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当前共找到 35811 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-01-29 |
ULMnet: inferring physical cell-cell communication networks from scRNAseq data using univariate linear models
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1722504
PMID:41583424
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研究论文 | 本研究开发了一种名为ULMnet的计算方法，利用单变量线性模型从单细胞RNA测序数据中推断物理细胞间通信网络 | 通过识别scRNAseq中的多重体（尤其是双联体）来推断物理细胞间相互作用，克服了传统方法因组织解离而无法捕获直接接触的局限性 | 方法在预测已知成分的双联体时灵敏度约为56%，虽然精度高（~99%），但灵敏度相对较低，可能漏检部分多重体 | 开发一种计算工具，从scRNAseq数据中推断物理细胞间通信网络，以揭示组织中的直接细胞相互作用 | 单细胞RNA测序数据，包括细胞对、部分解离组织以及健康和癌症组织的常规scRNAseq数据集 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 单变量线性模型 | 单细胞RNA测序数据 | 多个数据集，包括细胞对、部分解离组织以及健康和癌症组织的scRNAseq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 242 | 2026-01-29 |
Liquid-liquid phase separation-driven molecular subtyping and prognostic modeling in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1741979
PMID:41583431
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研究论文 | 本文通过构建与液-液相分离相关的预后模型，对结直肠癌患者进行风险分层并指导个体化治疗策略 | 首次将液-液相分离相关基因应用于结直肠癌的分子亚型分型和预后建模，揭示了LLPS在结直肠癌进展中的作用 | 研究主要基于公共数据集，需要进一步实验验证LLPS机制在结直肠癌中的具体作用 | 探究液-液相分离在结直肠癌进展中的作用并构建预后模型 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 基因表达分析，空间转录组学分析，加权基因共表达网络分析 | Cox回归，LASSO回归，逐步AIC算法 | 基因表达数据，空间转录组数据 | 566个结直肠癌样本和19个正常对照（来自GSE39582数据集），以及COAD、READ和GSE17536验证队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 243 | 2026-01-29 |
Advances in the identification of novel cell signatures in benign prostatic hyperplasia and prostate cancer using single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1684895
PMID:41583437
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在良性前列腺增生和前列腺癌中识别新型细胞亚群和分子标志物的最新进展 | 整合单细胞RNA测序技术解析BPH和PCa中共享的细胞异质性和分子机制，为精准诊断和治疗提供新见解 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要依赖已有研究进行总结，可能受限于当前scRNA-seq技术的分辨率和样本量 | 探讨BPH和PCa的分子发病机制，识别新型细胞亚群和生物标志物以改善临床管理 | 良性前列腺增生和前列腺癌中的前列腺细胞及免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 244 | 2026-01-29 |
Cuproptosis-driven reprogramming of fibroblast communication by GK is associated with the immune microenvironment in diabetic foot ulcers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1687806
PMID:41583446
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了铜死亡相关基因GK在糖尿病足溃疡成纤维细胞-免疫细胞通讯重塑及免疫微环境调控中的关键作用 | 首次将铜死亡与糖尿病足溃疡的成纤维细胞通讯及免疫微环境联系起来，并鉴定GK作为新型诊断生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证，缺乏临床样本的直接功能验证 | 探究铜死亡在糖尿病足溃疡免疫微环境调控中的作用机制 | 糖尿病足溃疡患者的皮肤组织及SD大鼠伤口模型 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, 机器学习, PCR, Western blot | LASSO, SVM-RFE, Random Forest | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 33,095个细胞（质量控制后25,198个），9只SD大鼠（正常/伤口/糖尿病伤口各3只） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 245 | 2026-01-29 |
The role of 5-methylcytosine regulator-related genes in diagnostic and immune regulatory functions in atherosclerosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1636323
PMID:41583468
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研究论文 | 本研究通过分析动脉粥样硬化(AS)中5-甲基胞嘧啶(m5C)RNA修饰及其调控基因的作用，识别了五个潜在的诊断生物标志物，并揭示了m5C调节因子NSUN3在巨噬细胞功能中的关键作用 | 首次系统性地将m5C RNA修饰调控基因与动脉粥样硬化的诊断和免疫调节功能联系起来，并识别了五个新的潜在诊断生物标志物 | 研究主要基于公共微阵列数据库，需要进一步实验验证生物标志物的临床实用性 | 阐明m5C修饰及其相关基因在动脉粥样硬化中的作用，并识别潜在的诊断生物标志物 | 动脉粥样硬化患者样本数据、人类髓系白血病单核细胞(THP-1)以及巨噬细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 微阵列分析、LASSO逻辑回归、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、qRT-PCR | LASSO逻辑回归模型、WGCNA | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE90074、GSE27034、GSE59421、GSE159677)，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序、微阵列 | NA | NA |
| 246 | 2026-01-29 |
PANoptosis in urological diseases: molecular mechanisms, pathological roles, and emerging therapeutic opportunities
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1729348
PMID:41583472
|
综述 | 本文综述了PANoptosis在泌尿系统疾病中的分子机制、病理作用及新兴治疗机会 | 首次系统阐述PANoptosis作为一种整合性炎症程序性细胞死亡通路在泌尿系统疾病中的双重作用及作为治疗靶点的潜力 | NA | 探讨PANoptosis在泌尿系统疾病发病机制中的角色及作为诊断和治疗靶点的可能性 | 泌尿系统疾病，包括急慢性肾损伤、前列腺癌、肾癌和睾丸疾病 | NA | 泌尿系统疾病 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 247 | 2026-01-29 |
A novel prognostic model based on epithelial cell progression genes identifies OAS1 as a suppressor of bladder cancer aggressiveness
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1716130
PMID:41584451
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研究论文 | 本研究基于上皮细胞肿瘤进展相关基因构建了一个新的膀胱癌预后模型，并发现OAS1是抑制膀胱癌侵袭性的关键基因 | 利用单细胞RNA测序数据识别上皮细胞亚群及其恶性进展轨迹，并基于此构建了一个四基因特征的预后模型，同时通过体外实验验证了关键基因OAS1的功能 | 模型验证依赖于公共数据库的回顾性数据，需要在前瞻性临床队列中进一步验证；体外实验未能完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 识别驱动膀胱癌进展的关键上皮细胞来源特征基因，构建可靠的预后模型，并探索关键基因OAS1的生物学功能 | 膀胱癌患者（来自TCGA和GEO数据库）及膀胱癌细胞系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，LASSO Cox回归，CCK-8，Transwell，伤口愈合实验 | LASSO Cox回归模型 | 单细胞RNA-seq数据，批量RNA-seq数据，临床数据 | TCGA膀胱癌队列及独立GEO验证队列（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 248 | 2026-01-29 |
A robust ammonia metabolism gene signature identified by machine learning predicts prognosis and immunotherapy response in clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1709096
PMID:41584585
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法，识别了一个与氨代谢相关的基因特征，用于预测透明细胞肾细胞癌的预后和免疫治疗反应 | 首次利用机器学习整合多组学数据，构建了氨代谢风险评分模型，并验证了其在预测预后和免疫治疗反应中的有效性，同时通过体外实验验证了关键基因CSAD的功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步的前瞻性临床研究验证模型的普适性 | 开发一个能够预测透明细胞肾细胞癌患者预后和免疫治疗反应的生物标志物 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 机器学习 | 肾细胞癌 | RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, TMB分析 | 随机森林, LASSO, 多元Cox回归 | RNA-seq数据, 多组学数据 | TCGA数据库中的患者数据，以及外部验证队列和免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 249 | 2026-01-29 |
Berberine suppresses hepatocellular carcinoma progression by blocking IL-4-JAK1-STAT6-mediated M2 polarization of macrophage
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1734201
PMID:41585886
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研究论文 | 本研究揭示了小檗碱通过阻断IL-4-JAK1-STAT6信号轴抑制巨噬细胞M2极化，从而抑制肝细胞癌进展的机制 | 首次阐明小檗碱通过直接结合JAK1蛋白的FERM结构域并稳定该蛋白，进而抑制IL-4诱导的巨噬细胞M2极化，并与抗PD-L1抗体联合治疗显示出协同抗肿瘤效应 | 研究主要基于H22荷瘤小鼠模型和体外实验，缺乏临床患者样本验证；联合治疗策略的长期安全性和疗效需进一步评估 | 探究小檗碱是否通过调节肿瘤炎症微环境抑制肝细胞癌进展 | 肝细胞癌（HCC）、肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、H22肿瘤细胞系、荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子对接、蛋白质稳定性测定、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据、细胞表型数据 | H22荷瘤小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2026-01-29 |
Integrative transcriptomic analysis reveals microglial metabolic-inflammatory crosstalk of HK2-HSPA5-TNF axis after intracerebral hemorrhage
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1740715
PMID:41601478
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学数据，揭示了脑出血后小胶质细胞中HK2-HSPA5-TNF轴介导的代谢-炎症相互作用 | 首次通过整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据，系统揭示了脑出血后小胶质细胞中葡萄糖代谢与炎症反应之间的时空动态调控网络 | 研究主要基于转录组学数据，缺乏蛋白质水平的功能验证；动物模型与人类组织的直接可比性有待进一步确认 | 探究脑出血后葡萄糖代谢失调如何促进神经炎症的发病机制 | 脑出血后的小胶质细胞代谢-炎症调控网络 | 生物信息学 | 脑血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 加权基因共表达网络分析, 伪时间轨迹重建, 细胞间通讯推断 | 转录组数据 | 人类血肿周围组织和小鼠脑出血模型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 251 | 2026-01-29 |
SpaLLM: a general framework for spatial domain identification with large language models
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1713975
PMID:41601479
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研究论文 | 提出SpaLLM框架，通过整合大语言模型生成的基因描述嵌入与空间转录组学数据，改进空间域识别 | 首次将大语言模型生成的基因功能描述嵌入整合到空间转录组学分析中，利用预计算的GenePT嵌入创建生物学信息丰富的基因表示，从而增强空间域识别的准确性 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 改进空间转录组学中的空间域识别方法 | 空间转录组学数据，包括基因表达矩阵和空间坐标 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 大语言模型 | 基因表达矩阵、空间坐标、基因功能描述文本 | 12个基于测序的Visium切片和一个独立的基于成像的osmFISH数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 基于测序的Visium切片 |
| 252 | 2026-01-29 |
High-dimensional co-expression network analysis reveals persistent TRH gene expression throughout axolotl telencephalon regeneration
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1697212
PMID:41601481
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研究论文 | 本研究通过高维加权基因共表达网络分析，结合空间转录组学，揭示了蝾螈端脑再生过程中基因共表达的动态图谱，并识别了包括TRH在内的关键枢纽基因 | 整合hdWGCNA、空间转录组学和蛋白质-蛋白质相互作用网络，首次在蝾螈端脑再生中系统识别了枢纽基因，并发现了TRH基因在多个阶段的持续表达模式 | 研究主要为描述性分析，未进行实验验证枢纽基因的功能机制 | 识别蝾螈端脑再生过程中的枢纽基因并定位其细胞位置，以阐明脑再生的分子基础 | 蝾螈（Ambystoma mexicanum）的端脑再生过程 | 生物信息学 | NA | 高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、空间转录组学、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | NA | 时空转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 253 | 2026-01-29 |
Integrated multi-omics and single-cell analysis identify SERPINE1 as a key mediator of the inflammatory tumor microenvironment in PDAC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1716878
PMID:41601623
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研究论文 | 本研究通过整合多组学与单细胞分析，揭示了SERPINE1是胰腺导管腺癌（PDAC）炎症性肿瘤微环境的关键调控因子 | 首次通过整合多组学与单细胞分析，系统性地将SERPINE1确立为PDAC炎症驱动基质重塑和免疫逃逸的核心协调者，并发现其作为药物靶点的新潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，体内功能验证和临床转化研究有待进一步开展 | 阐明PDAC炎症性肿瘤微环境中的关键调控因子及其在免疫抑制和肿瘤进展中的作用 | 胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中的细胞与分子 | 生物信息学，单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，多组学分析，分子对接，CRISPR基因敲除 | NA | 基因组，转录组，单细胞转录组数据 | 来自TCGA、GEO、ArrayExpress数据库的多队列数据集，以及IMvigor210队列 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 254 | 2026-01-29 |
Single-cell transcriptomics reveals a novel mechanism of RDH16 regulating immune infiltration in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689987
PMID:41601632
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据与批量转录组数据集，揭示了RDH16在肝细胞癌中调节免疫浸润的新机制 | 首次将单细胞转录组学与孟德尔随机化分析结合，识别RDH16作为免疫调节生物标志物，并发现其与CD163⁺ M2巨噬细胞浸润的负相关关系 | 研究未直接验证RDH16在体内对免疫微环境的具体调控机制，且功能实验未显示其对肿瘤细胞增殖、迁移或侵袭的直接影响 | 探究肝细胞癌中肿瘤异质性及免疫微环境，识别可操作的生物标志物和免疫调节机制以改善患者预后 | 肝细胞癌组织与非肿瘤肝组织，重点关注RDH16基因表达及其与临床病理特征和免疫浸润的关联 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序，孟德尔随机化分析 | NA | 转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及肝细胞癌组织与非肿瘤肝组织的比较 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 255 | 2026-01-29 |
Revealing the role of regulatory microglial IRF7-NLRP3 interactions in optic nerve damage of normal-tension glaucoma based on single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1700998
PMID:41601638
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序，揭示了正常眼压性青光眼中IRF7与NLRP3分子相互作用调控小胶质细胞炎症反应在视神经损伤中的作用机制 | 首次揭示了OPTN (E50K)突变通过削弱IRF7对NLRP3的抑制作用，导致促炎性小胶质细胞表型，从而加剧NTG视神经损伤的具体分子机制 | 研究基于小鼠模型，其在人类疾病中的直接适用性仍需进一步验证；研究聚焦于IRF7-NLRP3轴，可能存在其他未被探索的相关通路 | 探究正常眼压性青光眼（NTG）视神经损伤的分子机制，特别是小胶质细胞炎症反应的作用 | 野生型和OPTN (E50K)突变小鼠的视网膜小胶质细胞 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序, Western blot, qPCR, 免疫荧光, 分子对接 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质印迹数据, 基因表达数据, 荧光成像数据 | 野生型和OPTN (E50K)突变小鼠的视网膜小胶质细胞（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 256 | 2026-01-29 |
Unveiling the immunometabolic landscape of colorectal cancer through PANoptosis-related gene expression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1615022
PMID:41601652
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研究论文 | 本研究通过分析PANoptosis相关基因表达，揭示了结直肠癌的免疫代谢景观，并构建了基于CPAN-index的风险分层模型 | 首次将PANoptosis相关基因与结直肠癌免疫代谢微环境关联，构建了CPAN-index风险分层工具，并验证了CDKN2A在肿瘤进展中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步的前瞻性临床验证和实验机制探索 | 探究PANoptosis相关基因在结直肠癌中的作用及其对免疫代谢微环境的影响 | 结直肠癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 基因敲低 | LASSO回归模型 | RNA-seq数据 | 未明确具体样本数量，但使用了公共数据集和外部验证集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 257 | 2026-01-29 |
Decoding inflammatory regulation in ovarian cancer at single-cell resolution
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1719669
PMID:41601649
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综述 | 本文综述了单细胞技术如何揭示卵巢癌微环境中炎症驱动的重塑、免疫细胞信号通路及动态的炎症-免疫相互作用 | 聚焦卵巢癌的“双重微环境”，整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多组学技术，从单细胞分辨率解析炎症调控机制 | 综述性文章，未开展原始实验研究；将单细胞见解转化为精准诊疗策略仍面临挑战 | 阐明炎症在卵巢癌发生发展中的调控作用，并探讨其临床转化前景 | 卵巢癌微环境（OCME），包括肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | scRNA-seq, 空间转录组学, 多组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 258 | 2026-01-29 |
TRIM29 drives ulcerative colitis by disrupting lipid metabolism via lysosomal dysfunction: a multi-omics and experimental study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1728932
PMID:41601651
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研究论文 | 本研究通过多组学和实验方法，揭示了TRIM29通过破坏溶酶体功能并重编程脂质代谢来驱动溃疡性结肠炎进展的机制 | 首次将TRIM29鉴定为溃疡性结肠炎进展的关键调控因子，并阐明了其通过溶酶体功能障碍影响脂质代谢的新轴心机制 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，尚未在人类患者中进行直接验证，且机制细节有待进一步深入探索 | 探究溃疡性结肠炎的发病机制，特别是脂质代谢与疾病之间的因果关系 | 溃疡性结肠炎患者数据、DSS诱导的结肠炎小鼠模型、结肠上皮细胞 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化、集成机器学习、单细胞RNA测序、转录组分析 | LASSO、SVM、XGBoost | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 259 | 2026-01-29 |
Integrated multi-omic profiling reveals macrophage-driven prognostic signatures in clear cell renal cell carcinoma through machine learning optimization
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1612262
PMID:41601657
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据与机器学习模型，揭示了透明细胞肾细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性，并构建了一个基于巨噬细胞的预后特征模型 | 首次在KIRC中系统鉴定出五个转录不同的巨噬细胞亚群，特别是三个脂质相关巨噬细胞亚群，并利用随机生存森林模型构建了具有强预后性能的巨噬细胞中心特征 | 研究样本量相对有限（十个KIRC肿瘤的单细胞数据），且主要依赖公共数据库（如TCGA和CPTAC）进行验证，可能受数据异质性影响 | 旨在阐明KIRC中肿瘤相关巨噬细胞的异质性，识别预后相关的巨噬细胞特征，并解析驱动KIRC进展的免疫代谢程序 | 透明细胞肾细胞癌（KIRC）患者及其肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA），机器学习模型 | 随机生存森林（RSF）模型，共使用了二十种机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据，临床数据 | 十个KIRC肿瘤的单细胞RNA测序数据，并在TCGA和CPTAC独立队列中进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 260 | 2026-01-29 |
Multi-omics integration identifies NK cell dysregulation and a five-gene diagnostic signature in major depressive disorder
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1700629
PMID:41601671
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，揭示了自然杀伤细胞功能障碍在重度抑郁症中的核心作用，并鉴定出五个关键基因作为诊断标志物 | 首次整合bulk RNA-seq与单细胞RNA-seq数据，结合机器学习方法，系统性地识别了MDD中NK细胞的功能失调及其相关的五个关键基因诊断特征 | 样本量较小（仅3名MDD患者和3名健康对照），且仅基于外周血单核细胞进行分析，可能无法完全反映大脑内的病理变化 | 揭示重度抑郁症的细胞类型特异性转录组失调和免疫功能障碍机制，并寻找诊断生物标志物和治疗靶点 | 重度抑郁症患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 重度抑郁症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 机器学习, 伪时间轨迹分析, GSVA, scMetabolism, SCENIC | 机器学习 | 基因表达数据 | 3名MDD患者和3名健康对照的PBMCs单细胞数据，以及GSE39653数据集的bulk RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |