 首次揭示了SRSF2在胰腺β细胞生存和血糖稳态中的重要作用,并通过单细胞RNA测序分析了其对β细胞身份和功能的调控机制 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证SRSF2的作用 探讨SRSF2在胰腺β细胞功能和血糖稳态中的作用 胰腺β细胞和小鼠模型 NA 糖尿病 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及10个月龄的小鼠和Min6细胞
2795 2024-10-26
Interactions between polycyclic aromatic hydrocarbons and genetic variants in the cGAS-STING pathway affect the risk of colorectal cancer
2024-Dec, Archives of toxicology IF:4.8Q1
研究论文 研究多环芳烃与cGAS-STING通路基因变异在结直肠癌风险中的相互作用 首次探讨了cGAS-STING通路基因变异与多环芳烃暴露在结直肠癌风险中的相互作用 研究样本量较小,可能影响结果的普适性 探讨基因与环境因素在结直肠癌风险中的相互作用 cGAS-STING通路基因变异与多环芳烃暴露 NA 结直肠癌 RNA测序 NA RNA NA
2796 2024-10-26
Evolutionary diversity of CXCL16-CXCR6: Convergent substitutions and recurrent gene loss in sauropsids
2024-Dec, Immunogenetics IF:2.9Q3
研究论文 研究CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性及其对宿主免疫的影响 首次在脊椎动物中比较了约400个CXCR6直系同源基因,发现DRF基序在不同物种中的替代和CXCR6基因在某些鸟类和爬行动物中的反复丢失 研究主要集中在脊椎动物,未涵盖所有物种,且对基因丢失的具体机制和免疫影响的深入研究有限 探讨CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性及其对宿主免疫的影响 CXCL16-CXCR6轴在不同脊椎动物中的基因变异和进化 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因序列 约400个CXCR6直系同源基因,涵盖多种脊椎动物
2797 2024-10-26
In situ reprogramming of cardiac fibroblasts into cardiomyocytes in mouse heart with chemicals
2024-Nov, Acta pharmacologica Sinica IF:6.9Q1
研究论文 研究使用化学混合物在心脏原位将成纤维细胞重编程为心肌细胞 首次在全心脏水平上验证了使用小分子混合物诱导成纤维细胞原位重编程为心肌细胞的可行性 NA 探索化学混合物在心脏原位重编程成纤维细胞为心肌细胞的效果 小鼠心脏中的成纤维细胞和心肌细胞 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 图像 两种遗传标记的小鼠
2798 2024-10-26
Tongmai Zhuke decoction restrains the inflammatory reaction of macrophages for carotid artery atherosclerosis by up-regulating lincRNA-Cox2
2024-Nov, Biotechnology & genetic engineering reviews
研究论文 探讨通脉逐瘀汤通过上调lincRNA-Cox2抑制巨噬细胞炎症反应,从而治疗颈动脉粥样硬化的机制 发现通脉逐瘀汤通过上调lincRNA-Cox2抑制巨噬细胞炎症反应,为颈动脉粥样硬化的治疗提供了新的机制 研究仅基于体外实验数据,缺乏体内实验验证 探索通脉逐瘀汤治疗颈动脉粥样硬化的分子机制 颈动脉粥样硬化中的巨噬细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 两组深度转录组数据和两组单细胞RNA测序数据
2799 2024-10-26
Spatial Transcriptomic Approach to Understanding Coronary Atherosclerotic Plaque Stability
2024-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 研究使用空间转录组学方法探讨冠状动脉粥样硬化斑块的稳定性 采用空间转录组学技术,结合GeoMx空间分析平台和全转录组图谱,对冠状动脉斑块进行细胞形态和空间转录组分析,揭示了斑块稳定性和不稳定性中的细胞特异性和区域性转录变化 研究样本量较小,仅包括5名患者,可能影响结果的普适性 探讨冠状动脉粥样硬化斑块稳定性的分子机制 冠状动脉斑块的稳定性和不稳定性 数字病理学 心血管疾病 空间转录组学 NA 转录组数据 5名患者
2800 2024-10-26
Hic-5 antisense oligonucleotide inhibits advanced hepatic fibrosis and steatosis in vivo
2024-Nov, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1
研究论文 本研究探讨了Hic-5反义寡核苷酸在抑制体内晚期肝纤维化和脂肪变性中的临床应用 开发了针对Hic-5的反义寡核苷酸,并在MASH小鼠模型中验证了其治疗晚期肝纤维化和脂肪变性的潜力 NA 研究Hic-5在肝纤维化和脂肪性肝炎中的作用,并评估反义寡核苷酸作为治疗手段的潜力 人肝纤维化组织和MASH小鼠模型 NA 肝病 单细胞RNA测序 NA RNA NA
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