单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 24981 - 25000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24981 | 2024-08-09 |
A spectral clustering with self-weighted multiple kernel learning method for single-cell RNA-seq data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa216
PMID:33003206
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研究论文 | 提出了一种基于自加权多核学习的光谱聚类方法，用于单细胞RNA测序数据 | 引入自加权多核学习模型，自动选择最适合单细胞RNA测序数据的核函数，并通过多核组合直接发现数据中的分组 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的距离度量方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | SVM | RNA测序数据 | NA |
| 24982 | 2024-08-09 |
A new bioinformatics tool to recover missing gene expression in single-cell RNA sequencing data
2021-04-10, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaa053
PMID:32997747
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24983 | 2024-08-09 |
Imputing single-cell RNA-seq data by considering cell heterogeneity and prior expression of dropouts
2021-04-10, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaa052
PMID:33002136
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞亚群的有界低秩（PBLR）方法，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值（dropout） | PBLR方法考虑了细胞异质性和dropout率与预期表达水平之间的关系，能够有效恢复dropout事件，并提高低维表示和基因间关系的恢复 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据分析中的计算挑战，特别是由于技术噪声导致的dropout问题 | 单细胞RNA测序数据中的dropout事件 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 有界低秩（PBLR）方法 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及模拟和真实单细胞RNA测序数据集 |
| 24984 | 2024-08-09 |
The HDAC Inhibitor Domatinostat Promotes Cell-Cycle Arrest, Induces Apoptosis, and Increases Immunogenicity of Merkel Cell Carcinoma Cells
2021-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.08.023
PMID:33002502
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研究论文 | 研究了HDAC抑制剂Domatinostat在Merkel细胞癌中的作用，包括细胞周期阻滞、诱导凋亡和增强免疫原性 | Domatinostat不仅能直接抑制肿瘤生长，还能恢复MCC细胞表面的HLA I类分子表达，增强其被细胞毒性T细胞识别和清除的能力 | NA | 探讨Domatinostat在Merkel细胞癌中的疗效和作用机制 | Merkel细胞癌 | NA | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24985 | 2024-08-09 |
Senescence of Alveolar Type 2 Cells Drives Progressive Pulmonary Fibrosis
2021-03-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202004-1274OC
PMID:32991815
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研究论文 | 研究探讨了肺泡类型2细胞衰老在特发性肺纤维化（IPF）的启动和进展中的作用，并评估了针对衰老相关通路和衰老细胞的治疗潜力。 | 开发了一种新型的小鼠模型，用于研究条件性肺泡类型2细胞衰老在肺纤维化中的作用，并展示了通过遗传或药物干预靶向p53激活或衰老可以阻止纤维化生成。 | NA | 研究肺泡类型2细胞衰老在特发性肺纤维化中的作用及其治疗潜力。 | 肺泡类型2细胞，特发性肺纤维化患者和对照组的肺组织。 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA | 9份对照组近端和远端肺组织，11份IPF纤维化肺组织 |
| 24986 | 2024-08-09 |
Fixed single-cell RNA sequencing for understanding virus infection and host response
2021-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2020.09.17.302232
PMID:32995793
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FD-seq的高通量方法，用于对甲醛固定的、染色和分选的单细胞进行基于液滴的RNA测序，以理解病毒感染和宿主反应 | FD-seq方法在固定和随后的细胞回收过程中保持了mRNA的完整性和相对丰度，并且检测到的基因和转录本数量比甲醇固定更多 | NA | 研究病毒感染和宿主反应 | 单细胞RNA测序技术 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 文本 | NA |
| 24987 | 2024-08-09 |
SC2disease: a manually curated database of single-cell transcriptome for human diseases
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa838
PMID:33010177
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research paper | SC2disease是一个人工 curated 的数据库，旨在为不同疾病提供各种细胞类型的基因表达谱的综合和准确资源 | SC2disease数据库汇总了使用scRNA-seq技术研究人类疾病的文献数据，提供了系统性、层次化和大规模的细胞水平基因表达谱 | NA | 开发一个全面且准确的数据库，用于汇总和比较不同疾病、组织和细胞类型的基因表达谱 | 人类疾病的细胞类型特异性基因表达谱 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达矩阵 | 946,481个条目，对应341种细胞类型、29种组织和25种疾病 |
| 24988 | 2024-08-09 |
SLC7A11 as a biomarker and therapeutic target in HPV-positive head and neck Squamous Cell Carcinoma
2020-12-17, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2020.09.134
PMID:33019976
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研究论文 | 研究探讨了SLC7A11作为HPV阳性头颈部鳞状细胞癌的生物标志物和治疗靶点的潜力 | 首次报道了HPV阳性肿瘤中SLC7A11表达水平较低，并且E6-E7细胞对铁死亡的敏感性增加 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步的临床试验验证 | 探索SLC7A11在HPV阳性头颈部鳞状细胞癌中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | HPV阳性头颈部鳞状细胞癌中的SLC7A11表达及铁死亡敏感性 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及两个HNSCC细胞系 |
| 24989 | 2024-08-09 |
Transient Activation of the Hedgehog-Gli Pathway Rescues Radiotherapy-Induced Dry Mouth via Recovering Salivary Gland Resident Macrophages
2020-12-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-0503
PMID:32998998
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research paper | 本文研究了短暂激活 Hedgehog-Gli 通路通过恢复唾液腺驻留巨噬细胞来挽救放射治疗诱导的口干症 | 首次揭示了驻留巨噬细胞及其修复相关的旁分泌因子在短暂激活 Hedgehog 通路挽救放射治疗诱导的唾液功能障碍中的关键作用 | NA | 探讨短暂激活 Hedgehog-Gli 通路恢复放射治疗诱导的唾液腺功能障碍的机制 | 小鼠唾液腺中的巨噬细胞、上皮细胞和内皮细胞 | NA | head and neck cancer | single-cell RNA sequencing, qRT-PCR | NA | RNA | 小鼠唾液腺细胞 |
| 24990 | 2024-08-09 |
Characteristics of anti-CD19 CAR T cell infusion products associated with efficacy and toxicity in patients with large B cell lymphomas
2020-12, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-1061-7
PMID:33020644
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基于捕获的细胞识别技术，分析了自体抗CD19 CAR T细胞输注产品在24名大B细胞淋巴瘤患者中的转录组特征，以识别与疗效和毒性相关的特征。 | 本研究首次揭示了CAR T细胞输注产品的细胞和分子特征异质性对axi-cel疗法疗效和毒性的影响，并提出第7天的分子反应可能作为CAR T细胞疗效的早期预测指标。 | 研究样本量较小，仅涉及24名患者，可能影响结果的普遍性。 | 旨在识别与大B细胞淋巴瘤患者接受抗CD19 CAR T细胞疗法的疗效和毒性相关的转录组特征。 | 自体抗CD19 CAR T细胞输注产品在大B细胞淋巴瘤患者中的转录组特征。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 24名大B细胞淋巴瘤患者 |
| 24991 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Diversity of the Immunological Landscape following Central Nervous System Infection by a Murine Coronavirus
2020-11-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/JVI.01295-20
PMID:32999036
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠冠状病毒JHMV感染中枢神经系统后免疫细胞的异质性 | 揭示了感染不同阶段免疫细胞的独特分子特征和参与有效抗病毒宿主防御的途径，并识别了可能参与脱髓鞘和再髓鞘化的基因 | NA | 旨在更好地理解JHMV感染中枢神经系统后先天和适应性免疫反应以及慢性脱髓鞘阶段的分子途径 | 小鼠中枢神经系统感染JHMV后的免疫细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从实验小鼠的大脑和脊髓中富集的CD45阳性细胞 |
| 24992 | 2024-08-09 |
Affinity-Restricted Memory B Cells Dominate Recall Responses to Heterologous Flaviviruses
2020-11-17, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.09.001
PMID:33010224
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研究论文 | 研究探讨了记忆B细胞（MBCs）在应对异源黄病毒时的回忆反应机制，发现这些反应主要受限于预先存在的克隆多样性，而非通过次级生发中心（GCs）进行新的特异性塑造。 | 通过条件性删除激活诱导的胞苷脱氨酶（AID），研究了异源黄病毒挑战后的回忆反应，发现这些反应主要受限于预先存在的克隆多样性，而非通过次级生发中心进行新的特异性塑造。 | 研究主要集中在记忆B细胞的回忆反应机制，未涉及其他免疫细胞类型或更广泛的免疫反应。 | 区分黄病毒感染和免疫接种中记忆B细胞对异源抗原的反应机制。 | 记忆B细胞（MBCs）对异源黄病毒的回忆反应机制。 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，条件性基因删除 | NA | RNA | 涉及多种黄病毒（西尼罗河病毒、日本脑炎病毒、寨卡病毒和登革病毒）的挑战。 |
| 24993 | 2024-08-09 |
Application of Single-Cell Sequencing to Immunotherapy
2020-Nov, The Urologic clinics of North America
DOI:10.1016/j.ucl.2020.07.005
PMID:33008498
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综述 | 本文通过单细胞视角探讨癌症免疫疗法，并讨论推动该领域发展的最先进技术 | 利用单细胞分析提高分辨率，有望发现并表征先前未被充分认识的细胞群，有助于理解癌症进展和治疗 | NA | 探讨单细胞分析在理解和开发针对泌尿系统和前列腺癌的免疫治疗策略中的潜力 | 泌尿系统和前列腺癌 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 24994 | 2024-08-09 |
Translocation of Viable Gut Microbiota to Mesenteric Adipose Drives Formation of Creeping Fat in Humans
2020-10-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.09.009
PMID:32991841
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研究论文 | 本研究探讨了克罗恩病中微生物移位是否是驱动“爬行脂肪”形成的关键因素 | 发现了与爬行脂肪相关的特定肠道细菌亚群，并确定了Clostridium innocuum作为该菌群的标志，以及其在黏膜和脂肪组织中的菌株变异 | NA | 研究克罗恩病中微生物移位与爬行脂肪形成的关系 | 克罗恩病患者的肠道微生物和爬行脂肪组织 | NA | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括克罗恩病患者的回肠手术切除标本和无菌小鼠 |
| 24995 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Dynamic Cell Populations and Differential Gene Expression Patterns in Control and Aneurysmal Human Aortic Tissue
2020-10-06, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，揭示了控制组和动脉瘤人主动脉组织中动态的细胞群和差异基因表达模式 | 首次全面评估了升主动脉壁的细胞组成，并揭示了人动脉瘤组织中基因表达景观的改变 | NA | 旨在全面表征升主动脉壁的细胞组成，并识别人动脉瘤组织中每个细胞群的分子改变 | 升主动脉组织中的细胞群和基因表达模式 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11名研究参与者，包括8名动脉瘤患者和3名对照组受试者 |
| 24996 | 2024-08-09 |
Generation of cortical neurons through large-scale expanding neuroepithelial stem cell from human pluripotent stem cells
2020-10-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-020-01939-6
PMID:33008480
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研究论文 | 本文开发了一种可扩展的悬浮培养系统，用于大规模生成来源于人类多能干细胞的神经上皮干细胞（NESC）及其衍生的皮质神经元。 | 本文创新性地使用小分子和生长因子的组合，优化了培养系统，实现了NESC的大规模生产，并展示了这些NESC-spheres向皮质神经元的高效分化潜力。 | NA | 研究目的是开发一种高效、低成本的培养系统，用于大规模生产高质量的NESC-spheres，并将其用于细胞疗法、疾病模型和药物筛选。 | 研究对象包括人类多能干细胞（hPSCs）、神经上皮干细胞（NESC）及其衍生的皮质神经元。 | 再生医学 | NA | 细胞免疫荧光染色、全局转录组和单细胞RNA测序分析 | NA | 细胞 | 大规模的NESC-spheres |
| 24997 | 2024-08-09 |
Identification of putative master regulators in rheumatoid arthritis synovial fibroblasts using gene expression data and network inference
2020-10-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-73147-4
PMID:33004899
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研究论文 | 本研究利用基因表达数据和网络推断方法，识别类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的潜在主调控因子 | 本研究首次识别了类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的五个特定主调控因子，并评估了它们的转录因子活性 | NA | 旨在表征类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的主调控转录因子，这些因子可能解释其表型特征 | 类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的主调控转录因子 | NA | 类风湿性关节炎 | 微阵列和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自类风湿性关节炎和骨关节炎患者的滑膜组织 |
| 24998 | 2024-08-09 |
Defining the First Part of the Oncogenic KRAS Journey
2020-10-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.09.009
PMID:33007229
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研究论文 | 本文通过分析类器官培养、患者样本和鼠模型结合单细胞RNA测序技术，探讨了致癌KRAS激活的早期事件 | 结合多种技术手段，如类器官培养、患者样本分析和单细胞RNA测序，以深入研究KRAS突变相关的早期致癌过程 | NA | 阐明致癌KRAS激活的早期事件 | KRAS突变在人类癌症中的早期致癌过程 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及类器官培养、患者样本和鼠模型 |
| 24999 | 2024-08-09 |
Single-Nucleus RNA-Seq Is Not Suitable for Detection of Microglial Activation Genes in Humans
2020-09-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108189
PMID:32997994
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研究论文 | 本文通过比较单细胞和单核RNA测序技术在人类大脑样本中的应用，探讨了单核RNA测序技术在检测人类组织细胞状态中的适用性 | 发现单核RNA测序技术在检测微胶质细胞激活基因方面存在低敏感性 | 单核RNA测序技术无法有效检测微胶质细胞在人类疾病中的细胞激活状态 | 评估单核RNA测序技术在检测人类组织细胞状态中的能力 | 微胶质细胞的激活基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | RNA | 四个人类受试者的大脑样本 |
| 25000 | 2024-08-09 |
Protocol for Isolation of Cardiac Interstitial Cells from Adult Murine Hearts for Unbiased Single Cell Profiling
2020-09-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100077
PMID:33000003
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研究论文 | 本文介绍了一种从成年小鼠心脏中高效分离高质量活核非心肌细胞的无偏单细胞RNA测序方法 | 使用基于液滴的技术进行单细胞分析，革新了对细胞状态和身份的研究 | NA | 开发一种高效的方法来分离心脏间质细胞，以进行无偏的单细胞RNA测序 | 成年小鼠心脏中的心脏间质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同小鼠品系的健康和受伤心脏样本 |