单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
24361 2024-08-09
Somatic mutations in lymphocytes in patients with immune-mediated aplastic anemia
2021-05, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 研究了免疫介导性再生障碍性贫血(AA)患者淋巴细胞中的体细胞突变情况 首次详细描述了非白血病T细胞中的体细胞突变及其在AA发病机制中的作用 样本量相对较小,需要进一步的大规模研究来验证结果 探讨体细胞突变在免疫介导性再生障碍性贫血发病机制中的作用 AA患者的CD4+和CD8+ T细胞 NA 再生障碍性贫血 定制的2533基因面板测序、T细胞受体beta测序、单细胞测序 NA 基因序列 24名AA患者和20名健康对照
24362 2024-08-09
Single-cell transcriptomics trajectory and molecular convergence of clinically relevant mutations in Brugada syndrome
2021-05-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,探讨了Brugada综合征中临床相关突变的分子汇聚及其与心脏发育细胞类型的关联 首次通过单细胞转录组学分析,揭示了Brugada综合征中临床相关突变在离子运输域的富集,并识别了与该综合征病因相关的心脏发育细胞类型 NA 评估Brugada综合征中临床相关突变的分子汇聚,并识别与该综合征病因相关的心脏发育细胞类型 Brugada综合征中的临床相关突变及其在心脏发育中的影响 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 733个突变,涉及16个与Brugada综合征相关的钠、钙、钾通道及调控和结构基因
24363 2024-08-09
Independence of chromatin conformation and gene regulation during Drosophila dorsoventral patterning
2021-04, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 本文研究了果蝇胚胎背腹模式形成过程中染色质结构与基因调控的独立性 提供了染色质组织与背腹基因表达独立性的证据,并发现组织特异性染色质状态和基因表达下,染色质组织在组织间基本保持不变 未明确说明基因表达和染色质状态是否驱动染色质组织,或染色质组织变化是否促进细胞类型特异性基因表达激活 探究染色质组织与基因调控之间的关系 果蝇胚胎的背腹模式形成 基因调控 NA 单细胞RNA测序 NA RNA序列 未明确说明具体样本数量
24364 2024-08-09
New dog, old tricks: Developmental programs resurface in inflammation
2021-04-01, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本文利用单细胞转录组学技术研究人类皮肤中的细胞状态和基因程序,揭示了皮肤病中可能促进炎症病理的胎儿程序 首次在人类皮肤中发现并定义了与皮肤病相关的胎儿基因程序 NA 研究人类皮肤中的细胞状态和基因程序,特别是在皮肤病中的表现 人类皮肤细胞及其在皮肤病中的基因表达 数字病理学 皮肤病 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 具体样本数量未在摘要中提及
24365 2024-08-09
Macrophages in SHH subgroup medulloblastoma display dynamic heterogeneity that varies with treatment modality
2021-03-30, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 研究探讨了SHH亚组髓母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的动态异质性及其在不同治疗方式下的变化 通过单细胞RNA测序分析,揭示了TAM在不同治疗方式下的显著异质性,并识别了不同TAM亚群的标志物 NA 研究SHH亚组髓母细胞瘤中TAM的异质性及其对治疗方式的响应 SHH亚组髓母细胞瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 儿童脑癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 自发性小鼠SHH亚组髓母细胞瘤样本
24366 2024-08-09
Dynamic Expression of Imprinted Genes in the Developing and Postnatal Pituitary Gland
2021-03-30, Genes IF:2.8Q2
研究论文 研究了印记基因在发育和产后垂体中的动态表达 首次尝试将印记基因的表达与垂体的形成和功能联系起来,并利用高灵敏度RNA测序和单细胞RNA测序数据描述了垂体的印记转录组 由于垂体在发育期间的小尺寸和成熟细胞的复杂性,获取有用的转录组数据存在技术困难 探讨印记基因在垂体发育和功能中的作用及其与印记疾病的关联 印记基因在垂体中的表达及其对垂体发育和功能的影响 NA 印记疾病 RNA测序 NA 转录组数据 NA
24367 2024-08-09
Single-Cell Sequencing Confirms Transcripts and VHDJH Rearrangements of Immunoglobulin Genes in Human Podocytes
2021-03-25, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和嵌套PCR结合Sanger测序,证实了人类足细胞中免疫球蛋白基因的转录本和VHDJH重排 首次在单细胞水平上证实了足细胞中免疫球蛋白基因的转录本和重排,并揭示了在病理情况下足细胞表达的免疫球蛋白多样性增加 NA 确认足细胞中免疫球蛋白基因的转录本并表征其重排谱 人类足细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序,嵌套PCR,Sanger测序 NA RNA序列 360个足细胞用于单细胞RNA测序,48个单足细胞用于嵌套PCR和Sanger测序
24368 2024-08-09
Novel Gene Regulation in Normal and Abnormal Spermatogenesis
2021-03-17, Cells IF:5.1Q2
综述 本文综述了新型基因在正常与异常精子发生中的调控作用及其机制 利用单细胞RNA测序等新技术,识别了更多与精子发生相关的调控基因 NA 探讨新型基因在正常与异常精子发生中的调控作用及其机制 啮齿动物和人类精原干细胞的增殖、分化和凋亡,以及精母细胞和其他生殖细胞的减数分裂 NA 男性不育 单细胞RNA测序 NA NA NA
24369 2024-08-09
Single-Cell Expression Landscape of SARS-CoV-2 Receptor ACE2 and Host Proteases in Normal and Malignant Lung Tissues from Pulmonary Adenocarcinoma Patients
2021-Mar-12, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨了肺腺癌患者正常和恶性肺组织中SARS-CoV-2受体ACE2及相关基因的单细胞表达谱 首次揭示了肺腺癌患者肺组织中SARS-CoV-2受体ACE2及相关基因的单细胞表达谱 NA 阐明肺腺癌患者肺组织中SARS-CoV-2受体ACE2及相关基因的单细胞表达谱 肺腺癌患者的正常和恶性肺组织 数字病理学 肺腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 5个肺腺癌组织和14个匹配的正常组织,共186,916个细胞
24370 2024-08-09
Advancing Drug Discovery for Neurological Disorders Using iPSC-Derived Neural Organoids
2021-Mar-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本文探讨了利用诱导多能干细胞衍生的神经类器官在神经退行性疾病药物发现中的应用 文章介绍了使用CRISPR创建同基因模型、单细胞RNA测序和机器学习分析复杂数据集等技术解决方案,以扩大类器官在药物发现中的应用 类器官技术在工业界大规模药物筛选中的应用受到可重复性、可扩展性和向人类疾病转化的挑战 推动类器官技术在神经退行性疾病大规模药物筛选中的应用 诱导多能干细胞衍生的神经类器官及其在神经退行性疾病模型中的应用 生物技术 神经退行性疾病 CRISPR, 单细胞RNA测序 机器学习 图像, 文本 NA
24371 2024-08-09
Spinal Inhibitory Interneurons: Gatekeepers of Sensorimotor Pathways
2021-Mar-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了脊髓抑制性中间神经元在感觉运动通路中的作用及其在脊髓微环路中的组织和功能 通过转基因操作、神经化学分析和单细胞转录组学等方法,识别出表达一系列遗传和/或神经化学标记的抑制性中间神经元群体,构成功能性微环路 NA 探讨抑制性中间神经元在脊髓中的组织方式及其在感觉运动通路中的调控作用,为治疗与抑制功能缺陷相关的病理状况提供潜在的治疗靶点 脊髓抑制性中间神经元及其在感觉运动通路中的作用 神经科学 感觉和运动障碍 转基因操作、神经化学分析、单细胞转录组学 NA 基因和神经化学标记 NA
24372 2024-08-09
The transcriptional landscape of Venezuelan equine encephalitis virus (TC-83) infection
2021-03, PLoS neglected tropical diseases IF:3.4Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术,分析了委内瑞拉马脑炎病毒(TC-83株)感染人星形胶质细胞后的宿主转录组和病毒RNA 首次在单细胞水平上同时分析宿主转录组和病毒RNA,揭示了病毒感染过程中的细胞间异质性,并识别了抗病毒治疗的潜在靶点 NA 研究委内瑞拉马脑炎病毒与宿主细胞的相互作用,寻找抗病毒治疗的潜在靶点 委内瑞拉马脑炎病毒(TC-83株)感染的人星形胶质细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 数千个单细胞
24373 2024-08-09
The Role of Diagnostic Biomarkers, Omics Strategies, and Single-Cell Sequencing for Nonalcoholic Fatty Liver Disease in Severely Obese Patients
2021-Mar-01, Journal of clinical medicine IF:3.0Q1
研究论文 本文探讨了诊断生物标志物、组学策略和单细胞测序在严重肥胖患者非酒精性脂肪肝病中的作用 文章介绍了组学技术和单细胞测序在发现生物标志物和增加对非酒精性肝病及脂肪性肝炎病理生理学理解方面的最新进展 当前诊断工具如弹性成像在设备和测量质量方面存在局限,尤其是在腹部周长大和皮下脂肪多的患者中 旨在发现新的生物标志物,并加深对健康和受损肝脏中个体细胞类型生物学功能的理解 严重肥胖患者的非酒精性脂肪肝病 NA 非酒精性脂肪肝病 单细胞测序 NA 基因组学、转录组学和蛋白质组学数据 NA
24374 2024-08-09
A Novel Method to Identify the Differences Between Two Single Cell Groups at Single Gene, Gene Pair, and Gene Module Levels
2021, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本文介绍了一种新的方法来比较两个单细胞群在单基因、基因对和基因模块水平上的差异 提出了一种新的流程来比较两个单细胞群,包括差异基因表达调用和共表达网络模块等 NA 揭示细胞群和细胞类型之间生物学差异的机制,并识别细胞类型特异的分子机制 单细胞群在分子水平上的差异 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 622个来自小鼠脑部的细胞和1,600个来自人类胰腺的细胞
24375 2024-08-09
Study on the Reparative Effect of PEGylated Growth Hormone on Ovarian Parameters and Mitochondrial Function of Oocytes From Rats With Premature Ovarian Insufficiency
2021, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 研究聚乙二醇化生长激素对化疗诱导的早发性卵巢功能不全大鼠卵母细胞的修复作用及其对卵巢参数和线粒体功能的影响 本研究首次揭示了重组人聚乙二醇化生长激素在提高卵母细胞数量、减轻颗粒细胞凋亡和氧化应激反应方面的潜在作用,并通过单细胞转录组分析确定了与修复过程相关的关键基因 高剂量的重组人聚乙二醇化生长激素未能完全恢复受干扰的发情周期和性激素水平 探讨重组人聚乙二醇化生长激素对早发性卵巢功能不全大鼠卵泡发育和线粒体功能的潜在影响 早发性卵巢功能不全大鼠的卵母细胞、卵巢参数和线粒体功能 NA 早发性卵巢功能不全 单细胞测序 NA 转录组数据 NA
24376 2024-08-09
Transcriptional Profiling Reveals Kidney Neutrophil Heterogeneity in Both Healthy People and ccRCC Patients
2021, Journal of immunology research IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了健康人群和ccRCC患者肾脏中的中性粒细胞异质性 首次揭示了ccRCC患者肾脏中中性粒细胞的六个亚群,并探讨了其在肿瘤病理和自身免疫中的作用 NA 探讨中性粒细胞在肾脏疾病中的异质性和病理意义 健康人群和ccRCC患者的肾脏组织 数字病理学 肾细胞癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 健康捐赠者和ccRCC患者的肾脏活检组织
24377 2024-08-09
A Role for Vasoactive Intestinal Peptide Interneurons in Neurodevelopmental Disorders
2021, Developmental neuroscience IF:2.3Q3
综述 本文综述了表达血管活性肠肽(VIP-INs)的大脑皮质GABA能抑制性中间神经元在神经发育障碍(NDDs)中的作用 强调了VIP-INs在多个大脑皮质区域的重复电路模式,并探讨了它们如何影响感觉输入、发育和行为 NA 探讨VIP-INs在神经发育障碍中的作用机制 VIP-INs及其相关基因在神经发育障碍中的作用 NA 神经发育障碍 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
24378 2024-08-09
Bioconductor toolchain for reproducible bioinformatics pipelines using Rcwl and RcwlPipelines
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了Rcwl和RcwlPipelines工具链,用于在R环境中开发、使用和维护基于Common Workflow Language (CWL)的可重复生物信息学工作流程 开发了Rcwl,一个连接R与CWL的接口,并收集了超过100个预构建的工具和管道在RcwlPipelines中,便于研究人员查询和使用 NA 提供便携和可重复的数据分析工作流程 生物信息学工具和管道 生物信息学 NA Common Workflow Language (CWL) NA NA NA
24379 2024-08-09
ShinyCell: simple and sharable visualization of single-cell gene expression data
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了ShinyCell,一个用于将单细胞RNA测序数据转换为可探索和可共享的交互界面的R包 ShinyCell提供了一个简单易用的工具,使非计算生物学研究人员也能轻松探索和共享单细胞RNA测序数据 NA 开发一个工具,使单细胞RNA测序数据更易于非专业人士探索和共享 单细胞RNA测序数据的可视化和共享 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
24380 2024-08-09
Macrophage phenotypes in tissue repair and the foreign body response: Implications for biomaterial-based regenerative medicine strategies
2021-10-01, Acta biomaterialia IF:9.4Q1
综述 本文综述了巨噬细胞表型在组织修复和异物反应中的作用,以及对基于生物材料的再生医学策略的潜在影响 本文总结了近期关于髓系细胞在生物材料微环境中的异质性的新见解,并讨论了单细胞水平上解析细胞异质性的新工具 NA 探讨巨噬细胞异质性对组织修复和异物反应过程的影响,以及对生物材料导向的再生医学应用的潜在意义 巨噬细胞表型及其在组织修复和异物反应中的功能特性 再生医学 NA 单细胞RNA测序 NA NA NA
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