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当前共找到 35765 篇文献，本页显示第 2601 - 2620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2601 | 2025-12-20 |
Identification of prognostic biomarkers for endometrioid endometrial carcinoma based on the miRNA and mRNA co-expression network regulated by estradiol
2025, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
DOI:10.1016/j.clinsp.2025.100672
PMID:40319860
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研究论文 | 本研究通过构建miRNA和mRNA共表达网络，识别了受雌二醇调控的子宫内膜样子宫内膜癌预后生物标志物 | 首次结合TCGA数据库和雌二醇处理的细胞测序数据，构建miRNA-mRNA调控网络，并利用单细胞转录组数据验证基因表达变化 | 样本量相对有限，特别是雌二醇处理组仅3个重复，且依赖公共数据库数据，未进行实验验证 | 识别与雌二醇调控相关的子宫内膜样子宫内膜癌预后生物标志物 | 子宫内膜样子宫内膜癌患者样本和雌二醇处理的子宫内膜癌Ishikawa细胞 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | RNA测序、单细胞转录组测序 | 共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络 | RNA表达谱、单细胞转录组数据 | TCGA数据库408例患者样本，雌二醇处理细胞实验9个样本（3个对照组，3个低剂量组，3个高剂量组） | NA | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 2602 | 2025-12-20 |
Potential function exploration of lncRNAs in idiopathic pulmonary fibrosis: insights from whole transcriptome sequencing data analysis
2025 Jan-Dec, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
DOI:10.1016/j.clinsp.2025.100732
PMID:40782499
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研究论文 | 本研究通过全转录组测序数据分析，探索长链非编码RNA在特发性肺纤维化中的潜在功能 | 结合RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，识别与IPF相关的差异表达lncRNAs及其共表达网络，并发现特定lncRNAs在炎症反应通路中的富集 | 样本量较小（12名IPF患者和5名对照），且为诊断性研究，需进一步验证 | 探索lncRNAs在特发性肺纤维化中的功能和作用机制 | 特发性肺纤维化患者和对照的RNA测序数据 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | WGCNA | RNA测序数据 | 12名IPF患者和5名对照 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2603 | 2025-12-18 |
Molecular mechanisms related to neutrophils in sepsis using single-cell sequencing combined with Mendelian randomization analysis
2025, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/213752
PMID:41403633
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2604 | 2025-12-20 |
Decoding cardiac metabolic reprogramming through single-cell multi-omics: from mechanisms to therapeutic applications
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1710474
PMID:41403700
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综述 | 本文综述了单细胞多组学技术如何揭示心脏代谢重编程在心血管疾病中的机制，并探讨了其治疗应用前景 | 系统整合了单细胞转录组学、表观基因组学和空间转录组学等前沿技术，首次在单细胞分辨率下系统解析心脏细胞的代谢异质性、动态变化和细胞间通讯，并连接基础机制与代谢靶向干预策略 | 将研究发现转化为临床实践仍面临挑战，包括技术标准化、数据整合及临床验证等方面的障碍 | 阐明心脏代谢重编程在心血管疾病中的病理机制，并探索基于代谢干预的治疗策略 | 心脏细胞（在生理和病理条件下） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学，单细胞表观基因组学，空间转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 2605 | 2025-12-20 |
Integrative multi-omics analysis identifies a PTM-related immune signature and IRF9 as a driver in ccRCC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1707375
PMID:41403935
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，在透明细胞肾细胞癌中鉴定了一个与翻译后修饰相关的免疫特征，并发现IRF9作为驱动因子 | 首次构建了一个基于翻译后修饰的五基因预后特征，并实验验证了IRF9在ccRCC中的功能驱动作用 | 研究主要基于回顾性队列和生物信息学分析，需要进一步的前瞻性临床验证 | 开发ccRCC的预后生物标志物并探索其免疫治疗反应预测价值 | 透明细胞肾细胞癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肾癌 | 多组学分析，单细胞RNA-seq，免疫组化，qPCR，功能实验 | 随机生存森林模型 | 基因表达数据，单细胞RNA-seq数据，临床数据 | TCGA-KIRC队列，E-MTAB-1980队列，IMvigor210免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2606 | 2025-12-20 |
Pan-cancer multi-omics analysis of CCT4 in tumor progression and cancer immunity, with focus on lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1714837
PMID:41403933
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了CCT4在泛癌及肺腺癌中的表达模式、临床意义及其在肿瘤进展和免疫逃逸中的作用 | 首次在泛癌层面整合多组学数据揭示CCT4与免疫浸润的关联，并通过单细胞RNA测序发现CCT亚基在肿瘤上皮细胞中的协同过表达及CCT4在增殖亚群中的特异性富集 | 研究主要基于生物信息学分析，体外实验验证有限，且CCT4的具体分子机制仍需进一步探索 | 阐明CCT4在肿瘤进展和癌症免疫中的作用，特别是在肺腺癌中的功能 | 泛癌数据集及肺腺癌样本，包括肿瘤细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 转录组学、蛋白质组学、基因组学、表观遗传学、免疫基因组学、单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | 泛癌数据集及肺腺癌样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2607 | 2025-12-20 |
Immune dysregulation in preeclampsia: integrative analysis of peripheral transcriptomes and placental single-cell land-scapes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1638603
PMID:41403942
|
研究论文 | 本研究通过整合先兆子痫高风险孕妇外周血转录组和胎盘单细胞RNA测序数据，揭示了免疫失调的分子机制并识别了潜在生物标志物 | 首次将外周血转录组与胎盘单细胞图谱整合分析，识别出在两种数据集中均稳定表达的五个候选基因，并揭示了它们在特定免疫细胞中的表达模式 | 未明确说明样本的具体数量，且候选基因名称在摘要中被省略，限制了结果的直接验证 | 探索先兆子痫中免疫失调的分子机制，并识别早期检测和机制研究的生物标志物 | 先兆子痫高风险孕妇的外周血和胎盘组织 | 生物信息学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），转录组分析 | 机器学习特征选择 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2608 | 2025-12-20 |
Upscaling: efficient generation of human lung organoids from induced pluripotent stem cells using a stirring bioreactor
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1684315
PMID:41404197
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用搅拌生物反应器高效生成人肺类器官的方法，并与手动培养方式进行了比较 | 采用配备独特膜搅拌器的搅拌罐生物反应器进行规模化、自动化培养，实现了动物成分自由的生产过程 | NA | 开发高效生成人诱导多能干细胞来源肺类器官的方法，用于疾病模拟和药物反应研究 | 人诱导多能干细胞来源的肺类器官 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2609 | 2025-12-20 |
Deciphering B Cell Heterogeneity and Pathogenic Mechanisms in Osteoporosis Through Single-Cell RNA Sequencing
2025, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/bmri/9979105
PMID:41404455
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了骨质疏松症中B细胞亚群的异质性及其在疾病进展中的作用，并识别出两个关键的信号通路 | 首次在骨质疏松症中利用单细胞RNA测序技术系统性地解析B细胞亚群的异质性，并识别出MIF-(CD74+CXCR4)和LGALS9-CD45这两个新的信号通路作为疾病进展的潜在关键调节因子 | 样本量较小（仅包括3名骨质疏松症患者和1名非骨质疏松症患者），且数据来源于公共数据库，可能限制了结果的普遍性和统计效力 | 探究B细胞亚群在骨质疏松症中的作用及其对骨代谢的影响 | 人类股骨头组织细胞，包括骨质疏松症患者和非骨质疏松症患者的样本 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 4名患者（3名骨质疏松症患者和1名非骨质疏松症患者）的股骨头组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2610 | 2025-12-20 |
The role of LSM1 in breast cancer: Shaping metabolism and tumor-associated macrophage infiltration
2023-12, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2023.107008
PMID:37995895
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研究论文 | 本研究探讨LSM1在乳腺癌中的作用，揭示其作为诊断和预后标志物的潜力，并分析其对代谢和肿瘤免疫微环境的影响 | 首次通过多组学方法将LSM1鉴定为晚期乳腺癌的诊断标志物，并利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术分析其与免疫细胞的关联 | 研究样本量相对较小（54例患者活检），且需要进一步验证LSM1在更大队列中的临床应用价值 | 探究LSM1在乳腺癌临床病理、肿瘤免疫微环境和精准肿瘤学中的潜在作用 | 乳腺癌患者组织样本（包括活检和组织微阵列）以及乳腺癌细胞系 | 数字病理 | 乳腺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 生物信息学分析 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 54例乳腺癌患者活检和组织微阵列 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2611 | 2025-12-20 |
Identification of cytokine-induced cell communications by pan-cancer meta-analysis
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16221
PMID:38054018
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和泛癌水平转录组学整合，识别了细胞因子介导的细胞间通讯，并构建了全面的细胞因子-受体图谱 | 开发了一种单细胞方法主动表达62对细胞因子-受体对，揭示了稳定的细胞因子介导的细胞通讯，涉及84种细胞因子和受体，并在泛癌水平进行了整合分析 | 研究基于转录组学数据，可能未完全捕捉蛋白质水平的相互作用；样本量虽大，但某些癌症类型可能代表性不足 | 揭示不同癌症中细胞因子介导的细胞间通讯机制及其在癌症发展和治疗反应中的作用 | 41,900个细胞，涵盖25种癌症类型，以及来自TCGA的10,967个样本，涉及32种癌症类型 | 生物信息学 | 泛癌 | 单细胞转录组学，泛癌meta分析，功能富集分析，共突变分析 | NA | 单细胞转录组数据，TCGA突变数据，临床生存数据 | 41,900个细胞（25种癌症类型），10,967个样本（32种TCGA癌症类型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2612 | 2025-12-20 |
Elucidating the role of nicotinamide N-methyltransferase-p53 axis in the progression of chronic kidney disease
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16301
PMID:37953778
|
研究论文 | 本研究探讨了烟酰胺N-甲基转移酶（NNMT）在慢性肾病（CKD）进展中的作用，特别是其通过p53轴促进肾间质纤维化的机制 | 首次通过单细胞转录组测序（scRNA-seq）发现NNMT在纤维母细胞中特异性增加，并揭示了NNMT通过调节p53的DNA甲基化和磷酸化促进纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠UUO模型和体外细胞实验，尚未在人类临床样本中验证，且NNMT的具体下游信号通路仍需进一步阐明 | 阐明NNMT在慢性肾病肾间质纤维化中的作用机制，并探索其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠（UUO模型）和培养的肾间质纤维母细胞（NRK-49F） | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 小鼠肾脏组织（UUO与假手术组对比）及培养细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2613 | 2025-12-20 |
Data-driven modeling predicts gene regulatory network dynamics during the differentiation of multipotential hematopoietic progenitors
2022-01, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009779
PMID:35030198
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研究论文 | 本文通过数据驱动建模预测了多潜能造血祖细胞分化过程中的基因调控网络动态 | 利用瞬时基因表达模式推断基因调控网络的遗传结构和动态，揭示了PU.1上调的调控机制超出Gata1-PU.1双稳态开关 | 模型基于诱导细胞系数据，可能无法完全反映体内复杂环境 | 研究造血过程中细胞分化的基因调控网络动态 | 多潜能造血祖细胞分化为红细胞和中性粒细胞的过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因电路模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2614 | 2025-12-19 |
A Single-Cell Atlas of Transcriptome Changes in the Intestinal Epithelium at the Suckling-to-Weaning Transition in Male Rabbits
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101628
PMID:40907661
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了雄性兔子在哺乳到断奶过渡期间肠道上皮细胞的转录组变化 | 首次提供了兔子肠道上皮的单细胞图谱，并突出了兔子作为研究BEST4+上皮细胞模型的优势，这些细胞在小鼠中缺失 | 研究仅针对雄性兔子，未涉及雌性；样本来自盲肠，可能不全面代表整个肠道 | 识别固体食物摄入诱导的肠道上皮各细胞类型的转录组变化 | 雄性兔子的肠道上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 年龄匹配的同窝雄性兔子，分为摄入固体食物组和未摄入组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2615 | 2025-12-19 |
Sex-related variations in liver homeostasis and disease: From zonation dynamics to clinical implications
2026-Jan, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.08.007
PMID:40846185
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综述 | 本文综述了肝脏在性别上的显著二态性，包括结构、代谢功能和疾病易感性的差异，并探讨了肝区带异质性、性激素影响以及相关疾病临床意义 | 整合单细胞RNA测序和空间蛋白质组学等新技术，揭示了基因和蛋白表达的性别特异性差异与肝脏功能空间异质性的关联，并探讨了数字孪生模型在个性化诊疗中的前景 | NA | 探讨肝脏性别二态性的生物学基础及其对疾病易感性和进展的临床影响 | 肝脏的区带异质性、性激素信号通路及相关肝脏疾病 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | 数字孪生模型 | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 2616 | 2025-12-19 |
Patient-derived liver organoids recapitulate liver epithelial heterogeneity and enable precision modeling of alcohol-related liver disease
2026-Jan, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.07.014
PMID:40754225
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研究论文 | 本研究开发了一种基于肝穿刺活检的类器官模型，用于模拟酒精相关肝病并支持个性化药物测试 | 首次利用肝穿刺活检生成类器官，成功捕捉了肝脏上皮细胞的异质性，并保留了疾病阶段特征 | 研究依赖于活检样本，可能无法完全代表所有患者群体或疾病亚型 | 开发一种能够模拟酒精相关肝病并用于个性化医疗的人类类器官模型 | 酒精相关肝病患者 | 数字病理学 | 酒精相关肝病 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，批量RNA测序 | 类器官模型 | RNA测序数据，图像数据 | 早期阶段患者28例，晚期阶段患者34例 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2617 | 2025-12-19 |
Single-cell RNA sequencing methodology, analysis, applications, and future directions with special focus on cotton
2026-Jan, Plant biology (Stuttgart, Germany)
DOI:10.1111/plb.70131
PMID:41139384
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在棉花研究中的方法学、分析流程、应用及未来方向 | 重点探讨了scRNA-seq在植物细胞（特别是棉花）中的独特挑战与解决方案，如原生质体制备和细胞大小变异性，并展望了多组学整合的未来趋势 | 仍面临原生质体制备困难、细胞大小变异性大以及可靠标记基因需求等挑战 | 总结scRNA-seq技术在植物研究（尤其是棉花）中的进展、应用与未来发展方向 | 植物细胞，特别是棉花细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2618 | 2025-12-19 |
Combined HIF-1α blockade and CHIR99021 treatment reverses pulmonary fibrosis via modulation endothelial-to-mesenchymal transition
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114028
PMID:41399517
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研究论文 | 本研究通过联合抑制HIF-1α和GSK-3β，逆转了辐射诱导的肺纤维化，并揭示了其通过调控内皮-间质转化、DNA修复和染色质重塑的机制 | 首次提出联合使用2-ME和CHIR99021双重抑制HIF-1α和GSK-3β来逆转肺纤维化，并利用单细胞RNA测序和谱系追踪技术验证了其在恢复内皮细胞特性和抑制间质转化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和患者成纤维细胞，尚未在人体临床试验中验证其安全性和有效性 | 探索逆转辐射诱导肺纤维化的治疗策略 | 内皮细胞、肺成纤维细胞、小鼠RIPF模型以及特发性肺纤维化患者的成纤维细胞 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、表观遗传分析 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 小鼠模型和患者成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2619 | 2025-12-19 |
Endothelial Transcription Factor EB Protects Against Doxorubicin-Induced Endothelial Toxicity and Cardiac Dysfunction
2025-Dec-18, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞特异性转录因子EB（TFEB）在对抗阿霉素（DOX）诱导的内皮毒性和心脏功能障碍中的保护作用及其分子机制 | 首次揭示了内皮细胞特异性TFEB通过调控DAB2基因，增强自噬、减少氧化应激、维持内皮屏障完整性和内皮-心肌细胞通讯，从而保护心脏免受DOX毒性的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，其结论在人类患者中的直接适用性仍需进一步临床验证 | 探究内皮细胞TFEB是否能够保护内皮细胞免受损伤，并减轻DOX治疗诱导的心脏功能障碍 | 内皮细胞特异性TFEB转基因小鼠、内皮细胞特异性TFEB敲除小鼠、人类和小鼠心脏微血管内皮细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | RNA测序、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀结合定量聚合酶链反应 | 转基因小鼠模型、基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、染色质结合数据 | 多种基因型小鼠模型及对应的同窝对照小鼠，以及体外培养的人类和小鼠心脏微血管内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2620 | 2025-12-19 |
Macrophage-Specific E3 Ubiquitin Ligase TRIM31 Reduces Atherosclerotic Plaque Formation by Targeting LOX-1
2025-Dec-18, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞特异性E3泛素连接酶TRIM31通过靶向LOX-1促进其泛素化降解，从而减少动脉粥样硬化斑块形成 | 首次发现TRIM31作为巨噬细胞富集的保护因子，通过K48连接泛素化修饰LOX-1第12位赖氨酸并促进其降解，从而抑制泡沫细胞形成和炎症反应 | 研究主要基于小鼠模型，人类巨噬细胞的验证样本量较小（每组5-6个），且未涉及其他潜在TRIM31底物的系统筛选 | 探究TRIM31在巨噬细胞脂质代谢和炎症中的作用及其在动脉粥样硬化中的保护机制 | 小鼠巨噬细胞、人类巨噬细胞、动脉粥样硬化斑块 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、免疫沉淀-质谱分析、位点定向突变 | 基因敲除小鼠模型（Trim31fl/flLyz2cre, Lox-1-/-）、基因过表达模型（Trim31Lyz2-KI） | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞测序数据 | 小鼠每组8只，细胞实验每组5-6个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |