单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27897 篇文献，本页显示第 25361 - 25380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25361 | 2024-08-09 |
"Zooming in" on Glioblastoma: Understanding Tumor Heterogeneity and its Clinical Implications in the Era of Single-Cell Ribonucleic Acid Sequencing
2021-02-16, Neurosurgery
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/neuros/nyaa305
PMID:32674143
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术深入探讨了胶质母细胞瘤的异质性及其临床意义 | 引入了单细胞RNA测序技术，以更详细地理解胶质母细胞瘤的异质性 | NA | 探讨胶质母细胞瘤的异质性及其对个性化医疗的影响 | 胶质母细胞瘤的基因组和转录组异质性 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25362 | 2024-08-09 |
Immune cell infiltration features and related marker genes in lung cancer based on single-cell RNA-seq
2021-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-020-02435-2
PMID:32656582
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了肺癌中的免疫细胞浸润特征及相关标记基因 | 揭示了肺癌组织与正常组织中免疫细胞类型的显著差异 | NA | 分析肺癌免疫微环境中免疫细胞的浸润特征及相关标记基因 | 肺癌细胞及其免疫微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,485个肺癌细胞 |
| 25363 | 2024-08-09 |
Weighted gene co-expression network analysis can sort cancer-associated fibroblast-specific markers promoting bladder cancer progression
2021-02, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.29939
PMID:32657439
|
研究论文 | 本文通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）研究了膀胱尿路上皮癌（BLCA）中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的特定基因表达模块，这些基因与癌症进展和生存状态相关 | 首次在膀胱尿路上皮癌中应用WGCNA分析CAFs的特定基因表达模块，并确定了15个关键基因作为BLCA特异性CAF标记 | NA | 探讨CAFs在膀胱尿路上皮癌进展中的作用及其特定基因标记 | 膀胱尿路上皮癌中的癌症相关成纤维细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25364 | 2024-08-09 |
Lessons from single cell sequencing in CNS cell specification and function
2020-12, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2020.05.043
PMID:32679535
|
review | 本文综述了单细胞RNA测序技术在中枢神经系统（CNS）细胞特化和功能研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术提高了对CNS细胞类型的分辨率，并揭示了它们的发展轨迹和物种间的多样性变化 | NA | 探讨单细胞基因组学时代的优势、创新和挑战，以及它如何影响我们对神经发育和神经功能的理解 | 中枢神经系统（CNS）中的神经元、星形胶质细胞和少突胶质细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25365 | 2024-08-09 |
Hemolysis transforms liver macrophages into antiinflammatory erythrophagocytes
2020-10-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI137282
PMID:32663195
|
研究论文 | 研究通过遗传性球形红细胞增多症的小鼠模型和单细胞RNA测序，发现溶血过程中肝脏巨噬细胞吞噬受损红细胞后转变为抗炎性红细胞吞噬细胞，从而减轻炎症性疾病的表现。 | 首次定义了MarcohiHmoxhiMHC class IIlo红细胞吞噬细胞的抗炎表型，并揭示了NFE2L2/NRF2转录因子在调控这一过程中的关键作用。 | NA | 探究溶血过程中肝脏巨噬细胞功能的变化及其在炎症性疾病中的作用。 | 肝脏巨噬细胞、红细胞吞噬细胞、炎症性疾病模型。 | 免疫学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类巨噬细胞 |
| 25366 | 2024-08-09 |
Harnessing Expressed Single Nucleotide Variation and Single Cell RNA Sequencing To Define Immune Cell Chimerism in the Rejecting Kidney Transplant
2020-09, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020030326
PMID:32669324
|
研究论文 | 本文利用单核苷酸变异和单细胞RNA测序技术，定义了移植肾脏中的免疫细胞嵌合现象 | 通过分析单细胞RNA测序数据中的表达单核苷酸变异，准确区分了供体和受体的免疫细胞来源，并能在单细胞分辨率下研究转录组特征 | NA | 探究移植肾脏中供体来源的免疫细胞是否持续存在及其在排斥反应中的作用 | 人类移植肾脏活检核心样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | DNA序列 | 81,139个细胞 |
| 25367 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in breast cancer: Understanding tumor heterogeneity and paving roads to individualized therapy
2020-08, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12078
PMID:32654419
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在乳腺癌研究中的应用，探讨了其在解析肿瘤异质性和个性化治疗方面的潜力 | scRNA-seq技术通过提高灵敏度、准确性和效率，以及高吞吐量的单细胞分离方法，为解析细胞群体的异质性和探索与肿瘤发生和转移相关的稀有细胞类型提供了优势 | 当前scRNA-seq技术在乳腺癌治疗选择研究中应用有限，且存在一些技术问题需要克服 | 探讨scRNA-seq技术在乳腺癌研究中的应用，包括肿瘤异质性分析和个性化治疗 | 乳腺癌细胞群体和肿瘤微环境中的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 25368 | 2024-08-09 |
Complex Genetics in Pancreatitis: Insights Gained From a New Candidate Locus Panel
2020-08, Pancreas
IF:1.7Q3
DOI:10.1097/MPA.0000000000001612
PMID:32658084
|
研究论文 | 本研究通过使用新的DNA测序面板评估100名胰腺炎患者，探索胰腺炎的复杂遗传机制 | 提出了一个新的非孟德尔遗传风险/病因范式，其中非致病性遗传风险变异在易感基因组和损伤/功能障碍反应基因中的组合导致获得性胰腺疾病 | NA | 探索胰腺炎的遗传因素及其在胰腺腺泡细胞和导管细胞中的作用 | 胰腺炎患者及其遗传变异 | 遗传学 | 胰腺炎 | DNA测序 | NA | 基因数据 | 100名胰腺炎患者 |
| 25369 | 2024-08-09 |
Persistence of a regeneration-associated, transitional alveolar epithelial cell state in pulmonary fibrosis
2020-08, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-0542-8
PMID:32661339
|
研究论文 | 本研究利用肺类器官、多种体内修复模型、单细胞转录组学和谱系追踪技术，发现肺泡II型上皮细胞在分化为I型细胞的过程中，会获得预肺泡I型过渡细胞状态（PATS），并在终末成熟过程中经历广泛的拉伸，使其易受DNA损伤。 | 本研究首次揭示了肺泡II型上皮细胞在分化过程中的过渡状态PATS，并发现其在肺纤维化中的异常积累。 | NA | 研究肺泡上皮细胞在损伤修复过程中的过渡状态及其在疾病中的作用。 | 肺泡II型上皮细胞的分化过程及其在肺纤维化中的表现。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | NA |
| 25370 | 2024-08-09 |
Cell shape: effects on gene expression and signaling
2020-Aug, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-020-00722-4
PMID:32671813
|
综述 | 本文综述了细胞形状对基因表达和信号传导的影响，特别是通过单细胞捕获和RNA测序技术在心肌细胞中的应用 | 介绍了新的单细胞捕获策略和单细胞RNA测序技术，用于分析不同几何形态的心肌细胞的转录组 | NA | 探讨细胞形状与基因表达之间的关系及其在生物学和疾病治疗中的潜在应用 | 心肌细胞的形状及其对基因表达的影响 | 生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25371 | 2024-08-09 |
New light on cortical neuropeptides and synaptic network plasticity
2020-08, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2020.04.002
PMID:32679509
|
研究论文 | 本文探讨了皮质神经肽及其在皮质突触网络可塑性中的作用 | 利用单细胞RNA测序转录组学的新发现揭示了皮质神经肽信号基因表达的复杂模式，并介绍了新的工具以增强对皮质神经肽信号的分子访问 | NA | 探索神经肽和突触网络相互作用在皮质功能和可塑性中的作用 | 皮质神经肽及其在皮质突触网络中的功能 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 25372 | 2024-08-09 |
Single-cell and spatial transcriptomics approaches of cardiovascular development and disease
2020-Aug, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:32684243
|
综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在心血管发育和疾病研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学技术在识别罕见和新型细胞类型以及描述正常和病理条件下转录变异方面的进展 | NA | 探讨单细胞和空间转录组学技术如何促进我们对心血管发育和疾病的理解 | 心血管发育和疾病中的细胞异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 25373 | 2024-08-09 |
RNA Identification of PRIME Cells Predicting Rheumatoid Arthritis Flares
2020-07-16, The New England journal of medicine
DOI:10.1056/NEJMoa2004114
PMID:32668112
|
研究论文 | 本文通过纵向RNA测序研究类风湿性关节炎发作前的分子事件，发现PRIME细胞在发作前出现在血液中，并提出这些细胞在发作前几周被B细胞激活并迁移到滑膜的模型。 | 首次通过纵向RNA测序识别出在类风湿性关节炎发作前血液中出现的PRIME细胞，并提出其与B细胞激活和迁移至滑膜的机制。 | 研究样本量相对较小，仅包括四名患者，可能影响结果的普遍性。 | 探究类风湿性关节炎发作前的分子事件及其机制。 | 类风湿性关节炎患者的血液样本和滑膜组织。 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | RNA测序 | NA | RNA | 364个时间点的样本来自一名患者，235个时间点的样本来自三名额外患者，以及19名额外患者的验证样本。 |
| 25374 | 2024-08-09 |
Seamless integration of image and molecular analysis for spatial transcriptomics workflows
2020-Jul-14, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-06832-3
PMID:32664861
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为STUtility的R包，用于处理和分析10x Genomics Visium平台的空间转录组数据，并提供3D可视化功能 | STUtility是首个允许用户处理图像、对齐堆叠实验并最终在3D中可视化以创建组织整体视图的软件 | NA | 开发一个软件工具，用于无缝集成图像和分子分析，以支持空间转录组工作流程 | 10x Genomics Visium平台的空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像和RNA测序数据 | 多个组织切片 |
| 25375 | 2024-08-09 |
Multiomics Investigation Revealing the Characteristics of HIV-1-Infected Cells In Vivo
2020-07-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107887
PMID:32668246
|
研究论文 | 本文通过多组学实验揭示了体内HIV-1感染细胞的多种特征 | 使用造血干细胞移植的人源化小鼠模型和最近开发的技术进行多组学实验，揭示了HIV-1感染细胞的特征和异质性 | NA | 阐明体内HIV-1感染细胞的详细特征和异质性，为HIV-1治愈方法的开发提供线索 | 体内HIV-1感染细胞的特征 | NA | HIV-1感染 | 多组学实验 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 使用造血干细胞移植的人源化小鼠模型 |
| 25376 | 2024-08-09 |
PhISCS-BnB: a fast branch and bound algorithm for the perfect tumor phylogeny reconstruction problem
2020-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa464
PMID:32657358
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为PhISCS-BnB的分支定界算法，用于从单细胞测序（SCS）数据中提取的基因型矩阵计算最可能的完美肿瘤系统发育 | PhISCS-BnB算法不仅提供了最优性保证，而且在模拟的肿瘤SCS数据上比现有最佳方法快10-100倍 | NA | 开发一种能够处理新兴SCS数据规模和噪声特征的新方法，以充分利用这项技术 | 肿瘤系统发育重建 | 生物信息学 | 皮肤癌 | 单细胞测序（SCS） | 分支定界算法 | 基因型矩阵 | 涉及20个克隆和2367个突变的大型黑色素瘤数据集 |
| 25377 | 2024-08-09 |
Identification of conserved evolutionary trajectories in tumors
2020-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa453
PMID:32657374
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CONETT的组合优化方法，用于检测肿瘤中的重复进化轨迹，并构建了基于肿瘤样本中改变事件时间顺序的保守进化轨迹的共识树 | 提出了一种新的组合优化方法CONETT，用于识别肿瘤中的重复进化轨迹 | NA | 旨在从肿瘤活检测序数据中推断肿瘤的亚克隆组成和进化历史 | 多区域、时间序列和单细胞测序数据中的肿瘤进化特征 | 生物信息学 | 肾细胞癌，非小细胞肺癌 | 测序 | 组合优化方法 | 测序数据 | 100例肾透明细胞癌和99例非小细胞肺癌患者 |
| 25378 | 2024-08-09 |
A Bayesian framework for inter-cellular information sharing improves dscRNA-seq quantification
2020-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa450
PMID:32657394
|
研究论文 | 本文介绍了一种贝叶斯框架，通过细胞间的信息共享来改进dscRNA-seq数据的基因定量估计 | 引入了一种基于锚点的方法来连接具有相似基因表达模式的细胞，并学习了提供给alevin基因多重映射分辨算法的经验性先验，从而改进了没有唯一映射读取的基因的定量估计 | NA | 改进dscRNA-seq数据的基因定量估计 | dscRNA-seq数据的基因定量估计 | 数字病理学 | NA | dscRNA-seq | 贝叶斯框架 | dscRNA-seq数据 | 多种模拟和真实数据集 |
| 25379 | 2024-08-09 |
BIRD: identifying cell doublets via biallelic expression from single cells
2020-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa474
PMID:32657402
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为BIRD的流程，通过单细胞转录组数据中的杂合遗传变异来识别双细胞 | 利用单等位基因与双等位基因表达的比例作为区分双细胞的特征，这一方法在识别具有相同遗传背景的细胞混合物中的双细胞方面具有创新性 | BIRD的性能受实验方法、单倍型间的基因组多样性、序列覆盖度和深度等因素的影响 | 开发一种新的方法来识别和估计单细胞实验数据中的双细胞污染 | 单细胞转录组数据中的双细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 转录组数据 | 163个初级成纤维细胞单细胞和约13,300个单细胞的外周血细胞 |
| 25380 | 2024-08-09 |
TinGa: fast and flexible trajectory inference with Growing Neural Gas
2020-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa463
PMID:32657409
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为TinGa的新型轨迹推断模型，该模型基于Growing Neural Graphs，具有快速和灵活的特点 | TinGa模型在各种复杂度的数据集上都能产生准确的模型，并且在执行时间上表现最快 | NA | 开发一种新的轨迹推断方法，以改进现有的细胞发育动态模型 | 细胞发育动态的轨迹推断 | 单细胞转录组学 | NA | Growing Neural Graphs | Growing Neural Gas | 数据集 | 250个数据集，包括合成数据和真实数据 |