单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 27041 - 27060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 27041 | 2024-08-09 |
RNA-Seq Profiling of Intact and Enucleated Oocyte SCNT Embryos Reveals the Role of Pig Oocyte Nucleus in Somatic Reprogramming
2016, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0153093
PMID:27070804
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析了完整和去核卵母细胞的SCNT胚胎，揭示了猪卵母细胞核在体细胞重编程中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了完整和去核卵母细胞SCNT胚胎在2细胞和4细胞阶段的转录组差异，为理解卵母细胞核在体细胞重编程中的机制提供了新的见解 | 研究仅限于猪的卵母细胞和胚胎，可能需要进一步研究以推广到其他物种 | 探究卵母细胞核在体细胞重编程中的分子机制 | 猪的完整和去核卵母细胞SCNT胚胎 | 分子生物学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 539个完整MII卵母细胞和461个去核MII卵母细胞，260个多倍体胚胎和93个传统克隆胚胎 |
| 27042 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing: revealing human pre-implantation development, pluripotency and germline development
2016-Sep, Journal of internal medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1111/joim.12493
PMID:27046137
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示人类早期发育、多能性和生殖细胞发育方面的应用 | 单细胞RNA测序技术为系统性探索人类早期胚胎提供了新的强大工具 | 由于伦理问题、人类胚胎稀缺以及DNA和RNA微量存在，对这一过程的彻底研究仍然受限 | 探讨单细胞RNA测序技术在人类早期发育研究中的优势和局限 | 人类早期发育、胚胎干细胞和生殖细胞的建立 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数百个细胞组成的囊胚 |
| 27043 | 2024-08-09 |
Distinct myeloid progenitor-differentiation pathways identified through single-cell RNA sequencing
2016-06, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/ni.3412
PMID:27043410
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究者发现了不同的骨髓前体细胞分化途径 | 本文首次通过单细胞转录组分析，揭示了骨髓前体细胞在分化过程中存在两种不同的途径，一种途径表达转录因子GATA-1，生成肥大细胞、嗜酸性粒细胞、巨核细胞和红细胞；另一种途径不表达该基因，生成单核细胞、中性粒细胞和淋巴细胞 | NA | 探索骨髓前体细胞的分化途径 | 骨髓前体细胞的分化途径 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 27044 | 2024-08-09 |
Expression Analysis Highlights AXL as a Candidate Zika Virus Entry Receptor in Neural Stem Cells
2016-05-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2016.03.012
PMID:27038591
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化技术，分析了Zika病毒（ZIKV）在发育中的大脑中多个细胞类型的受体表达情况，特别是候选病毒进入受体AXL的表达。 | 首次揭示AXL在人类放射状胶质细胞、星形胶质细胞、内皮细胞和微胶质细胞中的高表达，以及在发育中的小鼠和雪貂皮质及人类干细胞衍生的脑类器官中的保守表达。 | NA | 探讨Zika病毒感染与胎儿异常和微头症之间的分子和细胞机制。 | Zika病毒在发育中的大脑中的受体表达情况，特别是AXL受体。 | NA | NA | 单细胞RNA测序，免疫组化 | NA | RNA | 多种细胞类型，包括人类放射状胶质细胞、星形胶质细胞、内皮细胞、微胶质细胞，以及小鼠和雪貂的皮质细胞和人类干细胞衍生的脑类器官。 |
| 27045 | 2024-08-09 |
Design and computational analysis of single-cell RNA-sequencing experiments
2016-Apr-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-016-0927-y
PMID:27052890
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研究论文 | 本文重点介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）实验设计和分析的计算方法，及其在不同场景下的优缺点 | 探讨了scRNA-seq实验中新兴的计算挑战，并提出了未来发展的预期 | NA | 旨在解决scRNA-seq实验中的计算挑战，并推动该领域的发展 | 单细胞RNA测序实验的设计和分析方法 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | NA |
| 27046 | 2024-08-09 |
The potential of single-cell profiling in plants
2016-Apr-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-016-0931-2
PMID:27048384
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research paper | 本文探讨了单细胞转录组学在植物研究中的应用潜力 | 单细胞RNA-seq技术在植物细胞中的应用为植物生物学提供了新的视角 | 单细胞转录组学在植物中的应用仍处于早期阶段，且需要针对单细胞实验的新分析工具 | 探讨单细胞转录组学在植物研究中的应用及其对植物生物学基本问题的潜在影响 | 植物细胞的特性、可塑性及对环境输入的局部细胞反应 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 27047 | 2024-08-09 |
Lineage specification in the mouse preimplantation embryo
2016-Apr-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.128314
PMID:27048685
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research paper | 本文探讨了小鼠植入前胚胎中细胞谱系的形成过程及其调控机制 | 利用活体成像、计算建模和单细胞转录组分析等新技术，提供了对细胞谱系形成过程的新见解 | NA | 研究小鼠植入前胚胎中细胞谱系的形成及其调控机制 | 小鼠植入前胚胎中的细胞谱系形成 | NA | NA | 活体成像、计算建模、单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 27048 | 2024-08-09 |
A biased view toward celiac disease
2016-05, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/mi.2016.17
PMID:27007675
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研究论文 | 本文通过应用体外单细胞TCR测序技术，研究了乳糜泻患者中T细胞受体的偏倚使用情况，揭示了其与两种谷蛋白表位的反应关系。 | 首次应用体外单细胞TCR测序技术研究乳糜泻患者中T细胞受体的偏倚使用情况，为疾病发病机制、诊断和治疗提供了新视角。 | NA | 探讨乳糜泻患者中T细胞受体的偏倚使用情况及其与疾病发病机制、诊断和治疗的关系。 | 乳糜泻患者的T细胞受体及谷蛋白表位。 | NA | 乳糜泻 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 27049 | 2024-08-09 |
DNMT3A Haploinsufficiency Transforms FLT3ITD Myeloproliferative Disease into a Rapid, Spontaneous, and Fully Penetrant Acute Myeloid Leukemia
2016-05, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-16-0008
PMID:27016502
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研究论文 | 研究显示DNMT3A半合子不足能够将FLT3ITD骨髓增殖性疾病转化为快速、自发且完全渗透性的急性髓系白血病 | 首次证明DNMT3A半合子不足在FLT3ITD骨髓增殖性疾病转化为急性髓系白血病中的作用，并揭示了其可逆的表观遗传学改变 | NA | 探讨DNMT3A半合子不足在FLT3ITD骨髓增殖性疾病转化为急性髓系白血病中的作用及其机制 | DNMT3A和FLT3突变的小鼠模型 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 27050 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals molecular and functional platelet bias of aged haematopoietic stem cells
2016-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms11075
PMID:27009448
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了衰老造血干细胞在分子和功能上对血小板的偏向性 | 发现了衰老造血干细胞中一种先前未被识别的、专门产生血小板的干细胞类别，并证实了通过去除FOG-1转录因子来消除造血干细胞的血小板编程，可以增加淋巴细胞的输出 | NA | 探究衰老造血干细胞内在变化及其子集平衡如何影响细胞谱系输出 | 衰老造血干细胞的分子和功能特性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 27051 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals activation of unique gene groups as a consequence of stem cell-parenchymal cell fusion
2016-Mar-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep23270
PMID:26997336
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了间充质干细胞与心肌细胞融合后基因表达的独特变化 | 发现融合细胞在短时间内表现出独特的转录组变化，包括表达多能性和心脏前体基因，以及与癌症相关的基因 | 文章未明确提及研究的具体局限性 | 探究间充质干细胞与心肌细胞融合后的表型多样化和相关时间进程 | 间充质干细胞与心肌细胞的融合细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 27052 | 2024-08-09 |
Integrative Single-Cell Transcriptomics Reveals Molecular Networks Defining Neuronal Maturation During Postnatal Neurogenesis
2017-03-01, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)
DOI:10.1093/cercor/bhw040
PMID:26989163
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学结合新的整合生物信息学方法，揭示了在哺乳动物海马体中，DCX表达的未成熟神经元在神经发生过程中通过特定的转录网络进展到不同的发育阶段 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和整合生物信息学方法，分类了未成熟神经元的不同发育亚群，并揭示了与神经元成熟相关的新途径 | NA | 测试DCX表达的未成熟神经元通过特定转录网络进展到不同发育阶段的假设 | 哺乳动物海马体中的未成熟神经元及其在神经发生过程中的分子网络 | 数字病理学 | 神经发育疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 27053 | 2024-08-09 |
Intra-tumour heterogeneity - going beyond genetics
2016-06, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.13705
PMID:26945550
|
研究论文 | 本文探讨了肿瘤内异质性的遗传和非遗传因素，并介绍了相关技术方法以深入理解这一现象 | 本文首次系统地分析了非遗传因素在肿瘤内异质性中的作用，并提出了综合遗传和非遗传因素的技术方法 | NA | 旨在深入理解肿瘤内异质性的全貌，以开发更有效的癌症治疗策略 | 肿瘤内异质性的遗传和非遗传因素 | 数字病理学 | 癌症 | 基因组分析、细胞谱系追踪、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、细胞数据 | NA |
| 27054 | 2024-08-09 |
Sequential transcriptional waves direct the differentiation of newborn neurons in the mouse neocortex
2016-Mar-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aad8361
PMID:26940868
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研究论文 | 本文通过高时间分辨率技术结合单细胞转录组学，研究了小鼠新皮质中新生的神经元如何从室管膜区（VZ）的前体细胞中分化出来，并动态地指定其身份 | 本文首次揭示了早期转录波如何指导神经元分化事件的顺序和节奏，为从未分化细胞中逆向工程特定类别的皮质神经元提供了路线图 | NA | 研究神经元身份如何在前体细胞分裂时动态指定 | 小鼠新皮质中的新生神经元分化过程 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 27055 | 2024-08-09 |
Use of the Fluidigm C1 platform for RNA sequencing of single mouse pancreatic islet cells
2016-Mar-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1602306113
PMID:26951663
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研究论文 | 本研究评估了Fluidigm C1平台用于单个小鼠胰岛细胞的RNA测序 | 首次使用Fluidigm C1平台进行单个小鼠胰岛细胞的RNA测序，并识别了不同类型的胰岛细胞及其特异性转录因子和通路 | 由于细胞活力低、测序质量差或污染，281个细胞被排除在分析之外，且C1 Fluidigm细胞捕获过程存在局限性，导致细胞污染和基因表达模式改变 | 评估Fluidigm C1平台用于单个胰岛细胞RNA测序的适用性，并提供高质量基因表达数据集 | 小鼠胰岛细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 622个细胞，其中341个具有高质量基因表达谱 |
| 27056 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing for Precise Cancer Research: Progress and Prospects
2016-Mar-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-15-1907
PMID:26941284
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研究论文 | 本文讨论了单细胞测序技术在精确癌症研究中的进展和前景 | 开发了多种单细胞测序方法，能够全面精确地分析癌细胞的基因组、转录组和表观基因组 | NA | 探讨单细胞测序技术在癌症研究中的应用、挑战和前景 | 癌细胞的基因组、转录组和表观基因组 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 单个癌细胞 |
| 27057 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome sequencing: recent advances and remaining challenges
2016, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.7223.1
PMID:26949524
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review | 本文综述了单细胞转录组测序技术的最新进展及其面临的挑战 | 单细胞RNA测序技术已成为高吞吐量、高分辨率转录组分析的有力工具，能够揭示表面均一群体中的细胞多样性 | 技术改进、分析框架的开发以及互补单细胞检测方法的增加仍然是挑战 | 探讨单细胞转录组测序技术在细胞状态和动态分析中的应用 | 单细胞转录组测序技术及其分析方法 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 27058 | 2024-08-09 |
Copy number variants calling for single cell sequencing data by multi-constrained optimization
2016-08, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种基于多约束优化的单细胞测序数据拷贝数变异检测方法 | 通过将拷贝数变异检测问题转化为包含泊松分布噪声的二次优化问题，并引入稀疏性和平滑性约束，提高了单细胞测序数据中拷贝数变异模式的准确性 | NA | 开发一种新的方法来准确检测单细胞测序数据中的拷贝数变异 | 单细胞测序数据中的拷贝数变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | ADMM | 测序数据 | 合成数据和实际单细胞测序数据 |
| 27059 | 2024-08-09 |
Systematic characterization of lncRNAs' cell-to-cell expression heterogeneity in glioblastoma cells
2016-Apr-05, Oncotarget
DOI:10.18632/oncotarget.7580
PMID:26918340
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研究论文 | 本文系统分析了胶质母细胞瘤细胞中长非编码RNA（lncRNA）的细胞间表达异质性 | 利用单细胞RNA测序技术，全面检查了2,003个lncRNA在380个细胞中的表达模式，并揭示了lncRNA在丰度和剪接模式上的异质性 | NA | 旨在深入理解lncRNA的功能，开发有价值的生物标志物，并增进对胶质母细胞瘤生物学的认识 | 胶质母细胞瘤细胞中的长非编码RNA（lncRNA） | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 自组织映射 | RNA | 2,003个lncRNA在380个细胞中 |
| 27060 | 2024-08-09 |
Discrete distributional differential expression (D3E)--a tool for gene expression analysis of single-cell RNA-seq data
2016-Feb-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-016-0944-6
PMID:26927822
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研究论文 | 本文介绍了一种针对单细胞RNA测序数据设计的离散分布式差异基因表达分析工具D(3)E | D(3)E算法能够检测表达变化，即使在平均水平不变的情况下，并能通过分析模型量化生物学上有意义的属性 | NA | 开发和评估一种新的单细胞RNA测序数据差异基因表达分析方法 | 单细胞RNA测序数据中的差异基因表达 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | 使用合成数据进行评估，具体样本数量未提及 |