单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 35765 篇文献,本页显示第 2521 - 2540 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2521 2025-12-21
Bulk Transcriptome and Single-Cell Sequencing Datasets Reveal Key Programmed Cell Death Patterns in Radiation-Induced Lung Injury: Crosstalk Between NETosis and Macrophages' Responses
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究整合了批量转录组和单细胞RNA测序数据集,揭示了辐射诱导肺损伤中NETosis与巨噬细胞反应之间的关键程序性细胞死亡模式 首次通过整合批量转录组和单细胞测序数据,识别出NETosis是辐射诱导肺损伤中最显著的程序性细胞死亡亚型,并揭示了中性粒细胞与巨噬细胞之间的交互作用及转录因子调控网络 研究依赖于公共数据集,可能受限于样本来源和实验条件的异质性,且未进行体内或体外实验验证 探究辐射诱导肺损伤中程序性细胞死亡的特定亚型及其细胞类型特异性模式 肺组织样本,包括辐射处理和对照 数字病理学 肺损伤 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 来自三个公共数据集(GSE25295, GSE41789, GSE211713)的样本,具体数量未明确 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
2522 2025-12-21
Single-cell and bulk transcriptome analysis reveals the impact of inflammatory microglia on prognosis and immunotherapy response in primary glioblastoma
2025-Dec-20, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞和批量转录组分析,探讨了炎症性小胶质细胞对原发性胶质母细胞瘤预后和免疫治疗反应的影响 首次基于炎症性小胶质细胞相关基因对GBM患者进行分层,揭示了其与预后、免疫治疗反应及肿瘤微环境特征的关联 研究基于回顾性数据分析,需进一步实验验证炎症性小胶质细胞的具体作用机制 评估炎症性小胶质细胞在GBM中的影响,以改善预后预测和免疫治疗策略 胶质母细胞瘤患者及其肿瘤微环境中的小胶质细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,批量转录组分析 Cox回归分析 RNA测序数据 三个独立数据集中的患者样本 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
2523 2025-12-21
MR-DELTAnet: A Longitudinal MRI-Transformer Model Predicting Pathological Complete Response and Revealing Immune Microenvironment via scRNA-seq in Locally Advanced Rectal Cancer
2025-Dec-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究开发了一个基于纵向MRI的Transformer模型MR-DELTAnet,用于预测局部晚期直肠癌患者对新辅助放化疗的病理完全缓解,并通过单细胞RNA测序揭示了相关的免疫微环境特征 提出了一个创新的纵向MRI-Transformer框架MR-DELTAnet,首次整合了Delta-Efficient Latent-Temporal Attention机制,并成功将影像学预测模型与单细胞RNA测序的生物学发现相关联 研究为回顾性设计,需要前瞻性研究进一步验证;单细胞RNA测序队列样本量较小(n=26) 开发一种非侵入性工具,用于术前准确评估局部晚期直肠癌患者对新辅助放化疗的病理完全缓解可能性,并探索其生物学基础 局部晚期直肠癌患者 医学影像分析,生物信息学 直肠癌 单细胞RNA测序 Transformer MRI影像,单细胞RNA测序数据 总计1026名患者(训练集633,内部验证集212,外部验证集181),另有一个独立的单细胞RNA测序队列26名患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2524 2025-12-21
CD27 agonism enhances long-lived CD4 T cell vaccine responses critical for antitumor immunity
2025-Dec-19, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本研究探讨了CD27激动剂如何增强HER2靶向疫苗诱导的长期CD4 T细胞记忆反应,从而改善抗肿瘤免疫效果 首次在长期存活(>18年)的HER2乳腺癌患者中鉴定出HER2特异性CD27+记忆T细胞,并证明CD27激动剂与疫苗联用可显著增强CD4 T细胞的长期记忆功能,该抗肿瘤效果不完全依赖于CD8 T细胞 研究包含回顾性临床分析和小鼠模型实验,尚未在大型前瞻性临床试验中验证;机制研究主要基于转基因小鼠模型 探究如何通过CD27信号增强肿瘤疫苗的长期免疫记忆,提高抗肿瘤疗效 HER2阳性乳腺癌患者、人CD27转基因小鼠、HER2特异性T细胞 免疫肿瘤学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、过继性T细胞转移 转基因小鼠模型 单细胞转录组数据、免疫表型数据 长期存活(>18年)的HER2乳腺癌患者队列、转基因小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2525 2025-12-21
GALA: Integrating Weighted Graph Walks and Latent-Space Adversarial Training for Single-Cell Batch Alignment
2025-Dec-19, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文提出了一种名为GALA的新型单细胞批次校正框架,通过整合加权图随机游走和潜在空间对抗训练,以消除技术批次效应并保留关键生物信号 提出了一种结合加权图互近邻模块和潜在空间对抗训练的新框架,在跨批次细胞配对多样性和覆盖率上相比传统方法有显著提升 NA 开发一种鲁棒的单细胞RNA测序数据批次校正方法,以消除技术变异并保留生物异质性 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 对抗训练 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2526 2025-12-21
Subtype specific immune-metabolic reprogramming in preeclampsia revealed by multiomics and serum biomarkers
2025-Dec-19, Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension IF:4.3Q1
研究论文 本研究通过整合胎盘单细胞RNA-seq、空间转录组学和空间代谢组学数据,结合母体血清代谢组学分析,揭示了早发型和晚发型子痫前期的亚型特异性免疫代谢重编程机制,并鉴定了早期预测生物标志物 首次在子痫前期研究中结合单细胞RNA-seq、空间转录组学、空间代谢组学和血清代谢组学多组学方法,系统揭示了EOPE和LOPE亚型在胎盘细胞组成、转录程序和代谢功能上的特异性差异,并发现了三种具有高预测性能的早期血清代谢物生物标志物 样本量相对有限(199例妊娠),且研究主要关注胎盘组织,未深入探讨母体全身性代谢变化或其他器官的影响 阐明子痫前期不同亚型的胎盘免疫代谢重编程机制,并开发早期预测生物标志物 早发型子痫前期(EOPE)、晚发型子痫前期(LOPE)患者及匹配对照的胎盘组织和母体血清样本 数字病理学 子痫前期 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学, 血清代谢组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 代谢组数据, 血清代谢数据 199例妊娠(包括EOPE、LOPE患者及匹配对照) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学, 代谢组学 NA NA
2527 2025-12-21
Aberrant STING signalling promotes endothelial dysfunction and neurovascular injury in diabetic retinopathy
2025-Dec-19, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 本文探讨了STING信号通路在糖尿病视网膜病变中促进内皮功能障碍和神经血管损伤的作用 揭示了内皮细胞特异性激活cGAS/STING/IFN通路是糖尿病视网膜炎症和神经血管功能障碍的关键驱动因素 研究主要基于小鼠模型和公共单细胞RNA-seq数据,人类样本验证有限 阐明STING信号通路在糖尿病视网膜病变早期干预中的细胞特异性功能和治疗靶点价值 人类增殖性糖尿病视网膜病变纤维膜样本、正常死后视网膜、糖尿病和非糖尿病小鼠的视网膜内皮细胞 数字病理学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA-seq、流式细胞术、腺相关病毒介导的基因操作、siRNA干扰、药理学抑制 NA 单细胞RNA-seq数据、流式细胞术数据、免疫荧光图像 包括人类增殖性糖尿病视网膜病变和特发性黄斑裂孔样本、正常死后视网膜、以及高脂饮食联合链脲佐菌素诱导的2型糖尿病小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2528 2025-12-18
Integrate bulk RNA and single-cell sequencing to identify prognostic genes associated with dietary restriction and circadian rhythm in colorectal cancer and conduct experimental verification
2025-Dec-17, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
2529 2025-12-21
Comprehensive analysis based on spatial domains identifies CD44 as a potential target of puerarin
2025-Dec-17, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和分子对接技术,探讨了葛根素在黑色素瘤中的空间靶向机制,并识别CD44作为潜在作用靶点 首次结合空间域分析和多组学方法,揭示葛根素在黑色素瘤中的空间特异性作用,并通过分子模拟优先确定CD44为候选受体 研究结果仅为假设生成性,需要进一步实验验证CD44是否确实介导葛根素的空间效应 阐明葛根素在黑色素瘤中的治疗特异性及其空间靶向机制 黑色素瘤细胞及其微环境 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 分子对接, 蛋白质-配体模拟 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 分子结构数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
2530 2025-12-21
Comprehensive molecular characterization of high-stemness gastric cancer cells using single-cell transcriptomics, spatial mapping, and machine learning
2025-Dec-17, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学、空间转录组学和机器学习,全面表征了高干性胃癌细胞的分子特征和功能 首次系统性地整合单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习算法,识别并验证了高干性胃癌细胞的特定基因特征及其在化疗耐药中的潜在作用 研究主要基于计算分析和体外细胞系验证,缺乏体内模型或大规模临床队列的进一步验证 全面表征高干性胃癌细胞的分子特征,并探索其在肿瘤侵袭性和治疗抵抗中的作用 胃癌细胞,特别是高干性亚群 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序,机器学习 支持向量机,SHAP分析 单细胞转录组数据,空间转录组数据,bulk RNA测序数据 未明确指定样本数量,但使用了SGC7901和HGC-27胃癌细胞系进行实验验证 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
2531 2025-12-21
In situ DC-primed vaccine combined with CD137 agonist elicits long-lasting antitumor immunity through cDC1-mediated tumor antigen-specific CD8+ T cell responses
2025-Dec-12, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究评估了原位DC启动疫苗与CD137激动剂联合疗法在小鼠肺癌和结肠癌模型中的抗肿瘤效果及免疫机制 首次揭示了该联合疗法通过cDC1介导的肿瘤抗原特异性CD8+ T细胞反应建立持久抗肿瘤免疫的新机制,并发现其对调节性T细胞的功能重塑作用 研究基于小鼠模型,临床转化效果尚需验证;单细胞测序样本量有限,需扩大验证 探索癌症免疫治疗中新型联合疗法的抗肿瘤免疫机制 小鼠肺癌和结肠癌模型中的免疫细胞(CD8+ T细胞、cDC1、Tregs等) 免疫学 肺癌, 结肠癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 植入性小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2532 2025-12-21
Immunoregulatory Roles of Tumor-Originated Pericytes Identified by Single-Cell Analysis in Glioblastoma
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析人原发胶质母细胞瘤中的周细胞,揭示了肿瘤来源周细胞的存在及其在调节肿瘤相关巨噬细胞极化和促进肿瘤生长中的免疫调节作用 首次在胶质母细胞瘤中通过单细胞分析区分出肿瘤来源周细胞和正常来源周细胞,并发现CD44标记的周细胞亚群与肿瘤相关巨噬细胞密切相关,具有促进M2极化和肿瘤生长的功能 NA 阐明胶质母细胞瘤中周细胞的起源、功能异质性及其免疫调节作用 人原发胶质母细胞瘤样本中的CD146阳性周细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 人原发胶质母细胞瘤样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2533 2025-12-21
Extracellular Vesicle-Packaged circTAX1BP1 from Cancer-Associated Fibroblasts Regulates RNA m6A Modification through Lactylation of VIRMA in Colorectal Cancer Cells
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞(CAFs)来源的细胞外囊泡(EVs)中circTAX1BP1通过VIRMA的乳酰化调控RNA m6A修饰,从而促进结直肠癌肝转移(CRLM)的分子机制 首次发现CAFs来源的EVs中circTAX1BP1通过招募AARS2促进VIRMA的乳酰化,进而增强SP1 mRNA的m6A修饰和稳定性,形成CRC细胞与ITGA11 myCAFs亚群之间的正反馈环路 研究主要基于体外和体内模型,临床样本验证有限,且PDX模型中的联合阻断策略需进一步临床前评估 阐明结直肠癌肝转移(CRLM)中肿瘤细胞与癌症相关成纤维细胞(CAFs)相互作用的分子机制 结直肠癌(CRC)细胞、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、细胞外囊泡(EVs)、circTAX1BP1、VIRMA蛋白、SP1转录因子 肿瘤生物学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、体内外功能实验、患者来源异种移植(PDX)模型 NA 测序数据、实验数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2534 2025-12-21
Associations of Plasma Metabolite Phenylacetylglutamine on Coronary Plaque Characterization in Patients with ST-Segment Elevation Myocardial Infarction
2025-Dec, Cardiovascular toxicology IF:3.4Q2
研究论文 本研究探讨了肠道菌群代谢物苯乙酰谷氨酰胺(PAGln)与ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者罪犯斑块特征之间的关联 首次揭示了PAGln浓度与易损斑块特征独立相关,并通过单细胞RNA测序发现巨噬细胞可能参与此过程 研究为观察性设计,无法确定因果关系;样本仅来自STEMI患者,结果可能不适用于其他人群 探究血浆PAGln水平与STEMI患者罪犯斑块特征之间的关系 ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者 心血管疾病研究 心血管疾病 光学相干断层扫描(OCT),单细胞RNA测序,生物信息学分析 逻辑回归模型 血浆代谢物数据,OCT影像数据,单细胞RNA测序数据 776名接受OCT成像的STEMI患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2535 2025-12-21
Effect of acupuncture on brain microenvironment in rats with post-stroke limb spasticity based on single-cell transcriptome sequencing technology
2025-Dec, Journal of traditional Chinese medicine = Chung i tsa chih ying wen pan
研究论文 本研究基于单细胞转录组测序技术,探讨了针刺对脑卒中后肢体痉挛大鼠脑微环境的影响及其可能机制 首次结合单细胞转录组测序技术研究针刺改善脑卒中后肢体痉挛的细胞类型比例变化及关键差异基因 研究仅在大鼠模型中进行,样本量有限,且未进行长期随访观察 探究针刺改善脑卒中后肢体痉挛的可能机制 大脑中动脉闭塞模型大鼠 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组测序,Western blot,实时定量聚合酶链反应,酶联免疫吸附测定 NA 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,基因表达数据 32只大鼠,分为对照组、假手术组、模型组和针刺组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2536 2025-12-21
Exploring Functionally Enhanced BLP-Trained Macrophage Subpopulations in S. Aureus Infection: Underlying Mechanisms and Therapeutic Significance
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析BLP训练巨噬细胞在金黄色葡萄球菌感染中的转录组特征,揭示其增强抗感染能力的机制 首次在单细胞水平鉴定出BLP训练诱导的两个新巨噬细胞亚群C5和C7,并阐明其通过NRF2信号通路和代谢重编程增强抗感染功能的机制 研究主要基于小鼠模型,临床转化潜力需进一步评估 探究BLP训练巨噬细胞增强抗感染能力的分子机制及其治疗潜力 小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) 单细胞组学 败血症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2537 2025-12-21
Idiopathic Pulmonary Fibrosis: Cellular Heterogeneity, Mechanisms, and Therapeutic Implications
2025-Dec, MedComm IF:10.7Q1
综述 本文综述了特发性肺纤维化(IPF)的细胞异质性、致病机制及治疗意义,整合了单细胞RNA测序和空间转录组学的最新发现 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示IPF中关键致病细胞群及其信号串扰,提出多维数据合成的细胞分子框架 IPF的动态细胞间网络和时空调控机制仍不明确,致病机制尚未完全理解 阐明IPF的致病机制,为生物标志物引导的精准治疗提供概念基础 特发性肺纤维化(IPF)及其纤维化微环境中的上皮细胞、间充质细胞、免疫细胞和血管细胞 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2538 2025-12-21
Immune-modulating effects on tumor-draining lymph nodes of neoadjuvant chemoradiotherapy combined with dual immunotherapy in patients with T3-4N0-2 NSCLC
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了在T3-4N0-2非小细胞肺癌患者中,新辅助放化疗联合双重免疫疗法对肿瘤引流淋巴结的免疫调节作用 结合空间转录组学和免疫组织化学分析,首次系统研究了新辅助放化疗联合双重免疫疗法对肿瘤引流淋巴结的免疫调节效应,特别是在不同辐射剂量下的影响 研究为观察性队列设计,样本量有限(每组25例),且仅针对特定亚型的非小细胞肺癌患者,结果可能无法推广到其他癌症类型或治疗组合 评估新辅助放化疗联合双重免疫疗法对肿瘤引流淋巴结免疫功能的调节作用 T3-4N0-2非小细胞肺癌患者的肿瘤引流淋巴结 数字病理学 肺癌 空间转录组学, 免疫组织化学 NA 空间转录组数据, 免疫组织化学图像 50例患者(INCREASE试验组25例,匹配对照组25例) NA 空间转录组学 GeoMx GeoMx空间转录组学分析平台,用于CD8/Ki67+T细胞热点区域的转录组分析
2539 2025-12-21
Spatially organized cellular communities shape functional tissue architecture in the pancreas
2025-Nov-14, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究结合单细胞和空间转录组学技术,绘制了小鼠胰腺从胚胎发育到成年稳态的细胞群体空间时间图谱 首次结合单细胞和空间转录组学解析胰腺细胞类型的空间异质性,并发现上皮-间充质单元作为基本组织微环境 研究主要基于小鼠模型,人类模型验证有限 揭示胰腺细胞如何通过空间组织形成功能性组织结构 小鼠和人类胰腺组织 空间转录组学 胰腺疾病 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2540 2025-12-21
scHLens: a web server for hierarchically and interactively exploring single cell RNA-seq data
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了一个名为scHLens的交互式网络服务器,用于分层探索单细胞RNA测序数据 开发了支持用户自定义分析流程和分层探索模式的交互式网络服务器,解决了现有方法在界面友好性、流程灵活性和细胞亚型识别方面的不足 未在摘要中明确说明 降低单细胞RNA测序数据分析的技术门槛,提高细胞异质性识别的灵活性 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部