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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25801 | 2025-10-07 |
Targeting LHPP in neoadjuvant chemotherapy resistance of gastric cancer: insights from single-cell and multi-omics data on tumor immune microenvironment and stemness characteristics
2025-Apr-16, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07614-z
PMID:40240758
|
研究论文 | 通过单细胞和多组学数据分析LHPP在胃癌新辅助化疗耐药中的作用机制 | 首次发现LHPP通过调节GSK-3β磷酸化抑制胃癌干细胞特性和化疗耐药性,并建立干细胞-免疫风险评分模型 | 样本量有限,需要进一步实验验证机制 | 研究LHPP在胃癌新辅助化疗耐药中的作用机制 | 胃癌患者样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序,多组学分析 | 风险评分模型 | 基因组数据,临床数据 | 375个TCGA样本和141个临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |
| 25802 | 2025-10-07 |
Deciphering the heterogeneity of epithelial cells in pancreatic ductal adenocarcinoma: implications for metastasis and immune evasion
2025-Apr-16, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-03793-3
PMID:40240899
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示胰腺导管腺癌上皮细胞的异质性及其在肿瘤进展、转移和免疫抑制中的作用 | 首次整合多个单细胞RNA测序数据集,系统识别PDAC上皮细胞亚群并揭示其与肿瘤转移和免疫调节的关系 | 研究基于已有数据集,缺乏实验验证和更大样本量的独立验证 | 探究胰腺导管腺癌上皮细胞异质性及其在肿瘤进展和免疫逃避中的作用机制 | 胰腺导管腺癌患者的上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,拷贝数变异分析,轨迹分析,细胞间通讯分析 | Harmony算法整合,CellChat平台,预后预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | 两个公共数据集(GSE154778和GSE158356)的整合分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25803 | 2025-10-07 |
CAFs activated by YAP1 upregulate cancer matrix stiffness to mediate hepatocellular carcinoma progression
2025-Apr-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06325-5
PMID:40241143
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析发现YAP1阳性癌症相关成纤维细胞通过上调细胞外基质硬度相关基因表达促进肝细胞癌进展 | 首次在单细胞水平揭示YAP1阳性CAF亚群通过调控基质硬度促进肝癌进展的具体机制 | NA | 探索特定CAF亚群与肝癌基质硬度的关系,寻找新的治疗靶点 | 肝细胞癌、癌症相关成纤维细胞 | 单细胞测序分析 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、伪时间分析、细胞间通讯分析、转录因子活性分析、GO分析 | NA | 单细胞测序数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25804 | 2025-10-07 |
Distribution of gut microbiota across intestinal segments and their impact on human physiological and pathological processes
2025-Apr-16, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01385-y
PMID:40241220
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综述 | 系统总结肠道微生物在不同肠段的分布特征及其对人类生理和病理过程的影响 | 首次系统总结了六个肠段(十二指肠、空肠、回肠、盲肠、结肠、直肠)的微生物分布特征及其与特定疾病的关联 | NA | 阐明特定解剖部位微生物在精确调控特定疾病过程中的作用 | 人类肠道微生物 | 微生物组学 | 肠道相关疾病 | 宏基因组学、代谢组学、单细胞测序 | NA | 微生物组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 25805 | 2025-10-07 |
High-throughput drug screening identifies SMAC mimetics as enhancers of NK-cell cytotoxicity in chronic myeloid leukemia
2025-Apr-10, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025286
PMID:39792962
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研究论文 | 通过高通量药物筛选发现SMAC模拟物可增强NK细胞在慢性髓性白血病中的细胞毒性 | 首次系统评估500多种小分子化合物对NK细胞功能的影响,并发现SMAC模拟物能显著增强NK细胞杀伤活性 | 研究主要基于体外实验,临床转化效果需进一步验证 | 探索增强NK细胞免疫疗法在慢性髓性白血病中疗效的药物策略 | 原代NK细胞和慢性髓性白血病细胞系及患者样本 | 免疫肿瘤学 | 慢性髓性白血病 | 高通量药物筛选, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | 超过500种小分子化合物,包含细胞系和原代患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25806 | 2025-10-07 |
NAT10 Promotes Gastric Cancer Liver Metastasis by Modulation of M2 Macrophage Polarization and Metastatic Tumor Cell Hepatic Adhesion
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410263
PMID:39985269
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研究论文 | 本研究揭示了RNA乙酰转移酶NAT10通过调控M2巨噬细胞极化和肿瘤细胞肝粘附促进胃癌肝转移的分子机制 | 首次发现NAT10介导的RNA修饰在胃癌肝转移中的关键作用,并阐明NAT10/KLF5信号轴通过调控巨噬细胞极化和肿瘤细胞粘附的双重机制 | 研究主要基于临床样本分析和小鼠模型,需要进一步在人体中验证治疗靶点的有效性 | 探究RNA修饰在胃癌肝转移中的作用机制及潜在治疗靶点 | 胃癌细胞、肝转移灶、巨噬细胞、小鼠模型和类器官模型 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞测序, 临床样本分析, 小鼠模型, 类器官模型 | 动物模型, 类器官模型 | 基因表达数据, 临床数据, 实验数据 | 临床样本和小鼠模型,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 25807 | 2025-10-07 |
CpG-Based Nanovaccines Enhance Ovarian Cancer Immune Response by Gbp2-Mediated Remodeling of Tumor-Associated Macrophages
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412881
PMID:39985265
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CpG的纳米疫苗,通过Gbp2介导的机制重塑肿瘤相关巨噬细胞,增强卵巢癌免疫反应 | 开发了PLGA-CpG@ID8-M纳米疫苗,首次阐明Gbp2-Pin1-NFκB通路在TAMs M1极化中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 开发新型纳米疫苗并阐明其通过重塑肿瘤相关巨噬细胞增强抗肿瘤免疫的机制 | ID8卵巢癌细胞、4T1乳腺癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | ID8荷瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 25808 | 2025-10-07 |
Multiscale Dissection of Spatial Heterogeneity by Integrating Multi-Slice Spatial and Single-Cell Transcriptomics
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413124
PMID:39999288
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研究论文 | 提出一种名为SMILE的新型深度学习方法,用于整合多切片空间转录组和单细胞转录组数据以解析空间异质性 | 首次结合图对比自编码器和多层感知器,通过局部约束学习多尺度信息性spot表示,能够同时分析不同尺度的空间变异 | 未明确说明方法在计算效率或大规模数据集上的表现 | 开发能够同时进行多切片空间对齐和细胞类型解卷积的计算方法 | 空间转录组数据和单细胞转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序,单细胞RNA测序 | 图对比自编码器,多层感知器 | 空间转录组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25809 | 2025-10-07 |
ANKRD11 as a potential biomarker for brain metastasis from lung adenocarcinoma via cerebrospinal fluid liquid biopsy
2025-Mar-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-800
PMID:40248734
|
研究论文 | 本研究通过脑脊液液体活检识别ANKRD11作为肺腺癌脑转移的潜在生物标志物 | 首次通过脑脊液ctDNA测序结合单细胞RNA测序分析发现ANKRD11在肺腺癌脑转移中的表达逐渐降低及其抑癌功能 | 样本量较小(仅7例患者),需要更大规模研究验证 | 探索肺腺癌脑转移的新型生物标志物 | 肺腺癌脑转移患者、细胞系、裸鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | ctDNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 7例BM-LUAD患者脑脊液样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 液体活检 | NA | NA |
| 25810 | 2025-10-07 |
Single cell RNA-seq and bulk RNA-seq analysis identifies MUC1 as a key gene for lung adenocarcinoma to neuroendocrine transformation
2025-Mar-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-806
PMID:40248742
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析,揭示了MUC1基因在肺腺癌向神经内分泌癌转化过程中的关键作用 | 首次结合孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序技术系统研究肺腺癌向神经内分泌癌转化的分子机制,并识别MUC1作为关键调控基因 | 样本量相对有限(6个组织活检样本),需要在更大规模队列中验证研究结果 | 探索肺腺癌向神经内分泌癌转化过程中的遗传和免疫特征 | 肺腺癌和神经内分泌癌组织样本 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 孟德尔随机化分析, WGCNA, CIBERSORT | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 16,765个细胞,来自6个组织活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 25811 | 2025-10-07 |
Male-Dominant Spinal Microglia Contribute to Neuropathic Pain by Producing CC-Chemokine Ligand 4 Following Peripheral Nerve Injury
2025-03-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14070484
PMID:40214438
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研究论文 | 本研究揭示了雄性小鼠脊髓小胶质细胞通过产生CCL4促进神经病理性疼痛的性别特异性机制 | 首次发现雄性小鼠脊髓小胶质细胞中CCL4表达显著增加,并证实其通过CCL4-CCR5信号通路特异性加剧雄性小鼠的神经病理性疼痛 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需验证;机制研究尚未完全阐明CCL4作用的下游通路 | 探究外周神经损伤后脊髓小胶质细胞在神经病理性疼痛中的性别特异性作用机制 | 雄性小鼠脊髓小胶质细胞 | 神经科学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序,行为学测试,药理学干预 | NA | 基因表达数据,行为学数据 | 小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25812 | 2025-10-07 |
Cancer-associated fibroblasts: multidimensional players in liver cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1454546
PMID:40248197
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综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞在肝癌微环境中的多维作用及其亚群功能 | 利用单细胞RNA测序技术结合基因工程小鼠模型,首次在肝癌前微环境和肝内胆管癌微环境中鉴定出多种CAF亚群 | NA | 阐明不同CAF亚群在肝癌发展中的具体作用和调控机制 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其亚群 | 肿瘤微环境研究 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25813 | 2025-10-07 |
Exploring wound management in dental pulp: Utilizing single-cell RNA sequencing for global transcriptomic analysis in healthy and inflamed pulpal tissues
2024-Mar, International wound journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1111/iwj.14804
PMID:38385817
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析健康和炎症牙髓组织的转录组景观,探索牙髓伤口愈合的细胞和分子机制 | 首次在牙髓研究中应用单细胞RNA测序技术揭示龋齿条件下细胞组成变化和细胞间相互作用网络 | 样本量相对有限,仅包含50例患者样本 | 研究牙髓伤口愈合过程中信号级联、细胞反应和细胞外基质动力学的复杂相互作用 | 人类牙髓组织(健康和炎症状态) | 单细胞组学 | 牙髓疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 50例患者牙髓组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25814 | 2025-10-07 |
Evaluating the role of wound-healing genes in conjunction with stool routine and serum tumor markers for colorectal cancer diagnosis and prognostic implications
2024-Mar, International wound journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1111/iwj.14768
PMID:38446012
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研究论文 | 本研究评估粪便常规检查联合血清肿瘤标志物检测在结直肠癌诊断中的临床应用价值 | 首次将伤口愈合基因(VEGFA、TP53、TGFA)与粪便常规和血清肿瘤标志物结合用于结直肠癌诊断和预后评估 | 样本量较小(仅56例患者),需要更大规模研究验证结果 | 探索结直肠癌的新型诊断和预后评估方法 | 结直肠癌患者和健康对照者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 临床数据, 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 56例结直肠癌患者和56例健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25815 | 2025-10-07 |
Simultaneous CRISPR screening and spatial transcriptomics reveals intracellular, intercellular, and functional transcriptional circuits
2023-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.30.569494
PMID:38076932
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研究论文 | 开发了一种结合CRISPR筛选和空间转录组学的新方法Perturb-FISH,用于研究单细胞分辨率下的遗传和分子关联 | 首次将成像空间转录组学与并行光学检测扩增的引导RNA相结合,能够同时分析细胞内、细胞间和功能转录回路 | NA | 开发一种能够在单细胞分辨率下研究空间和功能生物学遗传和分子关联的通用方法 | 培养的单核细胞、诱导多能干细胞衍生的星形胶质细胞 | 空间转录组学 | 自闭症谱系障碍 | CRISPR筛选、空间转录组学、成像技术 | NA | 转录组数据、空间位置数据、功能表型数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | Perturb-FISH平台 |
| 25816 | 2025-10-07 |
Heterogeneity of human prostate carcinoma-associated fibroblasts implicates a role for subpopulations in myeloid cell recruitment
2020-02, The Prostate
DOI:10.1002/pros.23929
PMID:31763714
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类前列腺癌相关成纤维细胞的异质性及其在髓系细胞招募中的作用 | 首次在前列腺癌中发现CAF存在六个功能异质性亚群,并证实特定亚群通过分泌CCL2趋化因子招募髓系细胞 | 研究样本量有限(3321个CAF),机制研究主要基于体外实验,需要更多体内验证 | 鉴定前列腺癌相关成纤维细胞的功能亚群及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 人类前列腺癌相关成纤维细胞(CAF)和正常前列腺成纤维细胞(NPF) | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,贝叶斯分析,体外迁移实验 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 3321个CAF细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25817 | 2025-10-07 |
OmniClust: A versatile clustering toolkit for single-cell and spatial transcriptomics data
2025-Jun, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.03.007
PMID:40057293
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研究论文 | 开发了一个名为OmniClust的多功能聚类工具包,用于单细胞和空间转录组学数据分析 | 开发了首个同时整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据的聚类工具包,采用深度学习算法处理空间转录组数据,机器学习算法处理单细胞RNA测序数据 | NA | 开发一个能够整合单细胞和空间转录组学数据的通用聚类工具包 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 深度学习,机器学习 | 转录组数据 | 12个空间转录组基准数据集和4个单细胞RNA测序基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 25818 | 2025-02-23 |
Decoding cell-cell communication using spatial transcriptomics
2025-May, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00824-3
PMID:39984677
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25819 | 2025-10-07 |
Identification of the crucial roles of BAXhigh NK cells in human derived mesenchymal stem cell therapy for chronic heart failure patients
2025-May, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.155924
PMID:40174277
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,揭示了BAX高表达NK细胞在间充质干细胞治疗慢性心力衰竭中的关键作用机制 | 首次发现BAX高表达NK细胞在心力衰竭发病机制中的作用,并阐明间充质干细胞通过抑制BAX表达改善NK细胞功能的治疗机制 | 样本量有限,机制研究仍需进一步实验验证 | 探究间充质干细胞治疗心力衰竭的分子机制 | 慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 心力衰竭患者治疗前后外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25820 | 2025-10-07 |
Identification of a cancer stem cell-like subpopulation that promotes HCC metastasis
2025-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101302
PMID:40242316
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,鉴定并表征了肝细胞癌中促进转移的癌症干细胞样亚群 | 首次在肝细胞癌中鉴定出促进转移的癌症干细胞样亚群,并揭示其通过ICAM1信号通路诱导免疫抑制微环境的新机制 | 样本量相对有限(19例单细胞RNA测序样本和12例空间转录组样本),需要更大规模研究验证 | 探索癌症干细胞在肝细胞癌转移中的作用机制 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的癌症干细胞样细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床队列数据 | 19例肝细胞癌样本(单细胞RNA测序), 12例肝细胞癌样本(空间转录组), 9个临床队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |