单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 41850 篇文献，本页显示第 2461 - 2480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2461 | 2026-06-19 |
Immune cells during compensatory renal hypertrophy after unilateral nephrectomy
2026-May-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9568023/v1
PMID:42183369
|
研究论文 | 探讨单侧肾切除后代偿性肾肥大的免疫细胞动态变化及其对肾功能的影响 | 首次系统揭示单侧肾切除后残余肾脏中免疫细胞的多阶段动态变化，包括先天性免疫快速激活、适应性免疫逐步调控以及免疫检查点水平变化，并发现Rag1小鼠中GFR恢复更显著 | 研究基于小鼠模型，结果需在人体中验证；未深入探讨具体免疫细胞亚群的分子机制 | 阐明单侧肾切除后代偿性肾肥大中免疫细胞的作用及机制 | 小鼠（野生型C57BL/6和Rag1小鼠） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、肾小球滤过率测量 | 无特定模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠模型，具体数量未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 2462 | 2026-06-19 |
GatorSC: multi-scale cell and gene graphs with mixture-of-experts fusion for single-cell transcriptomics
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag330
PMID:42308421
|
研究论文 | 提出GatorSC框架，通过多尺度细胞和基因图与混合专家融合进行单细胞转录组学表示学习 | 首次将多尺度细胞图和基因图与混合专家架构结合，通过图重建和图对比学习的自监督目标实现噪声鲁棒和结构保持的表示学习 | 未明确讨论计算效率或大规模数据集的扩展性 | 开发统一的表示学习框架，有效利用单细胞转录组数据中跨细胞和基因的多尺度结构信息进行综合分析 | 单细胞转录组数据中的细胞和基因 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | 图神经网络、混合专家模型 | 单细胞基因表达数据 | 19个公开scRNA-seq数据集，涵盖不同组织、物种和测序平台；一个阿尔茨海默病单细胞核数据集 | NA | scRNA-seq | NA | NA |
| 2463 | 2026-06-19 |
Current trends and challenges in deciphering single molecule resolution maps of single cell transcriptomes
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag323
PMID:42308418
|
综述 | 回顾单细胞RNA测序技术从手动分离到高通量短读和长读测序的演变，并讨论其在单分子分辨率下解析单细胞转录组的当前趋势与挑战 | 整合技术、计算和生物学视角，系统阐述长读长测序与高通量条形码结合后对细胞异质性和转录动态研究的变革潜力 | 文中未提及自身局限性，但长读长测序仍面临碱基识别准确性较低和通量相对短读技术不足等问题 | 总结单细胞RNA测序技术发展历程并探讨长读长测序在单细胞转录组学中的应用前景 | 单细胞RNA测序技术及其在细胞异质性、转录动态及相关计算工具中的应用 | 自然语言处理 | NA | RNA-seq, scRNA-seq, 长读长测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, 组合条形码平台 | 高通量短读液滴与组合条形码平台，结合长读长测序协议 |
| 2464 | 2026-06-19 |
Machine learning-guided multimodal profiling defines perturbed immune states at the time of cancer diagnosis
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag320
PMID:42308424
|
研究论文 | 利用机器学习引导的多模态分析，在癌症诊断时描绘外周血单个核细胞的免疫状态变化 | 首次整合流式细胞术、多重细胞因子分析和单细胞RNA测序的多组学数据，并结合机器学习模型对初治癌症患者的免疫状态进行系统性刻画，且模型可解释性强 | 未在独立外部队列中验证模型的泛化能力，样本量可能有限，且仅聚焦于外周血而未能涵盖肿瘤微环境 | 阐明癌症诊断时全身免疫状态的扰动特征，并建立基于免疫的多组学分析方法 | 初治癌症患者的血液样本，包括外周血单个核细胞和血浆 | 机器学习 | 癌症 | 流式细胞术、多重细胞因子分析、单细胞RNA测序 | 机器学习模型（具体类型未明确） | 单细胞多组学数据（流式细胞术和单细胞RNA测序）、血浆细胞因子数据 | 初治癌症患者与健康供者，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | NA |
| 2465 | 2026-06-19 |
Activation of the Cerebrospinal Fluid-Contacting Nucleus Mitigates Systemic Inflammation Induced by Sepsis
2026-May-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002665
PMID:41457044
|
研究论文 | 本研究揭示脑脊液接触核在脓毒症中通过调控免疫反应发挥保护性作用 | 首次阐明脑脊液接触核通过神经-免疫交互机制调控脓毒症全身性炎症反应 | 未明确脑脊液接触核调控免疫的具体下游分子通路 | 探究脑脊液接触核在脓毒症中的免疫调节作用及机制 | 脓毒症小鼠模型中的脑脊液接触核 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症小鼠脑脊液接触核组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 2466 | 2026-06-19 |
Integrated Bulk and Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Transcriptional Activation of PTGS2 by FOS in Progression From T2DM to T2DM-Associated NAFLD
2026-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71182
PMID:42108421
|
研究论文 | 通过整合批量与单细胞RNA测序数据，揭示FOS介导的PTGS2转录激活在2型糖尿病相关非酒精性脂肪肝病进展中的调控作用 | 首次证明FOS直接结合PTGS2启动子驱动其转录，并阐明该通路在T2DM向NAFLD转化中介导肝脏炎症和凋亡的机制 | 未提及具体局限性 | 探究从2型糖尿病进展为T2DM相关非酒精性脂肪肝病的分子机制 | 2型糖尿病及T2DM相关NAFLD患者样本中的基因表达和调控网络 | 机器学习和转录组学 | 2型糖尿病, 非酒精性脂肪肝病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 双荧光素酶报告实验 | LASSO回归, 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2467 | 2026-06-19 |
Integrating single-cell RNA and bulk RNA sequencing data to identify prognostic genes associated with pyrimidine metabolism in triple-negative breast cancer by machine learning algorithm combinations
2026-Apr-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05118-6
PMID:42060238
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA和批量RNA测序数据，利用机器学习算法组合识别三阴性乳腺癌中与嘧啶代谢相关的预后基因 | 采用101种机器学习算法组合构建风险模型，并结合单细胞RNA测序分析探索与预后基因表达相关的细胞类型 | 数据均来自公共数据库，未提及外部验证队列的多样性或前瞻性验证 | 识别三阴性乳腺癌中与嘧啶代谢相关的预后基因并构建风险模型 | 三阴性乳腺癌的基因表达数据和患者预后信息 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序 | 机器学习算法组合 | 基因表达数据 | 来自公共数据库的三阴性乳腺癌样本 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2468 | 2026-06-19 |
Integration of 117 machine learning algorithms and single-cell transcriptomics identifies macrophage polarization and ER stress signatures for cancer prognosis and precision therapy
2026-Apr-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05126-6
PMID:42062606
|
研究论文 | 通过整合117种机器学习算法和单细胞转录组学，识别巨噬细胞极化和内质网应激特征用于癌症预后和精准治疗 | 首次系统性地在泛癌水平分析巨噬细胞极化和内质网应激相关基因，并利用117种机器学习算法组合开发出稳健的预后特征 | 未提及具体限制 | 探究巨噬细胞极化和内质网应激相关基因在癌症进展和治疗抵抗中的作用，并开发预后标志物和精准治疗策略 | 33种癌症类型的多组学数据，包括TCGA、GTEx、CCLE以及单细胞RNA测序数据集中的86,378个细胞 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法组合（117种） | 文本 | 86,378个单细胞（来自多种癌症类型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2469 | 2026-06-19 |
Lipid metabolism as a central driver of immune remodeling and therapeutic vulnerability in metastatic colorectal cancer
2026-Apr-30, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-026-02956-9
PMID:42063056
|
综述 | 本综述整合了结直肠癌中脂质代谢重编程的最新知识，结合新兴多组学见解，揭示了脂质代谢在转移性结直肠癌免疫重塑和潜在治疗靶点中的核心驱动作用 | 通过整合单细胞和空间转录组学、代谢组学及脂质组学等多组学技术，首次高分辨率绘制了转移性结直肠癌病变中脂质依赖性免疫微环境，并识别出先前未被认识到的代谢脆弱性，提出了脂质代谢作为统一框架理解转移性结直肠癌生物学 | 研究主要基于相关性和临床前证据，缺乏大规模临床验证，脂质代谢与免疫重塑的因果关系机制尚需进一步确认 | 系统阐述脂质代谢在结直肠癌转移中驱动免疫重塑和产生治疗易感性的分子机制，并探讨靶向脂质代谢通路与免疫治疗的协同策略 | 结直肠癌，特别是转移性结直肠癌 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学，空间转录组学，代谢组学，脂质组学 | NA | 多组学数据 | 鼠类模型和人类研究数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学，代谢组学，脂质组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞转录组测序，10x Visium空间转录组学技术 |
| 2470 | 2026-06-19 |
Identification and validation of an intratumor heterogeneity-related prognostic signature in triple-negative breast cancer: a study based on integrative machine learning and single-cell sequencing
2026-Apr-25, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-026-02291-y
PMID:42035196
|
研究论文 | 本研究结合机器学习和单细胞测序，构建并验证了三阴性乳腺癌中基于肿瘤内异质性的预后签名，提高了预后预测准确性 | 创新性地结合十种机器学习算法和单细胞测序技术，构建了包含七个基因的肿瘤内异质性相关预后签名，并验证了其对免疫治疗反应的预测能力 | 该研究主要基于公共数据库，未说明外部前瞻性验证样本的获取情况 | 开发并验证基于肿瘤内异质性的三阴性乳腺癌预后签名，以改进风险分层和治疗反应预测 | 三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞测序，qRT-PCR | StepCox[backward] + GBM | 转录组数据 | METABRIC训练集以及来自GEO数据库的多个验证集，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2471 | 2026-06-19 |
Integrating optogenetic fMRI and spatial transcriptomics to reveal circuit-specific gene signatures in fronto- and hippo-thalamic networks
2026-Apr-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71923-w
PMID:42000729
|
研究论文 | 通过整合清醒小鼠的光遗传学fMRI和空间转录组学，揭示前额-丘脑和海马-丘脑通路中调控神经血管耦合的回路特异性基因特征 | 首次在同一小鼠中同时进行清醒光遗传学fMRI与空间转录组学分析，克服了跨模态数据来自不同个体的局限性，实现了神经活动与基因表达的因果关联解析 | 仅关注前额-丘脑和海马-丘脑两个回路，且传统线性模型主要捕获线性基因-过程关系，未充分探索非线性计算方法 | 揭示微观分子结构如何塑造宏观脑网络组织，特别是基因表达与神经血管耦合之间的因果联系 | 清醒状态下的B6小鼠，涉及前额叶皮层、海马下托和丘脑区域 | 计算机视觉 | 不适用 | 光遗传学fMRI, 空间转录组学 | 广义线性模型, 主成分分析 | fMRI影像, 空间基因表达数据 | 同一批小鼠，具体数量未详述 | NA | 空间转录组学, 光遗传学fMRI | NA | 采用定制化光遗传学fMRI和空间转录组学流程，具体平台未指明 |
| 2472 | 2026-06-19 |
Single-cell transcriptomic landscape highlights epithelial-fibroblast interactions and CD44-mediated malignant traits in laryngeal squamous cell carcinoma
2026-Apr-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01431-z
PMID:42000946
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示喉鳞状细胞癌中上皮-成纤维细胞相互作用及CD44介导的恶性特征 | 首次在喉鳞状细胞癌中绘制单细胞转录组图谱，识别出三种恶性上皮亚型和五种成纤维细胞亚型，并发现CD44在成纤维细胞-上皮细胞互作中驱动转移的关键作用 | 样本量较小（仅3例患者），未提及功能验证的体内模型细节及临床相关性分析 | 探究喉鳞状细胞癌中上皮细胞和成纤维细胞的异质性及其在肿瘤进展和转移中的作用 | 喉鳞状细胞癌患者的原发肿瘤、癌旁正常组织和转移淋巴结样本 | 数字病理学 | 喉鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3例患者的9份匹配样本（原发肿瘤、癌旁组织、转移淋巴结各3份） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 2473 | 2026-06-19 |
Antiviral CD4+ T and myeloid cell responses to influenza vaccines are attenuated in older adults
2026-Apr-17, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-026-01586-7
PMID:41998201
|
研究论文 | 本研究结合体外和体内免疫检测与人类样本，在血清学和单细胞水平上探究老年人和年轻人对流感疫苗的B细胞、CD4+ T细胞和髓系细胞反应差异 | 首次在单细胞转录组水平揭示老年人在流感疫苗应答中T辅助细胞和髓系细胞干扰素转录程序减弱，且抗体应答虽正常但细胞免疫应答受损 | 未明确说明局限性 | 探究老年人对流感疫苗的细胞免疫反应减弱机制，特别是CD4+ T细胞和髓系细胞的转录变化 | 年轻和老年人外周血样本中的B细胞、CD4+ T细胞和髓系细胞 | NA | 老年疾病 | 单细胞转录组测序（single-cell transcriptomics） | NA | 基因表达数据 | 年轻人和老年人的血液样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2474 | 2026-06-19 |
Integrative single-cell analysis reveals endothelial diversity in the vasa vasorum of human atherosclerosis
2026-Apr-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10095-1
PMID:41998210
|
研究论文 | 通过整合单细胞分析揭示人类动脉粥样硬化血管外膜血管内皮细胞的多样性 | 首次构建人类动脉粥样硬化单细胞转录组图谱，识别出SULF1 ArtECs和VenECs作为内皮间质转化和白细胞招募的潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性 | 研究动脉粥样硬化斑块中微血管的内皮细胞异质性及其在疾病进展中的作用 | 动脉粥样硬化斑块中的血管内皮细胞 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自5项研究的17,367个血管内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2475 | 2026-06-19 |
Design of the biosensor-dependent coupling system stabilizes the high-synthesis phenotype of cell factory
2026-Apr-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71801-5
PMID:41974726
|
研究论文 | 本研究通过快速转录组挖掘方法开发了响应甘草次酸和美迪紫檀素的酵母生物传感器，并将其与必需基因耦合构建生长依赖的合成回路，以稳定高产表型，同时利用单细胞转录组揭示群体分工机制 | 提出一种快速转录组挖掘工作流，用于开发缺乏特异性生物传感器的天然产物；创建生长依赖的耦合回路，避免传统方法中高产表型随传代丢失的问题；通过单细胞转录组揭示耦合策略通过扩增特定高产亚群而非消除表型异质性来提升产量 | 仅以甘草次酸和美迪紫檀素作为概念验证，其他天然产物的适用性尚需验证；PDR5启动子的微调过程可能需针对不同传感器进行优化；单细胞分析揭示了基因表达特征，但删除或富集特定亚群的操作在工业规模上的可行性未讨论 | 设计一种基于生物传感器的生长耦合系统，以稳定微生物细胞工厂中天然产物的高产表型，并利用单细胞分析优化群体生产性能 | 酿酒酵母细胞工厂中产甘草次酸和美迪紫檀素的菌株群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 初始菌株和进化菌株的酵母细胞群体（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2476 | 2026-06-19 |
Prostaglandin E2-driven dedifferentiation of Schwann cells leads to perineural invasion in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr-07, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02648-x
PMID:41946682
|
研究论文 | 该研究通过整合RNA测序、空间转录组学和临床样本单细胞分析，发现神经侵犯区域显著富集去分化雪旺细胞并上调关键标志物，证明胰腺癌细胞通过PGE₂驱动雪旺细胞去分化并分泌促侵袭因子（LIF和ADAMTS-1），形成有利于神经侵犯的微环境 | 首次揭示肿瘤来源的PGE₂通过PTGES-SC轴驱动雪旺细胞去分化，并识别LIF和ADAMTS-1作为关键促侵袭因子，为胰腺癌神经侵犯提供了全新治疗靶点 | NA | 阐明胰腺导管腺癌中雪旺细胞去分化促进神经侵犯的分子机制及潜在治疗靶点 | 胰腺癌临床标本及PANC-1和BxPC-3细胞系 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | RNA测序, 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 | 临床样本（具体数量未说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 2477 | 2026-06-19 |
A comprehensive benchmarking study on computational tools for cross-omics label transfer from single-cell RNA to ATAC data
2026-04-01, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkag026
PMID:41655240
|
研究论文 | 对27种从单细胞RNA数据向ATAC数据进行跨组学标签转移的计算工具进行了全面基准测试 | 首次系统地评估了27种跨组学标签转移工具，涵盖多种人类和小鼠组织数据，并揭示了数据平衡性、跨组学差异等影响模型性能的关键因素 | 研究主要依赖于公开数据集，可能未覆盖所有可能的生物学场景；方法性能受数据质量和预处理方式影响较大 | 系统评估和比较计算工具在单细胞RNA到ATAC数据标签转移中的表现，为未来方法开发提供建议 | 来自多种人类和小鼠组织的单细胞RNA和ATAC数据 | 机器学习 | NA | 单细胞ATAC测序（scATAC-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Bridge、GLUE、bindSC等深度学习模型 | 单细胞基因表达数据（scRNA-seq）和染色质可及性数据（scATAC-seq） | 使用多种人类和小鼠组织数据集，具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 2478 | 2026-06-19 |
Topological Data Analysis for Unsupervised Feature Selection in Large Scale Spatial Omics Data Sets
2026-Mar-04, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-026-01618-2
PMID:41779089
|
研究论文 | 应用持续同调（一种拓扑数据分析方法）进行大规模空间组学数据的无监督特征选择，并展示其在空间可变基因识别等下游任务中的应用 | 首次将拓扑数据分析中的持续同调方法应用于空间转录组学特征选择，提供连续的基因空间结构量化指标，并证明其在不同空间组学模态（如空间代谢组学）中的自然扩展性 | 未提及具体局限性 | 开发一种基于拓扑数据分析的无监督特征选择方法，用于大规模空间组学数据集中空间结构量化与空间可变基因识别 | 公共空间转录组学数据中的肾脏疾病和心肌梗死样本，以及空间代谢组学样本 | 计算机视觉, 机器学习 | 肾脏疾病, 心血管疾病 | 空间转录组学, 空间代谢组学 | 持续同调 | 空间转录组数据, 空间代谢组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 2479 | 2026-06-19 |
EMP1-driven ferroptosis in liver sinusoidal endothelial cells exacerbates hepatic ischemia-reperfusion injury via P38 MAPK
2026-02-16, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现EMP1通过P38 MAPK通路驱动肝窦内皮细胞铁死亡，加剧肝缺血再灌注损伤 | 首次揭示肝窦内皮细胞铁死亡在肝缺血再灌注损伤中的直接致病作用，并建立EMP1/p38信号轴为核心机制 | 信息未提供，暂按NA处理 | 阐明肝窦内皮细胞铁死亡在肝缺血再灌注损伤中的分子机制及EMP1的致病作用 | 人体肝脏移植组织、肝窦内皮细胞和BRL3A肝细胞 | 数字病理学 | 肝缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, siRNA沉默, 铁死亡调控, p38信号干预 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常对照与移植诱导的缺血再灌注损伤人体肝脏样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2480 | 2026-06-19 |
Single-cell characterization of the gastrointestinal HIV reservoir reveals heterogeneous cellular phenotypes
2026-02-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196536
PMID:41433124
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序表征胃肠道HIV储库，揭示其异质性细胞表型和区室特异性基因表达模式 | 首次在单细胞水平系统描述胃肠道组织HIV储库的细胞异质性，发现vRNA+细胞在Th17和Treg17表型中富集，并鉴定出116个与HIV感染相关的差异表达基因 | 样本量较小（10人），缺乏功能性验证实验，未明确区分潜伏感染与活跃复制的病毒 | 阐明胃肠道组织中HIV-1病毒储库的细胞特征及其与血液样本的差异 | 来自10名接受抗逆转录病毒治疗的HIV感染者的胃肠道组织和外周血单核细胞 | 机器学习 | 艾滋病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10名HIV感染者 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |