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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2361 | 2026-03-04 |
CD14 plays a critical role in pain and inflammation across multiple models of post-traumatic osteoarthritis
2026-Feb-24, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70100
PMID:41735778
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研究论文 | 本研究通过基因敲除和抗体阻断方法,在多模型小鼠中验证CD14在创伤后骨关节炎疼痛和炎症中的关键作用 | 首次在多模型系统中系统验证CD14在骨关节炎疼痛和炎症中的核心作用,并采用单细胞转录组和空间蛋白质组学揭示其作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究CD14在创伤后骨关节炎疼痛和炎症中的作用机制 | 人类骨关节炎滑液样本、多种创伤后骨关节炎小鼠模型 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组学、空间蛋白质组学、流式细胞术 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、行为学数据 | 人类滑液样本及多种小鼠模型(包括不同性别和肥胖因素) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 2362 | 2026-03-04 |
Large-scale sequencing study of de novo regulatory Tandem Repeats (TRs) identifies new ASD (Autism Spectrum Disorders) candidate genes integrating gene expression mapping, brain scRNA-seq and organoid models
2026-Feb-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8374597/v1
PMID:41727608
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研究论文 | 本研究通过对新生串联重复序列进行整合分析,结合基因表达图谱、大脑单细胞RNA测序和类器官模型,识别出新的自闭症谱系障碍候选基因 | 整合了新生串联重复序列分析、多组学功能注释、大脑单细胞RNA测序和皮质类器官表达数据,以揭示传统外显子组或全基因组分析中通常遗漏的非编码区域复杂遗传变异 | 研究主要基于特定队列(西班牙队列和SSC队列),样本来源和规模可能限制结果的普适性;依赖生物信息学流程的准确性,可能存在检测偏差 | 揭示自闭症谱系障碍的缺失遗传性,识别新的风险基因,特别是在非编码区域 | 自闭症谱系障碍患者及其家庭(包括西班牙队列200个ASD三重奏和SSC的1637个ASD单纯型四重家庭),以及人类大脑组织和皮质类器官 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 目标测序、单细胞RNA测序、生物信息学分析 | NA | 基因组测序数据、单细胞RNA测序数据、类器官表达数据 | 200个ASD三重奏(西班牙队列)和1637个ASD单纯型四重家庭(SSC),以及人类大脑单细胞RNA测序数据和皮质类器官数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2363 | 2026-03-04 |
WAS Protein Deficiency Disrupts Memory B Cell Formation During Acute LCMV Infection
2026-Feb-11, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-026-01984-5
PMID:41670926
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研究论文 | 本研究通过使用WAS蛋白敲除小鼠模型,探究了在急性LCMV感染中WAS蛋白缺乏对记忆B细胞分化的影响及其机制 | 首次结合单细胞RNA测序技术,揭示了WAS蛋白在急性病毒感染期间差异表达于记忆B细胞亚群,并调控其命运 | 研究仅基于小鼠模型,可能无法完全反映人类WAS患者的复杂免疫反应 | 探究WAS蛋白缺乏如何影响记忆B细胞在急性病毒感染中的形成机制 | WAS蛋白敲除小鼠在急性LCMV感染后的记忆B细胞 | 免疫学 | Wiskott-Aldrich综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2364 | 2026-03-04 |
fastdemux: Robust SNP-based demultiplexing of single-cell population genomics data
2026-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.10.705082
PMID:41726916
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研究论文 | 本文介绍了fastdemux,一种基于SNP的高效单细胞基因组学数据解复用框架,通过DLDA模型显著提升计算效率并保持准确的供体分配 | 提出基于对角线性判别分析(DLDA)的快速解复用框架,在计算速度和内存使用上相比现有方法有数量级提升,同时支持双联体和多联体检测,并适用于scATAC-seq数据 | 未明确提及具体样本量限制或跨平台验证的广泛性 | 开发一种高效且可扩展的单细胞基因组学数据解复用方法,以降低大规模研究中的成本和批次效应 | 单细胞RNA-seq和scATAC-seq数据中的供体解复用 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, scATAC-seq | DLDA(对角线性判别分析) | 基因组学数据(SNP变异信息) | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2365 | 2026-03-04 |
SCALPEL: A pipeline for processing large-scale spatial transcriptomics data
2026-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.09.698732
PMID:41648271
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研究论文 | 本文介绍了一个名为SCALPEL的用于处理大规模空间转录组学数据的分析流程 | 该流程针对大型图谱级数据集设计,集成了优化的3D分割、改进的过滤标准、基于转录组的双联体检测、增强的细胞类型标签转移、空间域检测、组织切片配准至标准脑图谱以及全基因组表达插补等多项先进功能 | NA | 开发一个能够高效、准确处理大规模空间转录组学数据的标准化分析流程 | 空间转录组学数据,特别是来自小鼠全脑的大规模数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组学数据,scRNA-seq数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2366 | 2026-03-04 |
Club cell RhoA activation amplifies allergic airway inflammation by regulating epithelial integrity and C1qα+ interstitial macrophages
2026-Feb-01, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.016
PMID:41633491
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研究论文 | 本研究探讨了Club细胞中RhoA激活在过敏性气道炎症中的作用,通过基因敲除小鼠模型和多组学技术揭示了其通过影响上皮屏障功能和巨噬细胞动态来放大炎症的机制 | 首次在Club细胞中特异性研究RhoA的功能,并发现其通过调节上皮完整性和C1qα+间质巨噬细胞来放大过敏性气道炎症 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 确定Club细胞中RhoA在过敏性气道炎症中的功能 | Club细胞特异性RhoA敲除小鼠模型及气液界面培养的上皮细胞 | 免疫学与呼吸疾病研究 | 过敏性气道炎症 | 多维流式细胞术、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、流式细胞数据、单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及基因敲除小鼠模型和多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2367 | 2026-03-04 |
Chimeric brain models to study human glial-neuronal and macroglial-microglial interactions
2026-Jan-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116794
PMID:41499239
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研究论文 | 本研究通过将人源多能干细胞衍生的神经前体细胞和巨噬细胞前体细胞共移植到新生小鼠大脑中,构建了包含人类小胶质细胞、大胶质细胞和神经元的嵌合大脑模型,用于研究人类胶质细胞-神经元以及胶质细胞间的相互作用 | 开发了一种新型共移植嵌合大脑模型,首次在体内同时整合了人类神经元、大胶质细胞和小胶质细胞,并利用单细胞RNA测序和细胞间通讯分析揭示了人类神经细胞间特异的信号通路 | 模型基于小鼠宿主环境,可能无法完全模拟人类大脑的完整微环境;研究主要关注发育早期阶段,成年期相互作用的长期效应尚不明确 | 研究人类胶质细胞与神经元之间以及不同类型胶质细胞之间的相互作用机制 | 人类多能干细胞衍生的神经前体细胞和巨噬细胞前体细胞,移植到新生小鼠大脑中形成的嵌合组织 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,超分辨率成像,3D重建,细胞间通讯分析 | 嵌合大脑模型 | 单细胞转录组数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2368 | 2026-03-04 |
LncRNA ZFAS1 Promotes Alveolar Bone Resorption by Enhancing Osteoclastogenesis in Periodontitis
2026-01, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70134
PMID:41549697
|
研究论文 | 本研究探讨了长链非编码RNA ZFAS1在牙周炎微环境中骨重塑失调的机制作用 | 揭示了lncRNA ZFAS1作为炎症性骨丢失的关键驱动因子,通过促进破骨细胞生成和抑制成骨细胞生成发挥双重调控作用 | 研究主要基于体外细胞模型(RAW264.7和MC3T3-E1细胞),体内验证和临床转化潜力需进一步探索 | 阐明牙周炎中骨吸收的分子机制,特别是lncRNA ZFAS1在病理骨丢失中的作用 | 牙周组织(健康与患病)、RAW264.7破骨前体细胞、MC3T3-E1成骨前体细胞 | 分子生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qPCR、组织学、免疫组织化学 | NA | RNA测序数据、基因表达数据、组织图像 | 未明确具体样本数量,涉及健康与患病牙周组织样本及细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2369 | 2026-03-04 |
The Ly6ghigh Neutrophil Subset Dictates Breast Cancer Lung Metastasis via CD8+ T Cell Death
2026, Cancer communications (London, England)
DOI:10.34133/cancomm.0003
PMID:41625479
|
研究论文 | 本研究揭示了Ly6g高表达中性粒细胞亚群通过NETs中的cathelicidin诱导CD8+ T细胞凋亡,从而促进乳腺癌肺转移的机制 | 首次鉴定出Ly6g高表达中性粒细胞亚群在乳腺癌肺转移中的关键作用,并阐明其通过NETs释放cathelicidin直接结合CD8+ T细胞线粒体蛋白Ant1触发凋亡的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚不充分;机制研究集中在cathelicidin-Ant1轴,可能存在其他调控途径 | 解析乳腺癌肺转移微环境中中性粒细胞与CD8+ T细胞的相互作用机制及其在免疫逃逸中的作用 | 小鼠乳腺癌肺转移模型中的肺组织、中性粒细胞亚群、CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、多重免疫荧光、蛋白质结合实验 | NA | 单细胞转录组数据、流式数据、免疫荧光图像、蛋白质互作数据 | 小鼠乳腺癌肺转移模型肺组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2370 | 2026-03-04 |
Deciphering precursor cell dynamics in esophageal preneoplasia via genetic barcoding and single-cell transcriptomics
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509534122
PMID:41337486
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研究论文 | 本文通过结合遗传条形码和单细胞转录组学技术,追踪食管癌前病变细胞的谱系,揭示了高可塑性前体细胞的动态变化及其在肿瘤发生中的作用 | 首次将遗传条形码与单细胞RNA测序结合,用于追踪食管癌前病变细胞的谱系,并识别出具有高可塑性的独特前体细胞群体 | 未明确提及样本量或具体技术平台细节,可能限制结果的普遍性 | 阐明食管癌前病变细胞的起源和轨迹,以理解早期肿瘤发生机制 | 食管癌前病变细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,遗传条形码,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2371 | 2026-03-04 |
Single-cell analysis identifies PI3+S100A7+keratinocytes in early cervical squamous cell carcinoma with HPV infection
2025-Oct-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003795
PMID:40947786
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,在早期宫颈鳞状细胞癌中鉴定出与HPV感染相关的PI3+S100A7+角质形成细胞,并揭示了其与肿瘤微环境中巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞的相互作用 | 首次在早期HPV阳性宫颈鳞状细胞癌中鉴定出PI3+S100A7+角质形成细胞亚群,并系统揭示了该细胞亚群与巨噬细胞之间的空间邻近性和信号通路互作,以及不同HPV亚型(如HPV16与HPV66)驱动的独特肿瘤促进机制 | 样本量较小(仅4例患者),且研究聚焦于早期肿瘤,未涵盖晚期或转移性病例 | 探究HPV感染在早期宫颈鳞状细胞癌发生发展中的作用机制,特别是肿瘤微环境中细胞异质性和细胞间互作 | 早期宫颈鳞状细胞癌患者的肿瘤组织及配对癌旁组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,病毒序列比对,轨迹分析,免疫荧光染色,CIBERSORTx分析 | NA | 单细胞转录组数据,临床预后数据,免疫荧光图像数据 | 4例早期宫颈鳞状细胞癌患者的肿瘤及配对癌旁组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics平台(具体配置未在摘要中说明,推断为10x Chromium单细胞3'基因表达解决方案) |
| 2372 | 2026-03-04 |
KIAA0319 Plays a Critical Role in Cortical Neuronal Maturation and Synaptic Development Through a Dyslexia-Associated Gene Network
2025-Oct-18, Biological psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.biopsych.2025.10.014
PMID:41115623
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9技术敲除KIAA0319基因,利用人类皮质类器官模型探究其在神经发育中的作用,揭示了该基因通过调控阅读障碍相关基因网络影响皮质神经元成熟和突触发育 | 首次在人类皮质类器官模型中系统研究KIAA0319基因敲除对神经发育的影响,并发现其通过调控一个包含多个阅读障碍相关基因的广泛网络发挥作用 | 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内大脑发育的复杂性;样本规模相对有限 | 探究KIAA0319基因在神经发育中的分子功能及其与阅读障碍的关联机制 | KIAA0319敲除的人类胚胎干细胞及其分化的人类皮质类器官 | 神经科学 | 阅读障碍 | CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、钙成像、免疫染色、EdU检测 | 人类皮质类器官模型 | 单细胞转录组数据、图像数据、功能成像数据 | 未明确说明具体样本数量,使用基因敲除和对照类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2373 | 2026-03-04 |
Single-cell nanodroplet processing proteomics pipeline for analysis of human-derived microglia
2025-Oct-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.02.680067
PMID:41256374
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研究论文 | 本文介绍了一种用于分析人源性小胶质细胞的单细胞纳米液滴处理蛋白质组学流程 | 开发了一种基于FACS辅助分离、冷冻保存和纳米液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学工作流程,首次实现了对死后人脑皮层来源小胶质细胞的单细胞蛋白质组分析,平均每个细胞可鉴定1039种蛋白质 | 作为原理验证性研究,数据规模有限,仅部分重现了先前已知的小胶质细胞亚型 | 探索脑小胶质细胞在细胞水平的异质性,为阿尔茨海默病等神经系统疾病寻找功能和分析相关的蛋白质靶点 | 人脑皮层来源的小胶质细胞 | 蛋白质组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞质谱蛋白质组学、FACS、纳米液滴处理 | NA | 蛋白质组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞蛋白质组学 | NA | 基于纳米液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学平台 |
| 2374 | 2026-03-04 |
Tumor-expressed GPNMB orchestrates Siglec-9+ TAM polarization and EMT to promote metastasis in triple-negative breast cancer
2025-Sep-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503081122
PMID:40892920
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤表达的GPNMB如何通过调控Siglec-9+ TAM极化和EMT来促进三阴性乳腺癌的转移 | 揭示了GPNMB通过诱导单核细胞中次级GPNMB表达,形成前馈放大环路,促进免疫抑制性TAM极化,并首次阐明了GPNMB不同唾液酸化修饰(α2,3 vs α2,6)导致Siglec-9差异识别的机制 | 研究主要基于体外共培养和体内小鼠模型,人类临床样本验证相对有限,且Siglec-9在人体中的功能需进一步验证 | 阐明GPNMB在三阴性乳腺癌转移中的分子机制,并探索其作为治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌细胞、单核细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(bulk RNA-seq)、去卷积分析、体外共培养、体内小鼠模型 | NA | RNA测序数据、基因表达数据 | 基于公开可用的TNBC scRNA-seq数据集和TNBC队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2375 | 2026-03-04 |
Epigenomic subtypes of late-onset Alzheimer's disease reveal distinct microglial signatures
2025-Aug-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7232080/v1
PMID:40799738
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研究论文 | 本研究通过分析晚期阿尔茨海默病(LOAD)的死后脑组织DNA甲基化数据,识别出两种不同的表观基因组亚型,并揭示了它们与特定小胶质细胞签名和功能机制的关联 | 首次在LOAD中基于全基因组DNA甲基化数据识别出两种一致的表观基因组亚型,并整合单细胞RNA-seq数据揭示了亚型特异性小胶质细胞炎症状态 | 研究基于死后脑组织样本,可能无法完全反映疾病早期或活体状态;样本量相对有限(N=831),且为回顾性分析 | 识别LOAD的表观基因组亚型,并探索其与小胶质细胞签名、功能机制及临床病理特征的关系 | 晚期阿尔茨海默病患者的死后脑组织样本 | 表观基因组学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组DNA甲基化分析、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | 无监督聚类方法 | DNA甲基化数据、RNA-seq数据 | 831个死后脑组织样本(来自三个独立队列) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2376 | 2026-03-04 |
Gene regulatory networks and essential transcription factors for de novo-originated genes
2025-Aug, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-025-02747-y
PMID:40659874
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研究论文 | 本研究通过计算方法和单细胞RNA测序数据,识别了调控de novo基因表达的关键转录因子,并利用果蝇遗传工具验证了这些转录因子的作用 | 首次揭示了de novo基因的调控程序,识别了关键转录因子如achintya和vismay,并探讨了转录因子复制与de novo基因表达调控的关联 | 研究主要基于果蝇模型,结果在其他物种中的普适性有待验证,且调控机制的实验验证可能有限 | 探究de novo起源基因的调控网络和关键转录因子 | 果蝇中的de novo基因及其调控转录因子 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2377 | 2026-03-04 |
SpaceBF: Spatial coexpression analysis using Bayesian Fused approaches in spatial omics datasets
2025-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.29.646124
PMID:40236135
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpaceBF的贝叶斯融合建模框架,用于在空间组学数据中分析分子间的空间共表达模式 | 开发了首个基于贝叶斯融合方法的框架,能够同时估计局部(位置特异性)和全局(组织范围)的分子共表达,相比现有主要依赖地理空间指标(如双变量莫兰指数和李氏指数)的方法具有更高的特异性和统计效力 | 未明确说明方法对计算资源的需求或可扩展性限制,也未讨论在超大规模数据集上的应用性能 | 开发稳健的统计方法来检测空间组学数据中分子对之间的空间变化共表达模式 | 空间转录组学和空间蛋白质组学数据中的分子(基因、肽段、脂质、N-聚糖)共表达关系 | 空间组学 | 癌症(多种类型) | 空间转录组学、质谱成像 | 贝叶斯融合模型 | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 2378 | 2026-03-04 |
Combining Machine Learning and Multiplexed, In Situ Profiling to Engineer Cell Type and Behavioral Specificity
2025-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660790
PMID:40667316
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研究论文 | 本研究开发了一个结合机器学习与多重原位分析的端到端平台ESCargoT,用于加速脊髓背角增强子发现,以实现神经回路的精确控制 | 整合机器学习指导的增强子优先排序、模块化AAV组装和多重原位筛选,实现空间解析的多重增强子分析 | 未明确提及样本量或实验重复次数,可能限制统计稳健性 | 加速脊髓背角增强子发现,以开发细胞靶向工具和基因疗法 | 小鼠脊髓背角神经元亚型(如兴奋性神经元、Exc-LMO3和Exc-SKOR2神经元)以及少突胶质细胞和运动神经元 | 机器学习 | 疼痛和瘙痒相关疾病 | 机器学习模型、交叉物种染色质可及性数据、多重原位分析、Golden-Gate组装 | 机器学习模型 | 染色质可及性数据、空间分析数据 | NA | NA | 多重原位分析、空间平行报告基因检测 | NA | ESCargoT平台结合机器学习指导的增强子优先排序、模块化AAV组装和多重原位筛选 |
| 2379 | 2026-03-04 |
A statistical framework for inferring genetic requirements from embryo-scale single-cell sequencing experiments
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.03.646654
PMID:40236139
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研究论文 | 本文介绍了一个统计框架和两个软件工具(Hooke和Platt),用于从胚胎尺度的单细胞测序实验中推断遗传需求,并应用于斑马鱼胚胎的单细胞图谱分析 | 开发了Hooke和Platt软件工具,利用单细胞数据集中的丰富统计模式来表征实验扰动的直接分子和细胞后果,并通过细胞类型协变分析揭示发育中的基因依赖关系 | NA | 推断遗传、化学或环境扰动对基因和细胞类型的直接影响,并构建谱系依赖图谱 | 斑马鱼胚胎的单细胞测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 统计框架 | 单细胞测序数据 | 数千个斑马鱼胚胎的百万级细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2380 | 2026-03-04 |
Multiomics identifies tumor-intrinsic SREBP1 driving immune exclusion in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011537
PMID:40518290
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肝细胞癌中肿瘤内在的SREBP1通过促进巨噬细胞M2样重编程驱动免疫排斥的机制 | 首次通过大规模多组学分析结合单细胞RNA测序和空间脂质组学,系统性识别了肝细胞癌中与免疫排斥相关的32条致癌通路,并确定SREBP1为核心调控因子 | 研究主要基于体外三维共培养模型,缺乏体内实验验证;样本量虽大但单细胞RNA测序样本相对较少(31个) | 识别肝细胞癌中导致免疫检查点抑制剂耐药的新治疗靶点 | 肝细胞癌患者样本(包括肿瘤组织)和体外培养的HepG2肝癌细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 成像质谱流式细胞术, 空间脂质组学, CRISPR基因敲除 | 三维共培养模型 | RNA测序数据, 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据, 质谱成像数据 | 900多个人类样本(RNA测序和蛋白质组学)和31个肿瘤单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间脂质组学 | NA | NA |