单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 24941 - 24960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24941 | 2024-08-09 |
MARS: discovering novel cell types across heterogeneous single-cell experiments
2020-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-00979-3
PMID:33077966
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MARS的元学习方法，用于在异质单细胞RNA测序数据中识别和注释已知及新型细胞类型 | MARS通过跨多个数据集转移潜在细胞表示来克服细胞类型的异质性，并能发现以前未见过的细胞类型 | NA | 开发一种方法以在异质单细胞RNA测序数据中识别和注释新型细胞类型 | 异质单细胞RNA测序数据中的新型细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 数据集 | 大量小鼠细胞图谱 |
| 24942 | 2024-08-09 |
A new lymphoid-primed progenitor marked by Dach1 downregulation identified with single cell multi-omics
2020-12, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0799-x
PMID:33077975
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，识别了Dach1及其相关基因在淋巴样前体细胞中的表达模式，并利用Dach1-GFP报告鼠模型，鉴定了一类具有淋巴样潜能的新型前体细胞——淋巴样前体细胞（LPPs）。 | 本文首次鉴定了一种新型淋巴样前体细胞（LPPs），并定义了淋巴样发育在造血过程中的早期分支点。 | NA | 研究淋巴样前体细胞的鉴定及其在造血过程中的作用。 | 淋巴样前体细胞（LPPs）及其在造血过程中的作用。 | 血液学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24943 | 2024-08-09 |
Visualizing HIF-1α mRNA in a Subpopulation of Bone Marrow-Derived Cells to Predict Retinal Neovascularization
2020-11-20, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.0c00662
PMID:33080135
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研究论文 | 本文描述了一种新的混合纳米颗粒的合成，用于在小鼠新生血管化模型中选择性地可视化微胶质细胞/巨噬细胞中的HIF-1α mRNA | 开发了一种新的混合纳米颗粒，能够选择性地在特定组织微胶质细胞/巨噬细胞中可视化HIF-1α mRNA，用于预测新生血管化的发生和进展 | NA | 研究微胶质细胞/巨噬细胞在新生血管化中的调控作用，并开发一种新的方法来预测新生血管化的发生和进展 | 微胶质细胞/巨噬细胞中的HIF-1α mRNA表达 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 24944 | 2024-08-09 |
Leveraging Uncertainty in Machine Learning Accelerates Biological Discovery and Design
2020-11-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.09.007
PMID:33065027
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研究论文 | 本文展示了利用基于高斯过程的不确定性预测在生物发现中的广泛应用 | 通过量化预测不确定性，算法能够更好地处理超出训练数据分布的新现象 | NA | 加速生物发现和设计 | 化合物库中的化合物及其对不同激酶和结核分枝杆菌细胞生长的抑制作用 | 机器学习 | NA | 高斯过程 | NA | 化合物 | 72个化合物用于训练模型，10,833个化合物用于预测 |
| 24945 | 2024-08-09 |
Cell-type-specific 3D epigenomes in the developing human cortex
2020-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2825-4
PMID:33057195
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研究论文 | 研究了人类皮质发育过程中特定细胞类型的三维表观基因组特征 | 开发了CRISPRview技术，整合免疫染色、CRISPR干扰、RNAscope和图像分析，验证了细胞类型特异性的顺式调控元件 | NA | 揭示发育中人类皮质中细胞类型特异性的基因表达模式，并增进对基因调控和谱系特化的理解 | 放射状胶质细胞、中间前体细胞、兴奋性神经元和抑制性神经元 | 表观遗传学 | NA | CRISPR干扰、RNAscope、图像分析 | NA | 基因组数据 | 来自中孕期人类皮质样本的多种细胞类型 |
| 24946 | 2024-08-09 |
PREIMPLANTATION GENETIC TESTING: Single-cell technologies at the forefront of PGT and embryo research
2020-11, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-20-0102
PMID:33065545
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研究论文 | 本文探讨了单细胞技术在胚胎植入前遗传测试（PGT）和胚胎研究中的应用 | 介绍了高吞吐量技术如DNA微阵列和大规模并行测序的发展，使得单细胞基因组研究从评估少数位点扩展到全面筛查所有24条染色体 | NA | 研究单细胞技术在胚胎发育和遗传疾病检测中的应用 | 胚胎的染色体镶嵌现象及其对胚胎发育的影响 | 遗传学 | 遗传性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 24947 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: A single-cell transcriptome atlas of marsupial embryogenesis and X inactivation
2020-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2840-5
PMID:33067604
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24948 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics uncover distinct innate and adaptive cell subsets during tissue homeostasis and regeneration
2020-11, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.6MR0720-131R
PMID:33070367
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在揭示组织稳态和再生过程中不同免疫细胞亚群中的应用 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）提供了一种前所未有的方法，无需依赖先验的细胞特异性标记即可揭示细胞多样性 | NA | 探讨scRNA-Seq如何促进免疫细胞的表征，包括巨噬细胞、固有淋巴细胞和T、B淋巴细胞，以及发现免疫细胞异质性、识别新亚群和追踪不同免疫细胞在组织稳态、修复和再生中的发育轨迹 | 免疫细胞在组织修复和再生中的作用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 24949 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Engineered Cardiac Tissues From Patient-Specific Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes Reveals Abnormal Developmental Trajectory and Intrinsic Contractile Defects in Hypoplastic Right Heart Syndrome
2020-10-20, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.120.016528
PMID:33059525
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和表型分析，比较了来自患者和健康个体的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞及其工程化组织模型，揭示了肺动脉闭锁伴完整室间隔（PAIVS）中先天性心脏病的内在发育和功能异常 | 首次揭示了PAIVS中心肌细胞发育和功能的内在异常，排除了次要解剖缺陷的影响 | NA | 理解PAIVS中先天性心脏病的内在发育和功能异常 | 来自患者和健康个体的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞及其工程化组织模型 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 3名PAIVS患者和3名健康个体的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞及其工程化组织模型 |
| 24950 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Parkinson's Disease Human In Vitro Models Reveals Dopamine Neuron-Specific Stress Responses
2020-10-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108263
PMID:33053338
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了帕金森病人类体外模型中多巴胺神经元对细胞毒性和遗传应激的基因表达动态 | 首次进行了最大规模的单细胞转录组学研究，揭示了多巴胺神经元亚型的转录特征和应激敏感性差异 | NA | 阐明帕金森病中多巴胺神经元在细胞毒性和遗传应激下的基因表达动态 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）衍生的多巴胺神经元 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个神经元亚型 |
| 24951 | 2024-08-09 |
Identification of oncolytic vaccinia restriction factors in canine high-grade mammary tumor cells using single-cell transcriptomics
2020-10, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1008660
PMID:33075093
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法，分析了犬高级别乳腺肿瘤细胞中溶瘤痘病毒的限制因子，特别是DDIT4基因的作用 | 首次揭示了DDIT4基因在溶瘤痘病毒治疗中的潜在抗性标记作用，并展示了单细胞转录组学在识别影响病毒复制的细胞因子方面的应用 | NA | 探讨溶瘤痘病毒在犬乳腺肿瘤细胞中的效力和潜在的抗性因子 | 犬高级别乳腺肿瘤细胞，特别是三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个不同的三阴性乳腺癌细胞样本，分别感染或未感染痘病毒 |
| 24952 | 2024-08-09 |
Cell Development Deficiency and Gene Expression Dysregulation of Trisomy 21 Retina Revealed by Single-Nucleus RNA Sequencing
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.564057
PMID:33072724
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研究论文 | 本文通过单核RNA测序技术揭示了唐氏综合症（T21）视网膜的细胞发育缺陷和基因表达失调 | 首次提供了人类T21视网膜的单细胞转录组图谱，揭示了细胞组成的多样性和异质性以及异常的细胞构成 | NA | 评估染色体非整倍性对视网膜发育的影响 | 唐氏综合症（T21）视网膜的单细胞转录组特征 | 数字病理学 | 唐氏综合症 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一个T21胎儿的视网膜样本 |
| 24953 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Data Clustering by Low-Rank Subspace Ensemble Framework
2022 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2020.3029187
PMID:33026977
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研究论文 | 本文提出了一种低秩子空间集成聚类框架（LRSEC）用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析 | LRSEC框架通过低秩子空间捕获数据的全局结构，相比单一聚类模型具有更好的聚类性能 | NA | 分析scRNA-seq数据，揭示细胞的异质性和多样性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 低秩模型 | 基因表达数据 | 七个小数据集和一个大数据集 |
| 24954 | 2024-08-09 |
Deconvolution of monocyte responses in inflammatory bowel disease reveals an IL-1 cytokine network that regulates IL-23 in genetic and acquired IL-10 resistance
2021-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-321731
PMID:33037057
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研究论文 | 研究炎症性肠病中IL-23表达的调控机制，并探讨其在个性化治疗中的应用 | 识别了IL-10和IL-1作为单核细胞IL-23产生的关键调节因子，并区分了稳态和超炎症相关的IL-23产生 | NA | 探讨IL-23在炎症性肠病中的调控机制，为个性化治疗提供依据 | 人类单核细胞和外周血单核细胞中的IL-23表达 | NA | 炎症性肠病 | 转录组分析，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康个体和炎症性肠病患者的单核细胞样本 |
| 24955 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq of Human Myeloid-Derived Suppressor Cells in Late Sepsis Reveals Multiple Subsets With Unique Transcriptional Responses: A Pilot Study
2021-05-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000001671
PMID:33021571
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了晚期脓毒症患者中的髓源抑制细胞（MDSCs）的转录组特征 | 首次揭示了晚期脓毒症中MDSCs的多个亚群及其独特的转录反应 | 研究样本量较小，仅为两名晚期脓毒症患者和两名对照受试者 | 探究晚期脓毒症中髓源抑制细胞的转录组特征及其在免疫抑制中的作用 | 晚期脓毒症患者的髓源抑制细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 两名晚期脓毒症患者和两名对照受试者的血液样本 |
| 24956 | 2024-08-09 |
Ensemble learning models that predict surface protein abundance from single-cell multimodal omics data
2021-05, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2020.10.001
PMID:33039573
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研究论文 | 本文比较了几种基于树的集成学习方法与神经网络模型，发现集成学习通常优于神经网络，特别是随机森林（RF）表现最佳 | 首次系统比较了集成学习方法与神经网络在预测单细胞多模态组学数据中表面蛋白丰度的效果，并发现集成学习方法更为有效 | 文章未明确提及具体的局限性 | 探索并改进从单细胞多模态组学数据中预测蛋白质丰度的机器学习模型性能 | 单细胞多模态组学数据中的RNA和蛋白质丰度 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 集成学习模型，随机森林（RF） | 单细胞多模态组学数据 | 未具体说明样本数量 |
| 24957 | 2024-08-09 |
STARCH: copy number and clone inference from spatial transcriptomics data
2021-03-09, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/abbe99
PMID:33022659
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STARCH的新方法，用于从空间转录组数据中推断拷贝数变异和克隆信息 | STARCH方法利用肿瘤中相邻细胞可能共享相似拷贝数变异的观察结果，克服了从RNA测序数据中推断拷贝数变异的挑战 | NA | 开发一种新的方法来从空间转录组数据中推断肿瘤细胞的拷贝数变异 | 肿瘤细胞的拷贝数变异和克隆信息 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 每个点包含少量细胞的网格 |
| 24958 | 2024-08-09 |
The mononuclear phagocyte system contributes to fibrosis in post-transplant obliterans bronchiolitis
2021-03, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00344-2020
PMID:33033147
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research paper | 本研究使用谱系追踪工具追踪或清除异位气管移植模型中潜在的肌成纤维细胞来源，以识别移植后气道纤维闭塞的间充质细胞前体 | 发现受体来源的髓系祖细胞是同种异体移植后气道浸润的间充质细胞的临床相关来源，并提出针对单核吞噬细胞系统的治疗可能改善肺移植后的长期结果 | NA | 识别移植后气道纤维闭塞的间充质细胞前体 | 肌成纤维细胞的来源及其在移植后纤维化过程中的作用 | NA | 肺移植后闭塞性细支气管炎综合征 | 谱系追踪、组织学分析、共聚焦显微镜、流式细胞术、单细胞转录组分析 | NA | 组织样本 | NA |
| 24959 | 2024-08-09 |
Transcriptional heterogeneity of clonal plasma cells and immune evasion in immunoglobulin light chain amyloidosis
2021-Feb, International journal of hematology
IF:1.7Q3
DOI:10.1007/s12185-020-03016-3
PMID:33040275
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了免疫球蛋白轻链淀粉样变性（AL淀粉样变性）患者的浆细胞（PCs）的转录异质性和免疫逃避机制 | 发现了AL淀粉样变性患者克隆浆细胞中MHC I类分子的过度表达和自然杀伤（NK）细胞频率的显著降低 | 研究样本量较小，仅包括四名AL淀粉样变性患者、一名治疗后的AL患者和六名健康对照 | 探讨AL淀粉样变性患者浆细胞的转录异质性和免疫逃避机制 | AL淀粉样变性患者的浆细胞和免疫系统 | 数字病理学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 四名AL淀粉样变性患者、一名治疗后的AL患者和六名健康对照 |
| 24960 | 2024-08-09 |
Defining circulating mononuclear cells in heart failure through single-cell RNA sequencing: new insights for an old disease
2021-01-21, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaa156
PMID:33049776
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |