单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32106 篇文献，本页显示第 26361 - 26380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 26361 | 2024-08-08 |
Dissecting chicken germ cell dynamics by combining a germ cell tracing transgenic chicken model with single-cell RNA sequencing
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.03.040
PMID:35465157
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研究论文 | 本文通过结合转基因鸡胚胎模型和单细胞RNA测序技术，研究了鸡生殖细胞发育过程中的动态转录景观 | 首次使用了一种新的生殖细胞追踪方法来监测和分离不同发育阶段的鸡生殖细胞，并揭示了性别特异性的发育阶段和轨迹 | NA | 揭示鸡生殖细胞发育过程中的动态转录景观 | 鸡生殖细胞 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | 转基因鸡胚胎模型 | RNA | 4,752个雄性和13,028个雌性生殖细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 26362 | 2024-08-08 |
The use of base editing technology to characterize single nucleotide variants
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.03.031
PMID:35465164
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综述 | 本文综述了碱基编辑技术在单核苷酸变异（SNVs）特性研究中的应用及其潜力 | 探讨了碱基编辑技术与单细胞RNA测序结合的可能性，以加速该领域进展，并强调了其在非欧洲人群遗传机制研究中的潜在应用 | 当前研究主要集中在欧洲人群，其他人群的遗传特征机制研究不足 | 加速单核苷酸变异与特定疾病表型的关联研究，并扩展到非欧洲人群 | 单核苷酸变异及其对人类基因组的影响 | NA | NA | 碱基编辑技术 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26363 | 2024-08-08 |
Digital Spatial Profiling Reveals Functional Shift of Enterochromaffin Cell in Patients With Ulcerative Colitis
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.841090
PMID:35465329
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研究论文 | 本研究利用数字空间分析技术，探讨了肠嗜铬细胞在溃疡性结肠炎患者中的功能转变 | 首次通过数字空间分析技术揭示了肠嗜铬细胞在溃疡性结肠炎中的功能转变，包括蛋白质合成能力的增强和新免疫功能的获得 | 研究样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探究肠嗜铬细胞在溃疡性结肠炎中的功能变化 | 肠嗜铬细胞及其他上皮细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 数字空间分析 | NA | 转录组数据 | 8名溃疡性结肠炎患者和7名健康对照者的结肠镜活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 26364 | 2024-08-08 |
Synergy of single-cell sequencing analyses and in vivo lineage-tracing approaches: A new opportunity for stem cell biology
2022, Biocell : official journal of the Sociedades Latinoamericanas de Microscopia Electronica ... et. al
IF:0.8Q4
DOI:10.32604/biocell.2022.018960
PMID:35475293
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研究论文 | 本文讨论了单细胞测序分析与体内谱系追踪方法在干细胞生物学中的潜在协同作用 | 结合单细胞测序技术和谱系追踪方法，更清晰地定义干细胞的分化路径 | 目前难以定义“干细胞”群体内的微异质性 | 探讨单细胞测序分析与谱系追踪方法在干细胞生物学中的应用 | 干细胞及其分化路径 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26365 | 2024-08-08 |
Contact-Dependent Granzyme B-Mediated Cytotoxicity of Th17-Polarized Cells Toward Human Oligodendrocytes
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.850616
PMID:35479072
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研究论文 | 研究了人类CD4 T细胞介导的少突胶质细胞死亡的机制，发现Th17极化细胞通过释放granzyme B对少突胶质细胞产生直接毒性 | 首次揭示了Th17极化细胞与少突胶质细胞的生物学显著接触，并通过释放granzyme B产生直接毒性 | NA | 探讨多发性硬化症中Th17细胞对少突胶质细胞的毒性机制 | 人类CD4 T细胞和少突胶质细胞 | NA | 多发性硬化症 | 荧光和明场活体成像、单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫荧光 | NA | 细胞 | 使用了人类原代少突胶质细胞和人类少突胶质细胞系MO3.13 | NA | NA | NA | NA |
| 26366 | 2024-08-08 |
The Establishment and Experimental Verification of an lncRNA-Derived CD8+ T Cell Infiltration ceRNA Network in Colorectal Cancer
2022, Clinical Medicine Insights. Oncology
DOI:10.1177/11795549221092218
PMID:35479766
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研究论文 | 本研究旨在探讨长非编码RNA（lncRNA）在结直肠癌（CRC）中调控CD8+ T细胞功能的潜在机制 | 成功构建了一个针对结直肠癌中lncRNA介导的CD8+ T细胞浸润的竞争性内源RNA（ceRNA）网络，并发现LINC00657可能是结直肠癌免疫逃逸的关键因素 | NA | 揭示lncRNA在结直肠癌中调控CD8+ T细胞功能的机制 | lncRNA、CD8+ T细胞、结直肠癌 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、qPCR | NA | RNA序列数据 | 使用了来自The Cancer Genome Atlas（TCGA）和Gene Expression Omnibus（GEO）数据库的批量RNA-seq、miRNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 26367 | 2024-08-08 |
Establishment of a Prognostic Model of Lung Adenocarcinoma Based on Tumor Heterogeneity
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.807497
PMID:35480896
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研究论文 | 本研究旨在基于肺腺癌（LUAD）的异质性识别独立预后基因，生成预后风险评分模型，并结合其他病理特征构建诺模图以预测患者的总体生存（OS） | 本研究首次基于肺腺癌的异质性建立了预后风险评分模型，并发现高风险患者对免疫检查点阻断疗法更敏感 | NA | 建立一个基于肺腺癌异质性的预后模型，以指导临床实践 | 肺腺癌（LUAD）患者的预后 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），RNA测序（RNA-seq），体细胞突变分析 | 风险评分模型，诺模图 | 基因数据 | 大量数据 | NA | NA | NA | NA |
| 26368 | 2024-08-08 |
A Reproducible and Dynamic Workflow for Analysis and Annotation of scRNA-Seq Data
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2281-0_10
PMID:35486243
|
研究论文 | 本文介绍了一种可重复且动态的工作流程，用于单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据的预处理、基因丰度量化以及细胞的可视化和注释 | 提出了一种可重复且动态的工作流程，用于处理和分析scRNA-Seq数据 | NA | 开发一种用于scRNA-Seq数据分析和注释的工作流程 | scRNA-Seq数据 | 基因组学 | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26369 | 2024-08-08 |
Complete Transcriptome Analysis by 5'-End Single-Cell RNA-Seq with Random Priming
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2281-0_11
PMID:35486244
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研究论文 | 本文介绍了一种使用随机引物在Fluidigm C1™平台上进行单细胞5'端转录组分析的方法 | 该方法能够检测单细胞分辨率下的转录起始位点（TSS），提供更全面的基因调控元件概览，包括非多聚腺苷酸RNA和增强子RNA活性 | NA | 实现完整的转录组分析 | 单细胞5'端转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 每次运行可从单个样本中分离和处理多达96个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 26370 | 2024-08-08 |
Identifying luminal and basal mammary cell specific genes and their expression patterns during pregnancy
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0267211
PMID:35486595
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据深入分析了未怀孕和怀孕小鼠乳腺上皮细胞，以探索乳腺祖细胞或其后代分化为管腔细胞和肌上皮细胞的机制 | 本研究采用蒙特卡洛特征选择和增量特征选择曲线，结合支持向量机或RIPPER算法，找到了能够将上皮细胞分为不同亚型和阶段的优化基因特征和规则 | NA | 探索乳腺祖细胞或其后代分化为管腔细胞和肌上皮细胞的机制 | 未怀孕和怀孕小鼠的乳腺上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 支持向量机 | 基因表达数据 | 未怀孕和怀孕小鼠的乳腺上皮细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 26371 | 2024-08-08 |
Computational tools for analyzing single-cell data in pluripotent cell differentiation studies
2021-10-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100087
PMID:35474899
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综述 | 本文综述了用于分析单细胞数据以研究多能细胞分化的计算方法 | 探讨了单细胞技术在多能细胞分化研究中的应用，特别是在优化分化协议、验证、鲁棒性和使用方面的潜力 | NA | 旨在讨论计算方法在单细胞组学和成像数据分析中的应用，以解决多能细胞分化过程中的一些主要挑战 | 单细胞组学和成像数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 组学数据，成像数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26372 | 2024-08-08 |
Interrogating RNA and protein spatial subcellular distribution in smFISH data with DypFISH
2021-09-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100068
PMID:35474672
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DypFISH的方法，用于定量研究RNA和蛋白质的亚细胞定位 | DypFISH结合了单分子RNA荧光杂交（smFISH）数据和蛋白质免疫标记，能够研究分子聚集模式、mRNA-蛋白质亚细胞定位与微管组织中心方向的关系以及mRNA-蛋白质空间分布的相互依赖性 | NA | 定量研究RNA和蛋白质的亚细胞定位 | RNA和蛋白质的亚细胞定位 | 分子生物学 | NA | smFISH | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26373 | 2024-08-08 |
Phenotypic, transcriptomic and functional profiling reveal reduced activation thresholds of CD8+ T cells in giant cell arteritis
2022-12-23, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keac250
PMID:35460236
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研究论文 | 本研究通过表型、转录组和功能分析揭示了巨细胞动脉炎患者中CD8+ T细胞激活阈值降低的现象 | 首次全面分析了巨细胞动脉炎患者循环和病变中的CD8+ T细胞，并揭示了其激活阈值降低和增殖倾向的表型 | 样本量较小，仅包括14名新诊断的巨细胞动脉炎患者和18名健康对照 | 探讨CD8+ T细胞在巨细胞动脉炎发病机制中的确切作用 | 巨细胞动脉炎患者的循环和病变中的CD8+ T细胞 | NA | 巨细胞动脉炎 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，免疫组化 | NA | 细胞 | 14名新诊断的巨细胞动脉炎患者和18名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 26374 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq analysis of testicular somatic cell development in pigs
2022-11, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2022.03.014
PMID:35436608
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了关中黑猪在不同年龄阶段的睾丸体细胞发育情况 | 首次在分子水平上详细描述了猪睾丸体细胞的发育和成熟过程，并发现了Sertoli细胞的新标记基因PRND | 研究仅限于关中黑猪，且样本年龄点有限 | 探究猪睾丸体细胞在不同发育阶段的分子特征及其在精子发生中的作用 | 关中黑猪的睾丸体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五个年龄段的关中黑猪睾丸样本 | NA | NA | NA | NA |
| 26375 | 2024-08-08 |
A variety of 'exhausted' T cells in the tumor microenvironment
2022-10-05, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxac013
PMID:35460561
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综述 | 本文综述了肿瘤微环境中各种'耗竭'T细胞亚群的最新见解 | 探讨了CD4+ T细胞和Treg细胞在肿瘤微环境中的耗竭现象，以及单细胞RNA测序揭示的具有细胞毒活性的CD4+ T细胞的耗竭情况 | NA | 揭示新的治疗靶点和策略，以诱导强大的抗肿瘤免疫反应 | 肿瘤微环境中的耗竭T细胞亚群 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26376 | 2024-08-08 |
Exploring the R-ISS stage-specific regular networks in the progression of multiple myeloma at single-cell resolution
2022-09, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-021-2097-1
PMID:35437648
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探索了多发性骨髓瘤（MM）在修订国际分期系统（R-ISS）下的细胞异质性和规律网络 | 发现了新的分子、网络和交叉对话对，这些在不同R-ISS阶段的多发性骨髓瘤中具有显著意义 | NA | 旨在改善多发性骨髓瘤的治疗方法 | 多发性骨髓瘤患者及其细胞异质性 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9名多发性骨髓瘤患者和22名其他患者的骨髓瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 26377 | 2024-08-08 |
Improved T-cell Immunity Following Neoadjuvant Chemotherapy in Ovarian Cancer
2022-08-02, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-2834
PMID:35443043
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研究论文 | 本文评估了接受新辅助化疗的晚期上皮性卵巢癌患者外周免疫细胞功能和组成的演变 | 发现新辅助化疗可能通过减少肿瘤负担和增强抗原处理与呈递来缓解肿瘤相关免疫抑制 | 研究样本量较小，仅包括10名患者 | 研究新辅助化疗对晚期上皮性卵巢癌患者外周免疫细胞功能和组成的影响 | 晚期高级别浆液性卵巢癌患者 | NA | 卵巢癌 | RNA测序 | NA | 血液样本 | 10名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 26378 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals circadian rhythm disruption associated with poor prognosis and drug-resistance in lung adenocarcinoma
2022-Aug, Journal of pineal research
IF:8.3Q1
DOI:10.1111/jpi.12803
PMID:35436363
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研究论文 | 本研究开发了一种计算算法，用于定义肺腺癌中单细胞RNA测序数据集中的肿瘤内昼夜节律紊乱状态，并探讨其与临床预后和药物抵抗的关系 | 首次使用单细胞转录组数据分析昼夜节律紊乱与肺腺癌预后和药物抵抗的关系，并开发了开源R包CRDscore进行分析 | NA | 探讨昼夜节律紊乱在肺腺癌临床预测中的作用 | 肺腺癌中的昼夜节律紊乱状态及其对预后和药物抵抗的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算算法 | 转录组数据 | 三个代表性的单细胞RNA测序数据集及涉及22种癌症类型的公共批量转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 26379 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals heterogeneity in hiPSC-derived muscle progenitors and E2F family as a key regulator of proliferation
2022-08, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202101312
PMID:35459735
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了hiPSC衍生的肌肉前体细胞图谱，揭示了其异质性并发现了E2F转录因子家族在细胞增殖中的关键作用 | 首次揭示了hiPSC衍生的肌肉前体细胞的异质性，并识别了E2F转录因子家族作为其增殖的关键调节因子 | NA | 研究hiPSC衍生的肌肉前体细胞的异质性及其对再生潜力的影响 | hiPSC衍生的肌肉前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个hiPSC衍生的肌肉前体细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 26380 | 2024-08-08 |
Discovering single-cell eQTLs from scRNA-seq data only
2022-Jun-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2022.146520
PMID:35452708
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研究论文 | 本文介绍了一种名为eQTLsingle的新方法，该方法仅使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据来发现单细胞水平的eQTL | eQTLsingle方法能够在没有基因组数据的情况下，从scRNA-seq数据中检测突变，并使用零膨胀负二项（ZINB）模型对不同基因型的基因表达进行建模，以发现基因型与表型之间的关联 | NA | 研究单细胞水平的eQTL，以理解基因组调控的细胞类型特异性和细胞环境相关性 | 单细胞RNA测序数据中的eQTL | 基因组学 | 脑瘤 | scRNA-seq | ZINB | scRNA-seq数据 | 一个胶质母细胞瘤和胶质球scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |