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当前共找到 37711 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-03-21 |
Reconstructing single-cell resolution from spatial transcriptomics with CellRefiner
2026-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70090-2
PMID:41760664
|
研究论文 | 本文提出了一种基于物理模型的方法CellRefiner，通过整合单细胞数据集与配对的空间数据集，在空间数据中重建单细胞分辨率 | CellRefiner首次将细胞建模为通过力连接的粒子，并利用空间邻近约束、基因表达相似性和细胞间配体-受体相互作用优化细胞位置，从而从非单细胞分辨率空间数据中重建单细胞分辨率 | NA | 开发一种方法以从空间转录组数据中重建单细胞分辨率，以支持需要个体细胞分辨率和空间信息的下游分析 | 空间转录组数据，包括Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2和STARmap数据集，以及小鼠皮层和淋巴结组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 物理模型 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 多种模拟和真实数据集，包括Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2和STARmap数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 10x Visium | NA |
| 242 | 2026-03-21 |
The splenic norepinephrine-β2-adrenergic receptor axis aggravates sepsis-associated acute kidney injury via neutrophil-mediated immunosuppression
2026-Feb-20, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.01.024
PMID:41724376
|
研究论文 | 本研究揭示了脾脏去甲肾上腺素-β2-肾上腺素能受体轴通过中性粒细胞介导的免疫抑制加剧脓毒症相关急性肾损伤的机制 | 首次明确了脾脏神经免疫调节在脓毒症相关急性肾损伤中的具体作用机制，特别是NE/β2-AR信号通过cAMP反应元件结合蛋白途径增强中性粒细胞前列腺素E2合成，从而抑制Th1细胞活化的新通路 | 研究主要基于小鼠盲肠结扎穿孔模型，临床转化价值需进一步验证；机制研究集中在脾脏局部，全身性神经免疫相互作用的贡献未充分探讨 | 阐明脾脏神经免疫调节在脓毒症相关急性肾损伤发生发展中的作用机制 | 小鼠（包括脾神经切断、脾内持续输注、中性粒细胞特异性Adrb2敲除等模型） | 免疫学 | 脓毒症相关急性肾损伤 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 243 | 2026-03-21 |
Chronic inflammation promotes gastric cancer progression via ADAM10-mediated cleavage of CX3CL1
2026-Feb-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39743-6
PMID:41691064
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研究论文 | 本研究探讨了慢性炎症通过ADAM10介导的CX3CL1切割促进胃癌进展的分子机制 | 揭示了慢性炎症通过上调ADAM10表达，将膜结合型CX3CL1转化为可溶性形式，从而激活ADAM10/CX3CL1轴促进胃癌进展的新机制 | 研究主要基于小鼠皮下异种移植模型和体外细胞实验，缺乏更接近人体生理环境的体内模型验证 | 探究慢性炎症对胃癌进展的影响及其分子机制 | 胃癌细胞、615品系小鼠、胃癌组织样本 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、ELISA、qRT-PCR、Western blot、免疫荧光染色 | 小鼠皮下异种移植模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及小鼠模型、胃癌细胞系和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2026-03-21 |
PreTSA: computationally efficient modeling of temporal and spatial gene expression patterns
2026-Feb-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03994-3
PMID:41673899
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为PreTSA的计算方法，用于高效建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时空基因表达模式 | PreTSA在保持与现有先进方法结果一致的同时，显著减少了计算时间，为研究超大规模数据集中的基因表达模式提供了独特解决方案 | NA | 开发一种计算高效的方法来建模单细胞和空间转录组数据中的时空基因表达模式 | 单细胞和空间转录组数据，包含数百万个细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 245 | 2026-03-21 |
Development and validation of an oxidative phosphorylation based prognostic model revealing tumor progression and immune microenvironment in lung adenocarcinoma
2026-Feb-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04478-3
PMID:41670771
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于氧化磷酸化的预后模型，用于揭示肺腺癌的肿瘤进展和免疫微环境 | 首次构建了基于氧化磷酸化相关基因的预后模型，并揭示了UQCC3⁺和RAB5IF⁺上皮细胞通过TGF-β和Galectin信号通路促进恶性增殖和免疫抑制的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床验证 | 开发肺腺癌的预后模型并探索氧化磷酸化在肿瘤进展中的作用机制 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA数据集作为发现队列，多个GEO数据集作为独立验证队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 246 | 2026-02-13 |
Spatial transcriptomics and single-cell analyses reveal the role of the cisplatin-resistant gene panel in NSCLC progression and the tumor microenvironment, identifying LOXL2 as a potential therapeutic target
2026-Feb-11, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04170-0
PMID:41673658
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2026-03-21 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals immunological mechanisms by which recombinant Echinococcus granulosus P29 protein alleviates airway inflammation in mice with allergic asthma
2026-Feb-11, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-026-07256-w
PMID:41673792
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了重组细粒棘球绦虫P29蛋白缓解小鼠过敏性哮喘气道炎症的免疫机制 | 首次使用单细胞转录组测序结合实验方法探究rEg.P29在过敏性哮喘中的免疫调节作用，并识别了新的Treg细胞亚群Lag3+Tnfrsf9+ Treg | 研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类样本，且机制细节需进一步验证 | 探究rEg.P29如何缓解过敏性哮喘小鼠的气道炎症及其免疫机制 | 过敏性哮喘小鼠模型 | 数字病理学 | 过敏性哮喘 | 单细胞转录组测序, 流式细胞术, 酶联免疫吸附试验, 细胞因子微球阵列 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 流式细胞数据, 血清学数据 | 小鼠肺组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 248 | 2026-03-21 |
TCF21-WNT5A axis drives metastasis of colorectal cancer via stromal-tumor cell communication
2026-Feb-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07835-6
PMID:41673874
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了TCF21-WNT5A轴通过基质-肿瘤细胞通讯驱动结直肠癌转移的分子机制 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，系统性地识别了与结直肠癌肝转移相关的12个关键基因，并阐明了TCF21通过调控WNT5A促进转移的新机制 | 研究主要基于公共数据库数据和细胞系实验，缺乏大规模临床队列验证和体内功能实验的深入证实 | 解析结直肠癌肝转移的分子机制，寻找新的治疗靶点 | 结直肠癌组织（正常组织、原发肿瘤、转移灶）和HCT116细胞系 | 计算生物学 | 结直肠癌 | scRNA-seq, Bulk RNA-seq, 机器学习 | 机器学习（未指定具体模型） | 基因表达数据 | 从GEO数据库收集的scRNA-seq和Bulk RNA-seq数据，以及临床样本和HCT116细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 249 | 2026-02-11 |
Mitochondrial DNA methylation predicts immunotherapy response and prognosis in lung adenocarcinoma: evidence from scRNA-Seq and machine learning
2026-Feb-10, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15648-5
PMID:41663976
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 250 | 2026-03-21 |
Mapping Whole-Organism Genetic Comorbidities Across Model Species Using Unified Ontologies
2026-Feb-10, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyag038
PMID:41664592
|
研究论文 | 本文提出了一种基于统一本体的计算方法，用于分析与非梗阻性无精子症（NOA）相关基因的全生物体共病模式，并揭示其跨物种的遗传共病机制 | 开发了一个整合新生殖表型本体与标准化全身表型类别的统一跨物种表型结构框架，支持直接跨物种比较，并创建了CoMorbidity DataBase Mapper（CoMo DBM）资源 | 研究依赖于模型生物数据库中的基因型-表型关联数据，可能受数据完整性和准确性限制，且跨物种映射可能忽略物种特异性差异 | 识别非梗阻性无精子症（NOA）基因的全生物体共病模式，并探索其跨物种的遗传共病机制 | 204个经实验验证的小鼠精子发生失败基因，及其在人类、小鼠、斑马鱼、果蝇和线虫中的直系同源基因和表型注释 | 生物信息学 | 男性不育症 | 单细胞RNA-seq，基因本体注释，跨物种表型映射 | NA | 基因型-表型关联数据，基因表达数据 | 204个小鼠基因及其跨物种直系同源基因 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 251 | 2026-03-21 |
DANST enables cell-type deconvolution in spatial transcriptomics using deep domain adversarial neural networks
2026-Feb-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09659-y
PMID:41663685
|
研究论文 | 本研究提出了一个基于深度域对抗神经网络的细胞类型反卷积框架DANST，用于从空间转录组学数据中恢复细胞类型比例 | 首次将深度域对抗神经网络应用于空间转录组学反卷积，通过变分自编码器学习精细特征表示，并利用域对抗架构对齐伪空间数据与真实数据的特征分布 | 未在论文摘要中明确说明 | 开发高精度的空间转录组学细胞类型反卷积方法 | 人类和小鼠的空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 肿瘤微环境分析 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学 | 深度域对抗神经网络，变分自编码器（VAE） | 基因表达数据，空间坐标数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 252 | 2026-03-21 |
Hepatic stellate cell derived lipid droplets drive protumoral M2 macrophage polarization in hepatocellular carcinoma
2026-Feb-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04626-9
PMID:41663693
|
研究论文 | 本研究揭示了在慢性肝损伤中，活化的肝星状细胞通过释放脂滴被肝巨噬细胞内吞，诱导其M2极化，从而促进肝细胞癌发展的新机制 | 首次发现活化的肝星状细胞释放的脂滴可作为直接代谢信号诱导肝巨噬细胞M2极化，并促进肝细胞癌生长，提出了一种新的HSC-巨噬细胞串扰机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床相关性仅通过TCGA数据库分析验证，缺乏直接的患者样本功能验证 | 探究肝星状细胞脂滴在慢性肝损伤中的命运及其对肝巨噬细胞表型和肝细胞癌发展的影响 | 肝星状细胞、肝巨噬细胞、肝细胞癌 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、透射电子显微镜、流式细胞术、梯度离心、TCGA数据分析 | NA | 基因表达数据、图像数据、临床数据 | C57BL/6小鼠（慢性肝损伤模型）、TCGA-LIHC队列患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 253 | 2026-03-21 |
Ex vivo long-term expansion of human hematopoietic stem and progenitor cells as a tool for modeling vector integration sites and clonality
2026-Feb-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07700-6
PMID:41654907
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用小分子APU（A83-01、pomalidomide和UM171）在体外长期扩增人类造血干细胞和祖细胞（HSPCs）的方法，旨在通过整合位点分析（ISA）评估逆转录病毒载体（RVs）的基因毒性风险，并模拟基因治疗中的克隆性动态 | 首次利用APU小分子组合实现人类HSPCs的体外长期扩增和培养，结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和异种移植研究，建立了一种新型的体外模型来预测插入突变和克隆性变化，为基因治疗的安全性评估提供了新工具 | 研究主要基于脐带血来源的HSPCs，可能不适用于其他来源的干细胞；体外模型与体内环境的差异可能影响结果的直接转化；样本量相对有限，需要进一步验证 | 评估基因治疗中逆转录病毒载体的基因毒性风险，开发一种基于人类HSPCs的体外模型来预测插入突变和克隆性动态 | 人类造血干细胞和祖细胞（HSPCs），特别是脐带血来源的CD34+CD38-CD45RA-CD90+EPCR+细胞 | 基因治疗与干细胞研究 | 单基因疾病（如通过基因治疗治疗的疾病） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、整合位点分析（ISA）、异种移植研究 | 体外细胞培养模型 | 单细胞RNA测序数据、整合位点分析数据 | 未明确指定具体样本数量，但涉及脐带血来源的HSPCs和异种移植小鼠的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2026-03-21 |
scLong: a billion-parameter foundation model for capturing long-range gene context in single-cell transcriptomics
2026-02-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69102-y
PMID:41639087
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研究论文 | 本文介绍了scLong，一个基于48百万细胞预训练的十亿参数基础模型，旨在通过自注意力机制捕获单细胞转录组学中所有基因（包括低表达基因）的长程依赖关系，并整合基因本体知识以提升基因功能理解 | scLong是首个在单细胞转录组学中应用自注意力于全部28,000个人类基因的基础模型，能够处理包括低表达和未表达基因在内的长程基因依赖，并整合了基因本体知识以增强上下文理解 | 未明确提及模型的计算资源需求、泛化能力到其他物种或数据类型的限制，以及在实际临床应用中可能面临的挑战 | 开发一个能够捕获单细胞转录组数据中长程基因依赖关系并整合外部知识的基础模型，以提升对细胞异质性、基因调控和疾病响应的分析能力 | 单细胞RNA测序数据，涵盖48百万个细胞和28,000个人类基因 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 基础模型（基于自注意力和图卷积网络） | 基因表达数据 | 48百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 255 | 2026-03-21 |
FLASH-MM: fast and scalable single-cell differential expression analysis using linear mixed-effects models
2026-02-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69063-2
PMID:41644528
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研究论文 | 本文介绍了一种快速且可扩展的线性混合效应模型估计算法FLASH-MM，用于单细胞RNA测序数据的差异表达分析 | 通过重新设计线性混合模型估计过程，降低了计算复杂度和内存使用，实现了快速且可扩展的差异表达分析 | NA | 解决单细胞差异表达分析中面临的样本相关性、个体变异和可扩展性等挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性混合效应模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 256 | 2026-03-21 |
Tumour-intrinsic features shape T cell differentiation through precursor to symptomatic multiple myeloma
2026-02-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68718-4
PMID:41644568
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤患者骨髓和血液样本，揭示了肿瘤内在特征如何影响T细胞分化，并预测疾病进展 | 首次在多发性骨髓瘤中证明T细胞分化由抗原驱动而非耗竭，并发现肿瘤负荷和抗原呈递基因表达等内在特征影响此过程 | 研究未详细探讨治疗干预对T细胞动力学的长期影响，且样本来源可能受限于特定患者群体 | 探究多发性骨髓瘤中T细胞分化的机制及其在疾病进展中的作用 | 多发性骨髓瘤患者、前驱条件患者及非癌症对照的骨髓和血液样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自多发性骨髓瘤、前驱条件和非癌症对照患者的大型骨髓和血液样本数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 257 | 2026-03-21 |
Indolent primary cutaneous B-cell lymphomas resemble persistent antigen reactions without signs of dedifferentiation
2026-02-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69210-9
PMID:41639106
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析惰性原发性皮肤B细胞淋巴瘤（pcMZL和pcFCL）与侵袭性pcDLBCL-LT的差异，揭示其病理生理基础 | 首次在单细胞水平上比较惰性与侵袭性皮肤B细胞淋巴瘤，并发现惰性淋巴瘤中持续存在的生发中心反应 | 研究中未知抗原的具体身份尚未确定，样本来源可能有限 | 阐明原发性皮肤B细胞淋巴瘤的病理生理机制和分类依据 | 原发性皮肤滤泡中心淋巴瘤（pcFCL）、原发性皮肤边缘区淋巴瘤（pcMZL）、原发性皮肤弥漫大B细胞淋巴瘤腿型（pcDLBCL-LT）、反应性B细胞丰富淋巴增殖（rB-LP）和胃MALT淋巴瘤 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多种淋巴瘤类型样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 258 | 2026-03-21 |
Atlas-guided discovery of transcription factors for T cell programming
2026-Feb-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09989-7
PMID:41639465
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和表观遗传数据构建了CD8 T细胞状态的综合图谱，并利用体内CRISPR筛选结合单细胞RNA测序技术，揭示了调控T细胞分化的关键转录因子 | 构建了首个整合多组学数据的CD8 T细胞状态图谱，并利用体内Perturb-seq技术系统性鉴定出调控T细胞分化的新转录因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类T细胞的验证数据相对有限 | 系统鉴定调控CD8 T细胞不同分化状态的转录因子，为细胞免疫疗法提供新靶点 | CD8 T细胞，特别是终末耗竭T细胞和组织驻留记忆T细胞 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，表观遗传分析，CRISPR筛选 | NA | 转录组数据，表观遗传数据 | 涵盖九种CD8 T细胞状态 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 259 | 2026-03-21 |
HCMV infection disrupts barrier functions and promotes epithelial-mesenchymal transition in a cholangiocyte organoid model
2026-02-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68962-8
PMID:41634045
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研究论文 | 本研究建立了一个人iPSC来源的胆管样细胞类器官模型，用于探究人巨细胞病毒感染如何破坏胆管上皮屏障功能并促进上皮-间质转化 | 首次利用人iPSC来源的胆管样细胞类器官模型证明HCMV可直接感染胆管上皮，并通过TGF-β信号通路诱导上皮-间质转化 | 研究主要基于体外类器官模型，体内验证仅通过患者组织样本的有限分析，需要进一步在动物模型中验证 | 探究人巨细胞病毒感染对胆管上皮细胞的直接致病机制 | 人iPSC来源的胆管样细胞类器官 | 细胞生物学 | 胆管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 类器官模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量，包括类器官模型和胆道闭锁患者肝组织 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 260 | 2026-03-21 |
Single-Cell RNA Sequencing and Network Pharmacology Reveal the Potential Role of Oxidative Phosphorylation Inactivation in Diagnosing and Treating Chronic Tendon Injuries
2026-02, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.70085
PMID:41610872
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和网络药理学，揭示了氧化磷酸化失活在慢性肌腱损伤诊断和治疗中的潜在作用 | 首次在慢性肌腱损伤中，通过单细胞RNA测序结合网络药理学，系统揭示了氧化磷酸化通路失活与细胞坏死性凋亡增加之间的关联，并提出了靶向该通路的潜在治疗策略 | 研究主要基于测序数据和体外实验，缺乏体内动物模型验证；样本量相对有限；药物作用机制仍需进一步验证 | 探究慢性肌腱损伤的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点和药物 | 来自非损伤和损伤肌腱的肌腱细胞、血管内皮细胞、肌腱源性干细胞、脂肪细胞和神经元 | 单细胞组学 | 慢性肌腱损伤 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确具体样本数量，但涉及非损伤和损伤肌腱的多种细胞类型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |