单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
26361	2024-08-09	Single-cell RNA-seq reveals cell type-specific transcriptional signatures at the maternal-foetal interface during pregnancy 2016-04-25, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/ncomms11414 PMID:27108815	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了胎盘中的细胞类型特异性转录特征，揭示了母胎界面不同细胞类型的功能贡献	首次对胎盘进行单细胞RNA测序分析，识别了Blimp1依赖的转录本在SpA-TGCs中的富集	NA	探究母胎界面不同细胞类型的功能贡献及控制胎盘形态发生和血管拟态的动态基因表达模式	胎盘中的细胞类型特异性转录特征	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
26362	2024-08-09	Cell-cycle-independent transitions in temporal identity of mammalian neural progenitor cells 2016-Apr-20, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/ncomms11349 PMID:27094546	research paper	本文通过单细胞转录组分析，研究了不同发育阶段哺乳动物神经前体细胞（APs）的时间身份转换机制	发现APs中基因表达的时间变化与细胞周期无关，且不受Notch激活模式的影响	NA	探究哺乳动物神经前体细胞在脑发育过程中时间身份转换的机制	哺乳动物神经前体细胞（APs）及其在不同发育阶段的基因表达变化	NA	NA	单细胞转录组分析	NA	基因表达数据	NA
26363	2024-08-09	Nuclear RNA-seq of single neurons reveals molecular signatures of activation 2016-04-19, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/ncomms11022 PMID:27090946	研究论文	本文通过单核RNA测序（snRNA-seq）方法，研究了激活神经元的转录组变化，揭示了与经验驱动活动诱导相关的转录模式。	本文首次使用snRNA-seq技术，展示了激活神经元转录组的广泛变化，包括MAPK通路基因的诱导，并揭示了激活状态的连续性和伪时间模式。	NA	研究激活神经元的分子动力学，特别是与特定经验相关的差异神经元反应。	小鼠齿状回颗粒细胞在短暂新环境暴露后的激活神经元转录组。	数字病理学	NA	单核RNA测序（snRNA-seq）	NA	转录组数据	未具体说明样本数量
26364	2024-08-09	Single-Cell RNA-Seq Reveals Lineage and X Chromosome Dynamics in Human Preimplantation Embryos 2016-May-05, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2016.03.023 PMID:27062923	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术揭示了人类早期胚胎发育中的细胞谱系和X染色体动态变化	首次提供了人类早期胚胎发育的综合转录图谱，并发现女性细胞在植入前实现了X染色体RNA水平的剂量补偿	研究主要集中在人类早期胚胎发育，未涉及更广泛的发育阶段	探索人类早期胚胎发育的细胞谱系和X染色体动态	人类早期胚胎的细胞谱系和X染色体动态	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	1529个单细胞来自88个人类早期胚胎
26365	2024-08-09	Single-cell sequencing in stem cell biology 2016-Apr-15, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-016-0941-0 PMID:27083874	综述	本文综述了单细胞测序技术在干细胞生物学中的应用及其方法学进展和未来展望	单细胞测序技术能够全面解析细胞异质性，并识别出干细胞群体中的不同表型细胞类型	NA	探讨单细胞组学测序技术在干细胞领域的最新进展和未来发展方向	不同类型的干细胞，包括多能干细胞和组织特异性干细胞	生物技术	NA	单细胞基因组、表观基因组和转录组测序技术	NA	基因组数据	NA
26366	2024-08-09	Single-cell profiling of lncRNAs in the developing human brain 2016-04-14, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-016-0933-0 PMID:27079200	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了人类大脑发育过程中长非编码RNA（lncRNAs）的表达情况	发现lncRNAs在特定脑细胞中大量表达，而在整体样本中难以检测	NA	探讨lncRNAs在人类大脑发育中的功能和表达模式	人类大脑发育过程中的lncRNAs表达	基因组学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	特定个体脑细胞样本
26367	2024-08-09	Single-cell analysis of long non-coding RNAs in the developing human neocortex 2016-Apr-14, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-016-0932-1 PMID:27081004	研究论文	本文通过链特异性RNA测序深入分析了不同发育阶段人类大脑新皮层中的长非编码RNA（lncRNA），并应用于单细胞转录组分析	首次揭示了lncRNA在单个细胞中的高表达特性及其细胞类型特异性，特别是LOC646329在单个放射状胶质细胞中的富集	NA	研究lncRNA在人类大脑发育中的表达和功能	人类大脑新皮层中的长非编码RNA	数字病理学	NA	链特异性RNA测序	NA	RNA	数百个新皮层细胞
26368	2024-08-09	RNA-Seq Profiling of Intact and Enucleated Oocyte SCNT Embryos Reveals the Role of Pig Oocyte Nucleus in Somatic Reprogramming 2016, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0153093 PMID:27070804	研究论文	本研究通过RNA测序分析了完整和去核卵母细胞的SCNT胚胎，揭示了猪卵母细胞核在体细胞重编程中的作用	首次通过单细胞RNA测序揭示了完整和去核卵母细胞SCNT胚胎在2细胞和4细胞阶段的转录组差异，为理解卵母细胞核在体细胞重编程中的机制提供了新的见解	研究仅限于猪的卵母细胞和胚胎，可能需要进一步研究以推广到其他物种	探究卵母细胞核在体细胞重编程中的分子机制	猪的完整和去核卵母细胞SCNT胚胎	分子生物学	NA	RNA测序	NA	基因表达数据	539个完整MII卵母细胞和461个去核MII卵母细胞，260个多倍体胚胎和93个传统克隆胚胎
26369	2024-08-09	Single-cell RNA sequencing: revealing human pre-implantation development, pluripotency and germline development 2016-Sep, Journal of internal medicine IF:9.0Q1 DOI:10.1111/joim.12493 PMID:27046137	综述	本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示人类早期发育、多能性和生殖细胞发育方面的应用	单细胞RNA测序技术为系统性探索人类早期胚胎提供了新的强大工具	由于伦理问题、人类胚胎稀缺以及DNA和RNA微量存在，对这一过程的彻底研究仍然受限	探讨单细胞RNA测序技术在人类早期发育研究中的优势和局限	人类早期发育、胚胎干细胞和生殖细胞的建立	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	数百个细胞组成的囊胚
26370	2024-08-09	Distinct myeloid progenitor-differentiation pathways identified through single-cell RNA sequencing 2016-06, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/ni.3412 PMID:27043410	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究者发现了不同的骨髓前体细胞分化途径	本文首次通过单细胞转录组分析，揭示了骨髓前体细胞在分化过程中存在两种不同的途径，一种途径表达转录因子GATA-1，生成肥大细胞、嗜酸性粒细胞、巨核细胞和红细胞；另一种途径不表达该基因，生成单核细胞、中性粒细胞和淋巴细胞	NA	探索骨髓前体细胞的分化途径	骨髓前体细胞的分化途径	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组	NA
26371	2024-08-09	Expression Analysis Highlights AXL as a Candidate Zika Virus Entry Receptor in Neural Stem Cells 2016-05-05, Cell stem cell IF:19.8Q1 DOI:10.1016/j.stem.2016.03.012 PMID:27038591	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化技术，分析了Zika病毒（ZIKV）在发育中的大脑中多个细胞类型的受体表达情况，特别是候选病毒进入受体AXL的表达。	首次揭示AXL在人类放射状胶质细胞、星形胶质细胞、内皮细胞和微胶质细胞中的高表达，以及在发育中的小鼠和雪貂皮质及人类干细胞衍生的脑类器官中的保守表达。	NA	探讨Zika病毒感染与胎儿异常和微头症之间的分子和细胞机制。	Zika病毒在发育中的大脑中的受体表达情况，特别是AXL受体。	NA	NA	单细胞RNA测序，免疫组化	NA	RNA	多种细胞类型，包括人类放射状胶质细胞、星形胶质细胞、内皮细胞、微胶质细胞，以及小鼠和雪貂的皮质细胞和人类干细胞衍生的脑类器官。
26372	2024-08-09	Design and computational analysis of single-cell RNA-sequencing experiments 2016-Apr-07, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-016-0927-y PMID:27052890	研究论文	本文重点介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）实验设计和分析的计算方法，及其在不同场景下的优缺点	探讨了scRNA-seq实验中新兴的计算挑战，并提出了未来发展的预期	NA	旨在解决scRNA-seq实验中的计算挑战，并推动该领域的发展	单细胞RNA测序实验的设计和分析方法	自然语言处理	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	文本	NA
26373	2024-08-09	The potential of single-cell profiling in plants 2016-Apr-05, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-016-0931-2 PMID:27048384	research paper	本文探讨了单细胞转录组学在植物研究中的应用潜力	单细胞RNA-seq技术在植物细胞中的应用为植物生物学提供了新的视角	单细胞转录组学在植物中的应用仍处于早期阶段，且需要针对单细胞实验的新分析工具	探讨单细胞转录组学在植物研究中的应用及其对植物生物学基本问题的潜在影响	植物细胞的特性、可塑性及对环境输入的局部细胞反应	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	转录组数据	NA
26374	2024-08-09	Lineage specification in the mouse preimplantation embryo 2016-Apr-01, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.128314 PMID:27048685	research paper	本文探讨了小鼠植入前胚胎中细胞谱系的形成过程及其调控机制	利用活体成像、计算建模和单细胞转录组分析等新技术，提供了对细胞谱系形成过程的新见解	NA	研究小鼠植入前胚胎中细胞谱系的形成及其调控机制	小鼠植入前胚胎中的细胞谱系形成	NA	NA	活体成像、计算建模、单细胞转录组分析	NA	NA	NA
26375	2024-08-09	A biased view toward celiac disease 2016-05, Mucosal immunology IF:7.9Q1 DOI:10.1038/mi.2016.17 PMID:27007675	研究论文	本文通过应用体外单细胞TCR测序技术，研究了乳糜泻患者中T细胞受体的偏倚使用情况，揭示了其与两种谷蛋白表位的反应关系。	首次应用体外单细胞TCR测序技术研究乳糜泻患者中T细胞受体的偏倚使用情况，为疾病发病机制、诊断和治疗提供了新视角。	NA	探讨乳糜泻患者中T细胞受体的偏倚使用情况及其与疾病发病机制、诊断和治疗的关系。	乳糜泻患者的T细胞受体及谷蛋白表位。	NA	乳糜泻	单细胞测序	NA	细胞	NA
26376	2024-08-09	DNMT3A Haploinsufficiency Transforms FLT3ITD Myeloproliferative Disease into a Rapid, Spontaneous, and Fully Penetrant Acute Myeloid Leukemia 2016-05, Cancer discovery IF:29.7Q1 DOI:10.1158/2159-8290.CD-16-0008 PMID:27016502	研究论文	研究显示DNMT3A半合子不足能够将FLT3ITD骨髓增殖性疾病转化为快速、自发且完全渗透性的急性髓系白血病	首次证明DNMT3A半合子不足在FLT3ITD骨髓增殖性疾病转化为急性髓系白血病中的作用，并揭示了其可逆的表观遗传学改变	NA	探讨DNMT3A半合子不足在FLT3ITD骨髓增殖性疾病转化为急性髓系白血病中的作用及其机制	DNMT3A和FLT3突变的小鼠模型	数字病理学	急性髓系白血病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
26377	2024-08-09	Single-cell RNA sequencing reveals molecular and functional platelet bias of aged haematopoietic stem cells 2016-Mar-24, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/ncomms11075 PMID:27009448	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了衰老造血干细胞在分子和功能上对血小板的偏向性	发现了衰老造血干细胞中一种先前未被识别的、专门产生血小板的干细胞类别，并证实了通过去除FOG-1转录因子来消除造血干细胞的血小板编程，可以增加淋巴细胞的输出	NA	探究衰老造血干细胞内在变化及其子集平衡如何影响细胞谱系输出	衰老造血干细胞的分子和功能特性	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组	具体样本数量未在摘要中提及
26378	2024-08-09	Single-cell RNA-seq reveals activation of unique gene groups as a consequence of stem cell-parenchymal cell fusion 2016-Mar-21, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/srep23270 PMID:26997336	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了间充质干细胞与心肌细胞融合后基因表达的独特变化	发现融合细胞在短时间内表现出独特的转录组变化，包括表达多能性和心脏前体基因，以及与癌症相关的基因	文章未明确提及研究的具体局限性	探究间充质干细胞与心肌细胞融合后的表型多样化和相关时间进程	间充质干细胞与心肌细胞的融合细胞	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	具体样本数量未在摘要中明确提及
26379	2024-08-09	Integrative Single-Cell Transcriptomics Reveals Molecular Networks Defining Neuronal Maturation During Postnatal Neurogenesis 2017-03-01, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991) DOI:10.1093/cercor/bhw040 PMID:26989163	研究论文	本研究利用单细胞转录组学结合新的整合生物信息学方法，揭示了在哺乳动物海马体中，DCX表达的未成熟神经元在神经发生过程中通过特定的转录网络进展到不同的发育阶段	本研究首次通过单细胞RNA测序和整合生物信息学方法，分类了未成熟神经元的不同发育亚群，并揭示了与神经元成熟相关的新途径	NA	测试DCX表达的未成熟神经元通过特定转录网络进展到不同发育阶段的假设	哺乳动物海马体中的未成熟神经元及其在神经发生过程中的分子网络	数字病理学	神经发育疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
26380	2024-08-09	Intra-tumour heterogeneity - going beyond genetics 2016-06, The FEBS journal DOI:10.1111/febs.13705 PMID:26945550	研究论文	本文探讨了肿瘤内异质性的遗传和非遗传因素，并介绍了相关技术方法以深入理解这一现象	本文首次系统地分析了非遗传因素在肿瘤内异质性中的作用，并提出了综合遗传和非遗传因素的技术方法	NA	旨在深入理解肿瘤内异质性的全貌，以开发更有效的癌症治疗策略	肿瘤内异质性的遗传和非遗传因素	数字病理学	癌症	基因组分析、细胞谱系追踪、单细胞RNA测序	NA	基因组数据、细胞数据	NA