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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2521 | 2026-02-17 |
Repurposing antimicrobials, disulfiram, and metformin for cancer therapy: Bridging mechanistic gaps through RNA sequencing
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178258
PMID:41101682
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综述 | 本文综述了将抗菌药物、双硫仑和二甲双胍重新用于癌症治疗的潜力,并探讨了RNA测序在揭示其作用机制和指导临床转化中的关键作用 | 系统性地将多种抗菌药物与双硫仑、二甲双胍并列,探讨其抗癌重定位的共性机制,并强调利用转录组学(尤其是单细胞和空间转录组学)来弥合机制认知差距并指导精准治疗 | 临床转化结果参差不齐,面临药物相互作用、亚治疗浓度、耐药机制和肿瘤微环境成分等关键挑战,且除二甲双胍外,其他候选药物的临床前和临床研究数据相对有限 | 探讨药物重定位用于癌症治疗的潜力,并阐明RNA测序技术在理解药物作用机制和指导临床转化中的应用 | 抗菌药物(阿奇霉素、克拉霉素、氯碘羟喹、氯喹、多西环素、红霉素、伊维菌素、替加环素)、双硫仑和二甲双胍 | 自然语言处理 | 癌症 | RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2522 | 2026-02-17 |
Enhanced Production of Lipid Mediators in Plasma and Activation of DNA Damage Pathways in PBMCs Are Correlated With the Severity of Ancestral SARS-CoV-2 Infection
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403195R
PMID:40322970
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研究论文 | 本研究通过分析PBMCs和血浆样本,揭示了特定脂质介质及其合成基因的上调与SARS-CoV-2感染严重程度的相关性 | 首次将血浆脂质代谢物谱、PBMCs的转录组学数据与鼻咽部单细胞基因表达数据相结合,系统性地关联了脂质炎症介质、DNA损伤通路激活与COVID-19疾病严重程度 | 样本量较小(PBMCs分析仅20例),且为观察性研究,无法确定因果关系 | 探究遗传因素和脂质代谢物在严重SARS-CoV-2感染中的作用机制 | 感染与未感染SARS-CoV-2的患者外周血单核细胞(PBMCs)、血浆及鼻咽拭子样本 | 生物信息学 | COVID-19 | bulk RNA-seq, 脂肪酸组学分析, 单细胞RNA-seq数据分析 | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | PBMCs/血浆:10例感染患者 + 10例未感染患者;鼻咽拭子:58例健康与COVID-19参与者 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2523 | 2026-02-17 |
Dissection of Gαs and Hedgehog signaling crosstalk reveals therapeutic opportunities to target adenosine receptor 2b in Hedgehog-dependent tumors
2025-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639530
PMID:40060632
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研究论文 | 本研究通过组织学、bulk RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了Gαs信号通路失活驱动的基底细胞癌(BCC)与经典Hedgehog SMO驱动肿瘤的相似性,并提出了靶向腺苷2B受体作为潜在治疗策略 | 首次发现Gαs通路失活可导致SMO独立的致癌Hedgehog信号,并证明激活Gαs偶联的腺苷2B受体能抑制Hedgehog信号和肿瘤形成 | 研究主要基于小鼠模型和人类BCC突变分析,临床转化潜力需进一步验证 | 探索Gαs与Hedgehog信号串扰在基底细胞癌中的作用,寻找新的治疗靶点 | 小鼠BCC样肿瘤和人类基底细胞癌 | 肿瘤生物学 | 基底细胞癌 | 组织学分析、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2524 | 2026-02-17 |
The mTOR Pathway: A Common Link Between Alzheimer's Disease and Down Syndrome
2024-Oct-17, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13206183
PMID:39458132
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综述 | 本文探讨了mTOR通路在阿尔茨海默病和唐氏综合征之间的共同联系,并提出了利用组学平台进行未来研究的建议 | 首次提出将组学技术(如空间转录组学、蛋白质组学)应用于研究mTOR通路在唐氏综合征相关阿尔茨海默病中的作用,采用无偏倚方法揭示病理机制 | 目前尚未实际应用组学技术分析mTOR通路与DS-AD的关联,机制研究尚不充分 | 探讨mTOR通路在阿尔茨海默病与唐氏综合征共同病理机制中的作用,并推动未来跨组学研究 | 阿尔茨海默病和唐氏综合征的分子病理机制,特别是mTOR通路及其上游调控因子 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2525 | 2026-02-17 |
Activation-Induced Marker Assay to Identify and Isolate HCV-Specific T Cells for Single-Cell RNA-Seq Analysis
2024-10-17, Viruses
DOI:10.3390/v16101623
PMID:39459954
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研究论文 | 开发了一种基于激活诱导标记(AIM)的检测方法,用于识别、分选并分析丙型肝炎病毒(HCV)特异性T细胞,以进行单细胞RNA测序研究 | 该方法不依赖于MHC多聚体,能够高灵敏度检测稀有的抗原特异性T细胞,并适用于不同MHC匹配的研究对象 | 研究仅基于一名受试者进行验证,样本量较小,且未在更大队列中评估方法的普适性 | 开发一种用于识别和分离HCV特异性T细胞的方法,以进行单细胞转录组分析 | HCV特异性T细胞(包括CD4和CD8 T细胞) | 免疫学 | 丙型肝炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、激活诱导标记(AIM)检测、T细胞受体(TCR)分析 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据 | 一名受试者(具体数量未明确说明,但基于单例分析) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2526 | 2026-02-17 |
An integrated approach identifies the molecular underpinnings of murine anterior visceral endoderm migration
2024-09-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.05.014
PMID:38843837
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学、高分辨率活体成像和短期谱系标记与干预技术,揭示了小鼠胚胎前内脏内胚层(AVE)迁移的分子基础及其与转录状态的紧密关联 | 首次结合单细胞转录组、磷酸化蛋白质组学和活体成像技术系统解析AVE迁移的动态过程,发现AVE的瞬时性特征及其迁移过程中基因表达的异质性,并鉴定出信号素信号通路对正常迁移的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠胚胎模型,人类胚胎中的保守性有待验证;技术整合虽全面但可能未覆盖所有调控层面 | 阐明小鼠胚胎前内脏内胚层(AVE)独特迁移行为及其限制原条形成的分子机制 | 小鼠胚胎前内脏内胚层(AVE)及周围内脏内胚层(VE)细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白质组学, 高分辨率活体成像, 晶格光片显微镜, 短期谱系标记 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 活体成像视频 | 未明确样本数量的小鼠胚胎VE细胞(迁移前及迁移期间) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2527 | 2026-02-17 |
Molecular portraits of patients with intrahepatic cholangiocarcinoma who diverge as rapid progressors or long survivors on chemotherapy
2024-02-23, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-330748
PMID:37758326
|
研究论文 | 本研究通过分析肝内胆管癌患者化疗前的分子特征,预测其对化疗的反应差异,并揭示了肿瘤-髓系细胞相互作用在先天化疗耐药中的关键作用 | 首次基于化疗前诊断活检的转录组特征,区分出化疗快速进展者与长期生存者,并发现该特征源于肿瘤-髓系细胞动态失衡,与肝微环境密切相关 | 研究样本量有限,且为回顾性分析,需要在前瞻性队列中进一步验证和开发该转录组特征 | 预测晚期肝内胆管癌患者对化疗的获益差异,并阐明先天化疗耐药的分子基础 | 晚期肝内胆管癌患者的诊断活检组织 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 全转录组测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、转录组数据 | 一组基线特征可比的晚期肝内胆管癌患者(包括快速进展者和长期生存者) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | GeoMx | 靶向数字空间分析平台 |
| 2528 | 2026-02-17 |
Pro-inflammatory feedback loops define immune responses to pathogenic Lentivirus infection
2024-02-05, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01290-y
PMID:38317183
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了高致病性慢病毒感染引发延迟、广泛且持续的炎症反馈环路,从而驱动疾病进展的免疫机制 | 利用遗传相似但毒力不同的SIV变体感染猪尾猕猴模型,结合纵向单细胞转录组学和细胞间通讯技术,首次系统阐明了慢病毒致病性差异的免疫基础,并识别出CXCL10和CXCL16作为关键炎症驱动因子 | 研究基于非人灵长类动物模型,结果向人类HIV感染的直接转化需谨慎;单细胞技术可能无法完全捕获所有免疫细胞亚群或低丰度信号 | 探究慢病毒(如HIV/SIV)致病性差异的免疫机制,特别是宿主与病毒因素如何影响炎症反应和疾病进展 | 猪尾猕猴感染遗传相似但毒力不同的猴免疫缺陷病毒(SIV)变体 | 免疫学 | 艾滋病 | 单细胞转录组学,细胞间通讯分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 猪尾猕猴队列的纵向样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2529 | 2026-02-17 |
Sex differences in interindividual gene expression variability across human tissues
2022-Nov, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac243
PMID:36712323
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研究论文 | 本研究通过分析GTEx项目的RNA-seq数据,探讨了人类组织中基因表达变异性的性别差异及其与生物学功能和疾病的关系 | 首次系统性地研究了性别在基因表达变异性方面的差异,并关联到细胞类型特异性表达、性别偏倚疾病(如Graves病)以及进化约束 | 研究主要基于GTEx项目的RNA-seq数据,可能受样本来源和技术平台的限制,且单细胞RNA-seq分析仅针对乳腺上皮细胞 | 探究性别在个体间基因表达变异性上的差异及其生物学意义 | 人类43种组织的RNA-seq数据及乳腺上皮细胞的单细胞RNA-seq数据 | 自然语言处理 | Graves病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自GTEx项目的43种组织数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2530 | 2026-02-17 |
Single-cell profiling reveals distinct subsets of CD14+ monocytes drive blood immune signatures of active tuberculosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1087010
PMID:36713384
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了CD14+单核细胞的不同亚群在活动性结核病血液免疫特征中的独特作用 | 首次证明中间型和经典单核细胞各自贡献于活动性结核病的血液免疫特征,并识别了新的亚群和相关基因特征 | 样本量有限,仅包括活动性结核病患者和健康对照,未涵盖潜伏感染或其他疾病状态 | 探究单核细胞在活动性结核病血液免疫特征中的作用 | 活动性结核病患者在诊断和治疗中期的配对血液样本以及健康对照 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 活动性结核病患者和健康对照的配对血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2531 | 2026-02-17 |
MAP4K3/GLK inhibits Treg differentiation by direct phosphorylating IKKβ and inducing IKKβ-mediated FoxO1 nuclear export and Foxp3 downregulation
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.72148
PMID:35966593
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研究论文 | 本文探讨了GLK(MAP4K3)通过直接磷酸化IKKβ并诱导FoxO1核输出,从而抑制Treg分化的分子机制 | 揭示了GLK在PKCθ非依赖方式下直接磷酸化IKKβ Ser733位点的新机制,并建立了GLK-IKKβ-FoxO1信号轴调控Foxp3转录的完整通路 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;单细胞RNA测序样本量有限 | 阐明GLK/IKKβ信号轴在调节性T细胞(Treg)分化和功能中的作用机制 | T细胞特异性GLK转基因小鼠和IKKβ条件性敲除小鼠的CD4 T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 染色质免疫沉淀、报告基因检测、激酶检测、蛋白质互作检测、质谱分析、共聚焦显微镜、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质互作数据、磷酸化数据 | 转基因小鼠和条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2532 | 2026-02-17 |
Single-cell transcriptomics identifies an effectorness gradient shaping the response of CD4+ T cells to cytokines
2020-04-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15543-y
PMID:32286271
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了CD4+ T细胞对细胞因子反应的效应梯度 | 首次在人类CD4+ T细胞中通过单细胞RNA-seq识别出从初始到效应记忆T细胞的转录连续体,并发现效应梯度影响细胞活化和细胞因子反应 | 研究主要关注人类CD4+ T细胞,未涉及其他免疫细胞类型或体内验证 | 探究初始和记忆CD4+ T细胞对细胞因子反应的差异及其异质性 | 人类初始和记忆CD4+ T细胞 | 单细胞组学 | 炎症相关疾病 | 定量蛋白质组学, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 蛋白质组数据, RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | 超过40,000个人类初始和记忆CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2533 | 2026-02-16 |
Immune dysfunction contributes to comorbid depression in patients with multiple sclerosis
2026-May-15, Journal of affective disorders
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jad.2026.121253
PMID:41605342
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研究论文 | 本研究通过整合基因组学和单细胞数据,探讨了免疫功能障碍在多发性硬化症患者并发抑郁症中的作用 | 首次整合GWAS和单细胞RNA测序数据,揭示了CD8+ T细胞通过HLA-B限制性靶向表达5-HT1F的神经元在MS相关抑郁症中的潜在机制 | 样本量较小(仅4名MS患者进行scRNA-seq),且未能通过孟德尔随机化证实因果关系 | 探究多发性硬化症患者并发抑郁症的免疫病理机制 | 多发性硬化症患者(伴有和不伴有抑郁症) | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 全基因组关联研究(GWAS)、连锁不平衡评分回归(LDSC)、双向双样本孟德尔随机化(2SMR)、GWAS多性状分析(MTAG)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据 | GWAS汇总统计数据(来自IMSGC和PGC),以及4名MS患者的外周血单个核细胞(PBMCs)进行scRNA-seq | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2534 | 2026-02-16 |
Integrative functional genomics and fine-mapping identify regulatory mechanisms of multivariate obesity GWAS and its cardiometabolic implications
2026-Apr, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156509
PMID:41570977
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研究论文 | 本研究通过整合多变量肥胖GWAS与功能基因组学数据,揭示了肥胖的跨组织神经-脂肪调控轴及其心脏代谢影响 | 采用基因组结构方程模型构建多变量肥胖表型,结合多组学数据(染色质可及性、增强子-启动子互作、eQTL、TWAS、PWAS)进行精细定位和共定位分析,首次系统识别了肥胖相关的神经-脂肪调控机制 | 研究主要基于欧洲人群数据,可能限制其跨人群普适性;功能验证实验不足,机制结论仍需进一步实验证实 | 解析肥胖的共享遗传结构和关键调控机制,特别是非编码变异的作用,及其对心脏代谢特征的影响 | 五种肥胖相关性状(体重指数、腰围、内脏脂肪、肝脏脂肪、体脂百分比)的GWAS数据,脂肪组织多组学数据,以及心脏代谢特征 | 基因组学 | 肥胖症 | GWAS, 基因组结构方程建模, 染色质可及性分析, 增强子-启动子互作分析, eQTL分析, TWAS, PWAS, 精细定位, 共定位分析, 单细胞分析 | 基因组结构方程模型, MAGMA, scPagwas | 基因组数据, 表观基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2535 | 2026-02-16 |
Myd88 and Sqstm1 as novel biomarkers for pyroptosis-driven immune checkpoint inhibitors-related myocarditis
2026-Mar-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116336
PMID:41653556
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,鉴定并验证了Myd88和Sqstm1作为免疫检查点抑制剂相关心肌炎中焦亡的关键基因和潜在生物标志物 | 首次在单细胞水平上揭示了焦亡在免疫检查点抑制剂相关心肌炎发病机制中的作用,并鉴定出Myd88和Sqstm1两个新型生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,尚未在临床患者样本中进行大规模验证 | 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制,并寻找可用于临床诊断的生物标志物 | 免疫检查点抑制剂相关心肌炎 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 实时定量PCR, 蛋白质印迹分析 | NA | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量,但使用了小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2536 | 2026-02-16 |
ResiDUBs: A deubiquitinating enzyme-based prognostic model identifies UBXN1 driving sorafenib resistance in liver cancer
2026-Mar-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116290
PMID:41605053
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研究论文 | 本研究构建了一个基于去泛素化酶的预后模型ResiDUBs,用于预测肝癌对索拉非尼的耐药性,并鉴定出UBXN1是驱动耐药的关键基因 | 首次构建了基于去泛素化酶的肝癌索拉非尼耐药预测模型,并通过多组学分析鉴定出UBXN1的关键作用及其通过PI3K/AKT通路和巨噬细胞极化介导耐药的机制 | 模型仅在回顾性数据中验证,需要前瞻性临床研究进一步确认;UBXN1的具体作用机制仍需深入探索 | 探究去泛素化酶在肝癌索拉非尼耐药中的作用,并构建预后预测模型 | 肝癌细胞、肝癌患者样本 | 生物信息学与计算生物学 | 肝癌 | 加权基因共表达网络分析、差异表达分析、多变量Cox回归分析、单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序、体内实验 | 预后预测模型(基于多变量Cox回归) | 基因表达数据、转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及患者分组和细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2537 | 2026-02-16 |
SARS-CoV-2 E protein reduces PPARA activity in colonic and pulmonary epithelial cells, driving diarrhea and pneumonia in COVID-19
2026-Mar-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116291
PMID:41628511
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研究论文 | 本研究通过临床数据和单细胞RNA测序,揭示了SARS-CoV-2 E蛋白通过抑制PPARA活性,导致结肠和肺上皮细胞中膜转运蛋白表达下调,从而引发COVID-19相关腹泻和肺炎的机制 | 首次发现SARS-CoV-2 E蛋白通过抑制PPARA活性,在结肠和肺上皮细胞中共同驱动腹泻和肺炎,并提出了PPARA激动剂作为潜在治疗策略 | 单细胞RNA测序仅基于一名死亡COVID-19腹泻患者的结肠组织样本,样本量较小,且体外细胞模型可能无法完全模拟体内复杂环境 | 阐明SARS-CoV-2诱导腹泻和肺炎的分子机制,并探索潜在治疗靶点 | COVID-19患者(临床数据)及结肠和肺上皮细胞(体外模型) | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因调控网络分析、体外细胞培养实验 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据、体外实验数据 | 3023名患者的临床数据,以及一名死亡COVID-19腹泻患者的结肠组织进行scRNA-seq | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2538 | 2026-02-16 |
Autophagy-driven CCL7+ monocyte terminal differentiation program fuels CD8+ T cell-mediated cardiac injury in Sepsis
2026-Mar-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116265
PMID:41628512
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研究论文 | 本研究揭示了自噬驱动的CCL7+单核细胞终末分化程序通过CCL7介导的免疫激活促进CD8+ T细胞介导的心脏损伤,为脓毒症心肌病提供了新的免疫代谢机制 | 首次鉴定出具有高自噬通量和CCL7表达的C6单核细胞亚群,并阐明了其通过CCL7-CCR1/CCR2-PI3K-AKT信号轴促进CD8+ T细胞活化和心肌损伤的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型,临床验证有限,且未深入探讨其他免疫细胞亚群的具体作用 | 揭示自噬依赖性单核细胞重编程在脓毒症心肌病中的作用及其通过CCL7介导的免疫激活机制 | 脓毒症患者样本、LPS诱导的脓毒症小鼠模型、体外共培养系统 | 单细胞转录组学 | 脓毒症心肌病 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、WGCNA、伪时间轨迹推断、CellChat通讯分析、流式细胞术、ELISA、Western blot | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 来自公共数据库GSE65682、GSE152363、GSE167363的脓毒症患者数据,以及LPS诱导的脓毒症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 2539 | 2026-02-16 |
Multi-omics profiling of intercellular immunometabolic heterogeneity highlights in lung cancer: Crosstalk mechanisms and resistance in the tumor-immune interface
2026-Mar, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.105094
PMID:41453552
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综述 | 本文综述了肺癌肿瘤微环境中恶性细胞与免疫细胞之间的代谢串扰机制,及其如何驱动免疫逃逸、异质性和免疫治疗耐药,并整合多组学数据定义了相关的免疫代谢表型和治疗策略 | 独特地整合了2009-2025年的最新文献,利用多组学数据(单细胞转录组学、蛋白质组学、代谢组学、空间分析)来定义肺癌中的免疫代谢表型(如LM-high、CD73^high、KEAP1/NRF2突变)和相关通路,并强调了靶向这些通路的治疗策略 | 本文为综述性文章,未进行原始数据研究,其结论基于对现有文献的综合分析 | 阐明肺癌肿瘤微环境中肿瘤细胞与免疫细胞之间的免疫代谢串扰机制,及其对免疫治疗耐药的影响,并探索基于多组学分析的精准治疗策略 | 肺癌的肿瘤微环境,特别是其中的恶性细胞和免疫细胞(如细胞毒性T细胞、树突状细胞、调节性和抑制性免疫亚群) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学,蛋白质组学,代谢组学,空间分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2540 | 2026-02-16 |
Interpretable Aging Signatures in Human Retinal Cell Types Revealed by Single-Cell RNA Sequencing and Sparse Logistic Regression
2026-Mar, Ophthalmology science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.xops.2025.101062
PMID:41684508
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和稀疏逻辑回归,揭示了中国人群视网膜细胞类型中可解释的衰老特征 | 首次在中国人群中利用机器学习模型推导出细胞类型特异性的视网膜衰老特征,揭示了保守的分子标志和独特的细胞脆弱性 | 样本量相对较小(18个视网膜,12名捐赠者),且为横断面研究,无法追踪个体衰老动态 | 表征人类视网膜衰老过程中的细胞类型特异性转录变化,并开发用于细胞年龄判别的机器学习模型 | 人类视网膜细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | L1正则化逻辑回归加递归特征消除 | 单细胞转录组数据 | 18个未冷冻视网膜,来自12名中国捐赠者(9名年轻,34-55岁;9名老年,68-92岁),共223,612个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' v3.1 |