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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26901 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing revealed the necessity of macrophages in brain microenvironment remodeling by breast cancer metastasis
2025-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102287
PMID:39837060
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示巨噬细胞在乳腺癌脑转移微环境重塑中的必要性 | 首次在小鼠乳腺癌脑转移模型中实施单细胞RNA测序,发现巨噬细胞亚群在中枢神经系统的变化及癌细胞对肿瘤微环境细胞互作的重塑 | 研究样本量有限,仅重新分析了三个脑外科标本数据并使用小鼠模型 | 全面研究乳腺癌脑转移的肿瘤微环境,识别促进脑转移的促肿瘤机制和关键分子 | 乳腺癌脑转移患者手术标本和小鼠模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 三个脑外科标本和一个小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26902 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis and experiments identified ANXA1 as an unfavorable prognosticator in glioma
2025-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102286
PMID:39842212
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证ANXA1在胶质瘤中的促癌作用及预后价值 | 首次结合单细胞测序数据和功能实验系统揭示ANXA1在胶质瘤恶性进展中的关键作用 | ANXA1在胶质瘤中的促癌机制及其与患者功能状态的相关性仍需进一步研究 | 探讨ANXA1在胶质瘤中的预后价值和生物学功能 | 胶质瘤患者样本、胶质瘤细胞系、动物模型 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 实时定量PCR, Western blotting, 单细胞测序, 慢病毒载体, 伤口愈合实验, Transwell实验 | NA | 基因表达数据, 实验数据 | 两个患者队列, GSE162631数据集样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26903 | 2025-10-07 |
CD47 is a tumor cell-derived exosomal signature and regulates tumor immune microenvironment and immunotherapy responses
2025-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102291
PMID:39864342
|
研究论文 | 本研究揭示CD47作为肿瘤源性外泌体标志物,可区分免疫热肿瘤和冷肿瘤并预测免疫治疗反应 | 首次发现CD47是肿瘤源性外泌体特异性标志物,能够有效区分免疫热/冷肿瘤并预测免疫治疗敏感性 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证机制 | 探索肿瘤源性外泌体标志物在肿瘤免疫微环境调控和免疫治疗反应中的作用 | 卵巢癌、乳腺癌及其他妇科癌症患者 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌、乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、组织芯片 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据、临床数据 | 多个癌症队列的大规模数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 26904 | 2025-10-07 |
Cellular heterogeneity and communication networks in gastric cancer: Single-cell analysis reveals β-hydroxybutyrylation-associated genes and immune infiltration characteristics
2025-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102270
PMID:39884220
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析胃癌细胞异质性和通讯网络,揭示β-羟基丁酰化相关基因与免疫浸润特征 | 首次在胃癌中发现20个β-羟基丁酰化相关基因,并构建基于这些基因的风险评分模型 | 样本量相对有限,需要进一步验证 | 解析胃癌细胞异质性及其与肿瘤微环境的相互作用 | 胃癌细胞和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | 风险评分模型 | 单细胞基因表达数据 | 189,700个单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26905 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq in diabetic foot ulcer wound healing
2024 Nov-Dec, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.13218
PMID:39264020
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索糖尿病足溃疡创面愈合的分子机制 | 首次在单细胞水平系统研究糖尿病足溃疡创面愈合过程中的细胞亚群、基因和分子特征 | NA | 深入理解糖尿病足溃疡创面愈合机制并识别潜在治疗靶点 | 糖尿病足溃疡慢性创面相关细胞 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26906 | 2025-10-07 |
Intestinal Stromal Cells in the Turmoil of Inflammation and Defective Connective Tissue Remodeling in Inflammatory Bowel Disease
2024-09-03, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izae066
PMID:38581412
|
综述 | 本文综述了肠道基质细胞在炎症性肠病中对炎症反应和细胞外基质重塑的调控作用 | 通过单细胞测序和空间转录组学揭示了基质细胞表型复杂性及空间功能分区,为靶向治疗提供新视角 | 当前IBD治疗主要针对炎症过程,对纤维狭窄或瘘管性疾病疗效有限 | 探讨肠道基质细胞在IBD发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 肠道上皮下肌成纤维细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 26907 | 2025-10-07 |
Network analysis of large-scale ImmGen and Tabula Muris datasets highlights metabolic diversity of tissue mononuclear phagocytes
2023-02-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112046
PMID:36708514
|
研究论文 | 通过代谢网络分析研究组织单核吞噬细胞的代谢多样性 | 开发了基于网络的GAM聚类计算方法,首次在38种不同组织中系统识别了单核吞噬细胞的9个关键代谢子网络 | 研究主要基于小鼠数据集,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 理解单核吞噬细胞在不同组织中的代谢变异性 | 小鼠单核吞噬细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,代谢网络分析 | GAM聚类 | 转录组数据 | 337个样本(ImmGen MNP数据集)+202个样本(ImmGen Phase I)+51,364个细胞(Tabula Muris scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26908 | 2025-10-07 |
Internal oligo(dT) priming introduces systematic bias in bulk and single-cell RNA sequencing count data
2022-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac035
PMID:35651651
|
研究论文 | 本研究揭示了oligo(dT)引物在RNA测序中引起的系统性偏差,并开发了计算方法来识别和消除这种偏差 | 首次系统性地描述了内部oligo(dT)引物在bulk和单细胞RNA测序中的偏差问题,并开发了专门的算法来解决这一问题 | 研究主要基于公共数据集分析,缺乏实验验证;对基因表达量化的具体影响程度仍需进一步确认 | 评估oligo(dT)引物在RNA测序中对基因表达量化的系统性偏差影响 | 多种bulk和单细胞RNA测序平台产生的公共数据集 | 转录组学 | NA | RNA测序 | 计算算法 | RNA测序数据 | 多个公共数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 26909 | 2025-10-07 |
Single-cell immunopathology of recurrent acute generalized exanthematous pustulosis associated with vancomycin
2025-May, The journal of allergy and clinical immunology. Global
DOI:10.1016/j.jacig.2025.100426
PMID:40008097
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术研究万古霉素相关复发性急性泛发性发疹性脓疱病的免疫病理机制 | 首次对复发性AGEP患者进行纵向单细胞免疫病理学分析,揭示了TH17样效应细胞群在发病机制中的作用 | 单病例研究,样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 阐明急性泛发性发疹性脓疱病的遗传风险因素和单细胞免疫发病机制 | 一名万古霉素触发的复发性AGEP患者 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 1名患者,在3个时间点进行检测 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26910 | 2025-10-07 |
Multi-omics analyses and machine learning prediction of oviductal responses in the presence of gametes and embryos
2025-Feb-26, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.100705
PMID:40009070
|
研究论文 | 通过多组学分析和机器学习预测输卵管对配子和胚胎存在的响应机制 | 首次结合转录组学、蛋白质组学和单细胞测序技术,开发基于transformer的机器学习模型整合多组学数据预测转录因子对蛋白质表达的影响 | 小鼠模型与人类输卵管炎症反应存在差异,样本时间点有限 | 阐明输卵管与配子/胚胎之间的适应性相互作用机制 | 小鼠输卵管组织和输卵管液 | 机器学习 | 生殖系统疾病 | RNA-seq, scRNA-seq, 蛋白质组学 | transformer | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 不同交配后时间点的小鼠输卵管样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 26911 | 2025-10-07 |
Cancer-associated fibroblasts promote EGFR-TKI resistance via the CTHRC1/glycolysis/H3K18la positive feedback loop
2025-Feb-26, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03318-y
PMID:40011576
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CTHRC1+癌症相关成纤维细胞通过糖代谢/组蛋白乳酸化正反馈环路促进肺癌EGFR-TKI耐药 | 首次揭示CTHRC1+CAF亚群通过CTHRC1/糖酵解/H3K18la正反馈环路驱动EGFR-TKI耐药的新机制,并发现天然化合物Gambogenic Acid可破坏该环路 | NA | 探究癌症相关成纤维细胞在EGFR-TKI耐药中的作用机制 | 肺癌患者肿瘤组织中的癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 接受EGFR-TKI治疗的肺癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26912 | 2025-02-28 |
Publisher Correction: Single-Cell RNA sequencing reveals mitochondrial dysfunction in microtia chondrocytes
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-90745-2
PMID:40011623
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26913 | 2025-10-07 |
Th1-poised naive CD4 T cell subpopulation reflects anti-tumor immunity and autoimmune disease
2025-Feb-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57237-3
PMID:40000667
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出naive CD4 T细胞中存在具有Th1预备特征的亚群,该亚群表达高水平IL-7R并参与抗肿瘤免疫和自身免疫疾病 | 首次在人和小鼠naive CD4 T细胞中发现表达超高IL-7R的Th1预备亚群,并证明其与抗PD-1治疗反应和多发性硬化疾病状态相关 | NA | 探索naive CD4 T细胞的异质性及其在疾病背景和治疗反应中的作用 | 小鼠和人类的naive CD4 T细胞 | 免疫学 | 癌症, 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26914 | 2025-10-07 |
Single-cell multi-omics analysis identifies SPP1+ macrophages as key drivers of ferroptosis-mediated fibrosis in ligamentum flavum hypertrophy
2025-Feb-25, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00746-6
PMID:40001138
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示了SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴调控铁死亡促进黄韧带肥厚纤维化的机制 | 首次在单细胞水平构建黄韧带肥厚的细胞图谱,发现SPP1+巨噬细胞亚群通过调控铁死亡驱动纤维化进程 | 研究样本量有限,动物模型验证需要进一步扩展 | 探究黄韧带肥厚的细胞和分子机制 | 人类黄韧带样本和动物模型 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化, 透射电子显微镜, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 组织切片图像 | 人类黄韧带样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间多组学 | NA | NA |
| 26915 | 2025-10-07 |
Revolutionizing the treatment of intervertebral disc degeneration: an approach based on molecular typing
2025-Feb-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06225-8
PMID:40001145
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于软骨细胞分化相关基因的椎间盘退变分子分型系统,并验证了其临床转化价值 | 首次基于软骨细胞分化轨迹构建椎间盘退变分子分型系统,并发现吉非替尼可将低分化亚型转化为高分化亚型 | 研究样本量有限,需要更大规模临床验证 | 建立椎间盘退变的分子分型系统并探索精准治疗策略 | 椎间盘退变患者 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | ConsensusClusterPlus, pRRophetic | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26916 | 2025-10-07 |
Identification of splenic IRF7 as a nanotherapy target for tele-conditioning myocardial reperfusion injury
2025-Feb-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57048-6
PMID:39994192
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研究论文 | 本研究通过重定向纳米药物至脾脏,开发了一种治疗心肌再灌注损伤的远程调节新策略 | 首次发现脾脏IRF7在脾-心通讯网络中的关键作用,并开发了脾靶向纳米颗粒STEER用于时序抑制IRF7 | 研究主要使用雄性小鼠临床前模型,尚未在更广泛的动物模型或人体中进行验证 | 开发针对心肌再灌注损伤的纳米治疗新方法 | 心肌再灌注损伤的免疫调节机制 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,异位脾移植,纳米颗粒工程 | NA | 基因表达数据,功能评估数据 | 小鼠临床前模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 26917 | 2025-10-07 |
CCN2 mediates fibroblast-macrophage interaction in knee arthrofibrosis based on single-cell RNA-seq analysis
2025-Feb-24, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00400-9
PMID:39994205
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示CCN2在膝关节纤维化中介导成纤维细胞-巨噬细胞相互作用 | 首次发现CCN2通过TGF-β通路介导成纤维细胞与巨噬细胞相互作用促进纤维化 | 样本量较小(6例患者),需要更大规模研究验证 | 探究膝关节纤维化的病理机制 | 膝关节纤维化患者的滑膜组织 | 单细胞测序分析 | 膝关节纤维化 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据 | 6例膝关节纤维化患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26918 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA transcriptome uncovers distinct developmental trajectories in the embryonic skeletal muscle of Daheng broiler and Tibetan chicken
2025-Feb-24, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11363-w
PMID:39994525
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了大恒肉鸡和藏鸡胚胎骨骼肌发育的分子机制差异 | 首次构建了鸡胚胎骨骼肌单细胞图谱,揭示不同品种间肌母细胞和纤维脂肪祖细胞发育轨迹及基因表达动态差异 | 研究仅针对胚胎期三个时间点,未涵盖出生后发育阶段 | 探究不同鸡品种骨骼肌表型差异的分子机制 | 大恒肉鸡和藏鸡的胚胎腿部肌肉组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 29,579个高质量细胞,来自两个鸡品种三个胚胎期(E10,E14,E18) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26919 | 2025-10-07 |
THBS1 in macrophage-derived exosomes exacerbates cerebral ischemia-reperfusion injury by inducing ferroptosis in endothelial cells
2025-Feb-24, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03382-x
PMID:39994679
|
研究论文 | 本研究揭示巨噬细胞来源的外泌体通过THBS1-OTUD5-GPX4轴诱导内皮细胞铁死亡,加剧脑缺血再灌注损伤 | 首次发现THBS1作为外泌体关键分子通过结合OTUD5促进GPX4泛素化诱导内皮细胞铁死亡的新机制 | 研究主要基于细胞和动物模型,临床转化仍需进一步验证 | 探索巨噬细胞来源外泌体在脑缺血再灌注损伤中的作用机制 | 内皮细胞、巨噬细胞、tMCAO小鼠模型、AIS患者外周血样本 | 分子生物学 | 脑血管疾病 | 蛋白质组测序、转录组测序、单细胞测序、RNA干扰、腺相关病毒转染、高通量筛选、分子对接、分子动力学模拟、细胞热位移分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞测序数据 | tMCAO小鼠模型、THP-1和RAW264.7细胞系、AIS患者外周血样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 26920 | 2025-10-07 |
Comprehensive Analysis of TCR and BCR Repertoires: Insights into Methodologies, Challenges, and Applications
2025-Feb-24, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-024-00034-z
PMID:39994831
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综述 | 本文系统综述了T细胞受体和B细胞受体谱系分析的方法学、挑战及应用前景 | 整合免疫学、生物信息学和临床研究,系统比较了批量与单细胞测序在免疫受体分析中的技术差异 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证 | 探讨TCR和BCR受体谱系分析的技术方法及其在免疫功能和精准医疗中的应用 | T细胞受体和B细胞受体的序列多样性 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞测序, 批量RNA测序 | NA | NA |