单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 23918 篇文献，本页显示第 23621 - 23640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23621 | 2024-08-09 |
Single-cell TCRseq: paired recovery of entire T-cell alpha and beta chain transcripts in T-cell receptors from single-cell RNAseq
2016-07-27, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-016-0335-7
PMID:27460926
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为single-cell TCRseq（scTCRseq）的新方法，用于从配对末端单细胞RNA测序读取中识别和组装全长重排的T细胞受体序列 | 该方法具有从配对末端单细胞RNA测序读取中恢复配对α和β片段的新颖能力 | NA | 准确表征T细胞受体α和β链的谱系，以理解适应性免疫 | T细胞受体α和β链的全长重排序列 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 23622 | 2024-08-09 |
Identification of key factors conquering developmental arrest of somatic cell cloned embryos by combining embryo biopsy and single-cell sequencing
2016, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/celldisc.2016.10
PMID:27462457
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研究论文 | 本文通过结合胚胎活检和单细胞测序技术，研究了体细胞克隆胚胎发育停滞的关键因素 | 首次开发了体细胞核转移胚胎的活检系统，并利用单细胞转录组测序技术，发现了Kdm4b和Kdm5b的失活是克隆胚胎发育停滞的关键因素 | NA | 探索体细胞克隆胚胎发育停滞的分子机制 | 体细胞克隆胚胎的发育过程 | 生物技术 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 不同发育命运的体细胞核转移胚胎 |
| 23623 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-sequencing: The future of genome biology is now
2017-05-04, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2016.1201618
PMID:27442339
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在基因组学研究中的应用及其对未来科学和社会的影响 | 介绍了更敏感和自动化的方法，提高了数据质量和通量，减少了操作时间 | NA | 探索单细胞RNA测序技术在基因组学研究中的应用及其对未来科学和社会的影响 | 单细胞RNA测序技术及其在复杂多细胞生物中的转录组景观研究 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 数千个单细胞 |
| 23624 | 2024-08-09 |
Cellular Taxonomy of the Mouse Striatum as Revealed by Single-Cell RNA-Seq
2016-07-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2016.06.059
PMID:27425622
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示小鼠纹状体的细胞分类 | 首次通过微流控和FACS技术进行单细胞RNA测序，详细分类了小鼠纹状体的细胞多样性，并发现了多种标记基因和特定功能状态的细胞亚型 | NA | 揭示小鼠纹状体的细胞类型及其功能多样性 | 小鼠纹状体的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠纹状体的多种细胞类型 |
| 23625 | 2024-08-09 |
Single-cell Sequencing of Thiomargarita Reveals Genomic Flexibility for Adaptation to Dynamic Redox Conditions
2016, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2016.00964
PMID:27446006
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术分析了Thiomargarita的基因组，揭示了其在动态氧化还原条件下适应性的基因组灵活性 | 发现了Thiomargarita nelsonii Thio36的新陈代谢途径，包括硝酸盐呼吸、硫氧化和无机碳固定，以及一种新的基于黄素的能量分支途径 | NA | 探索Thiomargarita在动态氧化还原条件下的适应性和其基因组的独特特征 | Thiomargarita nelsonii Thio36的单细胞基因组及其与其他Beggiatoaceae成员的比较 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 一个链状的'Candidatus Thiomargarita nelsonii Thio36'样本，以及五个其他Beggiatoaceae成员的草图基因组和一个完整基因组 |
| 23626 | 2024-08-09 |
Comparison of methods to detect differentially expressed genes between single-cell populations
2017-09-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbw057
PMID:27373736
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research paper | 比较了五种统计方法在两个不同单细胞群体中检测差异表达基因的效果 | 探讨了原本为传统批量RNA-seq数据开发的差异表达方法是否适用于单细胞RNA-seq数据分析 | 未发现当前可用单细胞特异性方法的系统性优势 | 评估不同统计方法在单细胞RNA-seq数据中检测差异表达基因的有效性 | 两个不同的单细胞群体中的差异表达基因 | NA | NA | RNA-seq | NA | single-cell RNA-seq data | 三个不同的比较设置 |
| 23627 | 2024-08-09 |
Single-cell Sequencing Reveals Variants in ARID1A, GPRC5A and MLL2 Driving Self-renewal of Human Bladder Cancer Stem Cells
2017-01, European urology
IF:25.3Q1
DOI:10.1016/j.eururo.2016.06.025
PMID:27387124
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了59个细胞，包括膀胱癌干细胞、膀胱癌非干细胞、膀胱上皮干细胞和膀胱上皮非干细胞，以揭示人类膀胱癌干细胞的遗传基础和起源 | 首次通过单细胞测序技术全面揭示了人类膀胱癌干细胞的遗传基础，并通过进化分析展示了膀胱癌干细胞的双克隆起源 | NA | 揭示人类膀胱癌干细胞的遗传基础和起源 | 膀胱癌干细胞、膀胱癌非干细胞、膀胱上皮干细胞和膀胱上皮非干细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 59个细胞，包括膀胱癌干细胞、膀胱癌非干细胞、膀胱上皮干细胞和膀胱上皮非干细胞 |
| 23628 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of the Human Endocrine Pancreas
2016-10, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db16-0405
PMID:27364731
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对来自不同年龄和糖尿病类型的捐献者的人类内分泌胰腺进行分析 | 首次展示了糖尿病患者α-和β-细胞的表达特征与儿童相似，表明存在部分去分化过程，并发现Sonic hedgehog信号通路在人类α-细胞增殖中的激活 | NA | 揭示人类内分泌胰腺细胞的异质性并检测稀有细胞状态 | 人类胰腺胰岛中的多种内分泌细胞类型 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个死亡器官捐献者的胰岛，包括儿童、健康成年人和1型或2型糖尿病患者 |
| 23629 | 2024-08-09 |
Single-cell pluripotency regulatory networks
2016-09, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.201500528
PMID:27357612
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研究论文 | 本文讨论了使用新型单细胞转录组学和蛋白质组学重建单细胞中调控网络的方法，以扩展我们对多能性分子基础的理解 | 采用单细胞转录组学和蛋白质组学技术，以更精细的粒度研究多能干细胞中的调控网络 | 目前对多能干细胞中响应信号通路与核心转录调控网络的时空整合理解尚不完整 | 扩展对多能性分子基础的理解，包括多能干细胞群体中细胞间变异性的作用及调控网络的控制方法 | 多能干细胞中的调控网络 | NA | NA | 单细胞转录组学和蛋白质组学 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | NA |
| 23630 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq technology lends a hand into HSC ontogeny
2016-Sep, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-016-5092-8
PMID:27376532
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23631 | 2024-08-09 |
A single-cell resolution map of mouse hematopoietic stem and progenitor cell differentiation
2016-08-25, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood-2016-05-716480
PMID:27365425
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，对超过1600个单个造血干细胞和祖细胞（HSPCs）进行了分析，以揭示HSPC分化过程中的动态分子变化。 | 首次展示了单细胞分辨率的HSPC分化图谱，并开发了一个直观的网络界面作为社区资源，用于可视化任何选定基因在HSPCs中的单细胞分辨率表达。 | NA | 探索造血干细胞和祖细胞分化过程中的细胞命运决策和分子变化。 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs）及其分化过程。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过1600个单个HSPCs |
| 23632 | 2024-08-09 |
Laser capture microscopy coupled with Smart-seq2 for precise spatial transcriptomic profiling
2016-07-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms12139
PMID:27387371
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研究论文 | 本文介绍了一种结合激光捕获显微镜（LCM）和全长mRNA测序（LCM-seq）的高效策略，用于单细胞转录组学研究 | 该方法无需组织解离，简化了实验流程并降低了技术噪声，适用于从单个捕获细胞中获取生物学见解 | NA | 开发一种高效且稳健的LCM-seq方法，用于精确的空间转录组学分析 | 从鼠组织和人类死后组织中分离的神经元 | 数字病理学 | NA | LCM-seq | NA | 转录组数据 | 单个捕获细胞 |
| 23633 | 2024-08-09 |
Visualization and analysis of gene expression in tissue sections by spatial transcriptomics
2016-Jul-01, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaf2403
PMID:27365449
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研究论文 | 本文介绍了一种名为“空间转录组学”的方法，能够在组织切片中以空间分辨率可视化和定量分析转录组 | 提出了一种新的“空间转录组学”策略，能够在组织切片中同时可视化和定量分析大量基因表达 | NA | 开发一种能够在组织切片中以空间分辨率可视化和定量分析转录组的新方法 | 小鼠大脑和人类乳腺癌组织切片中的基因表达 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | 图像 | 小鼠大脑和人类乳腺癌组织切片 |
| 23634 | 2024-08-09 |
Depletion of Ribosomal RNA Sequences from Single-Cell RNA-Sequencing Library
2016-07-01, Current protocols in molecular biology
DOI:10.1002/cpmb.11
PMID:27366895
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研究论文 | 本文介绍了一种从单细胞RNA测序文库中去除核糖体RNA序列的新方法 | 使用热稳定的双链特异性核酸酶有效去除核糖体RNA序列，适用于单细胞或微量RNA的RNA-seq文库构建 | 需要高输入量的总RNA，不适用于单细胞水平或有限输入DNA | 提高单细胞RNA测序技术的准确性和效率 | 单细胞RNA测序文库中的核糖体RNA序列 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单细胞或微量RNA |
| 23635 | 2024-08-09 |
GiniClust: detecting rare cell types from single-cell gene expression data with Gini index
2016-07-01, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-016-1010-4
PMID:27368803
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GiniClust的新型计算方法，用于从单细胞基因表达数据中检测稀有细胞类型 | GiniClust利用Gini指数提高了检测稀有细胞类型的敏感性和特异性 | NA | 开发一种新的计算方法来检测单细胞基因表达数据中的稀有细胞类型 | 单细胞基因表达数据中的稀有细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | GiniClust | 基因表达数据 | 涉及小鼠胚胎干细胞和皮质及海马中的细胞样本 |
| 23636 | 2024-08-09 |
De Novo Prediction of Stem Cell Identity using Single-Cell Transcriptome Data
2016-08-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2016.05.010
PMID:27345837
|
研究论文 | 本文介绍了一种从单细胞转录组数据中推导出谱系树并识别干细胞的计算方法 | 提出了StemID算法，用于从所有可检测的细胞类型中识别干细胞 | NA | 开发一种新的计算方法来预测和识别干细胞 | 成人有丝分裂组织中的干细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | StemID算法 | 转录组数据 | 涉及小肠中的Lgr5+细胞和骨髓中的造血干细胞 |
| 23637 | 2024-08-09 |
Long noncoding RNAs: Central to nervous system development
2016-Dec, International journal of developmental neuroscience : the official journal of the International Society for Developmental Neuroscience
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.ijdevneu.2016.06.001
PMID:27296516
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research paper | 本文探讨了长非编码RNA（lncRNAs）在中枢神经系统（CNS）发育中的作用 | lncRNAs在CNS发育中展现出功能多样性，为研究提供了新的视角 | lncRNAs的表达水平低于蛋白质编码RNA，增加了研究的复杂性 | 研究lncRNAs在CNS特定分化中的作用 | 长非编码RNA（lncRNAs）及其在中枢神经系统发育中的功能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23638 | 2024-08-09 |
Genetic screens to study the immune system in cancer
2016-08, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2016.05.007
PMID:27309352
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研究论文 | 本文利用RNA干扰和CRISPR/Cas9技术，系统地发现调控免疫细胞与肿瘤细胞相互作用关键通路的基因 | 本文通过体内筛选方法，识别限制抗肿瘤免疫效果的基因，并结合单细胞RNA测序实验，定义功能不同的免疫细胞亚群之间的差异表达基因 | NA | 研究免疫系统在癌症中的作用 | 免疫细胞与肿瘤细胞相互作用的基因调控 | 数字病理学 | 癌症 | RNA干扰, CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 23639 | 2024-08-09 |
Visualization and cellular hierarchy inference of single-cell data using SPADE
2016-07, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2016.066
PMID:27310265
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研究论文 | 本文描述了使用SPADE算法进行单细胞数据可视化和细胞层次结构推断的方法 | SPADE算法最初是为流式和质谱细胞术单细胞数据开发的，本文展示了其对单细胞RNA测序数据的适用性，并提出了一种结合t-SNE和SPADE的集成策略 | NA | 介绍和应用SPADE算法进行单细胞数据分析 | 单细胞数据及其细胞亚群的层次结构 | 生物信息学 | NA | SPADE算法 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 23640 | 2024-08-09 |
Tumor Heterogeneity, Single-Cell Sequencing, and Drug Resistance
2016-Jun-16, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph9020033
PMID:27322289
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤异质性、单细胞测序与药物抗性的关系，并讨论了单细胞测序技术在个性化肿瘤治疗中的应用前景 | 单细胞测序技术为理解肿瘤异质性的基因组原理提供了新的视角，并为更有效的肿瘤治疗奠定了基础 | 单细胞的分离和测序仍然是一个技术挑战，包括单细胞分离、全基因组扩增和转录组广泛的下一代测序技术 | 探讨肿瘤异质性与药物抗性的关系，并评估单细胞测序在个性化肿瘤治疗中的应用 | 肿瘤异质性、单细胞测序技术及其在药物抗性和个性化治疗中的应用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 单个肿瘤细胞 |