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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2601 | 2026-02-15 |
Integrated single-cell and transcriptomic analysis of CD8+CD101+TIM3+ T cells in hepatocellular carcinoma: implications for tumor microenvironment and prognostic modeling
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1639
PMID:41674942
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和转录组学分析,揭示了肝细胞癌中CD8+CD101+TIM3+ T细胞的功能、分化机制及其在肿瘤微环境中的作用,并构建了一个预后模型 | 首次在肝细胞癌中系统研究了CD8+CD101+TIM3+ T细胞的功能、分化轨迹及其与肿瘤微环境的相互作用,并基于此构建了一个新的预后预测模型 | 研究主要基于公共数据库和单细胞测序数据,缺乏体内实验验证;预后模型在验证队列中的表现略低于训练队列 | 探究肝细胞癌中特定T细胞亚群的功能、分化机制及其对免疫治疗和预后的影响 | 肝细胞癌组织中的CD8+CD101+TIM3+ T细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | Cox回归模型,LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据,临床数据,转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2602 | 2026-02-15 |
Prognostic value of palmitoylation-regulated mechanisms in glioblastoma: integrated multi-omics analysis via least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) regression and single-cell sequencing
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1953
PMID:41674962
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和单细胞测序,系统探讨了棕榈酰化相关基因在胶质母细胞瘤中的预后价值 | 结合LASSO回归和单细胞RNA测序分析,识别出与患者总生存期显著相关的核心基因,并揭示了它们在关键致癌通路中的富集和异质表达模式 | 研究主要基于公共数据库(如TCGA和GTEx)的转录组数据,可能未涵盖所有临床或分子亚型,且功能验证仅限于细胞系实验 | 系统研究棕榈酰化相关基因在胶质母细胞瘤中的预后意义 | 胶质母细胞瘤组织和正常脑组织 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组分析、单细胞RNA测序、LASSO回归、Kaplan-Meier生存分析 | LASSO回归 | RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据 | 基于TCGA和GTEx数据库的胶质母细胞瘤与正常组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2603 | 2026-02-15 |
Single-cell analysis reveals the prognostic role of immune escape in the colorectal cancer microenvironment
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1466
PMID:41674966
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌肿瘤微环境中的免疫逃逸相关细胞亚型,揭示了其在预后和免疫治疗中的潜在作用 | 首次系统性地对结直肠癌肿瘤微环境中的免疫逃逸相关细胞亚型进行新型分类,并利用CellChat和伪时序分析探索其细胞间相互作用和分化途径 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,需要通过多重免疫组化等技术进一步验证,且样本量可能有限 | 探索结直肠癌中免疫逃逸相关亚型的新型分类,阐明其机制,并评估其对免疫治疗和预后的价值 | 结直肠癌肿瘤微环境中的免疫逃逸相关细胞亚型,包括癌症相关成纤维细胞、CD8+ T细胞、巨噬细胞和B细胞等 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化 | 非负矩阵分解聚类, CellChat, 伪时序分析, SCENIC, Cox比例风险回归, Kaplan-Meier生存分析 | 单细胞RNA测序数据, 免疫组化图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2604 | 2026-02-15 |
Single-patient single-cell RNA sequencing reveals neuroendocrine predominance and immunosuppression in small-cell lung cancer
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1674
PMID:41674970
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小细胞肺癌患者的肿瘤组织,揭示了神经内分泌细胞占主导和免疫抑制的肿瘤微环境特征 | 首次在单患者水平使用scRNA-seq深入解析SCLC的瘤内异性和免疫微环境,并识别BEX1和MAP1b作为新的治疗靶点 | 研究仅基于单个患者样本,结果需在更大队列中验证;BEX1和MAP1b的临床实用性尚待后续研究确认 | 表征小细胞肺癌的瘤内异性和免疫抑制肿瘤微环境,并探索潜在治疗靶点 | 小细胞肺癌患者的原发肿瘤组织及相邻非癌组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例SCLC患者的原发肿瘤和相邻非癌组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2605 | 2026-02-15 |
Key genes and pathway differences between serrated polyps and conventional adenomas: insights from multi-omics
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-2138
PMID:41674976
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了锯齿状息肉与传统腺瘤在关键细胞类型和基因上的差异 | 首次整合CRC GWAS数据与单细胞测序,识别出锯齿状特异性细胞(SSC)作为CRC遗传风险的关键上皮细胞群,并鉴定出六个稳健的风险基因 | NA | 探究锯齿状息肉和传统腺瘤恶性转化过程中的关键细胞类型和基因 | 结直肠癌(CRC)中的锯齿状息肉和传统腺瘤 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序, GWAS, TWAS, 精细定位, 孟德尔随机化 | scPagwas, SMR | 基因组, 转录组, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2606 | 2026-02-15 |
Novel fatty acid metabolism-related molecular subtyping and prognostic signature for breast cancer
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1424
PMID:41674979
|
研究论文 | 本研究开发了一种与脂肪酸代谢相关的基因预后模型,用于乳腺癌的风险分层和预后预测 | 首次整合十种机器学习方法构建脂肪酸代谢相关基因预后模型,并结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析验证模型基因的功能和空间表达模式 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能 | 识别与脂肪酸代谢相关的有效生物标志物,以改善乳腺癌患者的风险分层和治疗选择 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,基因表达分析 | CoxBoost,随机生存森林 | 基因表达数据 | 1,217名乳腺癌患者(TCGA数据库),26名乳腺癌患者(单细胞RNA测序数据) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2607 | 2026-02-15 |
GNAL-driven calcium signaling reshapes the spatiotemporal immune landscape in ER+ breast cancer: causal insights and prognostic implications
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1796
PMID:41674994
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和空间转录组学,系统探讨了GNAL在ER+乳腺癌中的生物学功能、分子机制及预后相关性,揭示了其通过钙信号和干细胞样分化调控肿瘤免疫微环境的时空重塑 | 首次系统研究GNAL在ER+乳腺癌中的作用,结合因果推断、单细胞和空间分析,构建了多组学预后模型,并发现GNAL通过MIF-CD74轴招募B细胞 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证GNAL的具体调控机制 | 探究GNAL在ER+乳腺癌内分泌抵抗中的生物学功能、分子机制及预后价值 | ER+乳腺癌患者样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化, 分子对接 | 多组学预后模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | TCGA和GEO队列中的多个患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2608 | 2026-02-15 |
Integrating multi-omic QTLs and predictive models reveals regulatory architectures at immune related GWAS loci in CD4+ T cells
2026-Jan-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.01.27.26344979
PMID:41646693
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和染色质可及性的多组学QTL映射与深度学习预测模型,揭示了CD4+ T细胞中免疫相关GWAS位点的调控架构 | 结合多组学QTL映射与基于染色质可及性训练的深度学习预测模型,系统解析遗传变异的调控效应 | 仅有一小部分经验检测到的molQTLs被预测模型发现,深度学习方法仅覆盖4.7%的GWAS位点 | 解析遗传变异在复杂性状中的调控机制,特别是免疫相关GWAS位点的功能解释 | CD4+ T细胞 | 机器学习 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA-seq, 染色质可及性分析, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞RNA-seq数据, 染色质可及性数据 | 362名捐赠者的CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2609 | 2026-02-15 |
CD8a antibody-functionalized biomimetic red blood cell membrane ectosomes delivering C646 reverse CD8⁺ T Cell exhaustion via H3K18la histone delactylation in gastric cardia adenocarcinoma
2026-Jan-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03957-z
PMID:41612336
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向CD8⁺ T细胞的仿生纳米囊泡,用于递送表观遗传抑制剂C646,以逆转胃贲门腺癌中CD8⁺ T细胞的功能耗竭 | 开发了CD8a抗体功能化的仿生红细胞膜外囊泡(CD8a-NVEs)作为靶向递送平台,并首次揭示了乳酸驱动的H3K18乳酰化(H3K18la)在CD8⁺ T细胞耗竭中的关键作用,以及通过p300抑制剂C646进行表观遗传重编程的新策略 | 研究主要在临床前模型中进行,其安全性和有效性在人体中的验证尚需进一步临床试验 | 通过靶向表观遗传重编程逆转肿瘤微环境中CD8⁺ T细胞的功能耗竭,以增强胃贲门腺癌的免疫治疗效果 | 胃贲门腺癌(GCA)肿瘤微环境中的CD8⁺ T细胞 | 肿瘤免疫学,纳米生物技术 | 胃贲门腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),表观遗传分析 | 仿生纳米递送系统(CD8a-NVEs) | 单细胞转录组数据,体外和体内实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2610 | 2026-02-15 |
Transcriptional signature of induced neurons differentiates virologically suppressed people with HIV from people without HIV
2026-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.190445
PMID:41324907
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研究论文 | 本研究利用参与者来源的直接诱导神经元(iNs)建模HIV感染者的神经元生物学和损伤,通过转录组分析识别出区分病毒抑制的HIV感染者与非感染者的基因特征 | 首次使用iNs模型保留供体年龄和疾病相关特征,揭示了HIV相关神经认知障碍的潜在机制,包括IFI27上调及FOXL2NB-FOXL2-LINC01391表达降低与神经认知损伤的关联 | 样本量较小(仅6名HIV感染者和7名非感染者),且仅基于体外iNs模型,可能无法完全反映体内大脑环境的复杂性 | 探究病毒抑制的HIV感染者神经认知障碍的分子机制 | HIV感染者与非感染者的诱导神经元(iNs) | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,免疫细胞化学,电生理记录 | 诱导神经元(iNs)模型 | 转录组数据,图像数据,电生理数据 | 6名病毒抑制的HIV感染者和7名匹配的非感染者 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 2611 | 2026-02-15 |
Single-cell mapping of human endometrium and decidua reveals epithelial and stromal contributions to fertility
2026-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195254
PMID:41574608
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序绘制了人类子宫内膜和蜕膜的单细胞图谱,揭示了上皮细胞和基质细胞对生育能力的贡献 | 首次在单细胞水平系统表征了月经周期和早期妊娠中子宫内膜的基因表达动态,并鉴定出包含556个基因的腺上皮容受性模块(GERM)特征 | 研究样本量相对有限,且主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证 | 探究人类子宫内膜容受性和胚胎植入的分子机制 | 人类月经周期子宫内膜和早期妊娠蜕膜组织 | 单细胞组学 | 生育障碍 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 未明确具体样本数量,但包含多个女性子宫内膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2612 | 2026-02-15 |
Deciphering the Cellular and Metabolic Landscape of Lymph Node Metastasis in Breast Cancer Using Single-Cell and Spatial Multi-Omics
2026-Jan-22, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.01.002
PMID:41580234
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间多组学技术,解析了乳腺癌淋巴结转移的细胞和代谢景观 | 构建了转移灶的单细胞图谱,识别了早期播散癌细胞亚群,揭示了代谢重编程和免疫调节在恶性转化中的作用,并通过计算药物重定位识别了潜在治疗靶点 | 样本量相对有限(78个原发肿瘤及配对淋巴结转移样本),且空间转录组学验证仅基于四个转移淋巴结组织切片 | 阐明乳腺癌淋巴结转移的细胞组成、信号网络和分子机制 | 乳腺癌原发肿瘤及其配对的淋巴结转移样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组学数据 | 78个原发乳腺癌肿瘤及其配对淋巴结转移样本,以及四个转移淋巴结组织切片 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2613 | 2026-02-15 |
Identification and verification of SPP1 in anoikis as a prognostic biomarker for intestinal metaplasia and gastric cancer
2026-Jan-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-36714-9
PMID:41559138
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研究论文 | 本研究探讨了失巢凋亡相关基因SPP1在肠化生和胃癌中的表达、免疫学作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次将SPP1与肠化生/胃癌关联,并整合多组学分析、单细胞RNA测序及体外实验验证其在肿瘤进展和免疫微环境中的作用 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏大规模临床队列验证,免疫治疗相关性需进一步研究 | 探索SPP1在肠化生至胃癌进展中的表达特征、免疫学功能及其作为预后生物标志物的价值 | 胃癌、肠化生组织样本及细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, Western blot | Cox比例风险回归, ROC曲线分析, WGCNA, ceRNA网络 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质印迹数据 | 32例人体组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2614 | 2026-02-15 |
Single-cell profiling of immunogenic cell death in melanoma reveals prognostic signatures and therapeutic targets
2026-Jan-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04406-5
PMID:41543608
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研究论文 | 本研究通过整合批量转录组数据和单细胞RNA测序数据,开发了一个基于免疫原性细胞死亡的预后模型,并探讨了其在黑色素瘤中的临床相关性 | 首次在黑色素瘤中整合批量与单细胞数据构建基于ICD的预后模型,并识别出MYO10作为关键基因与免疫逃逸相关 | 研究主要依赖于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性队列验证,且单细胞数据样本来源有限 | 研究免疫原性细胞死亡在黑色素瘤中的作用,开发预后模型并探索治疗靶点 | 黑色素瘤患者样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 来自TCGA、GEO和GSE215120的多个队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2615 | 2026-01-18 |
Neighborhood nonnegative matrix factorization identifies patterns and spatially-variable genes in large-scale spatial transcriptomics data
2026-Jan-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03846-6
PMID:41546049
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2616 | 2026-01-18 |
Single-cell sequencing-based analysis of CD4 + T-cell and B-cell heterogeneity in patients with lupus nephritis
2026-Jan-15, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02277-3
PMID:41540405
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2617 | 2026-02-15 |
Analysis of cranial tenocyte heterogeneity reveals a role for Wnt signaling in tendon attachments
2026-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205047
PMID:41582829
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析斑马鱼胚胎头部结缔组织,揭示了肌腱细胞在胚胎发育过程中的空间和功能异质性,并确定了Wnt信号在肌腱附着模式形成中的作用 | 首次在胚胎发育中识别出肌腱细胞和韧带细胞的亚群,并发现Wnt信号通路在肌腱附着模式形成中的新功能 | 研究基于斑马鱼胚胎模型,结果在哺乳动物或人类中的适用性需进一步验证 | 探究肌腱和韧带发育的遗传机制,特别是肌腱细胞异质性和附着模式的形成 | 斑马鱼胚胎头部的结缔组织,包括肌腱细胞和韧带细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),组合原位分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,原位表达数据 | 斑马鱼胚胎头部结缔组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2618 | 2026-02-15 |
Recent Advances in Single-Cell Analysis of Atherosclerotic Plaque Biology
2026-Jan-15, JMA journal
IF:1.5Q2
DOI:10.31662/jmaj.2025-0397
PMID:41676784
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在动脉粥样硬化斑块生物学研究中的最新进展,揭示了斑块内免疫细胞的异质性和空间组织 | 利用单细胞和空间转录组学技术,首次在动脉粥样硬化斑块中识别出多种先前未知的免疫细胞亚群(如TREM2泡沫样巨噬细胞亚群和CD163巨噬细胞亚群,包括血红蛋白刺激的巨噬细胞[M(Hb)]表型),并揭示了斑块内免疫细胞的空间特异性炎症生态位和纤维帽动态 | 本文为综述文章,未直接进行实验研究,因此未涉及具体的技术平台或样本量细节,且依赖于现有研究的局限性 | 总结单细胞和空间转录组学技术在动脉粥样硬化斑块生物学研究中的应用,以推动对动脉粥样硬化发病机制的理解和精准免疫治疗策略的开发 | 动脉粥样硬化斑块,特别是斑块内的免疫细胞(如巨噬细胞和T细胞) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2619 | 2026-02-15 |
Unveiling personalised targets of PD-1 blockade hyperprogression in a cervical adenocarcinoma via longitudinal single-cell and spatial monitoring
2026-Jan-13, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01270-4
PMID:41530529
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研究论文 | 本研究通过纵向单细胞和空间转录组学分析,揭示了一例宫颈腺癌患者在PD-1阻断治疗后出现超进展疾病的个性化分子机制 | 首次在单个宫颈腺癌病例中,通过纵向整合单细胞RNA测序、T细胞受体分析和空间转录组学,实时揭示了PD-1阻断后超进展疾病的适应性机制,并提出了LAG3和IGF1R作为潜在治疗靶点 | 研究仅基于单个病例,结果需要更大样本量的队列研究进行验证 | 探究宫颈腺癌患者对PD-1免疫检查点抑制剂产生超进展反应背后的分子和细胞机制 | 一例接受抗PD-1免疫治疗后出现超进展疾病的宫颈腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体分析, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 1例宫颈腺癌患者(纵向监测) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2620 | 2026-02-15 |
Using Spatial Transcriptomics to Identify a Diagnostic Molecular Signature Associated with Reversible Dental Pulpitis
2026-Jan-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7955718/v1
PMID:41646399
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析牙髓炎样本,旨在识别与可逆性牙髓炎相关的诊断性分子特征,以改进牙髓状态的分类和诊断 | 首次应用空间转录组学(Visium-CytAssist-V2)于牙髓组织,揭示了可逆与不可逆牙髓炎之间共享的分子特征,并强调了免疫-成纤维细胞相互作用在疾病进展中的关键作用 | 样本量较小(仅4个牙髓组织),可能限制结果的普遍性和统计效力 | 研究牙髓炎的转录组谱,识别炎症亚型,并改进传统的可逆/不可逆分类框架 | 人类牙髓组织,包括健康牙髓、可逆性牙髓炎和不可逆性牙髓炎样本 | 数字病理学 | 牙髓炎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 4个牙髓组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium-CytAssist-V2 |