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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25141 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Roles of Fibroblasts During Intestinal Injury and Repair in Rats with Severe Acute Pancreatitis
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S436511
PMID:38107381
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了严重急性胰腺炎大鼠模型中肠道损伤与修复过程中细胞异质性和组成的分子机制 | 发现纤维母细胞通过细胞间通讯影响肠道损伤与修复,并揭示了RNA结合蛋白在纤维母细胞功能中的潜在作用 | NA | 探索肠道损伤与治疗的分子机制 | 严重急性胰腺炎大鼠模型的肠道组织 | 数字病理学 | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三组实验,包括健康对照组、模型组和治疗组的大鼠肠道组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 25142 | 2024-08-07 |
Precursors of human CD4+ cytotoxic T lymphocytes identified by single-cell transcriptome analysis
2018-01-19, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aan8664
PMID:29352091
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析,揭示了人类CD4+细胞毒性T淋巴细胞(CD4-CTL)的异质性、转录谱和克隆性 | 首次在人类中识别出CD4-CTL前体细胞群体,并探讨了其与CD4-CTL效应细胞的关系 | NA | 研究CD4-CTL的生物学特性及其在人类中的生成机制 | 人类CD4+细胞毒性T淋巴细胞及其前体细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过9000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 25143 | 2024-08-07 |
Single-Cell Profiling Indicates a Proinflammatory Role of Meningeal Ectopic Lymphoid Tissue in Experimental Autoimmune Encephalomyelitis
2024-Jan, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200185
PMID:38100739
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术,比较了脑膜异位淋巴组织(mELT)与次级淋巴器官(SLOs)在自发性慢性实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)中的基因表达谱,揭示了mELT在多发性硬化症进展中的关键作用 | 首次揭示了脑膜异位淋巴组织(mELT)在实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)中的促炎作用,并提出了mELT可能是中枢神经系统炎症的关键驱动因素 | 研究仅限于动物模型,尚未在人类多发性硬化症患者中验证 | 探究多发性硬化症进展的机制及如何预防 | 脑膜异位淋巴组织(mELT)与次级淋巴器官(SLOs)中的免疫细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25144 | 2024-08-07 |
Empagliflozin targets Mfn1 and Opa1 to attenuate microglia-mediated neuroinflammation in retinal ischemia and reperfusion injury
2023-Dec-12, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02982-9
PMID:38082266
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研究论文 | 本研究评估了抗糖尿病药物恩格列净(EMPA)在视网膜缺血再灌注损伤中的治疗效果,发现其通过调节Mfn1和Opa1基因表达来减轻由小胶质细胞介导的神经炎症 | 本研究首次揭示了EMPA通过下调NLRP3信号通路和上调线粒体融合相关基因Mfn1和Opa1的表达,来恢复线粒体动态平衡,从而减轻视网膜缺血再灌注损伤中的神经炎症 | NA | 评估EMPA在视网膜缺血再灌注损伤中的治疗效果 | 视网膜缺血再灌注损伤中的神经炎症和线粒体功能障碍 | NA | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 小鼠模型,体外实验使用BV2小胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 25145 | 2024-08-05 |
SingleScan: a comprehensive resource for single-cell sequencing data processing and mining
2023-Dec-07, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05590-9
PMID:38062357
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研究论文 | 本研究开发了一个名为SingleScan的在线资源,以便更便捷地获取单细胞测序方法和数据处理流程的详细信息 | 提供了分类的单细胞转录组/基因组分析工具和流程,并总结了单细胞数据分析的典型工作流程 | 尚未提及特定的实验验证或工具有效性的评估 | 旨在为研究人员提供一个便利用于单细胞测序数据处理的资源 | 该资源旨在帮助没有计算经验的研究人员进入单细胞测序领域 | 数字病理 | NA | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25146 | 2024-08-07 |
The role of single-cell RNA sequencing in cardiac tumour - a case report
2023-Dec, JPMA. The Journal of the Pakistan Medical Association
DOI:10.47391/JPMA.7776
PMID:38083933
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病例报告 | 本文报告了一例65岁女性心脏肿瘤患者的病例,通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析肿瘤性质 | 使用scRNA-seq技术分析心脏肿瘤的生长模式,有助于区分肿瘤的性质 | NA | 探讨单细胞RNA测序在心脏肿瘤中的应用 | 心脏肿瘤的细胞成分及相关的信号通路 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 一例心脏肿瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 25147 | 2024-08-05 |
Isolation, Purification, and Application of Protoplasts and Transient Expression Systems in Plants
2023-Nov-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242316892
PMID:38069215
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综述 | 本文提供了原生质体的分离、纯化及其瞬时表达系统在植物中的应用的全面概述 | 文章创新性地总结了原生质体在多种植物物种中的应用及其分离和瞬时表达系统的建立 | 文章未具体涉及不同植物物种在原生质体应用中的具体差异 | 旨在为植物科学社区提供关于原生质体分离和瞬时表达系统建立的有效资源 | 研究原生质体及其在植物中的应用 | 植物生物技术 | NA | 原生质体分离和瞬时表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25148 | 2024-08-07 |
Integrative Analysis of Machine Learning and Molecule Docking Simulations for Ischemic Stroke Diagnosis and Therapy
2023-Nov-22, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules28237704
PMID:38067435
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研究论文 | 本研究利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和maSigPro R包确定与中风相关的基因模块和时间依赖性基因,结合三种机器学习算法识别中风特征基因,并构建诺模图模型评估中风患者。通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析中风中的小胶质细胞亚群,利用RNA速度、伪时间和基因集富集分析(GSEA)研究小胶质细胞亚群的关系,并通过连接图(CMap)分析和分子对接筛选中风的治疗药物。 | 本研究首次结合机器学习算法和分子对接模拟,构建了用于中风诊断的诺模图模型,并筛选出潜在的治疗分子AZ_628。 | NA | 研究中风的诊断和治疗方法 | 中风及其相关基因和小胶质细胞亚群 | 机器学习 | 中风 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接 | 诺模图模型 | 基因数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25149 | 2024-08-07 |
Mapping and Validation of scRNA-Seq-Derived Cell-Cell Communication Networks in the Tumor Microenvironment
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.885267
PMID:35572582
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术推断细胞间通信网络的方法,并讨论了这些方法如何促进肿瘤微环境(TME)中免疫治疗干预的研究 | 介绍了将scRNA-seq衍生的交互网络与现有实验和计算方法整合的策略,以增强对TME中免疫抑制和免疫治疗改变信号的研究 | 验证假设的细胞间交互作用仍是一个中心挑战 | 探讨scRNA-seq技术在肿瘤微环境中细胞间通信网络的推断及其在免疫治疗中的应用 | 单细胞RNA测序技术及其在肿瘤微环境中细胞间通信的推断 | 生物信息学 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25150 | 2024-08-05 |
Glycolysis regulation in tumor-associated macrophages: Its role in tumor development and cancer treatment
2024-Feb-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34711
PMID:37688376
|
研究论文 | 本文回顾了肿瘤相关巨噬细胞中糖代谢的现状,并总结了不同亚型的代谢特征 | 从单细胞组学的角度对肿瘤相关巨噬细胞的代谢特征进行了综合总结,探讨了糖酵解在肿瘤发展及治疗中的作用 | 对肿瘤相关巨噬细胞代谢特征的总结还不够全面,尚未深入探讨糖流对肿瘤进展的具体影响 | 研究肿瘤相关巨噬细胞中的糖代谢对肿瘤发展及癌症治疗的影响 | 肿瘤相关巨噬细胞及其不同亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25151 | 2024-08-07 |
Targeted single-cell RNA sequencing analysis reveals metabolic reprogramming and the ferroptosis-resistant state in hematologic malignancies
2023-Dec, Cell biochemistry and function
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/cbf.3869
PMID:37823726
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)与靶向致癌基因面板,对急性髓系白血病进行转录组测序,揭示了血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态 | 本研究克服了scRNA-seq在检测致癌突变方面的局限性,通过靶向方法识别了骨髓样本中每种细胞类型的致癌IDH1、IDH2和KRAS突变分布 | NA | 探讨血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态的机制 | 急性髓系白血病患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 多个患者的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 25152 | 2024-08-07 |
Integrated single cell transcriptome sequencing analysis reveals species-specific genes and molecular pathways for pig spermiogenesis
2023-Dec, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14493
PMID:37874861
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研究论文 | 本文通过综合睾丸单细胞RNA测序分析,比较了人类和猪的精子发生过程,特别是精子形成阶段,揭示了物种特异性的基因和分子通路 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了猪和人类的精子形成过程,识别了特定类型的精子细胞的标记基因和分子通路 | NA | 研究人类和猪的精子形成过程中特异性的基因和分子通路 | 人类和猪的精子形成过程 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列 | 人类和猪的睾丸细胞被分为26个不同的组 | NA | NA | NA | NA |
| 25153 | 2024-08-07 |
Distinct mononuclear diploid cardiac subpopulation with minimal cell-cell communications persists in embryonic and adult mammalian heart
2023-Oct, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-0987-9
PMID:37294383
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞(MNDCMs)的异质性及其在发育过程中的变化 | 揭示了一种新的非增殖性MNDCM亚群,该亚群具有最小的细胞间通讯,并强调了微环境对心肌细胞成熟过程中命运的重要性 | NA | 阐明单核二倍体心肌细胞的异质性及其在心脏发育过程中的变化 | 胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12645个心脏细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 25154 | 2024-08-05 |
[Advances of spatial omics in the individualized diagnosis and treatment of head and neck cancer]
2023-Sep, Lin chuang er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Journal of clinical otorhinolaryngology, head, and neck surgery
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研究论文 | 本文总结了空间组学在头颈癌诊断和治疗中的最新进展 | 介绍了空间组学如何弥补单细胞测序技术无法获取细胞空间分布信息的缺陷 | NA | 探讨空间组学在头颈癌中的应用进展 | 头颈癌的病理机制、靶点探索和药物开发 | 数字病理学 | 头颈癌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25155 | 2024-08-07 |
Multilineage contribution of CD34+ cells in cardiac remodeling after ischemia/reperfusion injury
2023-05-05, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-00981-8
PMID:37147443
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和可诱导的Cd34谱系追踪小鼠模型,探讨了Cd34细胞在心脏重塑中的生物学功能及其对心脏重塑的净效应 | 本研究首次揭示了Cd34细胞在心脏重塑过程中的多谱系贡献,并阐明了其在心脏纤维化、血管新生和炎症反应中的具体作用 | NA | 旨在阐明异质性Cd34细胞群的生物学功能,并研究Cd34细胞干预对心脏重塑的净效应 | Cd34细胞在心脏重塑中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人和小鼠的缺血心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 25156 | 2024-08-07 |
Ploidy-stratified single cardiomyocyte transcriptomics map Zinc Finger E-Box Binding Homeobox 1 to underly cardiomyocyte proliferation before birth
2023-03-02, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-00979-2
PMID:36862248
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,研究了出生前后心肌细胞的转录组变化,特别是锌指E盒结合同源盒1(ZEB1)在心肌细胞增殖中的作用 | 首次揭示了ZEB1在心肌细胞增殖和内复制中的关键作用,并提供了高分辨率的心肌细胞单细胞转录组图谱 | 研究仅限于小鼠模型,且样本量相对较小 | 识别出生前后心肌细胞增殖和终末分化相关的转录因子 | 心肌细胞的转录组和增殖机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 来自发育中(E16.5、P1和P5)小鼠心脏的固定心肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 25157 | 2024-08-05 |
Somatosensory neurons express specific sets of lincRNAs, and lincRNA CLAP promotes itch sensation in mice
2023-02-06, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202154313
PMID:36524339
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研究论文 | 这篇文章探讨了体感神经元中特定类型的长非编码RNA(lincRNAs)的分布及其在痒感中的作用 | 首次揭示了特定类型的lincRNAs在体感神经元中的丰富性及其与痒感的关系 | 对lincRNAs在其他神经元类型中的作用尚未进行探索 | 研究体感神经元中特定lincRNAs的分布及其在感觉传递中的功能 | 小鼠的体感神经元及其特定类型的lincRNAs | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和Smart-seq2全长测序 | NA | RNA数据 | 分析了位于背根神经节(DRG)的单个神经元中的200个lincRNAs | NA | NA | NA | NA |
| 25158 | 2024-08-07 |
Decoding the Spermatogenesis Program: New Insights from Transcriptomic Analyses
2022-11-30, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了精细的细胞图谱,揭示了测试中已知和新型细胞类型及其功能状态,为跨物种比较提供了参考系统 | 利用单细胞RNA测序技术提供了对测试细胞类型多样性和分子特征的深入见解,并构建了精细的细胞图谱 | 目前缺乏高分辨率数据来探索组织环境中生殖细胞与体细胞的相互作用 | 旨在通过单细胞研究提高对配子发生机制的理解,以探索不孕的潜在原因并开发新的治疗干预措施 | 研究对象为精子的发生过程及其细胞和分子特征 | NA | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 25159 | 2024-08-07 |
As in Real Estate, Location Matters: Cellular Expression of Complement Varies Between Macular and Peripheral Regions of the Retina and Supporting Tissues
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.895519
PMID:35784369
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研究论文 | 本研究通过基因表达分析、质谱分析和免疫组织化学方法,探讨了视网膜和脉络膜细胞类型在决定补体稳态中的作用,特别是在年龄相关性黄斑变性(AMD)中的作用 | 本研究发现早期AMD中,脉络膜中的成纤维细胞、周细胞和内皮细胞对补体反应更为强烈;晚期AMD中,视网膜中补体变化更为显著,尤其是经典途径启动子的表达。此外,研究还揭示了这些差异的空间偏好性 | NA | 探讨视网膜和脉络膜细胞类型在决定补体稳态中的作用,特别是在年龄相关性黄斑变性(AMD)中的作用 | 视网膜和脉络膜细胞类型 | NA | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、质谱分析、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25160 | 2024-08-07 |
Cell Type Catalog of Middle Turbinate Epithelium (Cell Catalog of Turbinate Epithelium)
2023 Oct-Dec, OTO open
IF:1.8Q2
DOI:10.1002/oto2.91
PMID:38093720
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术创建了人类中鼻甲黏膜的首个单细胞转录组目录 | 首次为中鼻甲黏膜创建了单细胞转录组目录 | NA | 揭示健康中鼻甲上皮的细胞层级基因表达谱,为鼻窦疾病的分子发病机制和靶向治疗研究奠定基础 | 中鼻甲黏膜的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自一名健康志愿者的中鼻甲头部样本 | NA | NA | NA | NA |