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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-07-27 |
Correction to "Single-Cell Sequencing Data Revealed Mechanisms of Interactions Between Tumor Cells and Cancer-Associated Fibroblasts in Metastatic Colorectal Cancer"
2026, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/bmri/9847386
PMID:42437566
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2026-07-27 |
Gene expression profiling of recipient immune cells induced by 7 × 19 CAR-T cell dosing in a syngeneic mouse model
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0352813
PMID:42467615
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研究论文 | 通过同基因小鼠模型分析7×19 CAR-T细胞输注后宿主免疫细胞的基因表达谱 | 首次探索7×19 CAR-T细胞通过招募和激活宿主免疫细胞对抗实体瘤的早期机制 | 仅在小鼠模型中研究,未在人类临床样本中验证;仅分析输注后4天的早期反应 | 阐明7×19 CAR-T细胞在实体瘤微环境中通过内源性免疫细胞介导的抗肿瘤机制 | 接受7×19 CAR-T细胞治疗的同基因小鼠模型中的宿主免疫细胞 | 机器学习 | 肿瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, AmpliSeq | NA | 基因表达数据 | C57BL/6N小鼠皮下MC38肿瘤模型,数量未明确 | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | AmpliSeq, 10x Chromium | AmpliSeq用于批量基因表达分析,10x Chromium用于单细胞RNA-seq |
| 243 | 2026-07-27 |
A Potential miR-1246-5p-H3K27ac-NOL12 Regulatory Axis and Its Putative Tumour-Promoting Function in Hepatocellular Carcinoma
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70071
PMID:42480981
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研究论文 | 通过多组学数据分析,探讨miR-1246-5p-H3K27ac-NOL12调控轴在肝细胞癌中的潜在促癌作用 | 首次整合bulk RNA-seq、scRNA-seq、空间转录组学、ChIP-seq和CRISPR筛选等多维度数据,揭示NOL12受miR-1246-5p和H3K27ac修饰增强子调控的机制 | 未明确说明研究局限性 | 分析NOL12在肝细胞癌中的表达模式、临床意义及其受miR-1246-5p和H3K27ac调控的潜在机制 | 肝细胞癌组织样本、非肿瘤肝组织样本及公共数据库中HCC相关转录组数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, ChIP-seq, CRISPR筛选, 免疫组化 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、免疫组化图像、ChIP-seq数据 | 4264例HCC vs 3145例非HCC(bulk RNA-seq);12例HCC样本(scRNA-seq);394对HCC与癌旁组织(IHC) | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, ChIP-seq | Illumina NovaSeq | 公共数据库来源:GEO、TCGA、GTEx;Cistrome DB用于ChIP-seq分析 |
| 244 | 2026-07-27 |
Serum IL2Rα as a Diagnostic Biomarker and Its Functional Interplay With IL-2 in Breast Cancer
2026, The breast journal
DOI:10.1155/tbj/5295439
PMID:42487443
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研究论文 | 本研究探讨了血清IL2Rα作为乳腺癌诊断生物标志物的潜力及其与IL-2的功能相互作用 | 首次系统评估了IL2Rα在乳腺癌中的血清表达、诊断和预后价值,并揭示了IL2RA与IL-2在乳腺癌病理生理中的功能性拮抗关系 | 样本量相对较小,且为单中心回顾性研究,血清IL2Rα的诊断效能仅为中等(AUC=0.650) | 评估血清IL2Rα作为乳腺癌诊断生物标志物的价值,并探究IL-2/IL2RA轴在乳腺癌中的功能作用 | 252例接受乳腺手术的连续患者(99例乳腺癌和153例良性乳腺疾病) | 机器学习 | 乳腺癌 | 电化学发光免疫分析、单细胞测序、RNA-seq | NA | 血清细胞因子数据、单细胞测序数据、转录组数据 | 252例患者(99例乳腺癌,153例良性乳腺疾病) | NA | 单细胞测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 245 | 2026-07-27 |
Single-Cell and Machine Learning Analyses Identify MYDGF as an Immune-Related Biomarker Associated With the Tumor Microenvironment in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/5262666
PMID:42502300
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和机器学习方法,识别MYDGF作为透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中与免疫相关的生物标志物 | 首次将单细胞 profiling、批量多组学和功能验证相结合,系统性揭示MYDGF在ccRCC中的生物学和临床意义,并利用机器学习进行生物标志物发现 | 初步的19基因MYDGF相关预后基因集需进一步验证,且研究主要依赖公共数据集,可能限制结果的普适性 | 探究MYDGF在透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中的免疫相关作用和预后价值 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤组织样本及细胞系 | 计算机视觉 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 批量RNA测序 | LASSO Cox回归 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、临床数据 | GSE156632数据集(scRNA-seq)和TCGA-KIRC数据集(批量转录组及临床数据) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 246 | 2026-07-27 |
Mendelian Randomization and Experimental Validation Identify Key Immune Signatures in Bullous Pemphigoid
2026, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S617562
PMID:42502352
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研究论文 | 通过孟德尔随机化与实验验证,鉴定大疱性类天疱疮的关键免疫特征 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞RNA测序及实验验证,系统评估外周免疫表型与大疱性类天疱疮的因果关联,并鉴定出M-MDSCs、CD16和CD62L等关键免疫特征 | GWAS数据集中的BP病例队列样本量有限,且小鼠模型中未评估CD62L | 探究遗传决定的外周免疫表型与大疱性类天疱疮之间的潜在因果关联 | 大疱性类天疱疮(BP)患者及其免疫表型 | 自然语言处理 | 大疱性类天疱疮 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、eQTL分析、流式细胞术 | NA | 基因型数据、免疫表型数据、单细胞转录组数据 | 731种免疫表型的GWAS数据及BP的GWAS数据(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 247 | 2026-07-27 |
Exploration of the Potential Mechanisms of Yinqiao Powder in Treating Atopic Dermatitis: Integrating Network Pharmacology, Single-Cell, and Bulk RNA Sequencing
2026, Journal of asthma and allergy
IF:3.7Q1
DOI:10.2147/JAA.S592593
PMID:42502642
|
研究论文 | 整合网络药理学、单细胞和批量RNA测序探索银翘散治疗特应性皮炎的潜在机制 | 首次结合网络药理学、单细胞RNA测序和批量RNA测序,系统阐明银翘散治疗特应性皮炎的关键靶点基因和活性成分 | 样本量较小(15名患者和15名健康对照),且研究基于公开数据集和生物信息学分析,缺乏体内外实验验证 | 探究银翘散治疗特应性皮炎的潜在机制,并鉴定其关键靶点基因和活性成分 | 特应性皮炎患者和健康对照的血液样本,以及公开单细胞RNA测序数据(GSE180885) | 网络药理学 | 特应性皮炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | 15名特应性皮炎患者和15名健康对照的血液样本 | Illumina | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 248 | 2026-07-27 |
Integrative Single-Cell RNA Sequencing and Machine Learning Reveals Candidate Plasma Protein-Associated Gene Signatures for Osteoporosis: A Preliminary Exploratory in Silico Study
2026, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S616181
PMID:42502801
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和机器学习,识别骨质疏松症中与血浆蛋白相关的基因标志物JUN和CTSD,并探索其潜在分子机制 | 首次将单细胞RNA测序与高维加权基因共表达网络分析及多种机器学习算法结合,从转录组层面筛选骨质疏松症的血浆蛋白相关基因标志物,并利用分子对接预测潜在药物靶点 | 样本量较小(仅1例患者用于单细胞测序,6例患者和6例对照用于RT-qPCR验证,10例每组用于ELISA),需在更大队列和直接蛋白质组学研究中进一步验证 | 鉴定骨质疏松症中与血浆蛋白相关的生物标志物,并阐明其分子机制 | 骨质疏松症患者和健康对照的外周血淋巴细胞、骨髓间充质干细胞、血清样本 | 机器学习 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序、RT-qPCR、ELISA、分子对接 | 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、机器学习算法 | 基因表达数据(转录组)、蛋白质数据(血浆蛋白) | 1例患者用于单细胞RNA测序探索;6例患者和6例对照用于RT-qPCR验证;10例每组用于ELISA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 249 | 2026-07-27 |
Consensus spectral clustering with weighted similarity functions for single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-16, Communications in statistics: Simulation and computation
DOI:10.1080/03610918.2025.2578269
PMID:42491860
|
研究论文 | 本文探索了一种基于加权相似函数的共识谱聚类方法,用于单细胞RNA测序数据的无监督聚类分析 | 提出了基于随机采样的共识聚类框架与流形谱聚类相结合,并引入测地距离度量和两种加权度量改进相似性核函数,从而提升单细胞RNA-seq数据的聚类性能 | 未说明局限性,但可能存在对数据集变异类型的依赖,且未提及跨平台验证或大规模数据集的可扩展性 | 开发一种有效的无监督聚类算法,以解决单细胞RNA-seq数据的高维度、稀疏性和噪声问题,从而准确识别细胞类型和状态 | 单细胞RNA测序数据集(包含不同变异类型) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 谱聚类(共识聚类框架结合流形谱聚类) | 基因表达数据 | 多个单细胞RNA-seq数据集(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA |
| 250 | 2026-07-27 |
Covariate-moderated Empirical Bayes Matrix Factorization
2025, Advances in neural information processing systems
PMID:42433297
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研究论文 | 提出协变量调节经验贝叶斯矩阵分解方法,可整合多种侧信息以改进矩阵分解 | 提出模块化框架,能处理概率模型或神经网络可处理的任意类型侧信息,并自适应调整先验假设 | 未明确说明局限性 | 提出能整合多种侧信息的矩阵分解新方法 | 空间转录组数据和协同过滤数据 | 机器学习 | NA | NA | 矩阵分解 | 图像、文本、图结构数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 251 | 2026-07-26 |
Millepurpan from Astragali Radix binds condensin SMC2 to reverse microglial cell cycle arrest and metabolic reprogramming in neuroinflammation
2026-Sep-15, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2026.110089
PMID:42314597
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 252 | 2026-07-26 |
Advances in Helicobacter pylori-mediated oncogenic signaling pathways in gastric cancer: From pathological evolution to clinical application prospects (Review)
2026-Sep, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2026.15763
PMID:42500607
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2026-02-26 |
Unraveling CD4+ T cell heterogeneity and cell death-associated genes in high-grade serous ovarian cancer: a comprehensive analysis of single-cell RNA and spatial transcriptome sequencing
2026-Aug, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-026-04266-z
PMID:41735641
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,深入解析了高级别浆液性卵巢癌中CD4+ T细胞的异质性及其与细胞死亡相关基因的关联 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学,系统揭示了HGSOC中CD4+ T细胞的异质性,并构建了基于hdWGCNA的预后模型,同时通过共培养实验验证了MAL基因的功能作用 | 研究样本可能有限,且体外共培养实验可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 | 阐明CD4+ T细胞在高级别浆液性卵巢癌进展中的作用,并识别关键的细胞死亡相关基因 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本中的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qPCR, Western blotting | inferCNV, 伪时间轨迹分析, SCENIC转录调控网络, hdWGCNA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 独立的高级别浆液性卵巢癌队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 254 | 2026-06-18 |
Early-life manganese overexposure induces dysfunction in energy metabolism conversion that leads to disrupted hippocampal neurogenesis in mouse offspring via METTL3-mediated Cdc25b m6A modification
2026-Aug-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142703
PMID:42302365
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研究论文 | 早期锰过量暴露通过METTL3介导的Cdc25b m6A修饰,干扰能量代谢转换,导致小鼠后代海马神经发生异常 | 首次揭示早期锰暴露通过能量代谢转换障碍和METTL3介导的Cdc25b mRNA m6A修饰,导致神经干细胞分化受阻的分子机制 | 未明确能量代谢转换障碍与METTL3修饰之间的直接上下游关系,且仅在动物模型和原代细胞中验证 | 探究早期锰暴露引起海马神经发生异常的分子机制,特别是能量代谢转换与Cdc25b mRNA衰变的关系 | C57BL/6小鼠后代及其原代神经干细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠后代(具体数量未给出)及原代神经干细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 255 | 2026-07-26 |
Integrated analyses of the microbiome, metabolome, and spatial transcriptomics reveal sex-dependent bladder vulnerability to chronic inorganic arsenic
2026-Aug-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142653
PMID:42424946
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 256 | 2026-07-26 |
The Single-Cell Atlas Revolution: Integrating Lineage, Space, and Evolution to Decode Animal Biology
2026-Jul-25, DNA and cell biology
IF:2.6Q2
DOI:10.1177/10445498261460199
PMID:42499312
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 257 | 2026-07-26 |
Distinct systemic and gut IgA responses to bacteria of the human upper gastrointestinal tract
2026-Jul-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117721
PMID:42497062
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 258 | 2026-07-26 |
Periductal Fibroblast Density Defines Lymphocyte Exclusion via a CD44-Dependent Stromal Checkpoint in Pancreatic Cancer
2026-Jul-24, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1481
PMID:42497294
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| 259 | 2026-07-26 |
Ophiopogonin D induced Plet1+ macrophage differentiation to treat acute lung injury through blocking the interaction between NCOR1 and PPARγ
2026-Jul-24, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117173
PMID:42497662
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| 260 | 2026-07-26 |
Longitudinal zone- and cell type-specific pattern-triggered immune responses in Arabidopsis roots
2026-Jul-24, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2026.07.002
PMID:42497852
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