单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 26641 - 26660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26641 | 2024-08-09 |
ST Spot Detector: a web-based application for automatic spot and tissue detection for spatial Transcriptomics image datasets
2018-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty030
PMID:29360929
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research paper | 本文介绍了一个名为ST Spot Detector的网络工具，用于自动检测空间转录组学图像数据集中的斑点和组织 | ST Spot Detector通过用户友好的界面自动化并简化了图像与转录组数据的校准过程 | NA | 开发一个自动化工具，以简化空间转录组学数据与图像的校准过程 | 空间转录组学图像数据集中的斑点和组织检测 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA |
| 26642 | 2024-08-09 |
Circulating plasmablasts are elevated and produce pathogenic anti-endothelial cell autoantibodies in idiopathic pulmonary arterial hypertension
2018-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.201747460
PMID:29369345
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研究论文 | 本文研究了特发性肺动脉高压（IPAH）中循环浆母细胞的水平及其在疾病发病机制中的作用 | 首次详细描述了IPAH中浆母细胞产生的IgA自身抗体及其对内皮细胞的影响 | NA | 评估IPAH中激活B细胞（浆母细胞）的水平，并表征这些浆母细胞衍生的重组抗体 | 特发性肺动脉高压（IPAH）中的浆母细胞及其产生的抗体 | NA | 肺动脉高压 | 单细胞测序 | NA | 血液样本 | NA |
| 26643 | 2024-08-09 |
Systems biology of embryonic development: Prospects for a complete understanding of the Caenorhabditis elegans embryo
2018-05, Wiley interdisciplinary reviews. Developmental biology
DOI:10.1002/wdev.314
PMID:29369536
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研究论文 | 本文探讨了系统生物学框架如何帮助全面理解秀丽隐杆线虫胚胎中的胚胎调控关系 | 结合现代基因组学工具和发育生物学，特别是利用秀丽隐杆线虫胚胎的小尺寸和强大的遗传及基因组工具，以细胞分辨率理解mRNA表达和调控 | 目前的建模和扰动实验主要集中在单个细胞类型或基因上，需要改进方法以扩展到整个基因组和生物体 | 旨在通过系统生物学框架全面理解秀丽隐杆线虫胚胎的发育调控关系 | 秀丽隐杆线虫胚胎的基因表达和调控 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 26644 | 2024-08-09 |
dropClust: efficient clustering of ultra-large scRNA-seq data
2018-04-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky007
PMID:29361178
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研究论文 | 本文介绍了一种名为dropClust的新型聚类算法，该算法利用局部敏感哈希技术对超大规模的单细胞RNA测序数据进行高效聚类 | dropClust在执行时间、聚类准确性和检测次要细胞亚型方面优于现有的最佳实践方法 | NA | 开发一种适用于高维单细胞数据的聚类方法，以提高处理大规模数据时的效率和准确性 | 超大规模的单细胞RNA测序数据 | 单细胞测序 | NA | 局部敏感哈希 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 数万个单细胞 |
| 26645 | 2024-08-09 |
Review: Somatic mutations in neurodegeneration
2018-04, Neuropathology and applied neurobiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1111/nan.12465
PMID:29369391
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综述 | 本文综述了体细胞突变在神经退行性疾病中的作用，特别是晚发性散发性神经退行性疾病 | 探讨了体细胞突变在神经退行性疾病中的潜在作用，尤其是通过单细胞测序技术的进步 | 单细胞测序技术仍存在误差，且需要进一步改进 | 探讨体细胞突变在神经退行性疾病中的作用及其与疾病发展的关系 | 主要关注散发性晚发性神经退行性疾病，如帕金森病、阿尔茨海默病和肌萎缩侧索硬化症 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 26646 | 2024-08-09 |
Cell-cell signaling in blood vessel development and function
2018-03, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.201708610
PMID:29363489
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综述 | 本文综述了血管发育过程中细胞间信号传导的作用及其对血管功能的影响 | 单细胞RNA测序技术为解析器官内血管多样性和动静脉层次结构中的转录多样性提供了新方法 | 器官内血管多样性和动静脉层次结构复杂，增加了血管细胞分子特征化的难度 | 探讨血管发育及其在健康和疾病中的功能 | 血液血管及其在器官发育和功能中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 26647 | 2024-08-09 |
Coordination of olfactory receptor choice with guidance receptor expression and function in olfactory sensory neurons
2018-01, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1007164
PMID:29385124
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析新生嗅觉感觉神经元，探讨了嗅觉受体选择与轴突导向受体表达和功能之间的协调机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了嗅觉感觉神经元中特定嗅觉受体表达与轴突导向基因表达之间的关系 | 研究主要集中在斑马鱼幼体，可能需要进一步验证在其他物种中的适用性 | 探讨嗅觉感觉神经元中嗅觉受体选择与轴突导向受体表达和功能之间的协调机制 | 新生嗅觉感觉神经元及其表达的嗅觉受体和轴突导向基因 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 56个嗅觉标记蛋白阳性感觉神经元 |
| 26648 | 2024-08-09 |
Growth and Morphogenesis during Early Heart Development in Amniotes
2017-Nov-22, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd4040020
PMID:29367549
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综述 | 本文综述了羊膜动物早期心脏发育中的生长和形态发生过程 | 讨论了基于固定样本分析之外的新方法，如克隆分析、单细胞测序、活体成像和数据定量分析，可能在未来对早期心脏管区域化和形态发生的理解带来新的见解 | 心脏形态发生是一个复杂且动态的三维过程，目前对其细胞基础的理解尚不充分 | 探讨心脏形态发生和区域化的最新进展，并重新解释区域基因表达模式 | 羊膜动物早期心脏发育中的生长和形态发生 | NA | 先天性心脏病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 26649 | 2024-08-09 |
Clustering single cells: a review of approaches on high-and low-depth single-cell RNA-seq data
2019-11-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/ely001
PMID:29346505
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26650 | 2024-08-09 |
Repurposing Tin Mesoporphyrin as an Immune Checkpoint Inhibitor Shows Therapeutic Efficacy in Preclinical Models of Cancer
2018-04-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-17-2587
PMID:29339440
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研究论文 | 本研究探讨了利用锡中卟啉（SnMP）作为免疫检查点抑制剂在癌症治疗中的疗效，特别是在化疗诱导的抗肿瘤免疫反应背景下针对血红素氧化酶-1（HO-1）的作用。 | 首次评估SnMP作为免疫检查点阻断疗法在癌症治疗中的应用，并展示了其与PD-1阻断相当的疗效。 | 研究主要基于小鼠模型和临床数据分析，尚未进行人体临床试验。 | 研究SnMP作为新型免疫检查点疗法在癌症治疗中的潜在应用。 | 评估SnMP在乳腺癌模型中的疗效及其对化疗诱导的CD8 T细胞免疫抑制的影响。 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用乳腺癌患者的数据和乳腺癌小鼠模型进行研究 |
| 26651 | 2024-08-09 |
Conserved properties of dentate gyrus neurogenesis across postnatal development revealed by single-cell RNA sequencing
2018-02, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-017-0056-2
PMID:29335606
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了出生后、幼年和成年小鼠齿状回细胞类型的分子动力学和多样性 | 发现了不同静止和增殖的前体细胞类型，并通过短暂的中介状态与神经母细胞阶段和完全成熟的颗粒细胞相联系 | NA | 探讨发育期和成年期齿状回神经发生的关系 | 齿状回的细胞类型及其分子动态变化 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 出生后、幼年和成年小鼠 |
| 26652 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of the developing lateral geniculate nucleus reveals insights into circuit assembly and refinement
2018-01-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1717871115
PMID:29343640
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了发育中的背侧外侧膝状核（LGN）在四个时间点的全转录组基因表达，揭示了细胞类型特异性标记及其在电路组装和细化过程中的动态变化 | 本研究首次提供了LGN在发育过程中多个细胞类型的全转录组基因表达图谱，并发现与突触和电路发育相关的基因在非神经元细胞类型中的表达比例比之前认识的要高 | NA | 探索中枢神经系统在早期模式化和细胞类型特异性之后，基因表达变化如何影响电路组装和细化的后期阶段 | 背侧外侧膝状核（LGN）的基因表达及其在视觉结构中的电路组装和细化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四个时间点的背侧外侧膝状核（LGN）样本 |
| 26653 | 2024-08-09 |
A general and flexible method for signal extraction from single-cell RNA-seq data
2018-01-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-02554-5
PMID:29348443
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研究论文 | 本文提出了一种通用的零膨胀负二项模型（ZINB-WaVE），用于从单细胞RNA测序数据中提取信号 | ZINB-WaVE模型能够处理零膨胀（dropouts）、过度离散和数据计数性质，无需预先归一化步骤 | NA | 开发一种新的方法来更稳定和准确地从单细胞RNA测序数据中提取低维表示 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 零膨胀负二项模型（ZINB-WaVE） | 基因表达数据 | NA |
| 26654 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals Cellular Diversity and Intercommunication in the Mouse Heart
2018-01-16, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.12.072
PMID:29346760
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠心脏非心肌细胞的转录组，揭示了心脏细胞的多样性和细胞间通信网络 | 本研究首次详细分析了小鼠心脏非心肌细胞的单细胞转录组，揭示了心脏细胞的多样性和细胞间通信网络，并发现了心脏基因表达中的性别二态性 | NA | 理解心脏发育和正常器官功能，并为制定精确的治疗策略以对抗心脏病提供基础 | 小鼠心脏的非心肌细胞 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 26655 | 2024-08-09 |
Early B cell changes predict autoimmunity following combination immune checkpoint blockade
2018-02-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI96798
PMID:29309048
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研究论文 | 本文分析了黑色素瘤患者在接受抗CTLA4或抗PD1单一治疗或联合治疗后B细胞的变化，发现联合免疫检查点阻断（CCB）治疗导致循环B细胞数量下降及CD21lo B细胞和浆细胞样细胞增加，这些早期B细胞变化与免疫相关不良事件（IRAEs）的发生频率和时间相关。 | 首次揭示了CCB治疗后B细胞的早期变化与IRAEs风险增加之间的关系，并提出通过靶向B细胞的预防策略可能减少这些患者的毒性反应。 | NA | 研究CCB治疗后B细胞的变化及其与免疫相关不良事件的关系。 | 黑色素瘤患者在接受抗CTLA4或抗PD1单一治疗或联合治疗后的B细胞变化。 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 26656 | 2024-08-09 |
Troy+ brain stem cells cycle through quiescence and regulate their number by sensing niche occupancy
2018-01-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1715911114
PMID:29311336
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研究论文 | 本文提出了一种模型，其中活跃的神经干细胞（NSCs）的命运与共享微环境中邻近NSCs的总数相关联 | 使用敲入报告基因和单细胞RNA测序技术，发现Wnt靶标Troy可以识别活跃和静止的NSCs，并揭示了NSCs在稳态或损伤响应中的快速扩增和部分返回静止状态的行为 | NSCs的分子特征、自我更新能力和命运行为仍未完全明确 | 研究神经干细胞在成年小鼠侧脑室下区的微环境中的行为和调控机制 | 神经干细胞（NSCs）及其在微环境中的行为 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 成年小鼠的神经干细胞 |
| 26657 | 2024-08-09 |
Reply to Edemir: Physiological regulation and single-cell RNA sequencing
2018-01-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1720333115
PMID:29311339
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26658 | 2024-08-09 |
The epigenetic control of stemness in CD8+ T cell fate commitment
2018-Jan-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aah6499
PMID:29326266
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研究论文 | 研究探讨了组蛋白甲基转移酶Suv39h1在感染后激活的小鼠CD8 T细胞中通过H3K9三甲基化调控干细胞相关记忆基因表达的作用 | 首次揭示了Suv39h1在CD8 T细胞效应分化过程中通过标记染色质沉默干细胞/记忆基因的关键作用 | NA | 探究染色质动态变化如何影响基因表达程序，进而控制CD8+ T细胞的命运承诺 | CD8+ T细胞的命运承诺及其与干细胞特性的关系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠CD8 T细胞 |
| 26659 | 2024-08-09 |
Clonal analysis of lineage fate in native haematopoiesis
2018-01-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature25168
PMID:29323290
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研究论文 | 本研究使用转座子标记技术在未受干扰的造血过程中对前体细胞和干细胞的命运进行克隆追踪 | 研究揭示了在未受干扰的造血过程中，巨核细胞谱系主要独立于其他造血命运，并表明传统的长期造血干细胞是巨核细胞限制性前体细胞的重要来源 | NA | 探讨在未受干扰的造血过程中，造血干细胞和多能前体细胞的谱系命运 | 造血干细胞和多能前体细胞 | NA | NA | 转座子标记技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 26660 | 2024-08-09 |
Exploration of the Germline Genome of the Ciliate Chilodonella uncinata through Single-Cell Omics (Transcriptomics and Genomics)
2018-01-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.01836-17
PMID:29317511
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研究论文 | 本文通过单细胞组学技术探索纤毛虫奇洛登尼亚的生殖系基因组结构 | 首次使用单细胞转录组学和基因组学技术，克服了获取纯化生殖系DNA的困难，揭示了奇洛登尼亚生殖系基因组的结构特征 | 研究仅限于奇洛登尼亚这一种纤毛虫，且依赖于其高度碎片化的体细胞基因组 | 探索纤毛虫生殖系与体细胞基因组之间的基因组重排进化 | 纤毛虫奇洛登尼亚的生殖系基因组 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学和基因组学 | NA | 基因组数据 | 有限数量的奇洛登尼亚样本 |