单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 24324 篇文献，本页显示第 2461 - 2480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2461 | 2024-11-07 |
Construction of a Prognostic Model for Mitochondria and Macrophage Polarization Correlation in Glioma Based on Single-Cell and Transcriptome Sequencing
2024-Nov, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70083
PMID:39491527
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析构建了一个基于线粒体和巨噬细胞极化相关基因的胶质瘤预后模型 | 揭示了与胶质瘤预后相关的五个基因（ECI2, MCCC2, OXCT1, SUCLG2, 和 CPT2），为个性化治疗和预后提供了新的见解 | NA | 探讨线粒体相关基因和巨噬细胞极化相关基因与胶质瘤预后的关系 | 胶质瘤患者的预后预测 | 生物信息学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序和转录组测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 包括TCGA-GBMLGG, mRNA-seq-325, mRNA-seq-693, GSE16011, GSE4290, 和 GSE138794等多个数据集 |
| 2462 | 2024-11-07 |
Epigenetic agents plus anti-PD-1 reprogram the tumor microenvironment and restore antitumor efficacy in Hodgkin lymphoma
2024-10-31, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024487
PMID:39093981
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研究论文 | 研究评估了三联疗法（组蛋白去乙酰化酶抑制剂、DNA甲基转移酶抑制剂和抗PD-1抗体）在复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤中的疗效和安全性 | 首次评估了三联疗法在先前接受过DP疗法的患者中的疗效，并揭示了该疗法通过调节肿瘤微环境克服免疫疗法抵抗的机制 | 研究样本量较小，且仅限于先前接受过DP疗法的患者 | 评估三联疗法在复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤中的疗效和安全性，并探讨其克服免疫疗法抵抗的机制 | 复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤患者 | 肿瘤学 | 霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 52名患者 |
| 2463 | 2024-11-07 |
GraphCVAE: Uncovering cell heterogeneity and therapeutic target discovery through residual and contrastive learning
2024-Oct-31, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123208
PMID:39488267
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为GraphCVAE的模型，通过结合空间和形态信息、纠正批次效应和管理异质数据，增强空间域识别能力 | GraphCVAE结合了多层图卷积网络和变分自编码器，通过对比学习捕捉细胞类型和状态的细微差异，显著提高了空间信息表示和整合的准确性 | NA | 提高空间转录组学中空间域识别的准确性，揭示细胞异质性和治疗靶点 | 空间转录组学数据，特别是前额叶皮质和胶质母细胞瘤等疾病数据 | 机器学习 | NA | 图卷积网络（GCN），变分自编码器（VAE），对比学习 | 图卷积网络（GCN），变分自编码器（VAE） | 空间转录组学数据 | 涉及多种空间转录组学数据集，包括前额叶皮质和胶质母细胞瘤等 |
| 2464 | 2024-11-07 |
Exogenous IL-33 promotes tumor immunity via macroscopic regulation of ILC2s
2024-10-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77751-6
PMID:39478174
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研究论文 | 研究探讨了外源性IL-33通过宏观调控ILC2s促进肿瘤免疫的作用 | 首次揭示了外源性IL-33通过减少中性粒细胞积累和增加ILC2s比例来改善肿瘤免疫微环境，并促进抗肿瘤免疫反应 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证其效果 | 探讨外源性IL-33对肿瘤免疫微环境的影响及其机制 | 外源性IL-33、ILC2s、中性粒细胞、肿瘤免疫微环境 | NA | 黑色素瘤 | scRNA-seq、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞比例数据 | Il7rArg1小鼠 |
| 2465 | 2024-11-07 |
The critical involvement of monocytes/macrophages in the pathogenesis of primary Sjögren's syndrome: New evidence from Mendelian randomization and single-cell sequencing
2024-Oct-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39130
PMID:39497977
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研究论文 | 本文探讨了单核细胞/巨噬细胞在原发性干燥综合征（pSS）发病机制中的关键作用 | 结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，全面揭示了单核细胞/巨噬细胞在pSS复杂发病机制中的贡献 | NA | 揭示单核细胞/巨噬细胞在原发性干燥综合征发病机制中的作用 | 单核细胞/巨噬细胞在原发性干燥综合征中的基因表达和信号通路变化 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序，孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据 | 1434个差异表达基因，其中60个与pSS发生密切相关 |
| 2466 | 2024-11-07 |
Novel mechanisms of intestinal flora regulation in high-altitude hypoxia
2024-Oct-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38220
PMID:39498080
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研究论文 | 研究探讨了在高海拔低氧环境下，厚壁菌门介导的巨噬细胞极化和糖酵解代谢重编程的分子机制 | 揭示了厚壁菌门通过抑制HIF-1α/糖酵解途径来缓解高海拔低氧引起的肠道黏膜屏障损伤 | NA | 探究高海拔低氧环境下肠道菌群调节的分子机制 | 厚壁菌门介导的巨噬细胞极化和糖酵解代谢重编程 | NA | NA | 单细胞转录组测序、蛋白质组分析、代谢组分析 | NA | 转录组数据、蛋白质数据、代谢物数据 | NA |
| 2467 | 2024-11-07 |
Deciphering STAT3's negative regulation of LHPP in ESCC progression through single-cell transcriptomics analysis
2024-Oct-28, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00962-0
PMID:39468431
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了STAT3对LHPP在食管鳞状细胞癌进展中的负调控作用 | 发现了STAT3对LHPP表达的显著调控作用，揭示了食管鳞状细胞癌发病机制的新方面 | NA | 阐明食管鳞状细胞癌中的细胞动力学和分子机制，特别是STAT3与LHPP的转录相互作用 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤和邻近正常组织细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 44,206个细胞样本，包括21名食管鳞状细胞癌患者的临床样本 |
| 2468 | 2024-11-07 |
Metabolic reprogramming landscape of pan-cancer by single-cell transcriptome data integration
2024-Oct-24, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.10.026
PMID:39500689
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2469 | 2024-11-07 |
CXCL9, CXCL10, and CCL19 synergistically recruit T lymphocytes to skin in lichen planus
2024-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179899
PMID:39190494
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和体外迁移实验，揭示了扁平苔藓中CXCL9、CXCL10和CCL19协同招募T淋巴细胞到皮肤的机制 | 首次发现扁平苔藓角质形成细胞和成纤维细胞特异性分泌CXCL9、CXCL10和CCL19，并证明这些细胞因子协同增强CD8+ T细胞的招募 | 研究样本量较小，仅涉及7名患者，可能影响结果的普适性 | 探讨扁平苔藓的分子发病机制并寻找新的治疗靶点 | 扁平苔藓患者的皮肤和血液样本 | 免疫学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 7名扁平苔藓患者及其健康对照者的皮肤和血液样本 |
| 2470 | 2024-11-07 |
Characterization of EpCAM-Positive and EpCAM-Negative Tumor Cells in Early-Stage Breast Cancer
2024-Oct-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252011109
PMID:39456890
|
研究论文 | 研究早期乳腺癌中EpCAM阳性及阴性肿瘤细胞的特征 | 强调了EpCAM阴性CTC的存在，并评估了不同亚群中的干细胞标志物和EMT标志物 | 需要进一步研究以阐明EpCAM阴性和阳性CTC的预后意义 | 探讨早期乳腺癌中EpCAM阳性及阴性肿瘤细胞的特征及其预后意义 | 早期乳腺癌中的EpCAM阳性及阴性肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | RNA | 涉及早期乳腺癌患者的CTC和原发肿瘤样本 |
| 2471 | 2024-11-07 |
Microglia Signatures: A Cause or Consequence of Microglia-Related Brain Disorders?
2024-Oct-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252010951
PMID:39456734
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研究论文 | 本文探讨了小胶质细胞特征与相关脑部疾病之间的关系 | 利用单细胞RNA测序技术，详细研究了小胶质细胞在不同功能状态下的独特基因表达模式 | NA | 探讨小胶质细胞特征与神经退行性疾病和其他脑部疾病之间的关联 | 小胶质细胞的基因表达特征及其在不同病理条件下的变化 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2472 | 2024-11-07 |
Deubiquitinase USP18 inhibits hepatic stellate cells activation and alleviates liver fibrosis via regulation of TAK1 activity
2024-Oct-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2024.114235
PMID:39236989
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研究论文 | 研究揭示了去泛素化酶USP18通过调节TAK1活性抑制肝星状细胞活化和减轻肝纤维化的机制 | 首次揭示了USP18在肝星状细胞活化中的作用及其通过调节TAK1活性减轻肝纤维化的机制 | NA | 揭示肝星状细胞活化的分子机制，寻找抑制肝纤维化的有效靶点 | 肝星状细胞（HSCs）和去泛素化酶USP18 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠原代肝星状细胞和CCl4诱导的肝纤维化小鼠模型 |
| 2473 | 2024-11-07 |
Profiling Long Noncoding RNA in Psoriatic Skin Using Single-Cell RNA Sequencing
2024-Sep-27, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.09.010
PMID:39342985
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了银屑病皮肤中长非编码RNA（lncRNA）的表达谱及其在表皮分化中的作用 | 首次在单细胞水平上详细分析了银屑病皮肤中lncRNA的表达谱及其细胞来源 | 研究样本仅限于6名银屑病患者，可能影响结果的普适性 | 探讨单细胞RNA测序技术在银屑病皮肤中lncRNA表达谱分析中的应用 | 银屑病患者的皮肤样本，包括未受累和受累的皮肤组织 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6名银屑病患者的皮肤样本 |
| 2474 | 2024-11-07 |
Hematopoietic cells emerging from hemogenic endothelium exhibit lineage-specific oxidative stress responses
2024-Sep-24, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107815
PMID:39326495
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研究论文 | 研究了人类胚胎发育过程中，缺氧条件对内皮细胞向造血细胞转变及其后续造血过程的影响 | 首次揭示了不同造血谱系细胞在缺氧条件下对氧化应激的特异性反应，并发现了影响血细胞发育的关键转录和代谢途径 | NA | 探讨缺氧条件对内皮细胞向造血细胞转变及其后续造血过程的影响 | 内皮细胞向造血细胞转变及其后续造血过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同造血谱系细胞 |
| 2475 | 2024-11-07 |
Multi-level multi-view network based on structural contrastive learning for scRNA-seq data clustering
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae562
PMID:39494609
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研究论文 | 提出了一种基于结构一致性对比学习的scRNA-seq数据聚类方法 | 引入了多层次多视角网络和对比学习，以提高scRNA-seq数据聚类的准确性 | NA | 解决scRNA-seq数据高维度和复杂性带来的聚类挑战 | scRNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 对比学习 | 多层次多视角网络 | scRNA-seq数据 | 八个真实scRNA-seq数据集 |
| 2476 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Shows that Circulating Monocytes Enriched in IFN Signaling Are Associated with Nontuberculous Mycobacteria Pulmonary Disease in Cystic Fibrosis
2024-Sep-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202312-2279LE
PMID:38889330
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2477 | 2024-11-07 |
Primate-specific BTN3A2 protects against SARS-CoV-2 infection by interacting with and reducing ACE2
2024-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105281
PMID:39142074
|
研究论文 | 研究探讨了灵长类特异性蛋白BTN3A2通过与ACE2相互作用，减少ACE2表达，从而保护宿主细胞免受SARS-CoV-2感染的机制 | 首次揭示了BTN3A2在抑制SARS-CoV-2感染中的关键作用，并提出了通过模拟BTN3A2的单克隆抗体来开发COVID-19治疗新途径的可能性 | NA | 揭示SARS-CoV-2与宿主细胞相互作用的分子机制，为COVID-19的预防和治疗提供新思路 | BTN3A2在COVID-19中的作用及其与ACE2的相互作用 | 生物医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、基因编辑、免疫沉淀、流式细胞术、生物层干涉测量、竞争性ELISA | NA | RNA | 基因编辑细胞系、转基因小鼠、COVID-19患者病理组织样本 |
| 2478 | 2024-11-07 |
Intra-patient spatial comparison of non-metastatic and metastatic lymph nodes reveals the reduction of CD169+ macrophages by metastatic breast cancers
2024-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105271
PMID:39173531
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研究论文 | 研究乳腺癌细胞对淋巴结中免疫细胞的影响，特别是CD169+巨噬细胞的减少 | 首次系统比较了非转移性和转移性淋巴结中CD169+巨噬细胞的数量，并发现转移性淋巴结中CD169+巨噬细胞显著减少 | 研究样本量较小，仅涉及6名患者 | 探讨乳腺癌细胞对淋巴结中免疫细胞的影响机制 | 非转移性和转移性淋巴结中的免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学、成像质谱流式细胞术、组织学分析 | NA | 组织切片 | 6名乳腺癌患者的淋巴结样本，以及58名患者的474个组织切片 |
| 2479 | 2024-11-07 |
Unleashed monocytic engagement in Sézary syndrome during the combination of anti-CCR4 antibody with type I interferon
2024-05-28, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010043
PMID:38489234
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研究论文 | 研究探讨了在Sézary综合征中，结合抗CCR4抗体和I型干扰素治疗如何激活单核细胞并消除恶性CD4+ T细胞 | 首次揭示了在Sézary综合征治疗中，结合I型干扰素和抗CCR4抗体可以激活单核细胞的吞噬作用，从而有效清除恶性CD4+ T细胞 | 研究主要集中在体外实验和临床试验，缺乏长期随访数据 | 探讨在Sézary综合征中，如何通过联合治疗策略有效清除恶性CD4+ T细胞 | Sézary综合征中的恶性CD4+ T细胞和单核细胞 | NA | 皮肤癌 | 单细胞转录组分析，高吞吐量T细胞受体测序 | NA | 转录组数据，T细胞受体序列 | 涉及Sézary综合征患者的样本 |
| 2480 | 2024-11-07 |
Deciphering the regulatory landscape of murine splenic response to anemic stress at single-cell resolution
2024-04-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023011965
PMID:38315834
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研究论文 | 研究了小鼠脾脏在贫血压力下的单细胞分辨率调控景观 | 发现了早期红系前体细胞在贫血压力下的显著出现，并识别出一种新的标记物CD81用于标记红细胞岛中的中心巨噬细胞 | NA | 探索贫血压力下红系前体细胞的分子机制 | 小鼠脾脏组织中的红系前体细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从接受苯肼和连续放血的小鼠中分离的脾脏组织样本 |