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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2421 | 2026-04-14 |
Identification of papillary thyroid carcinoma-associated epithelial cell subpopulations and diagnostic biomarkers: integrating machine learning with single-cell analysis
2026-Mar-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-aw-2244
PMID:41969483
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序与机器学习算法,识别了甲状腺乳头状癌相关的上皮细胞亚群及诊断生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序与高维加权基因共表达网络分析及多种机器学习算法,鉴定出XPR1、SH3RF1和TLE1作为PTC诊断的关键基因 | 研究主要基于计算分析和细胞系验证,缺乏大规模临床样本的体外或体内实验验证 | 揭示甲状腺乳头状癌的分子机制并识别早期诊断和个体化治疗的潜在生物标志物 | 甲状腺乳头状癌组织中的细胞组成变化,特别是肿瘤相关上皮细胞 | 机器学习 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR | Random Forest, XGBoost, SVM-RFE | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2422 | 2026-04-14 |
ZNF460 inhibits HMGCL and promotes PI3K pathway in colon cancer
2026-Mar-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-aw-2410
PMID:41969486
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研究论文 | 本研究探讨了ZNF460在结肠癌中的表达模式、预后价值及生物学功能,揭示了其通过抑制HMGCL表达激活PI3K通路促进癌症进展的机制 | 首次阐明ZNF460在结肠癌中通过抑制HMGCL激活PI3K通路的具体分子机制,并利用单细胞测序技术揭示了ZNF460与多种细胞类型的相互作用 | 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证,且临床样本的验证可能有限 | 研究ZNF460在结肠癌中的表达、预后价值、生物学功能及其分子机制 | 结肠癌细胞、TCGA和GEO数据库中的转录组和临床数据 | 癌症生物学 | 结肠癌 | 单细胞测序、转录组分析、Western blot、CCK-8检测、EdU检测 | NA | 转录组数据、临床数据、细胞实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2423 | 2026-04-14 |
LDLR+ Monocytic Myeloid-derived Suppressor Cells Attenuate Allograft Rejection in Liver Transplantation
2026-Mar-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2025.00621
PMID:41970191
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了LDLR+单核髓源性抑制细胞在肝移植排斥反应中的关键免疫调节作用 | 首次系统表征了MDSC亚群的多样性及其在移植耐受中的背景依赖性功能,并鉴定出具有增强免疫抑制特性的LDLR+ M-MDSC亚群 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本的关联分析,需要进一步的人体临床试验验证 | 探究髓源性抑制细胞在肝移植排斥反应中的免疫调节机制 | 人类和小鼠的肝移植样本 | 数字病理学 | 肝移植排斥反应 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术, 多重免疫组化, 共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 流式细胞数据, 组织图像数据 | 人类和小鼠肝移植样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2424 | 2026-04-14 |
Nascent Glial Precursors in Human Bone Marrow Allow Rapid Induction of Functional Oligodendrocyte Precursors for Therapy
2026-Mar-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15070598
PMID:41972688
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研究论文 | 本研究开发了一种从小分子诱导方案,从人骨髓基质细胞中快速生成功能性少突胶质前体细胞,用于治疗髓鞘缺陷疾病 | 首次通过单细胞RNA测序识别出人骨髓基质细胞中的CD90EGFRPDGFRA前少突胶质前体样亚群,并设计出无病毒、无支持细胞的两步诱导方案,在八天内高效生成功能性少突胶质前体细胞 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证其安全性和有效性 | 开发一种快速、安全、伦理可接受的方案,从人骨髓基质细胞中诱导功能性少突胶质前体细胞,用于细胞移植治疗髓鞘缺陷疾病 | 人骨髓基质细胞(hBMSCs)及其中的CD90EGFRPDGFRA前少突胶质前体样亚群 | 细胞生物学与再生医学 | 中枢神经系统髓鞘缺陷疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2425 | 2026-04-14 |
Molecularly defined subpopulations of leptin receptor neurons dissociate the control of food intake from blood pressure
2026-Mar-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.26.714551
PMID:41929005
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研究论文 | 本研究通过分子定义瘦素受体神经元亚群,揭示了其如何分离控制食物摄入与血压的机制 | 首次识别出瘦素受体神经元在弓状核和背内侧下丘脑核中的两个独特亚群,分别独立调控食物摄入和血压,为靶向治疗提供了新方向 | 研究主要基于小鼠模型,人类中的相关性尚需进一步验证,且单细胞和空间转录组学数据的深度分析可能受技术限制 | 探究瘦素受体神经元在调控食物摄入和血压中的特异性作用 | 小鼠的瘦素受体神经元亚群,特别是弓状核和背内侧下丘脑核中的细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2426 | 2026-04-14 |
Transcriptional regulation of the main olfactory epithelium by environmental olfactory exposures
2026-Mar-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.24.713727
PMID:41929152
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探究了环境嗅觉暴露对小鼠主嗅上皮(MOE)中不同细胞类型特异性转录反应的影响 | 首次在稳态条件下揭示了环境嗅觉暴露对主嗅上皮细胞类型特异性转录的影响,并强调了多细胞相互作用在嗅觉上皮调控中的潜在重要性 | 研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类样本;环境暴露条件相对有限,可能无法涵盖所有真实环境中的复杂因素 | 探究环境嗅觉暴露如何影响主嗅上皮中不同细胞类型的转录调控 | 小鼠的主嗅上皮组织 | 单细胞转录组学 | 嗅觉功能障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠MOE组织在环境暴露后的scRNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2427 | 2026-04-14 |
Chronic Alcohol Consumption Reprograms Osteoclast Lineage Communications to Promote Osteoclastogenesis
2026-Mar-26, Biology
DOI:10.3390/biology15070527
PMID:41972530
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了慢性酒精摄入如何通过重编程破骨细胞谱系的细胞间通讯来促进破骨细胞生成 | 首次在灵长类动物模型中,结合单细胞转录组学、轨迹推断和细胞通讯网络分析,系统阐明了酒精诱导的破骨细胞生成加速的细胞机制 | 研究基于体外分化的破骨细胞,可能无法完全反映体内复杂的微环境;样本量相对有限 | 探究慢性酒精摄入促进破骨细胞生成的细胞机制 | 从长期摄入乙醇或等热量对照溶液的猕猴骨髓单核细胞体外分化的破骨细胞 | 单细胞组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | 广义加性模型(tradeSeq),CellChat | 单细胞转录组数据 | 猕猴骨髓单核细胞(12个月乙醇或对照干预后) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2428 | 2026-04-14 |
The Elusive Origin of Glioblastoma: Where Do We Stand?
2026-Mar-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15070590
PMID:41972682
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综述 | 本文全面综述了胶质母细胞瘤(GBM)的细胞起源,并评估了用于研究其起源和进化动态的先进技术方法 | 整合了当前关于GBM细胞起源(如神经干细胞和少突胶质前体细胞)的证据,并重点评估了单细胞测序、空间转录组学、多组学、人工智能等高分辨率技术在解析GBM起源问题上的应用潜力 | 作为一篇综述,它主要综合现有知识,本身不产生新的原始实验数据,且GBM的确切起源细胞仍未最终确定 | 旨在深化对胶质母细胞瘤(GBM)细胞起源的理解,并评估相关先进研究方法,以期为开发有效疗法提供基础 | 胶质母细胞瘤(GBM)及其潜在的细胞起源,如神经干细胞(NSCs)和少突胶质前体细胞(OPCs) | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学,多组学,下一代神经胶质瘤模型,生物信息学,人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,多组学 | NA | NA |
| 2429 | 2026-04-14 |
Spatial multi-omics of multiple myeloma uncovers niche-dependent pro-myeloma and immunosuppressive signaling in the bone marrow and extramedullary lesions
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.23.713195
PMID:41928953
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研究论文 | 本研究通过整合空间多组学技术,揭示了多发性骨髓瘤在骨髓和髓外病变中依赖微环境的促骨髓瘤和免疫抑制信号 | 开发了一个多模态框架,整合了10x Genomics Visium HD、Xenium和单细胞RNA测序数据,首次在空间上解析了多发性骨髓瘤微环境中细胞类型特异性信号通路 | 研究主要基于转录组数据,蛋白质水平和功能验证可能不足,且样本量相对有限 | 旨在空间解析多发性骨髓瘤微环境中细胞间相互作用及其对疾病进展的影响 | 多发性骨髓瘤患者骨髓和髓外病变组织 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 10x Visium HD, 10x Xenium | 10x Visium HD提供16微米分辨率的全转录组空间发现,10x Xenium提供单细胞分辨率的正交验证 |
| 2430 | 2026-04-14 |
Spatially-resolved single cell atlas of liposarcoma reveals lineage hierarchies, immune niches, and regulatory circuits
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.23.713651
PMID:41929055
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学测序、表观基因组分析和空间转录组学,揭示了脂肪肉瘤亚型间的细胞异质性、谱系层级、免疫微环境和调控网络 | 首次在单细胞和空间分辨率上系统比较了WDLPS和DDLPS的细胞与表观遗传异质性,识别了新的调控回路和中间亚型(硬化型WDLPS),并揭示了亚型特异的免疫微环境特征 | 未明确说明样本数量是否足够代表临床异质性,且功能验证实验可能有限 | 阐明脂肪肉瘤亚型的细胞异质性、谱系分化、免疫微环境及调控机制 | 高分化脂肪肉瘤(WDLPS)和去分化脂肪肉瘤(DDLPS)的肿瘤组织 | 数字病理学 | 脂肪肉瘤 | 单细胞多组学测序、表观基因组分析、空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据、表观基因组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2431 | 2026-04-14 |
Functional xenogeneic hematopoietic cells maintaining donor-dominant identity and immune tolerance enable therapy
2026-Mar-24, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00767-3
PMID:41877296
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研究论文 | 本研究通过异种嵌合体生成功能性异种造血细胞,并验证其在多种血液疾病模型中的治疗潜力 | 首次全面功能验证了在种间生物反应器中生成的异种造血细胞,证明其具有供体样分子身份、能逃避免疫排斥,并可作为有效“种子细胞”治疗多种血液疾病 | 研究主要在啮齿动物模型中进行,尚未在大型动物或人体中验证 | 探索异种造血细胞的生物学特性及治疗潜力,以克服临床造血细胞供应短缺 | 通过胚泡互补和骨髓移植在啮齿动物模型中生成的异种造血细胞(包括红细胞、血小板和白细胞) | NA | 血液疾病(包括出血性贫血、地中海贫血、血小板减少症和白血病) | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | RNA测序数据,蛋白质组数据 | 啮齿动物模型中的异种造血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2432 | 2026-04-14 |
PRAMEL12 orchestrates spermiogenesis to ensure male fertility in mice
2026-Mar-20, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.111392
PMID:41866036
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研究论文 | 本研究揭示了PRAMEL12在小鼠精子发生中的关键作用,其缺失导致组蛋白向鱼精蛋白转换缺陷,进而引发精子形态和功能异常,最终导致雄性不育 | 首次明确了PRAMEL12在精子发生中的具体功能,揭示了其通过调控组蛋白修饰和鱼精蛋白掺入来确保精子染色质正常凝聚的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类或其他物种中验证PRAMEL12的功能 | 探究PRAMEL12在精子发生过程中的具体功能及其对雄性生育能力的影响 | 小鼠模型,特别是Pramel12基因敲除的雄性小鼠及其精子细胞 | 生殖生物学 | 雄性不育 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析,组织化学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质组数据,组织化学图像数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及野生型和Pramel12敲除型小鼠的比较研究 | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 2433 | 2026-04-14 |
Insights into tick-pathogen interactions - a single cell RNA sequencing approach of transcriptional changes during ehrlichial infection
2026-Mar-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.19.712879
PMID:41889848
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了黑腿蜱胚胎细胞系(ISE6)在埃里希体感染过程中的转录变化,揭示了细胞异质性和时间依赖性转录调控 | 首次应用单细胞RNA测序技术解析蜱细胞系在病原感染中的转录动态,发现ISE6细胞虽异质但不同于已知蜱组织,且不影响感染易感性 | 研究仅基于ISE6细胞系,未涉及完整蜱体或体内环境,可能无法完全反映自然感染情况 | 探究蜱-病原体相互作用机制,特别是埃里希体感染过程中的细胞转录响应 | 黑腿蜱胚胎细胞系(ISE6)及埃里希体(EME)病原体 | 数字病理学 | 蜱传疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确样本数量,基于ISE6细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2434 | 2026-04-14 |
Interleukin-8-induced tumor self-rampart spatially confines oncolytic virotherapy in glioblastoma
2026-Mar-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf276
PMID:41339296
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤通过IL-8驱动的肿瘤自护墙形成空间性自我防御机制,限制溶瘤病毒扩散,并提出了IL-8阻断作为克服耐药性的策略 | 首次发现IL-8诱导的肿瘤自护墙(TSR)作为空间屏障限制溶瘤病毒传播,并验证IL-8阻断可破坏TSR、增强疗效 | 研究基于PDX模型和患者肿瘤验证,但临床转化效果需进一步临床试验确认 | 探究胶质母细胞瘤中溶瘤病毒复制动力学及肿瘤细胞耐药机制,以开发精准联合策略提高疗效 | 胶质母细胞瘤(GBM)患者来源的异种移植(PDX)模型及患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学、CRISPR激活筛选、组织学分析 | NA | 空间转录组数据、组织图像数据 | PDX模型及患者肿瘤样本(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2435 | 2026-04-14 |
Cholesterol-metabolic tumor-associated macrophages regulate tumor budding-like cell subpopulation to promote chordoma stemness via BACH1/ANGPTL4/SDC4 axis
2026-Mar-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf286
PMID:41390963
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研究论文 | 本研究揭示了脊索瘤中胆固醇代谢性肿瘤相关巨噬细胞通过BACH1/ANGPTL4/SDC4轴调控肿瘤出芽样细胞亚群,促进肿瘤干细胞特性及恶性进展的机制 | 首次在脊索瘤中发现肿瘤出芽样结构,并阐明其与胆固醇代谢性肿瘤相关巨噬细胞的相互作用机制,揭示了BACH1-ANGPTL4-SDC4信号轴在促进肿瘤干细胞特性和胆固醇积累中的作用 | 研究主要基于回顾性队列和临床前模型,需进一步验证在更广泛患者群体中的普适性及临床转化潜力 | 探究脊索瘤中肿瘤出芽样结构的分子机制及其对肿瘤进展的功能影响 | 481例脊索瘤患者的肿瘤标本及临床前模型(类器官、体外/体内功能实验) | 数字病理学 | 脊索瘤 | 多组学分析(包括GeoMx数字空间分析、空间转录组学、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、多重定量免疫荧光) | NA | 图像、转录组数据、表观遗传数据 | 481例脊索瘤患者(来自4个大型队列) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2436 | 2026-04-14 |
Improving atlas-scale single-cell annotation models with hierarchical cross-entropy loss
2026-03, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00945-z
PMID:41617882
|
研究论文 | 本文提出了一种分层交叉熵损失函数,用于改进单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释模型 | 引入分层交叉熵损失函数,将生物层次结构明确整合到模型训练目标中,提升了模型的泛化性能 | 未提及具体的数据集或实验细节限制 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和泛化能力 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释模型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性模型、Transformer | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2437 | 2026-04-14 |
Partially shared multi-modal embedding learns holistic representation of cell state
2026-03, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00948-w
PMID:41741805
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研究论文 | 本文提出了一种名为APOLLO的计算框架,用于自动学习多模态数据之间的部分信息共享,以更全面地表示细胞状态 | APOLLO通过使用具有部分重叠潜在空间的自动编码器,实现了多模态数据的有效集成,并能够区分共享和模态特定信息,提高了可解释性 | NA | 开发一个计算框架,以整合单细胞水平的多模态数据,并揭示各数据模态的贡献 | 单细胞数据,包括SHARE-seq(scRNA-seq和scATAC-seq)、CITE-seq(scRNA-seq和蛋白质丰度)以及两个多重成像数据集 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, 蛋白质丰度测量, 多重成像 | Autoencoder | 多模态数据(基因表达、染色质可及性、蛋白质丰度、成像数据) | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 2438 | 2026-04-14 |
SpaJoint: a transfer learning method for spatial transcriptomics deconvolution
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag158
PMID:41955028
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研究论文 | 本文提出了一种基于迁移学习的空间转录组学解卷积方法SpaJoint,用于预测空间点的细胞类型组成和识别细胞类型的空间区域 | SpaJoint通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据,并考虑不同点之间的空间相关性,实现了优异的性能表现 | NA | 解决空间转录组技术中单细胞分辨率不足的问题,解析组织中不同细胞类型的空间分布 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 迁移学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2439 | 2026-04-14 |
Utilizing bulk and single-cell RNA sequencing to identify potential biomarkers linked to angiogenesis and integrated stress response in chondrosarcoma
2026-Feb-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-40800-3
PMID:41723200
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,识别了软骨肉瘤中与血管生成和整合应激反应相关的潜在生物标志物HSPA8、LMNA和SERPINH1 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序数据,系统识别软骨肉瘤中与血管生成和整合应激反应相关的生物标志物,并通过多组学分析验证其调控网络 | 研究主要基于公共数据库数据,样本来源有限,且实验验证仅通过RT-qPCR,缺乏体内功能验证 | 识别软骨肉瘤中与血管生成和整合应激反应相关的潜在生物标志物,并阐明其分子机制 | 软骨肉瘤患者样本及相关基因表达数据 | 生物信息学 | 软骨肉瘤 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR | WGCNA, 分子对接分析 | 基因表达数据 | 基于GEO数据库的多个数据集(如GSE184118、GSE30835、GSE22855),具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2440 | 2026-04-14 |
Single-cell insights into cisplatin resistance mechanisms in bladder cancer tumor microenvironment
2026-Feb-20, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.111304
PMID:41724379
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序与体外实验验证,揭示了膀胱癌中顺铂耐药性的分子机制及肿瘤微环境内的细胞异质性 | 通过整合顺铂敏感与耐药膀胱癌样本的单细胞RNA测序数据,识别了关键耐药细胞亚群、耐药相关信号通路,并揭示了耐药细胞与免疫细胞或成纤维细胞间增强的相互作用,特别是MIF信号轴的激活 | NA | 阐明膀胱癌中顺铂耐药性的分子机制并表征肿瘤微环境内的细胞异质性 | 膀胱癌样本(顺铂敏感与耐药) | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |