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当前共找到 35811 篇文献,本页显示第 261 - 280 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
261 2026-01-29
A multi-omics analysis of pancreatitis: bridging familial genetics and disease progression
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,整合家族性慢性胰腺炎和急性胰腺炎队列,揭示了胰腺炎的共享分子和细胞病理学机制 整合罕见家族性慢性胰腺炎的全外显子组测序与大型急性胰腺炎队列的单细胞RNA测序及批量转录组学数据,首次构建了连接遗传变异与免疫细胞特征的统一发病机制模型 研究样本量相对有限,特别是家族性慢性胰腺炎病例较少,且主要依赖公共数据集进行验证 探究胰腺炎的遗传基础和免疫细胞机制,以识别潜在的生物标志物和治疗靶点 家族性慢性胰腺炎患者及其家庭成员,以及公共急性胰腺炎队列患者 多组学分析 胰腺炎 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 批量转录组学 人工智能驱动模型 基因组数据, 转录组数据 2名儿科慢性胰腺炎患者及其家庭成员,以及119名急性胰腺炎患者 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
262 2026-01-29
From multi-omics to functional validation: the PTMRS stratifies TME and positions PDGFRB in CRC biology
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究构建了一个基于翻译后修饰相关基因的风险特征模型(PTMRS),用于结直肠癌的预后分层,并通过实验验证了PDGFRβ在肿瘤微环境中的关键作用 首次整合多种翻译后修饰信号构建结直肠癌风险模型,并通过单细胞RNA测序和细胞通讯分析揭示了PTMRS与肿瘤微环境的关联,实验验证了PDGFRβ在成纤维细胞中的促癌功能 需要在体内模型和前瞻性临床队列中进一步验证 开发结直肠癌的精准预后分层工具并探索其生物学机制 结直肠癌患者样本、人类结肠成纤维细胞和结直肠癌细胞 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞通讯分析(CellChat)、体外功能实验 Cox偏最小二乘框架 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 TCGA和GTEx数据集中的结直肠癌样本,多个独立队列和免疫治疗数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
263 2026-01-29
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization identifies mitochondrial targets in immune cells for Major Depressive Disorder
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组孟德尔随机化方法,识别了免疫细胞中与重度抑郁症风险相关的线粒体靶基因 整合多组学数据与机器学习,结合细胞类型特异性孟德尔随机化分析,首次在免疫细胞中鉴定出线粒体相关能量代谢基因对重度抑郁症风险的因果影响 研究主要基于遗传关联数据,需进一步实验验证基因功能机制;样本来源和模型验证可能限制结果的普适性 识别与重度抑郁症风险相关的免疫细胞中线粒体基因,为生物标志物和治疗靶点开发提供依据 免疫细胞中的线粒体相关能量代谢基因(MEMRGs)及重度抑郁症患者 生物信息学 重度抑郁症 单细胞转录组测序,孟德尔随机化,机器学习,ssGSEA,CIBERSORT 机器学习模型(未指定具体类型),孟德尔随机化模型 多组学数据(包括转录组数据),遗传数据 未明确指定人类样本数量,但包括独立队列验证和CUMS大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
264 2026-01-29
Single-cell transcriptional profiling revealed the protective effects of Buddleoside in sepsis-associated acute liver injury
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了天然化合物Buddleoside对脓毒症相关急性肝损伤的保护作用及其免疫调节机制 首次在单细胞分辨率下系统阐明Buddleoside通过调节内皮细胞、中性粒细胞和巨噬细胞亚群来缓解脓毒症相关急性肝损伤的分子机制 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证;机制研究主要依赖转录组数据,缺乏蛋白质功能验证 评估Buddleoside对脓毒症相关急性肝损伤的保护作用并探索其免疫调节机制 小鼠脓毒症相关急性肝损伤模型中的肝脏细胞 单细胞组学 脓毒症相关急性肝损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
265 2026-01-29
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis reveals shared pathogenesis and prognostic biomarkers in breast and thyroid cancers
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析,揭示了乳腺癌和甲状腺癌的共享发病机制及预后生物标志物 首次结合单细胞和批量转录组数据,系统探索乳腺癌与甲状腺癌的共病分子机制,并利用机器学习构建预后模型,验证了SMR3B作为共享预后基因 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分有限,且样本来源和数量可能影响结果的普适性 阐明乳腺癌和甲状腺癌的共享发病机制,并识别共同的预后生物标志物和治疗靶点 乳腺癌和甲状腺癌的转录组数据,包括单细胞和批量RNA测序数据 生物信息学 乳腺癌, 甲状腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 差异表达基因分析, 功能富集分析, 拷贝数变异分析, 非负矩阵分解, 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法 非负矩阵分解, 加权基因共表达网络分析, 机器学习模型 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
266 2026-01-29
P2RY13+ dendritic cells correlate with enhanced antigen presentation and lymphocyte activation in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性表达于树突状细胞,并阐明了其通过增强抗原呈递和T细胞激活来促进抗肿瘤免疫的作用机制 首次在单细胞分辨率下确定了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性细胞表达谱(树突状细胞),并系统性地将其表达与免疫浸润、细胞间通讯及预后关联起来 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证来证实P2RY13在树突状细胞中的功能机制 探究P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的细胞特异性表达、功能及其与免疫调节和预后的关系 肺腺癌患者肿瘤组织及正常组织的转录组和临床数据 生物信息学 肺腺癌 单细胞RNA测序,转录组分析,生物信息学算法 Seurat, CIBERSORT, MCP-counter, quanTIseq, TIMER, ESTIMATE, CellChat, AUCell, UCell, AddModuleScore, GSVA, JASMINE, singscore, ssGSEA, viper 转录组数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 来自TCGA、GEO(GSE68465和GSE31210)和单细胞数据集(GSE131907)的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
267 2026-01-29
Cellular senescence in age-related cardiovascular disease: past and future
2025, Frontiers in aging IF:3.3Q2
综述 本文综述了细胞衰老在年龄相关心血管疾病中的作用,并提出了一个以衰老相关分泌表型为核心、解释少数衰老细胞如何系统性影响心血管微环境的统一框架 超越对通路的简单罗列,提出了一个以少数衰老细胞如何重编程心血管微环境为核心、整合关键调控网络的统一框架,并前瞻性地讨论了靶向衰老的治疗策略 机制复杂性高,动物模型和体外系统存在局限性 阐明细胞衰老在年龄相关心血管疾病发生发展中的作用机制,并探讨靶向衰老作为延缓心血管衰老和治疗相关疾病的新策略 衰老细胞及其分泌表型对主要心血管细胞类型(心肌细胞、内皮细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞)的影响 NA 心血管疾病 单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
268 2026-01-29
JAK-centric explainable few-shot gene-expression diagnosis framework for alopecia via MultiPLIER priors and relation-style set-to-set comparison
2025, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本文开发了一个基于JAK-STAT信号通路的可解释少样本基因表达诊断框架,用于区分斑秃和雄激素性脱发 提出了一种结合生物学先验知识(MultiPLIER潜在变量)和关系式集合比较的少样本深度学习分类器,增强了小样本条件下的诊断鲁棒性和机制可解释性 研究样本量有限,且框架在更广泛疾病类型中的应用仍需验证 开发可解释的AI框架,用于小样本转录组诊断,以区分斑秃和雄激素性脱发 斑秃和雄激素性脱发患者的头皮样本 机器学习 脱发疾病 RNA-seq 少样本深度学习分类器(Relation-style set-to-set comparator) 基因表达数据 未明确指定具体样本数量,但涉及独立AA/AGA/健康头皮样本 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
269 2026-01-29
Spatiotemporal dynamics of spermatogenesis: insights from high-resolution spatial transcriptomics and pseudotime trajectories in mouse testes
2025, Frontiers in reproductive health IF:2.3Q3
研究论文 本研究利用高分辨率空间转录组学技术揭示了小鼠睾丸中精子发生的时空动态过程 采用Salus-STS高分辨率空间转录组学(约1微米分辨率)结合Salus Cellbins算法,首次在单细胞水平上解析了睾丸的空间转录组特征,克服了传统空间转录组学分辨率不足的问题 研究仅基于小鼠模型,未直接验证人类样本;高分辨率技术可能受限于样本处理和成本 探究精子发生的分子基础和时空动态,以增进对男性生殖生物学的理解 小鼠睾丸组织 空间转录组学 男性不育 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq Salus-STS Salus-STS高分辨率空间转录组学(约1微米分辨率)
270 2026-01-29
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析,揭示了白细胞介素-1β在致心律失常性心肌病进展中的关键驱动作用 首次在ACM中结合单核RNA测序和空间转录组学,识别了炎症-纤维化空间微环境,并证实靶向IL-1β可改善疾病表型 研究样本量有限,且主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 探究致心律失常性心肌病的疾病进展机制并评估潜在治疗靶点 ACM患者心肌样本和Desmoglein-2突变小鼠模型 数字病理学 心血管疾病 单核RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 ACM患者和对照捐赠者的心肌样本,以及Desmoglein-2突变小鼠 NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
271 2026-01-29
Epigenomic, transcriptomic and proteomic characterizations of reference samples
2024-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过ATAC-seq、Methyl-seq、RNA-seq和蛋白质组学分析,全面表征了乳腺癌细胞系和配对B细胞系的表观基因组、转录组和蛋白质组景观,提供了多组学参考材料 首次为两种细胞系提供了包括表观基因组和蛋白质组在内的全面多组学参考数据,填补了现有参考材料在表观组学和蛋白质组学方面的空白 研究仅基于两种细胞系,可能无法完全代表更广泛的生物样本多样性 开发和验证用于下一代测序技术和临床应用的参考标准材料 乳腺癌细胞系和配对的B细胞系 多组学分析 乳腺癌 ATAC-seq, Methyl-seq, RNA-seq, 蛋白质组学分析, 全基因组测序, HiC, scRNA-seq NA 基因组、表观基因组、转录组、单细胞RNA-seq和蛋白质组数据 两种细胞系(乳腺癌细胞系和配对B细胞系) Illumina, PacBio, Nanopore 全基因组测序, HiC, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 甲基化测序, RNA-seq, 蛋白质组学 NA NA
272 2026-01-29
Single-cell RNA sequencing data locate ALDH1A2-mediated retinoic acid synthetic pathway to glomerular parietal epithelial cells
2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
综述 本文通过挖掘小鼠和人类肾脏的单细胞及单核RNA测序数据库,发现肾小球壁层上皮细胞(PECs)表达全谱的视黄酸合成相关基因,并定位了ALDH1A2介导的视黄酸合成通路,探讨了其在肾脏生理和病理中的潜在作用 首次利用单细胞及单核RNA测序数据,系统性地将ALDH1A2介导的视黄酸合成通路定位到肾小球壁层上皮细胞,并揭示了该通路在多种肾脏疾病模型及患者中的表达变化 本文主要基于数据挖掘和生物信息学分析,提出的假说(即PECs中ALDH1A2介导的视黄酸合成在肾脏中发挥未定义的作用且其失调介导损伤)仍需通过条件性基因敲除、RNA沉默及转基因小鼠模型等实验进行验证 阐明ALDH1A2介导的视黄酸合成通路在肾脏(特别是肾小球壁层上皮细胞)中的定位、表达调控及其在肾脏生理和病理(如肾小球肾炎、急性肾损伤、慢性肾病等)中的潜在作用 小鼠和人类肾脏组织,特别是肾小球壁层上皮细胞(PECs) 数字病理学 肾脏疾病(包括肾小球肾炎、急性肾损伤、慢性肾病、糖尿病肾病、局灶节段性肾小球硬化、多囊肾病等) 单细胞RNA测序,单核RNA测序,Spearman秩相关系数分析,基因本体通路分析 NA RNA测序数据(单细胞及单核水平) NA(涉及多个公开数据库中的小鼠模型及人类患者数据) NA 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq NA NA
273 2026-01-29
ExAD-GNN: Explainable Graph Neural Network for Alzheimer's Disease State Prediction from Single-cell Data
2023-Dec-06, APSIPA Transactions on Signal and Information Processing
研究论文 本文提出了一种名为ExAD-GNN的可解释图神经网络,用于从单细胞测序数据预测阿尔茨海默病状态 通过结合KNN图结构分析单细胞表达谱,ExAD-GNN不仅能预测AD病理状态,还能识别细胞类型特异性标记基因,提供分子层面的疾病机制洞察 方法依赖于单细胞测序数据的质量和可用性,可能未完全解决大脑复杂异质性的所有方面 开发一种可解释的机器学习方法,以从单细胞数据中准确预测阿尔茨海默病状态并识别相关风险基因 阿尔茨海默病患者和对照组的单细胞RNA测序数据 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 图神经网络 单细胞表达谱数据 大规模单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
274 2026-01-28
EMP1-driven ferroptosis in liver sinusoidal endothelial cells exacerbates hepatic ischemia-reperfusion injury via P38 MAPK
2026-Feb-16, Free radical biology & medicine
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现EMP1基因在肝窦内皮细胞中上调,驱动铁死亡并加剧肝缺血再灌注损伤,揭示了p38 MAPK信号通路的关键作用 首次将EMP1基因与肝窦内皮细胞的铁死亡联系起来,并阐明其通过p38 MAPK信号通路加剧肝缺血再灌注损伤的新机制 研究主要基于体外细胞模型和单细胞测序数据,缺乏在体动物模型的直接验证 探究肝缺血再灌注损伤中肝窦内皮细胞铁死亡的分子机制及其对肝细胞损伤的影响 人类肝脏样本、肝窦内皮细胞和BRL3A肝细胞 单细胞组学 肝缺血再灌注损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 人类正常对照组和移植诱导缺血再灌注损伤组肝脏样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
275 2026-01-28
Epigenetically activated MIR100HG regulates UPF1-mediated oxidative stress to promote pulmonary vascular immune microenvironment remodeling
2026-Feb-16, Free radical biology & medicine
研究论文 本研究揭示了长链非编码RNA MIR100HG通过调控UPF1/NRF2信号轴,在肺动脉高压中促进氧化应激、血管平滑肌细胞增殖及免疫微环境重塑的分子机制 首次系统鉴定了肺动脉高压中染色质重塑相关的lncRNA,并阐明了MIR100HG通过表观遗传激活,调控UPF1介导的氧化应激及免疫微环境重塑的新机制 研究主要基于细胞和动物模型,临床样本验证及MIR100HG作为治疗靶点的体内疗效和安全性评估有待进一步研究 阐明表观遗传修饰在肺动脉高压氧化应激及免疫微环境失衡中的分子机制 肺动脉平滑肌细胞、巨噬细胞、肺动脉高压动物模型 表观遗传学、分子生物学 肺动脉高压 ChIP-sequencing、单细胞测序、质谱分析、RNA-pulldown、RNA免疫沉淀 NA 基因组测序数据、单细胞测序数据、蛋白质互作数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
276 2026-01-28
A temporal and spatial atlas of adaptive immune responses in the lymph node following viral infection
2026-Feb-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究介绍了一种名为AIR-SPACE的整合方法,结合高分辨率空间转录组学和配对的高保真长读长测序,以分析淋巴结中适应性免疫细胞的空间组织和动态响应 开发了AIR-SPACE方法,首次将高分辨率空间转录组学与T和B细胞受体的配对长读长测序结合,实现了在原生空间背景下同时分析细胞转录组和适应性免疫受体库 研究仅基于小鼠模型和痘苗病毒感染,可能无法完全反映人类或其他病原体感染下的免疫响应 旨在理解病毒感染后淋巴结中适应性免疫细胞的空间组织和动态响应机制 小鼠腘淋巴结中的适应性免疫细胞(T细胞和B细胞) 空间转录组学 病毒感染 高分辨率空间转录组学,配对高保真长读长测序 NA 空间转录组数据,免疫受体序列数据 小鼠腘淋巴结在五个不同时间点 NA 空间转录组学,单细胞测序 NA NA
277 2026-01-28
Transcriptomics and metabolomics analysis reveal cell subpopulations of trophoblast cells associated with preeclampsia
2026-Feb-01, Physiological genomics IF:2.5Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组、批量转录组和代谢组数据,揭示了子痫前期胎盘组织中滋养细胞亚群的改变及其与免疫通路和代谢异常的关联 采用多组学整合方法,结合单细胞RNA测序、批量RNA测序和代谢组学数据,首次系统描绘了子痫前期胎盘滋养细胞亚群的组成、分化轨迹及基因-代谢物相互作用网络 样本量相对较小,单细胞RNA测序仅包括2例子痫前期和2例对照样本,代谢组学分析仅涉及6例患者和6例对照,可能限制统计功效和普遍性 探究子痫前期胎盘功能障碍的细胞和分子机制,特别是滋养细胞亚群的改变及其在疾病发病中的作用 子痫前期患者和匹配对照的胎盘组织及血浆样本 数字病理学 子痫前期 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 代谢组学分析 伪时间分析, 差异表达分析, 通路富集分析 转录组数据, 代谢组数据 单细胞RNA测序: 2例子痫前期和2例对照;批量RNA测序: 8例早发型子痫前期和5例正常足月分娩;代谢组学: 6例子痫前期和6例对照(各3次重复) NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 代谢组学 NA NA
278 2026-01-28
TLR3 stimulation rejuvenates aged mesenchymal stem cells and restores immunosuppressive function in graft-versus-host disease
2026-Feb, Transplant immunology IF:1.6Q3
研究论文 本研究探讨了间充质干细胞衰老对移植物抗宿主病疗效的影响,并发现TLR3激动剂poly(I:C)可逆转衰老表型,恢复其免疫抑制功能 首次通过单细胞RNA测序揭示MSC衰老导致免疫调节亚群丢失和TLR3信号下调,并证明TLR3激活可逆转衰老、恢复功能 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;未探讨长期治疗安全性和其他TLR激动剂效果 探究MSC衰老对GVHD治疗效果的影响及逆转衰老的策略 人类间充质干细胞(早期传代P5与晚期传代P15)及小鼠GVHD模型 干细胞治疗与免疫学 移植物抗宿主病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量,涉及早期(P5)和晚期(P15)传代MSCs及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
279 2026-01-28
Subclinical fields of BRAF V600E-mutant melanocytes populate human skin and are enriched around melanoma and naevi
2026-Jan-27, The British journal of dermatology
研究论文 本研究通过分析高风险个体非病变皮肤样本,发现BRAF V600E突变黑色素细胞在正常皮肤中普遍存在,尤其在肿瘤邻近区域更密集和频繁,挑战了BRAF V600E表达必然致癌的传统观点 首次在临床健康皮肤中系统识别出BRAF V600E突变黑色素细胞亚临床区域,揭示了这些细胞在肿瘤周围富集且呈现生长停滞的转录特征,为黑色素瘤起源提供了新见解 样本主要来自高风险澳大利亚人群,可能限制结果的普适性;研究未长期追踪这些突变细胞的肿瘤转化潜力 探究BRAF V600E突变黑色素细胞是否常见于高风险个体非病变皮肤中,以理解黑色素瘤的早期发生机制 高风险黑色素瘤个体的非病变皮肤样本(包括痣或黑色素瘤邻近区域、光损伤皮肤、光保护皮肤)及新生儿包皮来源的黑色素母细胞 数字病理学 黑色素瘤 免疫组织化学、液滴数字PCR、单细胞RNA测序 NA 组织切片图像、基因表达数据 97个临床和病理学健康的非病变皮肤样本,来自高风险黑色素瘤个体队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
280 2026-01-28
Heterogeneous generation and expansion of epidermal-resident memory T cells in individuals allergic to nickel
2026-Jan-27, The British journal of dermatology
研究论文 本研究通过重复镍斑贴试验,探究了镍过敏个体表皮中驻留记忆T细胞的异质性生成与扩增机制 首次在镍过敏个体中,通过重复暴露实验结合单细胞RNA测序,揭示了表皮TRM细胞的克隆扩增、分化异质性及耗竭样群体的存在 样本量较小(12名参与者),且未能将特定T细胞亚型与临床反应严重程度相关联 研究重复镍暴露如何影响镍过敏个体的临床反应及表皮TRM细胞的积累与分化 镍过敏个体的表皮皮肤样本 免疫学 过敏性接触性皮炎 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 12名镍过敏参与者,每人进行三次斑贴试验并采集皮肤活检 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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