单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 30478 篇文献，本页显示第 2701 - 2720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2701 | 2025-07-02 |
Morphodynamics of human early brain organoid development
2025-Jun-18, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09151-3
PMID:40533563
|
研究论文 | 本研究通过长期活体光片显微镜技术，探索了人类早期脑类器官发育的形态动力学 | 提出了一种新颖的双通道、多马赛克和多蛋白标记策略，结合计算去复用方法，实现了类器官发育过程中不同亚细胞特征的同步量化 | 研究主要依赖于体外培养的脑类器官模型，可能与体内真实脑发育存在差异 | 研究人类脑发育的机制和自我组织过程 | 人类诱导多能干细胞生成的脑类器官 | 发育生物学 | NA | 光片显微镜、单细胞转录组测序 | NA | 图像、转录组数据 | 未明确提及具体样本数量，使用荧光标记的人类诱导多能干细胞生成的脑类器官 |
| 2702 | 2025-07-02 |
A statistical framework for inferring genetic requirements from embryo-scale single-cell sequencing experiments
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.03.646654
PMID:40236139
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研究论文 | 本文介绍了一个统计框架和两个软件工具（Hooke和Platt），用于从胚胎尺度的单细胞测序实验中推断遗传需求 | 利用单细胞数据集中的丰富统计模式来表征实验扰动的直接分子和细胞后果，并揭示了命运决定转录因子的新作用 | 需要处理包含数百万个细胞和数千个样本的数据集，计算挑战较大 | 推断遗传需求并揭示细胞在脊椎动物发育程序中如何依赖基因和彼此 | 斑马鱼胚胎的单细胞图谱 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 统计框架 | 单细胞测序数据 | 数千个斑马鱼胚胎的数百万个细胞 |
| 2703 | 2025-07-02 |
HLA-DQB1*03:01 strongly affects age of onset of type 1 narcolepsy independently of DQA1 and ethnicity
2025-Jun-16, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.06.14.25328971
PMID:40585110
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研究论文 | 本研究探讨了HLA-DQB1*03:01对1型发作性睡病发病年龄的影响，并进行了首个跨种族研究 | 首次跨种族研究HLA-DQB1*03:01对发作性睡病发病年龄的影响，发现该基因独立于DQA1和种族背景显著影响发病年龄 | 尚未确定导致疾病的T细胞，病理生理学机制仍需进一步研究 | 探究HLA-DQB1*03:01对1型发作性睡病发病年龄的影响 | 5,339例来自中国、欧洲、韩国、日本和美国的1型发作性睡病患者 | 遗传学 | 发作性睡病 | GWAS, HIBAG, RNA-seq | NA | 基因数据 | 5,339例患者（来自5个国家） |
| 2704 | 2025-07-02 |
Cambridge Neoadjuvant Cancer of the Prostate (CANCAP03): A Window Study into the Effects of Olaparib ± Degarelix in Primary Prostate Cancer
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-1304
PMID:40358364
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研究论文 | 本研究探讨了PARP抑制剂与雄激素抑制联合治疗在原发性前列腺癌中的作用及其生物学机制 | 在无同源重组修复通路突变的情况下，探索了PARP抑制剂与雄激素抑制联合治疗的临床效果及生物学机制 | 研究样本量较小，且未明确长期治疗效果 | 研究PARP抑制剂与雄激素抑制联合治疗在原发性前列腺癌中的效果及生物学机制 | 原发性前列腺癌患者 | 肿瘤学 | 前列腺癌 | IHC、肿瘤基因测序、突变分析、RNA-seq（包括bulk和single-cell RNA-seq） | NA | 组织样本 | 未明确具体样本数量，但涉及诊断活检和根治性前列腺切除术样本 |
| 2705 | 2025-07-02 |
Azacitidine, Venetoclax, and Magrolimab in Newly Diagnosed and Relapsed Refractory Acute Myeloid Leukemia: Phase Ib/II Study and Correlative Analysis
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0229
PMID:40198272
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研究论文 | 评估阿扎胞苷、维奈托克和magrolimab三联疗法在新诊断和复发难治性急性髓系白血病中的安全性和有效性 | 首次在临床研究中评估了针对CD47的单克隆抗体magrolimab与阿扎胞苷-维奈托克联合使用的效果 | 生存结果不够理想，样本量相对较小 | 评估三联疗法在急性髓系白血病患者中的疗效和安全性 | 成人急性髓系白血病患者（初治不适合强化疗和复发难治性） | 临床肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据和基因表达数据 | 106名患者（54名初治患者和52名复发难治患者） |
| 2706 | 2025-07-02 |
Dissection of the immune landscape in psoriatic arthritis defines immunoproteasome up-regulation in treatment resistance
2025-06-06, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adu0284
PMID:40478933
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析银屑病关节炎患者的滑液免疫景观，揭示了治疗抵抗患者中免疫蛋白酶体和MHC I类基因的上调 | 首次在治疗抵抗的银屑病关节炎患者中鉴定出免疫蛋白酶体和MHC I类基因的上调，并验证了选择性免疫蛋白酶体抑制剂的治疗潜力 | 样本量相对较小（41例PsA患者和9例OA对照），且需要进一步临床验证免疫蛋白酶体抑制剂的效果 | 探索银屑病关节炎治疗抵抗的免疫学机制并寻找新的治疗靶点 | 银屑病关节炎患者的滑液免疫细胞 | 免疫学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 41例银屑病关节炎患者和9例骨关节炎对照的滑液样本 |
| 2707 | 2025-07-02 |
An engineered viral protein activates STAT5 to prevent T cell suppression
2025-05-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adn9633
PMID:40408430
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研究论文 | 本文展示了一种通过工程化病毒蛋白激活STAT5以增强T细胞功能的方法 | 利用工程化的疱疹病毒蛋白TIP非经典激活STAT蛋白，实现细胞因子非依赖的T细胞功能维持 | 研究主要基于体外和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 解决T细胞疗法中JAK-STAT信号通路失调导致的功能障碍问题 | CD8+ T细胞 | 免疫治疗 | 肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2708 | 2025-07-02 |
Potential Key Genes for Giant Cell Arteritis Revealed Based on Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization Analysis
2025-May-09, International archives of allergy and immunology
IF:2.5Q3
DOI:10.1159/000546323
PMID:40349694
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，识别了与巨细胞动脉炎(GCA)相关的三个关键基因，并探讨了其潜在致病机制 | 首次整合单细胞RNA测序、表达数量性状位点和全基因组关联研究数据，采用两样本孟德尔随机化方法探索CD4+ T细胞中标记基因对GCA发展的因果效应 | 研究结果需要进一步实验验证，且样本量和种族多样性可能有限 | 识别与GCA相关的关键基因并探索潜在致病机制 | 巨细胞动脉炎(GCA)患者 | 生物信息学 | 巨细胞动脉炎 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 表达数量性状位点分析, 全基因组关联研究 | 两样本孟德尔随机化模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 未明确说明样本数量 |
| 2709 | 2025-07-02 |
Fusion of spatiotemporal and network models to prioritize multiscale effects in single-cell perturbations
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf277
PMID:40545244
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研究论文 | 本文提出了一种名为Perturb-STNet的新框架，用于识别和排序单细胞扰动中的时空差异表达调控因子，以揭示疾病发展和治疗反应的关键调控网络 | Perturb-STNet结合了基于网络的时空模型，能够量化复杂多细胞或多组织系统中的动态影响，特别是在具有时空分辨率的单细胞数据中 | NA | 识别和排序单细胞扰动中的时空差异表达调控因子，以揭示疾病发展和治疗反应的关键调控网络 | 单细胞数据，包括上皮-间质转化肺癌数据、小鼠黑色素瘤模型的CODEX单细胞成像时间数据以及结肠炎的MERFISH空间转录组时间数据 | 数字病理学 | 肺癌, 黑色素瘤, 结肠炎 | CODEX单细胞成像, MERFISH空间转录组 | 网络模型, 时空模型 | 单细胞数据, 时空数据 | 合成数据、上皮-间质转化肺癌数据、小鼠黑色素瘤模型的CODEX单细胞成像时间数据、结肠炎的MERFISH空间转录组时间数据 |
| 2710 | 2025-07-02 |
T-B cell cooperation in ectopic lymphoid follicles propagates CNS autoimmunity
2025-04-25, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adn2784
PMID:40279405
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研究论文 | 本研究探讨了脑膜异位淋巴滤泡（eLF）样结构在多发性硬化症中的作用，揭示了T细胞与B细胞在其中的合作机制 | 首次通过单细胞RNA测序和活体成像技术直接观察T17-B细胞在eLF中的长期抗原特异性接触及其对自身反应性T细胞的再激活作用 | 研究基于实验性自身免疫性脑脊髓炎模型，结果向人类疾病的直接转化需要进一步验证 | 阐明中枢神经系统自身免疫中T-B细胞协作的分子机制 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中的T细胞和B细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序、活体成像 | T17过继转移实验性自身免疫性脑脊髓炎模型 | 基因表达数据、影像数据 | NA |
| 2711 | 2025-07-02 |
Single-Cell Analysis Combined with Mendelian Randomization Identifies Genes Associated with Prostate Cancer Cells
2025-Apr-23, The world journal of men's health
DOI:10.5534/wjmh.240298
PMID:40583027
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞数据与孟德尔随机化分析，探讨了与前列腺癌细胞囊膜侵袭相关的预后基因 | 结合单细胞测序与孟德尔随机化分析，识别出与前列腺癌进展相关的关键基因TMEM59 | 样本量较小，仅包含6例前列腺癌病例的单细胞数据 | 研究前列腺癌囊膜侵袭相关的预后基因 | 前列腺癌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 孟德尔随机化分析, 免疫组化 | hdWGCNA, Seurat | 单细胞测序数据, SNP数据, 临床数据 | 6例前列腺癌病例的单细胞数据, 来自TCGA和GEO的临床与基因表达数据 |
| 2712 | 2025-07-02 |
Identification of Recurrence-associated Gene Signatures and Machine Learning-based Prediction in IDH-Wildtype Histological Glioblastoma
2025-Apr-14, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-025-02345-4
PMID:40227386
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)和机器学习方法，识别了IDH野生型组织学胶质母细胞瘤(GBM)复发相关的基因特征，并建立了预测模型 | 发现了8个与GBM复发显著相关的基因，并首次建立了基于随机森林的高精度预测模型 | 研究样本量相对有限，且仅针对IDH野生型GBM | 探索GBM复发的分子机制并开发预测模型 | IDH野生型组织学胶质母细胞瘤 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | WGCNA, RT-qPCR, scRNA-seq, 机器学习 | 随机森林(RF) | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | CGGA-693队列(n=190), CGGA-325队列(n=111), 外加两个scRNA-seq数据集 |
| 2713 | 2025-07-02 |
Psychological stress increases skin infection through the action of TGFβ to suppress immune-acting fibroblasts
2025-04-11, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ads0519
PMID:40215323
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研究论文 | 研究心理压力如何通过TGFβ抑制免疫活性成纤维细胞增加皮肤感染 | 揭示了心理压力通过TGFβ介导的脑-皮肤轴抑制成纤维细胞的抗菌肽产生，从而增加皮肤感染的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需进一步验证 | 探究心理压力导致皮肤感染的分子机制 | 小鼠模型中的皮肤成纤维细胞 | 免疫学 | 皮肤感染 | 单细胞转录组学、脂质组学分析 | 小鼠压力模型 | 基因表达数据、脂质组数据 | 未明确说明的小鼠样本 |
| 2714 | 2025-07-02 |
Eutopic macrophages facilitate endometriosis progression via ferroptosis-mediated release of S100A9
2025-Apr-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf027
PMID:40493892
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研究论文 | 本研究探讨了子宫内膜异位症中S100A9+巨噬细胞亚群通过铁死亡促进疾病进展的机制 | 首次发现并验证了S100A9+巨噬细胞亚群通过铁死亡机制促进子宫内膜异位症血管生成 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床验证尚不充分 | 阐明巨噬细胞在子宫内膜异位症进展中的具体作用机制 | 子宫内膜异位症患者的子宫内膜组织和巨噬细胞 | 生殖医学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和体外功能实验 | 小鼠子宫内膜异位症模型 | 基因表达数据和病理学数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及人类子宫内膜组织和实验小鼠 |
| 2715 | 2025-07-02 |
Lysine methyltransferase SETD7 coordinates the emergence of mature and senescent subpopulations during the decidualization of endometrial stromal cells
2025-Apr-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf028
PMID:40570096
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白甲基转移酶SETD7在子宫内膜基质细胞（EnSC）蜕膜化过程中的作用 | 揭示了SETD7作为EnSC蜕膜化的新型分子调节剂，特别是在稳定雌激素受体蛋白和调节细胞命运分歧中的作用 | 研究主要基于体外实验和公开的单细胞RNA测序数据，可能无法完全反映体内复杂环境 | 探究SETD7在EnSC蜕膜化过程中的分子机制及其与妊娠失败的关联 | 子宫内膜基质细胞（EnSC） | 分子生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序、mRNA微阵列分析 | SETD7敲除模型 | RNA测序数据、微阵列数据 | 公开的单细胞RNA测序数据和子宫内膜组织的批量mRNA微阵列数据 |
| 2716 | 2025-07-02 |
Altered immune landscape of cervical lymph nodes reveals Epstein-Barr virus signature in multiple sclerosis
2025-02-21, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adl3604
PMID:39982975
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序和转录组与表位测序的细胞索引技术，分析了多发性硬化症(MS)患者深颈淋巴结(dcLNs)的免疫景观，揭示了EB病毒(EBV)在MS发病机制中的关键作用 | 首次在MS患者的dcLNs中观察到EBV驱动的B细胞失调，并检测到EBV DNA和病毒载量的增加 | 研究样本量有限，且仅针对新诊断未治疗的MS患者 | 探究EBV感染与多发性硬化症发病机制之间的关系 | 新诊断未治疗的多发性硬化症患者 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, 转录组与表位测序的细胞索引 | NA | RNA测序数据, 唾液样本 | 新诊断未治疗的MS患者样本 |
| 2717 | 2025-07-02 |
IL-4 induces CD22 expression to restrain the effector program of virtual memory T cells
2025-02-07, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adk4841
PMID:39919198
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research paper | 本文研究了IL-4如何通过诱导CD22表达来调控虚拟记忆T细胞的效应程序 | 首次发现CD22作为IL-4诱导T细胞的选择性表面标记物，并揭示了CD22在调控IL-4依赖性T细胞效应程序中的内在作用 | 研究主要聚焦于CD8 T细胞，未涉及其他免疫细胞类型的潜在作用 | 阐明IL-4依赖性T细胞激活和扩增的调控机制 | 虚拟记忆CD8 T细胞 | 免疫学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 |
| 2718 | 2025-07-02 |
Gonadal sex and temperature independently influence germ cell differentiation and meiotic progression in Trachemys scripta
2025-Jan-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2413191121
PMID:39793067
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研究论文 | 本研究探讨了温度和性腺性别对红耳滑龟生殖细胞分化和减数分裂进程的独立影响 | 揭示了温度对生殖细胞性分化的直接影响，独立于其对性腺体细胞的影响 | 研究仅针对红耳滑龟这一TSD物种，结果可能不适用于其他物种 | 探究温度是否直接影响生殖细胞分化和性别认同的其他方面 | 红耳滑龟(Trachemys scripta)的生殖细胞 | 发育生物学 | NA | 减数分裂铺片分析、单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2719 | 2025-07-02 |
An insight into COVID-19 host immunity at single-cell resolution
2025, International reviews of immunology
IF:4.3Q2
DOI:10.1080/08830185.2024.2443420
PMID:39707914
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综述 | 本文系统性地描述了COVID-19感染及不同疫苗接种期间，单细胞转录组学揭示的宿主免疫细胞类型和状态的相对丰度及分子行为的病毒诱导失调 | 利用单细胞转录组学高分辨率研究COVID-19宿主免疫反应，识别和表征疾病相关特定细胞群 | 基于过去三到四年发表的单细胞研究，可能未涵盖最新进展 | 探讨COVID-19宿主免疫反应的细胞和分子机制 | 先天和适应性免疫细胞类型及状态 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 2720 | 2025-07-02 |
Inonotus obliquus (chaga) ameliorates folic acid-induced renal fibrosis in mice: the crosstalk analysis among PT cells, macrophages and T cells based on single-cell sequencing
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1556739
PMID:40160460
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了桦褐孔菌（Chaga）对叶酸诱导的小鼠肾纤维化的治疗作用及其细胞和分子机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究Chaga在肾纤维化中的治疗作用，揭示了其通过调节巨噬细胞和T细胞的炎症反应及近端肾小管细胞的基因表达来减轻纤维化的潜在机制 | 需要进一步的实验验证以确立其临床应用 | 探讨桦褐孔菌（Chaga）对肾纤维化的治疗作用及其机制 | 叶酸诱导的肾纤维化小鼠模型 | 数字病理 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、UPLC-MS、H&E和Masson三色染色 | 小鼠模型 | 基因表达数据、图像数据 | 82,496个肾脏细胞 |