单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 24841 - 24860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24841 | 2024-08-09 |
CaMKIIα-Positive Interneurons Identified via a microRNA-Based Viral Gene Targeting Strategy
2020-12-09, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2570-19.2020
PMID:33158963
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研究论文 | 本文介绍了一种基于microRNA的病毒基因靶向策略，用于识别表达CaMKIIα的阳性中间神经元 | 提出了一种新的病毒基因表达策略，使用microRNA引导的神经元标签（mAGNET）来靶向具有特定microRNA表达的细胞 | NA | 研究大脑细胞中基因表达的多样性，并探索基因表达与生理特性之间的关系 | 表达CaMKIIα的中间神经元及其生理特性 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 雄性和雌性小鼠 |
| 24842 | 2024-08-09 |
Optimized Langendorff perfusion system for cardiomyocyte isolation in adult mouse heart
2020-12, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.15773
PMID:33147379
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research paper | 本文介绍了一种优化的Langendorff灌流系统，用于从成年小鼠心脏中分离心肌细胞 | 提出了一个简化和标准化的操作协议，利用重力作为灌流压力，并引入了新的去泡方法和消化终止标准 | NA | 改进Langendorff灌流系统，以提高心肌细胞的活性和纯度，满足单细胞测序技术的要求 | 成年小鼠心脏中的心肌细胞 | digital pathology | 心血管疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 细胞 | 多次自然重力沉降后获得稳定的心肌细胞 |
| 24843 | 2024-08-09 |
Toward a Consensus View of Mammalian Adipocyte Stem and Progenitor Cell Heterogeneity
2020-12, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2020.09.007
PMID:33148396
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综述 | 本文综述了关于哺乳动物脂肪细胞干细胞和前体细胞异质性的当前知识 | 利用单细胞转录组学技术，提供了对不同哺乳动物脂肪库中ASPCs细胞复杂性的新见解 | ASPCs的分子异质性和功能多样性仍未完全理解 | 探讨哺乳动物脂肪细胞干细胞和前体细胞的异质性 | 脂肪干细胞和前体细胞（ASPCs）及其在脂肪组织中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明 |
| 24844 | 2024-08-09 |
Defining the Teratoma as a Model for Multi-lineage Human Development
2020-11-25, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.10.018
PMID:33152263
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研究论文 | 本文提出畸胎瘤作为研究人类多谱系发育过程的有前景的平台，并通过单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9敲除筛选等技术验证了其潜力 | 畸胎瘤被证明能够模拟多谱系发育、泛组织功能遗传筛选和组织工程 | NA | 探索畸胎瘤作为研究人类发育过程的平台 | 畸胎瘤及其在人类发育中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (RNA-seq), CRISPR-Cas9, 微RNA (miRNA) 调控 | NA | 细胞 | 23个畸胎瘤，共179,632个细胞，来自4个细胞系 |
| 24845 | 2024-08-09 |
Comprehensive analysis of single-cell RNA sequencing data from healthy human marrow hematopoietic cells
2020-Nov-10, BMC research notes
IF:1.6Q2
DOI:10.1186/s13104-020-05357-y
PMID:33168060
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来自健康供体的391个骨髓CD34+细胞，以揭示造血过程中的转录异质性和动态变化 | 首次综合分析了健康人骨髓造血细胞的单细胞RNA测序数据，并结合长非编码RNA表达和染色质可及性测序数据，揭示了造血细胞分化过程中的基因表达调控模式 | NA | 探究造血过程中的转录异质性和动态变化 | 健康人骨髓中的CD34+造血干细胞/祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 391个单细胞 |
| 24846 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis demonstrates inter-patient and intra-tumor heterogeneity in primary and metastatic lung adenocarcinoma
2020-11-10, Aging
DOI:10.18632/aging.103945
PMID:33170151
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研究论文 | 本研究通过分析来自GSE123902和GSE131907数据集的50个原发性和转移性肺腺癌样本的单细胞转录组数据，揭示了患者间和肿瘤内异质性的景观 | 研究展示了单细胞转录组分析在揭示肺腺癌原发和转移组织中与肿瘤进展、化疗抵抗和代谢相关的通路调控异质性方面的创新应用 | NA | 确定原发性和转移性肺腺癌中患者间和肿瘤内异质性的景观 | 原发性和转移性肺腺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 50个原发性和转移性肺腺癌样本 |
| 24847 | 2024-08-09 |
Unveiling the heterogeneity of NKT cells in the liver through single cell RNA sequencing
2020-11-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-76659-1
PMID:33173202
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肝脏中NKT细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面描述了NKT细胞的异质性，并发现了一个先前未定义的功能性NKT细胞亚群 | NA | 研究NKT细胞在肝脏中的异质性及其功能 | 肝脏中的NKT细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型、Jα18缺陷型和CD1d缺陷型小鼠的肝脏NKT细胞 |
| 24848 | 2024-08-09 |
Fate and functional roles of Prominin 1+ cells in liver injury and cancer
2020-11-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-76458-8
PMID:33173221
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研究论文 | 本文通过遗传谱系追踪研究了Prominin 1 (PROM1)细胞在酒精性肝炎(AH)和肝细胞癌(HCC)中的起源、命运和功能 | 首次揭示了PROM1细胞在AH和HCC中的起源和功能，并发现Discodin Domain Receptor 1 (DDR1)在PROM1细胞中的独特上调及其与患者生存的负相关性 | NA | 探讨PROM1细胞在肝脏损伤和癌症中的作用及其潜在的驱动因子 | PROM1细胞在酒精性肝炎和肝细胞癌中的起源、命运和功能 | NA | 肝细胞癌 | 遗传谱系追踪、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24849 | 2024-08-09 |
Benchmarking of cell type deconvolution pipelines for transcriptomics data
2020-11-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19015-1
PMID:33159064
|
研究论文 | 本文通过五个单细胞RNA测序数据集生成的伪批量混合物，评估了数据转换、预处理、标记选择、细胞类型组成和方法选择对转录组数据细胞类型反卷积结果的综合影响 | 首次全面评估了影响转录组数据细胞类型反卷积的各种因素，并提出了提高反卷积性能的一般指导原则 | 研究主要集中在方法的比较和数据处理的影响上，未涉及实际生物样本的应用 | 评估和优化转录组数据细胞类型反卷积的方法 | 转录组数据的细胞类型反卷积方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五个单细胞RNA测序数据集 |
| 24850 | 2024-08-09 |
A single-cell atlas and lineage analysis of the adult Drosophila ovary
2020-11-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19361-0
PMID:33159074
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术构建了成年果蝇卵巢的综合细胞图谱，包括生殖干细胞及其微环境细胞、滤泡干细胞和先前未描述的伴细胞亚群的转录组特征 | 发现了伴细胞的一个独特亚群能够在饥饿或遗传操作下转化为滤泡干细胞 | NA | 研究果蝇卵巢中细胞类型及其转录组特征和细胞谱系 | 成年果蝇卵巢中的主要细胞类型及其功能 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 包含成年果蝇卵巢中每种主要细胞类型的转录组数据 |
| 24851 | 2024-08-09 |
Investigating transcriptome-wide sex dimorphism by multi-level analysis of single-cell RNA sequencing data in ten mouse cell types
2020-11-05, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-020-00335-2
PMID:33153500
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了十种小鼠细胞类型中的转录组范围内的性别二态性，并探索了其功能后果。 | 本研究采用了一种新颖的计算流程，结合标准差异表达分析和单细胞转录组中差异分布的鉴定，以测试基于性别的基因表达差异。 | NA | 探索性别二态性相关的基于基因表达的生物标志物、功能细胞组分和转录调控网络。 | 十种小鼠细胞类型（来自大脑和心脏）的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 年轻成年雌性和雄性小鼠的十种细胞类型 |
| 24852 | 2024-08-09 |
Widespread Traces of Lytic Kaposi Sarcoma-Associated Herpesvirus in Primary Effusion Lymphoma at Single-Cell Resolution
2020-Nov-05, Microbiology resource announcements
IF:0.7Q4
DOI:10.1128/MRA.00851-20
PMID:33154001
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术，检测了原发性渗出性淋巴瘤（PEL）细胞中Kaposi肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）和Epstein-Barr病毒（EBV）的转录相互作用 | 首次在单细胞分辨率下检测到KSHV裂解基因的广泛表达痕迹 | NA | 探究KSHV和EBV在PEL细胞中的转录相互作用 | 原发性渗出性淋巴瘤细胞中的KSHV和EBV | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24853 | 2024-08-09 |
The bone marrow microenvironment of pre-B acute lymphoblastic leukemia at single-cell resolution
2020-11-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-76157-4
PMID:33154494
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细描述了小鼠骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病进展中的动力学特征 | 首次详细揭示了骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病早期阶段的分子复杂性和细胞间相互作用 | NA | 深入了解骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病中的分子复杂性 | 骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病进展中的分子变化和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠骨髓微环境中的细胞样本 |
| 24854 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: Bayesian model selection reveals biological origins of zero inflation in single-cell transcriptomics
2020-Nov-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02182-1
PMID:33143736
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24855 | 2024-08-09 |
Embryonic liver developmental trajectory revealed by single-cell RNA sequencing in the Foxa2eGFP mouse
2020-11-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01364-8
PMID:33144666
|
研究论文 | 本研究利用转基因Foxa2报告鼠系，通过单细胞全长mRNA测序技术，揭示了从E7.5到E15.5胚胎阶段肝脏发育轨迹及其转录组特征 | 首次详细描述了胚胎肝脏发育轨迹，识别了具有肠道和肝脏特征的肝脏原基，并记录了肝细胞转化过程中的动态基因表达 | NA | 深入理解肝脏和胆囊在早期胚胎阶段的发育过程 | 胚胎肝脏和胆囊的发育轨迹及其转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞全长mRNA测序 | NA | 转录组 | 从E7.5到E15.5的十个胚胎阶段的内胚层和肝细胞 |
| 24856 | 2024-08-09 |
Mitochondria Define Intestinal Stem Cell Differentiation Downstream of a FOXO/Notch Axis
2020-11-03, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.10.005
PMID:33147486
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研究论文 | 本文研究了线粒体在FOXO/Notch信号通路下游对肠道干细胞分化的影响 | 揭示了FOXO转录因子和Notch信号在调控线粒体分裂及干细胞向杯状细胞和潘氏细胞分化中的新作用 | NA | 探讨线粒体在肠道干细胞分化中的作用及其与FOXO和Notch信号的相互关系 | 肠道干细胞及其分化过程 | NA | NA | scRNA-seq | NA | RNA | 小鼠肠道组织 |
| 24857 | 2024-08-09 |
A network medicine approach to investigation and population-based validation of disease manifestations and drug repurposing for COVID-19
2020-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3000970
PMID:33156843
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研究论文 | 本研究采用网络医学方法，结合临床和多组学观察，旨在识别SARS-CoV-2的发病机制、疾病表现及COVID-19的治疗方法 | 研究揭示了COVID-19与炎症性肠病和哮喘之间的共同病理生物学，并发现褪黑素可能作为预防和治疗COVID-19的潜在药物 | 研究主要基于观察性研究和网络预测，需要进一步的临床试验验证 | 识别SARS-CoV-2的发病机制、疾病表现及COVID-19的治疗方法 | SARS-CoV-2的发病机制、疾病表现及COVID-19的治疗方法 | 网络医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、代谢组学、转录组学 | 网络模型 | 蛋白质相互作用、转录组、蛋白质组 | 26,779名个体 |
| 24858 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of Different Stages of Oral Cancer Carcinogenesis in a Mouse Model
2020-Oct-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21218171
PMID:33142921
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了在小鼠模型中口腔癌致癌过程中不同阶段的基因表达特征 | 首次在单细胞水平上分析了口腔癌致癌过程中的基因表达变化，并识别了与MYC_targets_v1通路相关的细胞亚型标记物 | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床应用需要进一步验证 | 探究口腔癌致癌过程中不同阶段的基因表达特征，并寻找潜在的生物标志物 | 小鼠口腔癌致癌过程中的细胞亚型及其基因表达 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | Louvain算法 | 基因表达数据 | 使用了C57BL/6J雄性小鼠，分为对照组和治疗组，共进行了8、16、20和29周的实验 |
| 24859 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals the heterogeneity of the decidual endothelial cells that participate in labor onset
2020-10, European review for medical and pharmacological sciences
DOI:10.26355/eurrev_202010_23385
PMID:33155267
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术探讨了分娩前后蜕膜内皮细胞的异质性及其功能变化 | 揭示了蜕膜内皮细胞在分娩过程中的异质性，并发现了可能在分娩中更活跃的特定亚型 | NA | 探究蜕膜内皮细胞的异质性及其在分娩过程中的变化 | 蜕膜内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 9748个细胞 |
| 24860 | 2024-08-09 |
Advances and challenges in single-cell RNA-seq of microbial communities
2020-10, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2020.10.001
PMID:33160164
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在微生物群落研究中的进展和挑战 | 探讨了如何将单细胞RNA测序技术扩展到高吞吐量，以研究数千种微生物 | 单细胞RNA测序技术在真菌、原生生物和细菌中的应用仍处于初级阶段 | 旨在整合哺乳动物和微生物的单细胞分析，以研究健康和疾病中的微生物群落 | 微生物群落的分子状态 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |