单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 25021 - 25040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25021 | 2024-08-09 |
Agonist-induced functional analysis and cell sorting associated with single-cell transcriptomics characterizes cell subtypes in normal and pathological brain
2020-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.262717.120
PMID:32973039
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研究论文 | 本文开发了激动剂诱导的功能分析和细胞分选（aiFACS）技术，结合单细胞转录组学，用于分析正常和病理脑组织中的细胞亚型 | aiFACS技术允许实时记录和分选细胞，根据其对刺激的即时和个体反应，结合单细胞转录组学构建基于细胞特定药理反应的功能组织图谱 | NA | 深入了解细胞与其环境之间的动态相互作用 | 正常和病理脑组织中的细胞亚型 | 数字病理学 | NA | aiFACS | NA | 转录组 | 使用分离的小鼠脑组织，以及来自脆弱X综合征模型小鼠脑的中间神经元 |
| 25022 | 2024-08-09 |
Onco-fetal Reprogramming of Endothelial Cells Drives Immunosuppressive Macrophages in Hepatocellular Carcinoma
2020-10-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.08.040
PMID:32976798
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细描述了从发育到疾病的人类肝脏细胞图谱，并揭示了肝细胞癌中肿瘤微环境的胎儿样重编程现象 | 首次报道了肝细胞癌中存在与胎儿肝脏相似的免疫抑制性胎儿癌生态系统，并提供了新的治疗干预靶点 | NA | 探索肝细胞癌中肿瘤微环境的胎儿样重编程现象及其机制 | 人类胎儿、肝细胞癌及小鼠肝脏的细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 约212,000个细胞 |
| 25023 | 2024-08-09 |
Genetic landscape and autoimmunity of monocytes in developing Vogt-Koyanagi-Harada disease
2020-10-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2002476117
PMID:32989127
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研究论文 | 本研究利用先进的单细胞RNA测序技术，系统分析了11,259个人类循环单核细胞，并对其亚群进行了遗传学定义，揭示了Vogt-Koyanagi-Harada疾病相关单核细胞的精确分类、分子标记和信号通路 | 本研究首次揭示了两个先前未知的单核细胞亚群：HLA和巨核细胞样单核细胞亚群，并发现了与疾病相关的促炎单核细胞亚群，其基因表达特征指示炎症、抗病毒活性和病理性激活状态 | NA | 研究Vogt-Koyanagi-Harada疾病中单核细胞的遗传图谱和自身免疫机制 | 人类循环单核细胞及其在Vogt-Koyanagi-Harada疾病中的作用 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,259个人类循环单核细胞 |
| 25024 | 2024-08-09 |
Nanoparticle enhanced combination therapy for stem-like progenitors defined by single-cell transcriptomics in chemotherapy-resistant osteosarcoma
2020-09-25, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-020-00248-x
PMID:32973147
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，系统地绘制了化疗耐药性骨肉瘤肿瘤中细胞类型特异性基因表达图谱，并探讨了纳米颗粒增强的组合疗法对耐药性骨肉瘤的治疗效果 | 本研究首次揭示了化疗耐药性骨肉瘤中VEGFR2-JMJD3富集的静止干细胞样细胞亚群，并发现VEGFR2抑制剂和JMJD3抑制剂的协同作用能有效抑制骨肉瘤细胞增殖和肿瘤生长 | 尽管研究展示了纳米颗粒增强的组合疗法对耐药性骨肉瘤的有效性，但尚未探讨该疗法在临床应用中的长期效果和潜在副作用 | 探讨化疗耐药性骨肉瘤的细胞特征及其治疗策略 | 化疗耐药性骨肉瘤肿瘤中的细胞类型特异性基因表达 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 25025 | 2024-08-09 |
Immunosuppressive effects of mesenchymal stem cells on lung B cell gene expression in LPS-induced acute lung injury
2020-09-25, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-020-01934-x
PMID:32977837
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研究论文 | 本研究探讨了间充质干细胞（MSC）在脂多糖（LPS）诱导的急性肺损伤（ALI）中对肺B细胞基因表达的影响 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析了MSC治疗对肺B细胞转录变化的影响，揭示了MSC治疗ALI的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人体中验证这些发现 | 探讨MSC治疗在ALI中对肺B细胞的作用及其机制 | 肺B细胞在MSC治疗ALI中的作用 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的肺B细胞 |
| 25026 | 2024-08-09 |
Bimodal function of chromatin remodeler Hmga1 in neural crest induction and Wnt-dependent emigration
2020-09-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.57779
PMID:32965216
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research paper | 研究通过单细胞RNA测序结合高分辨率杂交技术，揭示了染色质重塑因子Hmga1在神经嵴细胞诱导和迁移中的双模态功能 | 首次展示了Hmga1在神经嵴发育中的两个不同功能，即在神经板边缘调节Pax7依赖的神经嵴谱系指定和在迁移前阶段减少颅神经嵴从背神经管的迁出 | NA | 探究Hmga1在神经嵴细胞发育中的作用 | 神经嵴细胞的诱导和迁移 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 高分辨率杂交, CRISPR-Cas9 | NA | RNA | NA |
| 25027 | 2024-08-09 |
Multi-scale supervised clustering-based feature selection for tumor classification and identification of biomarkers and targets on genomic data
2020-Sep-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07038-3
PMID:32962626
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研究论文 | 本文设计了一种基于多尺度监督聚类的特征选择算法MCBFS，用于基因组数据分析中的特征选择和模型学习，并通过实验验证了其有效性和鲁棒性 | 开发了一种新的特征选择算法MCBFS，结合了多尺度聚类和监督学习方法，提高了算法的解释性和可视化效果 | 文章未明确提及现有方法的具体局限性 | 提高疾病分类中深度学习技术的应用效果，增强特征选择算法的解释性和可视化能力 | 基因组数据中的特征选择、肿瘤分类、生物标志物和治疗靶点的识别 | 机器学习 | 肺癌 | 多尺度聚类 | MCBFS算法 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 涉及八个数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 25028 | 2024-08-09 |
Biological insights from multi-omic analysis of 31 genomic risk loci for adult hearing difficulty
2020-09, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009025
PMID:32986727
|
研究论文 | 本文通过多组学分析31个与成人听力困难相关的基因组风险位点，揭示了与年龄相关听力损伤的新风险基因和位点 | 本文首次报道了8个新的与听力困难相关的基因组风险位点，并通过多组学数据分析了这些位点的调控和细胞特异性表达 | 研究主要基于英国生物库的数据，可能存在人群特异性限制 | 揭示年龄相关听力损伤的遗传原因 | 31个与听力困难相关的基因组风险位点 | 遗传学 | 听力障碍 | GWAS, mRNA-seq, ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据 | 330,759名参与者 |
| 25029 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq Identifies Cell Subsets in Human Placenta That Highly Expresses Factors Driving Pathogenesis of SARS-CoV-2
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00783
PMID:32974340
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据，识别了人类胎盘中表达SARS-CoV-2感染所需因子的细胞亚群，并探讨了这些细胞在病毒感染中的作用 | 本文首次揭示了胎盘中特定细胞亚群表达SARS-CoV-2感染所需因子，并展示了这些细胞可能驱动病毒在发育中的人类胎盘中的传播 | NA | 旨在预测胎盘是否易受SARS-CoV-2感染，并揭示其在妊娠期病毒感染中的作用 | 人类胎盘中的细胞亚群及其在SARS-CoV-2感染中的作用 | 数字病理学 | 冠状病毒病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及多个物种的胎盘样本，包括人类 |
| 25030 | 2024-08-09 |
HSPA12B Secreted by Tumor-Associated Endothelial Cells Might Induce M2 Polarization of Macrophages via Activating PI3K/Akt/mTOR Signaling
2020, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S254985
PMID:32982299
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关内皮细胞分泌的HSPA12B在头颈部鳞状细胞癌中诱导巨噬细胞M2极化的潜在功能角色 | 发现肿瘤相关内皮细胞通过分泌HSPA12B，激活PI3K/Akt/mTOR信号通路，诱导巨噬细胞M2极化，这是一种新的肿瘤相关内皮细胞与肿瘤相关巨噬细胞之间的相互作用 | NA | 探索肿瘤相关内皮细胞分泌的HSPA12B在头颈部鳞状细胞癌中诱导巨噬细胞M2极化的功能角色 | 头颈部鳞状细胞癌中的肿瘤相关内皮细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | Bulk-seq, 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 超过5000个细胞来自18个原发性头颈部鳞状细胞癌病例 |
| 25031 | 2024-08-09 |
Re-analysis of Single Cell Transcriptome Reveals That the NR3C1-CXCL8-Neutrophil Axis Determines the Severity of COVID-19
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.02145
PMID:32983174
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研究论文 | 本研究通过重新分析COVID-19患者的单细胞转录组数据，探讨了NR3C1-CXCL8-中性粒细胞轴与疾病严重程度的关系 | 首次揭示了NR3C1-CXCL8-中性粒细胞轴在决定COVID-19严重程度中的作用 | NA | 探讨COVID-19患者疾病严重程度与免疫特征的关系 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液中的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 25032 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Sequencing From Mouse Incisor Reveals Dental Epithelial Cell-Type Specific Genes
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00841
PMID:32984333
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠门齿中的牙上皮细胞类型特异性基因 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了牙上皮细胞类型的异质性，并鉴定了新的牙上皮细胞标记基因 | NA | 旨在阐明牙上皮细胞类型的异质性及其在牙釉质形成中的分子机制 | 小鼠门齿中的牙上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6,260个单细胞 |
| 25033 | 2024-08-09 |
Reproducibility across single-cell RNA-seq protocols for spatial ordering analysis
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0239711
PMID:32986734
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研究论文 | 本文评估了三种不同单细胞RNA测序协议（Smart-seq、MARS-seq和10X）在空间重构分析中的可重复性 | 发现不同协议和计算算法生成的数据在空间重构分析后基因表达谱高度一致 | 需要优化协议中测序深度和细胞数量的平衡，以有效利用资源 | 评估不同单细胞RNA测序协议在空间重构分析中的表现 | 三种单细胞RNA测序协议在空间重构分析中的可重复性和生物信号再现能力 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了三种不同协议的数据集 |
| 25034 | 2024-08-09 |
Exploring the Early Phase of Crohn's Disease
2021-12, Clinical gastroenterology and hepatology : the official clinical practice journal of the American Gastroenterological Association
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.cgh.2020.09.023
PMID:32949730
|
研究论文 | 本文探讨了克罗恩病早期阶段的发展机制，特别是黏膜防御机制的失败和免疫现象的变化 | 利用单细胞转录组学和蛋白质组学技术，揭示了参与克罗恩病发展各阶段的细胞和分子机制 | NA | 深入理解克罗恩病的发病机制，并促进针对性治疗方案的设计 | 克罗恩病早期阶段的发展机制 | NA | 克罗恩病 | 单细胞转录组学和蛋白质组学 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | NA |
| 25035 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing analysis of SARS-CoV-2 entry receptors in human organoids
2021-04, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.30054
PMID:32944935
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了人源类器官中SARS-CoV-2进入受体ACE2和TMPRSS2的表达情况 | 首次在单细胞水平上分析了人源类器官中多种RNA受体在SARS-CoV-2发病机制中的作用 | 研究主要集中在ACE2和TMPRSS2的表达分析，未涉及其他可能的病毒进入途径 | 探索SARS-CoV-2在人源类器官中的发病机制及药物开发 | 人源类器官中的ACE2和TMPRSS2表达及其他RNA受体 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种人源类器官样本 |
| 25036 | 2024-08-09 |
Methodologies for Following EMT In Vivo at Single Cell Resolution
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0779-4_23
PMID:32939729
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研究论文 | 本文介绍了一种在单细胞分辨率下研究活体中上皮-间质转化（EMT）的方法，重点是通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术研究特定细胞在EMT过程中的基因表达。 | 本文采用单细胞RNA测序技术，能够在不受到其他细胞群体背景噪声干扰的情况下，研究海胆骨骼细胞在EMT过程中的基因表达。 | 该方法虽然有所改进，但并非完美，仍需进一步优化。 | 旨在开发一种新的方法，以便在单细胞水平上详细研究活体中的EMT过程。 | 研究对象为海胆胚胎中的骨骼细胞，这些细胞在EMT过程中仅占胚胎总细胞数的5%。 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 海胆胚胎中的骨骼细胞，占总细胞数的5% |
| 25037 | 2024-08-09 |
Serial single-cell profiling analysis of metastatic TNBC during Nab-paclitaxel and pembrolizumab treatment
2021-Jan, Breast cancer research and treatment
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10549-020-05936-4
PMID:32949350
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了转移性三阴性乳腺癌患者在接受白蛋白结合型紫杉醇和派姆单抗治疗过程中的肿瘤免疫微环境变化 | 首次在治疗过程中对肿瘤样本进行连续单细胞RNA测序，揭示了化疗和免疫治疗对肿瘤微环境的调节作用 | 研究样本仅限于两名患者，可能无法全面代表所有三阴性乳腺癌患者的治疗反应 | 开发预测性生物标志物并提高化疗与免疫治疗组合的疗效 | 转移性三阴性乳腺癌患者在接受白蛋白结合型紫杉醇和派姆单抗治疗过程中的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 两名患者 |
| 25038 | 2024-08-09 |
Cell fate specification and differentiation in the adult mammalian intestine
2021-01, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-020-0278-0
PMID:32958874
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研究论文 | 本文探讨了成年哺乳动物肠道中干细胞命运决定和分化的机制 | 利用单细胞转录组学和类器官模型，揭示了指导干细胞后代进入六种肠道细胞谱系的信号 | NA | 研究肠道干细胞的调控和命运决定，以开发利用肠道再生能力和功能的疗法 | 成年哺乳动物肠道中的干细胞及其后代细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | 类器官模型 | 转录组数据 | NA |
| 25039 | 2024-08-09 |
Use of Chlamydial Elementary Bodies as Probes to Isolate Pathogen-Specific Human Monoclonal Antibodies
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0795-4_3
PMID:32959238
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研究论文 | 本文介绍了一种利用荧光标记的完整细菌通过流式细胞术从冷冻保存的人外周血单个核细胞样本中识别和分离特定于衣原体的记忆B细胞的新方法 | 该方法允许对活单细胞进行排序，用于细胞培养、体外检测、单细胞RNA测序以及重组单克隆抗体的重链和轻链克隆 | NA | 研究衣原体特异性抗体在预防和清除感染中的作用 | 衣原体特异性记忆B细胞 | NA | 性传播疾病 | 流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 25040 | 2024-08-09 |
Mechanisms of cell specification and differentiation in vertebrate cranial sensory systems
2020-12, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2020.08.006
PMID:32950922
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研究论文 | 本文探讨了脊椎动物颅部感觉系统的细胞特化与分化机制 | 利用单细胞转录组学、高分辨率成像和系统生物学方法，以空前的分辨率研究这些过程 | NA | 揭示脊椎动物感觉器官中驱动细胞多样性的转录因子程序及其与组织形态发生的耦合 | 脊椎动物的感觉细胞特化和分化机制 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学、高分辨率成像、系统生物学 | NA | 转录组数据、成像数据 | NA |