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当前共找到 35765 篇文献，本页显示第 2481 - 2500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 2481 | 2025-12-23 |
Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal a Novel Mechanism of Oligodendrocyte-Neuron Interaction in Cognitive Decline After High-Altitude Cerebral Edema
2025-Jun, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70485
PMID:40546220
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了高原脑水肿后认知衰退中少突胶质细胞与神经元相互作用的新机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，在高原脑水肿模型中系统解析了少突胶质细胞与神经元间的相互作用机制，并发现了PI3K/mTOR动态变化、Rps29-bax轴及Tnfrsf21-App作为新型调控因子 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；仅观察了3天和7天两个时间点，长期效应尚不明确 | 探究高原脑水肿导致认知衰退的细胞与分子机制 | 高原脑水肿小鼠模型中的海马组织细胞 | 数字病理学 | 高原脑水肿 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2482 | 2025-12-23 |
Single-cell RNA-sequencing profiles reveal the developmental landscape of the Manihot esculenta Crantz leaves
2023-12-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad500
PMID:37706525
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，构建了木薯叶片的单细胞转录组图谱，揭示了其细胞发育景观和光合特性 | 首次在木薯叶片中应用单细胞RNA测序技术，识别了15个细胞簇和120个候选标记基因，并构建了细胞发育轨迹图，发现了6个与细胞分化命运相关的基因 | NA | 在细胞水平上研究木薯叶片的结构和光合特性，为提升木薯产量和营养提供理论基础 | 木薯（Manihot esculenta Crantz）叶片 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,177个高质量叶片细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2483 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics drives a new era in plant research
2023-12, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16437
PMID:37651723
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2484 | 2025-12-23 |
Identification and validation of prognostic and tumor microenvironment characteristics of necroptosis index and BIRC3 in clear cell renal cell carcinoma
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16643
PMID:38130918
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研究论文 | 本研究通过分析TCGA和GEO数据库，识别了与坏死性凋亡相关的基因簇和预后模型，并验证了枢纽基因BIRC3在透明细胞肾细胞癌中的表达及其对细胞增殖、迁移和侵袭的调控作用 | 首次构建了基于坏死性凋亡相关基因的预后模型，并深入探讨了BIRC3基因在ccRCC免疫微环境中的关键作用 | 研究主要依赖公共数据库数据，缺乏大规模临床样本验证，且实验部分仅限于细胞系水平 | 探索坏死性凋亡在透明细胞肾细胞癌中的调控机制及其临床意义 | 透明细胞肾细胞癌患者数据、细胞系及单细胞测序数据 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞测序、定量实时PCR、CCK8实验、transwell实验、伤口愈合实验 | LASSO回归模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的ccRCC患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2485 | 2025-12-23 |
Proximal tubule cells in blood and urine as potential biomarkers for kidney disease biopsy
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16499
PMID:38077419
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了肾炎患者的肾脏组织、外周血单核细胞和尿液中的细胞异质性，发现近端小管细胞在血液和尿液中的存在可作为肾脏疾病潜在的微创诊断标志物 | 首次通过单细胞RNA测序在肾炎患者的外周血和尿液中鉴定出近端小管细胞，并发现其与肾脏组织中的炎症性近端小管细胞具有高度相似的基因表达谱，提出了替代侵入性肾活检的潜在微创诊断方法 | 研究样本量较小（仅4名患者），且仅针对肾炎患者，结果在其他肾脏疾病中的普适性有待验证 | 探索肾脏疾病的病理机制并开发微创诊断方法 | 肾炎患者的肾脏组织、外周血单核细胞和尿液样本 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4名肾炎患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2486 | 2025-12-23 |
Isolation of Endothelial Cells from the Lumen of Mouse Carotid Arteries for Single-cell Multi-omics Experiments
2021-10-04, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63128
PMID:34661575
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研究论文 | 本文介绍了一种从小鼠颈动脉内腔分离内皮细胞的方法，用于单细胞多组学实验，以研究动脉粥样硬化中血流扰动对内皮细胞的影响 | 开发了一种内腔消化方法，从动脉壁中富集内皮细胞，解决了内皮细胞在总细胞群中占比较低的问题，从而在单细胞分辨率下更有效地研究血流对转录组和染色质可及性的影响 | 方法可能无法完全排除其他细胞类型的污染，如平滑肌细胞、成纤维细胞和免疫细胞，且在小鼠模型中的结果需进一步验证才能应用于人类动脉样本 | 研究动脉粥样硬化中血流扰动对内皮细胞转录组和表观基因组的影响，开发内皮细胞富集方法以促进单细胞多组学研究 | 小鼠颈动脉内皮细胞，通过部分颈动脉结扎手术诱导血流扰动，使用右颈动脉作为对照 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞RNA和染色质可及性数据 | 小鼠颈动脉样本，具体数量未在摘要中明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Genomics微流控设置，用于单细胞和单核条形码标记，后续进行RNA制备、文库生成和高通量DNA测序 |
| 2487 | 2025-12-22 |
Chemical Perturbations Impacting Histone Acetylation Govern Colorectal Cancer Differentiation
2026-Jan, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.07.003
PMID:40633623
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研究论文 | 本研究通过筛选靶向表观遗传调控因子的小分子化合物，发现抑制HDAC1/2催化结构域可促进结直肠癌分化并抑制肿瘤生长，揭示了H3K27ac和H3K9ac作为关键调控标记的机制 | 首次将HDAC1/2抑制与结直肠癌分化直接关联，并通过单细胞RNA测序和组蛋白修饰谱分析揭示了H3K27ac在介导这一过程中的核心作用 | 研究主要基于体外模型和患者来源的类器官，体内验证和临床转化仍需进一步探索 | 识别和表征结直肠癌分化的表观遗传调控因子，揭示重编程癌细胞状态的机制 | 结直肠癌细胞系、小鼠模型和患者来源的结直肠癌类器官 | 表观遗传学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、质谱组蛋白修饰谱分析、遗传筛选 | NA | 基因表达数据、组蛋白修饰数据、单细胞转录组数据 | 未明确指定具体样本数量，涉及小鼠和人类结直肠癌模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2488 | 2025-12-22 |
Robust integration and annotation of single-cell and spatial omics data using interpretable gene programs
2025-Dec-19, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101105
PMID:41421360
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研究论文 | 提出一个名为SSpMosaic的计算框架，利用可解释的基因程序作为通用锚点，实现单细胞和空间组学数据的稳健整合与注释 | 建立了元程序作为跨数据集对齐的高阶基因程序表示，实现了跨批次、模态和物种的一致整合，并能进行分辨率无关的空间转录组解卷积 | NA | 开发一个计算框架来整合和注释单细胞与空间组学数据，以解码细胞身份和生物功能 | 单细胞和空间组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学、染色质可及性、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间位置数据 | NA | 10x Genomics, NanoString | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | 10x Visium, CosMx, Visium HD | Visium（点水平）、CosMx/Visium HD（亚细胞水平） |
| 2489 | 2025-12-22 |
Single-cell to pre-clinical evaluation of Trem2, Folr2, and Slc7a7 as macrophage-associated biomarkers for atherosclerosis
2025-Dec-18, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf210
PMID:41206594
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TRAP-seq技术，在小鼠动脉粥样硬化模型中表征了巨噬细胞在主动脉、脂肪组织和肝脏中的功能多样性，并识别了Trem2、Folr2和Slc7a7作为巨噬细胞相关生物标志物，用于疾病诊断和监测 | 首次结合单细胞RNA测序和TRAP-seq技术，系统评估了巨噬细胞在动脉粥样硬化关键组织中的组织特异性基因程序，并识别了跨物种共享的生物标志物，包括Trem2作为循环生物标志物、Folr2和Slc7a7作为PET示踪剂靶点 | 研究基于小鼠模型，人类样本验证有限；PET示踪剂应用尚处探索阶段，需进一步临床验证 | 阐明巨噬细胞在动脉粥样硬化中的驱动机制，识别可用于诊断、监测和治疗的生物标志物 | 小鼠动脉粥样硬化模型中的巨噬细胞，涉及主动脉、脂肪组织和肝脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, TRAP-seq, PET成像 | NA | RNA测序数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2490 | 2025-12-22 |
[Single-cell RNA sequencing of B cells reveals molecular typing in Sjögren syndrome]
2025-Dec-18, Beijing da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Peking University. Health sciences
PMID:41399063
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研究论文 | 本研究通过B细胞单细胞RNA测序对干燥综合征患者进行分子分型，揭示了三种具有不同基因特征和临床异质性的亚型 | 首次利用B细胞scRNA-seq数据对干燥综合征患者进行无监督聚类，建立了分子分型框架，并识别了亚型特异性的核心调控基因和潜在治疗靶点 | 研究样本量相对较小（24名患者和4名健康对照），且数据来源于公共数据库，缺乏独立验证队列 | 建立干燥综合征的分子分类框架，以阐明其临床异质性并为靶向治疗提供见解 | 干燥综合征患者和健康对照者的B细胞 | 单细胞组学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 单细胞RNA测序数据 | 24名干燥综合征患者和4名健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2491 | 2025-12-22 |
Pomalidomide enhances CAR-T cell therapeutic efficacy and remodels immune microenvironment in lymphoid malignancies
2025-Dec-18, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04247-1
PMID:41410870
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研究论文 | 本研究探讨了泊马度胺如何增强CAR-T细胞功能并重塑免疫微环境，以克服淋巴恶性肿瘤治疗中的局限性 | 揭示了泊马度胺通过直接增强CAR-T细胞功能（如记忆、细胞因子/趋化因子产生、代谢适应性和减少耗竭）以及重塑抑制性免疫微环境（增加细胞毒性效应细胞、减少MDSC活性）来协同CAR-T治疗的机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型，临床样本仅来自一名淋巴瘤患者，样本量有限，需要更大规模的临床研究验证 | 阐明泊马度胺增强CAR-T细胞功能和重塑免疫微环境的机制，以优化难治性淋巴恶性肿瘤的治疗组合 | 人类CAR-T细胞、多发性骨髓瘤异种移植模型、淋巴瘤患者外周血单个核细胞 | 肿瘤免疫治疗 | 淋巴恶性肿瘤 | CCK-8、LDH、qPCR、ELISA、流式细胞术、bulk RNA-seq、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 体外人类CAR-T细胞、多发性骨髓瘤异种移植模型、一名淋巴瘤患者的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2492 | 2025-12-22 |
Integrating whole-exome sequencing and scRNA-seq reveal the characteristic in one clear cell renal cell carcinoma sample arising in the setting of VHL disease
2025-Dec-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-27699-y
PMID:41413084
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研究论文 | 本研究通过整合全外显子组测序和单细胞RNA测序技术，揭示了VHL疾病背景下透明细胞肾细胞癌的基因表达特征和肿瘤微环境特点 | 首次在单细胞水平上对VHL疾病相关的ccRCC进行特征分析，并整合了DNA突变和转录组数据以揭示其独特特性 | 仅使用了一个VHL突变样本进行研究，样本量较小，可能限制结果的普遍性 | 探究VHL疾病背景下透明细胞肾细胞癌的分子特征和肿瘤微环境 | 一个VHL突变ccRCC样本和六个非VHL突变ccRCC样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光 | Seurat | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | 一个VHL突变ccRCC样本和六个非VHL突变ccRCC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 2493 | 2025-12-22 |
Molecular subtyping and prognostic evaluation in idiopathic pulmonary fibrosis: a focus on mechanical-related genes
2025-Dec-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07365-7
PMID:41408564
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研究论文 | 本研究聚焦于机械力相关基因，对特发性肺纤维化进行分子分型与预后评估 | 首次将机械力相关基因评分应用于IPF，识别出与机械力相关的核心基因和分子亚型，并通过单细胞RNA测序和CMap分析揭示了潜在的致病机制与治疗靶点 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床队列验证核心基因的预后价值 | 探究机械敏感基因在特发性肺纤维化发病机制中的作用，并进行分子分型与预后评估 | 特发性肺纤维化患者样本与对照样本 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，机器学习算法，Cox回归分析，Connectivity Map分析 | 机器学习算法，Cox回归模型，列线图 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据，临床病理数据 | IPF样本与对照样本（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2494 | 2025-12-22 |
Multi-omic profiling reveals age-related immune dynamics in healthy adults
2025-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09686-5
PMID:41162704
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了健康成年人中与年龄相关的免疫动态变化 | 结合单细胞RNA测序、蛋白质组学和流式细胞术，纵向追踪96名成年人两年，首次系统描绘了年龄相关的T细胞转录重编程及其功能影响 | 研究主要关注外周血免疫细胞，未涉及组织特异性免疫变化；样本量虽大但年龄范围有限（25-90岁），且仅针对流感疫苗响应 | 探究健康成年人免疫系统随年龄变化的动态过程及其机制 | 300多名健康成年人（25-90岁）的外周血单个核细胞，重点关注T细胞和B细胞亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质数据, 流式细胞数据 | 超过300名健康成年人，其中96人进行为期两年的纵向追踪 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2495 | 2025-12-22 |
Anti-progestin therapy targets hallmarks of breast cancer risk
2025-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09684-7
PMID:41193807
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研究论文 | 本研究评估了抗孕激素药物醋酸乌利司他通过12周治疗，对24名绝经前女性乳腺癌风险标志物的影响，发现其能减少上皮增殖、基质重塑和管腔祖细胞活性 | 首次在临床试验中结合多层组学、活细胞方法、临床成像和组织微力学，揭示抗孕激素治疗通过胶原VI重塑和SOX9管腔祖细胞定位关联，抑制乳腺癌风险 | 样本量较小（仅24名绝经前女性），治疗周期较短（12周），且为早期阶段试验，长期效果和安全性需进一步验证 | 评估抗孕激素疗法是否通过减少乳腺癌风险标志物，实现绝经前乳腺癌的预防 | 24名绝经前女性乳腺癌风险患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、组织学、原子力显微镜、MRI成像 | NA | 组学数据、图像、微力学数据 | 24名绝经前女性 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2496 | 2025-12-22 |
IFN-Mediated Bronchial Epithelium Cellular Senescence in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Dec, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0453OC
PMID:40540688
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者支气管上皮细胞中细胞衰老的机制，并探讨了IFN通路在其中的作用 | 首次在COPD中结合单细胞RNA测序技术，系统分析了支气管上皮细胞亚型中的衰老标记分布，并发现I/II型干扰素介导的衰老表型，以及JAK-STAT和cGAS-STING通路抑制剂对衰老的缓解作用 | 研究样本量有限，且主要基于体外培养细胞和组织学分析，未涉及长期体内干预效果验证 | 阐明COPD中支气管上皮细胞衰老的分子机制及其在疾病发病中的作用 | COPD患者和健康受试者的原代支气管上皮细胞及肺组织 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、组织学图像 | COPD患者和健康受试者的原代支气管上皮细胞样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2497 | 2025-12-22 |
MAGNET: Multi-view graph autoencoder with cell-gene attention for cell interaction network reconstruction from spatial transcriptomics
2025-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013810
PMID:41397026
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研究论文 | 本文提出了一种名为MAGNET的多视图图自编码器框架，通过细胞-基因注意力模块整合细胞外部相互作用与内部基因调控，用于从空间转录组数据中重建细胞间相互作用网络 | 开发了细胞-基因注意力模块，将细胞环境与内部基因活动在统一表示中连接，克服了现有方法将两者分离处理的限制 | 未明确提及 | 从空间转录组数据中准确推断细胞间相互作用网络 | 空间转录组数据中的细胞 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 多视图图自编码器 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2498 | 2025-12-22 |
Identification of intestinal enteroendocrine cell subtypes and their associated hormones in zebrafish
2025-Dec, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003522
PMID:41411332
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和质谱分析，鉴定了斑马鱼肠道内分泌细胞的亚型及其相关激素，并揭示了其分化机制 | 首次在斑马鱼中系统鉴定肠道内分泌细胞亚型，发现神经生成素3（neurog3）和胃饥饿素阳性细胞作为不同亚型的前体细胞，并识别出新的斑马鱼分泌素同源物 | 研究主要基于斑马鱼模型，结果可能不完全适用于哺乳动物，且神经生成素3在斑马鱼中的作用与哺乳动物存在差异 | 探究斑马鱼肠道内分泌细胞亚型的分化、激素产生及其发育生物学机制 | 斑马鱼的肠道内分泌细胞及其亚型 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱分析 | NA | RNA测序数据, 质谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2499 | 2025-12-22 |
Determining gene specificity from multivariate single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.21.689845
PMID:41332587
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研究论文 | 本文提出了一种基于熵度量的基因特异性测量方法ember，用于分析单细胞RNA测序数据，并应用于小鼠和人类数据集 | 基于公理化方法定义了基因特异性测量的四个关键属性，并开发了唯一满足这些属性的ember方法 | 未明确讨论方法在复杂生物系统或大规模数据集中的计算效率或可扩展性限制 | 识别单细胞基因组学数据中基因对生物类别或实验条件的特异性 | 小鼠八个组织的基因表达数据及人类PBMC样本 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 八个小鼠组织及255名个体的人类PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2500 | 2025-12-22 |
Orchestrating Spatial Transcriptomics Analysis with Bioconductor
2025-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.20.688607
PMID:41332620
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研究论文 | 本文介绍了一个基于Bioconductor在R中用于空间转录组学数据分析的开源在线书籍，包含可复现的代码示例、数据集和工作流讨论 | 提供了一个自由访问、开源、持续更新和测试的在线资源，整合了空间组学数据分析的多步骤工作流，并支持与Python的互操作性 | NA | 简化和标准化空间转录组学数据的分析流程，促进可复现性研究 | 空间转录组学数据及其分析工作流 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |