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当前共找到 37592 篇文献,本页显示第 2621 - 2640 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2621 2026-02-15
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2026-Jan-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序解析了肾上腺皮质类固醇生成谱系的转录组,并揭示了转录因子HHEX在维持糖皮质激素水平和保护肾上腺免受雄激素诱导的脂质耗竭中的关键作用 首次通过单细胞RNA测序鉴定HHEX为糖皮质激素生成细胞中最富集的转录因子,并阐明其作为雄激素受体靶基因,在肾上腺性别二态性和脂质稳态中的多功能调控机制 研究主要基于小鼠模型,人类肾上腺中的HHEX功能尚未验证;雄激素诱导脂噬的具体分子通路仍需进一步探索 探究维持肾上腺皮质糖皮质激素生成细胞异质性和应激响应能力的分子机制 Sf1-Cre; Rosa报告基因小鼠的肾上腺皮质类固醇生成谱系细胞 单细胞组学 肾上腺功能障碍 单细胞RNA测序 遗传小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确样本数量,使用遗传工程小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2622 2026-02-15
Genital herpes shedding episodes associate with altered spatial organization and activation of mucosal immune cells
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了HSV-2感染期间病毒脱落对宫颈阴道黏膜免疫细胞空间组织和活化的影响 首次结合空间转录组学、流式细胞术和免疫荧光成像,系统揭示了活动性HSV-2脱落期间阴道黏膜免疫细胞的空间重编程和激活状态变化 研究为横断面设计,无法确定观察到的免疫变化与病毒脱落之间的因果关系;样本量虽大但可能未涵盖所有临床亚群 探究HSV-2感染对宫颈阴道黏膜免疫的影响机制 HSV-2血清阳性和阴性参与者的宫颈阴道组织和血液样本 空间转录组学 生殖器疱疹 流式细胞术、免疫荧光成像、可溶性免疫因子分析、空间转录组学 NA 组织样本、血液样本、空间转录组数据、成像数据 232名参与者(包括HSV-2血清阳性和阴性个体) NA 空间转录组学 NA NA
2623 2026-02-15
Fecal microbiota transplantation promotes type 2 mucosal immune responses with colonic epithelium proliferation in patients with recurrent Clostridioides difficile
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过分析复发性艰难梭菌感染患者在接受粪菌移植治疗前后的样本,揭示了FMT通过促进结肠上皮细胞增殖和2型免疫反应来发挥治疗作用的机制 首次结合空间转录组学和单细胞基因集分析,明确了FMT诱导的基因表达变化定位于结肠上皮,并揭示了IL-33和双调蛋白在介导增殖通路激活中的潜在作用 样本量较小(n=16),随访时间较短(2个月),且缺乏长期疗效和机制验证数据 探究粪菌移植治疗复发性艰难梭菌感染的分子和免疫学机制 复发性艰难梭菌感染患者(n=16)和健康对照的结肠活检组织、血浆、外周血单个核细胞及粪便样本 微生物组学与免疫学 感染性疾病(艰难梭菌感染) 高通量测序、流式细胞术免疫分型、空间转录组学 NA 基因表达数据、微生物组数据、免疫表型数据 16名rCDI患者及健康对照 NA 空间转录组学, 单细胞基因集分析 NA NA
2624 2026-02-15
Spatial transcriptomics reveals immune-stromal crosstalk within the synovium of patients with juvenile idiopathic arthritis
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用亚细胞分辨率空间转录组学技术,解析了活动性幼年特发性关节炎患者滑膜组织中免疫细胞与基质细胞的空间组织与相互作用 开发了新的空间共定位分析流程,首次在JIA滑膜中揭示了NOTCH信号介导的内皮细胞-成纤维细胞相互作用、CXCL9/CXCR3信号轴调控的巨噬细胞-CD8+ T细胞互作,并鉴定了JIA特有的细胞状态 研究样本仅来自活动期患者,缺乏疾病不同阶段或治疗后的纵向比较数据 解析幼年特发性关节炎滑膜组织的空间分子结构及细胞间相互作用网络 活动性幼年特发性关节炎患者的滑膜组织样本 空间转录组学 幼年特发性关节炎 空间转录组测序 空间共定位分析流程 空间转录组数据 未明确说明样本数量 NA 空间转录组学 NA 亚细胞分辨率空间转录组分析
2625 2026-02-15
Cellular immune endophenotypes separating early and late-onset myasthenia gravis
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过多模态技术(包括深度光谱流式细胞术和单细胞测序)区分了早发型和晚发型重症肌无力的细胞免疫表型,识别了三种主要淋巴细胞群体的差异 首次应用深度光谱流式细胞术和单细胞测序技术,揭示了早发型和晚发型重症肌无力在黏膜相关恒定T细胞、初始CD8+ T细胞和经典NK细胞频率上的显著差异,并实现了90%准确率的亚型预测 研究基于两个独立队列,但样本量可能有限,且未详细探讨免疫衰老机制与疾病进展的因果关系 区分早发型和晚发型重症肌无力的细胞免疫表型,以改进临床分类 重症肌无力患者的淋巴细胞群体 数字病理学 重症肌无力 深度光谱流式细胞术, 单细胞测序 NA 细胞表型数据, 测序数据 两个独立队列的患者样本 NA 单细胞测序 NA NA
2626 2026-02-15
An integrated single-cell and spatial transcriptomic atlas of thyroid cancer progression identifies prognostic fibroblast subpopulations
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据,构建了甲状腺癌进展的图谱,并识别了与预后相关的成纤维细胞亚群 首次在混合WDTC/ATC组织病理学样本中,结合单细胞和空间转录组学技术,系统性地描绘了甲状腺癌的进化过程,并鉴定出POSTN+肌成纤维细胞癌症相关成纤维细胞(myCAFs)这一与侵袭性肿瘤细胞密切相关的预后亚型 样本量相对有限(81个单细胞样本和28个空间转录组肿瘤),且主要基于转录组数据,可能未涵盖其他分子层面的变化 理解甲状腺癌在儿童和成人中的进化机制,并识别与疾病进展和预后相关的关键细胞亚群 甲状腺癌样本,包括分化良好的甲状腺癌(WDTC)、间变性甲状腺癌(ATC)、罕见的混合WDTC/ATC肿瘤以及儿童弥漫性硬化性甲状腺癌 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序 NA 转录组数据,空间数据 423,733个细胞来自81个样本,28个肿瘤进行空间转录组分析,5个大型bulk RNA测序队列 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
2627 2026-02-15
Altered MDC1 Interactions and Dysfunctional DNA Repair in Lobular Breast Cancer Confers Sensitivity to PARP Inhibition
2026-Jan-09, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本文研究了浸润性小叶乳腺癌中MDC1与ER的相互作用如何导致DNA修复功能失调,并揭示了PARP抑制剂在该癌症中的治疗潜力 发现ILC中MDC1与ER的特异性共调控导致了一种独特的“BRCA样”但非经典“BRCAness”的同源重组功能失调状态,并首次证明PARP抑制剂talazoparib在ILC模型中具有持久生长抑制效果 研究主要基于细胞系和异种移植模型,缺乏大规模临床样本验证;未详细探讨MDC1-ER相互作用的分子机制细节 探究浸润性小叶乳腺癌中MDC1如何调控ER活性及DNA修复功能,并评估PARP抑制剂的治疗潜力 浸润性小叶乳腺癌细胞、ILC异种移植模型 癌症生物学 乳腺癌 单细胞转录组分析、DNA修复活性分析、蛋白质相互作用组分析 NA 转录组数据、蛋白质相互作用数据、功能实验数据 多个ILC细胞系及异种移植模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2628 2026-02-15
VISTA uncovers missing gene expression and spatial-induced information for spatial transcriptomic data analysis
2026-Jan-08, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文提出了一种名为VISTA的模型,通过整合单细胞RNA测序和亚细胞空间转录组学数据,预测空间转录组数据中未测量的基因表达 VISTA结合了变分推断、几何深度学习和不确定性量化,首次实现了在空间转录组数据中准确预测未测量基因表达,并支持多种下游分析 未明确提及模型在处理高度异质性组织或大规模数据集时的具体限制 克服空间转录组技术基因覆盖有限的缺陷,提升空间转录组数据的解释性和应用价值 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 空间转录组学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 变分推断, 几何深度学习 基因表达数据, 空间数据 四个数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2629 2026-02-15
Resolving Single-Cell Gene Expression by Pseudotemporal Integration of Transcriptomic and Proteomic Datasets
2026-Jan, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1
研究论文 本研究提出了一种利用伪时间细胞排序整合单细胞RNA-Seq和单细胞蛋白质组学数据的新方法,以分析缺氧条件下的转录-翻译表达动态 通过伪时间轨迹整合单细胞转录组和蛋白质组数据,揭示转录和翻译响应的时间差异,如即时转录组响应和延迟蛋白质组表达 NA 整合单细胞转录组和蛋白质组数据,构建全面的转录-翻译图谱,以理解缺氧应激下的细胞表型 单细胞样本(在缺氧条件下采集的纵向样本) 单细胞组学 NA 单细胞RNA-Seq, 单细胞蛋白质组学(质谱分析) NA 转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 NA NA
2630 2026-02-15
TMEM106C, BSG, COPE, CDCA8, KPNA2, LIG1, UQCRH, and CCT5: Predictive of Survival and Immunotherapy Resistance in Hepatocellular Carcinoma
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和转录组分析,构建了一个基于衰老相关基因的预后模型,用于预测肝细胞癌患者的生存和免疫治疗反应 整合单细胞RNA测序和转录组数据,识别并验证了一个由八个基因(TMEM106C, BSG, COPE, CDCA8, KPNA2, LIG1, UQCRH, CCT5)组成的衰老相关基因特征,该特征可作为预测HCC预后和免疫治疗耐药性的稳健工具 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,实验验证主要在细胞系中进行,缺乏体内模型或大规模前瞻性临床队列的验证 识别肝细胞癌中与衰老相关的基因特征,构建预后模型以预测患者生存和免疫治疗反应 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的细胞,特别是自然杀伤细胞 生物信息学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,转录组分析,qRT-PCR,CCK-8,伤口愈合实验,Transwell实验 LASSO Cox回归风险模型 单细胞RNA测序数据,批量转录组数据 来自GEO和TCGA数据库的样本,共识别了80,997个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2631 2026-02-15
Gut Microbiota-Derived Metabolites Regulate CASP3 and Neuroimmune Pathways in Multiple Sclerosis: An Integrative Multiomics Study
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合网络药理学、机器学习和单细胞转录组分析,揭示了肠道菌群代谢物通过调节CASP3及神经免疫通路在多发性硬化症中的作用 首次将网络药理学、机器学习(SHAP方法)和单细胞转录组分析结合,识别出CASP3作为肠道菌群代谢物的核心靶点,并通过孟德尔随机化验证因果关系 研究结果需要进一步的实验验证来确认机制和转化潜力 探究肠道菌群代谢物在多发性硬化症发病机制中的作用,识别潜在治疗靶点 多发性硬化症相关的差异表达基因、肠道菌群代谢物及其靶点 机器学习 多发性硬化症 网络药理学、机器学习、单细胞转录组分析、孟德尔随机化、分子对接 机器学习模型(未指定具体类型,但使用了SHAP方法) 转录组数据、单细胞数据 NA NA 单细胞转录组分析 NA NA
2632 2026-02-15
Causal Association Between Plasma Proteins and Pericarditis: A Mendelian Randomization Study With Therapeutic Target Identification
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过孟德尔随机化分析探讨了血浆蛋白与心包炎之间的因果关系,并识别了潜在的治疗靶点 首次利用大规模血浆蛋白组GWAS数据,结合孟德尔随机化方法系统评估了血浆蛋白与心包炎的因果关联,并整合了单细胞RNA测序分析和分子对接技术来识别潜在治疗靶点和化合物 研究人群仅限于欧洲血统个体,可能限制了结果在其他人群中的普适性;孟德尔随机化分析依赖于遗传变异作为工具变量,可能存在残留混杂或水平多效性 评估血浆蛋白与心包炎之间的因果关系,并探索潜在的治疗靶点 35,559名欧洲血统个体的遗传和血浆蛋白数据,以及心包炎的遗传关联数据 生物信息学与遗传流行病学 心血管疾病 全基因组关联研究(GWAS)、孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接 逆方差加权中位数法、方差加权法、MR-Egger回归 遗传变异数据、血浆蛋白定量数据、单细胞基因表达数据 35,559名欧洲血统个体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2633 2026-02-15
Development and validation of an interpretable machine learning model identify the lactylation-related protein SUSD3 as a prognostic and therapeutic biomarker for breast cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究开发并验证了一个可解释的机器学习模型,用于识别乳酸化相关蛋白SUSD3作为乳腺癌的预后和治疗生物标志物 首次结合多种机器学习算法构建了与免疫细胞浸润、趋化因子表达和肿瘤突变负荷相关的乳酸化相关特征,并实验验证了枢纽基因SUSD3的作用 NA 探究乳酸化在乳腺癌发生发展中的作用,并开发用于预测恶性进展和免疫逃逸的风险模型 乳腺癌 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序、转录组学、空间转录组学 多种机器学习算法组合 基因组数据、转录组数据 来自公共数据库(TISCH、TCGA、GEO)的大量数据集 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq NA NA
2634 2026-02-15
Integrated single-cell analysis with experimental validation reveals ANXA2 as a therapeutic target for ferroptosis in inflammatory bowel disease
2026, American journal of translational research IF:1.7Q4
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序分析与实验验证,揭示了ANXA2作为炎症性肠病中铁死亡的关键治疗靶点 首次结合单细胞RNA测序与实验验证,识别出ANXA2作为IBD中铁死亡的核心靶点,并验证其在体外和体内模型中的调控作用 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类样本验证有限,且铁死亡机制在IBD中的具体通路仍需进一步探索 识别与炎症性肠病中铁死亡相关的潜在治疗靶点 炎症性肠病(IBD)患者和DSS诱导的IBD小鼠模型中的结肠组织细胞 数字病理学 炎症性肠病 单细胞RNA测序,RT-qPCR,Western blotting,流式细胞术,ELISA,免疫荧光染色 NA 单细胞RNA测序数据,基因表达数据,蛋白质表达数据 28,974个细胞(来自GSE134809数据集) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2635 2026-02-15
Utilisation of spatial methodologies for the investigation of the tumour microenvironment
2026, Methods in cell biology
综述 本章节为研究人员提供了关于空间转录组学技术的实用指南,重点介绍了三种主流平台及其在肿瘤微环境研究中的应用 系统比较了Merscope、CosMx和Xenium三种前沿空间转录组学平台的原理与差异,并提供了从样本制备到数据分析的详细实验方案与实用技巧 作为技术指南章节,未报告新的实验数据或临床验证结果,主要基于现有技术和作者经验进行总结 为研究人员提供实施空间转录组学技术的实用指导,以促进肿瘤微环境表征和精准肿瘤学研究 肿瘤微环境中的空间组织特征,特别是巨噬细胞、细胞毒性T淋巴细胞等免疫细胞的分布与相互作用 空间转录组学 癌症 空间转录组学、多重成像 NA 空间转录组数据、成像数据 NA NA 空间转录组学 Merscope, CosMx, Xenium 三种主流空间转录组学分析平台
2636 2026-02-15
Bronchial epithelial transcriptome reveals dysregulated interferon and inflammatory responses to rhinovirus in exacerbation-prone pediatric asthma
2025-Dec-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过器官型支气管上皮细胞培养,结合bulk和单细胞转录组学及靶向蛋白分析,揭示了易加重型儿童哮喘患者对鼻病毒感染的过度干扰素和炎症反应机制 首次在易加重型儿童哮喘患者中,通过单细胞转录组学揭示了细胞类型特异性(特别是非纤毛细胞)对鼻病毒感染的过度反应,并发现基线干扰素刺激基因表达降低是易感性的可调节因果决定因素 研究基于体外器官型培养模型,可能无法完全模拟体内复杂环境;样本量可能有限;未涉及长期临床结局验证 探究易加重型儿童哮喘患者对鼻病毒感染易感性的宿主因素和分子机制 来自特征明确的哮喘儿童和健康儿童的器官型支气管上皮细胞培养物 数字病理学 哮喘 bulk转录组学, 单细胞转录组学, 靶向蛋白分析 NA 转录组数据, 蛋白质数据 来自哮喘儿童和健康儿童的支气管上皮细胞培养物(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2637 2026-02-15
Targeting the pentose phosphate pathway mitigates graft-versus-host disease by rewiring alloreactive T cell metabolism
2025-Dec-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究揭示了戊糖磷酸途径在急性移植物抗宿主病中的作用,并发现靶向该途径的关键酶6PGD可减轻疾病严重程度,同时保留抗肿瘤效应 首次阐明戊糖磷酸途径在调控同种异体反应性T细胞代谢和功能中的关键作用,并确定6PGD为减轻aGvHD同时保留GvT效应的潜在治疗靶点 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证;长期抑制PPP的潜在副作用尚未明确 探索葡萄糖代谢下游途径在急性移植物抗宿主病中的作用,寻找特异性治疗靶点 同种异体反应性T细胞 单细胞组学 移植物抗宿主病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2638 2026-02-15
Integrating multi-omics data to resolve patterns of ion channel regulation in melanoma and predict tumor treatment response
2025-Dec-05, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究整合单细胞空间转录组和多组学数据,分析皮肤黑色素瘤中离子通道相关基因的调控模式,并构建评分系统以预测肿瘤治疗反应 首次在皮肤黑色素瘤中系统评估离子通道相关基因的调控模式,结合单细胞空间转录组数据揭示其与肿瘤微环境细胞浸润特征的关联,并构建了可量化的ICRG评分系统 研究基于现有数据进行分析,需要进一步实验验证ICRG基因的具体功能机制 解析皮肤黑色素瘤中离子通道相关基因的调控模式,并预测肿瘤治疗反应 皮肤黑色素瘤样本 数字病理学 黑色素瘤 单细胞空间转录组学,多组学数据分析 SCENIC分析,伪时间分析 转录组数据,空间转录组数据,多组学数据 NA NA 单细胞空间转录组学 NA NA
2639 2026-02-15
Spatial transcriptomics iterative hierarchical clustering (stIHC): A novel method for identifying spatial gene co-expression modules
2025-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
研究论文 本文提出了一种名为空间转录组学迭代层次聚类(stIHC)的新方法,用于识别空间基因共表达模块 stIHC方法能够检测稀有或独特的空间表达模式,优于现有方法如SPARK、SPARK-X、MERINGUE和SpatialDE NA 开发一种新方法以改进空间转录组学数据中空间可变基因的聚类分析 空间转录组学数据中的空间可变基因 空间转录组学 NA 空间转录组学 迭代层次聚类 空间转录组学数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, 10x Xenium 10x Visium, 10x Xenium, Spatial Transcriptomics
2640 2026-02-15
Cell lineage tracing: Methods, applications, and challenges
2025-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
综述 本文综述了细胞谱系追踪的实验和计算方法,强调了它们的优势、局限性和协同作用 整合了从早期标记技术到现代CRISPR-Cas9条形码等遗传工具的实验方法,以及用于分析单细胞测序等高维数据的计算方法,并讨论了人工智能增强的未来发展方向 存在准确性、分辨率、多组学整合和可扩展性方面的挑战 理解细胞命运和谱系关系,应用于发育生物学、组织再生和疾病进展研究 细胞谱系追踪技术 NA NA CRISPR-Cas9条形码,单细胞测序,多组学技术 NA 高维数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
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