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当前共找到 33724 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-12-06 |
DOCK9 as a predictive biomarker linked to angiogenesis and immune response in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Apr-24, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01653-8
PMID:40272582
|
研究论文 | 本研究探讨了DOCK9基因在食管鳞状细胞癌（ESCC）中的预后价值，揭示了其与血管生成和免疫反应的关联 | 首次将DOCK9基因与ESCC的血管生成和免疫调节功能联系起来，并开发了一个包含DOCK9的21基因预后风险模型 | 研究主要基于RNA微阵列和单细胞RNA测序数据，需要进一步实验验证DOCK9的具体作用机制 | 识别ESCC的预后生物标志物，以改善患者预后和治疗策略 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）组织和人脐静脉内皮细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | RNA微阵列，单细胞RNA测序，蛋白表达分析 | 预后风险模型 | RNA序列数据，蛋白表达数据 | 未明确指定样本数量，涉及ESCC组织和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 222 | 2025-12-06 |
Integrative Multi-Omics and Functional Characterization Reveal MCM4 as a Key Oncogenic Regulator in Hepatocellular Carcinoma
2025, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S543405
PMID:41333157
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研究论文 | 本研究通过整合多组学和功能验证，揭示了MCM4作为肝细胞癌中关键致癌调控因子的作用 | 首次在肝细胞癌中系统整合多组学数据、单细胞及空间转录组学分析，全面验证MCM4的致癌功能及其作为预后生物标志物的潜力 | 研究主要基于公共数据集和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接功能验证 | 识别肝细胞癌的稳健预后生物标志物和治疗靶点 | 肝细胞癌（HCC） | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 整合生物信息学分析、单细胞转录组学、空间转录组学、siRNA敲低、质粒过表达 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用网络、单细胞数据、空间转录组数据 | 三个公共HCC数据集（GSE14520、GSE56545、GSE84402）及HCCDB数据库 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 223 | 2025-12-06 |
Scaling transformers to high-dimensional sparse data: a Reformer-BERT approach for large-scale classification
2025, Frontiers in artificial intelligence
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/frai.2025.1661318
PMID:41333338
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研究论文 | 本研究开发了一种名为scReformer-BERT的新方法，用于基于单细胞RNA测序数据的大规模细胞类型自动分类 | 结合Reformer编码器与BERT架构，提出了一种针对高维稀疏数据的Transformer扩展方法，用于大规模预训练模型在细胞类型分类中的应用 | 本研究仅关注主要细胞类别的一级分类任务，未涉及更细粒度的细胞亚型或复杂细胞相互作用 | 开发并评估一个鲁棒的大规模预训练模型，用于自动化细胞类型分类，以提高高通量基因组研究中细胞识别的效率和精度 | 人类细胞类型及其基于单细胞RNA测序数据的分类 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | BERT, Transformer, Reformer | 高维分子特征数据 | 大量单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 224 | 2025-12-06 |
SPHK1-mediated M2 macrophage polarization drives TGF-β1-dependent thrombus fibrosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1681485
PMID:41333463
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研究论文 | 本研究探讨了SPHK1通过调节M2巨噬细胞极化促进血栓纤维化的机制 | 首次揭示了SPHK1在M2巨噬细胞极化中的关键作用及其通过TGF-β1依赖性机制驱动血栓纤维化的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，临床样本量有限，且未涉及其他潜在信号通路 | 探究SPHK1是否通过调节M2巨噬细胞极化促进血栓纤维化 | 患者血栓组织、大鼠血栓模型、骨髓源性巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、组织学染色、免疫荧光、共培养实验 | NA | 图像、文本 | 患者血栓组织（急性血栓和CTEPH）、大鼠血栓模型、骨髓源性巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 225 | 2025-12-06 |
Comprehensive analysis of metabolism-related genes in sepsis reveals metabolic-immune heterogeneity and highlights GYG1 as a potential therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1682846
PMID:41333476
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，系统分析了脓毒症中代谢相关基因，揭示了代谢-免疫异质性，并识别出GYG1作为潜在治疗靶点 | 首次基于代谢相关基因对脓毒症患者进行分层，构建了代谢风险评分系统，并通过单细胞RNA-seq和体内实验验证了GYG1在调控先天免疫过度激活中的关键作用 | 研究主要依赖于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证；体内实验仅使用LPS诱导的小鼠模型，可能无法完全模拟人类脓毒症的复杂性 | 探究脓毒症中代谢相关基因对免疫功能障碍的驱动作用，并识别潜在治疗靶点 | 脓毒症患者的转录组数据、LPS诱导的脓毒症小鼠模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习, 细胞间通讯分析 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 未明确指定患者数量，但包括外部队列验证 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 226 | 2025-12-06 |
Role of Dendritic Cells in Mediating the Effect of Growth Differentiation Factor 15 on Nonalcoholic Fatty Liver Disease: Insights From Causal Inference and Single-Cell Profiling
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/1153091
PMID:41333917
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序，揭示了生长分化因子15通过树突状细胞介导非酒精性脂肪肝病风险的因果机制 | 首次结合大规模GWAS数据、孟德尔随机化因果推断和单细胞测序技术，系统阐明了GDF-15通过特定树突状细胞亚群介导NAFLD发病的因果通路 | 研究主要基于欧洲人群的GWAS汇总数据，可能限制结论在其他人群中的普适性；单细胞分析样本量相对有限 | 探究循环GDF-15水平与NAFLD之间的因果关系，并鉴定免疫细胞在其中的介导作用 | 人类循环GDF-15水平、NAFLD疾病状态、731种免疫细胞表型 | 生物信息学与计算生物学 | 非酒精性脂肪肝病 | 全基因组关联研究（GWAS）、孟德尔随机化（MR）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 孟德尔随机化模型、中介分析模型 | 基因组汇总数据、单细胞转录组数据 | 大规模GWAS汇总数据（来源包括FinnGen数据库等），具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 227 | 2025-12-06 |
BMDB: An integrated database and web platform for single-cell transcriptomic profiling of bone marrow microenvironment
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.11.028
PMID:41334179
|
研究论文 | 本研究介绍了一个名为BMDB的集成数据库和网络平台，用于整合和分析骨髓微环境的单细胞转录组数据 | 首次构建了一个整合健康和疾病状态下、跨物种（人和小鼠）及发育阶段的骨髓微环境单细胞转录组参考图谱数据库，并提供了交互式网络分析平台 | 未明确说明数据覆盖的疾病类型范围是否全面，以及平台对新上传数据的质量控制标准 | 构建一个统一的资源平台，以系统探索骨髓微环境的细胞和分子复杂性 | 骨髓微环境中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 435,682个单细胞，来自142个健康样本和82个病理样本（涵盖人和小鼠） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 228 | 2025-12-06 |
CPRCSdb: A comprehensive phenotype-associated single-cell transcriptomic database for human cancer
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.11.033
PMID:41334181
|
研究论文 | 本文介绍了CPRCSdb，一个将临床表型与单细胞转录组异质性整合的综合性数据库 | 开发了首个系统性地将单细胞数据与临床相关表型（如患者生存、肿瘤大小、淋巴结受累、转移和抗癌治疗反应）关联的综合性数据库 | 数据库依赖于手动整理的数据，可能受限于样本的可用性和质量控制的一致性 | 构建一个整合临床表型与单细胞转录组异质性的数据库，以研究肿瘤发生和癌症进展的机制 | 人类癌症的单细胞转录组数据和临床表型数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、批量RNA-seq数据 | 超过405万个细胞，来自1053个手动整理的单细胞样本和101个整合数据集，以及11,032个批量RNA-seq样本，涵盖29种癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 229 | 2025-12-06 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular dynamics and transcriptional changes in diabetic wound tissues following ESWT treatment
2025, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2025.1693937
PMID:41334557
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，构建了体外冲击波疗法（ESWT）治疗糖尿病伤口组织的细胞图谱，揭示了ESWT促进组织修复的细胞机制 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了ESWT治疗糖尿病伤口后引发的广泛转录重编程和细胞间通讯网络变化 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平的功能验证，且样本量相对有限 | 探究体外冲击波疗法促进糖尿病伤口愈合的细胞和分子机制 | 糖尿病伤口组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约39,475个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 230 | 2025-12-06 |
Linking Cellular Senescence to Vascular Pathology: The Diagnostic Potential of Superoxide Dismutase 2 in Aortic Dissection
2025, Vascular health and risk management
IF:2.6Q2
DOI:10.2147/VHRM.S553609
PMID:41334574
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和单细胞转录组分析，探讨了血管衰老在主动脉夹层（AD）发病机制中的分子和细胞机制，并确定了超氧化物歧化酶2（SOD2）作为潜在的诊断生物标志物和治疗靶点 | 整合生物信息学和单细胞RNA测序技术，首次将SOD2与主动脉夹层的免疫调节和氧化应激联系起来，并提出了基因-药物相互作用网络用于靶向治疗 | 研究主要基于公开数据集和单细胞测序数据，需要进一步实验验证SOD2的功能机制和临床适用性 | 研究血管衰老的分子和细胞机制及其在主动脉夹层发病中的作用 | 主动脉夹层组织、血清样本以及相关的基因表达数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 基于公开数据集GSE52093和GSE153434，涉及主动脉夹层组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 231 | 2025-12-06 |
CellNeighborEX: deciphering neighbor-dependent gene expression from spatial transcriptomics data
2023-11-09, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202311670
PMID:37815040
|
研究论文 | 提出一种名为CellNeighborEX的新方法，用于从空间转录组学数据中解析细胞邻居依赖的基因表达 | 开发了一种能有效捕获不同微环境影响的新方法，通过直接细胞定位或多细胞转录组混合来分类细胞，识别与伙伴细胞类型相关的多样化基因集 | NA | 研究细胞邻居依赖的基因表达，以理解细胞间相互作用 | 小鼠胚胎、大脑和肝癌组织中的细胞 | 空间转录组学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 232 | 2025-12-06 |
Imprinted genes and the manipulation of parenting in mammals
2023-11, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-023-00644-3
PMID:37714957
|
综述 | 本文探讨了基因组印记在哺乳动物亲代抚育行为中的角色及其进化意义 | 利用单细胞RNA测序数据，揭示了印记基因与亲代抚育质量之间的双向、迭代关系 | NA | 研究基因组印记如何影响哺乳动物的亲代抚育行为及其进化背景 | 哺乳动物中的印记基因及其在亲代抚育中的作用 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 233 | 2025-12-06 |
Spatiotemporal, optogenetic control of gene expression in organoids
2023-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01986-w
PMID:37735569
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研究论文 | 本研究结合光遗传学和基因扰动技术，在类器官中实现了目标基因表达的可编程时空控制 | 首次将光遗传学与基因扰动技术结合，用于控制类器官中基因表达的时空模式，并通过空间和单细胞转录组分析揭示了SHH信号在神经发育中的新调控机制 | 未明确说明技术适用范围、效率或潜在脱靶效应，且可能仅限于特定类器官模型 | 开发控制类器官中基因表达时空模式的方法，以研究人类发育和疾病建模 | 干细胞衍生的类器官，特别是人类神经发育类器官模型 | 生物医学工程 | NA | 光遗传学、基因扰动技术、空间转录组学、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 234 | 2025-12-05 |
The unfolded protein response in progeria arteries originates from non-endothelial cell types
2026-Feb, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503485
PMID:41326174
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研究论文 | 本研究探讨了早衰症动脉中未折叠蛋白反应的起源，发现其主要源于非内皮细胞类型 | 揭示了在表达早老素的动脉中，UPR激活具有细胞类型特异性，挑战了先前关于血管平滑肌细胞和成纤维细胞中UPR普遍激活的观点 | 研究基于小鼠模型，可能不完全反映人类HGPS的病理生理学，且未详细探讨非内皮细胞中UPR的具体机制 | 研究早衰症中未折叠蛋白反应是否导致内皮细胞功能障碍 | Hutchinson-Gilford早衰综合征小鼠模型，特别是内皮细胞特异性表达早老素的动脉组织 | 数字病理学 | 早衰症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 235 | 2025-12-05 |
Spatial transcriptomics mapping of immune cell and TGFβ signalling pathway heterogeneity in testicular germ cell tumours
2026-Jan, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70100
PMID:40693358
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，绘制了睾丸生殖细胞肿瘤中免疫细胞和TGFβ信号通路的异质性图谱 | 首次应用空间转录组学分析睾丸生殖细胞肿瘤的组织切片，揭示了肿瘤内部及周围区域的免疫细胞和TGFβ信号通路异质性 | 样本量较小（仅4例患者），且未涉及长期临床结果验证 | 探究睾丸生殖细胞肿瘤的异质性，特别是免疫细胞和TGFβ信号通路在肿瘤发生发展中的作用 | 睾丸生殖细胞肿瘤组织切片，包括非精原细胞瘤和精原细胞瘤样本 | 空间转录组学 | 睾丸生殖细胞肿瘤 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | 4例TGCT患者样本，超过90个感兴趣区域 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | NanoString GeoMx空间全转录组工作流程 |
| 236 | 2025-12-05 |
Altered Inflammatory Signature in a C9ORF72 -ALS iPSC-Derived Motor Neuron and Microglia Coculture Model
2026-Jan, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70084
PMID:40952044
|
研究论文 | 本研究利用携带C9ORF72基因突变的人类诱导多能干细胞（iPSC）来源的运动神经元与小胶质细胞共培养模型，揭示了ALS中炎症反应的改变机制 | 首次在iPSC来源的运动神经元与小胶质细胞共培养模型中，结合单细胞RNA测序技术，系统分析了C9ORF72突变对神经炎症的影响，并发现LPS响应性小胶质细胞亚群的消失 | 研究主要基于体外细胞模型，可能无法完全模拟体内复杂的神经微环境；样本类型和数量有限 | 探究肌萎缩侧索硬化症（ALS）中，C9ORF72基因突变如何通过小胶质细胞介导的神经炎症影响疾病病理 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）来源的运动神经元和小胶质细胞，包括携带C9ORF72六核苷酸重复扩增（HRE）的ALS患者iPSC系和C9ORF72敲除（KO）iPSC系 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），细胞共培养，炎症因子表达与分泌分析 | iPSC来源的细胞共培养模型 | 单细胞转录组数据，细胞表型数据 | 多个iPSC细胞系（包括C9ORF72 HRE和KO系），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 237 | 2025-12-05 |
Plasma proteomics identifies potential drug targets for diabetic polyneuropathy: Evidence from prospective cohorts and genetic analysis
2026-Jan, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.70239
PMID:41144938
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研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学分析，结合前瞻性队列和遗传数据，识别出与糖尿病多发性神经病相关的潜在药物靶点，特别是TNFRSF14，并探讨其临床和细胞机制 | 首次大规模整合临床、遗传和单细胞测序数据，系统性地筛选并验证TNFRSF14作为糖尿病多发性神经病的新型生物标志物和治疗靶点 | 研究依赖于观察性队列和遗传关联分析，因果推断需进一步实验验证；单细胞测序数据可能样本有限，需扩大验证 | 识别糖尿病多发性神经病的潜在药物靶点，以提升治疗效果 | 糖尿病多发性神经病患者及相关蛋白质和遗传因素 | 蛋白质组学 | 糖尿病多发性神经病 | 血浆蛋白质组学、单细胞测序 | NA | 蛋白质组数据、遗传数据、临床数据 | 大规模临床和遗传数据集（具体样本数未在摘要中说明） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 238 | 2025-12-05 |
Dissolvable microneedles loaded with denosumab alleviate knee osteoarthritis in rodent and canine models by inhibiting macrophage senescence
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.116970
PMID:41328338
|
研究论文 | 本研究开发了一种负载地诺单抗的可溶性微针阵列，用于局部递送药物以治疗骨关节炎，并在啮齿类和犬类模型中验证了其疗效 | 首次将可溶性微针平台用于地诺单抗的经皮关节内递送，以靶向衰老巨噬细胞，提供了一种微创、局部治疗骨关节炎的新策略，避免了关节内注射的侵入性和全身给药的不良反应 | 研究主要在啮齿类和犬类动物模型中进行，其疗效和安全性仍需在人体临床试验中进一步验证 | 开发一种微创的微针给药平台，用于局部递送地诺单抗以治疗骨关节炎，并评估其疗效和机制 | 骨关节炎（OA） | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫荧光，组织学评估，行为学评估，衰老巨噬细胞-软骨细胞共培养 | NA | 基因表达数据，图像数据，行为数据 | 啮齿类动物（具体物种和数量未明确说明）和比格犬 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 239 | 2025-12-05 |
Enhancer-mediated NR2F2 recruitment activates BGN to promote tumor growth and shape tumor microenvironment in papillary thyroid cancer
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.113712
PMID:41328346
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研究论文 | 本研究揭示了NR2F2-BGN轴在调控甲状腺乳头状癌（PTC）肿瘤生长和肿瘤微环境（特别是巨噬细胞极化）中的关键作用，并评估了靶向该轴的潜在治疗策略 | 首次系统阐明了BGN在PTC中通过内分泌和旁分泌方式促进肿瘤进展的双重作用机制，并发现了NR2F2作为BGN转录的关键上游调控因子，同时验证了NR2F2特异性抑制剂CIA1的治疗潜力 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，其临床转化效果和长期安全性仍需在更多临床样本和试验中验证 | 探究细胞外基质成分BGN在甲状腺乳头状癌（PTC）发生发展中的内分泌与旁分泌作用及其分子机制 | 甲状腺乳头状癌（PTC）细胞、小鼠模型、肿瘤微环境中的免疫细胞（特别是巨噬细胞） | 肿瘤生物学 | 甲状腺癌 | 多组学整合分析、RNA-seq、单细胞RNA-seq、流式细胞术、CRISPR干扰、荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 240 | 2025-12-05 |
Spatial Myeloid Landscape of Large Artery Atherosclerotic and Cardioembolic Thrombi Retrieved by Mechanical Thrombectomy
2025-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501658RR
PMID:41329022
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和免疫组化分析，比较了大动脉粥样硬化性和心源性栓塞性血栓的免疫细胞组成和分子特征 | 首次在急性缺血性卒中的两种主要亚型中，结合空间转录组学和单细胞RNA测序，揭示了巨噬细胞和中性粒细胞在血栓形成中的特异性免疫血栓模式 | 样本量相对较小（空间转录组学分析仅8例，免疫组化分析35例），且未包括其他卒中病因亚型 | 探究大动脉粥样硬化性和心源性栓塞性卒中血栓中髓系细胞的分子特征和免疫血栓机制 | 接受血管内血栓切除术的急性缺血性卒中患者的血栓样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 免疫组化图像, 单细胞RNA测序数据 | 42例急性缺血性卒中患者（其中8例LAA，27例CE），空间转录组学分析8例（4例LAA，4例CE），免疫组化分析35例（8例LAA，27例CE） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |