单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 26021 - 26040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26021 | 2024-08-09 |
Dissecting the heterogeneity of DENV vaccine-elicited cellular immunity using single-cell RNA sequencing and metabolic profiling
2019-08-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-11634-7
PMID:31413301
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和代谢分析技术，探讨登革病毒疫苗引发的细胞免疫异质性 | 首次通过单细胞RNA测序和TCR克隆型纵向分析，识别出急性激活和克隆扩增的T细胞特有的转录特征，这些特征与记忆前体CD8 T细胞的持久性相关 | NA | 揭示登革病毒疫苗引发的T细胞免疫的分子机制 | 登革病毒疫苗引发的T细胞免疫 | 疫苗学 | 登革热 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 26022 | 2024-08-09 |
m6A RNA Methylation Maintains Hematopoietic Stem Cell Identity and Symmetric Commitment
2019-08-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.07.032
PMID:31412241
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研究论文 | 本研究探讨了m6A RNA甲基化在维持造血干细胞身份和对称分化中的作用 | 首次揭示了m6A RNA甲基化在控制造血干细胞对称分化中的具体机制 | NA | 研究m6A RNA甲基化如何影响造血干细胞的对称分化 | 造血干细胞及其对称分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自对照组和Mettl3条件敲除小鼠的造血干细胞和祖细胞 |
| 26023 | 2024-08-09 |
BERMUDA: a novel deep transfer learning method for single-cell RNA sequencing batch correction reveals hidden high-resolution cellular subtypes
2019-08-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1764-6
PMID:31405383
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研究论文 | 本文介绍了一种名为BERMUDA的新型深度迁移学习方法，用于单细胞RNA测序数据的批次效应校正，揭示了隐藏的高分辨率细胞亚型 | BERMUDA通过深度自编码器基于迁移学习的方法，有效结合不同批次的scRNA-seq数据，增强生物信号 | NA | 利用单细胞RNA测序技术识别细胞谱系和真实转录信号，通过整合多实验数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度自编码器 | 基因表达数据 | 多个模拟和真实scRNA-seq数据集 |
| 26024 | 2024-08-09 |
Biological Significance of Tumor Heterogeneity in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2019-Aug-12, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers11081156
PMID:31409002
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综述 | 本文综述了食管鳞状细胞癌（ESCC）的肿瘤异质性及其分子特征，重点讨论了基因组异常及其对癌症进化轨迹的功能贡献 | 介绍了单细胞测序和三维类器官等新型实验工具在理解肿瘤异质性方面的应用 | NA | 探讨肿瘤异质性的机制及其在开发食管鳞状细胞癌精准治疗中的潜力 | 食管鳞状细胞癌的肿瘤异质性 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 26025 | 2024-08-09 |
Mono- and multi-nucleated ventricular cardiomyocytes constitute a transcriptionally homogenous cell population
2019-08-09, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-019-0744-z
PMID:31399804
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了单核和多核成年心肌细胞的转录组特征，并探讨了在压力诱导的心脏肥大条件下心肌细胞的异质性 | 首次揭示了单核和多核心肌细胞在转录水平上的高度相似性，并阐明了心脏肥大过程中由于血管生长不均导致的细胞异质性 | 研究中非图像质量控制允许包含受损心肌细胞，导致人工细胞簇的形成，表明需要严格的排除标准 | 确定单核和多核成年心肌细胞的转录组特征，并研究在基础条件和压力诱导的心脏肥大中心肌细胞的异质性 | 单核和多核成年心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自健康和肥大心脏的单核和多核心肌细胞 |
| 26026 | 2024-08-09 |
High-dimensional analysis reveals a pathogenic role of inflammatory monocytes in experimental diffuse alveolar hemorrhage
2019-08-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.129703
PMID:31391335
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研究论文 | 本文通过高维分析揭示了炎症性单核细胞在实验性弥漫性肺泡出血中的致病作用 | 首次通过高维分析和单细胞RNA测序揭示了炎症性单核细胞在弥漫性肺泡出血中的关键作用，并发现干扰素调节因子8在疾病发展中的重要性 | NA | 探究弥漫性肺泡出血的病理生理机制及潜在治疗靶点 | 炎症性单核细胞在弥漫性肺泡出血中的作用 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮相关并发症 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用小鼠模型进行研究 |
| 26027 | 2024-08-09 |
Landscape of Intercellular Crosstalk in Healthy and NASH Liver Revealed by Single-Cell Secretome Gene Analysis
2019-08-08, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2019.07.028
PMID:31398325
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康和非酒精性脂肪肝（NASH）小鼠肝脏中非实质细胞的细胞间通讯网络 | 揭示了肝脏中细胞间信号传递的全局景观，并发现了NASH相关巨噬细胞（NAMs）和肝星状细胞（HSCs）在疾病中的新作用 | NA | 阐明健康和NASH状态下肝脏细胞间通讯的全球景观 | 健康和NASH小鼠肝脏中的非实质细胞 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康和NASH小鼠肝脏样本 |
| 26028 | 2024-08-09 |
Locally renewing resident synovial macrophages provide a protective barrier for the joint
2019-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1471-1
PMID:31391580
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研究论文 | 本文通过命运图谱、三维光片荧光显微镜和单细胞RNA测序技术，全面分析了健康和炎症关节中巨噬细胞亚群的组成、起源和分化，并研究了这些巨噬细胞在关节炎中的作用 | 发现了一种由CXCR1组织驻留巨噬细胞组成的动态膜状结构，这些巨噬细胞在滑膜衬里形成内部免疫屏障，通过紧密连接介导的盾牌限制炎症反应 | NA | 研究巨噬细胞在炎症性关节疾病中的确切起源和作用 | 健康和炎症关节中的巨噬细胞亚群 | NA | 风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 26029 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Transcriptome Helps Define the Limbal/Corneal Epithelial Stem/Early Transit Amplifying Cells and How Autophagy Affects This Population
2019-08-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.19-27656
PMID:31419300
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research paper | 利用单细胞RNA测序技术研究了野生型和自噬缺陷小鼠的角膜/结膜上皮干细胞及其早期过渡放大细胞，并探讨了自噬对这些细胞群体的影响 | 通过单细胞RNA测序技术，首次揭示了角膜/结膜上皮细胞的多个亚群及其分子特征，并发现了新的干细胞/早期过渡放大细胞调控因子 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人类样本中验证这些发现 | 探索角膜/结膜上皮干细胞及其早期过渡放大细胞的分子特征，并研究自噬对这些细胞群体的影响 | 野生型和自噬缺陷小鼠的角膜/结膜上皮细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | t-分布随机邻域嵌入 | 基因表达数据 | 野生型和beclin 1缺陷（beclin1+/-）小鼠的眼部前段组织 |
| 26030 | 2024-08-09 |
The single-cell sequencing: new developments and medical applications
2019, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-019-0314-y
PMID:31391919
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术的最新进展及其在肿瘤学、微生物学、神经学、生殖学、免疫学、消化系统和泌尿系统中的应用 | 介绍了单细胞测序技术在多个医学领域的最新应用 | NA | 探讨单细胞测序技术在医学领域的应用 | 单细胞的基因组、转录组及其他多组学特征 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组等多组学数据 | NA |
| 26031 | 2024-08-09 |
Growth Hormone Promotes in vitro Maturation of Human Oocytes
2019, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2019.00485
PMID:31396155
|
研究论文 | 本研究探讨了生长激素（GH）在体外成熟（IVM）人卵母细胞中的作用 | 首次系统研究了生长激素在人卵母细胞IVM中的应用，并通过单细胞RNA测序分析了其对基因表达的影响 | 研究仅限于特定的生长激素浓度和特定的人卵母细胞样本 | 提高人卵母细胞体外成熟的成功率 | 人卵母细胞及其在体外成熟过程中的基因表达 | 生殖医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了不同浓度的生长激素处理的人卵母细胞样本 |
| 26032 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of T Cells
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9728-2_16
PMID:31396939
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研究论文 | 本文提供了一个实验和计算工作流程，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析T细胞 | 介绍了使用scRNA-seq技术研究T细胞异质性的新途径，并讨论了其在T细胞生物学中的未来方向 | 讨论了当前方法在T细胞生物学中的局限性 | 探索T细胞的异质性，并提供一个可重现的生物信息学管道 | T细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从基于板的排序T细胞中提取的数据，使用流式细胞术和全长转录组协议如Smart-Seq2 |
| 26033 | 2024-08-09 |
A Gene Rank Based Approach for Single Cell Similarity Assessment and Clustering
2021 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2019.2931582
PMID:31369384
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研究论文 | 本文介绍了一种基于基因排序的单细胞相似性评估和聚类方法BioRank | BioRank是一种新的细胞相似性评估方法，基于注释基因集和基因排序，能够更好地进行单细胞聚类 | scRNA-seq数据分析面临高噪声、高维度和稀疏性的挑战，且多个潜在因素对基因表达异质性和细胞类型识别能力的影响尚不明确 | 旨在克服scRNA-seq数据分析中的挑战，准确识别不同的细胞类型 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 12个公共scRNA-seq数据集 |
| 26034 | 2024-08-09 |
ACTINN: automated identification of cell types in single cell RNA sequencing
2020-01-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz592
PMID:31359028
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ACTINN的自动化细胞类型识别方法，该方法使用具有三个隐藏层的神经网络，通过预定义细胞类型的数据集进行训练，并基于训练参数预测其他数据集的细胞类型 | ACTINN采用神经网络自动识别细胞类型，避免了传统方法中的人工查找和标记物不足的问题 | NA | 开发一种自动化的细胞类型识别方法，以改进单细胞RNA测序中的细胞类型分配 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 神经网络 | 文本 | 包括小鼠细胞类型图谱（Tabula Muris Atlas）和人类免疫细胞数据集 |
| 26035 | 2024-08-09 |
VirtualCytometry: a webserver for evaluating immune cell differentiation using single-cell RNA sequencing data
2020-01-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz610
PMID:31373613
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研究论文 | 介绍了一个名为VirtualCytometry的网络计算平台，用于利用单细胞RNA测序数据评估免疫细胞分化 | 利用单细胞RNA测序数据，通过细胞间基因表达的变异来识别不同功能状态的细胞亚群，从而更全面地理解免疫细胞分化 | NA | 开发一种新的分析方法，用于研究免疫细胞分化 | 免疫细胞分化过程中的细胞亚群和关键信号分子及转录因子 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过226个单细胞RNA测序数据集，涵盖正常和疾病组织中的多种人和小鼠免疫细胞类型 |
| 26036 | 2024-08-09 |
Human kidney organoids: progress and remaining challenges
2019-10, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-019-0176-x
PMID:31383997
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research paper | 本文综述了人类肾脏类器官的研究进展及其面临的挑战 | 成功使用肾脏类器官模拟肾小球和肾小管疾病，并利用单细胞RNA测序技术识别了多种细胞类型 | 类器官的成熟度是一个主要挑战，需要更详细的单细胞水平分析 | 研究正常和疾病状态下人类肾脏的发育 | 人类肾脏类器官及其在疾病模型中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多种细胞类型 |
| 26037 | 2024-08-09 |
Targeted sequencing aids in identifying clonality in chronic myelomonocytic leukemia
2019-09, Leukemia research
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.leukres.2019.106190
PMID:31377458
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研究论文 | 本研究通过分子和细胞遗传学分析以及单细胞测序技术，探讨了慢性粒单核细胞白血病（CMML）中克隆性的鉴定 | 首次在韩国CMML患者中使用单细胞测序技术，发现与先前在白种人研究中不同的突变频率和类型 | 研究样本仅限于韩国患者，可能限制了结果的普遍性 | 确定CMML的克隆性，并探讨其分子和细胞遗传学特征 | 慢性粒单核细胞白血病患者 | 数字病理学 | 血液疾病 | 靶向测序 | NA | 基因数据 | 35名CMML患者，41份骨髓样本，2例单细胞分析 |
| 26038 | 2024-08-09 |
SingleCellNet: A Computational Tool to Classify Single Cell RNA-Seq Data Across Platforms and Across Species
2019-08-28, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2019.06.004
PMID:31377170
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研究论文 | 介绍了一种名为SingleCellNet的计算工具，用于跨平台和跨物种的单细胞RNA-seq数据分类 | SingleCellNet能够定量地利用其他单细胞RNA-seq研究数据，提高了分类的敏感性和特异性，并能跨平台和跨物种进行分类 | NA | 开发一种新的工具来改进单细胞RNA-seq数据的分类 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 26039 | 2024-08-09 |
Immuno-PET identifies the myeloid compartment as a key contributor to the outcome of the antitumor response under PD-1 blockade
2019-08-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1905005116
PMID:31375632
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研究论文 | 研究使用免疫正电子发射断层扫描（immuno-PET）和单细胞RNA测序技术，探讨了PD-1阻断治疗下MC38结肠直肠小鼠腺癌模型中肿瘤内CD8 T细胞和CD11b髓系细胞的动态分布及其与治疗反应的关系 | 首次通过immuno-PET和单细胞RNA测序技术，揭示了PD-1阻断治疗对肿瘤内髓系细胞的影响，并发现CD11b髓系细胞的分布变化可作为评估抗PD-1治疗效果的生物标志物 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证这些发现 | 探讨PD-1阻断治疗对肿瘤内免疫细胞分布的影响及其与治疗反应的关系 | MC38结肠直肠小鼠腺癌模型中的CD8 T细胞和CD11b髓系细胞 | 数字病理学 | 结肠直肠癌 | 免疫正电子发射断层扫描（immuno-PET），单细胞RNA测序 | NA | 图像，RNA | 小鼠模型中的肿瘤样本 |
| 26040 | 2024-08-09 |
Circulating Tumour Cell Biomarkers in Head and Neck Cancer: Current Progress and Future Prospects
2019-Aug-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers11081115
PMID:31387228
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综述 | 本文综述了头颈癌中循环肿瘤细胞（CTCs）作为生物标志物的当前进展和未来前景 | 介绍了微流控技术在CTC分离中的应用，以及单细胞测序在识别可操作突变和基因表达特征中的潜力 | CTC分离方法的标准化和下游分析仍是一个主要障碍 | 探讨CTC作为生物标志物在头颈癌治疗决策中的应用，以改善患者预后并实现个性化治疗 | 头颈癌中的循环肿瘤细胞及其生物标志物 | 数字病理学 | 头颈癌 | 微流控技术，单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |