单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
24041	2024-08-09	A single-cell sequencing approach to the classification of large, vacuolated sulfur bacteria 2011-Jun, Systematic and applied microbiology IF:3.3Q2 DOI:10.1016/j.syapm.2011.02.001 PMID:21498017	研究论文	本文通过单细胞测序方法对大型、含硫空泡细菌进行分类研究	提出了保留Beggiatoaceae科的建议，并增加了九个Candidatus种和七个新的Candidatus属	NA	通过基因测序和形态学分析，重新评估大型硫细菌的分类	非丝状和已知丝状的大型硫细菌，包括Thiomargarita namibiensis等	微生物学	NA	16S rRNA基因和内部转录间隔区（ITS）测序	NA	序列数据	128个近全长16S rRNA-ITS序列
24042	2024-08-09	Tumour evolution inferred by single-cell sequencing 2011-Apr-07, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/nature09807 PMID:21399628	研究论文	本文通过单细胞测序技术研究了人类乳腺癌肿瘤的细胞群体结构和进化过程	利用流式细胞仪分离的细胞核、全基因组扩增和下一代测序技术，准确量化了个体细胞核内的基因组拷贝数	仅分析了两个乳腺癌病例，可能不足以代表所有乳腺癌的进化模式	探索肿瘤细胞的遗传异质性及其在肿瘤进化中的作用	人类乳腺癌肿瘤的细胞群体结构和进化	数字病理学	乳腺癌	单细胞测序	NA	基因组数据	分析了200个单细胞样本，分别来自两个乳腺癌病例
24043	2024-08-09	Capturing diversity of marine heterotrophic protists: one cell at a time 2011-Apr, The ISME journal DOI:10.1038/ismej.2010.155 PMID:20962875	研究论文	本文采用单细胞测序技术评估缅因湾小型（直径小于10微米）异养原生生物的组成	使用单细胞测序技术，相比传统环境PCR克隆方法，能更准确地评估原生生物群落组成，并能分析未培养原生生物群组的多个基因或整个基因组	现有的研究工具存在PCR和克隆偏差、低系统发育分辨率等显著限制	评估海洋中异养原生生物的多样性	小型异养原生生物	分子方法	NA	单细胞测序	NA	基因序列	单个细胞
24044	2024-08-09	Transcriptome study for early hematopoiesis--achievement, challenge and new opportunity 2010-Jun, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1 DOI:10.1002/jcp.22065 PMID:20143329	研究论文	本文研究造血干细胞前体细胞中的基因表达，以理解早期造血作用的遗传调控程序并识别干预造血障碍的基因靶点	采用了新开发的单细胞转录组方法和下一代DNA测序技术，为早期造血作用的转录组研究提供了新机遇	造血干细胞前体细胞的稀有性为研究设定了物理限制，传统基因组技术难以实现全面的转录组检测，且传统生物学方法难以从大量表达基因中识别控制干细胞自我更新和分化的关键基因	理解早期造血作用的遗传机制	造血干细胞前体细胞中的基因表达	基因组学	NA	单细胞转录组方法，下一代DNA测序技术	NA	转录组	NA
24045	2024-08-09	PGD on a recombinant allele: crossover between the TSC2 gene and 'linked' markers impairs accurate diagnosis 2008-Oct, Prenatal diagnosis IF:2.7Q2 DOI:10.1002/pd.2070 PMID:18792920	研究论文	本文探讨了在基于家族单体型开发准确的植入前遗传诊断（PGD）协议时考虑可能重组的重要性	本文首次在PGD分析中考虑了多代家族成员的单体型构建，以检测重组事件并实现精确诊断	文章未提及具体的局限性	开发一种基于家族单体型的准确植入前遗传诊断协议	研究对象为受结节性硬化症（TSC）影响的家族及其胚胎	NA	结节性硬化症	多重聚合酶链反应（PCR）、单细胞测序	NA	基因组DNA	涉及一个受TSC影响的家族及其胚胎
24046	2024-08-09	Genomic sequencing of single microbial cells from environmental samples 2008-Jun, Current opinion in microbiology IF:5.9Q1 DOI:10.1016/j.mib.2008.05.006 PMID:18550420	研究论文	本文探讨了将单细胞基因组测序技术应用于实验室环境样品中微生物细胞的研究策略	单细胞测序技术提供了一种无需培养即可进行基因组测序的替代方法，通过多重置换扩增（MDA）从单个细菌中扩增出所需的微克级DNA	MDA可能无法从大多数细菌中的单拷贝中恢复整个基因组，且在DNA扩增反应中可能发生一些序列重排	研究如何将单细胞基因组测序技术应用于实验室环境样品中的微生物细胞	环境样品中的单个微生物细胞	基因组学	NA	多重置换扩增（MDA）	NA	DNA	单个细菌细胞
24047	2024-08-09	TCR-based lineage tracing: no evidence for conversion of conventional into regulatory T cells in response to a natural self-antigen in pancreatic islets 2007-Sep-03, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20070822 PMID:17724131	研究论文	本文通过TCR基的谱系追踪技术，研究了在胰腺胰岛中自然自身抗原反应下，常规T细胞向调节性T细胞的转化情况	使用高吞吐量的单细胞测序技术，分析了T reg和T conv细胞在TCRalpha链上的CDR3alpha区域的差异，以此作为标记来检测T conv向T reg细胞的转化	研究仅限于特定的小鼠模型和特定的TCR，可能不适用于所有情况	验证在自然自身抗原反应下，常规T细胞是否能转化为调节性T细胞，从而在外周产生耐受性	BDC2.5 TCR转基因小鼠的T reg和T conv细胞	免疫学	糖尿病	单细胞测序	NA	序列数据	大量外周BDC(+)Valpha2(+)细胞
24048	2024-08-09	Single-cell sequencing and mini-sequencing for preimplantation genetic diagnosis 2003-Aug, Prenatal diagnosis IF:2.7Q2 DOI:10.1002/pd.658 PMID:12913874	研究论文	本文评估了单细胞水平上DNA测序和微测序技术在临床诊断中的可靠性和准确性，并报告了利用微测序技术进行囊性纤维化、镰状细胞贫血和β-地中海贫血诊断的单细胞协议。	微测序技术允许分析非常小的DNA片段，小扩增子具有较低的等位基因脱落率，这可能提高PGD的可靠性。	NA	评估单细胞测序和微测序技术在植入前遗传诊断中的应用。	囊性纤维化、镰状细胞贫血和β-地中海贫血的诊断。	NA	囊性纤维化、镰状细胞贫血、β-地中海贫血	单细胞测序、微测序	NA	DNA	单细胞
24049	2024-08-09	Single-cell transcriptional analysis of neuronal progenitors 2003-Apr-24, Neuron IF:14.7Q1 DOI:10.1016/s0896-6273(03)00229-0 PMID:12718852	研究论文	本文通过单细胞转录组分析技术，研究了神经前体细胞和成熟感觉神经元的表达谱，揭示了神经分化和多样化的分子机制	本文首次展示了单细胞转录组分析技术在神经前体细胞和成熟感觉神经元中的应用，能够精确识别数百种转录差异，并定义了多种信号通路	NA	揭示神经分化和多样化的分子机制	神经前体细胞和成熟感觉神经元	数字病理学	NA	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	从分离的组织或完整切片中收集的单个神经元和前体细胞