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当前共找到 41796 篇文献,本页显示第 221 - 240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
221 2026-07-27
Statistical Methods for Detecting Nonlinear Relationships in Gene Expression and Omics Data: A Review
2026-Jun-24, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 综述检测基因表达和组学数据中非线性关系的统计方法 将非线性方法系统归类为信息论、基于秩、基于核、基于距离、基于Copula和基于聚类六大类,并比较其统计行为、优缺点和典型失效模式 未提供定量性能基准测试,且依赖已发表文献的比较可能因实验条件不同而不一致 为组学数据中非线性依赖关系的分析方法选择提供基于场景的指导 检测非线性关系的统计方法及其在转录组学、网络推断和功能基因组学中的应用 机器学习 NA RNA-seq, 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
222 2026-07-27
Tumor Microenvironment Hijacks and Accelerates a Physiological Myeloid Senescence Signature Associated with Pan-Cancer Immunosuppression and Prognostic Stratification
2026-Jun-24, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过整合生理性衰老组织和泛癌单细胞数据集,揭示肿瘤微环境劫持并加速生理性髓系衰老信号,该信号与泛癌免疫抑制和预后分层相关 首次系统整合17个生理性衰老组织的转录组谱与泛癌单细胞数据集,发现恶性细胞通过MIF-CD74信号轴触发核心髓系亚群Mac_DAB2的衰老,并基于共享的髓系分化程序定义了髓系衰老相关基因(MSAG)特征 NA 阐明肿瘤微环境驱动髓系衰老的机制,并建立泛癌预后工具 生理性衰老组织(17种)和泛癌单细胞数据集(9种癌症类型,206个样本)中的髓系细胞 机器学习 泛癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 集成机器学习框架(117种算法) 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 206个样本,涵盖9种癌症类型 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
223 2026-07-27
Effect of Anti-Müllerian Hormone on Oocytes In Vitro Maturation in Sheep
2026-Jun-24, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 探究抗苗勒氏管激素(AMH)对绵羊卵母细胞体外成熟的影响及其分子机制 首次利用Smart-seq2单细胞RNA测序揭示AMH调控绵羊卵母细胞成熟的潜在信号通路,包括p53、MAPK、PI3K-Akt和TGF-beta等 仅基于两个时间点(12小时和24小时)的转录组数据,未涉及其他关键生物学过程 阐明AMH在绵羊卵母细胞体外成熟中的调控作用 绵羊卵母细胞 机器学习 其他 Smart-seq2单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 共检测到741个差异表达基因(FSH_12h与AMH_12h组)和746个差异表达基因(FSH_24h与A+F组) Illumina 单细胞RNA测序 Smart-seq2 Smart-seq2单细胞RNA测序平台
224 2026-07-27
Efficient Synthesis of Glucovanillin and Elucidation of Its Molecular Mechanisms in Ameliorating T2DM via Core Target Modulation and α-Glucosidase Inhibition
2026-Jun-24, Molecules (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究关注UGT109A1介导的葡糖香兰素的合成及其通过核心靶点调控和α-葡萄糖苷酶抑制改善2型糖尿病的分子机制 首次通过UGT109A1合成葡糖香兰素,并整合网络药理学、机器学习算法和单细胞转录组学揭示其抗2型糖尿病的双重机制 未明确提及研究局限性 探究葡糖香兰素对2型糖尿病的改善作用及其分子机制 葡糖香兰素、核心靶点SLC5A1和ADK、α-葡萄糖苷酶 机器学习 2型糖尿病 UGT109A1介导的糖基化 LASSO、SVM-RFE 基因表达数据、单细胞转录组数据 140个潜在靶点,7个关键靶点 NA 单细胞转录组学 NA NA
225 2026-07-27
Comparative Study of Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Data from Metastatic Bone Marrow Neuroblastoma Samples
2026-Jun-23, Cells IF:5.1Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序和 bulk RNA测序分析转移性骨髓神经母细胞瘤样本的细胞异质性 首次在单细胞分辨率下比较转移性骨髓神经母细胞瘤的单细胞与 bulk RNA测序数据,鉴定出新的肿瘤细胞抗原候选物CNTFR和CHRNA3 研究仅基于初诊时的转移性骨髓样本,可能无法反映疾病进展或治疗后的变化 探究神经母细胞瘤骨髓转移的细胞异质性和免疫微环境调控 转移性骨髓神经母细胞瘤样本 数字病理学 神经母细胞瘤 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA 转录组数据 初诊时的转移性骨髓样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA NA
226 2026-07-27
The Serpin Superfamily in Adipose Tissue Remodeling: Molecular Drivers of Immune-Metabolic Crosstalk and Insulin Sensitivity
2026-Jun-23, Biology
综述 综述serpin超家族在脂肪组织重塑中作为免疫-代谢串扰和胰岛素敏感性分子驱动因子的作用 系统阐述serpin超家族在脂肪组织重塑中的结构功能多样性及其在免疫-代谢串扰中的调控作用,并提出蛋白酶-抗蛋白酶平衡是代谢健康的关键决定因素 未明确提及 整合serpin超家族在脂肪组织重塑中的当前知识,探讨其机制作用,推动相关生物标志物和治疗靶点的识别 serpin超家族及其在脂肪组织重塑和免疫-代谢串扰中的机制 机器学习和计算生物学 肥胖及相关代谢疾病 NA NA NA NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
227 2026-07-27
Single-Cell Omics Advances in Understanding Tissue Development and Complex Trait Formation in Sheep and Goats
2026-Jun-23, Animals : an open access journal from MDPI IF:2.7Q1
综述 综述单细胞组学技术在理解绵羊和山羊组织发育及复杂性状形成中的进展 系统总结了单细胞组学在绵羊和山羊多种组织中的应用,并提出了整合单细胞多组学、空间转录组学和群体遗传学的新策略,以细胞类型特异性和空间信息背景解析调控机制 多数研究依赖单细胞RNA测序,受限于基因组注释不完整、生产性状覆盖不足及与群体遗传学整合薄弱,限制了其在分子育种中的应用 总结单细胞组学在绵羊和山羊组织发育和性状形成中的进展,并讨论新兴整合策略以加速基因发现和精准育种 绵羊和山羊的皮肤、毛囊、生殖器官、代谢组织和脂肪组织 机器学习 NA 单细胞RNA测序、单细胞多组学、空间转录组学、CRISPR/Cas9 NA 文本、图像 NA NA 单细胞RNA测序、单细胞多组学、空间转录组学 NA NA
228 2026-07-27
Correction to 'scSuperAnnotator: A platform for benchmarking comparison and visualizing automated cellular annotation methods for scRNA-seq data'
2026-Jun-22, Nucleic acids research IF:16.6Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
229 2026-07-27
Border-Associated Macrophages in CNS Health and Disease: A Comprehensive Review of Ontogeny, Heterogeneity, and Functional Plasticity at Neural Interfaces
2026-06-11, ASN neuro IF:3.9Q2
综述 系统综述中枢神经系统边界相关巨噬细胞的起源、异质性和功能可塑性及其在健康和疾病中的作用 首次全面整合BAM在脑膜、脉络丛和血管周围空间的区室特异性异质性,提出统一框架并揭示其从保护性稳态到致病性的双重角色转换机制 未明确讨论BAM研究的局限性,可能包括物种差异、技术限制和临床转化挑战 综合阐述BAM的起源、区室特异性异质性、转录程序及其在神经疾病中的功能角色 中枢神经系统边界相关巨噬细胞 数字病理学 神经系统疾病 谱系追踪、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 文本、基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
230 2026-07-27
Optineurin restrains IL-17-associated neuroinflammation in trigeminal ganglia to preserve sensory function after ocular HSV-1 infection
2026-Jun-07, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 利用小鼠HSV-1感染模型,发现视神经蛋白限制三叉神经节中IL-17相关神经炎症以保护感觉功能 首次鉴定视神经蛋白为三叉神经保护的关键调控因子,并揭示了IL-17相关炎症在神经功能障碍而非急性死亡中的作用 局限性未在摘要中明确提及 探究视神经蛋白在三叉神经节神经炎症和感觉功能保护中的作用 小鼠三叉神经节,角膜,及神经免疫细胞群 数字病理学 神经退行性疾病,感染性疾病(HSV-1相关神经营养性角膜炎) 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠三叉神经节(感染后30天) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 基于液滴的单细胞RNA测序
231 2026-07-27
Inflammatory genital strain of Chlamydia trachomatis elicits a Th17 immune response
2026-Jun-07, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 利用小鼠模型发现沙眼衣原体D型株选择性诱导Th17免疫反应,可能加剧生殖道炎症病理 首次揭示沙眼衣原体血清型特异性Th17极化机制,通过单细胞RNA测序鉴定Bhlhe40和Il1r1作为炎症表型的转录特征 未明确Th17细胞在人体中的直接病理作用;未探讨其他免疫细胞亚群的协同效应 阐明沙眼衣原体炎症型菌株D型如何通过Th17免疫反应引发组织病理损伤 沙眼衣原体D型和L2型血清型感染的小鼠生殖道模型 机器学习 肺炎衣原体相关疾病(生殖道炎症) 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠子宫CD4+T细胞(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序分析D型沙眼衣原体感染小鼠子宫CD4+T细胞
232 2026-07-27
Identification of MTFR1 as a Novel Prognostic Biomarker and Putative Oncogene for Breast Cancer: A Multi-Omics Analysis and in Vitro Experimental Validation
2026 Jan-Dec, IET systems biology IF:1.9Q3
研究论文 通过整合多组学数据、空间转录组学和单细胞测序,结合体外实验验证,系统鉴定MTFR1在乳腺癌中的预后生物标志物和潜在致癌基因作用 首次系统揭示MTFR1在乳腺癌中的多维作用,包括空间转录组和单细胞测序的整合分析,以及交叉癌症免疫治疗中的预测性能评估 未提及具体局限性信息 探究MTFR1在乳腺癌中的表达特征、临床意义和功能机制 乳腺癌组织和细胞系 数字病理学 乳腺癌 多组学分析, 空间转录组学, 单细胞测序, 体外实验验证 NA 多组学数据, 空间转录组数据, 单细胞测序数据, 实验数据 多组学数据集(具体样本量未提及)及体外细胞实验样本 NA 空间转录组学, 单细胞测序 NA NA
233 2026-07-27
Investigating tryptophan metabolism in colorectal cancer using Single-cell RNA sequencing based on machine learning techniques
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序和机器学习技术研究结直肠癌中的色氨酸代谢模式 首次揭示结直肠癌中色氨酸代谢的细胞模式,并发现巨噬细胞和潘氏细胞在肿瘤发展中起主要作用 未在具体摘要中明确说明局限性 阐明结直肠癌中色氨酸代谢在细胞水平的模式,并识别关键特征基因 结直肠癌细胞类型,特别是巨噬细胞和潘氏细胞 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序 随机森林、Boruta、LASSO、梯度提升机 基因表达数据 未在摘要中明确说明样本量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
234 2026-07-27
YAP1 depletion enhances TAZ and its complexation with TEAD4 and AP-1 heterodimer C-JUN/FOSB in gastric cancer progression and metastasis
2026, Cancer heterogeneity and plasticity
研究论文 探究YAP1缺失通过TAZ与TEAD4及AP-1异二聚体c-JUN/FOSB的复合作用促进胃癌进展和转移 首次揭示在胃癌腹膜转移中YAP1抑制会引发TAZ代偿性上调,并发现TAZ与TEAD4及AP-1异二聚体的复合作用增强,强调联合靶向YAP1和TAZ的潜在治疗价值 研究主要集中在体内外模型和PDX模型,尚未在大型临床试验中验证联合抑制的安全性和疗效 评估YAP1和TAZ在胃癌腹膜转移中的表达状态及联合靶向的抗肿瘤活性 胃癌腹膜转移样本、细胞系、小鼠模型和患者来源异种移植模型 机器学习 胃癌 单细胞RNA测序、共免疫荧光染色、基因敲除、反义寡核苷酸抑制、免疫共沉淀、荧光素酶报告实验 NA 单细胞转录组数据、蛋白质互作数据 包括胃癌腹膜转移组织样本、细胞系、实验小鼠和PDX模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
235 2026-07-27
Transcriptomic characterization of key psoriasis-associated genes based on single-cell RNA-seq and machine learning
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 基于单细胞RNA测序和机器学习鉴定银屑病关键基因并进行转录组特征分析 首次结合单细胞RNA测序和机器学习方法,识别出四个新银屑病相关关键基因(DEFB4A、GJB2、SERPINB3、SERPINB13),并探索其病灶调控作用和靶向治疗策略 研究基于公开数据库,样本量有限;功能验证主要依赖生物信息学分析,缺乏体内或体外实验的直接验证 解析银屑病的转录组特征,识别关键驱动基因并探索潜在治疗靶点 银屑病患者和健康对照的皮肤组织样本 机器学习 银屑病 单细胞RNA测序、批量RNA测序 机器学习算法(具体模型类型未明确) 基因表达数据 来自GEO数据库的银屑病和健康样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
236 2026-07-27
Key molecular mechanisms of mitochondrial metabolic pathways in specific cell subpopulations of pancreatic cancer based on scRNA-seq and bulk RNA-seq
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,探究胰腺癌细胞亚群中线粒体代谢通路的关键分子机制 首次通过整合scRNA-seq和bulk RNA-seq揭示胰腺癌不同细胞亚群中线粒体代谢重编程的分子机制,并鉴定出三个关键基因(IFI27、PKM和RSAD2) 本研究依赖公共数据库数据,缺乏实验验证,且样本量有限 探究胰腺癌细胞亚群中线粒体代谢的分子机制并鉴定潜在治疗靶点 胰腺癌细胞亚群中的线粒体代谢相关基因及其调控网络 数字病理学 胰腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 WGCNA, 机器学习算法(如LASSO等) 转录组测序数据(scRNA-seq和bulk RNA-seq) 使用GSE183795、GSE16515、GSE197177和TCGA-PAAD四个公共数据集 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
237 2026-07-27
Discovery of hub genes linking oxidative stress to type 2 diabetic sarcopenia using single-cell sequencing and machine learning
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过单细胞测序和机器学习识别2型糖尿病肌肉减少症中与氧化应激相关的核心基因 首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,结合127种机器学习算法组合,系统鉴定了2型糖尿病相关肌肉减少症中与氧化应激相关的7个核心基因,揭示了TNFRSF1B介导的炎症信号激活泛素-蛋白酶体系统导致肌肉萎缩的新机制 研究主要基于公开数据集分析,缺乏动物模型或临床样本的验证,且核心基因在2型糖尿病肌肉减少症中的具体功能机制仍需进一步实验证实 探究2型糖尿病与肌肉减少症共病机制中氧化应激相关的分子机制 2型糖尿病相关肌肉减少症患者 机器学习和单细胞组学 2型糖尿病,肌肉减少症 单细胞RNA测序,批量RNA测序 Lasso,Stepglm(逐步逻辑回归) 基因表达数据 本研究中分析了四个公开数据集(GSE244515, GSE268953, GSE202295, GSE226151),具体样本量未详细说明 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
238 2026-07-27
An integrated multi-omics study of key mediators and therapeutic targets for doxorubicin-induced atrial fibrillation
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过整合多组学策略研究多柔比星诱发房颤的关键介质与治疗靶点 首次将药物警戒分析、网络毒理学与多组学数据(转录组、单细胞RNA测序)相结合,系统识别并验证CCR2和PDE5A作为多柔比星诱导房颤的中枢介质和潜在治疗靶点 发现需进一步的实验验证 阐明多柔比星诱导房颤的分子与细胞机制并识别关键靶点 多柔比星相关房颤事件的患者数据及心房转录组数据集 机器学习 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 分子对接 MCC算法 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 多个独立数据集(具体数量未提及) NA 单细胞RNA-seq NA NA
239 2026-07-27
Dysregulated glucocorticoid-responsive immune genes in peripheral blood mononuclear cells as a shared molecular signature of autism spectrum disorder and irritable bowel syndrome
2026, PloS one IF:2.9Q1
research paper 通过整合转录组分析,发现自闭症谱系障碍和肠易激综合征在外周血单核细胞中共享糖皮质激素响应免疫基因的失调分子特征 首次揭示ASD和IBS在GRI相关转录活性上的共享分子特征,并鉴定出LRFN1、NUAK2、TMEM154和GAPT四个核心基因作为潜在生物标志物,整合了机器学习、单细胞测序和药物预测等多层次分析 研究样本量可能有限,且未验证因果机制,未来需进一步在独立队列中验证生物标志物和药物靶点 阐明ASD与IBS之间共享的糖皮质激素响应免疫信号分子机制及潜在生物标志物和治疗靶点 自闭症谱系障碍患者和肠易激综合征患者的外周血单核细胞 machine learning 自闭症谱系障碍, 肠易激综合征 RNA-seq, single-cell RNA-seq ssGSEA, WGCNA, machine learning 转录组数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
240 2026-07-27
LDHA, BIK, and CNIH4 Are Diagnostic Markers of Endoplasmic Reticulum Stress in Lung Cancer Comorbid With Sepsis: Integrating Machine Learning and Single-Cell Analysis of Immune Signaling
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 通过整合机器学习和单细胞分析,鉴定LDHA、BIK和CNIH4作为肺癌合并脓毒症的内质网应激诊断标志物,并实验验证其功能 首次将内质网应激与肺癌合并脓毒症的免疫调控相结合,利用机器学习筛选出三个新的诊断标志物,并通过单细胞测序和体外实验验证其细胞类型特异性表达和功能 未提供具体局限性信息,但基于摘要推断可能包括样本量有限、单细胞数据仅用于验证、PC9细胞系不能完全代表体内环境 探究内质网应激与肺癌合并脓毒症中免疫反应的相互作用机制,并发现潜在的诊断标志物 肺癌合并脓毒症患者的内质网应激相关基因和免疫信号 机器学习 肺癌, 脓毒症 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 西方印迹, 伤口愈合实验, Transwell实验, 分子对接 机器学习算法(具体类型未明确,但描述为穷举机器学习算法) 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 临床组织样本, 细胞系实验数据 数据集来自GEO,包含肺癌和脓毒症队列;临床组织队列包括癌旁正常组织、肺癌组织和肺癌合并脓毒症组织 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
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