单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 41850 篇文献,本页显示第 2341 - 2360 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2341 2026-06-21
GenOT: generative optimal transport enables spatiotemporal interpolation and generation in cross-platform spatial transcriptomics
2026-Jun-19, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出了一种名为GenOT的生成框架,结合多尺度图自监督对比学习与最优传输重心理论,实现跨切片和跨平台的空间转录组时空插值与数据生成 核心创新在于引入基于最优传输重心的插值算法,能够数学建模异构样本间的空间分布差异,从而重建时空基因表达动态 NA 解决空间转录组数据中跨平台异构样本的空间信息整合与数据生成问题 空间基因表达数据及其跨样本整合 机器学习 NA 空间转录组学 多尺度图自监督对比学习与最优传输模型 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
2342 2026-06-21
Unveiling a unique microglial phenotype promoting oxidation in the iBRB: insights from single-cell transcriptomics in the NPDR rat model
2026-Jun-19, Cell & bioscience
研究论文 利用单细胞转录组学揭示非增殖性糖尿病视网膜病变大鼠模型中一种促进内血视网膜屏障氧化损伤的独特小胶质细胞表型 首次在非增殖性糖尿病视网膜病变大鼠模型中鉴定出一种高表达Spp1的小胶质细胞亚型,该亚型具有高分化潜能并在病变后显著上调,为内血视网膜屏障微环境中的小胶质细胞调控提供了新见解 研究基于动物模型,结果需要进一步在人类样本中验证 探究非增殖性糖尿病视网膜病变中内血视网膜屏障微环境的细胞异质性和早期病变机制 Zucker糖尿病肥胖大鼠的视网膜组织 数字病理学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 36821个细胞(来自伴有视网膜水肿和肾损伤的NPDR大鼠及正常大鼠) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
2343 2026-06-21
Remodeling of the immune-metabolic landscape triggered by long-term high-altitude exposure
2026-Jun-18, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 通过整合单细胞转录组学和代谢组学,揭示长期高海拔暴露引发的免疫-代谢景观重塑机制 首次通过多组学整合分析阐明长期高海拔暴露下“先天激活和适应抑制”的免疫代谢重塑策略,并发现糖酵解-TCA-OXPHOS轴的保守上调 研究基于90天短期暴露样本,长期适应机制仍需进一步验证;小鼠模型与人类数据的一致性需更多证据支持 探究长期高海拔暴露对免疫-代谢网络的系统性重塑机制 46名低海拔居民(90天高海拔暴露)和低氧低压小鼠模型 机器学习, 数字病理学 NA 单细胞RNA测序, 代谢组学, 酶学测定 NA 单细胞转录组数据, 代谢物数据, 酶活性数据 46名人类受试者,小鼠模型(详细数量未报告) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2344 2026-06-21
Retinoic acid-driven expansion of CD16hiCD177+ neutrophils mediates steroid-resistant GI-GVHD
2026-Jun-18, Blood IF:21.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序发现视黄酸驱动的CD16hiCD177+中性粒细胞亚群介导类固醇耐药性胃肠道移植物抗宿主病 首次阐明CD16hiCD177+中性粒细胞亚群在类固醇耐药性胃肠道移植物抗宿主病中的致病机制,并发现视黄酸通过RARA-SPI1转录轴驱动该亚群的扩增和致病程序,提出RARA抑制作为潜在治疗策略 研究主要基于患者血液样本和小鼠模型,肠道组织样本的验证尚需进一步补充;且未讨论其他可能参与的中性粒细胞亚群或免疫细胞 探究中性粒细胞异质性在类固醇耐药性胃肠道移植物抗宿主病发病机制中的角色 接受异基因造血干细胞移植的类固醇耐药性胃肠道移植物抗宿主病患者及小鼠模型 数字病理学 移植物抗宿主病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 患者血液样本和小鼠模型样本,具体数量未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
2345 2026-06-21
Machine learning-assisted prediction of PANoptosis-related molecular targets and precise screening of neuroprotective drugs for spinal cord injury
2026-Jun-17, Experimental neurology IF:4.6Q1
研究论文 利用机器学习辅助预测脊髓损伤相关PANoptosis分子靶点并筛选神经保护药物 首次将机器学习与RNA-seq、单细胞测序等多维数据整合,构建PANoptosis分子靶点预测及药物筛选框架,并验证了药物Xaliproden与Ripk1蛋白多个结构域的稳定相互作用 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;药物筛选依赖数据库预测,需实验验证其体内效果 预测脊髓损伤后PANoptosis相关的分子靶点并筛选神经保护药物,建立精准治疗体系 脊髓损伤小鼠模型(正常、急性期和亚急性期) 机器学习 脊髓损伤 RNA-seq, 单细胞测序, 机器学习, WGCNA, MCC 弹性网络-GLM, 随机森林, 支持向量机, LASSO 基因表达数据 小鼠模型样本,具体数量未提及 NA NA NA NA
2346 2026-06-21
Qi Wei Zhi Gan formulation alleviates progressive fibrosis in metabolic dysfunction-associated steatohepatitis through suppressing Peroxidasin-collagen IV crosslinking
2026-Jun-11, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 探索芪味脂肝方通过抑制过氧化物酶体-胶原IV交联减轻代谢功能障碍相关脂肪性肝炎纤维化的机制 首次揭示了芪味脂肝方通过抑制Pxdn介导的胶原IV交联从而减轻肝纤维化的新机制,并利用单核RNA测序和空间转录组学验证了Pxdn与Col4a1的关联 研究主要在动物模型中进行,其临床有效性和机制仍需在人体验证 研究芪味脂肝方对代谢功能障碍相关脂肪性肝炎的抗纤维化作用及其与细胞外基质重塑相关的机制 小鼠模型(CDAA饮食诱导MASH)、原代肝细胞、人肝脏样本 机器学习 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 蛋白质组学、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光、腺病毒介导的过表达、单核RNA测序、空间转录组学 NA 蛋白质组数据、RNA测序数据、空间转录组数据 小鼠模型(具体数量未在摘要中提及)、人肝脏样本(具体数量未在摘要中提及) 10x Genomics 单核RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium用于单核RNA测序,10x Visium用于空间转录组学
2347 2026-06-21
APOE4 Increases Systemic Inflammation and Alters Metabolic and Neuroprotective Pathways following Multiagent Chemotherapy in Older Human APOE Knock-In Mice
2026-Jun-10, The American journal of pathology
研究论文 研究APOE4基因型老年小鼠在多药化疗后出现系统性炎症增加以及代谢和神经保护通路改变的现象 首次在老年APOE基因敲入小鼠中探讨APOE4对多药化疗后认知功能的影响,并使用空间转录组学揭示脑区特异性通路变化 仅使用小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;样本量未知;仅观察化疗后短期(2周)效应 探究APOE4等位基因在老年乳腺癌患者化疗后认知障碍中的作用机制 14-16月龄APOE3和APOE4基因敲入C57Bl/6小鼠 机器学习 乳腺癌、神经退行性疾病 空间转录组学、磁共振波谱 NA 基因表达数据、代谢物数据 未明确样本数量,但涉及APOE3和APOE4两种基因型老年小鼠 NA 空间转录组学 NA 未提供具体平台细节
2348 2026-06-21
Lanmodulin-Engineered Outer Membrane Vesicles for Synergistic Targeted Radio-Immunotherapy
2026-Jun-09, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 开发了一种可编程的“即插即用”纳米平台TRT@LnOMVs,用于协同靶向放射-免疫治疗,通过展示兰姆调节蛋白(LanM)于外膜囊泡表面,实现高效放射性标记和精准靶向 首次利用经改造的减毒沙门氏菌外膜囊泡展示兰姆调节蛋白,实现温和条件下的多样化治疗性放射性同位素高效标记,避免了传统螯合剂方法的局限 摘要未提及具体局限性 开发一种适应性递送平台,将靶向放射治疗与免疫治疗结合,以增强抗肿瘤免疫反应 前列腺癌模型中的肿瘤微环境及免疫细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序、转录组分析 NA 文本、图像 前列腺癌小鼠模型与临床批准的Lu-PSMA-617进行比较 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2349 2026-06-21
Integrated multi-omics strategies for identifying novel therapies in psoriasis
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 通过整合多组学策略来识别银屑病的新型治疗方法 首次综合运用蛋白质组范围的孟德尔随机化、表达验证、遗传易感性分析、差异基因表达、共定位、通路富集和蛋白质-蛋白质相互作用等多种方法,系统性地筛选出29个高置信度靶点,其中包括13个新候选靶点 摘要未明确提及局限性 系统识别银屑病的潜在治疗靶点 银屑病和银屑病关节炎的蛋白质靶点和相关基因 机器学习 银屑病, 银屑病关节炎 蛋白质组范围的孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析, 共定位分析, 通路富集分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析 NA 蛋白质组数据, 表达数据, 遗传数据 NA NA NA NA NA
2350 2026-06-21
CIPHER: An end-to-end framework for designing optimized aggregated spatial transcriptomics experiments
2026-06, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 CIPHER是一个端到端框架,用于设计优化的聚合空间转录组学实验 联合优化实验编码矩阵和下游细胞嵌入,并将成像检测的物理限制直接整合到损失函数中 基于模拟数据和小鼠脑参考数据验证,对组织异质性和噪声的鲁棒性仍有待进一步验证 设计优化的聚合空间转录组学实验框架 聚合空间转录组学实验中的特征设计与解码准确性 机器学习和数字病理学 NA 空间转录组学、单细胞RNA-seq 神经网络 序列数据 小鼠脑scRNA-seq参考数据(大规模) NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
2351 2026-06-21
StPedf: Cell trajectory inference of spatial transcriptomics via spatial proximity embedding and spatial density-adaptive fusion
2026-06, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出一种基于空间邻近嵌入和空间密度自适应融合的细胞轨迹推断方法StPedf,用于从空间转录组数据重建细胞发育轨迹 核心创新在于使用带掩码机制的神经网络捕捉高维基因与空间位置的复杂非线性交互,并基于空间密度动态自适应调整嵌入和邻域信息权重,从而实现空间引导的轨迹推断 现有方法难以统一建模高维基因表达与空间坐标之间的复杂非线性交互 开发一种能够利用空间信息准确推断细胞发育动态轨迹的方法 空间转录组数据中细胞的基因表达和空间位置信息 机器学学习 NA 空间转录组学 神经网络 基因表达数据、空间坐标数据 五个不同结构模拟数据集及三个真实数据集(墨西哥钝口螈端脑再生、原发肿瘤、人背外侧前额叶皮层) NA 空间转录组学 NA NA
2352 2026-06-21
RNA Metabolism Genes as Prognostic Biomarkers and Therapeutic Targets in Colorectal Cancer Based on the Analysis of Single-Cell and Bulk-RNA Sequencing Data
2026-06, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,鉴定与结直肠癌进展相关的RNA代谢基因,并评估其临床意义 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序数据构建基于PCBP3和NGRN的两基因预后模型,并揭示其在结直肠癌中的免疫调控机制 仅使用HCT116细胞系进行功能验证,缺乏原代细胞和体内实验支持 鉴定结直肠癌中RNA代谢相关基因的生物标志物和治疗靶点 结直肠癌患者的单细胞和bulk RNA测序数据 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq 预后模型 基因表达数据 多个独立验证队列 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
2353 2026-06-21
Immune Landscape and Tumour Heterogeneity in Ovarian Cancer: Insights From Single-Cell RNA Sequencing
2026-Jun, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
综述 利用单细胞RNA测序揭示卵巢癌的免疫景观与肿瘤异质性 通过scRNA-seq技术高分辨率解析肿瘤微环境中免疫细胞的多样性和功能状态,为个性化免疫治疗提供新平台 未提及具体实验验证或临床转化中的挑战 研究卵巢癌中免疫细胞浸润的异质性及其对治疗反应的影响 卵巢癌肿瘤微环境中的免疫细胞(包括树突状细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞和T淋巴细胞等) 数字病理学 卵巢癌 scRNA-seq NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2354 2026-06-21
Osteoblast-derived CAR3 synergizing with collagen and bone sialoprotein enhances bone formation
2026-05-19, International journal of oral science IF:10.8Q1
研究论文 本研究发现成骨细胞来源的CAR3通过与胶原和骨涎蛋白协同作用增强骨形成 首次揭示碳酸酐酶III(CAR3)在成骨细胞中的关键作用及其调控骨骼发育与稳态的机制,特别是CAR3与COL1A1和骨涎蛋白形成三元复合物促进胶原纤维内矿化 未提及 研究成骨细胞中碳酸酐酶III(CAR3)在骨骼发育和稳态中的功能及机制 小鼠颅骨和长骨中的成骨细胞 机器学习 骨质疏松 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠颅骨和长骨样本 未提及 单细胞RNA-seq NA NA
2355 2026-06-20
Malignant cell-secreted chemokines drive colorectal cancer progression through endothelial cell activation
2026-Jul, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序等技术,揭示恶性细胞分泌的趋化因子CXCL2通过激活内皮细胞上的ACKR1促进结直肠癌进展的机制 首次利用单细胞RNA测序、拷贝数变异推断和非负矩阵分解分析不同T分期的CRC肿瘤微环境动态变化,确定CXCL2-ACKR1轴在肿瘤侵袭中的关键作用,并提出阶段特异性干预策略 未在更大队列或体内模型中验证CXCL2-ACKR1相互作用的临床相关性,且仅以CXCL2为单一候选因子,可能忽略其他微环境组分的影响 阐明结直肠癌进展过程中肿瘤微环境细胞互作机制,识别促进肿瘤侵袭的关键趋化因子及其靶向策略 26例结直肠癌患者(根据T分期分层为T2、T3、T4a)的肿瘤样本 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序、拷贝数变异推断、非负矩阵分解 NA 单细胞基因表达数据 26例结直肠癌患者(T2、T3、T4a分期) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2356 2026-06-20
STING Drives Psoriatic Inflammation by Promoting Neutrophil Recruitment and Facilitating NETosis
2026-07, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 研究揭示STING信号通路通过促进中性粒细胞招募和NETosis加重银屑病炎症 首次阐明STING信号通路在中性粒细胞介导的银屑病炎症中不仅调控细胞招募,还直接驱动NETs产物的终末效应功能,并发现不同小鼠品系间STING通路活化的遗传异质性 未涉及STING通路在不同银屑病亚型中的差异及长期治疗安全性评价 探索STING信号通路在中性粒细胞介导银屑病炎症中的具体作用机制 银屑病患者病变组织和外周血中性粒细胞、IMQ诱导的银屑病小鼠模型(野生型、STING-/-、PADi4-/-)及HL-60细胞 数字病理学 银屑病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 临床样本包含银屑病病变组织和外周血,小鼠模型涵盖不同品系 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
2357 2026-06-20
Gut Microbiota-Induced CTLA4 Expression on CD8 + T Cells Impairs Antitumor Immunity and Promotes Colorectal Cancer Progression
2026-07, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 揭示了肠道微生物群通过诱导CD8+ T细胞上CTLA4表达抑制抗肿瘤免疫并促进结直肠癌进展的机制 首次发现肠道菌群失调通过上调CD8 T细胞CTLA4表达促进T细胞耗竭和肿瘤免疫逃逸,建立了菌群-CTLA4轴这一新的免疫抑制通路 未提及 研究肠道微生物群在结直肠癌中调控CTLA4表达及抗肿瘤免疫的作用机制 结直肠癌患者及小鼠模型 机器学习和数字病理学 结直肠癌 16S rRNA测序,单细胞转录组学,空间转录组学,粪便微生物移植 NA 测序数据,空间转录组数据 结直肠癌患者样本及小鼠模型样本 Illumina 16S rRNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组学 Illumina测序平台 16S rRNA基因测序及单细胞转录组学分析
2358 2026-06-20
Enzyme-converted O kidneys allow ABO-incompatible transplantation without hyperacute rejection in a human decedent model
2026-Jun, Nature biomedical engineering IF:26.8Q1
研究论文 通过酶转化O型血肾脏实现ABO血型不相容移植而不引发超急性排斥反应的人体模型研究 首次在人体模型上采用供体中心脱敏方案,通过低温灌注将A型肾脏转化为酶转化O型肾脏,成功避免超急性排斥反应,并提出长期耐受的潜力 移植后第3天开始出现抗体介导的损伤和补体沉积,伴随A抗原再生,提示需要进一步研究以延长耐受期 探索供体中心器官工程策略,以扩大ABO血型不相容肾移植的应用范围 A型血肾脏和O型血脑死亡受体 NA 肾脏疾病 单细胞测序 NA 测序数据 一个酶转化O型肾脏移植给一名高抗A抗体滴度的O型脑死亡受体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2359 2026-06-20
Alterations in NK Cell Function and Glucose Metabolism Characteristics in Patients With Progressive Hepatocellular Carcinoma
2026-05, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 本研究探讨进展性肝细胞癌患者NK细胞的功能与代谢改变及其与疾病进展的关系 首次在单细胞水平揭示进展性肝癌中NK细胞存在TIM3高表达亚群、其功能受损且糖酵解关键酶下调,并确定TIM3为潜在治疗靶点 NA 阐明进展性肝细胞癌中NK细胞在单细胞层面的免疫抑制和代谢重编程特征 6例初治肝细胞癌患者的外周血、肿瘤及癌旁组织样本 单细胞转录组学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 6例初治肝细胞癌患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2360 2026-06-20
GPR56 Outperforms CD319 as a Discriminative Marker for CD4 + Cytotoxic T Lymphocytes and Is Elevated in Primary Sjögren's Syndrome
2026-04, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 本研究探讨GPR56和CD319作为CD4+细胞毒性T淋巴细胞表面标志物的潜力,并发现GPR56在原发性干燥综合征中升高 首次识别GPR56作为CD4 CTL的新型表面标志物,并揭示其在原发性干燥综合征中的功能相关性 未提及研究的局限性,可能包括样本量较小或机制探索不足 鉴定CD4 CTL的表面标志物并评估其在自身免疫疾病中的意义 CD4+细胞毒性T淋巴细胞和原发性干燥综合征患者 数字病理学 干燥综合征 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 原发性干燥综合征患者样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
回到顶部