单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 24324 篇文献，本页显示第 2481 - 2500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2481 | 2024-11-07 |
Modeling primitive and definitive erythropoiesis with induced pluripotent stem cells
2024-03-26, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023011708
PMID:38290102
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研究论文 | 本文利用诱导多能干细胞（iPSCs）模型研究了原始和确定性红细胞生成过程中的差异 | 首次通过iPSCs生成了同基因的原始和确定性红细胞，并进行了功能和转录组学比较 | NA | 研究原始和确定性红细胞生成的差异及其在遗传性血液疾病建模中的应用 | 诱导多能干细胞（iPSCs）生成的原始和确定性红细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从健康胎儿肝脏细胞生成的iPSCs及其衍生的红细胞 |
| 2482 | 2024-11-07 |
Gastrulation-stage gene expression in Nipbl+/- mouse embryos foreshadows the development of syndromic birth defects
2024-Mar-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4239
PMID:38507484
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研究论文 | 研究了Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚形成阶段的基因表达，揭示了与Cornelia de Lange综合征相关的出生缺陷的早期迹象 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚形成和早期心脏新月阶段的基因表达变化，发现了与出生缺陷相关的基因表达失调和谱系分配错误 | NA | 探讨Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚形成阶段的基因表达变化及其与出生缺陷的关系 | Nipbl+/-小鼠胚胎在原肠胚形成和早期心脏新月阶段的基因表达 | NA | 遗传性出生缺陷 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和Nipbl+/-小鼠胚胎 |
| 2483 | 2024-11-07 |
Expansion of memory Vδ2 T cells following SARS-CoV-2 vaccination revealed by temporal single-cell transcriptomics
2024-Mar-20, NPJ vaccines
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41541-024-00853-9
PMID:38509155
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研究论文 | 研究了mRNA SARS-CoV-2疫苗接种后Vδ2 T细胞的分子变化 | 揭示了第二次疫苗接种后Vδ2 T细胞的记忆特征，并通过体外实验验证了其效应功能 | NA | 探讨mRNA SARS-CoV-2疫苗接种后Vδ2 T细胞的免疫反应变化 | Vδ2 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序和γδ-TCR测序 | NA | RNA | 纵向研究中的多个时间点样本 |
| 2484 | 2024-11-07 |
A Foundation Model for Cell Segmentation
2024-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.17.567630
PMID:38045277
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellSAM的细胞分割基础模型，该模型能够跨多种细胞成像数据进行泛化 | CellSAM基于Segment Anything Model (SAM)开发了一种提示工程方法用于掩码生成，并通过训练对象检测器CellFinder来自动检测细胞并提示SAM生成分割结果 | NA | 开发一种能够跨不同细胞成像领域泛化的细胞分割模型 | 细胞分割在多种成像数据中的应用 | 计算机视觉 | NA | 深度学习 | 基础模型 | 图像 | 涉及哺乳动物细胞（组织和细胞培养）、酵母和细菌的图像，跨越多种成像模式 |
| 2485 | 2024-11-07 |
Intestinal epithelial adaptations to vertical sleeve gastrectomy defined at single-cell resolution
2024-03, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110805
PMID:38309446
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析，探讨了垂直袖状胃切除术（VSG）对小肠上皮细胞的影响 | 首次在单细胞分辨率下定义了VSG对小肠上皮细胞的适应性变化，并揭示了VSG恢复高脂饮食扰动的细胞类型特异性基因和通路 | 研究基于小鼠模型，结果的临床相关性需进一步验证 | 探讨垂直袖状胃切除术（VSG）对小肠上皮细胞的分子和细胞水平的影响 | 小肠上皮细胞及其在VSG后的适应性变化 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 2486 | 2024-11-07 |
YAP induces a neonatal-like pro-renewal niche in the adult heart
2024-Mar, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-024-00428-w
PMID:38510108
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研究论文 | 研究探讨了YAP激活在成年心脏中诱导新生儿样再生微环境的作用 | 发现YAP激活可以重建心肌梗死后心脏的微环境，并诱导心脏再生 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类心脏中验证 | 研究YAP激活在成年心脏中的再生潜力及其微环境重建机制 | 成年表达YAP5SA的心肌细胞和心脏微环境 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠和人类心脏样本 |
| 2487 | 2024-11-07 |
Impacts of cryopreservation on phenotype and functionality of mononuclear cells in peripheral blood and ascites
2024-Feb, Journal of translational internal medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.2478/jtim-2023-0136
PMID:38525442
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研究论文 | 研究了不同冷冻保存时间和额外冷冻-解冻循环对血液和腹水中单核细胞数量和功能的影响 | 首次探讨了不同冷冻保存条件对单核细胞亚型耐受性的影响 | 样本量较小，可能影响结果的普适性 | 探讨冷冻保存对单核细胞表型和功能的影响 | 血液和腹水中的单核细胞 | NA | 卵巢癌 | 流式细胞术，单细胞测序 | NA | 细胞 | 21份血液样本和8份腹水样本 |
| 2488 | 2024-11-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals Immune Education promotes T cell survival in mice subjected to the cecal ligation and puncture sepsis model
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1366955
PMID:38562928
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究免疫教育对小鼠T细胞在盲肠结扎和穿刺脓毒症模型中存活的影响 | 首次通过单细胞RNA测序探讨了免疫教育对小鼠T细胞在脓毒症模型中存活的影响 | 仅在单一早期时间点进行了研究，未探讨长期效应 | 研究免疫教育对小鼠T细胞在脓毒症模型中存活的影响 | 小鼠脾脏T细胞在盲肠结扎和穿刺脓毒症模型中的反应 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四组小鼠样本：对照组、免疫教育组、CLP组和免疫教育CLP组 |
| 2489 | 2024-11-07 |
Revisiting roles of mast cells and neural cells in keloid: exploring their connection to disease activity
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1339336
PMID:38524141
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研究论文 | 本文探讨了肥大细胞和神经细胞在瘢痕疙瘩中的作用及其与疾病活动的关系 | 首次通过单细胞RNA测序分析了活动性瘢痕疙瘩、非活动性瘢痕疙瘩和成熟瘢痕样本，揭示了肥大细胞和神经细胞在瘢痕疙瘩微环境中的重要作用 | 样本量较小，可能影响结果的普适性 | 阐明肥大细胞和神经细胞在瘢痕疙瘩发病机制中的作用及其与疾病活动的关系 | 瘢痕疙瘩样本中的肥大细胞和神经细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个活动性瘢痕疙瘩样本，4个非活动性瘢痕疙瘩样本，3个成熟瘢痕样本 |
| 2490 | 2024-11-07 |
Comprehensive analysis of lactylation-related gene sets and mitochondrial functions in gastric adenocarcinoma: implications for prognosis and therapeutic strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1451725
PMID:39478860
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研究论文 | 本研究探讨了乳酸化相关基因集和线粒体功能在胃腺癌中的预后意义，并提出了新的治疗策略 | 本研究通过整合大规模基因组数据，利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了胃腺癌中独特的分子亚型及其与生存结果和免疫特征的关系，并提出了优于现有模型的预后模型 | NA | 探讨乳酸化相关基因集和线粒体功能在胃腺癌中的预后意义，并提出新的治疗策略 | 胃腺癌中的乳酸化相关基因集、线粒体功能、肿瘤微环境、分子亚型、免疫细胞浸润和响应 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 预后模型 | 基因组数据 | 大规模基因组数据，包括TCGA和多个GEO数据集 |
| 2491 | 2024-11-07 |
Identification and validation of efferocytosis-related biomarkers for the diagnosis of metabolic dysfunction-associated steatohepatitis based on bioinformatics analysis and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1460431
PMID:39497821
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和机器学习方法，识别并验证了与代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）诊断相关的吞噬作用相关生物标志物 | 本研究首次系统地探讨了吞噬作用与MASH之间的关系，并通过机器学习构建了有效的诊断模型 | 本研究主要基于生物信息学分析和机器学习，缺乏大规模临床样本的验证 | 识别并验证与MASH诊断相关的吞噬作用相关生物标志物 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）及其相关的吞噬作用过程 | 机器学习 | 肝病 | 机器学习算法 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA |
| 2492 | 2024-11-07 |
Genomic and immune signatures predict clinical outcome in newly diagnosed multiple myeloma treated with immunotherapy regimens
2023-Dec, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00657-1
PMID:37945755
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研究论文 | 研究通过整合肿瘤全基因组和微环境单细胞RNA测序数据，探讨了新诊断的多发性骨髓瘤患者在接受包含达雷妥尤单抗的免疫治疗方案后的临床结果预测因素 | 首次通过整合肿瘤全基因组和微环境单细胞RNA测序数据，揭示了特定的基因驱动因素和免疫细胞变化对临床结果的影响 | 研究仅基于前瞻性2期试验数据，样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探讨新诊断的多发性骨髓瘤患者在接受包含达雷妥尤单抗的免疫治疗方案后的临床结果预测因素 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者及其在接受免疫治疗后的临床结果 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、RNA数据 | NA |
| 2493 | 2024-11-07 |
Transcriptional Landscape of Cotton Roots in Response to Salt Stress at Single-cell Resolution
2023-Oct-27, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100740
PMID:39492159
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术系统分析了棉花根系对盐胁迫的响应 | 首次在单细胞分辨率下描绘了盐胁迫下棉花根系的转录图谱，揭示了细胞异质性和分化轨迹 | NA | 探究盐胁迫下棉花根系的分子机制 | 棉花根系在盐胁迫下的响应 | NA | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 转录组数据 | 从自然生长和不同盐处理条件下的5天龄侧根尖中获得了56,281个高质量细胞 |
| 2494 | 2024-11-07 |
SOX9 Modulates the Transformation of Gastric Stem Cells Through Biased Symmetric Cell Division
2023-06, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.01.037
PMID:36740200
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研究论文 | 研究探讨了SOX9基因在胃干细胞通过偏向性对称细胞分裂进行恶性转化中的作用 | 提出了SOX9+SOX2+细胞在胃癌发生中的重要作用，并开发了一种新的鼠模型来研究这一过程 | 研究主要基于鼠模型和胃癌患者样本，可能无法完全反映人类胃癌的复杂性 | 研究胃干细胞在胃癌发生初期的行为，并探讨SOX9基因在这一过程中的作用 | 胃干细胞和胃癌 | NA | 胃癌 | 单细胞RNA测序、免疫染色、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 组织样本 | 鼠模型和胃癌患者样本 |
| 2495 | 2024-11-07 |
NF-κB activation in cardiac fibroblasts results in the recruitment of inflammatory Ly6Chi monocytes in pressure-overloaded hearts
2021-Oct-12, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.abe4932
PMID:34637330
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研究论文 | 研究揭示了心脏纤维母细胞在压力超负荷下通过NF-κB激活招募炎症性Ly6C单核细胞的机制 | 首次揭示了心脏纤维母细胞在压力超负荷下通过NF-κB激活招募炎症性Ly6C单核细胞的机制 | 研究仅在老鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨心脏纤维母细胞在压力超负荷下招募炎症性Ly6C单核细胞的机制 | 心脏纤维母细胞和Ly6C单核细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 老鼠模型 |
| 2496 | 2024-11-07 |
Control of the Anterior Pituitary Cell Lineage Regulator POU1F1 by the Stem Cell Determinant Musashi
2021-03-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaa245
PMID:33373440
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研究论文 | 本文研究了脂肪因子瘦素通过调节前垂体细胞系调控因子POU1F1的表达，影响能量稳态的机制 | 首次报道了干细胞标志物Musashi1对POU1F1 mRNA翻译的抑制作用，并揭示了瘦素信号通过逆转Musashi介导的POU1F1 mRNA翻译调控，协调前垂体生长激素细胞功能与代谢状态的机制 | NA | 探讨瘦素信号对前垂体细胞系调控因子POU1F1表达的调控机制 | 前垂体生长激素细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 来自对照雌性小鼠的垂体细胞 |
| 2497 | 2024-11-06 |
TNFα has differential effects on the transcriptome profile of selected populations in murine cartilage
2024-Dec, Osteoarthritis and cartilage open
DOI:10.1016/j.ocarto.2024.100528
PMID:39494399
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研究论文 | 研究探讨了肿瘤坏死因子α（TNFα）对小鼠软骨细胞转录组的影响 | 首次在单细胞分辨率下分析了TNFα对软骨细胞转录组的影响，并揭示了其对不同细胞群的差异性作用 | 研究仅限于新生C57BL/6小鼠的软骨细胞，未涉及其他物种或年龄段的小鼠 | 深入理解肿瘤坏死因子α（TNFα）在软骨细胞炎症反应中的作用 | 新生C57BL/6小鼠的骨骺软骨细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序（RNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 14,239个细胞和24,320个基因 |
| 2498 | 2024-11-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Metabolic Stress-Dependent Activation of Cardiac Macrophages in a Model of Dyslipidemia-Induced Diastolic Dysfunction
2024-Nov-05, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了高脂饮食诱导的ApoE敲除小鼠模型中心脏细胞的表达谱，揭示了代谢应激对心脏巨噬细胞的激活作用及其在舒张功能障碍中的作用 | 首次揭示了代谢应激通过内质网应激途径直接激活心脏巨噬细胞，并提出了钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂作为治疗HFpEF特定表型的潜在疗法 | NA | 探讨代谢应激对心脏炎症细胞的影响，特别是巨噬细胞，并评估钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂的潜在治疗效果 | ApoE敲除小鼠模型中的心脏细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | ApoE敲除小鼠 |
| 2499 | 2024-11-06 |
Angiotensin-Converting Enzyme-Dependent Intrarenal Angiotensin II Contributes to CTP: Phosphoethanolamine Cytidylyltransferase Downregulation, Mitochondrial Membranous Disruption, and Reactive Oxygen Species Overgeneration in Diabetic Tubulopathy
2024-Nov-04, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2024.0637
PMID:39495586
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研究论文 | 研究探讨了血管紧张素转换酶（ACE）依赖的肾内血管紧张素II在糖尿病肾小管病变中的作用 | 揭示了ACE依赖的肾内血管紧张素II在糖尿病肾小管病变中的关键作用，为治疗提供了新的见解 | NA | 测试ACE依赖的肾内血管紧张素II是否破坏肾小管线粒体膜稳态并导致过量ROS生成 | 糖尿病肾小管病变中的线粒体膜稳态和ROS生成 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 2500 | 2024-11-06 |
Single-cell sequencing applications in acute myeloid leukemia
2024-Nov-04, Leukemia & lymphoma
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/10428194.2024.2422833
PMID:39496597
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在急性髓系白血病中的应用及其进展 | 单细胞测序技术有助于理解急性髓系白血病中的遗传和功能异质性，特别是与白血病干细胞、克隆进化和可测量残留病监测相关的方面 | NA | 探讨单细胞测序技术在急性髓系白血病研究中的应用及其对临床实践的影响 | 急性髓系白血病及其相关细胞和遗传特征 | 数字病理学 | 血液系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |